Explorer la diversité des virus intestinaux des humains et des grands singes

«Explorer la diversité des virus intestinaux des humains et des grands singes», source CNRS.

Les transmissions de pathogènes entre humains et animaux menacent à la fois la santé humaine et la santé animale. Cette étude, menée par une collaboration incluant notamment l’Institut Pasteur, le CNRS et l’hôpital Saint Louis et publiée dans Nature Communication, intègre des analyses métagénomiques, historiques, anthropologiques et écologiques et compare un site en milieu naturel au Cameroun et un zoo européen. Les auteur.es montrent que les virus intestinaux se ressemblent plus entre les humains et les grands singes au Cameroun qu’au zoo.

Les transmissions de pathogènes entre humains et animaux menacent à la fois la santé humaine et la santé animale, et les processus qui favorisent la propagation des zoonoses sont complexes. Les précédentes études de terrain offrent un aperçu partiel de ces processus, mais ne prennent pas en compte l’écologie des animaux ni les perceptions et pratiques humaines qui facilitent le contact entre humains et animaux. Menée au Cameroun et dans un zoo européen, cette étude intègre des analyses métagénomiques, historiques, anthropologiques et écologiques des grands singes (gorilles et chimpanzés), ainsi qu'une évaluation en temps réel des types et de la fréquence des contacts entre les humains et les grands singes.

L'équipe constate que les humains et les grands singes partagent davantage leur virome intestinal au Cameroun qu’au zoo. De plus, la plus forte convergence est constatée entre gorilles et humains au Cameroun. Les adénovirus et les entérovirus sont les virus les plus fréquemment partagés entre les humains et les grands singes. C’est par l’approche profondément interdisciplinaire que les auteurs peuvent proposer des explications sur les résultats métagénomiques obtenus. Les contacts physiques et environnementaux sont plus intenses au Cameroun avec les gorilles qu’avec les chimpanzés. Les analyses menées indiquent que les gorilles sont plus nombreux que les chimpanzés, et sont aussi beaucoup plus chassés et consommés, notamment en raison d’un statut différent de celui des chimpanzés dans les représentations locales. Alors que les chimpanzés sont considérés comme très ressemblant aux humains et intelligents, les gorilles sont plutôt vus comme des animaux dangereux et très impliqués dans les pillages des cultures. Ce dernier point a été confirmé par nos questionnaires indiquant que les gorilles sont beaucoup plus impliqués dans les pillages que les chimpanzés.

Ainsi, c’est à la fois par plus de contacts physiques et de contacts environnementaux (dû notamment au pillage des champs), que peut être expliquée la plus grande convergence du virome intestinal des humains avec les gorilles au Cameroun. Concernant le zoo, les soigneurs et les grands singes avaient des contacts quotidiens et une grande proximité spatiale dans un site relativement petit. Le lavage des mains par les soigneurs pourrait contribuer à limiter le partage de virus intestinaux, et les mécanismes proposés au Cameroun pourraient expliquer cette plus grande convergence au Cameroun qu’au zoo.

L'utilisation d'antibiotiques engendre une résistance «à double sens» chez les humains et les animaux

«L'utilisation d'antibiotiques engendre une résistance «à double sens» chez les humains et les animaux », source article de Chris Dall paru le 4 avril 2023 dans CIDRAP News.

Dans une étude présentée comme la première du genre, une équipe internationale de chercheurs rapporte que l'association entre la consommation d'antibiotiques et la résistance aux antimicrobiens (RAM) chez les humains et les animaux est une «voie à double sens».

L'étude de modélisation, publiée dans Lancet Planetary Health, a utilisé des données mondiales sur les agents pathogènes résistants aux antibiotiques et la consommation humaine et animale d'antibiotiques pour montrer que chez les humains et les animaux producteurs de denrées alimentaires, sans surprise, une utilisation accrue d'antibiotiques est associée à une augmentation de la RAM.

Mais le modèle a également estimé qu'une utilisation accrue d'antibiotiques par les animaux producteurs de denrées alimentaires est associée à une résistance accrue des agents pathogènes bactériens qui infectent les humains, tandis que l'utilisation accrue d'antibiotiques chez l'homme est liée à une augmentation des taux de RAM chez les animaux.

En outre, l'étude a révélé que dans certaines parties du monde, des facteurs socio-économiques, tels que le manque d'accès à l'eau potable et à l'assainissement, peuvent avoir plus d'influence sur la résistance aux antimicrobiens que la consommation d'antibiotiques.

Une association bidirectionnelle

Pour l'étude, une équipe dirigée par des chercheurs de la London School of Hygiene & Tropical Medicine (LSHTM) a utilisé un modèle de régression multivariable et des données nationales 2018 sur la résistance aux antimicrobiens de l'Organisation mondiale de la santé (OMS), de l'Organisation panaméricaine de la santé et du Center for Disease Dynamics, Economics & Policy pour examiner les associations entre les taux mondiaux de RAM chez les humains et les animaux producteurs de denrées alimentaires et plusieurs variables indépendantes, notamment la consommation d'antibiotiques et les facteurs de risque sociodémographiques, liés à la santé et environnementaux.

La RAM chez les humains et les animaux se concentre sur les agents pathogènes prioritaires de l'OMS, notamment Acinetobacter baumannii et Pseudomonas aeruginosa résistants aux carbapénèmes, Escherichia coli et Klebsiella pneumoniae de troisième génération résistants aux céphalosporines, Staphylococcus aureus résistant à l'oxacilline et Enterococcus faecium résistant à la vancomycine. Les taux de résistance aux antimicrobiens chez les animaux étaient basés sur la résistance moyenne au niveau national chez les bovins, les porcs et les poulets.

Les données brutes ont montré que les taux les plus élevés de RAM pour les agents pathogènes humains ont été observés dans les pays à revenu faible et intermédiaire (LMICs pour low- and middle-income countries) et les plus faibles dans les pays à revenu élevé (HICs pour lowest in high-income countries) - une constatation qui a été observée dans des études précédentes. À l'inverse, les taux de RAM chez les animaux producteurs de denrées alimentaires étaient les plus élevés dans les HICs et les plus faibles dans les LMICs.

Le modèle de régression multivariable a montré que pour les agents pathogènes prioritaires critiques de l'OMS, l'augmentation de la consommation humaine de carbapénèmes et de céphalosporines, qui sont utilisés pour traiter les infections causées par ces agents pathogènes, était associée à une augmentation de la RAM (odds ratio [OR], 1,06 ; intervalle de confiance à 95% [IC], 1,00 à 1,12). L'association entre la consommation humaine d'antibiotiques et la résistance aux antimicrobiens était encore plus grande pour les agents pathogènes hautement prioritaires de l'OMS (OR, 1,22 ; IC à 95%, 1,09 à 1,37). Une consommation plus élevée d'antibiotiques chez l'homme était associée à une plus grande résistance pour presque toutes les combinaisons antibiotique-microbe.

Une association similaire a été observée entre la consommation d'antibiotiques et la RAM chez les animaux producteurs de denrées alimentaires (OR, 1,05 ; IC à 95%, 1,01 à 1,10).

Mais le modèle a également montré une association bidirectionnelle. La consommation d'antibiotiques chez les animaux producteurs de denrées alimentaires était positivement liée à la résistance des agents pathogènes prioritaires critiques (OR, 1,07 ; IC à 95%, 1,01 à 1,13), tandis que la consommation de carbapénèmes et des céphalosporines chez l'homme était positivement liée à la résistance aux antimicrobiens chez les animaux producteurs de denrées alimentaires (OR, 1,05 ; IC à 95%, 1,01 à 1,09).

«Au meilleur [de] nos connaissances, notre étude est la première à identifier ces associations bidirectionnelles animal-humain à l'échelle mondiale», ont écrit les auteurs de l'étude. «La signification conservée de la bidirectionnalité à cette échelle, et après ajustement pour d'autres covariables, apporte des preuves importantes au paradigme One Health.»

Des interventions One Health plus fortes sont nécessaires

Le modèle a également révélé qu'un résumé de l'inégalité des revenus appelé indice GINI était associé à une résistance accrue des agents pathogènes prioritaires de l'OMS (OR, 1,09 ; IC à 95%, 1,07 à 1,19), tandis que des taux de mortalité plus élevés attribuables à l'eau insalubre, à l'hygiène, et l'assainissement étaient associés à une résistance accrue des agents pathogènes de priorité moyenne de l'OMS (OR, 1,17 ; IC à 95%, 1,02 à 1,36).

«Par conséquent, nos modèles sont cohérents avec la littérature précédente, montrant que les facteurs indiquant un statut socio-économique inférieur sont associés à des niveaux plus élevés de RAM chez l'homme», ont écrit les auteurs. «Ces associations s'expliquent probablement par la dissémination incontrôlée de bactéries résistantes qui peut se produire dans des contextes où les services d'assainissement sont insuffisants et l'accès aux soins de santé est réduit.»

Dans le même temps, les indicateurs d'une gouvernance plus fiable, tels que les réglementations sur l'utilisation d'antibiotiques chez les animaux producteurs d'aliments, étaient associés à une résistance aux antimicrobiens plus faible.

Les auteurs affirment que ces résultats, pris ensemble, mettent en évidence le fait que si la consommation d'antibiotiques est un facteur important de la RAM, ce n'est pas le seul facteur. Et la lutte contre la résistance aux antimicrobiens dans le monde nécessitera plus d'une réduction juste des taux de consommation d'antibiotiques chez les humains et les animaux producteurs de denrées alimentaires.

«Concevoir des interventions autour de cette image holistique de la résistance sera essentiel pour lutter contre ce qui est rapidement devenu l'une des plus grandes menaces pour la santé mondiale», a dit l'auteur principal Laith Yakob de la LSHTM, dans un communiqué de presse. «À l'avenir, nous recommandons des politiques et des réglementations nationales plus strictes sur l'utilisation et la prescription d'antibiotiques chez les animaux et les humains, ainsi qu'une gouvernance, une transparence et une responsabilité améliorées, en particulier parmi les pays les plus touchés par la maladie.»

Des liens entre E. coli résistants chez les poulets et les humains, selon une étude

«Une étude suggère des liens entre E. coli résistants chez les poulets et les humains», source CIDRAP News.

Une étude menée dans des élevages du delta du Mékong, Vietnam, suggère que la résistance aux antimicrobiens (RAM) chez Escherichia coli des poulets et des humains en contact est motivée par l'utilisation d'antimicrobiens et la transmission potentielle entre espèces, ont rapporté des chercheurs dans JAC-Antimicrobial Resistance, Antimicrobial resistance in commensal Escherichia coli from humans and chickens in the Mekong Delta of Vietnam is driven by antimicrobial usage and potential cross-species transmission.

Pour l'étude, une équipe de chercheurs du Vietnam et du Royaume-Uni a recueilli des données sur l'utilisation des antimicrobiens (UAM) et des écouvillons fécaux d'humains et de poulets dans 237 petites exploitations du delta du Mékong. Les chercheurs ont isolé des souches de E. coli à partir de 426 échantillons humains et 237 échantillons de poulets, ont testé leur sensibilité à 11 antimicrobiens et ont étudié l'association entre l'UAM dans les élevages et les niveaux de RAM. Ils ont également examiné le degré de similitude des schémas de RAM entre les isolats de E. coli humains et de poulets provenant des mêmes élevages par rapport aux isolats de différentes élevages.

Sur la base de questionnaires structurés One Health remplis par les participants, les chercheurs ont estimé que 13,8% avaient utilisé des antimicrobiens au cours des 90 derniers jours et que des antimicrobiens avaient été administrés à 114 des 237 troupeaux de poulets (48,1%). Dans l'ensemble, le taux d'UAM chez les poulets (299,1 pour 1 000 jours-poulets) était 19 fois plus élevé que le taux d'UAM chez les humains (15,1 pour 1 000 jours-personnes).

Parmi les isolats testés, 311 (80,8%) provenant d'humains et 195 (82,3%) de poulets étaient résistants à au moins un antibiotique. Les isolats de poulets ont montré une prévalence plus élevée de multirésistance (63,3%) par rapport aux isolats humains (55,1%).

À l'aide d'un modèle de régression logistique, les chercheurs ont découvert que l'UAM augmentait considérablement la probabilité de résistance des isolats de E. coli chez les humains (rapports de cotes [ORs] de 2,1 à 5,3) et les poulets (odds ratios de 1,9 à 4,8). Les E. coli provenant d'humains et de poulets vivant dans les mêmes élevages présentaient un degré de similitude plus élevé dans leurs schémas de RAM que les isolats d'humains et de poulets vivant dans des fermes différentes. Notamment, il y avait une suggestion d'une probabilité plus élevée de coexistence E. coli résistants à la colistine chez les humains et les poulets s'ils vivaient dans le même élevage.

«En conclusion, en utilisant une conception d'enquête One Health qui impliquait un co-échantillonnage d'humains et de poulets provenant des mêmes élevages et des données intégrées sur l'UAM et la RAM, nous avons pu démontrer la corrélation entre l'UAM et la RAM, ainsi que la transmission potentielle entre espèces de certains phénotypes de résistance», concluent les auteurs.

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Une étude danoise suggère une propagation potentielle de Clostridioides difficile entre des porcs et des humains

«Une étude danoise suggère une propagation potentielle de Clostridioides difficile entre des porcs et des humains», source CIDRAP News.

Une étude menée sur des porcs danois a trouvé des souches de Clostridioides difficile similaires à celles trouvées chez l'homme, avec de multiples gènes de résistance, ont rapporté des chercheurs à la fin de la semaine dernière à l'ECCMID.

Dans l'étude, des chercheurs de l'Université de Copenhague et du Statens Serum Institut ont testé 514 échantillons prélevés en deux lots dans 14 élevages porcins danois pour détecter la présence de C. difficile. Ils ont également effectué un séquençage du génome entier pour déterminer le type de séquence multilocus, les toxines et les gènes de résistance, et pour comparer les isolats de porc aux isolats prélevés sur des patients humains atteints de C. difficile au cours de la même période.

Au total, 54 échantillons de porcs des deux lots ont été testés positifs, une analyse plus approfondie montrant que C. difficile était plus fréquent chez les porcelets et les truies que chez les porcs de boucherie. Tous les isolats étaient toxigènes et 13 types de séquences ont été retrouvés, toutes également présentzs dans les échantillons humains. La séquence type la plus répandue dans les isolats porcins et humains était ST11, et dans 16 cas, les isolats ST11 chez les porcs étaient presque identiques aux isolats humains, une découverte qui suggère le potentiel de transfert entre les porcs et les humains.

Trente-huit isolats de porcs contenaient au moins un gène de résistance, et la résistance a été prédite pour au moins sept classes d'antibiotiques, les plus courantes étant les macrolides, les bêta-lactamines, les aminoglycosides et la vancomycine.

Les auteurs de l'étude disent qu'une analyse phylogénétique plus approfondie serait nécessaire pour déterminer si C. difficile se propage des porcs aux humains ou si la transmission est bidirectionnelle. Mais l'identification des gènes de résistance partagés est une préoccupation, disent-ils.

«Notre découverte de gènes de résistance multiples et partagés indique que C. difficile est un réservoir de gènes de résistan uteur de l'étude, Semeh Bejaoui dans un  ce aux antimicrobiens qui peuvent être échangés entre les animaux et les humains», a dit le co-auteur de l'étude, Semeh Bejaoui dans un communiqué de presse de l'ECCMID. «Cette découverte alarmante suggère que la résistance aux antibiotiques peut se propager plus largement qu'on ne le pensait auparavant, et confirme les liens dans la chaîne de résistance menant des animaux de ferme aux humains.»

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Une seule santé : Une revue révèle un risque accru de SARM pour les propriétares de chien

«Une revue révèle un risque accru de SARM pour les propriétares de chien», source CIDRAP News.

Une revue et une méta-analyse d'études publiées précédemment ont identifié la possession d'un chien comme un facteur de risque de colonisation par Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM), ont rapporté des chercheurs allemands dans le Journal of Antimicrobial Chemotherapy.

Pour mieux comprendre le risque de colonisation par des micro-organismes multirésistants aux antibiotiques posé par la possession d'un animal de compagnie, les chercheurs ont mené trois revues et une méta-analyses distinctes de la littérature sur la possession d'un animal de compagnie et le SARM, les entérobactéries résistantes aux céphalosporines de troisième génération et les entérobactéries résistantes aux carbapénèmes et les entérocoques résistants à la vancomycine.

Le principal critère de jugement était le risque relatif de porter un micro-organisme multirésistants aux antibiotiques chez les humains en contact avec des animaux de compagnie (y compris les chiens, les chats, les rongeurs, les oiseaux et les reptiles) par rapport à ceux sans contact avec les animaux de compagnie.

Les chercheurs ont calculé un risque accru de portage du SARM pour les propriétaires de chiens, avec un rapport de risque (RR) de 2,28 (intervalle de confiance à 95% [IC], 1,47 à 3,56), mais pas pour les autres propriétaires d'animaux.

La méta-analyse pour les entérobactéries résistantes aux céphalosporines de troisième génération/les entérobactéries résistantes aux carbapénèmes n'a pas montré de risque de colonisation significativement plus élevé chez les propriétaires d'animaux que chez les non-propriétaires d'animaux, avec un RR de 1,18 (IC à 95%, 0,83 à 1,68) pour les propriétaires d'animaux en général. Pour les entérocoques résistants à la vancomycine les données étaient insuffisantes pour effectuer une méta-analyse.

Les auteurs de l'étude disent que le risque de SARM chez les propriétaires de chiens est plus élevé que celui retrouvé dans les revues de la littérature et, en raison des limites concernant les populations et les plans d'étude, il peut être une surestimation. Les données suggèrent que la transmission se produit principalement des humains aux chiens, qui peuvent alors servir de réservoir pour la réinfection et la transmission à d'autres membres du foyer domestique. De plus, les chiens peuvent être un vecteur de souches de SARM associées au bétail.

«Si en effet les animaux de compagnie jouent un rôle de facteur de risque pour l'acquisition de micro-organismes multirésistants aux antibiotiques chez l'homme, notre méta-analyse n'a suggéré cette relation que pour la transmission du SARM par les chiens», ont-ils écrit.

On lira aussi «Animaux de compagnie et staphylocoques résistants à la méticilline», Source Anses. Bulletin de veille scientifique n°25. Décembre 2014 et «Infections à germes méthicilline-résistants : ce qu’il faut savoir», source Advetia Centre hopitalier vétérinaire, 13 novembre 2018.

Estimation de l'exposition aux microplastiques durant la vie

«Estimation de l'exposition aux microplastiques durant la vie», source ACS News.

«Lifetime Accumulation of Microplastic in Children and Adults» (Accumulation pendant la vie de microplastiques chez les enfants et les adultes), article paru dans Environmental Science & Technology.

Chaque jour, des personnes sont exposées aux microplastiques provenant des aliments, de l'eau, des boissons et de l'air. Mais on ne sait pas exactement combien de ces particules s’accumulent dans le corps humain et si elles présentent des risques pour la santé. Désormais, des chercheurs rapportant dans Environmental Science & Technology de l'ACS ont développé un modèle d'exposition aux microplastiques pour la vie qui tient compte des niveaux variables provenant de différentes sources et dans différentes populations. Le nouveau modèle indique une masse moyenne d'accumulation de microplastiques plus faible que les estimations précédentes.

Les microplastiques, qui sont de minuscules morceaux de plastique dont la taille varie de 1 µm à 5 mm (environ la largeur d'une gomme à crayon), sont ingérés à partir de diverses sources, telles que l'eau en bouteille, le sel et les produits de la mer. Leur sort et leur transport dans le corps humain sont en grande partie inconnus, bien que les particules aient été détectées dans les selles humaines. En plus de causer des dommages aux tissus et une inflammation, les microplastiques pourraient être une source de cancérogènes et d'autres composés dangereux qui s'infiltrent du plastique dans le corps. Des études antérieures ont tenté d'estimer l'exposition humaine aux particules et à leurs produits chimiques lessivés, mais elles ont des limites, notamment des divergences dans les bases de données utilisées, un échec de la prise en compte de toute la gamme de tailles des microplastiques et l'utilisation de taux d'exposition moyens qui ne reflètent pas les apports mondiaux. Nur Hazimah Mohamed Nor, Albert Koelmans et leurs collègues voulaient développer un modèle complet pour estimer l'exposition durant la vie des adultes et des enfants aux microplastiques et à leurs produits chimiques associés.

Pour fabriquer leur modèle, les chercheurs ont identifié 134 études rapportant des concentrations de microplastiques dans les poissons, les mollusques, les crustacés, l'eau du robinet ou en bouteille, la bière, le lait, le sel et l'air. Ils ont corrigé les données afin de pouvoir les comparer avec précision entre les différentes études. Ensuite, l'équipe a utilisé des données sur la consommation alimentaire dans différents pays pour différents groupes d'âge pour estimer les fourchettes d'ingestion de microplastiques. Ces informations, combinées aux taux d'absorption microplastique du tractus gastro-intestinal et d'excrétion par le foie, ont été utilisées pour estimer la distribution microplastique dans l'intestin et les tissus. Le modèle prévoyait qu'à l'âge de 18 ans, les enfants pourraient accumuler en moyenne 8 300 particules (6,4 ng) de microplastiques dans leurs tissus, alors qu'à 70 ans, les adultes pourraient accumuler en moyenne 50 100 particules de microplastique (40,7 ng). Les quantités estimées de quatre produits chimiques lessivés des plastiques étaient faibles par rapport à l'apport total d'une personne de ces composés, ont conclu les chercheurs. Ces données suggèrent que des études antérieures pourraient avoir surestimé l'exposition aux microplastiques et les risques potentiels pour la santé, mais il sera important d'évaluer les contributions d'autres types d'aliments à l'ingestion et à l'accumulation, selon les chercheurs.

Mise à jour du 21 mai 2021. On lira ce document de l'Anses, Microplastiques et nanomatériaux.

Chiens et antibiorésistance

L'antibiorésistance existe, me semble-t-il dans les deux sens, animal vers humain et humain vers animal, dans oublier le rôle des aliments consommés par les animaux de compagnie …

Le blog a publié en 2020 trois articles sur les aliments pour animaux de compagnie et antibiorésistance ...

• La nourriture de votre animal de compagnie vous rend-elle malade? Une étude révèle que beaucoup de propriétaires ne connaissent pas les risques
• Les aliments crus pour chiens dits BARF contiennent des bactéries multirésistantes dans un cas sur deux. Certains germes peuvent également être dangereux pour l'être humain, selon une étude de l'Université de Zurich
• Une nouvelle étude révèle que les aliments crus pour chiens sont une source majeure de bactéries multirésistantes qui pourraient potentiellement coloniser les humains

L'Anses communique sur «Quel rôle jouent les chiens dans la diffusion de l’antibiorésistance ?»

Un projet coordonné par l’Anses sur le rôle des animaux de compagnie dans la propagation de l’antibiorésistance vient d’être retenu pour financement.

En France, plus d’un foyer sur deux possède un animal de compagnie. Ceux-ci jouent-ils un rôle important dans la transmission de bactéries résistantes aux antibiotiques ? Cette question est encore peu documentée.

Le projet DYASPEO (Dynamique de la propagation, de la persistance et de l'évolution de la résistance aux antimicrobiens entre l’Homme, les animaux et leur environnement) propose d’y répondre. Il est coordonné par l’Anses et vient d’être sélectionné lors du premier appel à projets du Programme prioritaire de recherche Antibiorésistance, mis en place par le Gouvernement et coordonné par l’Inserm. D’une durée de six ans, il s’appuiera sur une étude épidémiologique auprès de 500 chiens et des membres de leur foyer.

L’objectif est d’étudier la possibilité de transfert, entre les chiens et les humains, de bactéries de l’intestin résistantes à deux types d’antibiotiques, les céphalosporines à spectre étendu et les carbapénèmes. Les facteurs de risque d'acquisition, de persistance et d’évolution de ces bactéries seront déterminés. Pour cela, le projet associe des spécialistes en médecine humaine et vétérinaire, en sciences sociales, en génomique, en mathématiques et en modélisation. Outre l’Anses, les partenaires sont l’École vétérinaire d’Alfort, l’Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, l’Inserm, le CNRS, l’université de Clermont-Ferrand et l’Institut Pasteur.

NB : Merci aux rédacteurs de l'Anses d'écrire en Français. Vous avez écrit, de la persistance et de l'évolution de l’AMR entre l’Homme, les animaux et leur environnement. 

AMR est de l'angais pour antimicrobial resistance. Merci de préférer RAM, résistance aux antimicrobiens.

Des chatons pourraient détenir la clé de la compréhension de maladies diarrhéiques mortelles chez les enfants

«Des chatons pourraient détenir la clé de la compréhension des maladies diarrhéiques mortelles chez les enfants», source North Carolina State University.

Les chatons pourraient être le modèle pour comprendre les maladies diarrhéiques infectieuses, parfois mortelles, chez les animaux et les enfants, selon une étude de la North Carolina State University parue dans Infection and Immunity, une revue de l'ASM. L'article est disponible en intégralité.

Les bactéries diarrhéiques Escherichia coli (DEC) provoquent des maladies diarrhéiques mortelles chez les enfants du monde entier, tuant jusqu'à 120 000 enfants de moins de cinq ans par an. Les Escherichia coli atypiques (ATEC pour atypical Escherichia coli) sont une forme de DEC de plus en plus associée aux maladies diarrhéiques chez les humains et les chatons.

«Nous recherchions les causes de la diarrhée infectieuse chez les chatons, qui a un taux de mortalité élevé, et sommes tombés sur ce pathogène», explique Jody Gookin, professeur éméritee en formation de chercheurs vétérinaires à la NC State et auteur correspondant de l'étude.

«Ce qui est intéressant à propos des ATEC c'est que vous pouvez le trouver chez les personnes en bonne santé et malades. L’avoir dans votre tractus intestinal ne signifie pas que vous êtes malade, mais ceux qui sont malades ont un fardeau plus élevé, ou une plus grande quantité de bactéries, dans leur corps.»

Gookin et Victoria Watson, une ancienne Ph.D. Étudiante à NC State et principal auteur de l'étude, a effectué une analyse génomique des isolats ATEC provenant à la fois de chatons en bonne santé qui ont été colonisés par la bactérie et de chatons atteints d'infections mortelles pour essayer de déterminer pourquoi les ATEC provoque la maladie chez certains chatons mais reste dormant chez d'autres.

Avec des collaborateurs de l'Université du Maryland, Gookin et Watson ont ensuite comparé les données génomiques des deux groupes de chatons aux isolats humains ATEC. Cependant, aucun marqueur génétique spécifique n'a permis aux chercheurs de distinguer les groupes d'isolats.

«ATEC isolé des humains est le même que celui retrouvé chez les chatons sains et malades», dit Gookin. «Il n’existait pas de marqueurs génétiques uniques qui pourraient expliquer pourquoi un groupe de bactéries provoque des maladies alors que l’autre ne le fait pas. La seule chose que nous avons trouvée était des différences de comportement entre les groupes d'isolats.»

«Les isolats pathogènes causant la maladie avaient plus de motilité, ils étaient de meilleurs nageurs. Les bactéries ATEC provoquent des maladies en se fixant aux cellules épithéliales tapissant l'intestin. Ces cellules sécrètent alors des fluides, provoquant la diarrhée. Ainsi, plus les bactéries ATEC pourraient nager, plus il serait facile de trouver des cellules et de s'y attacher.»

Les résultats indiquent que les chatons sont un modèle potentiellement inestimable pour une exploration plus approfondie des ATEC au niveau moléculaire afin d'informer les approches de traitement pour les humains et les félins.

«C'est le premier article sur la génétique qui est la même dans des groupes d'isolats ATEC des humains et des chatons, à la fois en bonne santé et malades», dit Gookin. «C'est également une preuve supplémentaire que nos animaux de compagnie peuvent nous donner des informations importantes sur les maladies qui nous affectent tous les deux.»