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vendredi 19 mai 2023

L'Autriche révèle des résultats montrant la présence de pathogènes dans le lait cru et la viande

«L'Autriche révèle des résultats montrant la présence de pathogènes dans le lait cru et la viande», source Food Safety Newsdu 19 mai 2023.

Des contrôles récents en Autriche ont retrouvé Campylobacter dans du lait cru, Salmonella dans du poulet et le virus de l’hépatite E dans du foie de porc cru.

Plus tôt cette année, une campagne a contrôlé le lait cru des distributeurs automatiques pour les germes et les résidus d'agents de nettoyage.

L'Agence autrichienne pour la santé et la sécurité alimentaire (AGES) a déclaré que le lait cru pouvait contenir des pathogènes malgré les mesures d'hygiène pendant la traite. Le conseil est de toujours faire bouillir le lait avant de le boire. Pour les produits vendus directement aux consommateurs via des distributeurs automatiques ou dans le magasin de la ferme, la mention, «Lait cru, bouillir avant consommation» doit être présente.

Soixante prélèvements provenant de toute l'Autriche ont été examinés et 23 ont été rejetés. Dans l'ensemble, 21 ne se sont pas conformés parce que le nombre total de bactéries était trop élevé. Un prélèvement était contaminé par Campylobacter. Deux prélèvements étaient non conformes en raison d'un manque d'information sur la machine distributrice concernant le chauffage (faire bouillir) du produit.

Le lait cru des distributeurs automatiques avait été examiné pour sa qualité microbiologique lors de deux campagnes précédentes en 2017 et 2020. Dans ces actions, le lait de 112 fermes différentes a été contrôlé. Des prélèvements de 40 entreprises étaient non conformes, dont cinq entreprises à deux reprises.

Aliments prêts à consommer et le virus de l’hépatite E
Une autre campagne portait sur les aliments prêts à consommer et les sandwichs du commerce de détail. Les germes et agents pathogènes indicateurs de l'altération et de l'hygiène ont été analysés tandis que l'étiquetage a été évalué pour les articles emballés.

Des prélèvements ont été réalisés dans divers points de vente, notamment des établissements de restauration, des maisons de retraite et de soins infirmiers, des hôpitaux, des écoles et des jardins d'enfants, des restaurants libre-service et des supermarchés.

Sur près de 1 500 prélèvements, 73 étaient non conformes. Cinq ont été jugés dangereux pour la santé car une salade composée avec de la viande séchée contenait Listeria monocytogenes et dans quatre, les niveaux de Bacillus cereus présumés étaient trop élevés.

Sept prélèvements étaient impropres à la consommation humaine ou à l'utilisation prévue car les niveaux d'indicateurs d'hygiène ou d'organismes de détérioration étaient très élevés. Dans deux prélèvements, la valeur de E. coli comme indicateur d'hygiène était trop élevée. Pour un prélèvement, il y avait un manque d'information sur les allergènes. Sur 165 prélèvements de produits préemballés, des problèmes d'étiquetage ont été constatés à 34 reprises.

Dans un autre travail, la prévalence du virus de l’hépatite E dans du foie de porc cru du commerce de détail a été évaluée.

Le virus de l'hépatite E (VHE) a été trouvé dans trois des 78 prélèvements. Les autorités ont déclaré que bien que l'ARN du virus ait été détecté trois fois, le risque que les consommateurs soient infectés par le foie de porc produit en Autriche est faible. Les campagnes de 2015 et 2019 n'ont trouvé aucun prélèvement positif. Au total, 61 cas liés au VHE ont été signalés en Autriche en 2021 et 40 au cours des trois premiers trimestres de 2022.

Résultats sur Campylobacter et Salmonella
Une campagne différente a vérifié les autocontrôles des opérateurs pour Campylobacter dans les abattoirs de volailles.

Au total, 290 prélèvements officiels de poulets de chair du même lot ont été prélevés à l'abattoir en même temps que les prélèvements d'autocontrôle et analysés pour Campylobacter. Les résultats ont montré que le processus global d'autocontrôle, y compris les méthodes de laboratoire et l'envoi de prélèvements, était parfois insatisfaisant.

Le critère d'hygiène des procédés de l'UE est basé sur le dénombrement de Campylobacter sur les carcasses de poulets de chair. A partir de 2020, des actions sont nécessaires de la part des abattoirs si 15 carcasses sur 50 présentent plus de 1 000 ufc/g de Campylobacter après refroidissement.

Dans certains abattoirs, les résultats des analyses ou les résultats des contrôles internes ont montré des résultats insatisfaisants conformément à la réglementation de l'UE, au moins une fois au cours de la période de contrôle. Dans certains cas, des mesures correctives auraient dû être prises dans les abattoirs dès le mois d'août 2022, précise l'AGES.

L'agence a déclaré qu'une absence de résultats supérieurs à 1 000 unités formant colonies par gramme (ufc/g) sur 14 semaines d'été était «très discutable». Surtout lorsque dans ses investigations, des niveaux supérieurs à 1 000 ufc/g ont été détectés.

Les recommandations comprenaient des améliorations de l'hygiène à l'abattage, un examen des contrôles des procédés et des mesures de biosécurité dans les fermes. Ces actions doivent également être contrôlées régulièrement par les autorités, a dit AGES.

Un contrôle précédent a examiné Salmonella et Campylobacter dans la viande de poulet. Plus de 300 prélèvements ont été réalisés et 20 étaient non conformes.

Dans 231 des 302 prélèvements, Campylobacter a été détecté. Il n'y avait pas de différence majeure dans les niveaux de contamination entre la production biologique et conventionnelle ou entre les produits nationaux et étrangers. Les poulets produits à l'étranger ou élevés de manière conventionnelle étaient beaucoup plus susceptibles d'être contaminés par Salmonella que les poulets produits au pays ou élevés de manière biologique.

Salmonella Infantis a été détecté dans 62 des 69 prélèvements contaminés par Salmonella. Campylobacter a également été retrouvé dans 52 prélèvements testés positifs pour Salmonella.

Au total, 38 des 209 prélèvements nationaux étaient positifs pour Salmonella, tandis que 31 des 93 prélèvements importés étaient contaminés. Salmonella a été isolé de 11 des 21 prélèvements provenant de Hongrie.

mardi 15 mars 2022

Le virus de l'hépatite E du rat pourrait être considéré comme une maladie émergente en Europe, selon une étude

Photo d'illustration
«Le virus de l'hépatite E du rat pourrait être considéré comme une maladie émergente en Europe, selon une étude», source Outbreak News Today.

Dans une récente étude publiée dans le Journal of Hepatology le mois dernier, des chercheurs décrivent les premiers cas d'hépatite aiguë liés à l'infection par Orthohepevirus C (VHE-C), également connu sous le nom de virus de l'Hépatite E du rat, détectés en Europe.

ContexteLe virus de l'hépatite E (VHE) est le seul membre de la famille des Hepeviridae à potentiel zoonotique. Néanmoins, cette considération a été réévaluée car des preuves récentes ont fait état de plusieurs cas d'hépatite aiguë et chronique liés au genre Orthohepevirus C. Parce que la circulation du Orthohepevirus C chez les rongeurs a été décrite dans le monde entier, le risque de transmission zoonotique est plausible à l'échelle mondiale.

Méthodes
L'ARN du Orthohepevirus C a été évalué rétrospectivement dans deux cohortes de patients suivis en Espagne. La première cohorte comprenait des patients atteints d'hépatite aiguë sans diagnostic étiologique après dépistage d'une infection par un virus hépatotrope. La deuxième cohorte comprenait des patients diagnostiqués avec une infection aiguë par le VHE, définie comme une positivité pour les anticorps IgM anti-VHE et/ou l'ARN du VHE détectable dans le sérum.

Résultats
La cohorte 1 était composée de 169 patients (64,4 % d'hommes, âge médian 43 ans) et la cohorte 2 de 98 individus (68,3 % d'hommes, âge médian 45 ans). Parmi les individus inclus dans la cohorte 1, deux (1,18%; IC à 95%: 0,2-3,8) présentaient un ARN du Orthohepevirus C détectable dans le sérum. Dans la cohorte 2, sur les 98 patients inclus, 58 présentaient un ARN du VHE détectable, tandis que 40 présentaient uniquement une positivité pour les anticorps IgM. Parmi ceux qui ne portaient que des anticorps IgM, l'ARN du Orthohepevirus C a été détecté chez un individu (2,5%; IC à 95%: 0,06-13,1). Toutes les souches étaient compatibles avec le génotype C1. L'infection chez deux patients a entraîné une hépatite aiguë légère avec autorésolution. Dans l'autre cas, il s'agissait d'une hépatite aiguë sévère, décédant par insuffisance hépatique et rénale.
Conclusion
Nous avons décrit trois cas du Orthohepevirus C chez des patients atteints d'hépatite aiguë, aboutissant à la première description de cette infection en Europe. La prévalence obtenue dans notre étude suggère que Orthohepevirus C peut être une maladie émergente en Europe.

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vendredi 4 février 2022

Le virus de l’hépatite E résiste aux désinfectants courants pour les mains, selon une étude

«Le virus de l’hépatite E résiste aux désinfectants courants pour les mains, selon une étude», source Food Safety News.

Selon une étude, de nombreux désinfectants courants pour les mains n'inactivent pas le virus de l'hépatite E (VHE).

Des chercheurs ont découvert que le VHE avait une forte stabilité contre les alcools et les désinfectants pour les mains à base d'alcool, mais ont identifié une substance qui fonctionnait.

Le VHE peut être trouvé chez les porcs et infecter les humains qui mangent du porc insuffisamment cuit ou des produits à base de viande crue. C'est également une cause majeure d'épidémies d'origine hydrique dans les pays à revenu faible et intermédiaire.

L'Organisation mondiale de la santé (OMS) a des recommandations pour les désinfectants qui peuvent être facilement préparés et sont disponibles dans les zones rurales. Cependant, les scientifiques ont découvert que ces formulations n'étaient pas capables de perturber l'infectivité virale du VHE.

Différents types de virus de l’hépatite E
Le professeur Eike Steinmann, de la Ruhr Universität Bochum (RUB), a déclaré: «Nous avons testé l'effet des alcools, éthanol et propanol, à la fois individuellement et dans les rapports de mélange recommandés par l'OMS, ainsi que des désinfectants pour les mains commerciaux. Cependant, un seul produit contenant un autre composant était efficace.

Habituellement, le VHE se présente sans enveloppe et est très résistant aux influences chimiques. Cependant, les particules virales présentes dans le sang des patients sont entourées d'une enveloppe lipidique. Les scientifiques ont examiné les deux formes du virus dans leurs tests.

Ils ont utilisé un système de culture cellulaire du VEH récemment développé pour évaluer les désinfectants pour les mains couramment utilisés et leurs principaux composants (par exemple, les alcools) par rapport aux différentes formes de VEH.

Bien que certains désinfectants testés aient été certifiés pour inactiver les virus enveloppés et non enveloppés, ils n'étaient pas efficaces contre le VHE, selon l'étude publiée dans Journal of Hepatology.

L'hépatite E a quatre types différents. Les génotypes 1 et 2 n'ont été trouvés que chez l'homme tandis que les génotypes 3 et 4 circulent chez les animaux, y compris les porcs, les sangliers et les cerfs, sans provoquer de maladie, mais peuvent infecter les humains.

Résultats sur l'acide phosphorique
Les chercheurs ont dit qu'ils s'attendent à ce que la combinaison de différentes mesures de prévention comme un vaccin, la sécurité des aliments, l'hygiène et les désinfectants pour les mains contribuent toutes à une réduction des infections secondaires, quel que soit le génotype du VHE.

Sur les cinq désinfectants pour les mains commerciaux testés, un seul, qui contenait de l'acide phosphorique ainsi que de l'alcool, neutralisait suffisamment toutes les particules virales. L'éthanol a perturbé l'enveloppe du VHE mais il a laissé le virus infectieux intact.

Le Dr Patrick Behrendt a déclaré que l'équipe a montré que le VHE peut résister aux désinfectants pour les mains les plus courants.

«Les composants alcooliques dissolvent l'enveloppe lipidique, mais les virus nus qui en résultent sont toujours infectieux. Nous espérons que ces résultats seront pris en compte à l'avenir lorsque des mesures d'hygiène seront recommandées pour la manipulation de produits carnés contaminés et dans les situations d'épidémie de VHE.»

Aux lecteurs du blog
Comme le montre cette notice de la BNF, le blog Albert Amgar a été indexé sur le site de la revue PROCESS Alimentaire. 10 052 articles initialement publiés par mes soins de 2009 à 2017 sur le blog de la revue sont aujourd’hui inacessibles. Disons le franchement, la revue ne veut pas payer 500 euros pour remettre le site à flots, alors qu’elle a bénéficié de la manne de la publicité faite lors de la diffusion de ces articles.

mercredi 26 janvier 2022

Flambée d’hépatite E en 2021 en Suisse

Chiffre annuel (colonnes) et incidence (ligne) des cas de VHE en Suisse

«Flambée d’hépatite E en 2021 en Suisse», source OFSP-Bulletin 4/2022, édition du 24 janvier 2022.

Entre janvier et mai 2021, l’Office fédéral de la santé publique (OFSP) a enregistré une augmentation inhabituelle de cas d’hépatite E, qui a mené à une investigation plus approfondie. 105 cas au total ont été déclarés sur l’ensemble du territoire, ce qui représente près du triple par rapport aux années précédentes pour la même période. Les cas concernaient davantage les hommes que les femmes, et les âges se répartissaient entre 18 et 87 ans. Malgré une enquête systématique auprès des cas dans le cadre d’une étude cas-témoins et de nombreuses analyses de denrées alimentaires, aucune source d’infection n’a pu être identifiée.

Bilan et conclusion
Aucune denrée alimentaire spécifique n’a pu être identifiée comme responsable de la flambée. Cependant, il a été démontré que les infections ont été causées par un sous-type du VHE qui est prédominant dans le cheptel porcin en Suisse. Parmi les cas touchant l’être humain, trois clusters ont été identifiés, lesquels ont conduit simultanément à une flambée. Pour des raisons techniques, il n’a pas été possible de vérifier s’il existait un lien direct avec des produits à base de viande de porc contaminés. Aucune concordance n’a été trouvée entre un foie de porc positif issu du monitorage et les échantillons humains, ce qui aurait permis d’attribuer ce foie à un cluster. Les résultats n’ont pas non plus permis de confirmer ou de démentir un lien de cause à effet entre des denrées alimentaires et les cas touchant les êtres humains. Les analyses épidémiologiques ont permis de démontrer que les saucisses de foie et les saucisses de foie à tartiner ainsi que les foies de porc crus pourraient avoir joué un rôle durant cette période (janvier à mai 2021). Cependant, ces affirmations se fondent sur un nombre restreint de personnes interrogées et sur quelques analyses de denrées alimentaires.

En guise de recommandation, les personnes immunosupprimées ou souffrant d’une maladie hépatique, les personnes âgées, les personnes enceintes et les enfants devraient renoncer à manger des produits à base de viande de porc ou de sanglier crus ou cuits de manière insuffisante. Pour empêcher tout risque d’hépatite E, il est recommandé de bien cuire les produits carnés avant de les consommer.

Un article de Joe Whitworth de Food Safety News traite du modèle de l’inactivation thermique du virus de l'hépatite E

Pendant ce temps, un modèle pour prédire l'inactivation thermique du VHE a été publié par la Food Standards Agency (FSA).

La Glasgow Caledonian University, Campden BRI, Jorvik Food Safety Services et l'Université de Strathclyde faisaient partie du projet, Thermal Inactivation Model for Hepatitis E Virus.

L'infection par l'hépatite E est un problème émergent au Royaume-Uni et il existe des preuves suggérant une association avec des produits de porc insuffisamment cuits. Il n'existe pas de méthode standardisée pour évaluer la stabilité du VHE pouvant être présent dans les aliments pendant les processus de cuisson ou de méthode appropriée pour détecter uniquement le VHE intact qui peut provoquer une infection.

Les preuves publiées suggèrent que le chauffage a un impact sur le VHE, mais il existe une incertitude sur la survie du virus dans une gamme de temps et de températures de cuisson et dans différents aliments.

Le conseil minimum est de cuire les aliments à une température interne de 70°C pendant deux minutes. Les données montrent que le VHE est plus résistant que prévu et que la cuisson à 70°C à 75°C peut ne pas éliminer complètement le virus. Cependant, on ne sait pas s'il est toujours infectieux.

Le modèle créé peut aider à prédire la quantité de virus qui sera dégradée sur un temps spécifique et avec une cuisson à une certaine température. Il peut être adapté lorsque des progrès ont été réalisés dans la mesure de l'infectivité du VHE dans les aliments.

Le modèle peut être utilisé pour éclairer les évaluations des risques, les conseils de la FSA aux consommateurs et les mesures de maîtrise dans les systèmes de management de la sécurité des alimentse dans l'industrie.

Aux lecteurs du blog
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mercredi 12 mai 2021

Royaume-Uni: Une étude montre que le bacon et le porc salé sont des facteurs de risque d'hépatite E

Source and route of HEV1-4 infection, article Kamar N, Bendall R, Legrand-Abravanel F, Xia NS, Ijaz S, Izopet J, Dalton HR. Lancet. 2012 Jun 30;379(9835):2477-88.
«Une étude montre que le bacon et le porc salé sont des facteurs de risque d'hépatite E», source article de Joe Whitworth paru le 12 mai 2021 dans Food Safety News.

Le bacon et d'autres produits de charcuterie de porc ont été identifiés comme des facteurs de risque du virus de l'hépatite E (VHE) en Angleterre par des chercheurs.

Ils ont constaté que la consommation de bacon, de charcuterie et de foie de porc était significativement associée à une infection par le VHE, confirmant les liens antérieurs avec les produits de porc transformés.

Les scientifiques ont étudié les facteurs de risque d'infections par le VHE dans la population de donneurs de sang en Angleterre via une étude cas-témoins d'avril 2018 à mars 2019. Les participants à l'étude étaient 117 donneurs de sang positifs pour l'ARN du VHE et 564 donneurs négatifs pour l'ARN du VHE.

Les informations recueillies auprès des cas et des témoins comprenaient des antécédents de voyage, des expositions aux animaux et à l'environnement, la consommation d'alcool, des médicaments et d'autres conditions. Ils ont également été interrogés sur les aliments qu'ils consommaient et leurs préférences d'achat avec des questions détaillées sur la consommation de produits de porc.

Les symptômes les plus fréquemment rapportés étaient la fatigue, les douleurs articulaires et les maux de tête. Dans l'ensemble, 76 des 117 cas et 552 des 564 témoins étaient asymptomatiques. Il y avait une plus grande présence de VHE chez les hommes que chez les femmes donneuses de sang, mais la raison en est incertaine, selon l'étude publiée dans Emerging Infectious Diseases.

Lien avec du porc extérieur du Royaume-Uni

La période d'incubation du VHE peut être de deux à neuf semaines. Les patients ont été interrogés sur la période de 9 semaines précédant la date de leur don de sang positif pour l'ARN du VHE et les témoins environ 9 semaines avant leur don.

Sur les 19 aliments inclus, 14 étaient significativement associés à l'infection par le VHE et la plupart étaient des produits d'origine animale. Aucun patient et quatre témoins n'étaient végétariens. Le modèle final a montré que les seules variables à noter étaient le bacon, les viandes de porc salées telles que le salami et les kabanos tranchés, et le foie de porc. Il n'est pas encore clair si la salaison de porc est suffisant pour inactiver le VHE.

«L'identification de ces produits de porc souligne l'importance d'une information précise sur les exigences de cuisson ainsi que le rôle et l'importance de l'élevage pour prévenir l'infection par le VHE chez les porcs. Cibler l'infection par le VHE à la source empêcherait la transmission d'origine alimentaire à la population», ont dit les chercheurs.

Le virus de l'hépatite E a huit types; les génotypes 3 (G3) et G4 sont principalement d'origine alimentaire. L'augmentation du VHE en Angleterre en 2010 a coïncidé avec l'émergence d'un nouveau phylotype du VHE. Aucune preuve de ce phylotype n'a été retrouvée chez les porcs en Angleterre. Les virus détectés dans les échantillons cliniques humains au Royaume-Uni ont été étroitement liés à ceux trouvés chez les porcs en Europe. Les scientifiques ont déclaré que les preuves suggèrent que le risque provient des produits de porc hors du Royaume-Uni.

Les chercheurs ont dit que la prévention de la consommation de foie de porc ne conduirait qu'à une réduction modeste des cas de VHE car peu de gens en consomment. Ils n’ont pas non plus trouvé de risque lié à la consommation de pâtés au porc ou de jambon et de saucisses d’une certaine chaîne de supermarchés britannique. Cela pourrait être dû à des changements de fournisseur ou de source de viande de porc pour le supermarché depuis qu'une étude de 2013 a fait ce lien ou à des différences entre les populations étudiées.

La FSA demande à Campden BRI de se pencher sur le VHE

Une tendance à la hausse du VHE aigu a été observée au Royaume-Uni de 2010 à 2016, avec 1 212 cas signalés en 2015, 1 243 en 2016, 1 002 en 2018 et 1 202 en 2019. Le VHE est la cause la plus fréquente d'hépatite virale aiguë diagnostiquée en Angleterre et l'estimation annuelle des infections est de 100 000 à 150 000.

Selon l'étude, les méthodes d'échantillonnage et d'analyse du porc et d'autres produits alimentaires ne sont pas suffisamment solides pour fournir des informations sur la contamination par des virus infectieux.

La Food Standards Agency (FSA) a chargé Campden BRI et l'Université de Glasgow d'évaluer la meilleure façon de détecter le virus de l'hépatite E dans la viande de porc et les produits de porc en optimisant les éléments des méthodes existantes d'extraction et de détection du VHE.

Il y a des lacunes dans les preuves sur le VHE et des méthodes de détection standardisées et fiables sont nécessaires pour obtenir une meilleure compréhension. La méthode développée permettrait de quantifier le VHE de la viande de porc, des abats et des produits de porc avec une détection de faible niveau si possible. Le rapport final sera publié après la fin du projet en décembre 2022.

Il est prévu que le système développé sera présenté comme candidat à la certification de l'Organisation internationale de normalisation (ISO) en tant que méthode standard.

samedi 6 février 2021

Danger dans la porcherie: un projet de recherche vise à limiter la propagation des SalmonelleA et du virus de l'hépatite E

«Danger dans la porcherie: un projet de recherche vise à limiter la propagation des SalmonelleA et du virus de l'hépatite E», source communication du BfR n°003/2021 du 1er février 2021.

Les bactéries du genre Salmonella et le virus de l'hépatite E (VHE) peuvent infecter les humains et les animaux. Chez les porcs, ils conduisent souvent à des infections asymptomatiques (subcliniques). Cependant, chez l'homme et les porcs, ils peuvent également provoquer des infections graves et potentiellement mortelles. Les éleveurs et les vétérinaires en particulier ont un risque accru d'être infecté par Salmonella et le VHE en raison de leurs contacts fréquents et intensifs avec les porcs. Le projet de recherche européen BIOPIGEE («Biosecurity practices for pig farming across Europe ou Pratiques de biosécurité pour l'élevage porcin à travers l'Europe»), coordonné par l'institut fédéral allemand d'évaluation des risques (BfR), vise désormais à en savoir plus sur la manière de réduire la fréquence de Salmonella et du VHE dans les élevages porcins européens. Le but du projet est de déterminer les méthodes qui peuvent le mieux contenir les pathogènes.

BIOPIGEE fournira des informations sur la manière de protéger les porcs contre l'entrée et la propagation de pathogènes en utilisant différentes approches de recherche. Des échantillons fécaux seront prélevés sur des porcs de différents types d'élevages dans les pays participants et testés pour la recherche de Salmonella et du VHE, et les éleveurs seront interrogés sur les mesures de biosécurité dans l'élevage. La collaboration avec des experts expérimentés dans le contrôle de ces pathogènes dans les élevages de porcs, des ateliers d'experts et des revues de la littérature permettront de mieux comprendre les meilleures méthodes de contrôle. Les analyses de laboratoire seront réaliséee pour déterminer l'efficacité des désinfectants courants contre les Salmonella et le VHE.

Les données obtenues seront ensuite incluses dans des modèles mathématiques. Ils pourront être utilisés pour déterminer quelles mesures de biosécurité sont les plus efficaces contre un ou les deux pathogènes.

Le projet est financé par le «Programme conjoint européen One Health» (OHEJP). Il rassemble des experts européens pour étudier ces deux pathogènes et fournir des informations utiles pour l'élevage porcin. 13 pays et 16 instituts de recherche avec une expertise dans l'épidémiologie vétérinaire, la microbiologie, la médecine vétérinaire et humaine, l'agronomie, l'économétrie, la bactériologie et la virologie sont impliquées dans le projet. Les connaissances acquises grâce à BIOPIGEE seront partagé avec les parties intéressées dans le cadre de séminaires, de contenu de site Internet et d'un outil d'aide à la décision.

Plus d'informations sur le projet BIOPIGEE peuvent être trouvées sur la page d'accueil de One Health EJP.

jeudi 15 octobre 2020

Evaluation quantitative des risques microbiologiques liés à la consommation de viande rouge en France

Une étude française parue dans Microbial Risk Analysis traite de l'évaluation quantitative des risques microbiologiques liés à la consommation de viande rouge en France.

Faits saillants
  • Les maladies d'origine alimentaire associées à la consommation de viande rouge en France ont été évaluées.
  • Le nombre de cas, de décès et de DALYs* a été estimé pour huit agents pathogènes d'origine alimentaire.
  • Il y avait environ 670 [IC à 95% = 380-1 100] cas de maladie pour 100 000 habitants.
  • Les cas de maladie ont causé 0,12 [IC à 95% = 0,07–0,19] décès pour 100 000 habitants.
  • Il y avait une estimation de 39 [IC à 95% = 8–71] DALYs pour 100 000 habitants.
Résumé
Comme le rapportent le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies et l'Autorité européenne de sécurité des aliments, la viande rouge est une source alimentaire majeure responsable de maladies d'origine alimentaire en raison de dangers microbiologiques. 
Le premier objectif de cette étude était d'agréger les données disponibles dans la littérature afin d'identifier et de caractériser les principaux risques microbiologiques liés à la consommation de viande rouge en France. Ensuite, les nombres associés de maladies d'origine alimentaire, de décès et de la charge des maladies, exprimés en années de vie en bonne santé perdues ont été estimés.
En utilisant les huit agents pathogènes d'origine alimentaire dans l'évaluation, un modèle de risque probabiliste a été construit et l'incertitude des données a été considérée.
Campylobacter spp. a été classé comme le pire agent pathogène en termes de nombre de cas humains associés à la consommation de viande rouge, avec 210 [intervalle de confiance (IC) à 95% = 500–520] cas pour 100 000 habitants. L'agent pathogène qui a provoqué la mortalité la plus élevée était Salmonella enterica non typhique, avec 0,04 [IC à 95% = 0,01–0,10] décès pour 100 000 habitants.
Ces cas étaient principalement liés à la consommation de viande de porc.
Cependant, l'hépatite E est le principal contributeur en années de vie en bonne santé perdues s à cause de la consommation de viande rouge en France, avec 33 [IC à 95% = 1-64] DALY pour 100 000 habitants ; cet effet était principalement dû à la consommation de foie de porc.
En termes de bactéries d'origine alimentaire, pour la viande de bœuf et de porc, Campylobacter spp., S. enterica non typhoïde, Clostridium perfringens et Escherichia coli producteurs de shigatoxines (STEC) représentaient une moyenne de 2,2 [IC à 95% = 1,0–4,0] DALY pour 100 000 individus par an.
Les estimations fournies dans cette étude pourraient aider les autorités à se concentrer sur ces risques et à réduire à terme leur impact sur la santé de la population française.
Mots-clés
Maladies d'origine alimentaire ; Classement des risques; Santé publique ; Années de vie en bonne santé perdues (DALY).
*DALY (disability ajusted life years) ou années de vie en bonne santé perdues (appelé aussi espérance de vie corrigée de l'incapacité -aa). Cet indicateur synthétique de santé, utilisé par l’Organisation mondiale de la santé depuis 1990, représente la somme des années de vie perdues (mortalité) et des années de vie vécues avec incapacité (morbidité). Source Santé publique de France.

mardi 9 juin 2020

Les virus d'origine alimentaire vus par le BfR


L'Anses a mis en évidence Salmonella dans le cadre de deuxième journée mondiale de la sécurité sanitaire des aliments. Le blog en a parlé ici et ici.

Le BfR, quant à lui, a souhaité mettre l'accent sur différents virus avec ce communiqué, « Gardez la diarrhée et la jaunisse à distance »; source BfR 20/2020 du 5 juin 2020.

Journée internationale de la sécurité sanitaire des aliments : comment se protéger des virus.

En ce qui concerne les «virus», la plupart des personnes pensent à «coronavirus» de nos jours. Mais la transmission de ce nouveau coronavirus dans les aliments est peu probable et n'a pas été prouvée. Dans les aliments, cependant, d'autres virus sont à craindre comme cause de maladie. Il y a quatre principaux coupables: les norovirus et les rotavirus et les agents pathogènes responsables des hépatites A et E. À l'occasion de la «Journée mondiale de la sécurité sanitaire des aliments» le 7 juin 2020, l'Institut fédéral allemand pour l'évaluation des risques (BfR) souligne comment les consommateurs peuvent se protéger contre ces agents pathogènes. «Si vous suivez des règles simples d'hygiène en cuisine, vous pouvez réduire considérablement le risque d'infection», explique le président du BfR, le professeur Andreas Hensel.

Les «profils» des quatre virus les plus courants dans les aliments sont présentés ici:
Norovirus: Ils déclenchent des maladies gastro-intestinales chez l'homme, qui peuvent être associées à des diarrhées et des vomissements. En plus des infections humaines directes ou des surfaces contaminées, l'agent pathogène est souvent transmis à d'autres personnes par le biais d'aliments crus tels que la laitue, les fruits et les fruits de mer. Les baies congelées peuvent également contenir des norovirus viables, car ils ne sont pas affectés par le froid. Le nombre total de cas enregistrés en Allemagne à l'Institut Robert Koch (RKI) en 2019 (y compris la transmission alimentaire) est de 78 679.

Rotavirus: Les rotavirus provoquent également des maladies gastro-intestinales chez l'homme, qui entraînent des diarrhées, des vomissements et des douleurs abdominales. Les petits enfants sont particulièrement à risque. Dans de rares cas, le virus peut également être transmis à d'autres personnes via les aliments. Le nombre total de cas enregistrés au RKI en 2019: 36 876.

Virus de l'hépatite A: Le virus peut provoquer une inflammation aiguë du foie (jaunisse infectieuse) chez l'homme. L'infection survient le plus souvent via la consommation d'aliments contaminés ou d'eau potable lors de voyages à l'étranger, mais dans certains cas également via des aliments importés. Le nombre total de cas enregistrés au RKI en 2019: 873.

Virus de l'hépatite E: La maladie est similaire à l'inflammation du foie causée par le virus de l'hépatite A. L'agent pathogène est souvent transmis par des aliments insuffisamment chauffés provenant de porcs domestiques et de sangliers. Les animaux peuvent être infectés sans montrer de signes de maladie. Dans ce cas, le virus se trouve généralement déjà dans l'aliment et non sur celle-ci. Le nombre total de cas enregistrés au RKI en 2019: 3 725.

La plupart des agents pathogènes alimentaires sont sensibles à la chaleur. Par conséquent, les aliments doivent être chauffés à 70°C ou plus pendant au moins deux minutes. Il est également conseillé de chauffer suffisamment les baies congelées avant consommation. Les aliments consommés crus, comme la salade et les fruits, doivent être soigneusement lavés. Évitez tout contact entre les aliments crus et prêts à consommer (par exemple entre la viande crue et la laitue) car les agents pathogènes peuvent être transférés aux aliments prêts à consommer (contamination croisée).

Un nouveau Laboratoire national de référence pour les virus d'origine alimentaire a été mis en place au BfR fin 2019. Il mène des recherches sur ce groupe d'agents pathogènes et sur leur détection (souvent difficile) dans les aliments et conseille les autorités de contrôle des aliments du gouvernement fédéral allemand («Länder»).

samedi 25 avril 2020

Stabilité du virus de l’hépatitis E à différents pH


Dans un article à paraître dans International Journal of Food Microbiology, des scientifiques allemands ont étudié la stabilité du virus de l’hépatitis E (VHE) à différents pH.

Faits saillants
  • Optimisation d'une méthode de culture cellulaire pour des tests de stabilité du pH du VHE
  • Seule une infectiosité minimale diminue de pH 2 à pH 9 pendant 3h à 23°C
  • Inactivation importante à pH 1 et pH 10 pendant 3h à 23°C
  • < 0,8 log10 de baisse de pH 4,5 à pH 6,5 dans D/L acide lactique pendant 7 jours.
  • Du VHE infectieux résiduel est attendu après le fumage des produits carnés.
Résumé
L'infection par le virus de l'hépatite E (VEH) peut provoquer une hépatite aiguë et chronique chez l'homme. Le VEH à génotype 3 est principalement transmis par la consommation de produits de viande crus et fermentés préparés à partir de porcs infectés ou de sangliers.

L'abaissement du pH pendant la fermentation est l'un des obstacles microbiologiques considérés comme inhibant la croissance de certains agents pathogènes. Cependant, aucune donnée n'est actuellement disponible sur la stabilité du pH du VHE. Comme aucune mesure fiable et reproductible de l'infectiosité du VHE dans les produits à base de viande n'a été établie jusqu'à présent, la stabilité de la souche 47832c du génotype 3 du VHE adaptée à la culture cellulaire a été analysée ici dans un tampon phosphate salin (PBS) tamponné à différentes valeurs de pH.

Seule une diminution minimale de l'infectiosité (jusqu'à 0,6 log10 focus forming units) a été retrouvée après traitement de pH 2 à 9 pendant 3h à température ambiante. À pH 10, une diminution d'environ 3 log10 était évidente, alors qu'aucun virus restant (diminution > 3,5 log10) n'a été détecté à pH 1. Les conditions habituellement atteintes pendant le fumage de saucisses crues ont été simulées en utilisant de l'acide lactique (D/L) ajouté au PBS résultant en pH 4,5 à pH 6,5. Après incubation à 4°C pendant 7 jours dans ces conditions, aucune différence significative par rapport à une solution standard de PBS à pH 7,7 n'a été évidente. À température ambiante, une diminution de 0,8 log10 a été retrouvée à pH 4,7 après 7 jours d'incubation par rapport à pH 7,7, mais moins aux autres valeurs de pH.

En conclusion, seuls des effets d'inactivation minimes ont été constatés dans des conditions de pH qui se produisent couramment pendant la transformation des aliments. Par conséquent, le virus infectieux restant pourrait être présent dans les produits de viande fermentée si une matière de départ contaminée par le VHE était utilisée. Des effets supplémentaires d'autres facteurs tels que des concentrations élevées de sel et de faibles valeurs d'aw devraient être étudiés dans de futures études.

Mots clés
Virus de l'hépatite E, Culture cellulaire Stabilité, Inactivation, Valeur de pH.

mardi 11 février 2020

A propos de la présence du virus de l'hépatite E chez les porcs aux Etats-Unis


« Des scientifiques sont inquiets de la présence du virus de l'hépatite E chez les porcs à l'abattoir », source article de Coral Beach publié le 11 février 2020 dans Food Safety News.

Le sang contaminé provenant de porcs d'abattoir infectés par le virus de l'hépatite E pourrait atteindre la chaîne d'approvisionnement alimentaire humaine, selon des chercheurs.

« ... 40 pour cent des porcs d'abattage américains (échantillonnés) étaient séropositifs pour le VHE (virus de l'hépatite E), indiquant une infection antérieure par le VHE des porcs dans les élevages ce qui était cohérent avec les estimations antérieures pour les porcs d'élevage américains », selon un article qui vient d'être publié par une équipe de scientifiques dirigée par Harini Sooryanarain du Département des sciences biomédicales et de pathobiologie du Virginia Polytechnic Institute et de la State University.

Les scientifiques se sont lancés dans le projet en sachant que dans les pays industrialisés, il existe deux des huit génotypes zoonotiques porcins du VHE présentant une menace émergente de maladie d'origine alimentaire pour l'homme. Le virus peut être transmis par la consommation de porc cru ou insuffisamment cuit, selon l'équipe de recherche et les informations des Centers for Disease Control and Prevention.

Cela peut prendre jusqu'à 60 jours après l'exposition au virus pour que les symptômes se développent. Les personnes infectées peuvent rester contagieuses pendant plusieurs semaines. Le CDC rapporte qu'il n'y a pas de vaccin contre l'hépatite E approuvé aux États-Unis.

Les chercheurs ont commencé avec près de 23 000 échantillons de porcs provenant de 25 abattoirs dans 10 États. Ils ont utilisé 5 033 échantillons sélectionnés au hasard et représentant les 25 abattoirs et les 10 États. Les 23 000 échantillons ont été collectés en 2017-2019 pour une étude différente et archivés pour une analyse future. Les échantillons de sang ont été prélevés sur le plancher de mise à mort des abattoirs, et le sérum a été séparé et conservé congelé au Beltsville Agricultural Research Center de l'ARS-USDA.

« Nous avons précédemment montré que le VHE-3 est présent dans les troupeaux de porcs américains et qu'une petite proportion des produits du porc commerciaux, tels que le foie et les chitterlings, provenant des magasins américains contiennent du VHE infectieux », selon l'article des scientifiques publié dans l'édition de février de Emerging Infectious Diseases.

« Cependant, concernant le statut actuel de l'infection par le VHE des porcs du marché américain au moment de l'abattage, le point d'entrée de la chaîne d'approvisionnement alimentaire, reste inconnu. »

Bien que 40% des échantillons soient séropositifs, seuls 6% des porcs présentaient une virémie à VHE détectable. C'est encore assez inquiétant, selon l'équipe de recherche. Étant donné que de nombreux porcs à l'abattoir sont virémiques, la sécurité sanitaire du porc est préoccupante, car le sang contenant du VHE infectieux pendant l'abattage peut contaminer les produits de porc cru.

Les scientifiques ont rapporté que des études ont montré que près de 6 pour cent des porcs à l'abattoir au Royaume-Uni et 44,4 pour cent en Écosse étaient virémiques. Un nombre croissant de cas déclarés d'infection humaine ont été attribués à la consommation de porc cru ou insuffisamment cuit.

vendredi 7 février 2020

Séroprévalence du virus de l'hépatite E chez les donneurs de sang en Corse


Voici une étude sur la séroprévalence du virus de l'hépatite E chez les donneurs de sang en Corse

Référence
Capai Lisandru, Hozé Nathanaël, Chiaroni Jacques, Gross Sylvie, Djoudi Rachid, Charrel Rémi, Izopet Jacques, Bosseur Frédéric, Priet Stéphane, Cauchemez Simon, de Lamballerie Xavier, Falchi Alessandra, Gallian Pierre. Seroprevalence of hepatitis E virus among blood donors on Corsica, France, 2017Euro Surveill. 2020;25(5):pii=1900336. https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.5.1900336

Contexte
Avec une population de 338000 habitants en 2018, la Corse est une grande île française (8680 km2) située en mer Méditerranée dans le sud-est de la France métropolitaine. Le but de l'étude était d'étudier la séroprévalence du virus de l'hépatite E (VHE) chez des donneurs de sang volontaires de Corse, une zone considérée comme une zone de forte prévalence et d'évaluer le niveau d'immunité de la population ainsi qu'une analyse fine de la prévalence dans les districts corses.

Discussion
En 2011 et 2012, une enquête nationale (utilisant le test Wantai) a identifié une hétérogénéité géographique dans la distribution du statut sérologique des IgG anti-VHE chez les donneurs de sang volontaires en France métropolitaine, et la Corse faisait partie des zones où la séroprévalence était la plus élevée enregistrée (62 %).

Figatelli
Le ficatellu, une saucisse locale de foie de porc, a été officiellement identifié comme une source de contamination d'origine alimentaire par le VHE, mais l'impact réel de la consommation de ficatellu sur l'épidémiologie du VHE est inconnu et d'autres sources potentielles de contamination restent à explorer. Ici, nous avons terminé l'étude susmentionnée en effectuant une analyse spécifique d'un nouvel échantillon plus important de donneurs de sang corse.

Entre septembre 2017 et janvier 2018 (période sans activité touristique importante), nous avons recruté 2 705 donneurs de sang résidant en Corse dont 1 518 (56,1%) testés positifs pour les IgG anti-VHE. Cela a confirmé la forte endémicité du VHE en Corse.

D'autres zones à forte prévalence ont été identifiées en Europe à l'aide du même test IgG anti-VHE, à savoir le centre de l'Italie (région des Abruzzes, 49%) [46] et le sud-ouest de la France (région Midi-Pyrénées, 52,5%).

L'analyse des données brutes indique que la séroprévalence du VHE est plus élevée chez l'homme, constat qui a été précédemment décrit dans l'analyse univariée mais non multivariée, et également plus élevé chez les individus nés en Corse. Il a été précédemment proposé que ces différences puissent s'expliquer par des facteurs sociologiques (profession spécifique, chasse, etc.), mais il n'existe à ce jour aucune explication factuelle qui tienne compte de la forte prévalence générale chez les hommes et les femmes et également de la différence entre les sexes.

L'association entre l'antigène des leucocytes humains (HLA) ou les antigènes des groupes sanguins et les maladies infectieuses a été documentée dans la littérature mais, à notre connaissance, n'a jamais été étudiée pour l'infection par le VHE. Ici, nous n'avons pas identifié un tel lien entre les groupes sanguins ABO, Rhésus et Kell et la présence d'anticorps anti-HEV.

Les titres d'anticorps sont généralement faibles, avec 77,2%, 81,6% et 85,9% des donneurs ayant des titres d'IgG anti-VHE inférieurs à 5, 7 et 10 UI/mL, respectivement. La séroprévalence augmente avec l'âge, sauf chez les personnes de plus de 60 ans environ. Dans nos modèles, ce dernier peut s'expliquer soit par une force infectieuse variable avec l'âge (mais cela n'est pas étayé à ce jour par des informations épidémiologiques ou sociologiques) ou par une perte d'anticorps spécifiques dans le temps. Des études antérieures ont montré que les taux d'anticorps diminuent avec le temps et chez certains sujets, les IgG anti-VHE peuvent disparaître après un suivi variant entre 1 et 22 ans. Une étude récente auprès de donneurs de sang du centre de l'Italie utilisant le test Wantai a rapporté un taux de séroconversion VHE de 2,1 pour 100 personnes-années, du même ordre de grandeur (1,3-4,6/100 personnes-années) que ceux estimés avec nos modèles.

Notamment, la séroprévalence dans le groupe le plus jeune des donneurs de sang (18-27 ans) était plus de 10% plus élevée chez les personnes nées en Corse (environ 51%) que chez celles nées à l'extérieur (environ 39%). Cela se traduit par une force d'infection de 4,3% (IC 95% : 3,5–5,6) par an chez les natifs contre 2,8% (IC 95% : 2,5–3,2) par an chez les non-natifs dans le 'modèle de séroréversion'. Cependant, en l'absence de données épidémiologiques détaillées pour les individus de moins de 18 ans, la forme exacte de la courbe de séroconversion chez l'enfant et l'adolescent reste à établir. De toute évidence, l'identification des déterminants de l'exposition dans la population corse de moins de 18 ans est essentielle pour comprendre l'épidémiologie du VHE localement. Une comparaison de la séroprévalence du VHE mesurée ici (56,1%) avec les sérums archivés de donneurs de sang collectés en 2000 dans les deux départements de la Corse (53,3%; n = 90) (données non présentées) suggère que l'exposition au VHE a été stable en la population corse depuis au moins deux décennies. De plus, nous n'avons pas identifié de variation significative de la prévalence selon le district administratif de résidence. Dans l'ensemble, les informations épidémiologiques semblent converger vers une exposition potentielle commune et omniprésente à l'infection par le VHE pour les personnes vivant en Corse.

Le réservoir animal (principalement des porcs et des verrats) est consensuellement considéré comme une source majeure d'infection par le VHE chez l'homme [53,54]. Cependant, l'importance relative des voies de contamination directes (c'est-à-dire liées à la consommation de viande de porc et de sanglier) ou indirectes n'est pas claire. La contamination indirecte peut être liée à la transmission du virus par les mains ou des vecteurs passifs de transmission d'une maladie (fomites) mais également à l'eau potable contaminée. Des informations antérieures issues de l'étude nationale française ont identifié l'eau potable en bouteille comme facteur de protection contre l'infection, et dans la région rurale d'Auvergne (France métropolitaine centrale), l'eau du réseau public a été identifiée comme la source commune d'infection pour un groupe de sept cas humains, avec de l'ARN HEV détecté dans un puits privé qui a accidentellement contaminé le réseau public d'eau.

De plus, une étude récente en Suède a détecté des souches de génotype 3 du VHE dans l'eau du robinet et dans l'eau brute avant traitement. Par conséquent, à mesure que de nouvelles recherches sont mises en œuvre pour identifier les sources omniprésentes d'exposition au VHE en Corse, le rôle potentiel de l'eau potable dans la propagation de l'infection par le VHE devrait être étudié.

Conclusion
Notre étude confirme que la Corse est une zone d'endémie élevée pour l'infection par le VHE, avec une exposition homogène dans les différents quartiers géographiques. La séroprévalence augmente avec l'âge jusqu'à 60 ans et est plus élevée chez l'homme que chez la femme. Notre étude a identifié trois domaines prioritaires pour des investigations complémentaires sur la Corse.

Premièrement, l'épidémiologie dans le groupe d'âge plus jeune (moins de 18 ans) est essentiellement inconnue en l'absence de données biologiques et devrait être explorée plus avant.
Deuxièmement, les sources courantes de contamination, en particulier l'eau potable, méritent des études complémentaires car le VHE peut être trouvé dans les fèces et les eaux usées et la Corse est une région où l'infection des porcs et des verrats est fréquente. Le réservoir d'animaux, les eaux usées et la contamination potentielle du réseau public d'eau peuvent être étudiés.
Troisièmement, la forte proportion de donneurs ayant un faible titre d'anticorps anti-VHE soulève des questions sur la protection offerte par les anticorps IgG et sur la sensibilité à une infection secondaire par le VHE.