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lundi 6 novembre 2023

Thaïlande : Une recommandation concernant Streptococcus suis après 24 décès signalés

«La Thaïlande publie une recommandation concernant Streptococcus suis après 24 décès signalés», source article de Food safety News paru le 4 novembre 2023, complété par mes soins -aa. C'est sujet récurrent dans ce pays.

Les autorités sanitaires thaïlandaises exhortent la population à ne pas consommer de porc cru ou insuffisamment cuit après que des centaines de cas et deux douzaines de décès aient été enregistrés.

De janvier à novembre 2023, il y a eu 500 cas à Streptococcus suis avec 24 décès dans plusieurs provinces différentes, selon le Département de Contrôle des Maladies (DDC).

Les patients ont déclaré avoir mangé du porc cru ou insuffisamment cuit, des repas contenant du sang de porc et avoir travaillé avec des animaux potentiellement infectés.

Les responsables ont souligné une tendance sur les réseaux sociaux consistant à manger des aliments crus et à boire de l'alcool, mais ont déclaré que cela expose les gens à un risque d'infection.

En juin 2023, la Thaïlande a organisé un symposium international sur les maladies porcines émergentes et réémergentes (ISERPD pour International Symposium on Emerging and Re-emerging Pig Diseases ) et un atelier international sur Streptococcus suis. Les experts ont discuté de l'épidémiologie et du diagnostic de Streptococcus suis, du contrôle et de la prévention des maladies, ainsi que de l'infection chez l'homme.

Streptococcus suis en Thaïlande

En 2021, le Département de Contrôle des Maladies a signalé 266 cas et 12 décès dus à une infection à Streptococcus suis entre janvier et juin.

La plupart des cas concernaient des personnes âgées et des groupes d'âge actif, donc ceux âgés de 55 à 64 ans ou de 65 ans et plus. Les professions les plus à risque étaient les ouvriers agricoles et les abattoirs ainsi que les agriculteurs.

Sur l’année 2021, le Bureau thaïlandais d’épidémiologie a signalé 576 cas, dont 24 décès. Cela se compare à 344 cas et 11 décès en 2020.

L'infection à Streptococcus suis est généralement asymptomatique chez le porc. Les humains peuvent être infectés par la consommation de porc cru ou insuffisamment cuit et de sang frais contaminés ou par contact direct avec des porcs ou des produits à base de porc infectés.

La période d'incubation varie de quelques heures à cinq jours. Les symptômes comprennent une forte fièvre, des maux de tête et des étourdissements sévères, des vomissements, de la diarrhée, une raideur de la nuque, une intolérance à la lumière, une diminution du niveau de conscience et une perte auditive.

Le DDC conseille à tous les consommateurs d’éviter de consommer du porc cru ou insuffisamment cuit et du sang frais. Le porc doit être cuit pour atteindre une température interne de 70°C. Il est conseillé aux personnes d'acheter uniquement de la viande de porc réfrigérée provenant de sources fiables, de se laver régulièrement les mains, d'utiliser des ustensiles séparés pour la viande cuite et crue et de porter des gants lors de la manipulation du porc.

NB : On lira avant d’aller en Thaïlande, «Les infections à Streptococcus suis en Thaïlande».

vendredi 28 juillet 2023

Le Michigan signale un cas d’un variant de la grippe lors d’une foire alors qu'une nouvelle étude souligne la menace zoonotique

«Le Michigan signale un cas d’un variant de la grippe lors d’une foire alors qu'une nouvelle étude souligne la menace zoonotique», source article de Lisa Schnirring paru le 27 juillet 2023 dans CIDRAP News.

Le 26 juillet, des responsables de la santé du Michigan ont signalé un cas présumé positif du variant de la grippe humaine H3 impliquant un individu du comté de Lapeer qui a exposé à la foire du comté d'Oakland, qui a eu lieu du 7 au 16 juillet. Dans un communiqué, le Michigan Department of Health and Human Services (MDHHS) a déclaré qu'un prélèvement serait envoyé au Centers for Disease Control and Prevention pour des essais de confirmation.

Dans les développements liés à la grippe zoonotique, des chercheurs qui ont suivi la transmission du virus de la grippe H1N1 en 2009 des huH1N1mains aux porcs ont trouvé des centaines d'introductions depuis 2009, avec au moins 5 sauts de retour aux humains.

Cas annoncé après que des porcs présents à la foire aient montré des symptômes

Le patient était un exposant à la foire. Si le CDC confirme le cas, cela marquerait probablement la première infection du variant H3N2 (H3N2v) de l'été. Alors que les virus de la grippe porcine sont connus pour circuler chez les porcs tout au long de l'année, la transmission à l'homme est relativement rare mais peut se produire, principalement chez ceux qui sont en contact étroit avec les animaux. Une propagation interhumaine limitée, bien que non soutenue, a été signalée au cours des dernières années.

L'annonce du cas humain intervient après une annonce du 17 juillet du comté d'Oakland concernant la détection de la grippe A (grippe porcine) chez plusieurs porcs à la foire du comté d'Oakland. Les porcs ont commencé à montrer des symptômes de maladie le 14 juillet, ce qui a entraîné la fermeture de la porcherie ce soir-là et la surveillance des personnes exposées, y compris les exposants et le personnel de la foire. Les responsables ont également averti le public d'une exposition potentielle.

Plusieurs éclosions liées aux foires ont été signalées en 2012, entraînant 309 cas. Des cas sporadiques similaires continuent d'être signalés, en particulier pendant les mois de foire du comté. Pour la saison grippale 2021-2022, le CDC a signalé cinq cas de H3N2v.

Une étude révèle que le virus de la grippe H1N1 de 2009 a sauté vers des humains et des porcs près de 400 fois

Dans d'autres développements de la grippe zoonotique, des chercheurs de l’USDA qui ont examiné la transmission de l'ancien virus pandémique, maintenant une souche de grippe saisonnière, entre les humains et les porcs de 2009 à 2021 ont découvert qu'il était passé des humains aux porcs 370 fois, principalement lorsque la charge virale était élevée chez les humains.

L'équipe a rapporté ses résultats le 27 juillet dans PLOS Pathogens.

Bien que la circulation du H1N1 chez l'homme en 2009 ait diminué au cours des années de pandémie de la COVID-19 en 2020 et 2021, le virus a continué de circuler chez les porcs. La plupart des passages homme-porc ont été isolés, mais certains ont conduit à une circulation soutenue de différentes lignées H1N1 de 2009 chez les porcs. Au cours de la période d'étude, ils ont trouvé au moins cinq sauts de porcs à des personnes.

Les virus H1N1 de 2009 chez les porcs correspondaient mal aux vaccins contre la grippe saisonnière. Les auteurs ont déclaré que les résultats ajoutent un soutien à la gestion des infections de la grippe A chez les personnes qui sont en contact avec des porcs pour aider à prévenir la transmission aux porcs et les retombées sur les humains.

Mise à jour du 5 août 2023

Le Michigan rapporte en tout deux cas de grippe aviaire humaine en juillet 2023.

Mise à jour du 14 septembre 2023

Doit-on dire influenza aviaire ou grippe aviaire ? Source Anses.
Quand la maladie se manifeste chez les oiseaux, on parle d’influenza aviaire.
Quand un humain est touché par des virus influenza A d’origine aviaire, on parle alors de grippe aviaire.

samedi 24 juin 2023

L'actualité de Brucella en France

«Brucellose en France : 40 nouveaux cas déclarés en 2022 », source Santé publique France.

Santé publique France publie le bilan épidémiologique des cas de brucellose signalés sur l’année 2022 en France. Le nombre de cas de brucellose est revenu au niveau de 2019, en lien avec la reprise des voyages vers les pays considérés comme endémiques.

En France, cette maladie est désormais rare et a considérablement diminué depuis les années 1960, en lien avec l’amélioration de la situation de la maladie chez les ruminants. Actuellement, environ 80% des cas diagnostiqués sur le territoire français sont le résultat d'une infection contractée lors d'un voyage dans un pays où la maladie animale n’est pas maîtrisée. Ces infections surviennent principalement chez des personnes ayant consommé des produits laitiers contaminés ou ayant été en contact direct avec un animal infecté. Des règles d’hygiène et de sécurité permettent de prévenir la maladie.

Chiffres clés de la brucellose en France en 2022

Entre le 1er janvier et le 31 décembre 2022, 40 nouveaux cas de brucellose ont été déclarés en 2022 dans 12 régions françaises dont 10 (25%) en Ile-de-France et 8 (20%) en Auvergne-Rhône-Alpes. 

Trente-quatre souches appartenaient à l’espèce Brucella melitensis, une à l’espèce B. abortus et une n’avait pas été caractérisée. Trente-huit (95%) cas sur 40 étaient liés à des infections « importées » : voyage en Algérie (n=24), Turquie (n=4), Tunisie et Djibouti (n=2 chacun), et Arménie, Chine et Liban (n=1 chacun).

En 2022, troisième année depuis le début de la pandémie de COVID-19, le nombre de cas de brucellose a retrouvé le niveau de 2019 (n=42), en lien avec la reprise des voyages vers des pays considérés comme endémiques.

Selon l’Anses, «De nouvelles connaissances sur des bactéries Brucella émergentes».

De nombreuses découvertes ont été faites ces dernières années sur les bactéries du genre Brucella : de nouvelles espèces ont été découvertes, tandis que d’autres, déjà connues, ont été détectées chez des animaux que l’on ne savait pas porteurs de ces bactéries, ou encore apparaissent en Europe de l’Ouest, comme Brucella canis. Ces bactéries pourraient-elles se transmettre à l’être humain ? Quelles espèces animales sont concernées ? Comment distinguer ces bactéries les unes des autres ?

Depuis une quinzaine d’années, de nouvelles espèces de Brucella ont été découvertes, portées par des animaux aussi divers que des grenouilles, des renards ou des mammifères marins. Le projet IDEMBRU, coordonné par l’Anses et rassemblant 9 partenaires de 8 pays européens (Allemagne, Bulgarie, Espagne, Italie, Royaume-Uni, Pays-Bas, Portugal et France) visait à mieux connaître ces nouvelles bactéries. 

Prédire le risque de transmission à l’être humain

Pour les espèces de Brucella nouvellement découvertes, l’une des questions majeures est de savoir si elles présentent un risque pour l’être humain. « Nous avons développé une méthode d’infection cellulaire in vitro qui donne des indications sur leur pouvoir pathogène pour l’être humain. Jusqu’à présent, peu d’indicateurs de pathogénicité existaient pour ces bactéries, on se basait principalement sur l’identification des bactéries en cause dans les foyers d’infection. », décrit Vitomir Djokic, scientifique au sein de l’unité Zoonoses bactériennes, qui a participé au projet.

Mise à jour du 5 juillet 2023.
Deux chiens et Brucella
L'Anses tweete «Êtes-vous préoccupé par la brucellose canine en Europe ? Lire la publication dans la revue Pathogens sur les investigations moléculaires de deux premiers cas d'infections à Brucella suis Biovar 2 chez des chiens français.» Traduction par mes soins -aa.

mardi 21 mars 2023

Le ‘mystère' sur les origines du SARS-CoV-2 se dissipe peu à peu

Après, Le rapport de l'OMS sur les origines du COVID met en évidence des indices sur un saut animal-humain et Une nouvelle mise à jour sur les origines de la ,COVID-19 souligne l'importance d'une enquête fondée sur des preuves scientifiques, voici que «L'OMS détaille les discussions sur les séquences du SRAS-CoV-2 du marché de Wuhan récemment révélées», source article de Lisa Schnirring paru le 20 mars 2023 dans CIDRAP News.

Au cours du week-end, l'Organisation mondiale de la santé (OMS) a détaillé les conversations avec des chercheurs chinois, son groupe consultatif et des chercheurs internationaux qui ont trouvé des séquences de SRAS-CoV-2 jusqu'alors inconnues à l'épicentre de l'épidémie sur le marché des animaux sur la base de données GISAID.

Le nouveau développement intervient dans le contexte d'un examen minutieux de la Chine, des impacts mondiaux potentiels de son commerce d'espèces sauvages et de la possibilité que le virus provienne d'un laboratoire de la même ville où l'épidémie a commencé.

Des scientifiques de Chine et d'ailleurs interviennent
L'OMS a dit avoir appris les séquences pour la première fois le 12 mars, ce qui a suscité des discussions immédiates avec le Centre chinois de contrôle et de prévention des maladies (CDC de Chine) et deux hauts dirigeants de son groupe stratégique pour les origines des nouveaux agents pathogènes (SAGO pour Strategic Group for the Origins of Novel Pathogens), que l'OMS a créé à l'automne 2022 pour examiner la source des agents pathogènes émergents et réémergents qui ont un potentiel pandémique.

Les séquences d'échantillons prélevés sur le marché de gros de produits de la mer de Huanan à Wuhan, Chine, au début de l'épidémie sont récemment apparues sur GISAID et ont été téléchargées par des chercheurs de plusieurs pays avant que l'accès ne soit restreint, a di l'OMS dans un communiqué.

Des responsables chinois ont dit à l'OMS que les séquences génomiques faisaient partie d'une préimpression de 2022 qui a été soumise pour publication à Nature.

Plus tard le 12 mars, l'OMS a organisé un appel entre le CDC de Chine et certains des chercheurs internationaux qui ont accédé aux données pour discuter de l'importance des résultats. Le 14 mars, l'OMS a réuni l'ensemble du groupe SAGO et a invité des chercheurs chinois à fournir une analyse mise à jour de leurs données originales. L'OMS a également invité les chercheurs internationaux à préciser leur analyse des séquences postées temporairement.

Niveaux élevés d'ADN de chien viverrin
Les nouvelles données provenaient d'échantillons environnementaux provenant d'étals et d'eaux usées du marché collectés dès janvier 2020. Outre le SRAS-CoV-2, certains échantillons contenaient de l'ADN humain ainsi que de l'ADN mitochondrial de plusieurs espèces animales, dont certaines connues pour être sensibles au virus.

L'étude pré-imprimée indique que les chiens viverrins n'ont pas été testés, mais les nouvelles données - montrant des niveaux élevés d'ADN mitochondrial de chien viverrin, ce qui suggère que les chiens viverrins et d'autres animaux pourraient avoir été sur le marché avant qu'il ne soit nettoyé dans le cadre de la riposte à l'épidémie. Des preuves photographiques antérieures ont montré que des chiens viverrins et d'autres animaux étaient vendus dans les étals spécifiques par le passé.

«Bien que cela ne fournisse pas de preuves concluantes quant à l'hôte intermédiaire ou aux origines du virus, les données fournissent des preuves supplémentaires de la présence d'animaux sensibles sur le marché qui pourraient avoir été une source d'infections humaines», a dit l'OMS.

L'OMS a exhorté les scientifiques chinois et les chercheurs internationaux à partager toutes les données liées à l'origine du SRAS-CoV-2. Le groupe a également réitéré son appel à la Chine pour qu'elle enquête sur la provenance des animaux et des produits d'origine animale sur le marché avant sa fermeture. Il a également exhorté la Chine à partager toutes les données de séquençage sur GISAID et à partager son manuscrit en cours d'examen dès que possible.

NB : La photo représente un chien viverrin.

Mise à jour du 22 mars 2023
Un article scientifique a décrit les séquences du SRAS-CoV-2 retrouvé au marché de Huanan de Wuhan. Le président Biden signe un projet de loi sur la déclassification d'informations du renseignement glanées auprès des agences américaines sans nuire à la sécurité nationale. Source CIDRAP News.

Mise à jour du 25 mars 2023
On lira aussi l’article de l’Institut Pasteur du 22 mars 2023, «Origine du SARS-CoV-2 : les recherches se poursuivent».

samedi 18 mars 2023

L'OMS presse la Chine de partager des prélèvements d’un marché lié au SARS-CoV-2 jusqu'alors non divulgués

«L'OMS presse la Chine de partager des prélèvements d’un marché lié au SARS-CoV-2 jusqu'alors non divulgués», source article de Lisa Schnirring du 17 mars 2023 paru dans CIDRAP News. Le blog vous propose que la première partie de cet article consacrée à l’origine du SARS-CoV-2.

Suite à une apparition éphémère de séquences du SARS-CoV-2 provenant d'écouvillons environnementaux du marché de Wuhan qui était l'épicentre précoce de l'épidémie, le directeur général de l'Organisation mondiale de la santé (OMS) a réitéré son appel à la Chine pour qu'elle partage les informations sur le virus avec l'OMS et la communauté scientifique.

Dans d'autres développements liés à la COVID-19, des mises à jour du Centers for Disease Control and Prevention (CDC) des États-Unis montrent que le sous-variant Omicron XBB.1.5 représente désormais environ 90,2% des cas et que les cas, les hospitalisations et les décès continuent de baisser.

Des séquences ajoutent plus de preuves à l’origine animale
Hier soir, des articles de The Atlantic et de Science ont révélé qu’une scientifique française, Flo Debarre, est tombée sur de nouvelles données de séquence sur la base de données de partage du virus GISAID publiée par une équipe de recherche chinoise dirigée par George Gao, qui était l'ancien directeur du Centre chinois de contrôle et de prévention des maladies (CDC de Chine).

En février 2022, l'équipe de Gao, dans une étude avant impression, a dit que des échantillons environnementaux positifs pour le SARS-CoV-2 contenaient également de l'ADN humain, laissant entendre que les humains pourraient avoir introduit le virus sur le marché.

Des scientifiques ont téléchargé et rapidement analysé les séquences nouvellement mises en ligne, qui ont depuis été supprimées par le groupe chinois. Les premiers résultats suggèrent que certains des échantillons de SARS-CoV-2 du marché contiennent de l'ADN ou de l'ARN de chiens viverrins, de civettes et d'autres mammifères, ce qui ajoute davantage de preuves d'un débordement zoonotique comme origine de l'épidémie. Le 7 mars, les scientifiques qui se sont penchés sur les séquences nouvellement publiées ont présenté leurs premiers résultats au Groupe consultatif scientifique de l'OMS sur les origines des nouveaux agents pathogènes (SAGO pour Scientific Advisory Group for the Origins of Novel Pathogens).

Le mystère entourant l’origine du virus, au centre d'un débat intense, a également conduit à la spéculation selon laquelle le virus pourrait provenir d'une fuite de laboratoire, qui a récemment été adoptée, mais avec une faible confiance, par des responsables du renseignement de deux agences gouvernementales américaines, et le directeur génral de l'OMS, Tedros Adhanom Ghebreyesus, a appelé tous les pays à partager ce qu'ils savent.

Lors d'un briefing de l'OMS le 17 mars, Tedros a déclaré que l'OMS avait été informée du séquençage nouvellement publié le 5 mars, ce qui a incité le groupe à demander au CDC chinois de partager les données avec l'OMS et la communauté scientifique internationale.

«Ces données ne fournissent pas de réponse définitive à la question de savoir comment la pandémie a commencé, mais chaque élément de données est important pour nous rapprocher de cette réponse», a déclaré Tedros.

Il a ajouté que toutes les données liées aux origines du SARS-CoV-2 doivent être immédiatement partagées avec la communauté internationale. «Ces données auraient pu et auraient dû être partagées il y a 3 ans.»

Mise à jour du 25 mars 2023
On lira aussi l’article de l’Institut Pasteur du 22 mars 2023, «Origine du SARS-CoV-2 : les recherches se poursuivent».

vendredi 17 mars 2023

L'OMS signale une baisse des cas de variole du singe dans la plupart des régions, mais davantage de décès

«L'OMS signale une baisse de la variole du singe dans la plupart des régions, mais davantage de décès», source article de Lisa Schnirring paru le 16 mars 2023 dans CIDRAP News.

Dans une mise à jour couvrant les deux dernières semaines, l'Organisation mondiale de la santé (OMS) a dit qu'elle avait reçu des rapports faisant état de 323 nouveaux cas de mpox (nouveau nom de monkeypox) et de 11 décès supplémentaires.

Les cas diminuent lentement dans la plupart des régions, mais sans tendance claire à la baisse en Afrique, où le virus se propage avec un schéma mixte de retombées interhumaines et zoonotiques. En dehors de l'Afrique, des pays continuent de signaler des cas sporadiques et de petits cas groupés (clusters).

La région des Amériques a signalé la grande majorité des nouveaux cas au cours des trois dernières semaines, 408 sur 442, le Pacifique occidental signalant une augmentation au cours de la même période avec l'ajout de nouveaux cas en provenance du Japon et de Taïwan. L'OMS a dit que les courbes épidémiques montrent que l'Europe se dirige vers la fin de son épidémie, les niveaux diminuant plus lentement dans les Amériques.

Sur les 11 autres décès, 10 se sont produits dans les Amériques, dont 5 au Pérou, 4 aux États-Unis et 1 au Costa Rica. Le seul décès signalé en dehors des Amériques provenait de Belgique.

Les nouveaux cas et décès portent les totaux mondiaux à respectivement 86 496 et 111 dans 110 pays.

L'OMS a déclaré une urgence de santé publique pour le mpox en juillet 2022 à la suite d'une augmentation des cas interhumains, principalement chez les hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes, en dehors des zones d'Afrique où le virus a infecté de manière persistante les humains en raison d'événements zoonotiques en cours. En février 2023, l'OMS a annoncé qu'elle maintenait en place l'urgence de santé publique de portée internationale pour le mpox en raison d'une activité soutenue dans certains pays, ainsi que de lacunes dans la détection et de rapports tardifs.

Complément
Le virus de la variole du singe a été isolé pour la première fois en 1958, au sein d’une colonie de singes à Copenhague, au Danemark. Ces singes présentaient des lésions cutanées qui évoquaient la variole humaine. D’où le nom de MonkeyPox / variole du singe, attribué à cette maladie.
Bien qu’on l’appelle variole ‘du singe’, ce n’est pas via les singes que cette maladie se transmet à l’humain, mais à partir des rongeurs. La variole du singe se transmet à l’humain à partir des rongeurs (par exemple, en Afrique, les écureuils de forêt ou rat de Gambie). Toutefois, le réservoir animal n’a pas encore été formellement identifié. Source Institut Pasteur.

vendredi 21 octobre 2022

Un enfant de deux ans est décédé dans une éclosion à E. coli liée à un zoo pour enfants; d'autres ont été hospitalisés

«Un enfant de deux ans est décédé dans une éclosion à E. coli liée à un zoo pour enfants; d'autres ont été hospitalisés», source article de Jonan Pilet paru le 21 octobre 2022 dans Food Safety News.

Une épidémie à E. coli producteurs de shigatoxines (STEC) O157:H7 liée à un zoo pour enfants dans le comté de Rutherford, Tennessee, a entraîné la mort d'un enfant de 2 ans, selon un rapport du département de la Santé du Tennessee (TDH).

Le zoo pour enfants, Lucky Ladd Farms, n'a pas été identifié dans le rapport mais a publié une déclaration sur sa page Facebook.

«Nous avons reçu plusieurs demandes d'informations factuelles sur l'éclosion à E. coli qui s'est produite à la ferme l'été dernier et sur l'état actuel et la sécurité sanitaire de la visite de notre établissement.»

«Notre famille et notre personnel continuent d'offrir nos prières et nos sincères condoléances à toutes les personnes touchées par le très triste résultat survenu en juin.» Leur communiqué compler peut être lue ici.

Le TDH a été informé pour la première fois d'un enfant malade hospitalisé en Floride après avoir participé à un camp d'été d'élevage de chèvres dans une ferme locale du comté de Rutherford le 22 juin. Ils ont reçu un deuxième appel le 25 juin de la même mère indiquant qu'elle connaissait un enfant de 2 ans, un ancien patient hospitalisé à l'hôpital Vanderbilt de Nashville, Tennessee, atteint d’un syndrome hémolytique et urémique (SHU) et a signalé que le frère aîné de cet enfant avait fréquenté le même camp.

Le 27 juin, l'équipe des maladies d'origine alimentaire et entérique du TDH a lancé une enquête sur l'éclosion. Lucky Ladd Farms comprenait des attractions telles qu'un zoo pour enfants, des promenades à poney, une pataugeoire, des sentiers pédestres, divers champs et trois établissements de restauration.

Pendant les mois d'été, la ferme a organisé plusieurs camps d'été de cinq jours pour enseigner l'élevage aux enfants de 6 à 10 ans. Entre autres activités, les enfants choisissent un chevreau et s'en occupent pendant le reste du camp. Les enfants ont participé au camp pendant la journée et rentrent chez eux chaque après-midi.

Sur 82 participants au camp d'été, le TDH a identifié trois cas confirmés à E. coli - deux primaires (participants au camp) et un autre secondaire (un membre de la famille d'un participant). L'enfant de 2 ans était un membre de la famille d'un des participants au camp d'été. La TDH a identifié 11 autres cas probables.

Le TDH a conclu que cette éclosion était due à un contact direct avec des chèvres infectées par E. coli O157:H7 avec transmission secondaire à partir de cas. Le TDH suggère que la mise en œuvre des mesures de contrôle en place à la ferme pour minimiser la transmission peut avoir réduit les maladies supplémentaires.

Commentaire
Dans un document récent de Santé publique France sur le «Syndrome hémolytique et urémique pédiatrique en France : chiffres clés 2021», il est rapporté entre autres recommandations,

Il faut éviter le contact des très jeunes enfants (moins de 5 ans) avec les vaches, veaux, moutons, chèvres, etc., et leur environnement ; en cas de contact avec ces animaux le lavage des mains (eau et savon) doit être systématique avant que l’enfant ne porte ses doigts à sa bouche.

Je ne sais pas si cela est fait systématiquement en France, la preuve en est la visite des animaux au salon de l’Agriculture où des enfants peuvent toucher des animaux sans poste de lavage des mains à proximité.

mercredi 19 octobre 2022

Variole du singe : De nouvelles preuves en faveur d'une infection sexuellement transmissible. Qu'en pense Santé publique France ?

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mmunofluorescence démontre que le virus de la variole du singe (vert) peut être détecté dans la lumière épididymaire (rouge), site de maturation et de stockage des spermatozoïdes, d'un macaque crabier atteint d'une infection aiguë par le virus de la variole du singe. Les noyaux étaient contre-colorés en bleu. (Crédit image : Dr Xiankun (Kevin) Zeng, USAMRIID).

Peut-on mettre un mot sur certaines maladies, en l’occurrence les cas de variole du singe ?

Pour Santé publique France, il s’agit de cas d’une zoonose ou maladie transmissible de l’animal à l’homme. Bien entendu, cette maladie peut être qualifiée de zoonose, mais vu le nombre de cas dans le monde, il est plus exact, me semble-t-il, de la qualifier d’infection sexuellement transmissible. Mais est-ce politiquement correct ? Santé publique France n’a sans doute pas voulu s’attirer les foudres de quelques lobbies ...

Dans un précédent article, le blog vous avait informé, «Variole du singe, infection sexuellement transmissible ou non ?» réalisé à partir d’un communiqué de l’Académie de médecine de France, «Variole du singe : zoonose et infection sexuellement transmissible (IST)», et pourtant il y aurait de quoi, mais comme l’on dit pas d’amalgame.

Voici donc un nouvel élément, «Une étude chez les primates montre que la présence du virus de la variole du singe dans les testicules», source article de Stephanie Soucheray paru le 19 octobre dans CIDRAP News.

Pour la première fois, des chercheurs ont dit avoir détecté le virus de la variole du singe dans des testicules de primates non humains pendant la phase aiguë de l'infection, selon une étude publiée dans Nature Microbiology. Bien que l'étude ait impliqué des macaques, elle fournit plus de preuves que le virus de la variole du singe pourrait être transmis sexuellement chez l'homme.

L'étude a été menée par des scientifiques de l'US Army Medical Research Institute of Infectious Diseases (USAMRIID).

Virus retrouvé dans les structures de production du sperme
«Nous avons détecté le virus du monkeypox dans les cellules interstitielles et les tubules séminifères des testicules, ainsi que dans la lumière épididymaire, qui sont les sites de production et de maturation des spermatozoïdes», a dit l'auteur principal Xiankun (Kevin) Zeng de l'USAMRIID dans un communiqué de presse.

Le virus a été retrouvé dans les testicules de deux animaux qui ont survécu à un challenge au virus d ela variole du singe pendant la phase aiguë, et le virus a été détecté dans les testicules jusqu'à 37 jours après l'infection, bien plus longtemps que ce qui était détectable à partir d'autres organes et lésions cutanées.

«Il semble donc plausible que la transmission humaine chez les patients masculins convalescents puisse se produire via le sperme», a déclaré Zeng. Le sperme des singes n'a pas été testé, car les chercheurs utilisaient des échantillons de tissus archivés.

Actuellement, la transmission humaine est comprise comme se produisant par contact direct avec des lésions cutanées, des fluides corporels et des sécrétions respiratoires. Certaines petites études menées cette année ont cependant montré la détection de l'ADN viral du monkeypox dans le sperme de patients.

«Comme le virus de la variole du singe peut être transmis par contact direct avec des fluides corporels, la compréhension de la biologie de l'infection par le virus de la variole du singe des testicules pendant les phases aiguës et de convalescence de la maladie, et l'excrétion dans le sperme, a des implications importantes pour la santé publique», ont conclu les auteurs.

dimanche 25 septembre 2022

Japon : des scientifiques trouvent un grand écart dans les estimations d'Anisakis et les statistiques officielles

«Japon : des scientifiques trouvent un grand écart dans les estimations d'Anisakis et les statistiques officielles», source article de Joe Whitworth paru le 24 septembre 2022 dans Food Safety News.

Des chercheurs ont estimé que le Japon comptait environ 20 000 cas d’anisakidose chaque année en 2018 et 2019. Ces chiffres sont bien supérieurs aux données officielles.

L'anisakidose est une maladie parasitaire causée par des larves d’Anisakidae. La transmission se produit lorsque des larves infectieuses sont ingérées à partir de poissons ou de calmars consommés crus ou insuffisamment cuits. Les Japonais consomment de grandes quantités de fruits de mer et il est courant d'avoir des fruits de mer crus, comme des sushis et des sashimis.

Pour l'anisakidose, il existe une grande différence entre les statistiques d'intoxication alimentaire du ministère de la Santé, du Travail et des Affaires sociales et l'incidence réelle, ont déclaré les chercheurs.

À l'aide d'une base de données des réclamations d'assurance maladie de 2018 à 2019, les scientifiques ont estimé l'incidence annuelle moyenne de l'anisakidose au Japon à 19 737 cas. La base de données couvre plus de 8,4 millions de personnes par an, soit environ 6% de la population totale du Japon.

Le nombre de patients enregistrés dans la base de données était de 991 en 2018 et de 766 en 2019, a constaté l'étude publiée dans la revue du CDC, Emerging Infectious Diseases.

Les chercheurs ont estimé que le nombre personnes atteintes d'anisakidose au Japon était de 21 511 en 2018 et de 17 962 en 2019. Le nombre de patients enregistrés dans les statistiques d'intoxication alimentaire au cours de la même période était considérablement inférieur à 478 en 2018 et 336 en 2019.

Plus d'attention sur l'infection à Anisakis
Le gouvernement du Japon a demandé aux établissements locaux tels que les restaurants et les poissonniers ainsi qu'aux consommateurs de congeler les fruits de mer à -20°C pendant au moins 24 heures avant de les consommer crus ou d'enlever les larves d’Anisakidae pendant la cuisson.

Le ministère de la Santé, du Travail et du Bien-être du Japon fournit des statistiques sur les intoxications alimentaires avec des informations sur les espèces de poissons signalées par les patients et les procédures de préparation associées aux infections pour aider les consommateurs et les poissonniers à éviter l'anisakidose.

Les scientifiques ont également obtenu 189 larves de vers d’Anisakis isolés de 181 patients atteints d'anisakidose dans 30 des 47 préfectures du Japon en 2018 et 2019. Ils ont identifié 168 larves d'Anisakis simplex sensu stricto, 10 larves d'Anisakis pegreffii et 11 larves de Pseudoterranova azarasi.

Au Japon, les parasites Anisakis simplex sont responsables de l'incidence la plus élevée, tandis que les parasites Anisakis pegreffii sont la principale cause en Europe et en Corée du Sud.

Les symptômes de l'anisakidose sont des douleurs abdominales, des nausées, des vomissements, une distension abdominale, de la diarrhée, du sang et du mucus dans les selles et une légère fièvre. Des réactions allergiques accompagnées d'éruptions cutanées et de démangeaisons, ainsi que d'anaphylaxie, peuvent également survenir. Le traitement peut nécessiter l'ablation chirurgicale du ver.

Selon l’Anses, dans les recommandations aux opérateurs, il est rapporté, «La cuisson (60°C à cœur) et la congélation telle que décrite dans le règlement (CE) n°853/2004 du 29 avril 2004, dans des conditions de temps et températures précises (- 20°C en tous points du produit pendant au moins 24 heures), sont les traitements les plus efficaces pour tuer les larves d’Anisakis et Pseudoterranova

Les recommandations aux consommateurs sont :

L’inactivation des larves d’Anisakidae est assurée par :
- une congélation pendant sept jours dans un congélateur domestique,
- une cuisson à cœur (un minute minimum à 60°C à cœur). Une cuisson rose à l’arête est insuffisante pour inactiver les larves potentiellement présentes.
Une éviscération rapide du poisson pêché ou acheté entier est conseillée. La découpe en tranches fines (carpaccio) plutôt qu’en tranches épaisses ou en cubes permet souvent de détecter la présence de parasite. Une larve d’Anisakis coupée en deux morceaux reste capable de pénétrer dans la paroi du tube digestif. Il n’existe pas de mesure permettant d’éviter le risque allergique, seule l’éviction est recommandée en cas d’allergie.

dimanche 11 septembre 2022

Variole du singe, infection sexuellement transmissible ou non ?

Publié le 8 juillet 2022, ce communiqué de l’Académie de médecine de France n’a pas fait grand bruit et n’a pas été repris, «Variole du singe : zoonose et infection sexuellement transmissible (IST)», et pourtant il y aurait de quoi, mais comme l’on dit pas d’amalgame ...

Depuis le 7 mai 2022, une épidémie de cas humains de variole du singe est constatée en Europe, en Amérique du Nord et en Australie. Le 6 juillet 2022, 7146 cas ont été recensés dans 53 pays, dont 577 en France. Cette épidémie révèle des changements majeurs dans l’épidémiologie de cette zoonose tropicale :
– pas de voyage récent en Afrique, à l’exception du premier cas au Royaume-Uni, qui revenait du Nigéria ;
– pas d’origine zoonotique identifiée, mais une transmission interhumaine certaine ou probable ;
– forte prédominance masculine, en majorité des Hommes ayant des relations Sexuelles avec des Hommes (HSH) et ayant des partenaires multiples ;
– prévalence très élevée des localisations génitales et anales de l’éruption vésiculeuse (78% pour 498 cas confirmés en France, situation au 30 juin 2022).

Dans son point au 8 septembre, Santé publique France indique que «La très grande majorité des cas confirmés adultes recensés à ce jour sont de sexe masculin et 73 cas (1,9%) sont de sexe féminin.»

Pour autant, Santé publique France, temple de la bien pensance, s’il en est, n’emploie pas la terminologie d’infection sexuellement transmissible (IST) pour parler de la variole du singe.

Alors que l’Académie nationale de médecine recommande de mettre en œuvre toutes les mesures disponibles permettant de contrôler sa diffusion, notamment de définir sans les stigmatiser les populations à risque.

Unn commentaire récent sur le site de CIDRAP News indique, «No question monkeypox is an STI» (Il ne fait aucun doute, la variole du singe est une infection sexuellement transmissible ou IST), voici quelques extraits.

La question de savoir si la variole du singe (MPX) doit ou non être étiqueté comme une infection sexuellement transmissible (IST) n'est pas vraiment un débat parmi les experts en IST.

Jusqu'à présent, plus de 95% des cas aux États-Unis ont été contractés lors de contacts sexuels entre hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes (HSH). Ne pas appeler cela une IST équivaut presque à dire que la syphilis n'est pas une IST, car les exceptions à la transmission sexuelle sont courantes dans certains contextes.

De manière pragmatique, les HSH doivent être informés que certaines pratiques sexuelles et certains modes de vie les exposent à un risque très élevé de MPX. Ainsi que son contraire : que les expositions sexuelles modifiées peuvent être presque 100 % protectrices.

Le Centers for Disease Control and Prevention a publié le 9 septembre un rapport documentant une association intime entre le MPX et d'autres IST chez les HSH aux États-Unis. Le CDC conseille depuis longtemps de dépister les patients qui ont des IST nouvellement diagnostiquées pour d'autres IST, et il recommande le dépistage des IST à toutes les personnes évaluées pour le MPX, reconnaissant implicitement le MPX comme une IST.

Les cas récemment signalés de MPX chez des personnes autres que les HSH sont similaires à l'évolution de la transmission du VIH au cours des premières années du VIH/SIDA dans les pays industrialisés. Mais la transmission sexuelle dominante du VIH chez les HSH, et sa caractérisation comme une IST chez eux, reste valable.

NB : La photo provient du NIAID

mercredi 22 juin 2022

Hérissons de compagnie, ça peut piquer mais surtout Salmonella inside !

«Une éclosion multiprovinciale de Salmonella Typhimurium au Canada associée à une exposition à des hérissons de compagnie, 2017 à 2020», source Relevé des maladies transmissibles au Canada.

Résumé
Contexte : En octobre 2020, une enquête a été ouverte au Canada sur une éclosion d’infections à Salmonella Typhimurium de la même souche qu’une éclosion concomitante aux États-Unis, liée à des hérissons de compagnie. L’objectif de cet article est d’identifier la source de l’éclosion, de déterminer s’il existe un lien entre les éclosions canadienne et américaine et de définir les facteurs de risque d’infection afin de guider les interventions de santé publique.

Méthodes : Les cas ont été établis par le séquençage du génome entier des isolats de S. Typhimurium. Des renseignements ont été recueillis sur les expositions des cas, y compris les contacts avec les animaux. Des spécimens de hérissons et de l’environnement ont été testés pour S. Typhimurium et une enquête de traçabilité a été menée.

Résultats : Il y avait 31 cas dans six provinces, avec des dates d’apparition de la maladie allant du 1er juin 2017 au 15 octobre 2020. L’âge médian des cas était de 20 ans et 52% étaient des femmes. Les isolats ont été regroupés entre 0 et 46 différences d’allèles lors du typage de séquence du génome entier sur plusieurs locus. Sur les 23 cas pour lesquels on disposait de renseignements sur l’exposition, 19 (83%) ont déclaré avoir été en contact avec des hérissons dans les sept jours précédant les symptômes; 15/18 (83%) ont déclaré un contact direct et 3/18 (17%) un contact indirect. L’enquête de traçabilité n’a pas permis d’établir une source commune de hérissons, mais a mis en évidence une industrie dotée d’un réseau de distribution complexe. La souche de l’éclosion a été détectée dans des échantillons prélevés sur un hérisson au domicile d’un des cas et sur un hérisson dans un zoo du Québec.

Conclusion: Le contact direct et indirect avec des hérissons a été établi comme la source de cette éclosion de S. Typhimurium. Les communications de santé publique visaient à sensibiliser aux risques de zoonoses liés aux hérissons et à faire connaître les principales pratiques d’hygiène permettant de réduire la transmission des maladies.

NB : Merci à Joe Whitworth de m’avoir signalé l’information.

Aux lecteurs du blog
Je suis en conflit depuis plusieurs années avec la revue PROCESS Alimentaire pour une triste question d’argent qui permettrait de récupérer et de diffuser correctement les 10 052 articles initialement publiés gracieusement par mes soins de 2009 à 2017 sur le blog de la revue, alors qu’elle a bénéficié de la manne de la publicité faite lors de la diffusion de ces articles. La revue PROCESS Alimentaire s’est comportée, continue de se comporter en censeur et refuse tout assouplissement pour la modique somme de 500 euros. N’ayant pas les moyens d’aller devant la justice, je leur fait ici de la publicité gratuite. Derrière cette revue, il y a une direction dégueulasse et un rédacteur en chef complice !