Chine : Un employé du fabricant de bière Tsingtao aurait uriné dans un conteneur de malt

Il s'agit d'une vidéo virale montrant comment un employé présumé de la Tsingtao Beer Factory 3 escalade un mur sur le site de production de matières premières et commence à uriner. Beaucoup de gens pensent qu'il s'agit d'une opération d'infiltration menée par une entreprise concurrente : une personne a fait pipi, une autre a divulgué la vidéo ... 

This is the viral video showing how an alleged worker at the Tsingtao Beer Factory 3 climbs over a wall at the raw material production site and starts to urinate. Many people think it's an undercover operation by a rivaling company: one person peed, another leaked the video? 🍻🤢 pic.twitter.com/eJcYljo2aQ

— Manya Koetse (@manyapan) October 21, 2023

Le brasseur chinois Tsingtao a annoncé vendredi avoir ouvert une enquête après qu’une vidéo montrant un employé de l’usine urinant sur des matières premières est devenue virale cette semaine.

Les images, publiées en ligne jeudi, montrent prétendument un ouvrier d’un entrepôt de Tsingtao Brewery Co., l’un des plus grands fabricants de bière de Chine, grimpant dans un grand conteneur et se soulageant sur son contenu.

La vidéo a largement circulé sur les réseaux sociaux chinois, enregistrant des dizaines de millions de vues sur la plateforme populaire Weibo.

Tsingtao a indiqué vendredi avoir contacté la police au sujet de l’incident et qu’une enquête était en cours.

«Notre société attache une grande importance à la vidéo de la brasserie Tsingtao n°3 qui a été diffusée le 19 octobre», a déclaré le fabricant de bière dans un communiqué.

«Nous avons signalé l’incident à la police le plus tôt possible et les organes de sécurité publique participent à l’enquête», a-t-il ajouté. «À l’heure actuelle, le lot de malt en question a été entièrement scellé. L’entreprise continue à renforcer ses procédures de gestion et à garantir la qualité de ses produits».

Tsingtao, deuxième brasseur de Chine, est l’une des marques de boissons les plus connues du pays, et ses grandes bouteilles de bière blonde sont présentes dans la plupart des bars et restaurants d’Asie de l’Est. Source Le journal de Québec.

Taux élevé de S. aureus résistants retrouvés dans des produits alimentaires chinois

«Taux élevé de S. aureus résistants retrouvés dans des produits alimentaires chinois», source article de Chris Dall paru le 6 septembre 2023 dans CIDRAP News.

Une nouvelle étude menée par des chercheurs chinois met en évidence la menace de Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM) et multirésistant aux antibiotiques (MDR pour multidrug-resistant) dans des aliments conditionnés.

Dans l'étude, publiée la semaine dernière dans la revue Zoonoses, des chercheurs du China National Center for Food Safety Risk Assessment ont analysé 276 isolats de S. aureus associés aux aliments prêts à consommer collectés dans des supermarchés, des dépanneurs, des fast-foods et des marchés de produits agricoles dans 25 provinces de Chine en 2018. Les chercheurs ont évalué la sensibilité aux antimicrobiens, les facteurs de virulence et les caractéristiques moléculaires.

En 2015, des chercheurs chinois ont signalé que 4,3% des aliments vendus au détail étaient contaminés par S. aureus, qui peut provoquer une intoxication alimentaire à staphylocoques, et qu'un pourcentage beaucoup plus élevé de contamination a été retrouvé dans les aliments prêts à consommer. Mais la prévalence et les caractéristiques épidémiques du SARM dans les aliments prêts à consommer n’avaient pas été établies.

S. aureus résistants à la méthicilline et MDR assez courants

Sur les 276 isolats analysés, 250 (90,6%) étaient résistants à au moins un agent antimicrobien et 73 (26,4%) étaient MDR (résistants à trois antimicrobiens ou plus). Parmi les isolats de MDR, 30 isolats de SARM ont été identifiés et neuf gènes de toxines ont été détectés, 18 (60%) des isolats de SARM hébergeant plusieurs gènes de toxines. Treize types de séquences ont été identifiés. Les lignées de SARM les plus répandues étaient CC59-t437-SCCmecIV/V (23,3%), CC398-t011-SCCmecV (23,3%) et CC1-t114-SCCmecIV (16,7%).

L’étude a également révélé que la diversité génotypique des isolats de SARM était liée aux gènes de résistance aux antimicrobiens et de virulence.

«Ces résultats suggèrent que la surveillance des génotypes de SARM dans les aliments prêts à consommer serait déterminante pour tracer la source de contamination et évaluer la résistance aux antimicrobiens et le risque d’intoxication alimentaire à staphylocoques», ont-ils écrit. «Par conséquent, un tel travail sera utile pour aider le gouvernement, les industries alimentaires et d'autres parties prenantes à améliorer les mesures de sécurité des aliments et à maîtriser la voie de transmission de cette bactérie.»

NB : La photo est du NIAID.

La Chine enregistre une augmentation des épidémies d’origine alimentaire

«La Chine enregistre une augmentation des épidémies d’origine alimentaire», source article de Joe Whitworth paru le 25 août 2023 dans Food Safety News.

Le nombre de foyers de cas d'origine alimentaire en Chine a augmenté sur 10 ans, selon une étude.

Les chercheurs ont analysé la cause des foyers de cas de maladies d’origine alimentaire dans les ménages de 2010 à 2020 à l’aide des données du Système national de surveillance des maladies d’origine alimentaire.

Au total, 17 985 foyers, qui ont entraîné 73 252 personnes malades, 38 829 hospitalisations et 1 269 décès, ont été signalés. La plupart des épisodes se sont produits de mai à octobre, et le nombre le plus élevé s'est produit en juillet.

Une étude similaire, publiée dans China CDC Weekly, avait examiné les éfoyers de cas dans les établissements de restauration du pays en utilisant des données de la même période.

Problème liés aux champignons sauvages

Les champignons, principalement des champignons vénéneux, constituent la catégorie alimentaire la plus impliquée, avec 8 873 foyers de cas familiaux. Le deuxième groupe concernait les plantes toxiques et leurs produits, avec 1 552. Ceux-ci incluent l'aconit, l'herbe potagère, les graines ou l'huile d'abrasin, la gourde amère et le fruit Masang. Les champignons étaient le principal agent étiologique, avec 31 125 cas de maladie et 736 décès.

Les foyers de cas domestiques sont passées de 118 en 2010 à 4 140 en 2020. Près de 700 foyers de cas étaient dues à des aliments inconnus. Les produits alcoolisés sont à l'origine du taux de mortalité le plus élevé, selon l'étude publiée dans la revue Foodborne Pathogens and Disease.

Salmonella était le principal pathogène bactérien avec 437 foyers, et le principal agent chimique était le nitrite, provoquant 476 foyers. Des substances toxiques, la tétrodotoxine (TTX) et la saxitoxine étaient les principales toxines animales toxiques.

Norovirus était le principal virus, avec 13 foyers. La cause était inconnue pour plus de 4 200 foyers avec 75 décès.

Les saponines végétales toxiques se trouvaient principalement dans les légumes. Les œufs et les ovoproduits étaient principalement contaminés par Salmonella, suivis de la viande et des produits carnés contenant le même agent pathogène. Les pesticides chimiques se trouvaient principalement dans les légumes.

Aborder les problèmes

Les chercheurs ont déclaré que la plupart des épidémies liées aux champignons vénéneux se sont produites dans le sud-ouest de la Chine, notamment dans les provinces du Yunnan, du Hunan et du Guizhou.

Les épidémies liées aux produits végétaux étaient principalement causées par une mauvaise transformation. Le caractère immangeable et la mauvaise utilisation, notamment les erreurs d'identification, étaient les principaux facteurs contribuant aux maladies liées aux champignons vénéneux, principalement dans le sud-ouest de la Chine. La principale cause de contamination par Salmonella dans la viande et les produits carnés était une mauvaise transformation et un mauvais stockage.

«La raison en est que les champignons sauvages vénéneux ressemblent en apparence aux champignons comestibles et qu'il est difficile pour les personnes ordinaires de distinguer les champignons comestibles des champignons vénéneux sans un équipement approprié. Cette étude a montré que des interventions ciblées visant à réduire les intoxications aux champignons sont essentielles en Chine», ont dit les chercheurs.

«Une intoxication grave, voire mortelle, aux racines d'aconit peut survenir après avoir consommé des soupes aux herbes et des aliments préparés à partir de racines d'aconit. Si des préparations crues et de grandes quantités de racine d’aconit sont utilisées, même une ébullition prolongée peut ne pas avoir d’effet protecteur.

«Toutes les régions devraient renforcer la surveillance du marché et améliorer la surveillance en laboratoire des bactéries pathogènes telles que Salmonella dans la viande. Les résidents devraient les sensibiliser à la sécurité des aliments et garantir la sécurité de la viande en transformant la viande et les aliments crus séparément et en les stockant en toute sécurité.»

Les agences de santé publique devraient également renforcer la surveillance des maladies d'origine alimentaire afin d'en réduire les risques.

«Les gouvernements devraient renforcer la surveillance des provinces où l'incidence des maladies d'origine alimentaire est élevée, en particulier pendant les hautes saisons. En outre, l’éducation sanitaire pour les personnes manipulant des aliments au sein des ménages, comme un comportement approprié en matière de manipulation des aliments et l’accent mis sur l’hygiène en cuisine, devrait être renforcée pour sensibiliser les résidents à la sécurité alimentaire et réduire efficacement l’apparition de maladies d’origine alimentaire au sein des familles», ont dit les chercheurs.

Les scientifiques ont dit qu’il était nécessaire de changer la compréhension des plantes d’aconit. Les racines d’aconit sont utilisées pour préparer des soupes et des repas aux herbes pour leurs effets bénéfiques sur la santé.

De la sécurité des aliments en Chine ?

L’auteur de ce tweet indique avoir par le passé déjà publié une vidéo similaire. Seulement dans la précédente, c'était un homme qui faisait cela. Cela est devenu une pratique assez courante de réutiliser l'huile de gouttière ou de l’huile de poubelle pour nourrir les personnes afin d'améliorer la rentabilité.

I remember tweeting a similar video a while ago. Only in that one, it was a man doing this.
In #CCPChina, it has become a fairly common practice to reuse gutter oil/trashcan oil to feed people to improve profitability.#CCP #China #Chinanews #FoodSafety pic.twitter.com/B3rXoG5Wkq

— Inconvenient Truths by Jennifer Zeng 曾錚真言 (@jenniferzeng97) July 21, 2023

La Chine révèle une décennie de données des toxi-infections alimentaires collectives dans les sites de restauration

«La Chine révèle une décennie de données des toxi-infections alimentaires collectives des sites de restauration», source article de Joe Whitworth paru le 10 juillet 2023 dans Food Safety News.

Vibrio et Salmonella sont les principaux agents pathogènes bactériens liés aux épidémies dans les établissements de restauration, selon une décennie de données d'incidents en Chine.

De 2010 à 2020, les établissements de restauration en Chine ont signalé 18 331 intoxications alimentaires, qui ont entraîné 206 718 cas de maladie, 68 561 hospitalisations et 201 décès.

Il y a eu 5 607 foyers d’intoxication alimentaire dans des restaurants, 2 876 intoxications alimentaires liées à des vendeurs de rue et 2 560 dans des cantines d'employés. Les banquets ruraux et les vendeurs de rue ont été associés respectivement à 64 et 34 décès. Les données proviennent du système de surveillance des épidémies de maladies d'origine alimentaire (FDOSS pour Foodborne Disease Outbreak Surveillance System).

Le nombre médian de patients par épidémie était de 15, avec une médiane de trois hospitalisations par événement, selon l'étude publiée dans la revue China CDC Weekly.

Des études antérieures ont montré qu'une maîtrise inadéquat du temps et de la température, une mauvaise hygiène de la cuisine et la présence de manipulateurs d'aliments infectés dans les établissements de restauration contribuent aux maladies d'origine alimentaire.

Agent pathogène derrière les incidents

Le nombre de foyers de cas et le nombre de cas a grimpé rapidement de 2010 à 2018, avec un pic de 3 610 foyers de cas et 31 230 cas en 2018. Une diminution en 2020 pourrait être liée à la pandémie de COVID-19 et aux mesures de maîtrise, a révélé l'étude.

Les micro-organismes pathogènes étaient la principale cause d'épidémies dans les régions du sud, du nord-ouest, de l'est, du centre et du nord de la Chine, tandis que les animaux, les végétaux et les champignons toxiques étaient la principale cause dans les régions du nord-est et du sud-ouest.

Les incidents liés aux produits chimiques ont entraîné le plus de décès dans les régions du nord-est, du nord-ouest, du centre et du nord. Alors que les animaux et les plantes toxiques étaient la principale cause de décès dans les régions du sud et de l'est. Les champignons toxiques représentaient les taux de mortalité les plus élevés dans la région du sud-ouest.

Les agents pathogènes représentaient 4 883 foyers de cas, 94 047 cas, 32 170 hospitalisations et 21 décès. Les animaux, les plantes et les champignons toxiques étaient responsables de 3 279 foyers de cas, 30 698 cas, 12 338 hospitalisations et 95 décès. La cause était inconnue pour plus de 18 500 foyers de cas avec 21 décès.

Des substances chimiques, telles que le méthanol et les nitrites, ont causé 63 décès. Vibrio parahaemolyticus, Salmonella et Staphylococcus aureus étaient les agents pathogènes les plus répandus, entraînant 3 333 foyers de cas, 60 520 cas, 21 491 hospitalisations et neuf décès.

Les produits carnés, les produits aquatiques et les légumes ont été associés respectivement à 2 724, 1 595 et 1 571 foyers de cas entre 2010 et 2020.

Foyers de cas d’intoxication alimentaire par cause

Les principales causes de foyers de cas d’intoxication alimentaire dans les restaurants étaient la transformation incorrecte, l'ingestion accidentelle et la contamination croisée. Les principales causes chez les vendeurs de rue étaient l'ingestion accidentelle, un stockage inapproprié et un traitement inadéquat. Les cantines du personnel ont connu des foyers de cas d’intoxication alimentaire principalement dus à une cuisson insuffisante, à une ingestion accidentelle et à un traitement inapproprié.

Malgré la présence de systèmes de management de la sécurité des aliments dans de nombreux restaurants et cafétérias, la mise en œuvre n'a pas toujours été efficace, ont dit les chercheurs. Les mesures de maîtrise comprennent une éducation à la santé publique sur les maladies d'origine alimentaire sur ces sites et une formation régulière à la sécurité des aliments pour les employés et les gestionnaires des restaurants.

Les produits aquatiques contaminés par Vibrio parahaemolyticus dans les restaurants et les banquets ruraux, ainsi que les lectines dans les haricots rouges dans les cantines du personnel, ont été les principaux contributeurs des foyers de cas d’intoxication alimentaire dans les opérations de restauration.

«En raison de l'évolution des habitudes alimentaires et de la nature trépidante de la vie moderne, un nombre croissant de personnes ont choisi de dîner dans des établissements de restauration ces dernières années. Il a été documenté qu'une variété de risques pour la sécurité des aliments existent dans les établissements de restauration, tels que les restaurants, y compris ceux associés aux ingrédients alimentaires, aux pratiques de manipulation, à l'entreposage et au transport. Ces risques peuvent contribuer à l'apparition foyers de cas de maladies d'origine alimentaire.»

Commentaire

Bien entendu, ce ne sont, à mon sens, que des estimations. Ces données me semblent être que la partie émergée de l’iceberg des toxi-infections alimentaires collectives, d'où l'idée de faire encore un effort ...

Une agence de renseignement américaine publie des évaluations déclassifiées des fuites du laboratoire de Wuhan sur le SARS-CoV-2

«Une agence de renseignement américaine publie des évaluations déclassifiées des fuites du laboratoire de Wuhan sur le SARS-CoV-2», source article de Lisa Schnirring paru le 26 juin 2023 dans CIDRAP News.

Le directeur de l’US Office of the Director of National Intelligence (ODNI) a publié le 23 juin un rapport déclassifié sur ce que les agences de renseignement américaines savent des liens potentiels entre l'Institut de virologie de Wuhan (WIV) et l'origine du virus SARS-CoV-2.

Début mars, les deux chambres du Congrès ont adopté une loi visant à déclassifier ce que les agences américaines ont découvert, à la suite de rapports selon lesquels deux d'entre elles, le Federal Bureau of Investigation (FBI) et le Department of Energy (DOE), ont découvert avec une faible confiance qu'une fuite de laboratoire était la cause. L’origine la plus probable. D'autres agences, également avec une faible confiance, ont déclaré qu'un saut des animaux aux humains était la source la plus probable.

Le président Biden a signé la loi le 20 mars, qui ordonnait à l'ODNI de déclassifier les informations dans un délai de 90 jours.

Selon Associated Press, quatre agences penchent toujours vers la source d'origine naturelle, tandis que le FBI et le DOE penchent toujours vers une fuite de laboratoire. Deux autres, dont la Central Intelligence Agency, n'ont pas fait d'évaluations.

Concernant les rapports de maladies parmi le personnel du WIV avant l'épidémie de pneumonie inexpliquée à Wuhan, le rapport de l'ODNI indique que plusieurs personnes sont tombées légèrement malades à l'automne 2019, avec une gamme de symptômes, notamment des rhumes et des allergies, avec des symptômes qui ne sont généralement pas associés à la COVID-19.

Certains avaient des maladies confirmées qui n'étaient pas liées au COVID. Aucune hospitalisation n'a été signalée pour des conditions similaires au COVID, bien qu'un employé de laboratoire ait pu être traité pour une affection non respiratoire.

NB : Photo NIAID / Flickr cc.

Le virus de la grippe aviaire se propage en catimini

«Ce que les précédentes épidémies de grippe aviaire nous apprennent », source communiqué de  Ecole polytechnique fédérale de Zurich (ETHZ).

Des chercheurs de l'EPF Zurich ont analysé l'épidémie de grippe aviaire causée par la souche H7N9 qui a touché la Chine de 2013 à 2017. De nouveaux arbres phylogénétiques permettront d'améliorer la surveillance des futures épidémies de grippe aviaire.

Résumé

- L'épidémie de grippe aviaire en Chine de 2013 à 2017 a montré que des agents pathogènes peuvent circuler dans les élevages avicoles pendant plusieurs mois avant d'être détectés.

- Les virus se propagent rapidement sur les marchés de volailles vivantes.

- Les auteurs de l'étude suggèrent de surveiller en permanence la santé des animaux.

L’étude a été publié dans PNAS.

Il existe de nombreux virus différents de la grippe aviaire. Outre le sous-type H5N1, qui se propage dans la population d'oiseaux sauvages européens depuis plusieurs années et constitue une menace pour les élevages avicoles locaux, il existe également, par exemple, le sous-type H7N9. Celui-ci a provoqué des épidémies de volailles en Chine de 2013 à 2017 et a également infecté des humains qui ont été en contact étroit avec des volailles vivantes.

Au total, 616 personnes en Chine seraient mortes d'une infection par ce sous-type.

Les experts suivent l'évolution des différents virus de la grippe aviaire. Avec H7N9 et d'autres sous-types, il existe un risque que des mutations dans leur génome puissent permettre une transmission interhumaine, augmentant ainsi la menace d'une pandémie.

C'est pourquoi Claire Guinat, ancienne post-doctorante dans le groupe de la professeure de l’ETHZ Tanja Stadler, a étudié les vagues de l'épidémie de H7N9 en Chine entre 2013 et 2017. Cela a impliqué les chercheurs analysant des séquences génétiques publiées de virus H7N9 isolés d'humains et de volailles infectés pour construire des arbres phylogénétiques. . Les chercheurs du Département des sciences et de l'ingénierie des biosystèmes de l'ETH Zurich à Bâle visaient à comprendre comment la maladie se propageait sur les marchés de la volaille et à tirer des conclusions qui aideraient à améliorer les efforts futurs pour surveiller et contrôler les épidémies de grippe aviaire.

Les marchés de volailles vivantes jouent un rôle clé

En Chine, les poulets et autres volailles sont souvent vendus vivants sur les marchés. On sait depuis longtemps que ces marchés jouent un rôle clé dans la transmission de la grippe aviaire, à la fois d'animal à animal et d'animal à humain.

Grâce à leurs analyses phylogénétiques, les chercheurs de l'ETH Zurich ont confirmé que le virus H7N9 circulait probablement dans les volailles pendant plusieurs mois avant d'être découvert à la fois sur les marchés de la volaille et chez l'homme. Leurs résultats suggèrent également que davantage de marchés de volailles pourraient avoir été touchés qu'on ne le pensait auparavant. Surtout entre 2013 et 2016, lorsque le virus a provoqué peu de symptômes chez les volailles, ce qui a rendu difficile la détection des épidémies. Comme le virus a muté et provoqué des symptômes plus graves chez les volailles à partir de 2016, il est devenu plus facile de reconnaître les volailles atteintes.

«Nos résultats montrent qu'il est préférable de ne pas attendre jusqu'à l'apparition des premiers cas, car le virus circule alors vraisemblablement depuis plus longtemps», indique Tanja Stadler. «Il conviendrait plutôt selon elle de procéder à des tests réguliers dans les élevages ou sur les marchés de volailles.»

Toujours en alerte

Les chercheurs se sont principalement concentrés sur l'analyse des virus des régions métropolitaines de Shanghai et du Guangdong. Leurs découvertes suggèrent que le virus avait largement circulé dans les marchés de volailles de ces régions. Bien qu'il existe une possibilité théorique que le virus soit introduit à plusieurs reprises entre les régions en raison du transport d'oiseaux infectés, les arbres phylogénétiques n'ont indiqué aucun schéma clair d'une introduction aussi régulière du virus entre les régions. Cela indique que les marchés de volailles vivantes dans les régions urbaines ont joué un rôle clé dans l'incidence de la maladie. «Compte tenu de la gravité d'épidémies comme celle-ci, il est crucial que chaque région touchée prenne des mesures immédiates pour arrêter la propagation du virus», dit Guinat, qui travaille désormais à l'INRAE de Toulouse.

L'épidémie de H7N9 était limitée à la Chine ; le pays a commencé à vacciner les volailles contre cet agent pathogène en 2017. Parallèlement à l'amélioration des mesures d'hygiène sur les marchés de volailles, les autorités ont pu réduire l'épidémie chez les animaux et réduire considérablement les cas de transmission à l'homme. Mais des épidémies isolées de la maladie se produisent encore. Le dernier décès humain résultant de complications d'une infection par le H7N9 remonte à 2019. Étant donné que les génomes du virus mutent constamment, il subsiste un risque que le virus H7N9 redevienne une menace pour l'homme. Les experts de la santé publique restent donc en alerte.

Le ‘mystère' sur les origines du SARS-CoV-2 se dissipe peu à peu

Après, Le rapport de l'OMS sur les origines du COVID met en évidence des indices sur un saut animal-humain et Une nouvelle mise à jour sur les origines de la ,COVID-19 souligne l'importance d'une enquête fondée sur des preuves scientifiques, voici que «L'OMS détaille les discussions sur les séquences du SRAS-CoV-2 du marché de Wuhan récemment révélées», source article de Lisa Schnirring paru le 20 mars 2023 dans CIDRAP News.

Au cours du week-end, l'Organisation mondiale de la santé (OMS) a détaillé les conversations avec des chercheurs chinois, son groupe consultatif et des chercheurs internationaux qui ont trouvé des séquences de SRAS-CoV-2 jusqu'alors inconnues à l'épicentre de l'épidémie sur le marché des animaux sur la base de données GISAID.

Le nouveau développement intervient dans le contexte d'un examen minutieux de la Chine, des impacts mondiaux potentiels de son commerce d'espèces sauvages et de la possibilité que le virus provienne d'un laboratoire de la même ville où l'épidémie a commencé.

Des scientifiques de Chine et d'ailleurs interviennent

L'OMS a dit avoir appris les séquences pour la première fois le 12 mars, ce qui a suscité des discussions immédiates avec le Centre chinois de contrôle et de prévention des maladies (CDC de Chine) et deux hauts dirigeants de son groupe stratégique pour les origines des nouveaux agents pathogènes (SAGO pour Strategic Group for the Origins of Novel Pathogens), que l'OMS a créé à l'automne 2022 pour examiner la source des agents pathogènes émergents et réémergents qui ont un potentiel pandémique.

Les séquences d'échantillons prélevés sur le marché de gros de produits de la mer de Huanan à Wuhan, Chine, au début de l'épidémie sont récemment apparues sur GISAID et ont été téléchargées par des chercheurs de plusieurs pays avant que l'accès ne soit restreint, a di l'OMS dans un communiqué.

Des responsables chinois ont dit à l'OMS que les séquences génomiques faisaient partie d'une préimpression de 2022 qui a été soumise pour publication à Nature.

Plus tard le 12 mars, l'OMS a organisé un appel entre le CDC de Chine et certains des chercheurs internationaux qui ont accédé aux données pour discuter de l'importance des résultats. Le 14 mars, l'OMS a réuni l'ensemble du groupe SAGO et a invité des chercheurs chinois à fournir une analyse mise à jour de leurs données originales. L'OMS a également invité les chercheurs internationaux à préciser leur analyse des séquences postées temporairement.

Niveaux élevés d'ADN de chien viverrin

Les nouvelles données provenaient d'échantillons environnementaux provenant d'étals et d'eaux usées du marché collectés dès janvier 2020. Outre le SRAS-CoV-2, certains échantillons contenaient de l'ADN humain ainsi que de l'ADN mitochondrial de plusieurs espèces animales, dont certaines connues pour être sensibles au virus.

L'étude pré-imprimée indique que les chiens viverrins n'ont pas été testés, mais les nouvelles données - montrant des niveaux élevés d'ADN mitochondrial de chien viverrin, ce qui suggère que les chiens viverrins et d'autres animaux pourraient avoir été sur le marché avant qu'il ne soit nettoyé dans le cadre de la riposte à l'épidémie. Des preuves photographiques antérieures ont montré que des chiens viverrins et d'autres animaux étaient vendus dans les étals spécifiques par le passé.

«Bien que cela ne fournisse pas de preuves concluantes quant à l'hôte intermédiaire ou aux origines du virus, les données fournissent des preuves supplémentaires de la présence d'animaux sensibles sur le marché qui pourraient avoir été une source d'infections humaines», a dit l'OMS.

L'OMS a exhorté les scientifiques chinois et les chercheurs internationaux à partager toutes les données liées à l'origine du SRAS-CoV-2. Le groupe a également réitéré son appel à la Chine pour qu'elle enquête sur la provenance des animaux et des produits d'origine animale sur le marché avant sa fermeture. Il a également exhorté la Chine à partager toutes les données de séquençage sur GISAID et à partager son manuscrit en cours d'examen dès que possible.

NB : La photo représente un chien viverrin.

Mise à jour du 22 mars 2023
Un article scientifique a décrit les séquences du SRAS-CoV-2 retrouvé au marché de Huanan de Wuhan. Le président Biden signe un projet de loi sur la déclassification d'informations du renseignement glanées auprès des agences américaines sans nuire à la sécurité nationale. Source CIDRAP News.

Mise à jour du 25 mars 2023
On lira aussi l’article de l’Institut Pasteur du 22 mars 2023, «Origine du SARS-CoV-2 : les recherches se poursuivent».

L'OMS presse la Chine de partager des prélèvements d’un marché lié au SARS-CoV-2 jusqu'alors non divulgués

«L'OMS presse la Chine de partager des prélèvements d’un marché lié au SARS-CoV-2 jusqu'alors non divulgués», source article de Lisa Schnirring du 17 mars 2023 paru dans CIDRAP News. Le blog vous propose que la première partie de cet article consacrée à l’origine du SARS-CoV-2.

Suite à une apparition éphémère de séquences du SARS-CoV-2 provenant d'écouvillons environnementaux du marché de Wuhan qui était l'épicentre précoce de l'épidémie, le directeur général de l'Organisation mondiale de la santé (OMS) a réitéré son appel à la Chine pour qu'elle partage les informations sur le virus avec l'OMS et la communauté scientifique.

Dans d'autres développements liés à la COVID-19, des mises à jour du Centers for Disease Control and Prevention (CDC) des États-Unis montrent que le sous-variant Omicron XBB.1.5 représente désormais environ 90,2% des cas et que les cas, les hospitalisations et les décès continuent de baisser.

Des séquences ajoutent plus de preuves à l’origine animale

Hier soir, des articles de The Atlantic et de Science ont révélé qu’une scientifique française, Flo Debarre, est tombée sur de nouvelles données de séquence sur la base de données de partage du virus GISAID publiée par une équipe de recherche chinoise dirigée par George Gao, qui était l'ancien directeur du Centre chinois de contrôle et de prévention des maladies (CDC de Chine).

En février 2022, l'équipe de Gao, dans une étude avant impression, a dit que des échantillons environnementaux positifs pour le SARS-CoV-2 contenaient également de l'ADN humain, laissant entendre que les humains pourraient avoir introduit le virus sur le marché.

Des scientifiques ont téléchargé et rapidement analysé les séquences nouvellement mises en ligne, qui ont depuis été supprimées par le groupe chinois. Les premiers résultats suggèrent que certains des échantillons de SARS-CoV-2 du marché contiennent de l'ADN ou de l'ARN de chiens viverrins, de civettes et d'autres mammifères, ce qui ajoute davantage de preuves d'un débordement zoonotique comme origine de l'épidémie. Le 7 mars, les scientifiques qui se sont penchés sur les séquences nouvellement publiées ont présenté leurs premiers résultats au Groupe consultatif scientifique de l'OMS sur les origines des nouveaux agents pathogènes (SAGO pour Scientific Advisory Group for the Origins of Novel Pathogens).

Le mystère entourant l’origine du virus, au centre d'un débat intense, a également conduit à la spéculation selon laquelle le virus pourrait provenir d'une fuite de laboratoire, qui a récemment été adoptée, mais avec une faible confiance, par des responsables du renseignement de deux agences gouvernementales américaines, et le directeur génral de l'OMS, Tedros Adhanom Ghebreyesus, a appelé tous les pays à partager ce qu'ils savent.

Lors d'un briefing de l'OMS le 17 mars, Tedros a déclaré que l'OMS avait été informée du séquençage nouvellement publié le 5 mars, ce qui a incité le groupe à demander au CDC chinois de partager les données avec l'OMS et la communauté scientifique internationale.

«Ces données ne fournissent pas de réponse définitive à la question de savoir comment la pandémie a commencé, mais chaque élément de données est important pour nous rapprocher de cette réponse», a déclaré Tedros.

Il a ajouté que toutes les données liées aux origines du SARS-CoV-2 doivent être immédiatement partagées avec la communauté internationale. «Ces données auraient pu et auraient dû être partagées il y a 3 ans.»

Mise à jour du 25 mars 2023
On lira aussi l’article de l’Institut Pasteur du 22 mars 2023, «Origine du SARS-CoV-2 : les recherches se poursuivent».

Trois ans après son apparition, l'OMS abandonne son plan pour la phase 2 de l'étude sur l'origine du SARS-CoV-2

«L'OMS abandonne son plan pour la phase 2 de l'étude sur l'origine du SARS-CoV-2», source article de Lisa Schnirring paru le 14 février 2023 dans CIDRAP News.

L'Organisation mondiale de la santé (OMS) a abandonné les plans pour la deuxième phase de son étude sur les origines du virus SARS-CoV-2 en raison des difficultés rencontrées pour mener des études clés en Chine, a rapporté la revue Nature, citant Maria Van Kerkhove, responsable technique de l'OMS pour le COVID-19.

Une équipe internationale dirigée par l'OMS a passé 4 semaines en Chine en janvier 2021 pour enquêter sur la source du virus. Ils ont publié leurs conclusions complètes en mars 2021, qui couvraient quatre possibilités, avec un saut vers l'homme à partir d'un porteur animal intermédiaire très probablement. Tout en faisant pression sur la Chine pour plus de transparence, le groupe prévoyait de faire une deuxième phase de l'étude.

L'étude des origines du virus a cependant été entravée par des tensions politiques à plusieurs niveaux. En juillet, l'OMS a envoyé à la Chine un plan proposé pour la deuxième phase de l'étude, qui comprenait des prélèvements sur les marchés d'animaux sauvages et des audits de laboratoires dans la région de Wuhan, mais la Chine a rejeté les plans, selon Nature.

Les prélèvements sur des chauves-souris se poursuit

D'autres efforts sont toujours en cours pour apprendre de nouveaux indices sur la propagation initiale, tels que des prélèvements chez les chauves-souris, ainsi que des tests sanguins et des eaux usées archivés, a rapporté Nature, ajoutant que des chercheurs disent que trop de temps s'est écoulé pour recueillir des données qui pourraient aider à mieux identifier la source.

Sur twitter, Peter Daszak, qui faisait partie de la mission conjointe de l'OMS et est le président d'EcoHealth Alliance, a dit qu'une politisation intense a fait dérailler la phase 2 de l'étude. «Un barrage constant de harcèlement médiatique, motivé par une politique polarisée, a effectivement stoppé le progrès scientifique. Il ne nous reste AUCUNE nouvelle donnée, juste des intrigues, des rumeurs, des ouï-dire et des postures politiques vindicatives.»

À l'été 2021, l'OMS a créé un groupe permanent appelé le Groupe consultatif scientifique sur les origines des nouveaux agents pathogènes (SAGO pour Scientific Advisory Group for Origins of Novel Pathogens) afin de poursuivre la recherche de la source du SARS-CoV-2 et d'autres nouveaux agents pathogènes.

La société a déclaré que l'essai était également destiné à soutenir des licences en Europe et au Brésil.

Three years later, the politicisation of origins studies and the consequence: no further work is being done https://t.co/jreGel5b0P

— Marion Koopmans, virology; emerging infections (@MarionKoopmans) February 14, 2023

Le microbiome d'un centre commercial est le reflet de ses clients

Les centres commerciaux sont une plaque tournante de l'activité, tant pour les personnes que pour les agents pathogènes. De nouvelles recherches en microbiologie sur le microbiome des centres commerciaux sont publiées sur le site de l’American Society for Microbiology (ASM); cela montre que le microbiome d'un centre commercial reflète ses clients (A Shopping Mall’s Microbiome Mirrors Its Shoppers).

Faits saillants

- Des chercheurs ont analysé les populations microbiennes des surfaces de 20 centres commerciaux en Chine.

- Chaque microbiome du centre commercial était différent, mais l'étude a trouvé un noyau commun, comprenant de nombreux agents pathogènes.

- Une meilleure compréhension des microbiomes des centres commerciaux pourrait améliorer les stratégies de surveillance des menaces émergentes pour la santé publique.

Les gens affluent vers les centres commerciaux pour toutes sortes de raisons. Mais l'argent n'est pas la seule chose qu'ils laissent derrière eux, et les sacs à provisions ne sont pas les seules choses qu'ils rapportent à la maison.

Cette semaine dans mSystems, des chercheurs rapportent (Dynamics of Microbial Community and Potential Microbial Pollutants in Shopping Malls) que les sols, escaliers mécaniques et autres surfaces des centres commerciaux ont leurs propres communautés microbiennes, assemblées à partir des microbes des personnes qui les traversent. Le microbiome du centre commercial comprend une grande partie d'agents pathogènes potentiels, en particulier à l'intérieur du bâtiment, ce qui suggère que la transmission de surfaces à personne pourrait propager la maladie.

«Les surfaces des centres commerciaux agissent comme une voie par laquelle les microbes se déplacent entre les zones des centres commerciaux, même entre des régions très éloignées», a dit Xin-Li An de l'Institut de l'environnement urbain (IUE) de l'Académie chinoise des sciences, à Xiamen. Elle a codirigé l'étude avec Jian-Xin Xu, au même institut. «L'exposition de la population au microbiome du centre commercial modifie peut-être la trajectoire de la santé en mettant des personnes en contact avec des agents pathogènes», a-t-elle dit.

Les résultats suggèrent que le mouvement des agents pathogènes dans un centre commercial ne se limite pas aux rencontres de personne à personne, mais peut également se produire par le biais de transmissions de personnes aux surfaces ou de surfaces aux personnes.

Dans des études précédentes, des chercheurs en Chine ont rapporté que les centres commerciaux avaient été au centre de nombreuses épidémies locales de la Covid-19 pendant la pandémie. Ces études ont amené An et ses collègues à réfléchir au rôle des centres commerciaux, qui rassemblent des personnes pour diverses activités, dans la propagation des agents pathogènes en général.

«Les centres commerciaux pourraient être un environnement de propagation de la contamination microbienne», a dit An.

Les chercheurs ont prélevé des échantillons au printemps et à l'été 2022 sur les sols et les escaliers mécaniques de 20 centres commerciaux de Xiamen, Chine, ainsi que sur l'extérieur immédiat du bâtiment, y compris les sols de la ceinture verte et la poussière des routes. Ils ont utilisé le séquençage de l'ARNr 16s pour analyser les échantillons de populations bactériennes et l'amplification ITS (Internal Transcribed Spacer) pour identifier les espèces fongiques. Ils ont trouvé la plus grande richesse en espèces bactériennes dans les sols des centres commerciaux, suivis des escaliers mécaniques, puis de la poussière des routes, et enfin des sols de la ceinture de verdure.

Les environnements intérieurs ont montré des concentrations plus élevées d'agents pathogènes humains, ainsi qu'une proportion plus élevée de gènes associés à la résistance aux antimicrobiens, que les prélèvements extérieurs. Les espèces qui dominaient la population variaient selon la saison. Et bien que les microbiomes variaient d'un centre commercial à l'autre et d'une saison à l'autre, les chercheurs ont trouvé une communauté microbienne centrale qui était partagée dans plus de 80% des 274 prélèvements totaux. La plupart de ces microbes étaient associés à des agents pathogènes potentiels.

Ce noyau comprenait Acinetobacter baumannii, une bactérie Gram négatif à l'origine de nombreuses infections nosocomiales. Il y avait également Kocuria kristinae, une bactérie Gram positif habituellement inoffensive qui vit sur la peau et peut provoquer des infections chez les patients dont le système immunitaire est affaibli. Cladosprorium, une type de moisissure qui peut provoquer des allergies et, dans certains cas, des infections, faisait également partie de la communauté de base.

Les travaux d'An à l'IUE se concentrent sur les agents pathogènes humains, en particulier les virus et les bactéries dotés de gènes de résistance aux antimicrobiens, dans les environnements urbains. Outre les centres commerciaux, ces environnements comprennent les usines de traitement des eaux usées, les marchés humides et les fermes. Comprendre le microbiome du centre commercial est un élément important d'un objectif plus large de surveillance des menaces potentielles pour la santé publique. La prochaine étape consiste à collecter plus de données sur la façon dont un microbiome de centre commercial change dans le temps et dans l'espace, et à rechercher plus de points communs.

La nouvelle étude suggère une autre direction pour de nouvelles recherches, a ajouté An, pour étudier les expositions microbiennes qui surviennent par la respiration. Dans une future étude, les chercheurs prévoient de se concentrer sur le microbiome de l'air dans les centres commerciaux.

La Chine va cesser de tester les aliments réfrigérés et surgelés pour la COVID à partir du 8 janvier 2023

Le vent semble tourner pour la Chine avec sa gestion de la pandémie liée à la Covid, avec ces quelques éléments,

- «Covid-19 : la Chine appelle l'OMS à adopter une position «impartiale». Rappelez-vous qu’au début de la pandémie, on disait l’OMS proche de la Chine ...
- «Inacceptable» : Pékin dénonce les tests Covid pour les voyageurs chinois et évoque des «contre-mesures». Là aussi, la Chine imposait des tests stricts à tout entrant ...

Mais il y a plus, «La Chine va cesser de tester les aliments réfrigérés et surgelés pour la COVID à partir du 8 janvier 2023», selon Reuters.

En janvier 2022, le blog vous proposé un article, «La Chine intensifie les contrôles après la découverte de coronavirus dans des fruits»

Le commerce de la viande en Chine a applaudi vendredi la fin imminente des tests et la désinfection des aliments réfrigérés et surgelés pour la COVID-19, plus de deux ans après que Pékin ait commencé la pratique controversée, ajoutant des coûts substantiels au commerce.

L'Administration d'État pour la réglementation du marché cessera de tester les aliments réfrigérés et surgelés pour la COVID-19 à partir du 8 janvier, selon un avis vu par Reuters et confirmé par l'agence.

Elle n'exigera plus non plus que tous les aliments réfrigérés et surgelés importés entrent dans des entrepôts centralisés pour être désinfectés et testés avant d'atteindre le marché intérieur.

L'abandon des mesures fait suite à une annonce similaire de l'autorité douanière mercredi selon laquelle elle cessera de tester les aliments de la chaîne du froid arrivant dans les ports du pays.

«Cette politique signifie que nous aurons des coûts et des risques beaucoup plus faibles sur le stockage et le transport des produits», a dit un importateur de viande basé à Pékin qui achète du bœuf et du porc aux États-Unis et dans d'autres pays.

NB : C'était le 5700e article du blog !

Etude sur une éclosion à Salmonella Newport liée à des écrevisses cuites congelées dans de la saumure à l'aneth en Suède

Dans Eurosurveillance, des chercheurs rapportent une éclosion à Salmonella Newport liée à des écrevisses cuites congelées importées dans de la saumure à l'aneth en Suède, de juillet à novembre 2019 (Outbreak of Salmonella Newport linked to imported frozen cooked crayfish in dill brine, Sweden, July to November 2019).

Vous lirez l’article de Joe Whitworth dans Food Safety News, Study details rare Salmonella outbreak from frozen crayfish from China (Une étude détaille une éclosion rare à Salmonella provenant d'écrevisses congelées de Chine).

Fin septembre 2019, l'Agence suédoise de santé publique (Folkhälsomyndigheten) a identifié un cluster de neuf patients atteints d'infections à Salmonella Newport. Fin octobre, il y avait 25 cas dont la maladie est apparue de la mi-août à la mi-octobre.

Le blog vous propose la dicussion et la conclusion de l’article.

Discussion

L'investigation épidémiologique a identifié une marque importée spécifique d'écrevisses entières cuites congelées dans de la saumure à l'aneth comme véhicule suspect de l'infection à Salmonella Newport ST46. Le véhicule de l'infection a ensuite été confirmé microbiologiquement dans des échantillons provenant de lots d'écrevisses rappelés et dans un échantillon provenant du contrôle aux frontières. Malgré le rappel complet du produit, deux cas supplémentaires avec la souche épidémique ont été identifiés, un en 2020 et un en 2021. Cela démontre la difficulté d'éliminer complètement le risque associé aux aliments contaminés avec des longues dates de péremption, car la possibilité de associer un aliment dans le congélateur à un rappel ou à l'annonce d'une épidémie diminue avec le temps.

Il s'agit, à notre connaissance, du premier foyer de cas à Salmonella lié à des écrevisses précuites congelées en saumure à l'aneth. Des épidémies à Salmonella Newport ont déjà été liées à des véhicules animaux et végétaux, par exemple de la viande bovine, la pastèque et des graines germées de haricot mungo. On ne sait pas comment le produit a été contaminé. Salmonella a déjà été détecté dans des écrevisses sauvages et il est possible que les écrevisses aient été insuffisamment cuites. Cependant, puisque Salmonella a été détectée dans deux lots, indiquant une contamination persistante, il est plus probable que le produit ait été contaminé après la cuisson, par l'ajout d'aneth contaminé ou par une contamination environnementale lors de la préparation.

Nous avons utilisé une étude cas-cas basée sur le questionnaire exploratoire national suédois sur Salmonella afin d’identifier une source possible dans cette éclosion. Outre la rapidité d'exécution, McCarthy et Gieseke ont proposé que les avantages des études cas-cas par rapport aux études cas-témoins sont une réduction des biais de sélection et de rappel. En effet, les cas d'éclosion et les cas témoins sont identifiés à partir du même système de surveillance et parce que les cas-témoins sont susceptibles de mieux se souvenir de leurs expositions que les témoins sains. Des études cas-cas ont été utilisées auparavant, à la fois pour comparer des cas sporadiques avec différentes maladies gastro-intestinales, pour établir une comparaison de base de cas avec différentes maladies, et dans les investigations sur les épidémies. Dans cette investigation sur l'éclosion, la justification de la réalisation d'une étude cas-cas était que l'écrevisse est un plat de saison, traditionnellement consommé en Suède lors des fêtes d'écrevisses en août et septembre. Les écrevisses sont généralement servies froides et les écrevisses précuites congelées sont prêtes à être consommées après décongélation, sans réchauffage. Par conséquent, nous avons considéré qu'une étude cas-témoin était difficile en raison d'un biais de rappel potentiel parmi les témoins. De plus, plusieurs cas confirmés avaient déjà répondu au questionnaire et les réponses d'autres cas de salmonellose de la même saison étaient disponibles. Nous avons sélectionné des cas témoins en fonction de la date d'apparition de la maladie et de l'âge pour correspondre aux cas d'épidémie, car les habitudes alimentaires peuvent varier selon la saison et entre les groupes d'âge.

Les cas liés à une importante éclosion simultanée à Salmonella Typhimurium monophasique n'étaient pas éligibles en tant que cas témoins, mais nous avons autorisé les cas témoins d'autres éclosions ne chevauchant que partiellement la saison d'intérêt. L'exclusion des cas témoins liés à d'autres éclosions a augmenté l'OR ajusté pour les écrevisses mais n'a pas autrement modifié les résultats. Dans cette investigation sur l'éclosion, l'approche d'étude de cas a été couronnée de succès, identifiant un véhicule suspect d'infection sur lequel on pouvait agir en temps opportun et confirmé par une investigation microbiologique. Compte tenu des circonstances suédoises, avec l'utilisation de questionnaires nationaux exploratoires, les études de cas pourraient être un outil utile lors de futures éclosions de maladies d'origine alimentaire et hydrique. La détection des signaux d'éclosion montre la force d'un programme national de surveillance microbienne où Salmonella est typée en temps opportun dans le but d'identifier les éclosions, en particulier avec des cas largement répartis géographiquement. Cependant, le programme de surveillance microbiologique de la Public Health Agency of Sweden ne comprend que l'analyse WGS des isolats provenant de cas domestiques. Par conséquent, il est possible que nous n'ayons pas détecté tous les cas d'épidémie, s'ils étaient considérés comme infectés à l'étranger.

Conclusion

Cette investigation a démontré l'utilisation réussie d'une étude de cas et de tests microbiologiques ciblés pour identifier les écrevisses importées congelées et précuites dans la saumure à l'aneth comme étant la source de l'éclosion. Cela montre l'importance de mettre en œuvre et de maintenir des systèmes de management de la sécurité des aliments efficaces dans l'ensemble de la chaîne de production, en particulier des aliments prêts à consommer.

Elle montre également la difficulté d'éliminer complètement le risque lié aux aliments contaminés avec des dates limites de consommation longues, comme en témoignent les deux cas supplémentaires bien après le rappel. L'action immédiate prise par l'entreprise de vente au détail vendant le produit, qui comprenait à la fois un rappel approfondi et une analyse des produits alimentaires, était importante pour confirmer le véhicule de l'infection et arrêter l'éclosion.

En marge de cet article, notons ce rapport 2021 en Suède «L'inspection des aliments est généralement bien organisée, ouverte et impartiale», source Livsmedelsverket, Agence suédoise de l'alimentation.

Aux lecteurs du blog

La revue PROCESS Alimentaire censure pour une triste question d’argent les 10 052 articles initialement publiés gracieusement par mes soins de 2009 à 2017 sur le blog de la revue, alors que la revue a bénéficié de la manne de la publicité faite lors de la diffusion de ces articles. La revue PROCESS Alimentaire a fermé le blog et refuse tout assouplissement. Derrière cette revue, il faut que vous le sachiez, il y a une direction aux éditions du Boisbaudry, pleine de mépris, et un rédacteur en chef complice !