Vaccin possible contre la peste porcine africaine dans un délai raisonnable, selon une étude américaine

Annonce : S’agissant de l’information à propos des rappels de produits alimentaires, pour le moment, il ne faut pas faire confiance à nos autorités sanitaires (Ministère de l’agriculture et DGCCRF). Ces deux entités ont fait et font toujours preuve d’une incroyable légèreté et d’un manque d’informations fiables vis-à-vis des consommateurs avec comme corollaire une absence de transparence en matière de sécurité des aliments.

« Vaccin possible contre la peste porcine africaine dans un délai raisonnable », source Pig Progress.

Un vaccin contre la peste porcine africaine (PPA) pourrait être possible «dans un délai raisonnable», selon le chercheur principal de l'Agricultural Research Service (ARS), qui fait partie du ministère américain de l'Agriculture (USDA).

Plus tôt ce mois-ci, la nouvelle a annoncé qu'un vaccin potentiellement nouveau contre la peste porcine africaine (PPA) avait été créé par des chercheurs l’ARS de l'USDA.

L’équipe de recherche du Plum Island Animal Disease Center qui a publié l’article. Le Dr Gladue est assis à droite. Photo: ARS-USDA.

Un article est apparu sur le site Internet Biorxiv, mentionnant que des chercheurs avaient trouvé un gène du virus auparavant inconnu, appelé I177L, qui une fois supprimé atténue complètement un isolat du virus de la PPA obtenu en Géorgie.

Pig Progress a contacté le Dr Douglas Gladue, scientifique principal au Plum Island Animal Disease Center, qui fait partie de l'ARS. Il est l'un des principaux scientifiques à l'origine de la publication.

Pig Progress: Quelles ont été les réactions à votre découverte jusqu'à présent?

Dr Douglas Gladue: « Nos résultats avec notre nouveau vaccin expérimental ASFv-G-ΔI177L ont été très prometteurs et ont des caractéristiques qui surpassent expérimentalement nos vaccins candidats découverts précédemment. »

Le vaccin nouvellement développé a-t-il également été testé dans des conditions agricoles?

« ASFv-G-ΔI177L n'a été testé que dans des conditions contrôlées expérimentales. »

Qu'en est-il de l'augmentation de la production à ce stade?

« Notre vaccin est encore au stade expérimental et nécessitera une approbation réglementaire; cette approbation varie selon les pays. Il n'existe actuellement aucune lignée cellulaire stable capable de soutenir la croissance du vaccin contre l'ASFv, la croissance de notre vaccin repose actuellement sur l'isolement de macrophages porcins primaires. »

Il y a déjà eu pas mal de gens qui m'ont demandé quand ce vaccin serait disponible. Peut-être à ses débuts, mais pourriez-vous en dire quelque chose à ce stade?

« ASFv-G-ΔI177L est encore au stade expérimental, jusqu'à présent, il a été très prometteur, le délai d'approbation réglementaire et de commercialisation est inconnu, mais nous pensons que cela pourrait être possible dans un délai raisonnable. »

Y a-t-il eu des contacts avec des parties pharmaceutiques commerciales au sujet de sa commercialisation? Si oui, lequel?

« Actuellement, nous n'avons pas de partenaire commercial pour ASFv-G-ΔI177L. »

À la lumière des développements en Europe et en Asie, je pourrais imaginer qu'il y a un intérêt massif de nombreux coins du monde. Y a-t-il eu des contacts avec les autorités des pays?

« Aucun que je sache actuellement. »

Qu'est-ce qui vous a poussé à examiner ce gène particulier?

« Le virus de la PPA a plus de 150 gènes, le nombre exact de gènes varie selon l'isolat. Très peu de ces gènes ont été étudiés expérimentalement, certains ayant une fonction prédite en raison de la similitude avec d'autres gènes (cellulaires ou viraux). À l'aide d'un pipeline bioinformatique, nous avons classé les gènes ayant une forte probabilité d'être importants pour l'évasion immunitaire. Nos trois premiers candidats étaient les gènes Ep152R, L83L et I177L. Ep152R, que nous avons déterminé était un gène essentiel et ne pouvait pas être supprimé (PMID 27497620). L83L, nous avons pu le supprimer mais il n'y a eu aucun effet sur la virulence du virus (PMID 29605728). I177L, notre troisième candidat, une fois supprimé, a été complètement atténué et est devenu notre candidat-vaccin. »

Surveillance et suivi de Salmonella dans l’UE avec un focus sur la France

Annonce : S’agissant de l’information à propos des rappels de produits alimentaires, pour le moment, il ne faut pas faire confiance à nos autorités sanitaires (Ministère de l’agriculture et DGCCRF). Ces deux entités ont fait et font toujours preuve d’une incroyable légèreté et d’un manque d’informations fiables vis-à-vis des consommateurs avec comme corollaire une absence de transparence en matière de sécurité des aliments.

Selon le communiqué de l’EFSA, « Près d'un foyer épidémique d'origine alimentaire (entendez par là toxi-infections alimentaires collectives) sur trois dans l'Union européenne en 2018 a été causé par la bactérie Salmonella. C'est l'une des principales conclusions du rapport annuel sur les tendances et les sources des zoonoses publié aujourd'hui par l'Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA) et le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC). »

La salmonellose est la deuxième infection gastro-intestinale la plus fréquemment signalée chez l'homme dans l'UE en 2018 (91 857 cas signalés), après la campylobactériose (246 571).

La tendance de la salmonellose chez l'homme s'est stabilisée au cours des cinq dernières années après une longue période d'une tendance à la baisse.

S. Infantis était le sérotype le plus signalé chez les volailles (Gallus gallus), représentant 36,7% des isolats sérotypés. Contrairement aux années précédentes, il était répandu chez la plupart des États membres qui ont envoyé des données sur Gallus gallus. S. Infantis a été massivement signalé chez les poulets de chair (36,5% de tous les isolats sérotypés) et de viande de poulet de chair (56,7%).

On se rapportera pour plus de détails au rapport de l’EFSA/ECDC sur « The European Union One Health 2018 Zoonoses Report ».

La notification de la salmonellose non typhique chez l'homme est obligatoire dans les 22 États-membres, en Islande et en Norvège et en Suisse, alors que dans 5 États membres, la notification est basée sur un système volontaire (Belgique, France, Luxembourg et Pays-Bas) ou d’autres systèmes (Royaume-Uni). Au Royaume-Uni, même si la déclaration d’intoxication alimentaire est obligatoire, l’isolement et l’identification de l’espèce en cause est volontaire. Les systèmes de surveillance de la salmonellose couvrent l'ensemble de la population dans tous les États membres, sauf en France, aux Pays-Bas et en Espagne.

La couverture estimée de la surveillance est de 48% en France et de 64% aux Pays-Bas. Ces proportions de populations ont été utilisées pour le calcul des taux de notification par pays et au niveau de l'UE. Pas d'estimation fournie de la couverture de la population en Espagne de 2014-2017, de sorte que le taux de notification n'a pas été calculé. En Belgique, une couverture nationale complète a été mise en place en 2015 et les taux avant cette date ne sont pas publiés. Tous les pays ont rapporté des données fondées sur des cas, à l'exception de la Bulgarie, qui a communiqué des données agrégées.

Une tendance à la hausse significative a été observée dans un État membre (Slovaquie) en 2009–2018 et dans quatre États membres (France, Portugal, Slovaquie et Espagne) en 2014–2018. La tendance à la hausse en Espagne est due en partie à une amélioration de la surveillance.

En tenant compte de ce qui a été dit plus haut, pour la France, le nombre de cas humains de salmonellose est respectivement pour 2018, 2017, 2016, 2015 et 2014, de 8 936, 8 936, 7 993, 8 876, 10 305 et 8 880.

Poules pondeuses

Pour trois États membres (Bulgarie, Croatie et France), la prévalence des troupeaux de poules pondeuses positifs pour Salmonella a fortement augmenté en 2018 par rapport à 2017. Pour la Bulgarie et la Croatie, cette augmentation de la prévalence était due à un nombre stable de troupeaux positifs tandis que le nombre des troupeaux testés étaient bien inférieurs à ceux de 2017. Au lieu de cela, pour la France, le nombre de troupeaux testés est resté assez stable, alors que le nombre de troupeaux positifs pour Salmonella a presque doublé (5 433 troupeaux testés et 193 troupeaux positifs pour Salmonella en 2017, 5 651 troupeaux testés et 371 troupeaux positifs pour Salmonella en 2018).

Par ailleurs, pour S. Typhimurium, 101 troupeaux positifs ont été notifiés dans l’UE et 34.6% d’entre eux ont été rapportés par la France.

Poulets de chair

Vingt-sept États membres et deux États non membres ont déclaré des données du programme national de contrôle de Salmonella provenant des troupeaux de poulets de chair. Aucune donnée n'a été envoyé par la Hongrie et la Norvège. Dans l'UE en 2018, Salmonella a été retrouvée dans 12 591 troupeaux soit 3,5% des troupeaux contre 3,3% en 2017.

Le nombre de troupeaux positifs pour S. Typhimurium a augmenté en 2018 (N = 433) par rapport à 2017 (N = 363) et la France représentait 65,6% des troupeaux de poulets de chair positifs pour ce sérotype, confirmant le scénario de l'année précédente.

Surveillance et suivi de Campylobacter dans l’UE avec un focus sur la France

Annonce : S’agissant de l’information à propos des rappels de produits alimentaires, pour le moment, il ne faut pas faire confiance à nos autorités sanitaires (Ministère de l’agriculture et DGCCRF). Ces deux entités ont fait et font toujours preuve d’une incroyable légèreté et d’un manque d’informations fiables vis-à-vis des consommateurs avec comme corollaire une absence de transparence en matière de sécurité des aliments.

Suite à la publication du rapport de l’EFSA/ECDC sur « The European Union One Health 2018 Zoonoses Report », voici quelques éléments à propos de Campylobacter chez l’homme dans l’UE avec un focus sur la France.

La notification de la campylobactériose (humaine) est obligatoire dans 21 États membres de l'UE, en Islande, en Norvège et en Suisse. Dans six États membres, la notification est basée sur un système volontaire (Belgique, France, Grèce, Italie, Luxembourg et Pays-Bas) et dans un pays sur un autre système (Royaume-Uni). La Grèce a commencé à communiquer des données sur la campylobactériose en 2018. Les systèmes de surveillance de la campylobactériose couvrent l'ensemble de la population dans tous les États membres sauf dans quatre (France, Italie, Pays-Bas et Espagne). La couverture estimée du système de surveillance est de 20% en France et de 52% aux Pays-Bas.

Pour 2018, 246 571 cas confirmés de campylobactériose humaine ont été signalés par 28 États membres de l'UE, ce qui correspond à un taux de notification dans l'UE de 64,1 cas pour 100000 habitants. Il s'agit du même niveau qu'en 2017 (64,9 cas pour 100 000 habitants).

En tenant compte de ce qui a été dit plus haut, pour la France, le nombre de cas humains de campylobactériose est respectivement pour 2018, 2017, 2016, 2015 et 2014, de 7 491, 7 491, 6 579, 6 698, 6 074, 5 958.

Au niveau des pays, 13 États membres (Autriche, République tchèque, Estonie, France, Hongrie, Irlande, Italie, Lettonie, Malte, Pologne, Slovaquie, Slovénie et Espagne) ont signalé des tendances à la hausse significatives entre 2009 et 2018. Chypre et les Pays-Bas ont déclaré une baisse (p < 0,05), à la fois sur la période 2009-2018 et 2014-2018.

Campylobacter a été identifié dans 29 foyers de cas avec des preuves solides et 495 foyers de cas avec des preuves faibles avec 135 hospitalisations et aucun décès. Parmi les sources de contamination dans les foyers de cas avec des preuves solides, 10 provenaient du lait et 10 de la viande de poulet de chair, ce qui signifie que ces catégories restent les aliments les plus fréquemment signalés comme causant la campylobactériose.

Campylobacter jejuni a été rapporté dans 273 foyers de cas et 18 pour Campylobacter coli. Campylobacter a été la principale cause de foyers deca en Autriche et en Allemagne avec des chiffres en légère augmentation en 2018. De grande éclosions de plus de 100 cas de maladie ont été rapportées en Hongrie, France et Suède.

Zoonoses 2018 dans l'UE, il fallait jouer dans l'ordre, Campylobater, Salmonella et STEC

Annonce : S’agissant de l’information à propos des rappels de produits alimentaires, pour le moment, il ne faut pas faire confiance à nos autorités sanitaires (Ministère de l’agriculture et DGCCRF). Ces deux entités ont fait et font toujours preuve d’une incroyable légèreté et d’un manque d’informations fiables vis-à-vis des consommateurs avec comme corollaire une absence de transparence en matière de sécurité des aliments.

« Salmonella est la cause la plus fréquente des foyers épidémiques d'origine alimentaire dans l'UE », tel est le titre du communiqué de l’EFSA du 12 décembre 2019 à propos du rapport annuel sur les tendances et les sources des zoonoses

Près d'un foyer épidémique d'origine alimentaire sur trois dans l'Union européenne en 2018 a été causé par la bactérie Salmonella. C'est l'une des principales conclusions du rapport annuel sur les tendances et les sources des zoonoses publié le 12 décembre 2019 par l'Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA) et le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC).

En 2018, les États membres de l'UE ont signalé 5146 foyers épidémiques d'origine alimentaire qui ont affecté 48.365 personnes. Ce qu’on appelle un foyer épidémique de maladie d'origine alimentaire est un incident au cours duquel au moins deux personnes contractent la même maladie à partir des mêmes aliments ou boissons contaminés.

La Slovaquie, l'Espagne et la Pologne représentaient 67% des 1581 foyers épidémiques de salmonellose. Ces foyers étaient principalement liés à des œufs.

« Les résultats de notre dernière enquête Eurobaromètre montrent que moins d'un tiers des citoyens européens classent les intoxications alimentaires bactériennes parmi leurs cinq préoccupations principales en matière de sécurité alimentaire. Le nombre de foyers signalés suggère qu'il serait opportun de sensibiliser les consommateurs à cette question étant donné que de nombreuses maladies d'origine alimentaire pourraient être évitées en améliorant les mesures d'hygiène appliquées lors de la manipulation et de la préparation des aliments », a déclaré Marta Hugas, scientifique en chef à l'EFSA.

La salmonellose est la deuxième infection gastro-intestinale la plus fréquemment signalée chez l'homme dans l'UE en 2018 (91 857 cas signalés), après la campylobactériose (246 571).

Virus du Nil occidental et infections à STEC : les niveaux sont inhabituellement élevés

L'augmentation de loin la plus élevée observée en 2018 est celle liée au nombre d'infections causées par le virus du Nil occidental.

Les cas liés au virus du Nil occidental, une zoonose transmise par les moustiques, se sont révélés sept fois plus nombreux qu'en 2017 (1605 contre 212) et ont dépassé tous les cas déclarés entre 2011 et 2017.

« Les raisons de ce pic ne sont pas encore entièrement comprises. Il a été démontré que des facteurs tels que la température, l'humidité ou les précipitations influencent l'activité saisonnière des moustiques et ces facteurs peuvent avoir joué un rôle. Bien que nous ne puissions pas prédire l'intensité des prochaines saisons de transmission, nous savons que le virus du Nil occidental circule activement dans de nombreux pays de l'UE, affectant les humains, les chevaux et les oiseaux. L'ECDC intensifie son soutien aux pays dans les domaines de la surveillance, de la préparation, de la communication et de la lutte contre les vecteurs », a déclaré le scientifique en chef de l'ECDC, Mike Catchpole.

La plupart des infections causées par le virus du Nil occidental acquises localement ont été signalées par l'Italie (610 cas), la Grèce (315) et la Roumanie (277). La Tchéquie et la Slovénie ont signalé leurs premiers cas depuis 2013.

L'Italie et la Hongrie ont également enregistré un nombre croissant de foyers liés au virus du Nil occidental chez les chevaux et d'autres espèces équines ces dernières années.

La bactérie, E. coli producteurs de shigatoxines (STEC), est devenue la troisième cause de zoonose d'origine alimentaire avec 8161 cas signalés – remplaçant la yersiniose avec une augmentation de 37% par rapport à 2017. Ce fait peut s'expliquer en partie par l'utilisation croissante de nouvelles technologies de laboratoire qui facilitent la détection des cas sporadiques.

Le nombre de personnes affectées par listériose en 2018 est similaire à celui observé en 2017 (2549 en 2018 contre 2480 l'année précédente). La tendance est toutefois à la hausse depuis les dix dernières années environ.

Parmi les zoonoses couvertes dans ce rapport, la listériose représente la proportion la plus élevée de cas d’hospitalisation (97%) et le plus grand nombre de décès (229), ce qui en fait l'une des maladies d'origine alimentaire les plus graves.

Le rapport contient également des données sur Mycobacterium bovis, Brucella, Yersinia, Trichinella, Echinococcus, Toxoplasma, la rage, Coxiella burnetii (Fièvre Q) et la tularémie.

Le rapport complet : The European Union One Health 2018 Zoonoses Report.

NB : Je reviendrais sur ce rapport concernant plus particulièrement notre pays prochainement.

La photo de droite est une photo de STEC issue du Helmholtz Centre for Infection Research que l'on peut retrouver sur ce lien. © HZI/Manfred Rohde.

La résistible ascension des toxi-infections alimentaires collectives en France et dans l’UE en 2018

Annonce : S’agissant de l’information à propos des rappels de produits alimentaires, pour le moment, il ne faut pas faire confiance à nos autorités sanitaires (Ministère de l’agriculture et DGCCRF). Ces deux entités ont fait et font toujours preuve d’une incroyable légèreté et d’un manque d’informations fiables vis-à-vis des consommateurs avec comme corollaire une absence de transparence en matière de sécurité des aliments.

Santé publique de France nous a expliqué avec une iconographie simplifiée et appropriée les toxi-infection aliemntaire collectives. La volonté de mettre en avant certains chiffres plutôt que d’autre semble l’évidence …, chacun pourra le constater ci-dessous ...

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Mais cela continue dans la publication des données de 2017 où nous nous explique qu’il y a eu – 10 % de toxi-infections alimentaires collectives, même si le nombre de personnes touchées en 2017 (13 010) est seniblement le même qu’en 2016 (13 997) et même si les chiffres des données des toxi-infections alimentaires collective ne sont en fait que la partie immergée de l’iceberg, il nous faut positiver, Ah, la com …

Mais patatras, ces « bons chiffres » de 2017 vont devoir être remplacés par les nouvelles données de 2018 fournies par l’EFSA issues du Food- and waterborne outbreaks (page 176) dans le rapport, The European Union One Health 2018 Zoonoses Report.

Rappelons qu’un tel rapport n’existe pas en France. Parmi les moyens à votre disposition pour rechercher une telle information, il vous faut aller sur le site de l'Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA). C'est en regroupant ces données et celles des pays européens que l'EFSA établit chaque année la compilation comme celle indiquée ci-dessus.

Selon l’EFSA, il y a eu en 2018 en France 1 629 foyers de TIAC (+ 18,2 % par rapport à 2017) totalisant 14 703 personnes touchées. Ces foyers représentent 30,4 % du total des foyers de cas dans l’UE.

Au total, les TIAC d'origine alimentaire et hydrique déclarés par la France, la Slovaquie, l'Espagne, la Pologne et l'Allemagne représentaient plus des trois quarts du nombre total des TIAC observés dans l'UE.

Le taux de déclaration des TIAC d'origine alimentaire et hydrique dans l'UE, qui ne tenait compte que de la population des États membres ayant fourni des données, était de 1,04 foyers (pour 100000 habitants), soit une augmentation de 4,6% par rapport à 2017, mais inférieure au taux moyen de déclaration. au cours de 2010-2018 (1,07).

En France, en 2018, le taux de déclaration des TIAC est de 2,43 TIAC pour 100 00 habitants versus 2,06 en 2017

On nous dit aussi qu’il y a eu d’importantes éclosions à Campylobacter (> 100 cas de maladie) qui a été rapportés en Hongrie, France et Suède. Je n’ai pas entendu parler de cette éclosion à Campylobacter en France en 2018 ...

Les TIAC liées à des toxines bactériennes représentaient une proportion importante de tous les TIAC déclarés dans l'UE en 2018 (N = 950; 18,5% de toutes les TIAC). Elles proviennent principalement de la France qui, à elle seule, a signalé la grande majorité des TIAC liées aux toxines bactériennes autres que C. botulinum (N = 799; 85,5% des TIAC liées à des toxines bactériennes autres que C. botulinum).

A noter que norovirus a été le virus le plus fréquemment identifiés dans les TIAC d'origine alimentaire et hydrique et il a été le quatrième agent le plus couramment rapporté dans les maladies infectieuses d’origine alimentaire.

Quatre États membres ont signalé en 2018 un nombre de TIAC d'origine alimentaire et hydrique considérablement plus élevé qu'en 2017: la Slovaquie (+342; 74,0% de foyers de plus qu'en 2017); la France (+251; 18,2% de foyers de plus qu'en 2017); l’Espagne (+207; 49,9% de foyers plus que 2017) et la Belgique (+93; 30,6% foyers plus que 2017). À l'inverse, les foyers déclarés par la Suède (269; 78,2% de moins qu'en 2017) et la Croatie (-33; 57,9% de moins qu'en 2017) étaient remarquablement inférieurs à ceux de 2017. Pour les deux pays, cependant, en 2018, le nombre moyen de cas par foyer était plus élevé que les années précédentes. De plus, le nombre de petites éclosions (<10 cas impliqués) signalées par la Suède en 2018 (n = 45; 60,0% de toutes les TIAC) était beaucoup plus faible qu'en 2017 (n = 308; 90,1% de toutes les éclosions).

L’augmentation des TIAC observée en France à norovirus (+119; 219% de plus qu’en 2017) et aux toxines bactériennes autres que C. botulinum (+116; 17.0%).

Parmi les conclusions,

Bien que moins d'États membres aient fourni des informations sur les toxi-infections alimentaires collectives qu'en 2017, une augmentation du nombre total à la fois des éclosions (67 éclosions de plus; augmentation de 1,3%) et des cas de maladie (5 067 cas de plus; 11,7% d’augmentation) a été observée. Cette augmentation s'inscrit dans la fourchette des variations observées au cours des 10 dernières années, au niveau de l'UE. Dans les États membres signalant un nombre plus élevé de TIAC par rapport à 2017, les l’augmentation semble différente et inclut divers agents responsables, en particulier Salmonella, Campylobacter, norovirus, toxines bactériennes mais aussi des agents inconnus.

En termes d'impact sur la santé, le résultat le plus critique est l'augmentation du nombre de décès liés aux flambées. Cela était dû à l’augmentation du nombre de foyers de listériose et de cas associés, hospitalisations et décès qui en 2018 a presque doublé (cas), triplé (hospitalisations) et sept fois plus (décès) par rapport aux valeurs moyennes de 2010-2017. Cette augmentation n’est pas seulement imputable aux épidémies multinationales à Listeria monocytogenes sérogroupe IVb liée à des légumes surgelés (maïs) qui a impliqué de nombreux États membres entre l'automne 2017 et l'été 2018, mais aux éclosions générales à l'échelle en ville qui se sont produites au niveau national et ont impliqué une exposition dans le même pays.