mercredi 20 janvier 2021

Une nouvelle méthode thermique tue des pathogènes avec un minimum de dommages aux plantes

«Une nouvelle méthode thermique tue des pathogènes avec un minimum de dommages aux plantes», source American Phyyopathological Society.

Dans l’industrie des pépinières de fraises, la réputation d’une pépinière repose sur sa capacité à produire des plantes exemptes de maladies et d’insectes. La meilleure façon de produire des plantes propres est de commencer avec du matériel végétal propre. De nombreuses pépinières sont aux prises avec la tache angulaire du fraisier (voir photo ci-contre) une maladie grave qui peut entraîner de graves pertes, soit en endommageant directement la plante, soit indirectement par une violation des normes de quarantaine au sein de l'industrie.

La tache angulaire est causée par le pathogène bactérien Xanthomonas fragariae. Les stratégies de gestion actuelles reposent principalement sur l'application de composés de cuivre après la plantation. Mis à part le fait que ces composés ne sont appliqués qu'après que l'agent pathogène a eu un certain temps pour s'établir, ces produits ont également une courte durée de vie et peuvent entraîner une phytotoxicité.

La chaleur est une autre technique utilisée pour tuer les pathogènes dans les plantes et est généralement appliquée avant la plantation lorsque la population d'agents pathogènes est vraisemblablement à son niveau le plus faible. Cependant, les traitements thermiques sont souvent trop sévères pour les plantes, retardant leur croissance ou les tuant. La chaleur peut également propager davantage les pathogènes si elle est appliquée comme traitement avec de l'eau chaude.

«L'un des principaux problèmes liés à l'utilisation de la chaleur pour traiter les plantes est que la température endommage également les tissus de la plupart des plantes», a expliqué Bill Turechek, phytopathologiste à l'USDA en Floride. «C'est pourquoi les traitements thermiques sont le plus souvent appliqués comme traitements de semences ou sur des tissus ligneux dormants qui ont tendance à être plus tolérants au traitement.»

Turechek et ses collègues ont entrepris de développer un nouveau traitement thermique qui tuerait les pathogènes sans nuire à la plante. Lorsqu'on lui a demandé ce qui les excitait le plus dans leur recherche et leur nouvelle méthode, Turechek a répondu: «Cela fonctionne! En introduisant une étape de conditionnement à basse température et en utilisant de la vapeur plutôt que de l'eau chaude, nous avons produit des plantes qui étaient mieux à même de résister au traitement à une température plus élevée conçue pour détruire le pathogène.»

La nouvelle méthode utilise uniquement un processus en deux étapes. La première étape est un traitement thermique de conditionnement qui induit la production de protéines protectrices et d'autres molécules dans la plante. La deuxième étape consiste à appliquer une température létale qui tue le pathogène tout en causant peu de dommages à la plante. Cette méthode, qui applique de la chaleur via de la vapeur aérée, réduit également la propagation d'agents pathogènes qui pourraient ne pas avoir été tués dans les traitements à l'eau chaude et ensuite dispersés dans l'eau du bain. Pour l'industrie de la fraise, cette nouvelle méthode offre un moyen sûr d'éliminer les pathogènes et les ravageurs et devrait entraîner une réduction des applications de pesticides et une augmentation de la qualité et du rendement des fruits.

Bien que cette méthode ait été conçue pour cibler le pathogène responsable de la tache angulaire des feuilles, elle s'est avérée efficace contre les champignons pathogènes, certains nématodes et les insectes ravageurs. «En d'autres termes, ce traitement semble avoir un large spectre d'activité contre de nombreux parasites microbiens, insectes et acariens», a expliqué Turechek. Ce protocole devrait être applicable à de nombreux autres produits.

Létude et les plans de construction des unités de thermothérapie de précision nécessaires dans cette nouvelle méthode sont décrits et publiés en accès libre dans le journal PhytoFrontiers: The Use of Aerated Steam as a Heat Treatment for Managing Angular Leaf Spot in Strawberry Nursery Production and Its Effect on Plant Yield.

A, La configuration de l'unité de thermothérapie de précision pour l'essai en 2016. La configuration étendue a permis le traitement de 18 boîtes et a employé quatre sources de vide. B, La configuration utilisée pour les essais menés à Escalon et Ballico en 2017. Une configuration similaire a été utilisée pour l'essai mené par les producteurs en 2018. 

La Suède publie une décennie de données sur les intoxications alimentaires

«La Suède publie une décennie de données sur les intoxications alimentaires», source article de Joe Whitworth paru le 20 janvier 2021.

Un nombre élevé de cas d'infection à Campylobacter et davantage de cas d'infection à Salmonella liés aux aliments d'origine non animale ont été identifiés en Suède au cours d'une période de 10 ans, selon une nouvelle étude.

Le document compile les maladies d'origine alimentaire déclarées pour 2008 à 2018 (document en Suédois). Il y a eu plus de 4 000 événements de maladie suspectée ou confirmée avec 30 964 cas de maladie.

Au cours de cette période, 194 des 290 municipalités du pays ont communiqué les résultats des enquêtes sur des cas de maladie d’origine alimentaire à l’Agence suédoise de l’alimentation (Livsmedelsverket). Le nombre de municipalités déclarantes par an a augmenté depuis le résumé précédent couvrant les années 2003 à 2007.

Dans 80% des rapports, l'agent responsable de la maladie était inconnu. Des bactéries ou des toxines ont été identifiées dans 13% des rapports, tandis que des virus étaient impliqués dans 7% d'entre eux. Seuls quelques-uns concernaient des parasites, des biotoxines marines ou des mycotoxines. Les résultats seront utilisés comme base pour l'évaluation des risques et pour définir des priorités afin de réduire les maladies infectieuses d'origine alimentaire dans le pays.

Manque de données rapportées

Le rapport a également révélé qu'environ une personne sur 100 a signalé une intoxication alimentaire présumée à l'agence locale de contrôle des aliments. Si c'était le cas, les autorités seraient en mesure de retracer la cause plus facilement et de prévenir davantage de personnes de tomber malades.

Il a montré que les signalements avaient augmenté, mais la plupart des cas sont encore peu susceptibles d'être portés à l'attention des autorités. Si les agences prennent rapidement connaissance d'un patient, elles peuvent analyser les prélèvements d’aliments et de selles suspectés de la personne malade.

«Beaucoup de personnes ne savent probablement pas que vous devez informer l'autorité de contrôle des aliments de leur municipalité lorsque vous soupçonnez une intoxication alimentaire. Si plus de personnes le faisaient, les autorités seraient mieux en mesure de suivre et d'arrêter l'infection et de mettre en place des mesures pour prévenir les intoxications alimentaires», a déclaré Jonas Toljander, évaluateur des risques chez Livsmedelsverket.

La viande de poulet de chair était la catégorie d'aliments à l'origine des cas les plus signalés avec 53 foyers de cas et 5 357 personnes contaminées et la plupart peuvent être attribuées à une éclosion nationale de campylobactériose entre 2016 et 2017. Les aliments mixtes, tels que la pizza, les brochettes et les sandwichs, représentaient presque autant de cas. Les aliments sous forme de buffet ont également constitué 98 foyers de cas et 1 397 personnes concernées, tandis que les légumes ont été liés à 50 foyers de cas avec 1 265 personnes.

Epidémies importantes à norovirus et à Campylobacter

La majorité des cas d'intoxication alimentaire signalés étaient dus à norovirus. Les aliments mélangés ont été le plus souvent identifiés comme la source des épidémies. La propagation a été en grande partie causée par des individus infectés manipulant des aliments pendant la préparation. Les aliments sous forme de buffet ouvert, les huîtres d'autres pays de l'UE et les framboises importées congelées étaient également des sources fréquentes de contamination. La plus grande épidémie à norovirus a rendu 681 personnes malades et a été l'une des 35 épidémies à affecter plus de 100 personnes. Il y a des signes que norovirus se propage moins en Suède en 2020 qu'avant, car de nombreuses personnes se sont mieux lavées les mains et davantage à cause de la pandémie du coronavirus.

Campylobacter était la deuxième cause de maladie d'origine alimentaire avec 83 foyers de cas et 5 589 personnes concernées. L'épidémie liée à du poulet de 2016 et de 2017 a touché 5 150 personnes. En plus du poulet, d'autres produits carnés, des aliments mélangés et des produits comme le lait non pasteurisé ont été mis en cause dans plusieurs rapports comme sources d'infection.

Salmonella a causé 99 rapports et 1 472 cas. Divers légumes ont été identifiés comme source d'infection pour un peu plus de cas que la viande et les produits laitiers. Un total de 24 sérotypes ont été retrouvés. Salmonella Typhimurium, y compris le variant monophasique de Salmonella Typhimurium, a été principalement signalé et a également touché le plus de personnes. Salmonella Enteritidis était le deuxième sérotype le plus courant.

L'histamine était responsable de 126 rapports, Bacillus cereus de 38, E. coli producteurs de shigatoxines de 36, Listeria de 16, Clostridium perfringens de 15 et Shigella de 13. Un total de 11 décès liés à une intoxication alimentaire ont été signalés entre 2008 et 2018 avec six causés par Listeria et un par STEC.

Dans 223 rapports, le pays d'origine du véhicule alimentaire a été indiqué et dans 112 il s'agissait de l'étranger. Parmi ceux-ci, 68 concernaient des denrées alimentaires importées de l'extérieur de l'UE.

La plupart des cas signalés sont dus à une mauvaise manipulation des aliments par les traiteurs et les restaurants. Le manque de compétences en matière d'hygiène est le principal facteur contribuant à l'intoxication alimentaire.

La présence d'agents pathogènes dans les aliments indique des carences dans la production primaire ou l'abattage. Le manque de contrôle de la température peut entraîner une croissance bactérienne et la formation de toxines bactériennes dans les aliments. Outre les mesures de réduction des risques dans la production primaire, des mesures telles que l'amélioration de l'hygiène et le maintien des aliments à la bonne température pourraient prévenir la plupart des intoxications alimentaires, selon le rapport.

L'intoxication alimentaire reste la principale préoccupation des Japonais

«L'intoxication alimentaire reste la principale préoccupation des Japonais», source Food Safety News.

Selon une étude, l'intoxication alimentaire est le principal problème de sécurité des aliments des Japonais interrogés presque chaque année depuis 2008.

L'intoxication alimentaire a été classée comme le principal danger lié à la sécurité des aliments dans 10 des 11 dernières enquêtes de 2004 à 2018. Cependant, le nombre de cas a diminué au cours des 15 dernières années avec 1 330 cas d’infections en 2018, a rapporté l'étude publiée dans un revue gérée par l'Agence japonaise pour la science et la technologie.

Les chercheurs ont examiné les 15 ans depuis la création de la Commission de la sécurité aliments du Japon (FSCJ pour Food Safety Commission of Japan) en 2003.

L'étude a exploré les changements dans la perception des dangers à l'aide des résultats de l'enquête annuelle de surveillance de la sécurité des aliments publiée par le FSCJ.

L'enquête interroge chaque année 470 personnes sur les dangers liés à la sécurité des aliments, tels que les additifs alimentaires, les résidus de pesticides, la résistance aux antimicrobiens, les contaminants tels que le cadmium, le méthylmercure et l'arsenic, les intoxications alimentaires dues aux micro-organismes et les substances chimiques provenant de matériaux en contact avec les aliments.

Événements ponctuels et préoccupations émergentes

Un score est attribué pour chaque danger, les répondants donnant 0 point pour «Je ne sais pas à propos de ce danger» et «Je ne suis pas du tout concerné», un pour «Je ne suis guère préoccupé», deux pour «Je ne suis pas certain», trois pour «Je suis quelque peu inquiet» et quatre points pour «Je suis très préoccupé».

Dans l'enquête de 2004, les contaminants, y compris le cadmium, le méthylmercure et l'arsenic et les résidus de pesticides, ont été classés premier et deuxième. Cependant, ils ont progressivement baissé depuis 2008 et se sont classés en dessous de la cinquième place depuis 2016. En 2011, la catégorie de danger classée première était celle des matières radioactives; cependant, ce danger n'a cessé de baisser et se classe en dessous de la cinquième depuis 2017. L'enquête de 2011 a été réalisée juste après l'accident nucléaire de Fukushima de cette année-là. En revanche, l'intoxication alimentaire due aux micro-organismes dangereux était quatrième en 2004 et à la première place depuis 2008 sauf en 2011. En 2017 et 2018, les allergènes sont apparus dans les cinq principaux problèmes alors que les mycotoxines y sont depuis trois ans.

Communication à propos des risques

Les chercheurs ont également examiné les différences de niveaux de préoccupation en fonction de l'expérience au travail et du sexe. Les inquiétudes liées aux additifs alimentaires et aux résidus de pesticides ajoutés intentionnellement dans les aliments et contrôlés ont progressivement diminué. Ces scores étaient considérablement plus faibles chez les hommes que chez les femmes. Les scores étaient également inférieurs pour les personnes ayant une expérience professionnelle dans le secteur alimentaire que celles sans expérience. Les préoccupations concernant les contaminants étaient plus faibles chez les hommes ayant une expérience professionnelle. Les scientifiques ont déclaré qu'un écart entre les spécialistes de l'alimentation et d'autres attributs dans la reconnaissance de base du risque rend difficile la communication efficace entre diverses personnes intéressées. «Pour améliorer la qualité de la communication sur les risques dans le domaine de la sécurité sanitaire des aliments, il sera nécessaire de fournir des connaissances et des informations scientifiques sur les mécanismes de management de la sécurité sanitaire des aliments pour les personnes sans expérience professionnelle dans le secteur alimentaire, en tenant compte de l'évolution des moyens d'information et de l'influence sur perception du risque», ont-ils ajouté.

Il n'y a aucune preuve scientifique que le COVID-19 se propage par la consommation d'aliments ou par un emballage

Des nouvelles comme celle-ci, il y en a un certain nombre ...

COVID-19: De la crème glacée testée positive pour le coronavirus en Chine. 
Un expert suggère que la découverte est probablement «ponctuelle» et ne doit pas nécessairement être une cause de panique.

C'est précisément ce type d'information qui a conduit l'International Food Dairy Association a publié le communiqué suivant :

Il n'y a aucune preuve scientifique que le COVID-19 se propage par la consommation d'aliments ou par un emballage.

Vous avez peut-être vu des articles suggérant que le COVID-19 peut être transmis via des aliments surgelés, comme la crème glacée ou des emballages.

Rassurez-vous, il n'y a aucun rapport d'individus contractant le COVID-19 en consommant des aliments ou en manipulant des emballages.

Plus d'une douzaine d'autorités de santé publique du monde entier, dont l'Organisation mondiale de la santé (OMS), les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) des États-Unis, la Food and Drug Administration (FDA) des États-Unis et le Ministère américain de l'Agriculture (USDA), avec les principaux experts en sécurité des aliments, tous conviennent qu'il n'y a aucune preuve de la propagation du COVID-19 par la consommation d'aliments ou d'emballages alimentaires, et aucun cas connu de COVID-19 d'origine alimentaire.

Le COVID-19 est une maladie respiratoire, pas une maladie d'origine alimentaire, c’est clair et simple. 

A propos de la tolérance de Listeria monocytognes aux désinfectants

Voici le détail d'un travail scientifique qui va être réalisé au sein du Center for Produce Safety de l'Université de Géorgie par Xiangyu Deng sur Possibility, duration, and molecular predictors of sanitizer tolerance in Listeria monocytogenes.

Résumé

En raison de préoccupations concernant la tolérance bactérienne aux désinfectants, la FDA et le FSIS recommandent la rotation des désinfectants dans les installations de transformation des aliments prêts à consommer afin de mieux maîtriser les pathogènes d'origine alimentaire, en particulier Listeria monocytogenes (Lm).

Ces recommandations sont non contraignantes, si Lm développe une tolérance aux désinfectants courants peu concluante et débattue. Même si Lm développe une tolérance par exposition sublétale à des désinfectants, il faut tenir compte de la durée et de la force de la tolérance pour déterminer si la rotation des désinfectants est nécessaire et à quelle fréquence elle doit être appliquée.

Le manque de consensus et de données quantitatives sur la possibilité et la durée de la tolérance aux désinfectants crée des confusions et des dilemmes, en particulier lorsque la rotation des désinfectants présente des défis considérables en matière de formation, de conformité et de contrôle des coûts pour l'industrie.

Cette proposition décrit des études pour aider à régler le débat et combler les lacunes de connaissances critiques concernant la tolérance de Lm au chlore et aux composés à base d'ammonium quaternaire.

Nous mesurerons les niveaux de désinfectant résiduel dans les installations de transformation des aliments. Nous effectuerons des analyses de laboratoire pour étudier le développement et la persistance de la tolérance. Nous explorerons la prédiction de la tolérance assistée par l'apprentissage automatique et identifierons les signaux évolutifs (ou leur absence) de développement de la tolérance à partir de données de séquençage du génome entier.

Nos résultats fourniront à l'industrie et aux services réglementaires des preuves scientifiques pour étayer, mieux mettre en œuvre ou à juste titre les programmes de rotation des désinfectants.

Résumé technique

Il n'y a toujours pas de consensus scientifique sur la question de savoir si Listeria monocytogenes (Lm) développe une tolérance aux désinfectants.

Nous émettons l'hypothèse que le développement de deux types de tolérance au désinfectant peut se produire chez Lm.

Premièrement, une adaptation à court terme à des niveaux sublétaux de désinfectants induit une tolérance acquise, qui est transitoire et non héréditaire.

Deuxièmement, la sélection à long terme par des désinfectants entraîne une tolérance intrinsèque, qui est établie dans les populations de Lm par des changements évolutifs du génome de Lm.

Pour aider à régler le débat, nous testerons notre hypothèse en distinguant et en étudiant les deux types de tolérance de Lm en utilisant comme désinfectants, le chlore et un composé à base d'ammonium quaternaire.

Dans cette étude, nous étudierons les niveaux de désinfectant résiduels dans une usine de transformation de légumes feuilles vertes et de tomates afin d'évaluer si les niveaux optimaux de désinfectant dérivés du laboratoire pour le développement de la tolérance sont pertinents pour les transformateurs.

Nous évaluerons la possibilité d'une tolérance acquise en mesurant la différence des concentrations minimales d'inhibitrices (CMI) avant et après adaptation au désinfectant.

Nous étudierons comment les différents niveaux de désinfectant et le temps d'exposition affectent le développement de la tolérance acquise, y compris la durée de la tolérance après exposition aux désinfectants.

Nous explorerons les mécanismes derrière le développement de la tolérance acquise au désinfectant en caractérisant les changements temporels du transcriptome de Lm pendant toute la durée de la tolérance.

Nous évaluerons la tolérance intrinsèque dans une collection de 200 à 300 souches de Lm stratégiquement sélectionnées en utilisant des tests de cinétique de croissance à haut débit.

Nous rechercherons des preuves évolutives suggérant le développement d'une tolérance intrinsèque dans l'histoire récente en analysant les données de séquençage du génome entier (WGS) de ces souches.

Nous construirons une classification par apprentissage automatique pour prédire les niveaux de tolérance et identifier les prédicteurs de tolérance clés issus du WGS.

Cette recherche fournira de précieuses informations préalables pour déterminer si la rotation des désinfectants est nécessaire pour prévenir le développement d'une tolérance de Lm aux désinfectants. Les données scientifiques du projet aideront également à optimiser les pratiques de désinfection afin de réduire le développement de la tolérance et de déterminer la fréquence de rotation des désinfectants, si une rotation est nécessaire.

L’affiche de Xiangyu Deng, «Possibility, duration, and molecular predictors of sanitizer tolerance in Listeria monocytogenes» peut être vue ici.

Une vidéo sur YouTube est aussi proposée ici.