«
Des scientifiques constatent une énorme augmentation des
infections à Salmonella résistantes aux antibiotiques
aux États-Unis», source
Food
Safety News.
Un
groupe de chercheurs estime que les infections causées par des
souches résistantes aux antibiotiques de Salmonella non
typhiques ont augmenté de 40 pour cent, sur la base des statistiques
de 2004-2008 par rapport aux chiffres de 2015-2016.
Une
«résistance cliniquement importante» à l'ampicilline ou à
la ceftriaxone ou une non-sensibilité à la ciprofloxacine a
été retrouvée lors de l'examen d'environ 220 000 cas d’infections
en 2015-2016, contre environ 159 000 cas d’infections en 2004-2008,
selon l’article des chercheurs publié dans la revue Emerging
Infectious Diseases.
«Salmonella
est une cause majeure de maladie d'origine alimentaire aux
États-Unis, et les souches résistantes aux antimicrobiens
constituent une menace sérieuse pour la santé publique», a
écrit l'équipe de scientifiques.
«En
extrapolant à la population des États-Unis et en tenant compte des
infections non signalées, nous avons estimé une augmentation de 40
% de l'incidence annuelle des infections présentant une résistance
cliniquement importante, résistance à l'ampicilline ou à la
ceftriaxone ou non-sensibilité à la ciprofloxacine», selon
l’article.
Les
chercheurs étaient dirigés par Felicita Medalla, épidémiologiste
au Center for Emerging and Zoonotic Infectious Diseases dans la
Division of Foodborne, Waterborne, and Environmental Diseases du
Centers for Disease Control and Prevention des
États-Unis. Ses intérêts de recherche comprennent la résistance
aux antimicrobiens de Salmonella et d'autres agents pathogènes
d'origine alimentaire et entérique.
De
2004 à 2016, les laboratoires de santé publique des États et les
services de santé locaux participants dans les 48 États contigus
ont signalé 539 862 cas d’infections à Salmonella
confirmés par culture au Laboratory-Based Enteric Disease
Surveillance (LEDS). Parmi les isolats de ces cas d’infections à
Salmonella, 89 pour cent étaient sérotypés. Les plus
courants étaient Enteritidis avec
20 pour cent, Typhimurium pour 16 avec
cent, Newport avec 11 pour cent, I4,[5],12:i:- avec
4 pour cent et Heidelberg avec
4 pour cent.
Les
laboratoires de santé publique des 48 États ont soumis 28 265
isolats au National Antimicrobial Resistance Monitoring System
(NARMS). Parmi ces isolats, 98 pour cent étaient sérotypés ; les
plus courants étaient Salmonella Enteritidis avec
19 pour cent, Typhimurium avec
16 pour cent, Newport avec 11 pour cent, I4,[5],12:i:- avec 4 pour
cent et Heidelberg à 4 pour cent.
«Les
changements dans l'incidence de la résistance variaient selon le
sérotype. Les sérotypes I4,[5],12:i:- et Enteritidis étaient
responsables des deux tiers de l'augmentation de l'incidence de la
résistance cliniquement importante au cours de la période
2015-2016. Les infections non sensibles à la ciprofloxacine
représentaient plus de la moitié de l'augmentation. Ces estimations
peuvent aider à fixer des objectifs et des priorités pour la
prévention», selon l’article.
L'augmentation
de l'incidence des cas d’infections à Salmonella non
sensibles à la ciprofloxacine de 2015 à 2016 par rapport à
l'incidence de 2004 à 2008 et de 2010 à 2014 est une tendance
préoccupante, ont déclaré les chercheurs. Le sérotype Enteritidis
a le plus contribué à cette augmentation.
Bien
que l'incidence des cas d’infections à Enteritidis, le sérotype
le plus courant, n'ait pas changé de manière significative depuis
plus de 10 ans, le pourcentage d'infections non sensibles à la
ciprofloxacine a augmenté presque régulièrement. Le poulet et les
œufs ont été les principales sources domestiques d'infections à
Enteritidis. Environ 20% des infections à Enteritidis sont liées
aux voyages internationaux.
L'incidence
des infections présentant une résistance cliniquement importante et
une non-sensibilité à la ciprofloxacine causées par des sérotypes
classés comme autres était plus élevée en 2015-2016 qu'en
2004-2008. Certains de ces sérotypes émergent ou présentent des
niveaux de résistance préoccupants, notamment Dublin, Infantis,
Kentucky, Hadar et Agona. Certains ont été associés à une
résistance, à une maladie invasive ou aux deux.
Considérations
régionales
Les
changements dans l'incidence de la résistance par catégorie de
résistance et sérotype variaient selon la région géographique,
avec des augmentations significatives dans la plupart des régions
pour les sérotypes I4,[5],12:i:- et Enteritidis. Une augmentation de
l'incidence des infections I4,[5],12:i:- avec une résistance à
plusieurs médicaments et à l'ampicilline seule s'est produite dans
toutes les régions, avec les augmentations les plus élevées dans
l'Ouest et le Midwest.
Les
produits de porc ont été associés à des infections I4,[5],12:i:-
avec une résistance à l'ampicilline, aux sulfamides, à la
streptomycine et à la tétracycline dans
l’Ouest. Le modèle régional de consommation
de porc a reflété le modèle régional de production de porc, qui
est le plus élevé dans le Midwest. Huit des 10 États ayant la
production porcine la plus élevée se trouvent dans le Midwest.
Une
étude a montré que les souches I4,[5],12:i:- multirésistantes de
porcs du Midwest entre 2014 et 2016 étaient généralement
résistantes à l'ampicilline, aux sulfamides, à la streptomycine et
à la tétracycline et faisaient probablement partie d'un clade
européen qui s’est
répandu aux États-Unis et ailleurs. Ces souches hébergeaient des
gènes de résistance à médiation plasmidique, qui peuvent être
transmis horizontalement à d'autres bactéries.
Cette
tendance pourrait expliquer en partie les écarts augmentation
préalable de l'incidence des cas d’infections résistantes
à plusieurs antibiotiques à I4,[5],12:i:-. Les
voyages internationaux pourraient avoir contribué à une
augmentation de l'incidence des infections à Enteritidis non
sensibles à la ciprofloxacine, qui a augmenté dans trois régions
des États-Unis et était la plus élevée dans le nord-est.
Les
voyages internationaux ont augmenté depuis 2014, et les résidents
des États du nord-est ont représenté plus d'un tiers des voyageurs
américains en 2015-2016. Au Royaume-Uni, une augmentation de ces
infections a été liée aux voyages internationaux et aux aliments
importés, selon l’article. Aux États-Unis, des souches non
sensibles à la ciprofloxacine de Salmonella Enteritidis et
d'autres sérotypes ont été isolées à partir de produits de la
mer importés.
«Nos
estimations des changements significatifs se sont limitées à des
comparaisons avec les périodes de référence utilisées pour
évaluer les changements dans les pourcentages de résistance dans
les rapports annuels du NARMS», ont écrit les scientifiques.
«Notre
choix de comparer une période de deux ans récente avec des périodes
de cinq ans antérieures a équilibré le besoin d'évaluer la
situation la plus actuelle avec le besoin de données suffisantes
pour évaluer les changements importants.»
Les
chercheurs ont dit
que le fait que certaines infections non
sensibles à la ciprofloxacine n'étaient pas incluses dans la
catégorie non sensible à la ciprofloxacine appuie davantage la
conclusion selon laquelle les infections non sensibles à la
ciprofloxacine ont augmenté au cours de la période d'étude. Ils
affirment que l'utilisation croissante de tests de diagnostic
indépendants de la culture par les laboratoires cliniques peut
modifier la soumission d'isolats aux laboratoires de santé publique
et la déclaration des infections. Ces changements justifient des
ajustements dans les analyses futures.
Méthodologie
Les
chercheurs ont multiplié par 29 les estimations d'infections
confirmées par culture pour tenir compte des infections non
diagnostiquées. Cependant, les infections résistantes sont
associées à une maladie plus grave, elles pourraient donc être
plus susceptibles d'être détectées. Ainsi, selon le rapport, le
multiplicateur approprié, le rapport des infections totales aux
infections confirmées par culture, pour les infections résistantes
pourrait être inférieur à 29. Pour calculer les cas d’infections
à Salmonella non diagnostiquées, des multiplicateurs de 12
pour les personnes de moins de 5 ans et de 23 pour les personnes de
65 ans et plus ont été rapportés.
Bien
que les enfants de moins de 5 ans aient la plus forte incidence
d'infections à Salmonella, les adultes plus âgés pourraient
être responsables de manière disproportionnée des infections
résistantes, car ils sont plus susceptibles d'avoir une maladie
grave et d'être hospitalisés, ont dit
les chercheurs. Par conséquent, un multiplicateur de 23 pourrait
être un choix approprié.
«Cependant,
nous avons choisi 29 parce qu'il a été utilisé dans une estimation
précédente du nombre total d'infections à Salmonella dans la
population et parce que les personnes âgées de 5 à 64 ans
représentent la plupart des infections confirmées par culture
signalées aux CDC et la plupart des isolats présentant une
résistance cliniquement importante. soumis au NARMS», indique
l’article.
«Nous
n'avons pas attaché d'incertitudes au nombre total extrapolé
d'infections résistantes et aux changements de ce nombre, car les
incertitudes du multiplicateur ne sont pas connues. Bien que
l'incidence de la résistance puisse varier selon le sous-groupe
démographique, la région géographique, le temps et d'autres
facteurs, nous n'avons pas inclus d'incertitudes supplémentaires
provenant de l'extrapolation à la population américaine en
utilisant les estimations démographiques moyennes 2015-2016 pour les
50 États.
L'équipe
de recherche a poursuivi le projet en partie parce que les
estimations des changements dans l'incidence de la résistance
peuvent aider à identifier les tendances les plus préoccupantes
pour établir des priorités de prévention. Les analyses qui
incluent les distributions variables des infections par sous-groupes
démographiques, saison et voyages récents pourraient éclairer les
stratégies de prévention spécifiques au sérotype, régionales et
ciblées par source, disent-ils.
À
l'avenir, l'utilisation croissante du séquençage du génome entier
par les laboratoires de santé publique pour caractériser les
souches de Salmonella renforcera la surveillance des
Salmonella résistants aux antimicrobiens d'origine humaine et
non humaine, selon les scientifiques. Les agents antimicrobiens
contribuent à la résistance partout où ils sont utilisés, y
compris chez les animaux destinés à l'alimentation et les humains.
«Une
approche «Une seule santé ou One Health» peut aider
à détecter et à contrôler la résistance aux antimicrobiens, qui
est un problème complexe et à multiples facettes qui affecte les
humains, les animaux et l'environnement», ont conclu les chercheurs.
En
plus de Medalla du CDC, les chercheurs comprenaient Weidong Gu, Cindy
R. Friedman, Michael Judd, Jason Folster, Patricia M. Griffin et
Robert M. Hoekstra.