vendredi 18 juin 2021

Des scientifiques constatent une énorme augmentation des infections à Salmonella résistantes aux antibiotiques aux États-Unis

«Des scientifiques constatent une énorme augmentation des infections à Salmonella résistantes aux antibiotiques aux États-Unis», source Food Safety News.

Un groupe de chercheurs estime que les infections causées par des souches résistantes aux antibiotiques de Salmonella non typhiques ont augmenté de 40 pour cent, sur la base des statistiques de 2004-2008 par rapport aux chiffres de 2015-2016.

Une «résistance cliniquement importante» à l'ampicilline ou à la ceftriaxone ou une non-sensibilité à la ciprofloxacine a été retrouvée lors de l'examen d'environ 220 000 cas d’infections en 2015-2016, contre environ 159 000 cas d’infections en 2004-2008, selon l’article des chercheurs publié dans la revue Emerging Infectious Diseases.

«Salmonella est une cause majeure de maladie d'origine alimentaire aux États-Unis, et les souches résistantes aux antimicrobiens constituent une menace sérieuse pour la santé publique», a écrit l'équipe de scientifiques.

«En extrapolant à la population des États-Unis et en tenant compte des infections non signalées, nous avons estimé une augmentation de 40 % de l'incidence annuelle des infections présentant une résistance cliniquement importante, résistance à l'ampicilline ou à la ceftriaxone ou non-sensibilité à la ciprofloxacine», selon l’article.

Les chercheurs étaient dirigés par Felicita Medalla, épidémiologiste au Center for Emerging and Zoonotic Infectious Diseases dans la Division of Foodborne, Waterborne, and Environmental Diseases du Centers for Disease Control and Prevention des États-Unis. Ses intérêts de recherche comprennent la résistance aux antimicrobiens de Salmonella et d'autres agents pathogènes d'origine alimentaire et entérique.

De 2004 à 2016, les laboratoires de santé publique des États et les services de santé locaux participants dans les 48 États contigus ont signalé 539 862 cas d’infections à Salmonella confirmés par culture au Laboratory-Based Enteric Disease Surveillance (LEDS). Parmi les isolats de ces cas d’infections à Salmonella, 89 pour cent étaient sérotypés. Les plus courants étaient Enteritidis avec 20 pour cent, Typhimurium pour 16 avec cent, Newport avec 11 pour cent, I4,[5],12:i:- avec 4 pour cent et Heidelberg avec 4 pour cent.

Les laboratoires de santé publique des 48 États ont soumis 28 265 isolats au National Antimicrobial Resistance Monitoring System (NARMS). Parmi ces isolats, 98 pour cent étaient sérotypés ; les plus courants étaient Salmonella Enteritidis avec 19 pour cent, Typhimurium avec 16 pour cent, Newport avec 11 pour cent, I4,[5],12:i:- avec 4 pour cent et Heidelberg à 4 pour cent.

«Les changements dans l'incidence de la résistance variaient selon le sérotype. Les sérotypes I4,[5],12:i:- et Enteritidis étaient responsables des deux tiers de l'augmentation de l'incidence de la résistance cliniquement importante au cours de la période 2015-2016. Les infections non sensibles à la ciprofloxacine représentaient plus de la moitié de l'augmentation. Ces estimations peuvent aider à fixer des objectifs et des priorités pour la prévention», selon l’article.

L'augmentation de l'incidence des cas d’infections à Salmonella non sensibles à la ciprofloxacine de 2015 à 2016 par rapport à l'incidence de 2004 à 2008 et de 2010 à 2014 est une tendance préoccupante, ont déclaré les chercheurs. Le sérotype Enteritidis a le plus contribué à cette augmentation.

Bien que l'incidence des cas d’infections à Enteritidis, le sérotype le plus courant, n'ait pas changé de manière significative depuis plus de 10 ans, le pourcentage d'infections non sensibles à la ciprofloxacine a augmenté presque régulièrement. Le poulet et les œufs ont été les principales sources domestiques d'infections à Enteritidis. Environ 20% des infections à Enteritidis sont liées aux voyages internationaux.

L'incidence des infections présentant une résistance cliniquement importante et une non-sensibilité à la ciprofloxacine causées par des sérotypes classés comme autres était plus élevée en 2015-2016 qu'en 2004-2008. Certains de ces sérotypes émergent ou présentent des niveaux de résistance préoccupants, notamment Dublin, Infantis, Kentucky, Hadar et Agona. Certains ont été associés à une résistance, à une maladie invasive ou aux deux.

Considérations régionales

Les changements dans l'incidence de la résistance par catégorie de résistance et sérotype variaient selon la région géographique, avec des augmentations significatives dans la plupart des régions pour les sérotypes I4,[5],12:i:- et Enteritidis. Une augmentation de l'incidence des infections I4,[5],12:i:- avec une résistance à plusieurs médicaments et à l'ampicilline seule s'est produite dans toutes les régions, avec les augmentations les plus élevées dans l'Ouest et le Midwest.

Les produits de porc ont été associés à des infections I4,[5],12:i:- avec une résistance à l'ampicilline, aux sulfamides, à la streptomycine et à la tétracycline dans l’Ouest. Le modèle régional de consommation de porc a reflété le modèle régional de production de porc, qui est le plus élevé dans le Midwest. Huit des 10 États ayant la production porcine la plus élevée se trouvent dans le Midwest.

Une étude a montré que les souches I4,[5],12:i:- multirésistantes de porcs du Midwest entre 2014 et 2016 étaient généralement résistantes à l'ampicilline, aux sulfamides, à la streptomycine et à la tétracycline et faisaient probablement partie d'un clade européen qui s’est répandu aux États-Unis et ailleurs. Ces souches hébergeaient des gènes de résistance à médiation plasmidique, qui peuvent être transmis horizontalement à d'autres bactéries.

Cette tendance pourrait expliquer en partie les écarts augmentation préalable de l'incidence des cas d’infections résistantes à plusieurs antibiotiques à I4,[5],12:i:-. Les voyages internationaux pourraient avoir contribué à une augmentation de l'incidence des infections à Enteritidis non sensibles à la ciprofloxacine, qui a augmenté dans trois régions des États-Unis et était la plus élevée dans le nord-est.

Les voyages internationaux ont augmenté depuis 2014, et les résidents des États du nord-est ont représenté plus d'un tiers des voyageurs américains en 2015-2016. Au Royaume-Uni, une augmentation de ces infections a été liée aux voyages internationaux et aux aliments importés, selon l’article. Aux États-Unis, des souches non sensibles à la ciprofloxacine de Salmonella Enteritidis et d'autres sérotypes ont été isolées à partir de produits de la mer importés.

«Nos estimations des changements significatifs se sont limitées à des comparaisons avec les périodes de référence utilisées pour évaluer les changements dans les pourcentages de résistance dans les rapports annuels du NARMS», ont écrit les scientifiques.

«Notre choix de comparer une période de deux ans récente avec des périodes de cinq ans antérieures a équilibré le besoin d'évaluer la situation la plus actuelle avec le besoin de données suffisantes pour évaluer les changements importants.»

Les chercheurs ont dit que le fait que certaines infections non sensibles à la ciprofloxacine n'étaient pas incluses dans la catégorie non sensible à la ciprofloxacine appuie davantage la conclusion selon laquelle les infections non sensibles à la ciprofloxacine ont augmenté au cours de la période d'étude. Ils affirment que l'utilisation croissante de tests de diagnostic indépendants de la culture par les laboratoires cliniques peut modifier la soumission d'isolats aux laboratoires de santé publique et la déclaration des infections. Ces changements justifient des ajustements dans les analyses futures.

Méthodologie

Les chercheurs ont multiplié par 29 les estimations d'infections confirmées par culture pour tenir compte des infections non diagnostiquées. Cependant, les infections résistantes sont associées à une maladie plus grave, elles pourraient donc être plus susceptibles d'être détectées. Ainsi, selon le rapport, le multiplicateur approprié, le rapport des infections totales aux infections confirmées par culture, pour les infections résistantes pourrait être inférieur à 29. Pour calculer les cas d’infections à Salmonella non diagnostiquées, des multiplicateurs de 12 pour les personnes de moins de 5 ans et de 23 pour les personnes de 65 ans et plus ont été rapportés.

Bien que les enfants de moins de 5 ans aient la plus forte incidence d'infections à Salmonella, les adultes plus âgés pourraient être responsables de manière disproportionnée des infections résistantes, car ils sont plus susceptibles d'avoir une maladie grave et d'être hospitalisés, ont dit les chercheurs. Par conséquent, un multiplicateur de 23 pourrait être un choix approprié.

«Cependant, nous avons choisi 29 parce qu'il a été utilisé dans une estimation précédente du nombre total d'infections à Salmonella dans la population et parce que les personnes âgées de 5 à 64 ans représentent la plupart des infections confirmées par culture signalées aux CDC et la plupart des isolats présentant une résistance cliniquement importante. soumis au NARMS», indique l’article.

«Nous n'avons pas attaché d'incertitudes au nombre total extrapolé d'infections résistantes et aux changements de ce nombre, car les incertitudes du multiplicateur ne sont pas connues. Bien que l'incidence de la résistance puisse varier selon le sous-groupe démographique, la région géographique, le temps et d'autres facteurs, nous n'avons pas inclus d'incertitudes supplémentaires provenant de l'extrapolation à la population américaine en utilisant les estimations démographiques moyennes 2015-2016 pour les 50 États.

L'équipe de recherche a poursuivi le projet en partie parce que les estimations des changements dans l'incidence de la résistance peuvent aider à identifier les tendances les plus préoccupantes pour établir des priorités de prévention. Les analyses qui incluent les distributions variables des infections par sous-groupes démographiques, saison et voyages récents pourraient éclairer les stratégies de prévention spécifiques au sérotype, régionales et ciblées par source, disent-ils.

À l'avenir, l'utilisation croissante du séquençage du génome entier par les laboratoires de santé publique pour caractériser les souches de Salmonella renforcera la surveillance des Salmonella résistants aux antimicrobiens d'origine humaine et non humaine, selon les scientifiques. Les agents antimicrobiens contribuent à la résistance partout où ils sont utilisés, y compris chez les animaux destinés à l'alimentation et les humains.

«Une approche «Une seule santé ou One Health» peut aider à détecter et à contrôler la résistance aux antimicrobiens, qui est un problème complexe et à multiples facettes qui affecte les humains, les animaux et l'environnement», ont conclu les chercheurs.

En plus de Medalla du CDC, les chercheurs comprenaient Weidong Gu, Cindy R. Friedman, Michael Judd, Jason Folster, Patricia M. Griffin et Robert M. Hoekstra.


Aucun commentaire:

Enregistrer un commentaire

Remarque : Seul un membre de ce blog est autorisé à enregistrer un commentaire.