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samedi 20 mai 2023

Comment les caractéristiques des températures microbiennes créent une rétroaction entre le cycle du carbone du sol et le réchauffement climatique ?

Les relations microbiennes avec la température varient avec les températures environnementales le long d'un gradient climatique. Ces informations peuvent être utilisées pour prévoir comment les caractéristiques de
s températures microbiennes créent une rétroaction entre le cycle du carbone du sol et le réchauffement climatique.

Ainsi dans Applied and Environmental Microbiology, des chercheurs rapporte que la variation des dépendances à la température à travers l'Europe révèle la sensibilité au climat des décomposeurs microbiens du sol.

Résumé
La température est un déterminant majeur des taux de processus biologiques, et les micro-organismes sont des régulateurs clés de la dynamique du carbone de l'écosystème. La température contrôle les taux de décomposition microbienne, et le réchauffement peut donc stimuler la perte de carbone, créant une rétroaction positive sur le changement climatique. Si les distributions des caractéristiques qui définissent les relations des températures des communautés microbiennes peuvent s'adapter aux températures modifiées, elles pourraient moduler la force de cette rétroaction, mais si cela se produit, cela reste incertain. Dans cette étude, nous avons prélevé des sols d'un gradient climatique latitudinal à travers l'Europe.

Nous avons établi les relations de températures entre la croissance microbienne et les taux de respiration et les avons utilisées pour déterminer si et avec quelle force les distributions des caractéristiques communautaires pour la température étaient adaptées à leur environnement local. De plus, nous avons séquencé des amplicons bactériens et fongiques pour lier la variance de la composition de la communauté aux changements des caractéristiques des températures. Nous avons constaté que les distributions des caractéristiques des températures microbiennes variaient systématiquement avec le climat, ce qui suggère qu'une augmentation de la température annuelle moyenne de 1°C entraînera des distributions de traits de température microbienne décalées vers le chaud équivalentes à une augmentation de la température minimale de 0,20°C. C pour la croissance bactérienne, 0,07°C pour la croissance fongique et 0,10°C pour la respiration. Les caractéristiques des températures pour la croissance bactérienne étaient donc plus sensibles au réchauffement que ceux pour la respiration et la croissance fongique. La composition de la communauté microbienne variait également avec la température, permettant l'interconnexion des informations taxonomiques avec les caractéristiques des températures microbiennes.

Notre travail montre que l'adaptation des distributions des caractéristiques des températures microbiennes à un réchauffement climatique affectera la rétroaction climatique du cycle du carbone, soulignant la nécessité de la représenter pour capturer la rétroaction microbienne au changement climatique.
Importance
L'une des plus grandes incertitudes du réchauffement climatique est de savoir si la rétroaction des décomposeurs microbiens renforcera ou affaiblira la rétroaction du cycle du carbone-climat du sol. Malgré des décennies d'efforts de recherche, la force de cette rétroaction sur le réchauffement reste inconnue. Nous présentons ici des preuves que les relations des températures microbiennes varient systématiquement avec les températures environnementales le long d'un gradient climatique et utilisons ces informations pour prévoir comment les caractéristiques des températures microbiennes créeront une rétroaction entre le cycle du carbone du sol et le réchauffement climatique. Nous montrons que l'utilisation actuelle d'une sensibilité universelle à la température est insuffisante pour représenter la rétroaction microbienne au changement climatique et fournissons de nouvelles estimations pour remplacer cette hypothèse erronée dans les modèles du système terrestre. Nous démontrons également que les relations de température pour les taux de croissance microbienne et de respiration sont différemment affectées par le réchauffement, avec des réponses plus fortes au réchauffement pour la croissance microbienne (formation de carbone du sol) que pour la respiration (perte de carbone du sol vers l'atmosphère), ce qui affectera l’équilibre carbone de l'atmosphère et de la terre.

NB ; On lira aussi dans Microcosm, le journal de l’ASM, «Des experts du changement climatique exploitent les microbes pour protéger la planète».

mercredi 21 septembre 2022

Cuisson à des températures internes sûres

Ah si nous avions des températures internes sûres pour la cuisson de la viande en France avec un thermomètre alimentaire, qui sait combien d'intoxication alimentaire nous éviterions ?
Un thermomètre alimentaire est pratique pour une cuison sûre des steaks hachés ...

Voici des pictogrammes éléborés par le CDC aux Etats-Unis.
 145°F = 63°C ; 160°F = 71°C ; 165°F = 74°C

mercredi 10 août 2022

Conseils clés aux entreprises alimentaires confrontées à ces températures élevées, selon l'AFSCA de Belgique

Le ministère de la Santé et l’Anses donnent des conseils d’hygiène aux particuliers, c’est bien, mais qui pense en France aux entreprises alimentaires ?

«Vague de chaleur – l’AFSCA réitère ses conseils clés aux entreprises alimentaires confrontées à ces températures élevées», source communiqué de presse de l’AFSCA du 10 août 2022.

«L’été s’ra chaud»... et très chaud même ! Les températures tropicales, you hate it or you love it, mais l’AFSCA veille à ce que cette chaleur n’ouvre pas la voie aux bactéries néfastes pour la santé.

Chaque été, l'AFSCA reçoit davantage de notifications de consommateurs qui pensent être tombés malades après avoir consommé des aliments. Au cours des mois de juin et juillet de cette année, ces notifications ont doublé et ce n'est pas surprenant : les événements se multiplient, les bars pop-up ouvrent leurs portes, les gens se retrouvent autour d'un barbecue chaleureux,... Comme toujours - et certainement maintenant en pleine vague de chaleur - l'AFSCA aide les entreprises alimentaires à garder la tête froide … tout comme leurs produits !

Conseil 1 : vérifiez les températures de vos produits à la réception
Conseil 2 : gardez un œil sur le thermomètre
Conseil 3 : baissez temporairement la température du réfrigérateur ou du congélateur
Conseil 4 : ne remplissez pas complètement vos buffets mais réapprovisionnez-les petit à petit
Conseil 5 : protégez vos produits du rayonnement direct du soleil
Conseil 6 : dégivrez lentement…ou très rapidement !
Conseil 7 : gérez adéquatement les produits invendus

 Lire aussi : 7 conseils alimentaires de l'AFSCA à des températures élevées.

Aux lecteurs du blog
La revue PROCESS Alimentaire censure pour une triste question d’argent les 10 052 articles initialement publiés gracieusement par mes soins de 2009 à 2017 sur le blog de la revue, alors que la revue a bénéficié de la manne de la publicité faite lors de la diffusion de ces articles. La revue PROCESS Alimentaire a fermé le blog et refuse tout assouplissement. Derrière cette revue, il faut que vous le sachiez, il y a une direction aux éditions du Boisbaudry, pleine de mépris, et un rédacteur en chef complice !

lundi 10 janvier 2022

De nouvelles bactéries dans les eaux britanniques alors que les températures augmentent. Vibrio inside !

Huîtres indigènes à Chichester Harbour.
Crédit Dr Luke Helmer

«De nouvelles bactéries dans les eaux britanniques alors que les températures augmentent», source communiqué de l’Universite d’Exeter.

La hausse des températures provoque une «diversité croissante» de bactéries Vibrio dans la mer autour du Royaume-Uni, selon une nouvelles étude.

L'étude, dirigée par l'Université d'Exeter, a trouvé deux espèces de Vibrio - Vibrio rotiferianus et Vibrio jasicida - qui n'avaient jamais été enregistrées dans les eaux britanniques auparavant.

Ces espèces peuvent nuire aux créatures marines telles que les coquillages, mais la gamme croissante d'espèces Vibrio soulève également des inquiétudes pour la santé humaine.

Certaines bactéries Vibrio peuvent provoquer une gastro-entérite lorsqu'elles sont consommées dans des coquillages crus ou insuffisamment cuits, et la bactérie peut également provoquer des infections cutanées.

Les chercheurs disent que la propagation des espèces Vibrio a entraîné une «augmentation mondiale» des vibrioses chez les humains et les animaux aquatiques.

«Les espèces Vibrio peuvent souvent être trouvées dans les eaux britanniques en été, lorsque les températures leur sont plus favorables», a déclaré le Dr Sariqa Wagley, de l'Université d'Exeter.

«Avec l'augmentation des températures de surface de la mer en raison du changement climatique, l'activité Vibrio dans les eaux est plus courante et la diversité des espèces Vibrio augmente désormais.»

L'étude a utilisé les données du Met Office pour identifier les endroits où les températures estivales à la surface de la mer étaient favorables aux bactéries Vibrio (sur la base du nombre moyen de jours par an plus chauds que 18°C).

Les chercheurs ont ensuite analysé des échantillons de coquillages provenant de quatre sites utilisés par l'industrie conchylicole C,hichester Harbour, Osea Island, Whitstable Bay et Lyme Bay.

«Nous avons trouvé Vibrio parahaemolyticus, la principale cause de gastro-entérite d'origine marine dans le monde, à Chichester Harbour», a déclaré le Dr Wagley.

«Vibrio alginolyticus, qui peut également provoquer des maladies chez l'homme, a été identifié sur trois des sites où la température de la surface de la mer était supérieure à 18°C (Chichester Harbour, Osea Island et Whitstable Bay).»

«Il est important de noter qu'une cuisson complète tue les bactéries Vibrio dangereuses dans les produits de la mer.»

Cependant, l'abondance et la diversité croissantes de la bactérie Vibrio créent des risques pour la santé non seulement pour les personnes qui mangent des produits de la mer, mais aussi pour ceux qui utilisent la mer à des fins récréatives - en raison de l'ingestion d'eau de mer infectée ou de la pénétration de bactéries dans des plaies ou des coupures exposées.

«Les bactéries Vibrio constituent également une menace pour diverses espèces marines, y compris les coquillages eux-mêmes. Les maladies coûtent à l'industrie aquacole mondiale 6 milliards de livres sterling par an, et ce fardeau de la maladie peut être dévastateur.»

Nous n'avons pas encore vu de mortalité massive de coquillages due à la bactérie Vibrio ici au Royaume-Uni, mais cela s'est produit ailleurs, y compris en France et en Australie.»

style="font-variant: normal; letter-spacing: normal; line-height: 100%; text-align: justify;"> Le Dr Wagley a ajouté: «Nos résultats soutiennent l'hypothèse selon laquelle les maladies associées à Vibrio sont en augmentation et sont influencées par l'augmentation de la température de surface de la mer.»

«Nous devons surveiller cette situation de près, pour protéger la santé humaine, la biodiversité marine et l'industrie des produits de la mer.»

Le Dr Joanne Preston, de l'Université de Portsmouth, a déclaré : «Il est important de surveiller l'impact de l'augmentation de la température de surface de la mer sur les pathogènes potentiels des coquillages, non seulement pour la santé et la sécurité humaines, mais aussi pour comprendre la résilience de nos espèces et habitats côtiers. au changement climatique.»

Le Dr Luke Helmer, de la Blue Marine Foundation et de l'Université de Portsmouth, a ajouté: «Les impacts du changement climatique sur l'environnement marin sont susceptibles d'être généralisés.»

«Comprendre comment ces changements affecteront les espèces d'importance écologique et commerciale et les personnes qui en dépendent sera crucial pour aller de l'avant, afin de les réduire.»

L'étude, financée par le Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC), a été soutenue par les Conseils de Chichester et Havant et la Sussex Inshore Fisheries and Conservation Authority.

L'article, publié dans la revue Water Research, s'intitule: «The increased prevalence of Vibrio species and the first reporting of Vibrio jasicida and Vibrio rotiferianus at UK shellfish sites» (La prévalence accrue des espèces Vibrio et le premier signalement de Vibrio jasicida et Vibrio rotiferianus sur les sites de coquillages du Royaume-Uni).

Aux lecteurs du blog
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mercredi 25 novembre 2020

La hausse des températures mondiales est-elle liée une augmentation de la résistance aux antibiotiques?

Ces cartes de 28 pays européens illustrent l’augmentation moyenne de la résistance aux antibiotiques pour  trois agents pathogènes courants (à gauche) et la température minimale moyenne annuelle (à droite)  entre 2000 et 2016. Crédit: Sarah McGough, Boston Children’s

«La hausse des températures mondiales est-elle liée une augmentation de la résistance aux antibiotiques», source Phys.org.

Une nouvelle analyse des données suggère que deux menaces croissantes pour la santé publique - le changement climatique et la résistance aux antibiotiques - sont liées. L'étude, qui s'étend de 2000 à 2016, n'établit pas de cause à effet. Mais ses conclusions, dans la revue Eurosurveillance, suggèrent que la hausse des températures mondiales pourrait contribuer à alimenter l'augmentation des bactéries résistantes aux antibiotiques.

Des chercheurs dirigés par Mauricio Santillana et Sarah McGough du Boston Children's Hospital Computational Health Informatics Program (CHIP) ont exploité les données de surveillance nationales de 28 pays européens, intégrant les résultats des tests chez plus de 4 millions de patients . Ils ont analysé la prévalence de la résistance aux antibiotiques au fil du temps, en se concentrant sur trois bactéries courantes (Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae et Staphylococcus aureus). Ils ont également recueilli des données sur la température européenne à partir de sources européennes et américaines.

«Notre étude longitudinale est la première à montrer que les pays européens où la température minimale ambiante est plus chaude ont connu des augmentations plus aiguës de la résistance aux antibiotiques au cours des 17 dernières années», a dit Santillana, également affilié à l'Harvard Medical School et à la Harvard T.H. Chan School of Public Health.

«Cette observation aide à expliquer les différences géographiques de résistance aux antibiotiques documentées dans d'autres études transversales. Une telle résistance pourrait éventuellement rendre nos agents antibiotiques les plus efficaces obsolètes.»

Les températures et la résistance aux antibiotiques augmentent de façon synchronisée

Les pays d'Europe du Sud avec des températures minimales plus chaudes de 10°C, comme l'Espagne, le Portugal, la Roumanie et l'Italie, ont enregistré une augmentation plus rapide de la prévalence de la résistance aux antibiotiques au fil du temps que les pays plus froids d'Europe du Nord comme la Suède et la Finlande et la Norvège. Les augmentations de la résistance allaient de 0,33 à 1,2 pour cent par an, même après avoir tenu compte de facteurs tels que la densité de la population locale et les modèles locaux d'utilisation d'antibiotiques.

L'association était valable pour les quatre classes d'antibiotiques analysées et pour deux des trois espèces bactériennes analysées. (La résistance a diminué pour la troisième bactérie, S. aureus; les chercheurs attribuent cela aux importants efforts de santé publique à travers l'Europe pour réduire S. aureus résistant à la méthicilline, ou SARM).

Pourquoi la température affecterait-elle la résistance aux antibiotiques?

Les chercheurs reconnaissent que leurs preuves sont circonstancielles. En d'autres termes, les augmentations de températures et de la résistance aux antibiotiques pourraient avoir changé indépendamment l'une de l'autre. Cependant, ils présentent certaines façons potentielles dont la température pourrait affecter la résistance aux antibiotiques.

Par exemple, des expériences in vitro montrent que la croissance bactérienne augmente à des températures chaudes, ce qui pourrait faciliter la transmission de souches résistantes. D'autres études fournissent des preuves que des températures plus élevées améliorent le transfert des gènes de résistance aux antibiotiques entre les bactéries.

Pour approfondir le lien, les chercheurs appellent à des études similaires à long terme aux États-Unis, surveillant la température et la résistance aux antibiotiques dans différentes régions du pays au fil du temps.

«Nos résultats peuvent motiver les futures recherches à mieux comprendre les mécanismes biologiques ou les modèles de comportement humain, tels que les pratiques agricoles, qui peuvent se produire dans des endroits plus chauds et peuvent avoir facilité l'augmentation rapide de la souche bactérienne résistante aux antibiotiques», déclare McGough.

«Une meilleure caractérisation des facteurs génétiques et biologiques qui peuvent contribuer à la propagation accrue des souches résistantes aux antibiotiques peut nous aider à mieux concevoir la santé publique et des interventions cliniques spécifiques», ajoute le co-auteur de l'étude Derek R. MacFadden.