Les cas à Listeria augmentent en Angleterre et au Pays de Galles

«Les cas à Listeria augmentent en Angleterre et au Pays de Galles», source article de Joe Whitworth paru le 3 octobre 2023 dans Food Safety News.

Le nombre de cas d’infection à Listeria a augmenté en 2021 en Angleterre et au Pays de Galles, selon l’UK Health Security Agency (UKHSA).

Au total, 160 cas de listériose ont été signalés en Angleterre et au Pays de Galles, contre 124 infections en 2020.

La surveillance nationale en Angleterre et au Pays de Galles est coordonnée par la Gastrointestinal Infections and Food Safety (One Health) à l’UK Health Security Agency (UKHSA), avec le soutien de Public Health Wales.

Au total, 22 personnes sont décédées, dont 12 avaient la listériose inscrite comme cause de décès sur le certificat de décès.

Les taux d'incidence étaient les plus élevés chez les personnes âgées de 80 ans et plus. L'incidence de la listériose était plus faible chez les hommes que chez les femmes, mais pour les groupes d'âge de 70 à 79 ans et de 80 ans et plus, les cas signalés chez les hommes étaient plus élevés que chez les femmes.

Sur 35 cas dans les groupes d'âge de 10 à 19 ans, de 20 à 29 ans et de 30 à 39 ans, 28 étaient des femmes et 24 étaient enceintes. Les infections associées à la grossesse représentaient environ un cinquième de tous les cas signalés, et 20% des cas liés à la grossesse entraînaient une mortinatalité ou une fausse couche.

L'incidence la plus faible était au Pays de Galles, avec cinq cas, et la plus élevée à Londres, avec 34 cas d’infection. Septembre a été le mois le plus élevé pour les déclarations de listériose en 2021.

Les cas en Angleterre et au Pays de Galles sont revenus aux niveaux observés avant la pandémie de COVID-19.

«Il est probable que la pandémie et les interventions non pharmaceutiques associées mises en œuvre pour contrôler le coronavirus ont affecté la surveillance des maladies gastro-intestinales de plusieurs manières. Il convient toutefois de noter que les interventions mises en œuvre au cours de cette période auraient été moins susceptibles d'affecter la déclaration des cas de listériose de la même manière que d'autres cas d'infections gastro-intestinales en raison de la plus grande gravité de la maladie des cas de listériose», selon le rapport. .

Notification de foyers de cas

Trois foyers ont fait l'objet d'une enquête en Angleterre et au Pays de Galles. Les sources étaient des produits de langue de bœuf cuite, du corned-beef et du poisson fumé, tous des aliments à haut risque de listériose chez les groupes vulnérables.

Les produits de langue de bœuf cuite ont rendu trois personnes malades. Le corned-beef a touché quatre personnes de 2019 à 2021. Cinq patients ont été enregistrés en 2020 et 2021 dans un foyer lié à du poisson fumé.

Entre novembre et décembre 2020, un foyer de cas a été détecté en Angleterre après que trois personnes ont été infectées par la même souche de Listeria monocytogenes, dont une est décédée. Tous les patients, y compris une femme enceinte, présentaient des affections sous-jacentes ou des facteurs de risque de listériose. Un patient a déclaré avoir mangé des morceaux de saumon et des tranches de saumon fumé provenant d'une chaîne de supermarchés britannique.

Le séquençage du génome entier (WGS) d'isolats de saumon fumé dans un pays de l'UE a permis d'identifier la souche épidémique. Les échantillons ont été tracés jusqu'à un fournisseur de poisson au Royaume-Uni qui distribuait des produits au supermarché. Deux autres patients ont été identifiés en 2021. Tous deux ont déclaré avoir consommé du saumon fumé.

Impact du changement climatique

Parallèlement, l'UKHSA a publié une revue des indicateurs pertinents pour la surveillance du changement climatique et de la santé en Angleterre.

Plusieurs des 59 indicateurs concernaient l'alimentation. Pour les «Foyers de cas d’origine alimentaire et/ou préoccupations et alertes signalées» et «Incidence des maladies d’origine alimentaire», il a été nécessaire de procéder à un nouveau traitement des données.

Les scientifiques ont noté que les risques liés à la sécurité des aliments pourraient changer et que la réponse aux impacts climatiques pourrait impliquer une utilisation accrue de pesticides, d'antibiotiques, d'engrais et de produits chimiques pour maximiser les rendements, ce qui pourrait conduire à une contamination chimique croissante des cultures et du bétail.

Les inondations ou les sécheresses pourraient également affecter l’approvisionnement public en eau. Des épidémies provenant de l'eau sont signalées. Cependant, la cause de la contamination et le rôle des conditions météorologiques ne sont pas systématiquement enregistrés.

La hausse des températures est indirectement liée aux risques, notamment à l'augmentation des maladies d'origine alimentaire, selon le rapport.

«Plusieurs études épidémiologiques ont montré que l’incidence des maladies dues à une contamination bactérienne est sensible à la température. De nombreuses infections gastro-intestinales sont contractées à l’étranger et il est nécessaire d’améliorer la surveillance des infections liées aux voyages. Comme pour d’autres maladies sensibles au climat, il est nécessaire d’établir le rôle des facteurs climatiques et météorologiques dans tout changement de leur incidence. Cela doit être fait avec les conseils d’experts.»

Hausse des maladies d'origine alimentaire attendue en raison du changement climatique

«Hausse des maladies d'origine alimentaire attendue en raison du changement climatique», source article de Joe Whitworth paru le 9 août 2023 dans Food Safety News.

Selon des scientifiques, le changement climatique devrait entraîner une augmentation des infections d'origine alimentaire et présenter un risque croissant pour la santé publique en Allemagne.

Un article (Impact of climate change on foodborne infections and intoxications) d'une série d'articles publiés dans le Journal of Health Monitoring par l'Institut Robert Koch, porte sur l'influence du changement climatique sur les intoxications d'origine alimentaire.

L'examen examine les risques pour la santé humaine posés par les bactéries, les parasites et les biotoxines marines d'origine alimentaire en Allemagne, notamment Salmonella, Campylobacter et Vibrio, ainsi que les parasites Cryptosporidium et Giardia.

Les changements climatiques peuvent entraîner une hausse des températures de l'air et de l'eau, une augmentation des précipitations ou une pénurie d'eau. Par exemple, à l'avenir, l'agriculture devra peut-être compter davantage sur les eaux usées traitées en raison des pénuries d'eau. Cela pose un risque pour la sécurité des aliments, en raison de la contamination possible des produits irrigués par des pathogènes, ont dit les chercheurs.

Campylobacter, Salmonella et Vibrio

Les infections à Campylobacter sont généralement saisonnières, avec la plupart des cas pendant les mois d'été de juillet à septembre. Avec le réchauffement progressif dû au changement climatique et les périodes chaudes prolongées associées, une augmentation des cas est attendue.

Il est également possible que pendant les mois d'été, l'augmentation des températures entraîne une prévalence plus élevée dans les troupeaux de volailles et une plus grande exposition des consommateurs via la consommation de viande de volaille, selon l'étude.

Des comportements modifiés pendant les mois d'été pourraient avoir un effet indirect sur l'augmentation des infections, comme des barbecues plus fréquents de volaille et d'autres viandes, ou la nage dans des eaux de surface. Une augmentation des infections et des épidémies a également été observée après de fortes pluies et des inondations.

En Europe, la plupart des cas de salmonellose sont signalés pendant les mois d'été.

La croissance favorisée de Salmonella à des températures plus élevées entraîne des concentrations plus élevées dans les aliments contaminés pendant les périodes plus chaudes. Cela est entre autres lié à une mauvaise préparation et réfrigération des aliments lors des barbecues ou des pique-niques, également plus fréquents en été. Des températures élevées augmentent le risque de rupture de la chaîne du froid, ce qui peut avoir un impact significatif sur l'état microbiologique des aliments.

Les infections à Vibrio d'origine alimentaire sont jusqu'à présent rares en Europe. La présence de Vibrio spp. est favorisée par le réchauffement climatique et l'augmentation des vagues de chaleur et pourrait conduire à sa propagation et éventuellement à l'établissement de nouveaux types en Europe, de sorte que l'incidence de l'infection humaine pourrait augmenter à l'avenir, selon les chercheurs.

L'augmentation de la température de l'eau entraînera une amplification de la contamination par Vibrio dans les zones européennes de capture, de récolte et d'élevage de fruits de mer, et s'étendra également au-delà des mois d'été et d'automne.

Des informations précises sur les infections à Vibrio d'origine alimentaire ne sont pas encore disponibles. En Allemagne, seuls des cas isolés ont été enregistrés depuis l'introduction de la déclaration obligatoire en 2020, ce qui peut indiquer soit une faible exposition aux produits contenant du Vibrio, soit qu'une grande partie des maladies ne sont pas détectées ou signalées. Les produits crus et insuffisamment cuits tels que les moules et les huîtres présentent un risque, en particulier pour les personnes dont le système immunitaire est affaibli ou qui ont des conditions préexistantes.

Parasites et mesures de prévention

Les recherches de l'Institut fédéral allemand pour l'évaluation des risques (BfR), qui n'ont pas encore été publiées, indiquent qu'un changement climatique a également un impact direct sur la prévalence et la virulence des parasites, qui sont déjà très stables dans l'environnement. Cryptosporidium et Giardia peuvent rester infectieux pendant une longue période et provoquer des maladies, en particulier après la consommation d'aliments crus contaminés.

Les conditions météorologiques extrêmes telles que les fortes pluies et les inondations, qui devraient augmenter en raison du changement climatique, augmentent le risque que des oocystes ou kystes infectieux pénètrent dans les plans d'eau, ainsi que le risque de contamination des aliments d'origine végétale, ont dit les chercheurs.

Le changement climatique modifie la répartition géographique de certaines espèces d'algues qui peuvent être impliquées dans la formation de proliférations d'algues nuisibles. Les biotoxines marines ne sont pas détectables par l'odeur, le goût ou l'apparence et ne sont généralement pas détruites par la cuisson, la congélation ou d'autres processus de préparation.

«Nos principales recommandations pour minimiser les risques pour la santé liés aux infections et aux intoxications d'origine alimentaire se situent dans le domaine de l'hygiène de la cuisine, qui doit toujours être appliquée lors de la préparation des aliments. Cela comprend un lavage minutieux des mains et l'utilisation d'ustensiles de cuisine frais après avoir manipulé de la viande et du poisson crus, ainsi que la prévention de la contamination croisée», ont dit les chercheurs.

«De plus, la plupart des pathogènes microbiologiques peuvent être tués en toute sécurité par un processus de cuisson suffisant ; par exemple, une température à cœur de 70°C pendant au moins deux minutes doit être maintenue lors de la préparation des fruits de mer.

«Nous recommandons également l'utilisation de nouvelles technologies pour suivre les chaînes d'approvisionnement. Compte tenu d'un réseau de distribution alimentaire mondialisé et de l'utilisation de différentes techniques de transformation et de conservation, il peut être difficile difficile de suivre la chaîne d'approvisionnement d'un produit pour identifier les risques potentiels. Les progrès technologiques ont produit des solutions numériques pour cela; la connaissance des stocks de poissons, la traçabilité des produits de la mer et la transparence de la chaîne d'approvisionnement peuvent bénéficier d'approches innovantes.

Complément du 10 août 2023

La Banque mondiale puble le 9 août 2023 ce document, «The Global Climate Crisis Poses Serious Risks to Human Health and Wellbeing» (La crise climatique mondiale pose de sérieux risques pour la santé et le bien-être humains).

Un nouveau rapport souligne l'importance des microbes dans la modélisation du changement climatique

Un nouveau rapport souligne l'importance des microbes dans la modélisation du changement climatique, souce American Society for Microbiology (ASM).

L'American Academy of Microbiology, un groupe de direction honorifique et un groupe de réflexion scientifique au sein de l'American Society for Microbiology (ASM), a publié un nouveau rapport issu d’un colloque, Microbes in Models: Steps for Integrating Microbes into Earth System Models for Understanding Climate Change, examinant les défis liés à l'inclusion explicite des processus microbiens dans les modèles du système terrestre afin d'améliorer les projections des modèles. 

Les modèles climatiques aident les scientifiques à comprendre les changements environnementaux actuels et à faire des projections pour l'avenir de la Terre, ce qui peut éclairer les réponses de la société aux effets négatifs du changement climatique. Les microbes influenceront également le changement climatique en entraînant des cycles biogéochimiques par la consommation et la production de gaz à effet de serre. L'inclusion de processus microbiens dans les modèles du système terrestre peut améliorer les projections des modèles.   

Le Groupe d'experts intergouvernemental sur l'évolution du climat (GIEC) a récemment signalé que «les impacts et les risques liés au changement climatique deviennent de plus en plus complexes et plus difficiles à gérer». Avec environ 3,3 à 3,6 milliards de personnes vivant dans des zones très vulnérables au changement climatique, les modèles du système terrestre aident à affiner la complexité du changement climatique en termes plus gérables pour guider les stratégies de planification et les mesures d'atténuation pour faire face à la menace pressante du changement climatique pour l'humanité.

Cependant, comprendre pleinement la rétroaction entre le changement climatique et les microbes, puis inclure ces processus dans les modèles du système terrestre, est un défi majeur. Le rapport décrit les 10 principaux défis qui doivent être surmontés pour mieux intégrer les processus microbiens dans les modèles du système terrestre. Les principaux défis de la recherche comprennent :  

- Compromis dans la complexité du modèle.  
- Identification des groupes fonctionnels microbiens.    
- Échelle temporelle et spatiale des microbes versus modèles globaux.  
- Harmonisation des données.  

Ce rapport est le résultat du colloque organisé par l'Académie en décembre 2022. L'événement a réuni plus de 25 experts des domaines de la microbiologie et de la modélisation climatique qui ont fourni des perspectives et des idées à multiples facettes. Ce colloque fait partie du Climate Change & Microbes Scientific Portfolio sur 5 ans, axé sur l'amélioration des connaissances scientifiques sur le changement climatique et les microbes, l'élaboration de politiques sur le changement climatique et la conduite d'innovations sur le marché.  

En savoir plus sur l'impact des microbes sur le changement climatique sur la page de ressources Microbes and Climate Change de l'American Society for Microbiology . 

Comment les caractéristiques des températures microbiennes créent une rétroaction entre le cycle du carbone du sol et le réchauffement climatique ?

Les relations microbiennes avec la température varient avec les températures environnementales le long d'un gradient climatique. Ces informations peuvent être utilisées pour prévoir comment les caractéristiques des températures microbiennes créent une rétroaction entre le cycle du carbone du sol et le réchauffement climatique.

Ainsi dans Applied and Environmental Microbiology, des chercheurs rapporte que la variation des dépendances à la température à travers l'Europe révèle la sensibilité au climat des décomposeurs microbiens du sol.

Résumé

La température est un déterminant majeur des taux de processus biologiques, et les micro-organismes sont des régulateurs clés de la dynamique du carbone de l'écosystème. La température contrôle les taux de décomposition microbienne, et le réchauffement peut donc stimuler la perte de carbone, créant une rétroaction positive sur le changement climatique. Si les distributions des caractéristiques qui définissent les relations des températures des communautés microbiennes peuvent s'adapter aux températures modifiées, elles pourraient moduler la force de cette rétroaction, mais si cela se produit, cela reste incertain. Dans cette étude, nous avons prélevé des sols d'un gradient climatique latitudinal à travers l'Europe.

Nous avons établi les relations de températures entre la croissance microbienne et les taux de respiration et les avons utilisées pour déterminer si et avec quelle force les distributions des caractéristiques communautaires pour la température étaient adaptées à leur environnement local. De plus, nous avons séquencé des amplicons bactériens et fongiques pour lier la variance de la composition de la communauté aux changements des caractéristiques des températures. Nous avons constaté que les distributions des caractéristiques des températures microbiennes variaient systématiquement avec le climat, ce qui suggère qu'une augmentation de la température annuelle moyenne de 1°C entraînera des distributions de traits de température microbienne décalées vers le chaud équivalentes à une augmentation de la température minimale de 0,20°C. C pour la croissance bactérienne, 0,07°C pour la croissance fongique et 0,10°C pour la respiration. Les caractéristiques des températures pour la croissance bactérienne étaient donc plus sensibles au réchauffement que ceux pour la respiration et la croissance fongique. La composition de la communauté microbienne variait également avec la température, permettant l'interconnexion des informations taxonomiques avec les caractéristiques des températures microbiennes.

Notre travail montre que l'adaptation des distributions des caractéristiques des températures microbiennes à un réchauffement climatique affectera la rétroaction climatique du cycle du carbone, soulignant la nécessité de la représenter pour capturer la rétroaction microbienne au changement climatique.

Importance

L'une des plus grandes incertitudes du réchauffement climatique est de savoir si la rétroaction des décomposeurs microbiens renforcera ou affaiblira la rétroaction du cycle du carbone-climat du sol. Malgré des décennies d'efforts de recherche, la force de cette rétroaction sur le réchauffement reste inconnue. Nous présentons ici des preuves que les relations des températures microbiennes varient systématiquement avec les températures environnementales le long d'un gradient climatique et utilisons ces informations pour prévoir comment les caractéristiques des températures microbiennes créeront une rétroaction entre le cycle du carbone du sol et le réchauffement climatique. Nous montrons que l'utilisation actuelle d'une sensibilité universelle à la température est insuffisante pour représenter la rétroaction microbienne au changement climatique et fournissons de nouvelles estimations pour remplacer cette hypothèse erronée dans les modèles du système terrestre. Nous démontrons également que les relations de température pour les taux de croissance microbienne et de respiration sont différemment affectées par le réchauffement, avec des réponses plus fortes au réchauffement pour la croissance microbienne (formation de carbone du sol) que pour la respiration (perte de carbone du sol vers l'atmosphère), ce qui affectera l’équilibre carbone de l'atmosphère et de la terre.

NB ; On lira aussi dans Microcosm, le journal de l’ASM, «Des experts du changement climatique exploitent les microbes pour protéger la planète».

Des scientifiques mettent en garde contre l'augmentation des infections bactériennes potentiellement mortelles en raison du réchauffement climatique

Cette fois-ci, loin de les négliger, ce n’est pas une zoonose qui est en cause, du coup One Health ?

Voici que «Des scientifiques mettent en garde contre l'augmentation des infections bactériennes potentiellement mortelles en raison du réchauffement climatique», source communiqué de l'Université d'East Anglia.

La poursuite du réchauffement climatique entraînerait une augmentation du nombre et de la propagation d'infections potentiellement mortelles causées par des bactéries présentes le long de certaines parties de la côte des États-Unis.

La bactérie Vibrio vulnificus se développe dans les eaux côtières chaudes peu profondes et peut infecter une coupure ou une piqûre d'insecte lors d'un contact avec l'eau de mer. Une nouvelle étude menée par l'Université britannique d'East Anglia (UEA), «Climate warming and increasing Vibrio vulnificus infections in North America», montre que le nombre d'infections à V. vulnificus le long de la côte Est des États-Unis, un point chaud mondial pour de telles infections, est passé de 10 à 80 par an sur une période de 30 ans.

De plus, chaque année, des cas surviennent plus au nord. À la fin des années 1980, des cas ont été découverts dans le golfe du Mexique et le long de la côte sud de l'Atlantique, mais étaient rares au nord de la Géorgie. Aujourd'hui, on les trouve aussi loin au nord que Philadelphie.

Les chercheurs prédisent que d'ici 2041-2060, les infections pourraient se propager pour englober les principaux centres de population autour de New York. Combiné à une population croissante et de plus en plus âgée, qui est plus susceptible d'être infectée, le nombre de cas annuels pourrait doubler.

D'ici 2081-2100, des infections pourraient être présentes dans tous les États de l'Est des États-Unis dans des scénarios d'émissions et de réchauffement futurs moyens à élevés.

Les résultats, publiés dans la revue Scientific Reports, sont importants car bien que le nombre de cas aux États-Unis ne soit pas important, une personne infectée par V. vulnificus a une chance sur cinq de mourir. C'est aussi l'agent pathogène marin le plus coûteux à traiter aux États-Unis.

La maladie culmine en été et voit la bactérie se propager rapidement et endommager gravement la chair de la personne. En conséquence, on l'appelle communément une maladie «mangeuse de chair» et de nombreuses personnes qui survivent ont été amputées des membres.

L'auteur principal de l'étude, Elizabeth Archer, chercheuse à l'UEA, a dit : «L'expansion prévue des infections met en évidence la nécessité d'une sensibilisation accrue à la santé individuelle et publique dans les zones touchées. Ceci est crucial car une action rapide lorsque des symptômes apparaissent est nécessaire pour prévenir des conséquences majeures pour la santé.»

«Les émissions de gaz à effet de serre provenant de l'activité humaine modifient notre climat et les impacts peuvent être particulièrement aigus sur les côtes du monde, qui constituent une frontière majeure entre les écosystèmes naturels et les populations humaines et sont une source importante de maladies humaines.»

«Nous montrons que d'ici la fin du 21e siècle, les infections à V. vulnificus s'étendront plus au nord, mais la distance au nord dépendra du degré de réchauffement supplémentaire et donc de nos futures émissions de gaz à effet de serre.»

«Si les émissions sont maintenues à un niveau bas, les cas peuvent s'étendre vers le nord uniquement jusqu'au Connecticut. Si les émissions sont élevées, des infections devraient se produire dans tous les États américains de la côte Est. D'ici la fin du 21e siècle, nous prévoyons qu'environ 140 à 200 cas d’infection à V. vulnificus pourraient être signalées chaque année.»

L'équipe de recherche suggère que les individus et les autorités sanitaires pourraient être avertis en temps réel des conditions environnementales particulièrement à risque grâce à des systèmes d'alerte précoce spécifiques à la mer ou à Vibrio.

Les mesures de contrôle actif pourraient inclure des programmes de sensibilisation plus importants pour les groupes à risque, par exemple les personnes âgées et les personnes souffrant de problèmes de santé sous-jacents, et une signalisation côtière pendant les périodes à haut risque.

Le co-auteur, le Professeur Iain Lake de l'UEA a déclaré : «L'observation que les cas à V. vulnificus se sont étendus vers le nord le long de la côte Est des États-Unis est une indication de l'effet que le changement climatique a déjà sur la santé humaine et le littoral. Savoir où les cas sont susceptibles de se produire à l'avenir devrait aider les services de santé à planifier l'avenir.»

L'étude est la première à cartographier comment les emplacements des cas de V. vulnificus ont changé le long de la côte est des États-Unis. C'est également le premier à explorer comment le changement climatique peut influencer la propagation des cas à l'avenir.

Les informations sur l'endroit où les personnes ont attrapé l'infection à V. vulnificus ont été obtenues auprès du Centers for Disease Control and Prevention des États-Unis. Cela a permis à l'équipe de cartographier comment les cas à Vibrio vulnificus se sont étendus vers le nord sur 30 ans de 1988 à 2018.

Les informations sur la température basées sur des observations et des modèles climatiques informatisés ont ensuite été utilisées pour prédire où, aux États-Unis, des cas pourraient se produire d'ici la fin du 21e siècle.

Le co-auteur, le professeur James Oliver de l'Université de Caroline du Nord à Charlotte, aux États-Unis, a déclaré : «Il s'agit d'un article historique qui non seulement lie le changement climatique mondial à la maladie, mais fournit des preuves solides de la propagation environnementale de ce pathogène bactérien extrêmement mortel.»

Comment les agents pathogènes survivent et se développent dans un climat changeant

«Comment les agents pathogènes survivent et se développent dans un climat changeant», source article d’Ashley Mayrianne dans Microcosm, le magazine de l’American Society for Microbiology. Extraits.

De nombreuses études sont arrivées à la même conclusion : un changement climatique influencera la santé et le bien-être des humains et de leur environnement. Les changements de température, de précipitations, d'humidité, de concentrations de CO2 et de disponibilité des nutriments peuvent augmenter le risque de maladies à transmission vectorielle et zoonotiques, à la fois dans de nouvelles zones géographiques et dans les endroits où ces maladies sont déjà endémiques ou éradiquées.

Une revue systématique de la littérature publiée en août 2022 a prédit que 58% des maladies pathogènes humaines sont susceptibles de s'aggraver avec le changement climatique. L'impact du changement climatique sur la santé mondiale devrait être si grave que l'Organisation mondiale de la santé l'a qualifié de «la plus grande menace pour la santé de l'humanité», estimant que les coûts de santé directs totaliseront entre 2 et 4 milliards de dollars d'ici 2030 en raison de augmentation des décès dus à la malnutrition, au paludisme, à la diarrhée et au stress thermique, entre autres facteurs. Les scientifiques s'attendent à voir la charge la plus élevée des maladies liées au climat dans les pays et les communautés à faibles ressources. Les personnes immunodéprimées ou qui ont des allergies respiratoires, nutritionnelles et saisonnières préexistantes seront également plus à risque.

Pourquoi le changement climatique augmente-t-il le risque de maladie ?

En général, un temps plus doux est plus propice à la survie et à la reproduction microbiennes. Pourtant, selon le Dr Arturo Casadevall, directeur du département de microbiologie moléculaire et d'immunologie W. Harry Feinstone et professeur à la Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health, le problème n'est pas simplement un temps plus chaud en moyenne. «Les gens disent ‘le monde ne se réchauffe que d'un degré’ ; ce n'est pas la bonne façon de penser. Chaque fois que vous avez une journée très chaude, c'est un événement de sélection», a-t-il dit. À mesure que le climat change, les microbes doivent s'adapter à la «nouvelle normalité», offrant aux agents pathogènes des opportunités de se déplacer et d'évoluer de manière inconnue, ce qui peut augmenter la virulence et la gamme d'hôtes. Alors que les humains se déplacent vers de nouveaux environnements pour éviter les impacts du changement climatique, ils peuvent également rencontrer de nouveaux agents pathogènes contre lesquels ils manquent d'immunité naturelle. L'évolution humaine ne peut tout simplement pas suivre.

«L'une des raisons pour lesquelles [les humains] ne s'inquiètent pas [actuellement] des maladies fongiques … c'est parce que nous avons chaud», a dit Casadevall. «La plupart des champignons ne peuvent pas se développer à la température de notre corps», mais infectent plutôt les créatures à température ambiante, comme les reptiles et les amphibiens, ou n'affectent les humains qu'au niveau de la peau. Cependant, «les champignons s'adaptent», a-t-il averti. «Alors que le monde se réchauffe, ils apprennent à pousser à des températures plus élevées.»

Les travaux de Casadevall au cours de la dernière décennie décrivent la capacité du champignon Candida auris à s'adapter et à survivre à des températures élevées (supérieures à 37°C), brisant la zone d'exclusion thermique protégeant autrement les humains contre l'infection. «Le problème avec le changement climatique est que le pilier qu'est la température peut être surmonté si les champignons s'adaptent», a-t-il dit, en particulier compte tenu des recherches montrant que la température moyenne du corps humain est en baisse.

L'hypothèse climatique de Casadevall est née du fait que trois isolats uniques de C. auris sont apparus simultanément sur trois continents, la tolérance à la température étant le dénominateur commun. Cette hypothèse est apparemment étayée par des recherches en Inde qui ont révélé que C. auris isolé d'une plage peuplée avait une tolérance à la température plus élevée qu'un isolat séparé d'un marais, indiquant que le champignon aurait pu s'adapter à différents environnements.

La suite est à lire dans cet article passionnant …

NB : La photo représente la couverture de Microcosm, (Re)Emergence of Infectious Diseases.

Climat : les Français réclament plus de sciences

«Information et engagement climatique», source étude de la Fondation Descartes du 28 novembre 2022. Auteur de l’étude, Laurent Cordonier, directeur de la recherche de la Fondation Descartes.

Objectifs

La présente étude, basée sur les réponses de 2 000 Français représentatifs de la population nationale à un vaste questionnaire élaboré pour l’occasion, poursuit les objectifs suivants :

Le premier est de décrire la manière dont les Français s’informent sur le dérèglement climatique. Nous avons plus précisément cherché à déterminer à quel point le sujet les intéresse, à quelle fréquence ils s’informent sur l’actualité climatique et par quels canaux ils passent pour le faire.

Le second objectif de cette étude est d’enregistrer l’opinion des Français sur la manière dont les médias généralistes traitent du dérèglement climatique. Nous leur avons ainsi demandé si, selon eux, la question climatique est suffisamment couverte par les médias, puis leur avons proposé de donner leur avis sur une série de critiques du traitement médiatique du climat que nous leur avons soumises.

Le troisième objectif poursuivi dans cette étude est de déterminer quels sont les facteurs informationnels, sociodémographiques, politiques et cognitifs qui influencent positivement ou négativement le niveau des connaissances climatiques des Français. Pour ce faire, nous avons demandé aux participants à notre étude de passer un petit quiz de connaissances climatiques, puis avons rapporté leurs résultats aux différents facteurs en question.

Le dernier objectif de la présente étude est de mesurer l’influence de ces mêmes facteurs informationnels, sociodémographiques, politiques et cognitifs sur la disposition des Français, premièrement, à adopter ou non des actions individuelles volontaires en faveur du climat (réduction de sa consommation de viande, par exemple) et, deuxièmement, à accepter ou non des mesures climatiques contraignantes (telles que l’instauration de taxes carbone, l’interdiction des vols courtes distances, l’intégration d’un coût du carbone dans le prix des biens et services, etc.).

Résultats clés

Les médias généralistes constituent le premier canal d’information climatique des Français, avant les réseaux sociaux. Pourtant, les Français se montrent majoritairement critiques à l’égard de la manière dont les médias traitent du sujet climatique. Deux types de critiques émergent à l’analyse :

- Premièrement, celles selon lesquelles le traitement médiatique du climat serait insuffisamment orienté vers les solutions et trop peu rigoureux et pédagogique. Les critiques de ce type se retrouvent de manière assez homogène dans l’ensemble de la population.

- Deuxièmement, celles selon lesquelles le traitement médiatique du climat serait trop alarmiste, politisé, militant et moralisateur. Les critiques de ce type, comparativement moins fréquentes, se retrouvent davantage chez les Français proches de la droite ou de l’extrême-droite.

Pour consulter l’étude dans son intégralité, ici.

Une large majorité du public (72,2 %) déplore que l'info sur le changement climatique soit traitée par les grands médias de façon peu constructive. 61,7 % trouvent la presse trop « politisée, militante », 63,5 % qu'elle manque de rigueur scientifique. https://t.co/XCNQDgZbf5

— Géraldine Woessner (@GeWoessner) November 28, 2022

La variabilité et le changement climatique sont les moteurs de la salmonellose en Australie de 1991 à 2019

Voici une étude parue dans Food Control sur «La variabilité et le changement climatiques sont les moteurs de la salmonellose en Australie de 1991 à 2019.»

Faits saillants

- La salmonellose augmente avec l'augmentation de températures moyennes mensuelles anormales en Australie.

- La salmonellose est positivement associée à une augmentation de la température sur le long terme en Australie.

- La salmonellose en Australie est associée aux phases de l'ENSO ( El Niño - Southern oscillation ou El Niño - Oscillation australe).

- L'association entre le climat et la salmonellose varie dans toute l'Australie.

Résumé

La salmonellose est une gastro-entérite sensible au climat avec plus de 92 millions de cas et plus de 50 000 décès par an dans le monde. L'Australie a des taux élevés de salmonellose par rapport aux autres pays industrialisés. Cette étude a utilisé un modèle de régression de séries chronologiques binomiales négatives pour étudier l'association entre les notifications australiennes de salmonellose et les variables climatiques mensuelles, dont l’ENSO, et les anomalies de températures moyennes de 1991 à 2019.

Entre 1991 et 2019 en Australie, il y a eu 275 753 notifications de salmonellose et le taux annuel médian de salmonellose était de 40,1 pour 100 000 habitants. Les notifications de salmonellose présentaient une forte saisonnalité, atteignant un pic en été et un minimum en hiver. Il y a eu une augmentation estimée de 3,4% des cas de salmonellose à l'échelle nationale par augmentation de 1°C de l'anomalie de température moyenne mensuelle (rapport des taux d'incidence [IRR] de 1,034, intervalle de confiance [IC] à 95%: 1,009, 1,059). Des associations similaires entre la salmonellose et les anomalies de températures moyennes ont été trouvées pour certains États. Les anomalies de températures moyennes a montré une tendance à la hausse de 0,9°C sur la période de 1991 à 2019. De plus, une association positive a été trouvée entre la salmonellose en Australie et l'ENSO, les périodes El Niño étant associées à 7,9% de cas de salmonellose en plus par rapport aux périodes neutres (IRR 1,079 , IC à 95%: 1,019, 1,143). Une association similaire avec l’ENSO a été détectée dans les deux États de l'est de la Nouvelle-Galles du Sud et du Queensland. Cette étude suggère que les mesures préventives de santé publique pour réduire la salmonellose pourraient être améliorées dans certaines régions pendant El Niño ainsi que pendant les périodes de températures élevées.

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Un nouveau rapport montre le rôle essentiel que jouent les microbes dans le changement climatique

«Un nouveau rapport montre le rôle essentiel que jouent les microbes dans le changement climatique», source ASM News du 20 avril 2022.

L'American Society for Microbiology (ASM) a publié un nouveau rapport, Microbes and Climate Change: Science, People, & Impacts, examinant la relation entre les microbes et le changement climatique. En tant que principaux moteurs des cycles élémentaires et producteurs et consommateurs de 3 des gaz responsables de 98% de l'augmentation du réchauffement climatique (dioxyde de carbone, méthane et protoxyde d'azote), les microbes ont un impact crucial sur le changement climatique et sont, à leur tour, impactés par cela. Pour bien comprendre comment s'adapter au changement climatique, il est essentiel de savoir comment notre changement climatique affectera les microbes et comment ils se rapportent aux humains et à l'environnement.

L'Organisation mondiale de la santé a identifié le changement climatique comme «la plus grande menace pour la santé de l'humanité en 2021», ayant des effets néfastes sur la qualité de l'eau, la sécurité des aliments et les économies mondiales. De plus, un récent rapport du Groupe d'experts intergouvernemental sur l'évolution du climat (GIEC) a révélé des changements Le climat de la Terre dans toutes les régions du monde, notant l'ampleur et la vitesse sans précédent du réchauffement de la surface de la planète au cours des 200 dernières années.

«Pour un problème aussi complexe que le changement climatique, nous avons besoin d'approches novatrices, de nouveaux outils et d'états d'esprit non conventionnels», a déclaré Arturo Casadevall, président des gouverneurs de l'Académie de l'American Society for Microbiology. «De plus, nous devons encourager les partenariats entre divers scientifiques, décideurs et entrepreneurs, et encourager l'innovation pour exploiter le pouvoir des microbes, qui sont essentiels pour lutter contre le changement climatique.»

«Le nouveau rapport du colloque de l'ASM souligne que dans la recherche de solutions au changement climatique, nous, en tant que société et communauté scientifique, avons de nouvelles opportunités d'utiliser les microbes à notre avantage», a déclaré Nguyen K. Nguyen, directeur de l’Académie américaine de microbiologie de l'ASM.

Ce rapport est le résultat du colloque de novembre 2021 de l'ASM, qui a réuni plus de 30 experts de diverses disciplines et secteurs qui ont fourni des perspectives et des idées à multiples facettes. L'Académie américaine de microbiologie, le think thank scientifique au sein de l'ASM, a convoqué le colloque.

Un article complémentaire, Microbes and Climate Change, a Research Prospectus for the Future, a été publié cette semaine dans la revue en libre accès de l'ASM, mBio. L’article de mBio s'appuie sur les concepts discutés lors de la réunion du colloque de novembre et fournit une vue étendue et des opinions sur la recherche nécessaire pour combler les lacunes dans les connaissances.

Les sciences microbiennes peuvent nous fournir des informations inestimables sur la manière de s'adapter au changement climatique et à ses effets en cascade. Du développement de carburants alternatifs à la prévention de la propagation des agents pathogènes, les applications des microbes sont vastes et de grande envergure. Le rapport détaille les principales recommandations pour les chercheurs, les décideurs et les services réglementaires.

Principales recommandations du rapport :

- Mettre l'accent sur la recherche interdisciplinaire visant à comprendre comment les activités microbiennes et le flux métabolique se modifient à mesure que le climat, les précipitations et les températures changent à l'échelle mondiale.

- Fournir des conseils pour la conception expérimentale et la collecte de données pour l'étude des communautés microbiennes qui permettent la comparaison des données entre divers écosystèmes mondiaux.

- Incorporer les données existantes sur la diversité microbienne et l'activité de consommation et de production de gaz à effet de serre dans les modèles Terre-climat pour améliorer les performances actuelles et prédictives des modèles.

- Accroître les investissements dans la recherche pour générer des connaissances et une prise de conscience de la contribution des microbes à la génération et à la consommation de gaz chauffants; intégrer ces résultats dans des stratégies politiques et réglementaires fondées sur des données probantes pour lutter contre le changement climatique.

- Déployer une surveillance et une détection accrues des zoonoses et des maladies à transmission vectorielle chez les animaux et les humains, notamment grâce aux technologies de séquençage de nouvelle génération, et intégrer une approche One Health pour faire face aux effets des changements climatiques sur les humains, les animaux et notre environnement.

Pour en savoir plus sur l'impact des microbes sur le changement climatique, visitez la page Microbes and Climate Change de l'American Society for Microbiology et lisez l'article, What Microbes Can Teach Us About Adapting to Climate Change (Ce que les microbes peuvent nous apprendre sur l'adaptation au changement climatique).

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Une étude révèle que le changement climatique pourrait aggraver la contamination microbienne du lait cru

«Une étude révèle que le changement climatique pourrait aggraver la contamination microbienne du lait cru», source Food Safety News.

Le changement climatique pourrait avoir un impact important sur la qualité microbiologique du lait cru en Europe, selon une étude.

Alors que de nombreux organismes souffrent de l'augmentation des températures dues au changement climatique, certaines souches de E. coli semblent prospérer. Le danger est qu'ils ont le potentiel de s'adapter pour résister au processus de pasteurisation.

Non pasteurisé, le lait cru est consommé dans plusieurs pays européens dont la France. Un modèle a été développé pour quantifier la concentration de E. coli dans le lait cru et voir ce qui peut arriver en France dans des conditions climatiques changeantes. Cela comprenait la contamination initiale, le conditionnement, la vente au détail et la réfrigération par les consommateurs.

Les dénombrments microbiens initiaux provenaient d'une laiterie en Arabie saoudite en 2019 pour refléter l'impact du temps chaud et montrer ce qui pourrait arriver en Europe à l'avenir en raison du changement climatique.

A la ferme, il a été supposé que la température du tank de refroidissement du lait était conforme à la législation française en dessous de 4°C. Les données sont les dénombrements de E. coli dans les réservoirs de lait en vrac, collectés et analysés dans le cadre du contrôle de qualité de routine. Ils ont été utilisés pour évaluer la contamination juste après l'étape de traite.

La croissance microbienne a été déterminée à travers différents scénarios de durée et de température de stockage reflétant la chaîne d'approvisionnement du lait cru en France, selon l'étude publiée dans Food Research International. L’article est disponible en intégralité.

Impact du stockage chez le consommateur

La concentration initiale moyenne de E. coli dans le lait cru a été estimée à 1,31 log d'unités formant colonie (UFC) par millilitre et il a été démontré qu'elle augmente à la fin de la chaîne d'approvisionnement en fonction des durées et des températures de stockage public.

En France, certaines prédictions de contamination initiale étaient déjà supérieures à la limite de 2 log pour E. coli. La présence de quantités élevées de E. coli signifie une contamination fécale, qui est un indicateur d'hygiène dans les laiteries.

Les estimations allaient de 1,73 log UFC par millilitre après 12 heures, 2,11 log UFC par millilitre après 36 heures et 2,41 log UFC par millilitre après 60 heures de stockage par le consommateur. Le nombre d'unités de lait dépassant les critères d'hygiène français de 2 log pour E. coli est passé de 10 pour cent à 53 pour cent au niveau du stockage chez les consommateurs.

Au stade de l'élevage, des températures moyennes plus élevées et des conditions occasionnelles extrêmement chaudes telles que les vagues de chaleur influencent l'apparition du stress thermique chez les vaches et augmentent la charge microbienne des produits laitiers.

L'élevage laitier en France est un mélange d’exploitations laitières de petite, moyenne et grande échelle. La petite échelle est la plus courante. Le lait cru peut être vendu sur les marchés locaux dans les 12 heures suivant la traite tant que la température de stockage est inférieure à 8°C le long de la chaîne d'approvisionnement et qu'il est consommé dans les 72 heures. La norme française répertorie le maintien des températures entre 2 et 4°C pendant le conditionnement du lait cru.

Au niveau de la distribution, la concentration prévue de E. coli était de 1,53 log UFC par millilitre dans le lait cru après 12 heures à 8°C. La probabilité de dépasser 2-log a été estimée à 19 pour cent.

Besoin de règles révisées ?

Les chercheurs ont découvert que si la concentration de E. coli observée par temps chaud devenait la norme en France, la consommation de lait cru pourrait devenir préoccupante. En effet, le niveau de contamination initial conduira à un non-respect du lait cru à la limite des 2 log même si la chaîne du froid était maintenue.

«La pratique actuelle de consommation de lait cru en France pourrait devoir être revue car les critères d'hygiène actuels pour le lait cru conditionné pourraient être difficiles à respecter à l'avenir si des conditions plus chaudes devenaient la norme», ont-ils déclaré.

L'étude a été financée par le projet européen d'outils de modélisation prédictive pour évaluer les effets du changement climatique sur la sécurité alimentaire (PROTECT) qui se déroule jusqu'en mars 2023 et est coordonné par l'University College Dublin avec la participation d'Arla, Danone et Nestlé.

Toujours dans le cadre de ce projet, Styliani Roufou de l'Université de Malte étudie comment la résistance de E. coli à l'augmentation de la température pourrait avoir un impact sur le secteur laitier.

Roufou teste la capacité de E. coli à s'adapter à des environnements nouveaux et extrêmes.

Aux lecteurs du blog

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