A propos de la résistance aux antibiotiques chez les bactéries probiotiques

« Résistance aux antibiotiques chez les bactéries probiotiques formant des spores », source ASM News.

De nouvelles études ont montré que six souches de Bacillus probiotiques sont résistantes à plusieurs antibiotiques. L'analyse génétique d'autres souches de Bacillus a montré des gènes qui contribuent à la résistance aux antibiotiques vis-à-vis de divers types de médicaments et de méthodes leur permettant de se développer en leur présence. L’étude est présentée à ASM Microbe, la réunion annuelle de l'American Society for Microbiology.

« Ces données peuvent nous aider à comprendre quels gènes contribuent à la résistance aux antibiotiques et s'ils peuvent être transférés à d'autres bactéries dangereuses à l'homme et aux animaux domestiques », a déclaré Emmanuel Flores, étudiant en master à CSU Fresno. « Ce travail peut être utilisé comme une forme de surveillance de la résistance aux antibiotiques et permet de prédire avec précision les menaces potentielles de résistance aux antibiotiques présentes dans les aliments fonctionnels et les aliments du bétail », a-t-il déclaré.

Bacillus est un groupe de bactéries couramment utilisé dans les produits probiotiques. On prétend que ces produits ont des effets bénéfiques sur la santé de ceux qui les consomment. Cette recherche visait à déterminer si les bactéries Bacillus utilisées dans les probiotiques sont résistantes aux antibiotiques couramment utilisés dans les établissements de santé.

« Comme les bactéries se sont avérées capables de transférer la résistance aux antibiotiques à d'autres bactéries, nous visons à déterminer si les Bacillus probiotiques sont capables de transférer leur propre résistance aux bactéries responsables de maladies telles que l'intoxication alimentaire », a déclaré Flores.

Les résultats obtenus jusqu’à présent nous ont montré que les Bacillus probiotiques pouvaient transférer la résistance aux antibiotiques. Cependant, d'autres essais doivent être effectués pour déterminer quels types de bactéries dangereuses sont susceptibles de recevoir une résistance aux antibiotiques. Les chercheurs envisagent de réaliser un essai qui facilitera le transfert de la résistance aux antibiotiques délimité par un essai qui permettra de déterminer de quel antibiotique les bactéries dangereuses ont acquis la résistance.

Les probiotiques sont disponibles pour le grand public et se présentent sous la forme de nombreux aliments fonctionnels et aliments pour le bétail. « Surveiller la propagation de la résistance aux antibiotiques en se concentrant sur les probiotiques a été négligé et devrait être mis en place car l'impact mondial de la résistance aux antibiotiques est en augmentation », a déclaré Flores.

Les travaux de laboratoire ont été effectués par Emmanuel Flores, étudiant en master dans le laboratoire du Dr Van Laar à CSU Fresno. Il a travaillé sous la direction du Dr. Van Laar, du Dr. Sistrom (UC Merced) et de Mo Kaze (étudiant en doctorat, UC Merced). Le financement de cette étude a été fourni par le programme Bridge to Doctorate et par la subvention de recherche pour les diplômés de CSU Fresno Graduate Net, attribuée à Emmanuel. Ce travail a été présenté à l'ASM Microbe 2019 au Moscone Center de San Francisco, en Californie, le vendredi 21 juin 2019.

« Nous devons comprendre les risques des probiotiques. [Cette étude] ne nous dit pas qu’ils sont mauvais pour vous, mais nous devons les surveiller », a déclaré Flores. À l'heure actuelle, les infections liées à une résistance antimicrobienne font face à une crise mondiale de la santé qui pourrait entraîner des dépenses mondiales de 100 000 milliards de dollars d'ici 2050 et de 10 millions de décès par an. Donc, en gros, c’est un bon moyen de surveiller la résistance. Nous buvons ces bactéries vivantes à des fins bénéfiques, nous devons donc nous assurer qu’il n’yca pas d’effets indésirables. »

NB : On pourra lire l'article paru dans Infectious Disease News, Bacteria in probiotic beverages harbor antibiotic resistance genes.

La natation en mer modifie le microbiome cutané, augmentant la vulnérabilité à l'infection

« La natation en mer modifie le microbiome cutané, augmentant la vulnérabilité à l'infection », source ASM News.

Nager dans l'océan modifie le microbiome de la peau et peut augmenter le risque d'infection, selon une étude présentée à l'ASM Microbe 2019*, la réunion annuelle de l'American Society for Microbiology.

« Nos données démontrent pour la première fois que l'exposition à l'eau de mer peut modifier la diversité et la composition du microbiome de la peau humaine», a déclaré Marisa Chattman Nielsen, étudiante en doctorat à l'Université de Californie, Irvine, auteur principal de l'étude. « En nageant, les bactéries résidentes normales ont été lavées, tandis que les bactéries océaniques se sont déposées sur la peau. » 

Les chercheurs ont détecté des bactéries océaniques chez tous les participants après séchage à l'air et six et 24 heures après avoir nagé, mais certains participants avaient acquis davantage de bactéries océaniques et/ou elles avaient persistées plus longtemps.

L’étude a été motivée par des études antérieures qui ont montré des associations entre la nage en mer et les infections, et par la prévalence élevée de la mauvaise qualité de l’eau sur de nombreuses plages, due aux eaux usées et au ruissellement des eaux pluviales. Des études récentes ont démontré que des changements dans le microbiome peuvent rendre l’hôte vulnérable aux infections et influer sur les états pathologiques. L'exposition à ces eaux peut provoquer des maladies gastro-intestinales et respiratoires, des otites et des infections cutanées.

Les enquêteurs ont recherché sur une plage 9 volontaires répondant à des critères d'absence de protection solaire, d'exposition peu fréquente à l'océan, de baignade au cours des 12 dernières heures et d'antibiotique au cours des six mois précédents. Les chercheurs ont écouvillonné les participants à l'arrière du mollet avant de pénétrer dans l'eau, puis de nouveau après le séchage complet des sujets après une baignade de dix minutes et six et 24 heures après la baignade.

Avant de nager, tous les individus avaient des communautés différentes les unes des autres, mais après avoir nagé, ils avaient tous des communautés similaires sur leur peau, qui étaient complètement différentes des communautés « avant de nager ». Six heures après avoir nagé, les microbiomes avaient commencé à retrouver leur composition d'avant la natation et, 24 heures plus tard, ils étaient bien avancés dans ce processus.

« Une découverte très intéressante a été que des espèces de Vibrio, identifiées uniquement au niveau du genre, ont été détectées sur chaque participant après avoir nagé dans l'océan et séché à l'air », a déclaré. Nielsen. (Le genre Vibrio comprend la bactérie qui cause le choléra.) Six heures après la baignade, ils étaient toujours présents sur la plupart des volontaires, mais 24 heures plus tard, ils n'étaient présents que chez un seul individu.

« Bien que de nombreux Vibrio ne soient pas pathogènes, le fait que nous les ayons récupérés sur la peau après la baignade montre que des espèces de Vibrio pathogènes pourraient éventuellement persister sur la peau après la baignade », a déclaré Nielsen. La fraction des espèces de Vibrio détectée sur la peau humaine était plus de 10 fois supérieure à celle de l'échantillon d'eau de mer, suggérant une affinité spécifique pour la fixation sur la peau humaine.

La peau est la première ligne de défense du corps, tant physiquement qu’immunologiquement, lorsqu’elle est exposée à de l’eau contaminée. « Des études récentes ont montré que le microbiome de la peau humaine joue un rôle important dans le fonctionnement du système immunitaire, des maladies localisées et systémiques et des infections », a déclaré Nielsen. « Un microbiome sain protège l'hôte de la colonisation et de l'infection par des microbes opportunistes et pathogènes. »

*ASM Microbe a lieu du 20 au 24 juin 2019 à San Francisco.

NB : On pourra aussi lire cet article dans Infectious Disease News, Ocean swimming changes skin microbiome, could raise infection risk.

Mme Catherine Geslain-Lanéelle n'a pas été élue à la Direction générale de la FAO

Si vous étiez comme moi un chaud partisan de la candidature de Madame Catherine Geslain-Lanéelle, candidate des Etats membres de l'UE et aussi de la France, vous ne pouvez qu'être déçus.

Pourquoi suis-je déçu ?

Tout simplement parce que j'ai pris la peine d'écouter les trois candidats, une femme et deux hommes et très honnêtement, il n'y avait pas photo, comme l'on dit.

S'exprimant en trois langues, Espagnol, Français et Anglais, Mme Geslain-Lanéelle a fait de loin le discours le plus brillant et le plus construit, et a eu le temps d'applaudissements le plus long, mais cela n'a semble-t-il pas été suffisant! Quel dommage!

Les deux autres candidats, l'un en bras de chemise et très décontracté, Davit Kirvalidze (Géorgie) a bredouillé un speech maintes fois connus de technocrate ..., il n'a pas été élu ...

Le second et dernier à s'exprimer, Qu Dongyu (Chine), a parlé dans un anglais littéralement incomprehensible et a remporté la mise au premier tour, par 108 voix sur 191 ... j'ai comme l'impression que tout était décidé d'avance ...

Mme Geslain-Lanéelle n'a obtenu que 71 voix ...

Le Figaro.fr avait évoqué avant l’élection « Les étranges pratiques de la Chine pour conquérir la FAO », alors que ce site rapporte, « FAO: élection du directeur général, offensive de charme chinoise pro-américaine ».

Le mérite ne suffit plus, tout se joue ailleurs …

Complément du 24 juin 2019. Si l'on se fie au court article du Figaro de ce jour, où il est question d'une claque cinglante pour la diplomatie européenne et française.

Mme Geslain-Lanéelle aurait déclaré, La Chine a fait une campagne très agressive avec des moyens que nous n'utilisons pas.

Il est aussi fait état d'une rumeur selon laquelle des pays en arriéré de paiement ont vu leur 'problème réglé', sans que l'on sache comment.

On lira aussi l’article d’Emmanuelle Ducros dans L’Opinion du 24 juin 2019, « La FAO passe au régime chinois ».

La Française Catherine Geslain-Lanéelle, qui avait axé sa campagne sur une lutte pragmatique contre la faim dans le monde, a été battue par Qu Dongyu pour la présidence de l’organisation des Nations Unies pour l’agriculture et l’alimentation.

Le système de sécurité alimentaire de l'UE est trop ambitieux, selon la Cour des comptes européenne

Un communiqué de presse de la Cour des compte européenne du 15 janvier 2019 rapporte que « Le système de sécurité alimentaire de l'UE est trop ambitieux, estime la Cour des comptes européenne ».

Le rapport spécial n°2/2019, « Rapport spécial Dangers chimiques dans notre alimentation: la politique de l’UE en matière de sécurité alimentaire nous protège, mais tout n’est pas réglé », est proposé en intégralité en Français.

Ce rapport, qui indique notamment que « Les denrées alimentaires importées de pays tiers doivent répondre aux normes de l'UE » se voit confirmer récemment par un rapport du Sénat en France, Une concurrence déloyale posant de vrais doutes sur la qualité sanitaire des produits importés ».

Je sais que l’information concernant ce rapport de la Cour des compte européenne un peu datée, mais elle se veut aussi, dans le contexte national de réorganisation future de la sécurité des aliments en France, une réponse aux interviews très récentes du directeur général de l’alimentation et aux informations diffusées sur le site du ministère de l’agriculture (1, 2 et 3) pour qui tout va bien … voire très bien …

Résumé.

La politique de l'UE en matière de sécurité alimentaire vise à garantir un niveau élevé de protection de la vie et de la santé des personnes et à prémunir les citoyens de l'Union contre trois types de dangers que présentent les denrées alimentaires: physiques, biologiques et chimiques. En l'occurrence, l'audit a été consacré exclusivement aux dangers chimiques.

Les auditeurs ont constaté que le modèle mis en place par l'UE en matière de sécurité alimentaire imposait le respect dans le monde entier, mais qu'il était actuellement trop ambitieux. Selon eux, le cadre juridique régissant les substances chimiques dans les denrées alimentaires, les aliments pour animaux, les plantes et les animaux vivants est toujours en chantier et n'a pas encore atteint le degré d'application prévu dans la législation de l'UE concernant la production alimentaire. Par ailleurs, l'Autorité européenne de sécurité des aliments, qui fournit des conseils scientifiques sur lesquels appuyer la prise de décision au niveau européen, enregistre des retards dans ses travaux relatifs aux substances chimiques. Cela a un effet préjudiciable sur le bon fonctionnement de certains pans du système ainsi que sur la durabilité du modèle dans son ensemble.

« La sécurité alimentaire, qui est l'une des grandes priorités de l'UE, concerne l'ensemble des citoyens et est étroitement liée au commerce », a déclaré M. Janusz Wojciechowski, membre de la Cour des comptes européenne et responsable du rapport. « Cependant, le système mis en place par l'Union dans ce domaine présente des incohérences et rencontre un certain nombre de difficultés. »

Les contrôles organisés par les États membres ne couvrent pas tous les groupes de substances chimiques avec la même fréquence, et les cadres juridiques nationaux sont si étendus que les autorités estiment qu'il leur est difficile d'assumer toutes leurs responsabilités. Les auditeurs sont d'avis que les contrôles effectués par des organismes publics ne peuvent jamais représenter qu'une part infirme de l'ensemble des contrôles réalisés et que le modèle de l'UE ne peut rester véritablement crédible que si les systèmes de contrôle des secteurs public et privé se complètent. Or les synergies entre ces deux pôles commencent à peine à être explorées.

L'UE a limité l'utilisation de certains pesticides sur la base de critères de dangerosité. Les auditeurs expliquent que des résidus de ces pesticides peuvent toutefois être tolérés dans des produits importés dans l'UE si une évaluation des risques a montré qu'ils n'en présentaient aucun pour les consommateurs.

Ils ont également observé que le système de contrôle a ses limites, étant donné que les États membres ont des difficultés à déterminer la nature des mesures coercitives à prendre en cas de non-conformité.

Les auditeurs recommandent à la Commission européenne:

• d'évaluer les modifications qui pourraient être apportées à la législation régissant les dangers chimiques à la lumière de la capacité de l'appliquer de manière cohérente;
• de continuer à encourager la complémentarité, de sorte que les autorités des États membres puissent s'appuyer davantage sur les contrôles effectués par le secteur privé;
• en ce qui concerne les résidus de pesticides dans les denrées alimentaires, d'expliquer les mesures qu'elle compte prendre pour que le niveau d'assurance reste inchangé, tant pour les denrées produites dans l'UE que pour celles qui y sont importées, tout en continuant à respecter les règles de l'OMC;
• de fournir aux États membres des orientations supplémentaires sur l'application des mesures coercitives et d'améliorer ses procédures de suivi en matière de respect des règles alimentaires de l'UE.