La tolérance des désinfectants vis-à-vis de Listeria aux concentrations d'utilisation montre une association limitée avec les marqueurs génétiques

Un récent article de 2026 rapporte que la tolérance des désinfectants vis-à-vis de Listeria aux concentrations d'utilisation montre une association limitée avec les marqueurs génétiques.

Résumé

La capacité de Listeria à présenter une sensibilité réduite aux désinfectants couramment utilisés dans les environnements de conditionnement et de transformation des fruits et légumes réfrigérés demeure une source de préoccupation. Nous avons évalué la survie de 501 isolats de Listeria associés à des fruits et légumes (328 Listeria monocytogenes [LM] et 173 Listeria spp. [LS]) après 30 secondes d'exposition au chlorure de benzalkonium (CB, 300 ppm) et à l'acide peracétique (PAA, 80 ppm). Un sous-ensemble de 108 isolats a également été exposé à l'hypochlorite de sodium (NaOCl, 500 ppm) pendant 30 secondes. Les isolats ont présenté des réductions logarithmiques variables, allant de 2,76 à 5,73 log pour le CB, de 0,15 à 6,16 log pour le PAA et de 1,34 à 7,02 log pour le NaOCl ; la variation des réductions logarithmiques était significativement plus faible pour le CB que pour le PAA et le NaOCl. L'analyse de regroupement des données de réduction logarithmique a identifié quatre groupes, dont un de cinq isolats de LM présentant une sensibilité réduite aux trois désinfectants. Les réductions logarithmiques de LS étaient significativement inférieures à celles de LM après exposition au PAA, indiquant une sensibilité réduite au PAA chez LS. La caractérisation de tous les isolats par séquençage du génome entier (WGS) a révélé que la présence de gènes de résistance connus au CB n'était pas significativement associée aux réductions logarithmiques du CB, et que la présence de l'îlot de survie au stress n'était pas significativement associée aux réductions logarithmiques du PAA et du NaOCl. Les études d'association pangénomiques n'ont révélé aucune association des gènes du pangénome avec la sensibilité phénotypique aux désinfectants, mais ont identifié plusieurs polymorprismes nucléotidiques simples dans des gènes essentiels comme étant associés à cette sensibilité.

Importance

Malgré des inquiétudes fréquemment exprimées concernant la sensibilité réduite de Listeria monocytogenes (LM) et de Listeria monocytogenes (LS) aux désinfectants (ce qui pourrait favoriser leur persistance et accroître le risque de contamination des produits), les données disponibles sur la sensibilité de Listeria aux désinfectants utilisés dans les environnements de conditionnement et de transformation des produits frais, aux concentrations recommandées, restent limitées. Nos données ont montré que la sensibilité réduite de Listeria aux désinfectants n'est pas liée à la présence de gènes de résistance aux désinfectants déjà répertoriés. Cependant, nous avons identifié un groupe de cinq isolats de LM présentant une sensibilité réduite aux trois désinfectants testés ; ces isolats appartenaient aux lignées I, II et III. L'ensemble de ces données suggère l'absence de groupes clonaux distincts de Listeria « résistants aux désinfectants » et indique que les données de séquençage du génome entier pourraient ne pas être particulièrement pertinentes pour prédire la sensibilité aux désinfectants aux concentrations d'utilisation. De plus, la forte variabilité des réductions logarithmiques observées pour les trois désinfectants souligne l'importance de prendre en compte cette variabilité, en plus de la réduction logarithmique moyenne, lors de l'évaluation de différents désinfectants.

Conclusions

Nos résultats confirment que la tolérance génétiquement déterminée aux désinfectants chez les espèces de Listeria stricto sensu pourrait être moins importante qu'on ne le pensait. Plus précisément, les données présentées ici suggèrent que la présence ou l'absence de gènes de résistance aux désinfectants et de réponse au stress ne contribuerait à la tolérance de Listeria aux désinfectants qu'à de faibles concentrations, avec un impact limité sur la réduction de la sensibilité de Listeria aux concentrations utilisées dans l'industrie. Nous avons également observé une forte variabilité des rédutions logarithmiques de Listeria après exposition à certains désinfectants, notamment l'acide peracétique (PAA). Compte tenu de ces résultats, il serait judicieux de fonder les critères de sélection des désinfectants et les décisions relatives à la rotation des désinfectants sur des facteurs autres que ceux liés à l'émergence d'une tolérance aux désinfectants. Cependant, nos données suggèrent que des recherches supplémentaires sur les impacts potentiels des polymorphismes nucléotidiques simples, y compris ceux associés à des phénotypes de tolérance accrue aux désinfectants, pourraient s'avérer précieuses pour identifier des marqueurNos résultats confirment que la tolérance génétiquement déterminée aux désinfectants chez les espèces de Listeria stricto sensu pourrait être moins importante qu'on ne le pensait. Plus précisément, les données présentées ici suggèrent que la présence ou l'absence de gènes de résistance aux désinfectants et de réponse au stress ne contribuerait à la tolérance de Listeria aux désinfectants qu'à de faibles concentrations, avec un impact limité sur la réduction de la sensibilité de Listeria aux concentrations utilisées dans l'industrie. Nous avons également observé une forte variabilité des rédutions logarithmiques de Listeria après exposition à certains désinfectants, notamment l'acide peracétique (PAA). Compte tenu de ces résultats, il serait judicieux de fonder les critères de sélection des désinfectants et les décisions relatives à la rotation des désinfectants sur des facteurs autres que ceux liés à l'émergence d'une tolérance aux désinfectants. Cependant, nos données suggèrent que des recherches supplémentaires sur les impacts potentiels des polymorphismes nucléotidiques simples, y compris ceux associés à des phénotypes de tolérance accrue aux désinfectants, pourraient s'avérer précieuses pour identifier des marqueurs de différences de sensibilité aux désinfectants.s de différences de sensibilité aux désinfectants.

Référence

Listeria sanitizer tolerance at use-level concentrations shows limited association with genetic loci. AAE, 2026.

NB : Le blog a écrit trois articles au sujet du chlorure de benzalkonium que l’on peut retrouver sur les liens suivants, 1, 2 et 3. Sur l’acide peracétique et l’hypochlorite de sodium, les articles sont respectivement ici et ici.

A propos de la persistance et de la réintroduction récurrente de Listeria monocytogenes dans les ateliers de production alimentaire

Voici une étude très détaillée et démonstrative, dont l’article est disponible en intégralité et publié dans AEM, qui s’est intéressée à la caractérisation de Listeria monocytogenes d’une telle façon que cela doit permettre d’étudier les causes profondes de la contamination récurrente par Listeria monocytogenes et Listeria spp.

L’étude porte sur 16 ateliers de conditionnement et d’atelier de produits fraîchement prédécoupé aux États-Unis.

Le titre de l’article est «Whole-Genome Sequencing-Based Characterization of Listeria Isolates from Produce Packinghouses and Fresh-Cut Facilities Suggests Both Persistence and Reintroduction of Fully Virulent L. monocytogenes» (La caractérisation basée sur le séquençage du génome entier d’isolats de Listeria provenant d’ateliers de conditionnement de produits frais et d’installations de produits fraîchement découpés suggère à la fois une persistance et une réintroduction de L. monocytogenes complètement virulents).

Résumé

La contamination des produits prêts à consommer par Listeria monocytogenes (Lm) peut souvent être attribuée à des sources environnementales dans les installations de transformation et les ateliers de conditionnement. Pour fournir une meilleure compréhension des sources et de la transmission de Listeria dans les opérations de production, nous avons effectué un séquençage du génome entier (WGS) de Lm (n = 169) et d'autres Listeria spp. (n = 107) provenant de 13 ateliers de conditionnement de produits frais et de trois installations de produits fraîchement découpés. Dans l'ensemble, une faible proportion d'isolats de Lm (9/169) avaient des codons stop prématurés inlA (internaline A), et une grande proportion (83/169) avaient l'un ou l'autre ou les deux opérons LIPI-3 ou LIPI-4, qui ont été associés à l'hypervirulence.

L'analyse plus approfondie des données WGS par opération a montré un réisolement (à au moins 2 mois d'intervalle) d'isolats hautement apparentés (différences <10 hqSNP) dans 7/16 opérations. Deux exploitations avaient des souches hautement apparentées réisolées à partir d'échantillons prélevés à au moins 1 an d'intervalle. L'identification des isolats collectés pendant la préproduction (c'est-à-dire après nettoyage-désinfection mais avant le début de la production) qui étaient fortement liés aux isolats collectés pendant la production (c'est-à-dire après que les personnes ou les produits soient entrés et ont commencé à se déplacer pendant l'opération) a fourni la preuve que certaines souches étaient capable de survivre aux pratiques de nettoyage-désinfection standardisées. L'identification d'isolats étroitement liés (différences <20 hqSNP) dans différentes opérations suggère que la contamination croisée entre les installations ou les introductions de fournisseurs communs peuvent également contribuer à la transmission de Listeria. Dans l'ensemble, nos données suggèrent que la majorité des isolats de Lm collectés dans les opérations de production sont complètement virulents et que la persistance et la réintroduction peuvent conduire à l'isolement répété de Listeria étroitement apparentées dans les opérations de production.

Importance

Listeria monocytogenes est particulièrement préoccupant pour l'industrie des fruits et légumes en raison de sa présence fréquente dans les environnements naturels ainsi que de sa capacité à survivre dans les ateliers de conditionnement et les installations de transformation des produits frais au fil du temps. L'utilisation du séquençage du génome entier, qui offre un pouvoir discriminant élevé pour la caractérisation des isolats de Listeria, ainsi que des données sources détaillées (date d'isolement et emplacement du prélèvement) montre que la présence de Listeria dans les opérations de production semble être due à une réintroduction aléatoire et continue ainsi qu'à la persistance de souches hautement apparentées dans les atliers de conditionnement et les installations de produits fraîchement découpés. Ces résultats indiquent l'importance d'utiliser des approches de caractérisation à haute résolution pour les analyses des causes profondes des problèmes de contamination par Listeria. En cas d'isolement répété de Listeria étroitement apparentées dans un établissement donné, la persistance et la réintroduction doivent être considérées comme des causes profondes possibles.

En conclusion, les auteurs indiquent,

Notre étude montre spécifiquement que la disponibilité d'ensembles de données WGS plus importants comprenant des isolats provenant de plusieurs ateliers, ainsi que des approches détaillées des causes profondes et épidémiologiques, aidera à différencier la persistance de la réintroduction ou de la contamination croisée. Cela aidera les installations à traiter plus rapidement les véritables causes profondes des événements de contamination.

Commentaire

Cette étude est importante et elle devrait être partagée par des centres techniques qui ont développé une compétence dans le WGS avec des industriels.

Plusieurs sujets de discussion dans l’article:

- L. monocytogenes dans les opérations de production est susceptible d'avoir la capacité de provoquer des maladies humaines.

- Alors qu'un certain nombre d'isolats de L. monocytogenes provenant d’ateliers de production sont susceptibles d'avoir des îlots de réponse au stress, peu contiennent des gènes qui transmettent une sensibilité réduite aux métaux, aux détergents ou aux ammonium quaternaires.

- Listeria spp. et L. monocytogenes sporadiques et persistants contribuent ensemble à la contamination environnementale des installations de production.

- Preuves d'une contamination croisée ou de sources communes qui contribuent à la présence de Listeria spp. et L. monocytogenes similaires dans plusieurs ateliers de production.

NB : Photo d'illustration, sans lien avec le contenu de l'article.

Des pommes, oui des pommes, mais sans Listeria !

«Prévalence de Listeria spp. sur des surfaces en contact avec les pommes dans des usines de conditionnement de pommes dans l'État de Washington», source AEM. L'article est disponible en intégralité.

Résumé

L'épidémie de listériose liée à des pommes au caramel en 2014 a été attribuée à une contamination croisée entre les surfaces en contact avec les aliments (SCA) de l'équipement utilisé pour le conditionnement et les pommes fraîches. Pour l'État de Washington, premier producteur de pommes aux États-Unis avec 79% de sa production totale destinée au marché du frais, la gestion du risque de contamination des pommes par Listeria monocytogenes dans l'environnement de conditionnement est cruciale. Les objectifs de cette étude étaient de déterminer la prévalence de Listeria spp. sur les SCA dans les usines de conditionnement de pommes de l'État de Washington pendant deux saisons de conditionnement et pour identifier les types de SCA les plus susceptibles d'héberger Listeria spp. Cinq usines de conditionnement commerciales de pommes ont été visitées chaque trimestre au cours de deux saisons de conditionnement consécutives d'un an. Une gamme de 27 à 50 SCA a été prélevée dans chaque installation pour détecter Listeria spp. à deux moments de prélèvements, (i) après nettoyage-désinfection (ii) en cours de la transformation (3h pendant l'opération de conditionnement), selon un protocole modifié de la méthode du Manuel d’analyse bactériologique de la FDA. Parmi 2 988 prélèvements analysés, 4,6% (n = 136) étaient positifs pour Listeria spp. Le revêtement de cire était l'opération unitaire à partir de laquelle Listeria spp. étaient le plus souvent isolé. La SCA qui a montré la plus forte prévalence de Listeria spp. étaient des brosses de polissage, des diviseurs et des brosses en acier inoxydable sous des ventilateurs/souffleurs et des rouleaux de séchage. La prévalence de Listeria spp. sur les SCA a augmenté tout au long du temps du stockage des pommes. Les résultats de cette étude aideront les conditionneurs de pommes à maîtriser la contamination et l'hébergement de L. monocytogenes et à améliorer le nettoyage et les pratiques de désinfection des SCA sur lesquels Listeria spp. est le plus répandu.

Importance

Depuis 2014, les pommes fraîches sont liées à des éclosions et des rappels associés à une contamination croisée après récolte par le pathogène d'origine alimentaire L. monocytogenes. Ces situations entraînent à la fois une charge pour la santé publique et des pertes économiques et soulignent la nécessité d'un examen continu du management des usines de conditionnement pour éliminer les niches potentielles de Listeria. Cette étude évalue la prévalence de Listeria spp. sur des SCA dans des usines de conditionnement de pommes et identifie les les SCA les plus susceptibles d'héberger Listeria spp. Ce srésultats sont essentiels pour l'industrie du conditionnement des pommes qui s'efforce de mieux comprendre et de réduire de manière exhaustive le risque de contamination par L. monocytogenes afin de prévenir de futures éclosions et rappels de listériose.

La prévalence de Listeria spp. a augmenté tout au long de la période de stockage des pommes

Dans l'ensemble, une augmentation de la prévalence de Listeria spp. sur les SCA a été observée pendant toute la durée de stockage des cultures et pendant les deux périodes de prélèvements. La prévalence la plus élevée de Listeria spp. a été obtenue au cours du dernier quart de prélèvements Q4) dans les prélèvements en cours (38,2%; P ≤ 0,05). Après Q2, une prévalence significativement plus élevée de Listeria spp. a été observée aux deux moments d'échantillonnage.

Cependant, la prévalence croissante de Listeria spp. tout au long de la période de stockage des cultures (trimestres) différait selon le fonctionnement de l'unité. Pour le fonctionnement de l'unité de revêtement de la cire, une plus grande prévalence de Listeria spp. a été obtenu au cours des quatre trimestres aux deux moments de prélèvements, et cela n'a pas augmenté de façon significative avec le temps. La seule opération unitaire où la prévalence de Listeria spp. a augmenté pendant les prélèvements après désinfection était le séchage en tunnel (de Q1 = 0% à Q3 = 13,9%; P ≤ 0,05), et les trois opérations unitaires qui représentaient l'augmentation de la prévalence en cours de traitement de Listeria spp. au cours du temps de stockage, le séchage par ventilateur, le séchage en tunnel et le tri. Ces opérations unitaires ont montré des fréquences d'isolement nettement plus élevées après le premier trimestre de prélèvements.

Selon nos résultats, la prévalence de Listeria spp. augmenté après 6 mois et 3 mois de temps de stockage respectivement pour les prélèvements après désinfection et en cours de fabrication. Un facteur qui aurait pu influencer l'augmentation pendant les prélèvements après désinfection est le type d'espèce de Listeria qui a persisté dans l'équipement de conditionnement, affectant l'efficacité des procédures de nettoyage et de désinfection. À l'inverse, l'augmentation de la prévalence de Listeria spp. pendant les prélèvements en cours de fabrication a été principalement attribuée à une contamination croisée entre les pommes et les SCA. Tout au long du stockage, certaines des maladies les plus courantes après récolte causées par des moisissures Botrytis cinerea, Penicillium expansum et Mucor piriformis peuvent augmenter la croissance des agents pathogènes microbiens. Après récolte, les bacs à pommes passent par une étape de trempage fongicide avant d'être stockés jusqu'à 12 mois. Néanmoins, les méthodes de trempage peuvent entraîner une contamination croisée avec des agents pathogènes, y compris L. monocytogenes, en raison de la réutilisation d'une solution fongicide. De plus, il n'y a pas d'étape permettant d'éliminer les pommes meurtries ou abîmées avant stockage. Les perforations, blessures ou lésions cutanées causées pendant la récolte et le transport facilitent la propagation et la croissance des bactéries et des champignons. La croissance fongique entourant les tissus meurtris dégradent la couche protective épidermique et produisent un gradient de pH (dû à l'utilisation d'acides organiques) neutralisant la chair de pomme et conduisant au potentiel de survie et de croissance de Listeria. Ainsi, on a émis l'hypothèse qu'à mesure que la durée de stockage augmente, la croissance fongique et le pH interne des fruits augmentent également et, lorsqu'ils sont combinés, ces deux facteurs conduisent à une augmentation de la charge microbienne à Listeria. Cependant, une enquête plus approfondie concernant la relation entre la survie de Listeria et les maladies fongiques après récolte est nécessaire dans un environnement de stockage à plus long terme.

De plus, Listeria peut croître à des températures réfrigérées utilisées à la fois pour le stockage sous atmosphère régulière (AR) et à long terme sous atmosphère contrôlée (CA) des pommes. L. monocytogenes utilise différents mécanismes d'adaptation au froid, tels que le gène de réponse au stress facteur sigma B (sigB), induit par des températures réfrigérées. Ce gène favorise la formation de cryoprotecteurs (c'est-à-dire la glycine bétaïne et la carnitine), qui stimulent la prolifération cellulaire sous stress au froid. Un autre mécanisme est l'altération de la composition lipidique de la membrane cellulaire, dans laquelle la quantité d'acides gras insaturés augmente à des températures réfrigérées pour assurer la fluidité membranaire optimale, l'activité enzymatique et le transport des solutés nécessaires à la survie de Listeria.

Des études qui ont évalué la survie de Listeria sur des pommes dans différents scénarios de stockage à long terme ont rapporté la survie de L. monocytogenes sur des pommes après 3 mois et 5 mois (34) d'entreposage en AR. De plus, après 7 mois de stockage en AR ou AC, L. innocua a survécu sur des pommes Fuji. Il a été rapporté que le stockage en AC réduit la croissance bactérienne aérobie en raison d'une disponibilité réduite d'oxygène, bien que les bactéries anaérobies facultatives telles que Listeria ne puissent pas être inhibées dans ces conditions. Sept mois de stockage en AC ont entraîné une plus grande réduction des populations de L. innocua que l'entreposage en AR. Cependant, le traitement en AC n'a pas eu d'influence significative sur les populations de L. monocytogenes et L. innocua.

Ces résultats fournissent des informations scientifiques sur les SCA qui nécessitent le plus d'attention afin de ne pas devenir une source de contamination par les espèces de Listeria dans les usines de conditionnement de pommes. Ces résultats permettront de mieux comprendre comment maîtriser la contamination par L. monocytogenes afin de prévenir les futures épidémies d'origine alimentaire et les rappels associés aux pommes fraîches grâce à l'amélioration des programmes de surveillance de l'environnement ainsi que des procédures de nettoyage et de désinfection améliorées sur les SCA où Listeria est le plus répandu. Enfin, plusieurs domaines de recherche future ont été identifiés afin de déterminer la capacité de Listeria à survivre et à se développer dans la cire et la nature complexe de la survie et de la croissance de Listeria sur les pommes tout au long du stockage, compte tenu de l'interdépendance avec les organismes responsables de pourriture.