Rôle de la toxine dans la gravité de l'infection à E. coli

« Rôle de la toxine dans la gravité de l'infection à E. coli », source Food safety News.

Des scientifiques ont examiné pourquoi l’homme infecté par E. coli risquaient davantage de souffrir de symptômes graves après avoir étudié les toxines produites par la bactérie.

L’équipe a découvert qu’une toxine produite naturellement par E. coli aide les bactéries à coloniser le tractus intestinal des bovins et augmente la transmission de la bactérie à d’autres animaux du troupeau.

Des scientifiques du Moredun Research Institute, du Roslin Institute (Université d’Édimbourg), de Biomathematics et de Statistics Scotland ont montré que des niveaux élevés et rapides d’expression de toxines signifiaient également que les personnes infectées auraient probablement des symptômes plus graves.

L'étude a été financée par la Food Standards Agency et la Food Standards Scotland et publiée dans la revue PLOS Pathogens.

Le rôle clé du type de shigatoxines

E. coli entérohémorragique (EHEC) O157 est un sous-ensemble de E. coli présents dans le tractus gastro-intestinal des bovins mais ne cause pas de maladie chez ces animaux. Cependant, EHEC O157 dans les matières fécales des bovins infectés peut être transmis à l'homme par l'exposition à de l'eau, de la viande ou des légumes contaminés.

EHEC produit des shigatoxines de divers sous-types. Ces toxines peuvent provoquer diverses maladies, de la diarrhée avec ou sans sang à une maladie rénale plus grave et potentiellement fatale. Le sous-type de toxine (stx) le plus dangereux est le sous-type 2a (Stx2a).

Au Royaume-Uni, les souches de phage type (PT) 21/28 O157 sont la principale cause d'infections à EHEC menaçant le pronostic vital et ce type de phage code couramment les types de toxines Stx2a et Stx2c.

« Notre étude montre pour la première fois que la toxine Stx2a joue un rôle clé en permettant à E. coli O157 de coloniser l'intestin des bovins, en augmentant la capacité des bactéries Stx2a positives à se transmettre entre animaux et à se répandre dans l'environnement », a dit le Dr Tom McNeilly, de l'Institut de recherche Moredun.

« Cela est important, car on pense que la plupart des infections humaines proviennent de bovins et que les infections à E. coli O157 contenant Stx2a sont associées à des formes plus graves de maladie humaine. »

Lors d'une série d'essais contrôlés sur des bovins, les chercheurs ont montré que les veaux recevaient par voie orale une souche PT21/28 excrétée à des niveaux significativement plus élevés que ceux recevant une souche PT32.

L'hypothèse selon laquelle Stx2a est importante pour la super-excrétion et la transmission de veau à veau a été testée en comparant les dynamiques d'excrétion et de transmission des souches de E. coli O157 avec et sans Stx2a.

Une survie plus longue et des niveaux plus élevés

L'étude a examiné le rôle de Stx2a dans la colonisation de l'intestin des bovins et a montré qu'il est essentiel pour la transmission croissante des EHEC O157 entre les bovins en raison de deux facteurs.

Premièrement, Stx2a est produite plus rapidement par la bactérie que les autres shigatoxines et, deuxièmement, Stx2a favorise la persistance de la bactérie sur les cellules qui tapissent le tube digestif du bétail en réduisant leur taux de renouvellement.

Cela permet aux cellules infectées de survivre plus longtemps et augmente la probabilité que le bétail élimine les bactéries dans leurs selles plus longtemps et à des niveaux plus élevés. Cela augmente donc le risque que des bactéries puissent être transmises à d'autres bovins du troupeau, ainsi qu'à l'homme.

Le professeur David Gally de l'Institut Roslin a dit que l'étude explique que le sous-type Stx2a est courant chez les souches de E. coli O157 car il peut être produit plus rapidement que d'autres sous-types de Stx.

« Deuxièmement, nos travaux démontrent à quel point la toxine peut offrir un avantage chez l’hôte animal, essentiellement en arrêtant le renouvellement habituel des cellules intestinales qui éliminerait les E. coli adhérents; ainsi, les bactéries se colonisent plus facilement, persistent dans l'intestin et peuvent être excrétées à des niveaux élevés pour infecter d'autres animaux et éventuellement l’homme. »

L’Institut de recherche Moredun, Roslin Technologies, le Collège rural d’Ecosse et l’Institut Roslin de l’Université d’Édimbourg ont financé également le développement commercial d’un vaccin contre le bétail pour E. coli O157:H7.

Le vaccin expérimental a été mis au point pour limiter l’excrétion de E. coli O157: H7 par les bovins et la transmission entre bovins.

Roslin Technologies réalisera un essai de validation en deux étapes de mai à septembre 2020 dans le Nebraska. Des essais sur le terrain examineront les bovins super-excréteurs, c'est-à-dire le passage de grands volumes de bactéries dans les matières fécales, afin de déterminer si le vaccin prévient l'excrétion de la bactérie et s'il est viable pour un usage commercial.

Des probiotiques associés à un risque accru d’infection à Clostridioides difficile dans une étude menée à l'hôpital de New York

« Des probiotiques associés à un risque accru d’infection à C. difficile dans une étude menée à l'hôpital de New York », source CIDRAP News.

Les patients qui ont reçu des probiotiques en même temps que des antibiotiques étaient plus susceptibles d'avoir un incident d'infection à Clostridioides difficile (IDC) que ceux qui n'ont pas reçu de probiotiques, ont annoncé des chercheurs dans l'American Journal of Infection Control.

L’étude rétrospective a analysé une cohorte de patients de l’hôpital NYU Winthrop ayant reçu au moins une dose d’antibiotiques associés à un risque élevé d’ICD, y compris des patients prenant ou ayant commencé à utiliser des probiotiques lors de l’administration des antibiotiques.

Bien qu'il soit courant dans les hôpitaux d'administrer des probiotiques en même temps que des antibiotiques sur la base de la théorie selon laquelle ils pourraient prévenir l'ICD, il existe des preuves contradictoires que les probiotiques aient ce bénéfice. Pour déterminer si les probiotiques sont efficaces dans la prophylaxie contre l'ICD, les chercheurs ont regroupé les patients en fonction de l'utilisation de probiotiques et ont examiné le lien entre l'utilisation de probiotiques et un incident d'ICD.

Sur les 3 266 patients analysés, 167 (5,1%) ont reçu des probiotiques dans les 24 heures suivant le début du traitement par antibiotiques et 216 autres (6,6%) ont reçu des probiotiques au cours de la période de suivi de 12 semaines. Un total de 150 patients (4,6%) ont présenté une ICD dans les 12 semaines suivant le début de l’administration du traitement par antibiotiques.

Parmi les patients qui ont commencé à utiliser des probiotiques au début du traitement par des antibiotiques ou avant, 9,6% ont eu un incident d’ICD dans les 12 semaines, contre 4,2% pour les non-probiotiques au début de leur traitement par des antibiotiques (risque relatif, 2,3; intervalle de confiance à 95% [ CI], 1,4 à 3,7; P = 0,001).

Dans les variables du temps dans le modèle de Cox en tenant compte de l'initiation des probiotiques et des facteurs de confusion potentiels, une association positive entre les probiotiques et l'ICD demeurait significative (ratio de risque de 2,7; IC 95%: 1,74 à 4,08; P < 0,001).

L'utilisation d'inhibiteurs de la pompe à protons et d'antagonistes des récepteurs H2 de l'histamine étaient également associée à un risque accru d'ICD, de même que l'administration simultanée de plusieurs antibiotiques. Le sexe et l'âge n'ont pas eu d'impact significatif sur l'incidence de l'ICD.

« Bien que notre découverte d'augmentation de l'ICD chez les patients prenant des probiotiques soit inattendue, les patients sont vulnérables à l'ICD lorsque leur flore intestinale est perturbée », écrivent les auteurs de l'étude. « Peut-être que de nouvelles perturbations avec diverses espèces bactériennes considérées comme protectrices sont tout aussi perturbantes et potentiellement dangereuses. »

Sur la base des résultats, les auteurs ne recommandent pas l’administration de probiotiques pour prévenir l’ICD.

Complément du 22 novembre 2019. On lira L’efficacité des "probiotiques" remise en question.

La viande de porc insuffisamment cuite est un facteur d’augmentation de l’hépatite E à Singapour

« La viande de porc insuffisamment cuite est un facteur d’augmentation de l’hépatite E à Singapour », source Food Safety News.

Selon une étude, une partie de la hausse des infections dues au virus de l'hépatite E à Singapour pourrait être liée à la consommation de viande de porc pas assez cuite.

L’étude menée par le Singapore General Hospital (SGH) a révélé que l'incidence de l'hépatite E (HEV) était passée de 1,7 cas par 100 000 habitants en 2012 à 4,1 cas par 100 000 habitants en 2016. L’étude a été publié dans la revue Zoonoses and Public Health.

Dans les pays asiatiques développés, les souches de VHE détectées chez l'homme et dans les sources alimentaires étaient génétiquement similaires, ce qui suggère que les infections aux VHE indigènes pourraient être en grande partie d'origine alimentaire.

Le sous-typage du VHE a été effectué sur 59 des 443 échantillons de sang prélevés chez des patients entre 2014 et 2016. Quarante-quatre de ces 59 échantillons ont montré que la souche appartenait au génotype 3a du VHE, qui était du même type que celui détecté dans trois des 36 échantillons de foie de porc cru achetés dans des marchés et supermarchés.

« Bien que nous n’ayons pas pu déterminer si le foie de porc était le principal responsable des cas de VHE à Singapour, nous avons observé que le foie de porc pouvait être retrouvé dans de nombreux plats locaux », a déclaré le Dr Chan Kwai Peng, auteur principal de l’étude et consultant principal du Département de microbiologie au SGH.

« Comme la plupart des gens l'aiment peu cuit pour sa texture, cela peut les exposer à un risque d'infection par le virus de l’hépatite E. Le moyen le plus sûr de consommer des aliments, y compris du porc, consiste à les cuire à cœur. »

Voie d'infection d'origine alimentaire

Les résultats de l’étude suggèrent que l’épidémiologie de l’hépatite E à Singapour est passée d’une maladie importée principalement du sous-continent indien à une maladie de plus en plus répandue parmi la population résidente.

Les génotypes de 143 échantillons humains ont identifié 121 comme étant du génotype 3, 21 du génotype 1 et un du génotype 4. D'autres analyses phylogénétiques ont suggéré que le génotype 3a était la cause d'infections indigènes chez les résidents, montrant une similitude génétique avec les souches de génotype 3a détectées. dans les foies de porc.

« Ce lien entre les souches de la majorité des échantillons humains et ceux des foies de porc consommés par le public suggère une possible voie de transmission alimentaire du VHE à Singapour », selon les chercheurs, .

L'hépatite E est une maladie hépatique virale pouvant se transmettre des animaux à l'homme par la consommation de viande de porc ou de gibier mal cuite ou crue et de viande de porc transformée et de coquillages. Il se transmet également par contact avec les selles ou les vomissures d'une personne infectée.

La plupart des gens ne nécessitent pas de traitement car les infections disparaissent naturellement. Les femmes enceintes et les personnes âgées, celles dont le système immunitaire est affaibli et les maladies chroniques du foie peuvent présenter des infections plus graves.

Les symptômes de l'hépatite E comprennent le jaunissement de la peau et des yeux, appelé jaunisse, assombrissement de l'urine et des selles pâles. La fatigue, la fièvre, les nausées, les vomissements et les douleurs abdominales peuvent également survenir.

La maladie disparaît généralement en une à quatre semaines. La période moyenne pendant laquelle vous pouvez avoir l’infection avant de développer des symptômes est de 40 jours, avec une plage de 15 à 60 jours.

Alimentation, Infox et fausses certitudes par Pierre Feilllet

L’Académie d’Agriculture de France a eu la bonne idée de proposer une intervention de Pierre Feillet « Alimentation, infox et fausses certitudes », le 9 octobre 2019.

En s’appuyant sur plusieurs exemples (OGM, aliments ultra-transformés, cancers et aliments biologiques, glyphosate, le tract de Villejuif, aliments « naturels » …), Pierre Feillet identifie cinq origines aux intox (ou « fakenews ») qui circulent dans les médias et sur les réseaux sociaux :

• des chercheurs malhonnêtes ou incompétents ou en quête de notoriété ;
• des médias qui transforment des incertitudes en certitudes ;
• des responsables politiques qui font du tri sélectif ;
• des professionnels qui flirtent avec la désinformation ;
• des réseaux sociaux qui manient approximations et contre-vérités.

L’adhésion des consommateurs à ces infox tient pour une part à leur crainte d’un impact négatif de leur alimentation sur la santé (je suis ce que je mange et je ne veux pas mettre la santé de mes enfants en danger) et mais également à leur rejet de tout aliment qualifié de « chimique » (ce n’est bon que si c’est naturel) et à leur conviction que l’agro-industrie privilégie sa rentabilité aux dépens des consommateurs et de la planète et que beaucoup de scientifiques sont les porte-paroles de l’agro-industrie (conflits d’intérêts). 

Des tomates seraient liées à une épidémie à Salmonella en Suède; 71 personnes contaminées

« Des tomates seraient liées à une épidémie à Salmonella en Suède; 71 personnes infectées », source article de Joe Whitworth paru le 10 octobre 2019 dans Food Safety News.

Selon les responsables de la santé publique, les tomates sont probablement à l'origine d'une épidémie à Salmonella en Suède, qui a touché 70 personnes.

Folkhälsomyndigheten (Agence de la santé publique de Suède) a identifié 71 cas d’infections provenant de 11 comtés appartenant à l'épidémie. Cela correspond à 36 cas de maladie dans 10 comtés qui ont été liées par séquençage du génome complet à la fin du mois de septembre. Västra Götaland, Jönköping, Halland et Dalarna ont signalé le plus grand nombre de patients.

Des cas de maladie ont été enregistrés dans tous les groupes d'âge avec 46 femmes et 25 hommes malades. Parmi les cas jusqu'à présent liés à l'épidémie, la dernière date connue d'apparition de la maladie était le 19 septembre.

Étude de cas-témoins, pas d'échantillons positifs

Les unités locales de maladies infectieuses, Livsmedelsverket (Agence alimentaire suédoise) et Folkhälsomyndigheten ont enquêté sur l'éclosion à Salmonella Typhimurium monophasique. L'analyse du génome de la bactérie Salmonella a montré que les cas de maladie étaient liés et il est probable qu'ils aient été infectés par la même source.

Folkhälsomyndigheten a mené une étude cas-témoins pour comparer ce que les malades avaient mangé la semaine précédant leur maladie et ce que les personnes en bonne santé avaient mangé. Les résultats ont montré que les malades avaient mangé des tomates dans une plus grande mesure que les personnes témoins saines.

Une investigation a révélé que les tomates se trouvaient dans des supermarchés à la fin du mois d'août, mais comme elles sont fraîches, il ne reste plus de stock dans les magasins. Le produit a été analysé, mais aucune tomate n'a été retrouvée positive pour Salmonella.

Les autorités ont déclaré que le risque d'être infecté par Salmonella provenant de tomates fraîches était très faible.

La souche épidémique a le profil 3-12-11-N-211 par MLVA.

La plupart des personnes infectées par Salmonella développent des signes 12 à 72 heures après leur exposition à la bactérie. Les symptômes peuvent inclure la diarrhée, la fièvre, les crampes abdominales et les vomissements qui durent plusieurs jours.

Sinon, les adultes en bonne santé sont généralement malades pendant quatre à sept jours. Les adultes plus âgés, les enfants, les femmes enceintes et les personnes dont le système immunitaire est affaibli, comme les patients atteints de cancer, sont plus susceptibles de développer une maladie grave et des affections graves, parfois menaçant le pronostic vital.

Intoxication aux lectines

Pendant ce temps, Livsmedelsverket a averti les consommateurs de bien faire tremper et cuire les légumineuses sèches telles que des haricots, des pois et des lentilles après leur association à une importante épidémie d'intoxication alimentaire dans une école.

Les légumineuses sèches contiennent naturellement des lectines qui peuvent provoquer des nausées, des vomissements et des diarrhées environ une à sept heures après leur consommation.

La maladie s'est déclarée dans la cantine à l'heure du déjeuner, début septembre, à l'école Baldergymnasiet de Skellefteå, une ville du comté de Västerbotten. Les médias suédois ont annoncé que près de 280 personnes avaient été touchées et des échantillons ont été envoyés à un laboratoire au Royaume-Uni.

Sandra Wallström, inspectrice des aliments à la municipalité de Skellefteå, a déclaré que c'était la première fois que des niveaux élevés de lectine avaient provoqué une intoxication alimentaire en Suède.

Des contrôles de suivi seront effectués à l'école pour s'assurer que la manipulation des haricots et des aliments similaires est sans danger à l'avenir.

Les responsables suédois ont exhorté les consommateurs à suivre les instructions sur l'emballage et les recettes. Les légumineuses doivent être trempées pendant au moins 12 heures, rincées et cuites pendant au moins une demi-heure. Les haricots en conserve sont déjà cuits et peuvent être consommés directement sans trempage ni ébullition.

Un composé présent dans le lait maternel combat des bactéries dangereuses

« Un composé présent dans le lait maternel combat des bactéries dangereuses », source communiqué du National Jewish Health.

Un composé simple et peu coûteux pourrait être ajouté à la formule infantile ou au lait de vache.

Des chercheurs de National Jewish Health et de l'Université de l'Iowa ont identifié un composé dans le lait maternel humain qui combat les infections par des bactéries dangereuses tout en permettant aux bactéries bénéfiques de se développer. Le lait maternel humain contient 200 fois plus de monolaurate de glycérol (GML pour glycerol monolaurate) que le lait de vache. Les préparations infantile pour nourrissons n'en ont pas. Le GML est peu coûteux à fabriquer. Des recherches futures détermineront si le GML pourrait être un additif bénéfique au lait de vache et aux préparations pour nourrissons.

« Nos résultats démontrent que des niveaux élevés de GML sont uniques au lait maternel humain et inhibent fortement la croissance des bactéries pathogènes », a déclaré Donald Leung, professeur de pédiatrie à National Jewish Health et auteur principal dans un article paru dans Scientific Reports.

« Bien que les antibiotiques puissent lutter contre les infections bactériennes chez les nourrissons, ils tuent les bactéries bénéfiques ainsi que les pathogènes », a déclaré Patrick Schlievert, PhD, professeur de microbiologie et d'immunologie à la faculté de médecine de l'Université de l'Iowa Carver, et premier auteur de l’article.

« Le GML est beaucoup plus sélectif et ne combat que les bactéries pathogènes tout en permettant aux espèces bénéfiques de se développer. Nous pensons que le GML est très prometteur en tant qu’additif potentiel au lait de vache et aux préparations pour nourrissons, qui pourrait favoriser la santé des bébés dans le monde. »

Après avoir déterminé que le lait maternel humain contenait des niveaux de GML beaucoup plus élevés que le lait de vache, les chercheurs ont montré que le lait maternel humain inhibait la croissance de la bactéries pathogènes, Staphylococcus aureus, Bacillus subtilis et Clostridium perfringens, alors que ni le lait de vache, ni le lait maternisé n'avaient aucun effet. Le lait maternel humain n'a pas inhibé la croissance de la bactérie bénéfique Enterococcus faecilis. Les bébés nourris au lait maternel humain présentent des taux élevés d'espèces bactériennes bénéfiques, bifidobactéries, lactobacilles et entérocoques.

Lorsque les chercheurs enlèvent le GML du lait maternel humain, celui-ci perd son activité antimicrobienne contre S. aureus. Quand ils ont ajouté du GML au lait de vache, il est devenu antimicrobien.

Les chercheurs ont également montré que le GML inhibe l'inflammation des cellules épithéliales, qui tapissent l'intestin et d'autres surfaces muqueuses. L'inflammation peut endommager les cellules épithéliales et contribuer à la sensibilité aux infections bactériennes et virales.

Les Drs. Schlievert et Leung ont déposé un brevet pour l’utilisation du GML en tant qu’additif bénéfique dans le lait de vache et les préparations pour nourrissons.

Les conséquences de l'éclosion à Listeria aux Pays-Bas : une compagnie aérienne néerlandaise concernée et des rappels au Luxembourg et en Belgique

« Une compagnie aérienne néerlandaise pourrait avoir servi de la viande contaminée par Listeria », source article de Joe Whitworth paru le 9 octobre dans Food Safety News.

La compagnie aérienne néerlandaise KLM a émis un avertissement à la suite de son annonce selon laquelle des produits carnés contaminés par Listeria auraient pu être servis sur certains de ses vols. Voir un précédent article sur le sujet.

Le RIVM (Institut national pour la santé publique et l'environnement) et NVWA (Autorité néerlandaise de sécurité des aliments et des produits de consommation) enquêtent sur un foyer à Listeria lié à la viande froide d'une société appelée Offerman. La société a arrêté la production de produits de viande sur son site d'Aalsmeer la semaine dernière.

Vingt patients ont été signalés sur deux ans avec trois décès associés et une femme ayant fait une fausse couche. Chaque année, 80 patients présentant une infection à Listeria sont signalés au RIVM.

La traçabilité de KLM continue

KLM a déclaré avoir été informée par un fournisseur de viande qu'un de leurs sites de production pourrait avoir été infecté par Listeria. Les produits contaminés ont peut-être été servis au petit-déjeuner en classe affaires.

Un porte-parole de KLM a déclaré à Food Safety News que KLM Catering enquêtait pour déterminer les produits et les vols exacts menacés.

«Nous espérons avoir des informations plus détaillées très bientôt. KLM a averti de manière proactive tous les passagers qui pourraient éventuellement être considérés comme présentant un risque sur la base des informations actuelles fournies par nos fournisseurs. ”

Une déclaration de KLM a exhorté les gens à consulter un médecin généraliste s'ils avaient des questions sur leur santé ou sur une éventuelle infection.

« Nous nous excusons pour le fait que vous ayez peut-être été confronté à cela et nous confirmons par la présente que nous avons immédiatement cessé de fournir nos avions avec ces produits carnés. Tous les repas actuellement servis à bord peuvent être consommés en toute sécurité. ”

Plus tôt cette année, Air France avait réagi à un incident différent après la détection de Listeria dans un sandwich. Servair, fournisseur du service de restauration à bord de la compagnie aérienne, a déclaré que Listeria avait été retrouvée dans un sandwich au thon disponible dans des buffets en libre-service à bord.

Le sandwich a été servi dans les cabines économiques et premium de neuf vols long-courriers au départ de Paris Orly et de Paris Charles de Gaulle entre le 21 et le 24 mai 2019. Servair a retiré tous les produits d'Air Food, le fournisseur, sur les vols Air France.

Rappel néerlandais élargi

Aux Pays-Bas, l’épidémie d’origine alimentaire est due à la présence de Listeria monocytogenes dans de la viande froide, telle que de la charcuterie, en tranches et préemballée.

Les clients d’Offerman aux Pays-Bas sont Aldi, Bidfood, Jumbo, Sligro et Versunie. Plus de 100 produits ont été touchés lors des rappels Jumbo et Sligro.

Les marques Freshly, Kraak-Vers, Anur, Wahid et FairBeleg sont également rappelées. Tous les produits à base de viande portant les codes NL 429 EC et NL 214850 EC sont concernés. Pour les noms de produits, codes et dates concernés, suivez ce lien et ouvrez le fichier PDF.

Offerman est une filiale de la société, Ter Beke, qui a publié une déclaration à propos de cet incident, soulignant que l’attention se concentrait principalement sur l’organisation du rappel des produits pertinents du marché, en collaboration avec la NVWA et les clients.

« Cette mesure de précaution, que nous avons délibérément déployée de manière très large, est mise en œuvre aussi rapidement et efficacement que possible et conformément à toutes les règles et procédures établies. »

Les représentants de Ter Beke se sont dits « choqués » par la découverte que la même souche de Listeria ait été retrouvée chez des personnes aux Pays-Bas et sur le site Offerman d'Aalsmeer.

« Nous ne disposons d'aucune information supplémentaire sur l'allégation selon laquelle cela indiquerait un lien de causalité entre les deux. Offerman est en contact avec les autorités compétentes et coopère à toutes les enquêtes ultérieures. »

Un communiqué de l'organisation néerlandaise de la distribtion (CBL) a dit que les membres impliqués prenaient des précautions en retirant les produits des rayons et en appelant les consommateurs à ne pas les manger et à les renvoyer.

Le groupe a déclaré qu'il était nécessaire de partager des informations entre le gouvernement et les entreprises le plus rapidement possible, ajoutant qu'il souhaitait s'entretenir avec le ministère de la Santé, du Bien-être et du Sport et la NVWA afin de partager efficacement les informations avec la chaîne d'approvisionnement.

Autres pays touchés

La distribution inclut Aruba, la Belgique, Curaçao, l'Allemagne, le Luxembourg, Saint-Martin, l'Espagne, le Surinam et le Royaume-Uni, selon le système d'alerte rapide pour les denrées alimentaires et les aliments pour animaux (RASFF).

Un communiqué du gouvernement luxembourgeois a confirmé que certains produits d'Offerman avaient été distribués dans le pays.

Produit rappelé par Aldi

Aldi Luxembourg a rappelé toutes les dates de Rosbif cuit 100 g de la marque Délifin jusqu'au 13 octobre 2019. Ce produit a été retiré des magasins, mais une partie en a été vendue.

En Belgique, le « Rôti de bœuf » de la marque Délifin aux mêmes dates qu'au Luxembourg a été rappelé des magasins Aldi. Le société Albert Heijn a également retiré la charcuterie de marque Wahid en raison du potentiel de présence de Listeria.

Produits rappelés par Albert Heijn

Les responsables belges ont initialement signalé qu'ils n'avaient pas été officiellement informés par NVWA. Ils ont donc contacté les autorités néerlandaises via le système RASFF et les ont instamment priées de fournir des informations sur la situation, y compris sur toute livraison supplémentaire dans le pays. Dans une déclaration mise à jour, les autorités belges ont déclaré que les autorités néerlandaises avaient fourni des informations supplémentaires sur la traçabilité et que d'autres rappels étaient possibles.

Selon l’AFSCA, en 2017, 74 personnes ont été atteintes de listériose, mais aucune n’est décédée.

Estimations d'attribution des sources de maladies d'origine alimentaire pour 2017 concernant Salmonella, Escherichia coli O157, Listeria monocytogenes et Campylobacter à l'aide de données de surveillance pluriannuelle des épidémies aux États Unis

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« Un nouveau rapport sur les maladies infectieuses d'origine alimentaire aux États-Unis met en évidence la présence de Salmonella et d'autres agents pathogènes », source CIDRAP News.

À la fin de la semaine dernière, des responsables de la FDA ont publié une vue d'ensemble globale des flambées de maladies d'origine alimentaire, mise à jour chaque année, intégrant des données de 2017 et mettant en évidence la présence de Salmonella comme agent pathogène le plus répandu.

Le rapport vise à peaufiner les interventions visant à réduire le nombre de maladies d'origine alimentaire.

Le rapport annuel de IFSAC (Interagency Food Safety Analytics Collaboration), qui inclut des données de surveillance depuis 1998, est conçu pour estimer les aliments responsables d'épidémies impliquant quatre agents pathogènes : Salmonella, Escherichia coli O157:H7, Listeria monocytogenes et Campylobacter. La collaboration comprend les Centers for Disease Control and Prevention (CDC), la Food and Drug Administration (FDA) et l’US Department of Agriculture (USDA).

Les données du rapport de cette année proviennent de 1 329 épidémies de maladies d'origine alimentaire de 1998 à 2017 qui étaient liées à une seule catégorie d'aliments.

Parmi ceux-ci, 811 ont été causées par Salmonella, 242 par E. coli O157, 40 par Listeria et 89 par Campylobacter (après que 147 foyers dus à des produits laitiers aient été exclus).

L'analyse a révélé que les maladies dues à Salmonella et à Campylobacter étaient plus largement réparties entre les catégories d'aliments et que les maladies dues à E. coli O157 et à Listeria étaient principalement liées à deux catégories d'aliments.

Pour E. coli, 75% des infections étaient liées à des cultures telles que les légumes à feuilles ou à la viande bovine, et plus de 75% des infections à Listeria provenaient de produits laitiers ou de fruits.

Le métabarcoding de l'ADN utile pour analyser le régime nutritionnel chez l’homme

« Le métabarcoding de l'ADN utile pour analyser le régime nutritionnel chez l’homme », source ASM News.

Une nouvelle étude démontre que le métabarcoding de l'ADN constitue une nouvelle méthode prometteuse pour suivre l'ingestion de plantes chez l’homme, suggérant que des approches similaires pourraient être utilisées pour caractériser les composants animaux et fongiques de l'alimentation humaine. L’étude, publiée dans la revue mSystems, a montré que l’ADN de plantes diététiques peut être amplifié et séquencé à partir de selles humaines à l’aide de méthodes couramment appliquées aux études sur la faune.

« Le séquençage nouvelle génération de l'ADN nous a fourni une grande quantité de nouvelles données sur des sujets tels que la microbiologie intestinale et la génétique personnelle. Cette étude suggère que la même technologie puissante pourrait également commencer à nous parler de ce que nous mangeons, ce qui est souvent une chose difficile à mesurer », a déclaré l'auteur principal de l'étude, Lawrence David, professeur au Center for Genomic and Computational Biology, Duke Molecular Genetics and Microbiology.

Il existe de nombreuses méthodes d’évaluation diététique préexistantes, mais la plupart reposent sur la capacité d’une personne à rapporter ce qu’elle a mangé. Cela signifie qu'elles sont sujettes aux erreurs de mémoire, aux préjugés des rapporteurs et aux capacités cognitives d'une personne répondant à une enquête. Le métabarcoding de l’ADN est un moyen alternatif d’obtenir des informations sur l’alimentation en utilisant l’ADN alimentaire dans les selles comme biomarqueur. Les chercheurs peuvent amplifier l'ADN d'un aliment provenant d'un échantillon de matières fécales, le séquencer et cartographier ces séquences d’aliments à l'aide d'une base de données de référence.

« Je pense que le métabarcoding d’ADN ressemble beaucoup à un code à barres dans un supermarché. Nous pouvons considérer une séquence d'ADN particulière comme un identifiant unique pour une espèce d’aliment particulier », a déclaré Brianna Petrone, deuxième auteur de l'étude, étudiante en troisième cycle à la Duke University School of Medicine.

Le Dr David et son co-premier auteur, Aspen Reese, actuellement junior fellow à l'Université Harvard, ont lancé l'étude après avoir rencontré des écologistes Rob Pringle de l'Université Princeton et Tyler Kartzinel, actuellement à l'Université Brown, qui ont utilisé le métabarcoding de l’ADN pour étudier des réseaux alimentaires complexes d’herbivores dans la savane africaine. « Nous nous sommes demandés si leur méthode fonctionnerait chez des personnes », a dit le Dr David. « De plus en plus de travaux dans le domaine du microbiome indiquent que des aliments spécifiques sont susceptibles de modifier ou de modifier les niveaux de bactéries spécifiques dans l'intestin, mais nous ne disposons souvent pas de données relatives à l'alimentation pour les études sur le microbiome. »

Pour mener leur étude, les chercheurs ont extrait l'ADN conservé en chambre froide qui a été extrait d'échantillons de selles d'une étude précédente.

« Nous avons mené une étude il y a quelques années, au cours de laquelle nous préparions des aliments pour les participants à une étude sur les aliments et le microbiome, et nous savions exactement ce qu'ils mangeaient pendant une semaine donnée après la collecte de leurs selles », a déclaré le Dr David.

Les chercheurs ont séquencé une région de code-barres à partir d'ADN de chloroplastes dans des échantillons de selles provenant de 11 personnes consommant des régimes témoins ou choisis librement. Ils ont réussi à amplifier l'ADN de plantes dans environ 50% des échantillons, ce nombre étant passé à 70% chez des individus ayant une alimentation témoin à base de plantes. La majorité des ADN de plantes séquencés correspondaient à des plantes alimentaires humaines communes, notamment des céréales, des légumes, des fruits et des herbes.

« Dans l'ensemble, il y avait un bon accord général entre les aliments qui étaient énumérés dans les journaux conservés par les participants de l'étude et ceux que nous avons séquencés à partir de selles », a dit le Dr David.

« Si un aliment était écrit dans le journal du régime alimentaire, dans environ 80% du temps, nous l'avons également retrouvé grâce à cette approche de métabarcoding. »

Le taux d'échec de la PCR relativement élevé et l'incapacité de distinguer certaines plantes diététiques au niveau de la séquence suggèrent la possibilité de perfectionnements futurs pour améliorer la méthode. Par exemple, le chou, le brocoli, le chou de Bruxelles et le chou-rave sont tous des cultivars de la même espèce et les chercheurs ont été incapables de les distinguer par leur séquence dans la région du code à barres du chloroplaste. Le café était le seul aliment enregistré dans le régime alimentaire qui n'ait jamais été détecté avec le métabarcoding de l'ADN, peut-être parce que son ADN était détérioré ou dilué lors de la torréfaction et de l'infusion.

Le Dr David a recommandé que le métabarcoding de l'ADN soit utilisé dans de futures études, ainsi que la possibilité de revoir l’analyse nutritionnelle d’études plus anciennes. « Semblable à cette étude, je pourrais imaginer que cela soit utilisé sur de l'ADN archivé pour voir s'il existe ou non des différences alimentaires sous-jacentes qui pourraient expliquer certains des profils du microbiome qui ont pu être observés dans une étude », a dit le Dr David. « À l'avenir, nous pouvons également imaginer que cela soit utilisé dans de nouvelles études sur le microbiome pour identifier les relations entre des aliments spécifiques et des bactéries intestinales, ainsi que dans des études plus vastes sur la nutrition en complément des techniques d'évaluation de l'alimentation traditionnelles. »

Listeria monocytogenes, à propos de la tolérance aux désinfectants et la résistance croisée avec des antibiotiques

Voici le résumé d’une étude, « Des isolats de Listeria monocytogenes tolérants aux biocides provenant d'usines allemandes de production alimentaire ne présentent pas de résistance croisée avec des antibiotiques cliniquement pertinents ».

L’étude est parue dans Applied and Environmental Microbiology, une revue de l’American Society for Microbiology.

Résumé

La contamination des aliments au cours de la transformation est reconnue comme l'une des principales voies de transmission de Listeria monocytogenes. Pour prévenir la contamination microbienne, les biocides sont largement utilisés comme désinfectants dans les usines de transformation alimentaires.

Cependant, il y a des inquiétude à propos du développement d’une résistance antimicrobienne chez les agents pathogènes d'origine alimentaire en raison de l'utilisation répandue de biocides.

Dans notre étude, 93 isolats de L. monocytogenes provenant d’installations allemandes de production alimentaire ont été (i) analysés avec des essais de sensibilité aux biocides et de résistance aux antibiotiques en utilisant des essais de microdilution sur bouillon, (ii) analysés pour des liens entre la sensibilité réduite aux biocides et la résistance aux antibiotiques, et (iii) caractérisés par séquençage du génome complet, y compris la détection de gènes codant pour la tolérance aux biocides, la résistance aux antibiotiques et d'autres facteurs de virulence.

Quinze isolats de L. monocytogenes étaient tolérants au chlorure de benzalkonium (BAC) et des gènes conférant la tolérance au BAC ont été retrouvés dans 13 d’entre eux.

La résistance aux antibiotiques n’a pas été associée à la tolérance aux biocides. Les isolats tolérants au BAC ont été attribués à 6 complexes clonaux par MLST, et la plupart d'entre eux hébergeaient des pseudogènes d'internine A avec des codons d'arrêt ou des délétions prématures (n = 9).

Notre étude a démontré une grande diversité génétique parmi les isolats étudiés, y compris des génotypes fréquemment impliqués dans des infections humaines. Bien que les études d’adaptation in vitro aux biocides aient suscité des inquiétudes quant à l’augmentation de la résistance croisée aux antibiotiques, nos résultats ne fournissent aucune preuve de ce phénomène dans les isolats de terrain.

Importance

Les agents pathogènes d'origine alimentaire tels que L. monocytogenes peuvent persister dans les environnements de production alimentaire pendant une longue période, provoquant ainsi des épidémies régulières. Par conséquent, les agents pathogènes bactériens peuvent survivre aux procédures de nettoyage et de désinfection. En conséquence, ils peuvent être exposés de manière répétée à des concentrations sublétales de désinfectants, ce qui pourrait entraîner une adaptation bactérienne à ces biocides. De plus, on sait que la résistance aux antibiotiques et la résistance croisée évoluent sous la pression de sélection des biocides in vitro. Par conséquent, la tolérance aux antimicrobiens semble jouer un rôle crucial dans la résilience et la persistance des agents pathogènes d'origine alimentaire dans la chaîne alimentaire et pourrait réduire les options thérapeutiques des maladies infectieuses.