Danemark et Suède : Épidémie à Yersinia liée à des épinards frais, plus de 50 personnes malades

« Épidémie en cours de Yersinia liée à des épinards frais, plus de 50 personnes malades », source article de Joe Whitworth paru le 28 mai 2019 dans Food Safety News.

Un foyer de cas à Yersinia au Danemark et en Suède comptant plus de 50 cas a été associé à des épinards frais.

Le Statens Serum Institut, un institut de recherche en santé publique au Danemark, a signalé que 20 personnes ont été infectées dans le pays. Une personne a eu besoin d'être hospitalisée. L'Agence suédoise de la santé publique (Folkhälsomyndigheten) a enregistré 37 cas confirmés.

En mars, 20 cas à Yersinia enterocolitica ont été découverts au Danemark. Il y avait 11 femmes et neuf hommes âgés de 2 à 74 ans, la plupart des cas âgés de 20 à 30 ans. Les patients étaient répartis dans tout le Danemark à Hovedstaden, Sjaelland, Syddanmark, Midtjylland et Nordjylland. Le lien avec les épinards a été basé sur une étude cas-témoins et sur une enquête de traçabilité, qui est toujours en cours pour déterminer le pays d'origine des épinards.

Après des entretiens avec des patients, le Statens Serum Institut a mené une étude dans laquelle il était demandé aux personnes en bonne santé du même sexe et du même âge vivant dans la même municipalité que les personnes malades si elles avaient mangé certains aliments que beaucoup de patients ontaminés par Yersinia avaient consommés. L'étude a montré que les patients avaient consommé des épinards frais dans une bien plus grande mesure que les témoins.

L'enquête a révélé que des épinards avaient été achetés chez Netto et dans une chaîne de supermarchés en Suède. Des responsables danois ont déclaré que le produit en cause n'était plus disponible sur le marché, car le pays n'avait pas vu de cas depuis mars et compte tenu de la durée de l'éclosion, il est probable que seul un lot a été contaminé.

La cause de l'épidémie a été Yersinia enterocolitica, sérotype O3, biotype 4. le séquençage du génome complet a motré que tous les patients étaient infectés par la même souche bactérienne.

« Bien que l’épidémie soit terminée, nous pouvons utiliser ces connaissances pour éviter qu’elle ne se reproduise. C’est également une bonne raison de rappeler aux consommateurs que les légumes verts à feuilles doivent toujours être bien lavés avant de les manger », a déclaré Luise Müller, épidémiologiste au Statens Serum Institut.

Le Danemark connaît environ 400 cas à Yersinia enterocolitica par an, dont 366 ont été signalés en 2018.

En Suède, l'augmentation des infections à Yersinia a débuté en mars et les 37 cas, principalement de jeunes adultes, provenaient de tout le pays.

L’infection à Yersinia est relativement rare en Suède, 200 à 300 cas étant notifiés chaque année.

Les épidémies précédentes étaient dues à la consommation de viande crue ou insuffisamment cuite et à des légumes contaminés prêts à être consommés. Après une période d'incubation de trois à sept jours, les symptômes incluent fièvre, diarrhée et douleurs abdominales dans la partie inférieure droite de l'abdomen.

Royaume-Uni : Recommandations pour améliorer la surveillance de la sécurité des aliments

« Recommandations de la FSA pour améliorer la surveillance de la sécurité des aliments », source Food Safety News.

Une étude commandée par le gouvernement a fait l'objet de huit recommandations visant à améliorer la surveillance de la sécurité sanitaire des aliments au Royaume-Uni.

La Food Standards Agency (FSA) a commandé l'étude à RAND Europe en février 2018. Fin 2017, elle a commencé à travailler sur une approche de la surveillance stratégique de la sécurité des denrées alimentaires basée sur des données, proactives et flexibles. RAND Europe est une organisation de recherche à but non lucratif qui travaille sur les politiques publiques.

L’approche actuelle en matière de surveillance des aliments comprend un échantillonnage aléatoire des produits par les autorités locales. Au lieu de l'échantillonnage traditionnel, la FSA souhaite utiliser des techniques analytiques modernes et diverses sources de données afin de créer un nouveau moyen d'identifier les risques pour la santé publique liés aux aliments.

Les chercheurs ont créé une approche en matière de surveillance stratégique, de sélection et de hiérarchisation des sujets et d’amélioration de la communication et de la coordination.

Une porte-parole de la FSA a déclaré que l'agence développait toujours l'approche de la surveillance.

« Nous avons commandé cette étude pour aider à la conception et à la mise en œuvre d'un système de surveillance stratégique pour le système alimentaire britannique et nous travaillons actuellement à la mise en œuvre des recommandations formulées par RAND Europe », a-t-elle déclaré.

Les recommandations sont:

• La sélection et la priorisation des sujets doivent être entreprises à l'aide d'un processus de prise de décision éclairé, reproductible et reproductible;
• La FSA devrait entreprendre des activités de prévision et d’analyse prospective pour identifier les inconnus que nous ne connaissons pas;
• Le programme de surveillance devrait continuer à identifier et à impliquer les parties prenantes;
• Il est nécessaire de définir le processus d'action et de communication des évaluations.
• La FSA devrait accroître sa visibilité auprès des parties prenantes pour faciliter la collecte de données et les actions futures;
• L'approche devrait continuer à exploiter les données existantes et à relier les sources de données afin d'exploiter les connaissances;
• La FSA devrait compiler un catalogue de données basé sur des métadonnées; et
• Les compétences, les connaissances et l'expérience doivent être capturées (c'est-à-dire sous la forme d'un catalogue de compétences et de méthodes) afin d'aider la FSA à structurer la résolution de problèmes et à mettre en œuvre l'approche.

L'analyse de RAND Europe a adopté une approche descendante en utilisant les modèles existants de la FSA et une approche ascendante en regroupant les thèmes des données des entretiens afin de produire un modèle de fonctionnement proposé pour la surveillance stratégique. L’équipe de recherche a interrogé des membres supérieurs de la FSA pour déterminer les exigences du système.

« L’approche globale a été conçue pour être flexible, évolutive et adaptable, au lieu d’un processus rigide; Il fournit une structure directrice et une base sur laquelle la FSA peut commencer à mettre en œuvre une surveillance stratégique et à faire évoluer l'approche à mesure que la FSA gagne en maturité en matière de surveillance », selon le rapport.

L'étude de sept semaines a conçu une approche globale de la surveillance stratégique en cinq étapes: planifier et diriger; recueillir et rassembler; analyser et produire; rendre compte et diffuser; et évaluer et examiner.

Le modèle opérationnel initial conçu par la FSA comportait les quatre étapes principales suivantes: analyse, repérage, réduction et évaluation, ainsi qu'une cinquième étape de partage/publication menant à des actions telles que. l'ouverture d'une enquête, l'émission d'un rappel de produit ou la notification à d'autres ministères ou organismes gouvernementaux en dehors du système de surveillance.

Afin de s’assurer que l’approche répondait aux besoins de la FSA, l’équipe d’étude l’a comparée à deux cas précédemment examinés par la FSA dans le cadre de son programme de surveillance; adultération de l'huile d'olive et contamination des coquillages par la bactérie Vibrio. Les tests ont montré que l'approche était appropriée pour les deux cas puisqu'aucune mesure n'avait été prise qui ne figurait pas dans l'approche globale.

La FSA souhaite que les recommandations soient terminées au début de l'année prochaine.

Pendant ce temps, le National Audit Office (NAO) examine l'efficacité des dispositions réglementaires en vigueur pour garantir que les aliments peuvent être consommés sans danger et c'est ce qu'il dit.

Le rapport doit paraître cet été et s'appuie sur les travaux d'octobre 2013 sur la sécurité des aliments et l'authenticité de la chaîne d'approvisionnement liée à la viande transformée.

Le NAO cherche à savoir si la FSA dispose de preuves montrant que le système de réglementation permet d’obtenir des résultats et d’améliorer les performances, et si le D Department for Environment, Food and Rural Affairs (Defra) et la FSA ont mis en place un régime réglementaire cohérent et coordonné pouvant s’adapter à défis actuels et émergents.

Malgré de nouvelles options de contrôle au Canada, une nouvelle éclosion est en cours concernant du poulet congelé

« Malgré de nouvelles options de contrôle au Canada, un nouvelle éclosion est en cours concernant du poulet congelé », source article de Coral Beach publié le 27 mai 2019 dans Food Safety News.

Les consommateurs canadiens sont à nouveau en alerte en raison de la présence de Salmonella dans du poulet pané et congelé, selon un nouvel avis de rappel et un avertissement de santé publique relatif au dernier des 18 foyers associés à ces produits depuis mai 2017.

Cette fois, le rappel du 24 mai 2019 concerne des produits de poulet de marque Compliments de Sofina Foods Inc. Le travaail des enquêteurs sur les épidémies a entraîné un rappel rapide de « Lanières de poulet – escalopettes de poulet panées – non cuites » vendues sous la marque Compliments, selon l’Agence canadienne d’inspection des aliments (ACIA).

Sofina Foods a rappelé différents produits de poulet congélés sous la marque Compliments en réponse à une situation similaire en mars.

« Ce rappel découle de renseignements obtenus par l'Agence canadienne d'inspection des aliments (ACIA) au cours d'une enquête sur une éclosion de maladie d'origine alimentaire. L'ACIA procède actuellement à une enquête sur la salubrité des aliments qui pourrait entraîner le rappel d'autres produits. Tout autre rappel de produit à haut risque sera signalé à la population au moyen d'une mise à jour de l'avis de rappel d'aliments. »

« L'Agence de la santé publique du Canada enquête sur une éclosion de maladie chez l'humain et a déterminé que ce produit constitue une source de maladie. L'enquête est en cours, et d'autres sources pourraient être trouvées. De nombreux produits de poulet panés congelés sur le marché sont crus et peuvent donc contenir la bactérie Salmonella. Ces produits peuvent avoir l'apparence d'être précuits, mais ils doivent être manipulés et préparés avec précaution. »

Les enquêteurs de la santé publique ont confirmé le lien entre les produits de poulet panés congelés rappelés et les personnes infectées par Salmonella. Au 25 mai, il y a une investigation nationale en cours sur une épidémie de Salmonella liée à ces produits, selon une notification d'épidémie de l'Agence de la santé publique du Canada.

L'épidémie actuelle, associée à des produits de poulet cru, pané et congelé de marque Compliments rappelé le 25 mai, a rendu malade au moins 11 personnes dans sept provinces canadiennes. L'un des patients a été hospitalisé. Les responsables fédéraux de la santé publique n'ont reçu aucun rapport de décès.

« Les produits de poulet crus, panés et congelés ont été identifiés comme une source de cette éclosion », selon l'avis d'épidémie. « Le produit a été vendu à l'échelle nationale jusqu'au 1er mai 2019, mais certains consommateurs pourraient toujours en avoir dans leur congélateur. »

De nouvelles options de contrôle concernant des éclosions en cours

En raison de la longue série d'éclosions liées aux produits de poulet panés, crus et congelés depuis mai 2017, le gouvernement canadien a mis en place de nouvelles options de contrôle pour l'industrie conçues pour mieux contrôler les risques liés à Salmonella.

« Les mesures sont entrées en vigueur le 1er avril 2019; toutefois, il est possible que les produits fabriqués avant cette date soient encore sur le marché ou dans les congélateurs des gens pour une période allant jusqu'à un an après le 1er avril. On rappelle donc aux consommateurs de prendre des précautions et de suivre les bonnes pratiques en matière de salubrité des aliments lorsqu’ils manipulent, préparent et consomment ces types de produits. »

Les enquêteurs de la santé publique chargés des épidémies ont établi un lien entre 14 produits de poulet panés congelés et 18 éclosions à Salmonella au Canada au cours des deux dernières années. L'ACIA a émis des avis de rappel pour 13 des produits.

Les responsables ont déclaré que la détection, l'investigation et le confinement des épidémies étaient grandement améliorés par l'utilisation du séquençage du génome entier, que les scientifiques du gouvernement canadien ont commencé à utiliser en mai 2017. Depuis lors, les partenaires fédéraux, provinciaux et territoriaux de la santé et de la sécurité des aliments ont investigué 18 éclosions nationale liées au poulet cru, y compris les produits de poulet panés, crus et congelés.

Au 25 mai, il y avait 584 patients confirmés par le laboratoire à travers le pays. Parmi les patients pour lesquels des informations sont disponibles, 97 ont été hospitalisés. Trois sont décédés, mais les responsables de la santé publique ont déclaré que Salmonella n'était pas la cause du décès de deux d'entre eux et qu'il n'avait pas été déterminé si Salmonella avait contribué à la cause du décès de la troisième personne.

Les provinces et le nombre de personnes infectées par Salmonella sont : Colombie-Britannique avec 44 cas; Alberta 85; Saskatchewan 18; Manitoba 29; Ontario 215; Québec 119; Nouveau-Brunswick 31; Nouvelle-Écosse 19; Île du Prince Édouard 6; Terre-Neuve et Labrador 12; Territoires du Nord-Ouest 2; Yukon 1; et Nunavut 2.

Pour plus d'informations sur les éclosions à Salmonella attribuées à des produits de poulet panés, crus et congelés, veuillez consulter les articles suivants parus dans Food Safety News : 1, 2, 3, 4, 5, 6 et 7.

La Chine annonce des progrès sur le vaccin contre la peste porcine africaine

Dans un article du 22 mai 2019, on apprend que s'agissant de la « Peste porcine africaine : la Chine fragilisée, la planète secouée »

La peste porcine africaine fait des ravages en Chine et menace de se propager dans les pays voisins. Cette épizootie, très difficile à contrôler, fait grimper les prix sur le marché mondial et impacte l’équilibre des échanges. Elle souligne à quel point les enjeux de la santé animale ont un caractère géopolitique bien marqué, à l’instar de l’agriculture dans son ensemble.  

« La Chine aurait deux vaccins contre la peste porcine africaine », source article de Jim Romahn paru sur son blog Agri 007.

La Chine serait sur le point de tester deux vaccins prometteurs en laboratoire contre la peste porcine africaine.

Le Harbin Veterinary Research Institute aurait découvert deux candidats vaccins, rapporte l’agence de presse Reuters.

Mais Liz Wagstrom, du National Pork Producers Council aux États-Unis indique qu'il peut s'avérer difficile d'obtenir un vaccin efficace, car les chercheurs tentent de le faire depuis plus de 50 ans.

La fièvre porcine africaine contient environ 70 fois plus de protéines que la moyenne des virus, ce qui explique pourquoi le défi est si grand.

« Dans la prochaine étape, l'Académie chinoise des sciences agricoles accélérera les progrès des essais pilotes et cliniques, ainsi que de la production de vaccins », indique le média chinois Weibo.

Bien que plusieurs chercheurs aient déjà identifié plusieurs vaccins candidats, il reste encore beaucoup à faire avant de mettre un produit efficace sur le marché.

Il existe également au moins deux souches du virus en circulation en Chine et un vaccin serait peu susceptible de protéger contre les deux, a rapporté Reuters.

Cependant, les scientifiques travaillant sur les vaccins pour animaux ont émis une note de prudence, affirmant qu'il serait difficile de développer et de lancer un vaccin efficace.

Les responsables de Harbin n'étaient pas immédiatement disponibles pour commenter lorsque Reuters les a appelé.

La fièvre porcine africaine a absorbé environ 20% de la population porcine de Chine depuis le début de sa propagation dévastatrice en août.

L'OMS repart à la chasse au acides gras trans et cible l’industrie des graisses, celle des huiles et les secteurs de l’alimentation et de la restauration

Dans un document du 26 mai 2016, l'Anses traitait des « acides gras trans. Présentation, sources et effets sur la santé » et faisait des recommandations pour la réduction de l'utilisation de ces acides gras trans déjà mis en œuvre par les professionnels, tant en alimentation humaine qu'animale, afin de réduire le risque d'exposition.

L'OMS entend aller plus loin et cible « L’industrie des graisses, celle des huiles et les secteurs de l’alimentation et de la restauration doivent se joindre aux efforts mondiaux pour éliminer les acides gras trans industriels des aliments transformés d’ici à 2023 », source déclaration de l'OMS du 23 avril 2019.

Cette déclaration de l'OMS fait suite au Plan de l’OMS pour éliminer de l’alimentation les acides gras trans produits industriellement du 14 mai 2018

L’élimination des acides gras trans industriels de l’alimentation mondiale  est une priorité de l’Organisation mondiale de la Santé (OMS) et l’un objectif du treizième programme général de travail, document qui guidera les activités de l’OMS jusqu’en 2023.

Le programme d’action REPLACE a été élaboré, et lancé en mai 2018, dans le cadre de l’action menée par l’OMS pour aider les gouvernements à éliminer les acides gras trans industriels de l’alimentation nationale et à remplacer ces composés nocifs par des graisses et des huiles plus saines.

Pour atteindre cet objectif, nous appelons non seulement les gouvernements à s’engager, mais aussi l’industrie à en faire de même et à agir pour effectuer cette transition.

L’OMS appelle l’industrie des graisses et des huiles et le secteur de l’alimentation, y compris celui de la restauration, à prendre les engagements suivants :

• Reformuler les aliments pour éliminer les acides gras trans industriels : Fixer des cibles d’élimination des acides gras trans et s’engager à les atteindre d’ici à 2023 ou avant, pour tous les produits des gammes proposées au niveau mondial, conformément à la recommandation de l’OMS applicable à l’ensemble des catégories d’aliments (<2 grammes pour 100 grammes d’huiles ou de graisses), sans les remplacer par des graisses saturées.
• Utiliser des étiquettes indiquant la teneur en acides gras trans : appliquer ces étiquettes sur tous les aliments préemballés.
• Renforcer l’offre en graisses et en huiles plus saines : renforcer l’offre en solutions de remplacement à faible teneur en graisses saturées.
• Évaluer les engagements : soutenir la conduite d’une évaluation indépendante pour suivre les progrès et contrôler le respect des engagements, notamment en communiquant chaque année les volumes de production pour les acides gras trans industriels et les volumes de ventes de chaque pays.

Des progrès majeurs ont été accomplis pour passer des huiles partiellement hydrogénées à des huiles plus saines, en particulier dans les pays à revenu élevé.

Cependant, beaucoup reste encore à faire.

L’élimination des acides gras trans industriels est l’un des moyens les plus simples et les plus efficaces de sauver des vies et d’obtenir une alimentation plus saine.

Chaque année, 130 millions d’enfants naissent dans le monde. D’ici à 2023, grâce à l’engagement et à la coopération de l’industrie, plus aucun d’entre eux ne sera exposé aux dangers des acides gras trans industriels.

Après la viande bovine, de la volaille de Pologne contaminée par Salmonella est une nouvelle pomme discorde avec la République tchèque

Je vous avais déjà narré les problèmes de la République tchèque et de la Pologne dans l'article, Le bœuf polonais et accessoirement Salmonella pomme de discorde entre la République tchèque, la Pologne et la Commission européenne.

Voici que cela se poursuit avec « Des analyses et essais tchèques révèlent la présence de Salmonella dans des volailles de Pologne », source article de Joe Whitworth paru le 25 mai 2019 dans Food Safety News.

Salmonella a été détectée dans 16 tonnes de volaille importée de Pologne vers la République tchèque depuis la mi-avril, selon l'Administration vétérinaire tchèque (SVS).

SVS a ordonné des mesures vétérinaires d'urgence pour 12 destinataires d'envois de volailles depuis la mise en place des règles en avril. Onze incidents ont impliqué du poulet et un lié à la dinde. Si Salmonella est présente dans de la viande de volaille, l'importateur doit effectuer des analyses de laboratoire supplémentaires.

La plupart des viandes contaminées ont probablement été consommées car les résultats des analyses n'ont pas été reçues avant la date de péremption des produits, mais aucun cas de maladie n'a été rapporté.

Les destinataires de la viande de volaille pour lesquels l'Administration vétérinaire de l'État a identifié la présence de Salmonella doivent faire examiner les envois ultérieurs provenant du même pays par un laboratoire avant de remettre la viande sur le marché. Ce n'est qu'après avoir reçu un résultat satisfaisant d'un laboratoire accrédité qu'ils pourront libérer le produit.

Si Salmonella est présente dans la viande, le lot entier doit être détruit et les sanctions peuvent atteindre jusqu'à 50 millions de couronnes tchèques (2 millions de dollars).

La semaine dernière, la République tchèque a émis 11 alertes au système d'alerte rapide pour les denrées alimentaires et les aliments pour animaux (RASFF) concernant la détection de Salmonella dans la viande de Pologne. Les produits concernés sont les poitrines de poulet réfrigérées et les cuisses et les souches de dinde réfrigérées comprennent Bardo, Infantis et Newport.

Les mesures ne concernent que la viande de volaille et ont été approuvées en avril par SVS et le ministre de l'Agriculture, Miroslav Toman, en raison de la présence répétée de salmonelles dans ce produit au printemps.

Ce sont des mesures ciblées et individuelles visant à protéger la santé publique liées à des envois spécifiques, à la différence des contrôles généraux du bœuf polonais plus tôt cette année.

La République tchèque a levé les contrôles sur le bœuf en provenance de Pologne fin mars, après que la Commission européenne les ait qualifiés de « disproportionnés ».

Les mesures vétérinaires extraordinaires consistaient à analyser toute la viande bovine polonaise par un laboratoire accrédité aux frais de l’importateur avant sa mise sur le marché à la suite de la détection de Salmonella.

Elles ont été mis en place après la révélation qu’un abattoir en Pologne qui avait abattu des vaches malades et avait envoyé la viande dans les pays de l’UE.

Les autorités polonaises ont présenté, à la mi-mai, lors d'une réunion du groupe de travail sur la sécurité biologique de la chaîne alimentaire du Comité permanent des plantes, des animaux, des denrées alimentaires et des aliments pour animaux, les actions entreprises suite à la découverte de l'abattage illégal de vaches en janvier.

La FDA soutient l'information 'meilleur si utilisé jusqu'à' la date sur l'étiquetage des produits alimentaires

« La FDA soutient l'information 'meilleur si utilisé jusqu'à' la date sur l'étiquetage des produits alimentaires », source article de Susan Kelly paru le 24 mai 2019 dans Meatingplace.

La FDA demande instamment à l'industrie alimentaire d'adopter l'expression « meilleur si utilisé jusqu'à » la date sur l'étiquetage des aliments emballés afin de réduire la confusion des consommateurs et le gaspillage alimentaire.

Dans une lettre à l’industrie, l’agence a déclaré que la confusion entourant l’étiquetage des dates représentait environ 20% du gaspillage alimentaire des consommateurs. L'Economic Research Service de l'USDA estime à 30% le gaspillage alimentaire au niveau du commerce et de la distribution et chez les consommateurs, ce qui signifie 51 milliards de kg de produits alimentaires d'une valeur de 161 milliards de dollars sont jetés chaque année, a dit la FDA.

En 2016, l'USDA a publié une mise à jour encourageant les fabricants et les distributeurs de produits alimentaires à utiliser la formulation « meilleur si utilisé jusqu'à » afin de rationaliser l'étiquetage en indiquant aux consommateurs qu'un produit sera de la meilleure qualité s'il est utilisé jusqu'à la date indiquée.

En 2017, un groupe consultatif de la Grocery Manufacturers Association (GMA) et le Food Marketing Institute (FMI) a recommandé la phrase « meilleur si utilisé jusqu'à » pour les aliments emballés (l'équivalent de notre DDM ou DLUO) et un étiquetage « à utiliser jusqu'à » la date pour les produits périssables (l'équivalent de notre DLC).

La FDA a dit qu'elle ne traitait pas de l'utilisation d'un étiquetage « utilisé jusqu'à » pour des raisons de sécurité sanitaire pour le moment.

La FMI a dit que l’approbation par la FDA de l’étiquetage de date « meilleur si utilisé jusqu'à » (best if used by) indique une meilleure pratique plus facile à comprendre pour les consommateurs.

« Nous sommes impatients de poursuivre les discussions avec la FDA et l'USDA concernant le petit univers de produits alimentaires nécessitant une démarcation pour la conservation et la sécurité sanitaire des aliments », a déclaré FMI.

A propos du séquençage du génome complet de Listeria monocytogenes au sein de l'UE

« Problèmes rencontrés dans quatre laboratoires au cours d'essais d'intercomparaison relatifs à la Listeria », source Food Safety News du 24 mai 2019

Selon un rapport du Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC), quatre laboratoires ont rencontré des problèmes lors d'un essai d'intercomparaison pour l'assemblage du génome complet de Listeria monocytogenes.

L’objectif était d’aider les laboratoires nationaux de référence de santé publique à effectuer un typage basé sur le séquençage du génome complet à générer des assemblages génomiques de bonne qualité et comparables pour Listeria monocytogenes.

Les assemblages peuvent être utilisés pour des analyses comprenant des données de typage de séquence multilocus de génome complet et de base ou core genome (wg/cgMLST). Des assemblages de bonne qualité sont nécessaires pour produire des données wg/cgMLST comparables entre laboratoires. Les laboratoires déclarants doivent s'assurer que leur processus d'assemblage est concordant afin d'éviter les problèmes de comparabilité et pouvant potentiellement affecter la détection et la vérification des épidémies, selon le rapport de l'ECDC.

L'ECDC est favorable à l'intégration des données de séquençage du génome complet (WGS pour whole genome sequencing) dans la surveillance et les investigations épidémiologiques dans plusieurs pays de maladies d'origine alimentaire, notamment la listériose.

Dix des 14 participants à l'essai de 2018 avaient au moins un pipeline (ensemble d’outils d’analyse, d’algorithmes et d’étapes de calcul. ) concordant et les quatre autres ont bénéficié d'une assistance après l'essai d'intercomparaison afin d'identifier la cause première du problème et améliorer les résultats. Les laboratoires ne disposant pas d'un pipeline d'assemblage concordant devraient envisager de le mettre à jour pour éviter les problèmes de détection d'épidémie et, dans l'intervalle, partager les lectures brutes avec l'ECDC.

Les quatre laboratoires qui ont eu des problèmes ont été informés des causes possibles. Deux d'entre eux ont depuis mis à jour leur pipeline et généré des résultats concordants. Pour le troisième laboratoire, la cause dépend d'une mise à niveau logicielle, ce qui pourrait être le cas pour le quatrième laboratoire.

Les 14 participants ont soumis des génomes assemblés pour 15 séries de lectures de séquences brutes. Plus d'un pipeline d'assemblage a été autorisé par participant et les résultats par pipeline ont été comparés à l'assemblage de référence généré par l'ECDC sur plusieurs métriques de qualité.

Seize organisations, dont 14 laboratoires nationaux de référence de santé publique, l'Autorité européenne de sécurité des aliments (Efsa) et l'Anses en tant que laboratoire de référence de l'Union européenne (EURL) pour Listeria monocytogenes, ont founi des résultats pour 29 pipelines d'assemblage.

Pour les lectures avec Illumina, les assemblages de référence ont été jugés appropriés. Pour les lectures avec Ion Torrent, il n’a pas été possible d’établir une concordance.

Pour la surveillance européenne de la listériose, l'ECDC n'acceptera que des assemblages de laboratoires générés par un pipeline concordant tel que vérifié selon la méthodologie exposée dans le rapport.

Faire avancer le séquençage du génome complet

Dans le même temps, un rapport de l'ECDC du mois dernier a proposé de donner la priorité à la mise en œuvre du WGS en fonction de la maladie et des applications de santé publique.

Il a présenté les options de mise en œuvre pour l'intégration à moyen terme des informations sur le typage moléculaire/génomique dans la surveillance au niveau de l'UE et les investigations sur les épidémies dans plusieurs pays.

Le rythme d'absorption du WGS varie entre les agents pathogènes, les maladies et les pays de l'Union européenne. L'ECDC aide les pays à utiliser progressivement le typage séquentiel afin de pouvoir participer à des opérations conjointes de réponse et de surveillance avec les États membres.

Le typage basé sur le WGS pour la surveillance de routine d'au moins un agent pathogène humain est passé de aucun pays en 2013 à 20 en 2017. Les résultats de l'enquête indiquent qu'à la fin de cette année, 29 États membres ont l'intention d'utiliser le typage basé sur le WGS pour la surveillance de la santé publique. au moins un agent pathogène dont la mise en œuvre est commune à Listeria monocytogenes.

De novembre 2015 à juin 2018, l'ECDC a aidé à investiguer sur 41 épidémies présumées d'origine alimentaire dans plusieurs pays causées par Salmonella enterica, Listeria monocytogenes ou E. coli producteurs de shigatoxines (STEC). Dans le cadre de ce travail, plus de 2 000 génomes bactériens ont été séquencés. Les investigations ont confirmé 31 épidémies touchant plusieurs pays et identifié la source alimentaire pour 12 épidémies.

Le cadre proposé révise la liste des agents pathogènes et des maladies prioritaires à intégrer à moyen terme de 2019 à 2021. Pendant cette période, l'ECDC prévoit de préparer et/ou de mettre en œuvre un soutien aux investigations épidémiques dans plusieurs pays, une surveillance continue et une surveillance sentinelle au sein de l'UE.

Campylobacter spp., le virus de l'hépatite A, Legionella spp., Listeria monocytogenes, Salmonella enterica et STEC sont listés dans l'aide aux investigations épidémiques menées dans plusieurs pays par le biais d'une catégorie de typage par séquençage.

Listeria monocytogenes, Salmonella enterica et STEC font également partie de la catégorie de la surveillance continue basée sur le séquençage à l'échelle de l'UE.

Les difficultés du métier d'inspecteur en abattoir en Angleterre

Les difficultés du métier d'inspecteur en abattoir en Angleterre sont illustrés avec cet article, « De la viande et des aliments pour animaux de compagnie déclarés impropres à la consommation alors que les infractions de la société anglaise se poursuivent », source article de Joe Whitworth du 23 mai 2019 paru dans Food Safety News.

Cet article est révélateur de certaines mauvaises pratiques mais aussi de la difficulté pour les inspecteurs de faire leur métier.

BirminghamHalal Abattoir a rappelé de la viande et des aliments pour animaux de compagnie, car ils pourraient être impropres à la consommation humaine ou animale.

Certains produits ne répondent pas aux exigences de sécurité des denrées alimentaires et des aliments pour animaux, il est donc dangereux de les consommer ou de les donner à des animaux de compagnie.

Les viandes et les aliments pour animaux de quatre gammes de produits qui auraient dû être retirés de la production ont été conditionnés avec des articles ayant subi une inspection satisfaisante.

Comme il n’était pas possible d’identifier quels lots contenaient le produit impropre à la vente, la société, exerçant ses activités sous le nom de Pak Mecca Meats, a rappelé certains lots d’articles vendus en Angleterre, car ils risquaient de contenir de la viande non sûre. Un porte-parole de la Food Standards Agency (FSA) a déclaré à Food Safety News que les auditeurs vétérinaires avaient détecté le problème lors de l'audit planifié du site.

« Certains produits carnés spécifiques (pieds de mouton, intestins de mouton et tripes de mouton) auraient dû être retirés de la production à l'étape où la carcasse associée n'a pas passé l'inspection. Par conséquent, tous ces produits carnés emballés et vendus en multiple sont rappelés à titre de précaution », a-t-il déclaré.

« Notre enquête a confirmé que les autres produits de viande ont été éliminés en conséquence et que ce sont les seuls produits concernés. Bien que le rappel ait été promulgué, la FSA poursuit son investigation. Nous ne sommes au courant d'aucun cas humain lié à ce rappel. »

Le rappel concerne tous les lots de sacs de 5 kg de pieds de mouton contenant 36 pieds et tous les conditionnements d'intestins de mouton produits et achetés jusqu'au 29 avril de cette année.

Les tripes de moutons destinées à la consommation humaine et conditionnées dans des sacs de 6 kg contenant six ou quatre tripes, ainsi que les tripes de moutons destinées à l'alimentation des animaux de compagnie, toutes les tailles de conditionnement sont sujettes à rappel.

Ce n’est pas la première fois que Birmingham Halal Abattoir fait l’objet des attentions de la FSA. Il a été reconnu coupable et condamné à payer plus de 18 000 £ (23 000 $) pour mis en échec des inspections de viande requises en 2018. En septembre 2017, l'entreprise a abattu 41 moutons qui n'avaient pas été soumis à des inspections ante mortem, qui étaient des inspections avant leur mort.

En février 2018, le Birmingham Magistrates Court a condamné la société à une amende de 12 000 £ (15 200 $) et à la somme de 6 767 £ (8 600 $) ainsi que d’une suramende supplémentaire de 170 £ (215 $).

En février 2016, l'entreprise a plaidé coupable des infractions en matière d'hygiène concernant le contact des carcasses avec le sol. Trois infractions liées au bien-être des animaux ont été commises depuis 2013.

Amendes pour entrave aux inspections de la FSA

Dans le même temps, une usine de découpe de viande rouge et blanche à Londres a été condamnée à une amende de 9 000 £ (11 400 $), assortie de frais de 1 000 £ (1 300 $) après avoir empêché les inspecteurs d'entrer.

Lors d'une audience devant le tribunal de première instance de la Tamise, le propriétaire du site de M Coban Ltd. a été reconnu coupable de deux infractions consistant à avoir empêché des inspecteurs de la FSA d'entrer dans les lieux les 4 juillet et 22 août 2018.

La FSA surveille la conformité dans les usines de découpe grâce à des audits planifiés et à des visites inopinées. La fréquence des audits dépend du niveau de conformité sur le site. Coban a déclaré à la cour qu'il se sentait harcelé par les inspections et qu'il avait consacré beaucoup de temps et de ressources à ses visites.

Le site n'est plus réglementé par la FSA et est maintenant enregistré par les autorités locales de Waltham Forest, qui disposent d'un régime d'inspection distinct.

Colin Sullivan, directeur des opérations à la FSA, a déclaré que l'agence était obligée de veiller à ce que les usines de découpe soient inspectées régulièrement.

« En empêchant notre personnel de jouer son rôle, non seulement cela nous empêche d'évaluer si les aliments produits sont sûrs, mais cela peut également constituer une infraction. Je suis heureux que cette société ait été tenue pour responsable pour avoir enfreint ces règles. »

Une proposition de l'EFSA dans le but d'aider à évaluer les risques de toxines et de contamination chimique

« Une proposition de l'EFSA dans le but d'aider à évaluer les risques de toxines et de contamination chimique », source Food SafetyNews du 21 mai 2019.

L'Autorité européenne de sécurité des aliments a mis au point une méthodologie pour améliorer la classification des notifications du système d'alerte rapide pour les denrées alimentaires et les aliments pour animaux (RASFF) sur la base des risques liés aux contaminants chimiques.

La méthodologie a été développée pour évaluer les contaminants présents dans les matériaux au contact des aliments, les substances pharmacologiquement actives et d'autres contaminants dans les aliments, selon l'Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA). Cela repose sur l'évaluation des propriétés toxicologiques et de l'exposition alimentaire.

Les résultats peuvent être classés comme sans risque, faible probabilité d'effets néfastes sur la santé ou peu préoccupante pour la santé publique, risque potentiel ou risque.

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Les exemples de contaminants chimiques sont les métaux lourds tels que le mercure, le cadmium, le plomb et l'arsenic; industriels et environnementaux, y compris les hydrocarbures aromatiques polycycliques, les dioxines, les huiles minérales et le 3-MCPD; la migration de substances organiques des matériaux au contact des aliments telles que le formaldéhyde, la mélamine et les phtalates; les mycotoxines et d'autres biotoxines telles que l'aflatoxine, l'ochratoxine A, la zéaralénone, la patuline et les alcaloïdes tropaniques; et les résidus de médicaments vétérinaires tels que les antibiotiques et le vert malachite.

La méthodologie vise à fournir des critères pouvant étayer la décision de notifier au RASFF tout en renforçant l'harmonisation du processus d'évaluation. L'approche peut être appliquée à la plupart des situations lorsqu'un résultat analytique est potentiellement préoccupant ou qu'une non-conformité est détectée dans un aliment ou pour les matériaux au contact des aliments.

Dépasser une limite légale ne déclenche pas systématiquement une notification RASFF conformément au règlement (UE) n°16/2011. Une évaluation du niveau de risque est nécessaire pour décider s’il doit en exister une. Les trois niveaux de risque de base sont les suivants: aucun risque, risque faible et risque grave.

En raison des différents niveaux de soutien scientifique et d'interprétation des risques entre les États membres, il était nécessaire de disposer de davantage de directives pour harmoniser l'évaluation des risques, selon des responsables. L'amélioration des directives sur l'évaluation des risques devrait conduire à une classification plus cohérente des notifications au RASFF en notifications d'alerte ou notifications d'informations. Les alertes sont plus prioritaires en raison du risque plus élevé pour la santé.

RACE et arbres de décision

L'outil « Rapid Assessment of Contaminant Exposure » (RACE) a été développé. Il utilise les informations liées à la consommation de la base de données européenne exhaustive de l'EFSA sur la consommation alimentaire européenne afin de fournir des estimations de l'exposition aiguë et chronique par un seul aliment et de comparer le résultat à des points de référence toxicologiques pertinents.

L'outil nécessite huit paramètres d'entrée et génère un fichier de sortie Excel. Les valeurs de sortie sont colorées différemment pour indiquer l'existence ou l'absence d'un risque potentiel.

Il devrait être mis à la disposition des utilisateurs enregistrés, tels que les membres du réseau RASFF, afin de recueillir les réactions et d'améliorer l'outil, ont déclaré des responsables. Les développements ultérieurs devraient envisager la récupération automatique à partir des sources d'informations toxicologiques.

Entre 2011 et 2016, il y avait 85 résidus de médicaments vétérinaires; 96 substances chimiques appartenant aux catégories de classification du RASFF, métaux lourds, mycotoxines, contaminants industriels, autres contaminations chimiques, et 34 substances liées aux matériaux en contact des aliments ont été signalées.

Un groupe de travail composé d'experts externes et de membres de l'EFSA a utilisé les documents d'orientation de l'EFSA, d'autres éléments scientifiques de l'agence et la littérature scientifique comme base de travail. Les points de contact du RASFF ont été consultés à trois reprises.

Ils ont créé deux arbres de décision selon que les limites légales soient dépassées ou si un résultat analytique indique un risque potentiel, et un pour les substances pharmacologiquement actives qui prend en compte le fait que la substance soit autorisée ou non.

Le groupe de travail a proposé que, lorsqu'un risque potentiel est identifié, les gestionnaires de risques et/ ou les membres du réseau RASFF devraient décider du type de notification requis, en tenant compte du taux de dépassement d'une valeur indicative basée sur la santé; la population exposée; la gravité de l'effet sur la santé humaine et les groupes de population spécifiques, la durée d'exposition et les caractéristiques de l'aliment dans lequel se trouve le contaminant.