L'Organisation mondiale de la santé (OMS) a publié le 25 octobre sa
toute première liste
de «pathogènes prioritaires» fongiques, identifiant 19 champignons
qui sont apparus comme des menaces importantes pour la santé
publique en raison de leur capacité à provoquer des infections
invasives graves et de leur résistance croissante aux antifongiques.
Bien que les données sur la prévalence des infections fongiques
invasives et les schémas de résistance aux antifongiques soient
rares et que l'on en sache peu sur certains de ces pathogènes, les
responsables de l'OMS affirment que de nouvelles preuves suggèrent
que l'incidence et l'étendue géographique des maladies fongiques
augmentent en raison du changement climatique et de l'augmentation
des voyages mondiaux. La pandémie de la COVID-19 a également mis en
lumière le problème, l'incidence signalée d'infections fongiques
invasives augmentant chez les patients hospitalisés atteints de
COVID.
En outre, la population la plus exposée aux infections invasives
causées par ces pathogènes, notamment les patients cancéreux, les
personnes vivant avec le VIH/sida, les receveurs d'organes et
d'autres patients immunodéprimés, est en augmentation.
Les responsables de l'OMS craignent que le nombre limité de
médicaments antifongiques, le manque de diagnostics rapides et
sensibles et les ressources financières limitées consacrées aux
infections fongiques n'entravent la capacité de détecter et de
répondre au problème croissant. Ils espèrent que la liste des
pathogènes fongiques prioritaires pourrait avoir un impact similaire
à celui du document sur lequel elle a été modélisée - la liste
2017 de l'OMS des pathogènes bactériens prioritaires.
Nous voulons que ce rapport catalyse la recherche et le développement
sur de nouveaux antifongiques et de nouveaux diagnostics sur les
maladies fongiques», a dit Haileyesus Getahun, directeur de la
coordination mondiale de la résistance aux antimicrobiens (RAM) à
l'OMS, lors d'un point de presse.
Il a ajouté que l'identification de ces 19 pathogènes fongiques
parmi des milliers de champignons aidera à orienter les efforts de
recherche et à orienter les investissements publics et privés
indispensables dans les traitements et les diagnostics.
Actuellement, les infections fongiques reçoivent moins de 1,5% de
tous les financements de recherche sur les maladies infectieuses.
Focus sur les infections fongiques invasives
Comme le rapport de 2017 sur les pathogènes bactériens
prioritaires, le document est divisé en trois catégories en
fonction de l'impact sur la santé publique et/ou du risque émergent
de résistance aux antifongiques : priorité critique, élevée et
moyenne, avec une note indiquant que certains des pathogènes
pourraient être plus préoccupants. dans les régions où elles sont
endémiques. Pour chaque catégorie, la résistance aux antifongiques
était le critère le plus important, suivi de l'incidence annuelle,
de la morbidité et de la mortalité.
Parmi les champignons du groupe prioritaire critique se trouve
Candida auris, la levure multirésistante qui a été découverte
pour la première fois au Japon en 2009 et qui s'est depuis propagée
dans le monde entier. Les infections invasives causées par C.
auris, qui se propage facilement dans les établissements de
santé et, dans certains cas, résiste à toutes les classes de
médicaments antifongiques, sont mortelles chez 53% des patients.
Une autre espèce de Candida qui a reçu une priorité
critique est Candida albicans, qui est commune
dans la bouche, la gorge, l'intestin, le vagin et la peau, mais peut
provoquer une maladie grave lorsqu'elle envahit d'autres tissus.
Figurent également dans le groupe prioritaire critique Crytptococcus
neoformans, une levure pathogène qui vit dans l'environnement et
peut provoquer de graves infections après avoir été inhalée, et
Aspergillus fumigatus, une moisissure environnementale qui
peut provoquer de graves infections pulmonaires et constitue une
menace particulière pour la fibrose kystique, la grippe , et les
patients atteints de la COVID-19.
Parmi les champignons répertoriés comme hautement prioritaires
figurent trois autres espèces de Candida (Candida
glabrata, Candida tropicalis et Candida parapsilosis),
Histoplasma spp. et Mucorales (un grand groupe de champignons
composé de différents genres). Le groupe de priorité moyenne
comprend Scedosporium spp., Candida krusei et
Coccidioides spp., qui causent la fièvre de la vallée.
La plus grande préoccupation avec ces pathogènes est lorsqu'ils
pénètrent dans la circulation sanguine, en particulier chez les
patients gravement malades et immunodéprimés. Carmem Pessoa-Silva,
chef d'équipe de l’AMR à l'OMS, a souligné la présence
d'espèces de Candida dans les trois groupes, notant la
capacité du champignon à provoquer des infections mortelles du
sang.
«La mortalité attribuable aux infections du sang à Candida
est très élevée», a-t-elle dit. «Les chiffres varient selon les
études, mais c'est presque toujours au-dessus de 30%.»
En raison de la mortalité estimée élevée et du besoin de plus de
données, Pessoa-Silva a dit que l'OMS avait commencé à surveiller
l'incidence des infections à Candida dans le sang dans 23
pays. Elle a également dit que le système mondial de surveillance
de la résistance et de l'utilisation des antimicrobiens (GLASS pour
Global Antimicrobial Resistance and Use Surveillance System) de l'OMS
collectera bientôt des données sur la résistance des isolats
d'infections sanguines à Candida, qui sont devenues de plus
en plus résistantes aux quatre classes de médicaments antifongiques
(azolés, échinocandines, polyènes et pyrimidines) actuellement
utilisé en pratique clinique.
«Pour la plupart des pathogènes critiques et hautement
prioritaires, les options de traitement sont limitées et très
toxiques», a-t-elle dit.
Pessoa-Silva a dit qu'en plus d'une surveillance accrue et du
développement antifongique, une plus grande capacité de laboratoire
et de meilleurs outils de diagnostic sont aussi désespérément
nécessaire. Elle a noté que parce que les infections fongiques
invasives ont souvent des symptômes similaires aux infections
bactériennes, les patients sont souvent mal diagnostiqués et sont
traités avec des antibiotiques au lieu d'antifongiques.
Un problème One Health
Les responsables de l'OMS ont également souligné le fait que
l'émergence de pathogènes fongiques résistants en tant que menace
mondiale pour la santé publique est un problème d’une seule
santé, motivé en partie par l'utilisation inappropriée
d'antifongiques dans l'agriculture. Par exemple, le rapport note que
l'utilisation généralisée des azolés comme fongicides pour
protéger les plantes contre les infections fongiques a contribué à
l'augmentation des taux d'infections d’A fumigatus
résistantes aux azolés chez l'homme. Les azolés sont le traitement
de première intention de l'aspergillose invasive.
Gethun a dit que les organisations quadripartites (l'OMS, la FAO,
l'Organisation mondiale de la santé animale et le Programme des
Nations Unies pour l'environnement) ont commencé à prendre des
mesures pour identifier les antifongiques essentiels à la santé
humaine et élaborer des stratégies pour garantir qu'ils ne sont pas
utilisés de manière inappropriée dans l'agriculture.
Les responsables de l'OMS ont dit que bien qu'il existe d'importantes
lacunes dans les connaissances sur le fardeau mondial des pathogènes
fongiques invasifs, il est important de «sonner l'alarme»
maintenant et de commencer à stimuler les investissements de
recherche ciblés et les interventions de santé publique. Hatim
Sati, responsable technique de la division RAM de l'OMS, a dit que si
une chose a été apprise de la pandémie de COVID-19, c'est que si
vous pouvez faire quelque chose dès le début pour informer la
réponse de santé publique, cela devrait être fait.
«Nous n'avons pas besoin d'attendre que les choses soient
catastrophiques pour agir», a-t-il dit.
