Royaume-Uni: Une enquête sur les risques alimentaires montre une faible connaissance de Campylobacter

«Une enquête sur les risques alimentaires montre une faible connaissance de Campylobacter», source article de Joe Whitworth paru le 18 février 2021 dans Food Safety News.

Il y a une faible connaissance de Campylobacter et de son impact bien qu'il soit la principale cause d'intoxication alimentaire au Royaume-Uni, selon un projet sur la façon dont le public perçoit les risques liés aux aliments.

Les résultats proviennent d'une enquête de Kantar Public et d'une analyse de la Food Standards Agency (FSA). L'étude était en ligne et comptait 1194 participants en mars 2017, mais les résultats n'ont été publiés que ce mois-ci.

L’objectif était d’améliorer la compréhension par la FSA des perceptions des consommateurs sur le risque alimentaire. Cela pourrait aider à développer le ciblage, la messages et l'efficacité de la communication avec le public, ont dit les chercheurs.

La perception du risque par les consommateurs sur 17 sujets identifiés par la FSA et Food Standards Scotland (FSS), y compris E. coli O157, les allergènes alimentaires, les produits chimiques dans les aliments, Campylobacter, norovirus, les pesticides et la radioactivité dans les aliments ont été mesurés.

Constatations sur les risques alimentaires

L'enquête a demandé aux personnes de noter chaque risque alimentaire en fonction de six critères: les connaissances, la préoccupation, le contrôle et la source, ainsi que la durée et la gravité de l'impact sur la santé.

Les répondants estimaient qu'ils connaissaient mieux les allergènes alimentaires et l'intolérance alimentaire, mais ils ne ressentaient qu'un niveau d'inquiétude modeste. Salmonella a obtenu un score élevé à la fois en termes de connaissances et de préoccupations.

La connaissance de Campylobacter était relativement faible, bien qu’elle soit responsable de la plupart des cas d’intoxication alimentaire au Royaume-Uni.

L'acrylamide avait le score de préoccupation le plus faible. E. coli, norovirus, les pesticides et les produits chimiques dans les aliments avaient un haut niveau de préoccupation parmi les participants.

Les risques avec un niveau élevé de contrôle sont E. coli, Campylobacter, les intoxications alimentaires génériques et les allergènes. L'acrylamide, qui se produit dans les aliments chauffés pendant de longues périodes, a obtenu un score de source et de préoccupation relativement faible, tandis que norovirus et Listeria ont obtenu des scores élevés.

Un tiers des répondants ont déclaré que les effets de l'intoxication alimentaire générique sont des défis à court terme. Un consommateur sur cinq a dit que E. coli était un risque qui, selon lui, aurait un impact à long terme de plus d'un mois. Un quart a estimé que l'acrylamide n'avait aucun impact et un sur cinq l'a dit à propos des allergènes alimentaires. Près de la moitié ne comprenait pas quel était l'impact de Campylobacter.

Environ la moitié d'entre eux pensaient que l'intoxication alimentaire générique, Campylobacter, E. coli et norovirus posaient un risque d'inconfort ou de légers désagréments lorsqu'on leur demandait d'évaluer le niveau de préjudice causé par chaque sujet.

Groupe de discussion de consommateurs sur le risque

Un projet d'accompagnement, également réalisé par Kantar Public, a étudié comment les consommateurs déterminent les risques alimentaires, pour voir comment les risques sont compris, classés et traités. Cela a été fait dans six groupes de discussion à travers le Royaume-Uni en 2017 avec 41 personnes. Un inconvénient de cette méthode est la variation entre le comportement déclaré des participants et la manière dont ils agissent dans la vie réelle, selon le rapport

Les groupes ont exploré les connaissances, les préoccupations et le niveau relatif d'acceptabilité de huit risques alimentaires: E. coli O157, Campylobacter, les allergènes alimentaires, la maladie cœliaque, les pesticides, les acrylamides, la variante de la maladie de Creutzfeldt-Jakob et la radioactivité. La manière dont les personnes ont répondu aux informations détaillées sur Campylobacter, les allergènes alimentaires et l'acrylamide a également été examinée.

Les participants avaient une grande confiance dans leurs propres connaissances et pratiques en matière de sécurité des aliments, basées sur le bon sens et l'instinct, malgré une certaine incertitude concernant le lavage du poulet et la conservation et le réchauffage des aliments.

Les risques les plus connus étaient les allergènes alimentaires, les pesticides et E. coli et la radioactivité. Campylobacter avait tendance à être moins familier. Les participants avaient des connaissances mitigées sur la maladie cœliaque, la variante de la maladie de Creutzfeldt-Jakob et l'acrylamide.

Facteurs impliqués dans la tolérance au risque

Des inquiétudes avaient tendance à être plus fortes pour E. coli et les allergènes et plus faibles pour la radioactivité et l'acrylamide.Les participants qui ont associé Campylobacter à une intoxication alimentaire et au poulet étaient inquiets. La maladie cœliaque, la variante de la maladie de Creutzfeldt-Jakob et les pesticides étaient des risques moyennement préoccupants.

Les risques jugés les moins acceptables étaient E. coli et Campylobacter - pour ceux qui en étaient conscients - parce que l'intoxication alimentaire connexe était perçue comme soudaine et grave. Pendant ce temps, les acrylamides et la radioactivité, dont les conséquences étaient inconnues et/ou «non prouvées», étaient plus acceptables pour les participants.

Le niveau de préoccupation des participants et leur volonté de tolérer les risques étaient motivés par la gravité de l’impact/des conséquences, la familiarité avec le risque, la connaissance du risque, l'expérience passée, le niveau perçu de contrôle sur celui-ci, si le risque est considéré comme actuel ou ancien et l'immédiateté des effets.

La plupart des participants étaient prudents avec les viandes, en particulier le poulet, et lors de la cuisson ou de la préparation des aliments pour les autres, mais ils ont pris plus de risques avec les légumes, les fruits et les produits laitiers et n'ont pas toujours suivi les dates limites de consommation.

Les personnes ont dit avoir adopté une attitude plus détendue à l'égard de la réduction des risques lorsqu'ils étaient sous pression financière. Ils ont souvent admis que le fait de donner la priorité au plaisir de manger par rapport aux pratiques alimentaires sûres et que la confiance dans la réglementation alimentaire et dans le respect des directives par les entreprises a conduit certaines personnes à ignorer certains risques.

Une étude met en évidence la capacité de Clostridium difficile à infecter les personnes

«Une étude met en évidence la capacité de Clostridium difficile à infecter les personnes», source ASM News du 22 décembre 2020.

Une nouvelle étude identifie un système clé de C. difficile qui régule la virulence du pathogène

Une nouvelle étude a montré que 2 gènes de Clostridium difficile, AgrB1 et AgrD1, sont impliqués dans de multiples fonctions, y compris la capacité de l'organisme à former des spores, à se déplacer et à produire des toxines. L'étude, publiée dans mBio, une revue en accès libre de l'American Society for Microbiology, fournit des indices sur la façon dont les chercheurs pourraient manipuler C. difficile et sa capacité à infecter les personnes.

«D'un point de vue bactériologique très basique, c'est en quelque sorte une découverte nouvelle que ce système est impliqué dans tant d'événements différents à la fois», a dit Jimmy Ballard, professeur et président du Département de microbiologie et d'immunologie de l'Université de l'Oklahoma Health Sciences Center, Oklahoma City, et chercheur principal de l'étude. «Agr peut être ciblé avec des médicaments et d'autres méthodes pour inhiber son activité et empêcher l'organisme de fabriquer des toxines ou de sporuler, nous pensons donc que c'est une bonne cible pour le développement de thérapies.»

C. difficile est une bactérie anaérobie toxinogène sporulante qui produit des toxines dans le tractus intestinal et provoque une diarrhée intestinale associée aux anticorps, qui peut être grave. Il fait également partie d'un groupe de bactéries qui forme des spores résistantes à l'environnement qui peuvent survivre longtemps à l'extérieur de l'hôte, ce qui est l'une des façons dont cet organisme est acquis à l'hôpital.

En utilisant le système d'édition de gènes CRISPR, les chercheurs ont effectué plusieurs expériences en supprimant AgrB1 et AgrD1. «Nous avons posé des questions fondamentales sur la façon dont le système Agr fonctionne, comment il influence la sporulation, la motilité et la capacité de l'organisme à produire des toxines», a dit le Dr Ballard.

Les chercheurs ont découvert que la suppression de AgrB1, AgrD1 ou du locus entier entraînait des changements dans la transcription des facteurs liés à la sporulation et une perte globale de la formation des spores. «Nous avons constaté que dans certains cas, les deux gènes sont nécessaires à la sporulation», a dit le Dr Ballard. La motilité de C. difficile était réduite uniquement lorsque AgrB1 et AgrD1 étaient perturbés. Alors que la suppression de AgrB1 l'a amené à créer plus de toxines, la suppression combinée de AgrB1/AgrD1 ou la suppression de seulement AgrD1 n'a pas d'effet significatif sur l'expression de la toxine. «Cette découverte suggère que le chemin peut se connecter avec d'autres choses qui sont nécessaires pour réguler la production de toxines. Il y a des choses que nous ne comprenons pas à propos de l’ensemble du système», a dit le Dr Ballard.

Le Dr Ballard a dit que la compréhension de la manière dont C. difficile détecte les conditions de croissance pour réguler l'expression des toxines et la sporulation est essentielle pour faire progresser la compréhension de ce pathogène. «La principale conclusion de cet article est l'identification du système Agr comme un régulateur majeur de multiples événements importants pour la virulence de ce pathogène», a dit le Dr Ballard. Si des chercheurs peuvent trouver un moyen de manipuler le système Agr pour modifier la formulation des spores, ils pourraient potentiellement avoir un impact sur la capacité de la bactérie à infecter les personnes et à arrêter la transmission de C. difficile dans les hôpitaux.

COVID-19 : Ce qu'on savait au 20 février 2020, une vidéo du Pr Arnaud Fontanet

Arnaud Fontanet est épidémiologiste à l'Institut Pasteur et c’est lui qui a été invité par le Premier Ministre lors de son intervention publique du 28 mars 2020 ou qui est présent sur cette interview en vidéo du 27 février 2020.

Mais voyons ce qu’il disait sur le coronavirus dans « Que sait-on sur le coronavirus (COVID-19) au 20 février 2020 ».

La vidéo est en langue anglaise mais retranscrite en Français.

NB : Le contenu de cette vidéo est daté. Les informations qu'elle contient sont sujettes à évolution et modification à mesure que l'épidémie progresse.

Des chercheurs améliorent les connaissances sur l'impact de la température sur Yersinia

Christian Twittenhoff (à droite) et Franz Narberhaus ont créé un modèle qui montre comment le thermomètre à ARN se dissout. © RUB, Kramer.

« Des chercheurs améliorent les connaissances sur l'impact de la température sur Yersinia », source Food Safety News.

Des chercheurs ont analysé ce qui se passe lorsque Yersinia passe en mode d'attaque.

Yersinia pseudotuberculosis est transmis par des aliments contaminés. Lorsqu'il arrive dans l'intestin de l'hôte à sang chaud, il sécrète un facteur cytotoxique nécrosant (CnfY), qui déclenche des réactions inflammatoires aiguës et augmente l'effet d'autres substances pathogènes.

Des chercheurs de la Ruhr-Universität Bochum (RUB) en Allemagne ont examiné des thermomètres à ARN, qui signalent aux bactéries si elles se trouvent dans l'hôte. Avec des collègues de l'Institut Helmholtz pour la recherche sur les infections à Braunschweig, ils ont montré que les bactéries avec des thermomètres à ARN désactivés ne pouvaient plus déclencher une infection. Les résultats ont été publiés dans la revue Plos Pathogens.

Les thermomètres à ARN sont responsables de la mesure de la température. Ce sont des sections d'ARN messager de nombreux gènes qui contiennent le plan des protéines causant des maladies.

« Nous savions par des études antérieures que Yersinia est très sensible aux changements de température et reconnaît qu'il est chez sont un hôte sur la base de la température corporelle », a déclaré le professeur Franz Narberhaus, responsable de la chaire de biologie microbienne à la RUB.

Étape vers l'arrêt de l'infection

À basses températures, donc à l'extérieur de l'hôte, les thermomètres à ARN empêchent l'ARN d'être lu et traduit en protéines. Après l'infection de l'hôte à sang chaud, donc à une température d'environ 37°C, les structures d'ARN se dissolvent. Ils peuvent ensuite être écrits dans des protéines qui ont un effet dangereux sur l'hôte.

Il pourrait être possible d'arrêter l'infection bactérienne en empêchant la fusion des structures d'ARN. Cependant, les scientifiques ne connaissent pas encore de substances qui gèlent les thermomètres à ARN dans un état fermé.

Christian Twittenhoff a utilisé des composants cellulaires isolés du pathogène pour montrer quelle structure le thermomètre à ARN pour la toxine CnfY se trouve et où il se dissout. Le biologiste a créé un modèle qui documente l'ouverture du thermomètre. Il montre également comment le ribosome - le composant cellulaire sur lequel l'ARN messager est traduit en protéines - s'arrête à l'ARN messager.

Les chercheurs ont démontré le rôle du thermomètre à ARN dans le processus de la maladie. Ils ont infecté des souris avec Yersinia qui avaient soit un ARN fonctionnel, soit des thermomètres à ARN inactivés qui ne pouvaient pas se dissoudre à 37°C Les souches bactériennes avec des thermomètres à ARN modifiés n'ont pas pu rendre les souris malades.

Twittenhoff a comparé le gène de la toxine CnfY avec les gènes de toxine d'autres pathogènes en utilisant la bioinformatique. Les résultats suggèrent que d'autres gènes de toxines pourraient également être régulés par des thermomètres à ARN.

Un quart des pathogènes bactériens peut propager la résistance aux antibiotiques directement à leurs pairs

« Un quart des pathogènes bactériens peut propager la résistance aux antibiotiques directement à leurs pairs », source communiqué de Duke Univesrity.

Les antibiotiques n'affectent pas la vitesse à laquelle les pathogènes partagent les gènes de résistance.

Les ingénieurs biomédicaux de l'Université Duke ont démontré qu'au moins 25 pour cent des bactéries pathogènes résistantes aux antibiotiques retrouvées en milieu clinique sont capables de propager leur résistance directement à d'autres bactéries. Dans le même temps, l'étude montre que, malgré des croyances communes, l'utilisation d'antibiotiques n'affecte pas de manière significative la vitesse à laquelle les gènes responsables de la résistance sont échangés entre les bactéries.

Les chercheurs ont utilisé une nouvelle méthode à haut débit pour mesurer la vitesse à laquelle les bactéries échangent les paquets d'ADN qui confèrent une résistance. La vitesse et la capacité d'automatiser une grande partie du processus pourraient permettre de nouvelles informations sur les variables affectant les taux de transfert. De tels efforts pourraient aider les médecins à ralentir, voire inverser, la propagation de la résistance chez certains pathogènes humains.

Les résultats sont publiés en ligne le 24 janvier dans la revue Science Advances.

« Nos recherches antérieures ont montré que les antibiotiques n'affectent pas la vitesse à laquelle les bactéries propagent leur résistance directement à leur communauté avec des souches de laboratoire de E. coli », a déclaré Lingchong You, professeur de génie biomédical à Duke. « Mais nous voulions voir si cela est également vrai pour les souches cliniques de pathogènes qui existent réellement dans le monde. »

Chaque pathogène résistant aux antibiotiques porte une recette génétique pour sa résistance. Mais comme les cookies aux pépites de chocolat, toutes les recettes ne sont pas les mêmes, et toutes ne sont pas facilement enseignées aux autres. Une façon de transférer la résistance, cependant, est que cette recette génétique soit soigneusement écrite dans une sorte de livre partageable appelé plasmide, qui est ensuite capté et lu par une bactérie voisine via un processus appelé conjugaison.

Alors que la résistance aux antibiotiques se développe dans le monde, les scientifiques tentent de trouver un moyen de prévenir sa propagation. Mais parce que beaucoup d'antibiotiques proviennent de sources naturelles, il serait impossible d'éliminer complètement la résistance dans la nature, ce qui signifie qu'il y aura toujours des réservoirs de bactéries remplis de livres de recettes pour la résistance.

« Le vrai problème est donc la résistance qui se propage vers les pathogènes qui nuisent aux humains », a déclaré Jonathan Bethke, doctorant travaillant dans le laboratoire de You et premier auteur du nouvel article. « Nous cherchons à bien comprendre les facteurs qui affectent leur taux de conjugaison, car si vous pouvez ralentir suffisamment ce processus, les plasmides porteurs des gènes de résistance peuvent chuter d'une population. »

Une vidéo de bactéries rouges et vertes qui luttent pour se développer avant d'être envahies par des bactéries jaunes.

Ce film décrit le processus de base de la résistance aux antibiotiques se propageant par conjugaison de plasmides, autrement connu sous le nom de transfert de gène horizontal. Deux souches de bactéries sont cultivées ensemble pendant quatre heures. Une souche apparaît rouge et porte une résistance à un type d'antibiotique, tandis que l'autre porte des gènes mobiles qui apparaissent verts et offrent une résistance à un autre antibiotique. Après l'application des deux antibiotiques, les bactéries rouges qui ont reçu les gènes de résistance verts apparaissent en jaune et prennent le relais de la culture car elles sont résistantes aux deux antibiotiques.

Un défi majeur pour y parvenir, cependant, est la méthode classique de mesure du taux de conjugaison plasmidique. En plus d'être exigeants en main-d'œuvre, les chercheurs doivent attendre 16 heures pour qu'une nouvelle génération de bactéries se développe dans des boîtes de Petri avant d'obtenir les résultats. Cette restriction rend cette approche difficile à utiliser lorsqu'il s'agit de centaines de souches bactériennes et de dizaines de variables modifiables.

Plutôt que de prendre des années pour terminer l'expérience, Bethke et Allison Lopatkin, une ancienne étudiante diplômée du laboratoire You qui est maintenant professeur adjoint au Barnard College, ont développé une méthode qui utilise des machines automatisées et ne prend que cinq heures pour fournir des résultats. Il s'agit de mélanger deux souches de bactéries: une souche donneuse résistante à un antibiotique qui peut être partagée par conjugaison plasmidique et une souche receveuse résistante à un antibiotique différent qui ne peut pas être partagée.

Après avoir laissé les souches se mélanger et que le processus de conjugaison des plasmides se déroule pendant un certain temps, le mélange bactérien est transféré dans des flacons contenant des nutriments et les deux antibiotiques. Cela favorise la croissance des bactéries receveuses qui ont reçu avec succès les plasmides du donneur pour la résistance tout en ralentissant la croissance de tous les autres. Les chercheurs attendent ensuite de voir combien de temps la nouvelle population avec une double résistance prend pour atteindre un certain seuil, ce qui indique combien de temps cela va mettre à commencer.

« Cette méthode ouvre la possibilité de tester de nombreux autres médicaments ou facteurs environnementaux pour voir comment ils influencent le taux de conjugaison des plasmides », a déclaré Bethke. « Cela nous permettra également de déterminer s'il existe une sorte de déterminant génétique qui joue un plus grand rôle en termes de taux de transfert. »

Vous et Bethke en collaboration avec Joshua Thaden, professeur adjoint de médecine à Duke, et Vance Fowler, professeur de médecine à Duke, pour obtenir 219 isolats cliniques de pathogènes - microbes retrouvés chez de vrais patients. Tous présentaient une résistance à la bêta-lactamase, la forme d'antibiotique la plus courante utilisée aujourd'hui. En mesurant le taux de conjugaison plasmidique avec et sans antibiotiques de la famillle des bêta-lactamases présents, ils ont montré que, à l'exception d'une valeur aberrante, ces antibiotiques n'augmentent pas le taux de partage de la résistance. Ils ont également découvert que plus de 25% des souches étudiées sont capables de partager leur résistance à des taux suffisamment rapides pour être détectés.

« Nous avons été surpris de découvrir qu'il était si haut », a déclaré You. « Et bien sûr, les antibiotiques favorisent la propagation de la résistance, mais notre étude indique que c'est principalement par le biais d'une dynamique de population sélective plutôt que par une augmentation du taux de conjugaison des plasmides. »

Les chercheurs ont également examiné comment de légères variations dans la génétique des plasmides de résistance eux-mêmes affectent leur taux de conjugaison. En collaboration avec le laboratoire de Minfeng Xiao au BGI Genomics à Shenzhen, en Chine, l'équipe a séquencé les plasmides et analysé leur ADN. Ils ont ensuite classé les plasmides en « groupes de mobilité » en fonction de la façon dont ils sautent entre les cellules et en « groupes d'incompatibilité » en fonction de la façon dont ils se répliquent. À la grande surprise des chercheurs, ils ont découvert que même s'il n'y avait que deux groupes de mobilité présents dans leur bibliothèque d'échantillons, aucun d'eux n'affectant le taux de conjugaison, il y avait sept groupes d'incompatibilité - et ils affectaient beaucoup le taux de conjugaison.

« Il s'agit d'une découverte préliminaire mais potentiellement importante car ces deux classifications sont génétiques, ce qui les rend faciles à identifier », a déclaré Bethke. « Si nous pouvons commencer à construire une bibliothèque de marqueurs génétiques qui indiquent quelle est la capacité d'un pathogène à propager sa résistance directement à ses voisins, alors nous pouvons commencer à faire de grandes prédictions sur des choses comme les réseaux de transfert de gènes horizontaux et peut-être commencer à comprendre comment les bactéries évoluent à travers ce processus dans son ensemble. »

« Une telle bibliothèque aurait également des implications directes sur la façon dont les médecins utilisent les antibiotiques sur le terrain », a déclaré You. « Cette connaissance aiderait les médecins à prendre des décisions spécifiques au patient sur l'opportunité ou non d'administrer des antibiotiques. »

La formation à la sécurité sanitaire des aliments peut améliorer les connaissances mais pas les comportements, selon une étude

Résumé

Une mauvaise manipulation des aliments chez des personnes travaillant en distribution et en restauration commerciale contribue fréquemment à des éclosions d’intoxications alimentaires.

Les interventions de formation et d’éducation en matière de sécurité des aliments sont des stratégies importantes pour améliorer les comportements et les précurseurs comportementaux (par exemple, les connaissances et les attitudes) des personnes manipulant les aliments dans ces établissements.

Nous avons effectué un examen systématique complet pour identifier, caractériser et synthétiser des études publiées dans ce domaine afin de déterminer l'efficacité globale de ces interventions.

La revue s'est concentrée sur des études expérimentales avec un groupe témoin indépendant. Les méthodes d’examen comprenaient une stratégie de recherche structurée, la sélection de résumés identifiés, la caractérisation des articles pertinents, l’estimation du risque de biais, l’extraction de données, la méta-analyse de l’efficacité des interventions pour quatre catégories de résultats (attitudes, connaissances, comportement et scores d’inspection des locaux destinés aux aliments), et une estimation de la qualité de la preuve.

Nous avons identifié 18 essais contrôlés randomisés (ECRs) et 29 essais non randomisés pertinents. Parmi les ECRs, 25 (64%) résultats uniques ont été considérés comme présentant un risque élevé de biais, principalement en raison de préoccupations liées aux méthodes de mesure des résultats, tandis que 45 (98%) résultats d'essais non randomisés ont été classés en tant que risque grave de biais, principalement en raison de facteurs de confusion.

Une confiance élevée a été identifiée pour l'effet des interventions de formation et d'éducation visant à améliorer les connaissances des manipulateurs d'aliments dans huit études d'ECRs (différence moyenne standardisée = 0,92; intervalle de confiance à 95%: 0,03, 1,81; I² = 86%).

Pour tous les autres résultats, aucun effet significatif n'a été identifié. En revanche, les essais non randomisés ont identifié un effet d'intervention positif statistiquement significatif pour tous les types de résultats, mais la confiance dans ces résultats était très faible en raison de la confusion possible et d'autres biais.

Les résultats indiquent que les interventions en matière de formation et d’éducation en matière de sécurité sanitaire des aliments sont efficaces pour améliorer les connaissances des personnes manipulant des aliments, mais il faut davantage de preuves sur les stratégies visant à améliorer le changement de comportement.

Référence

Effectiveness of food handler training and education interventions: A systematic review and analysis

Journal of Food Protection vol. 82 no. 10

Ian Young, Judy Greig, Barbara J. Wilhelm, and Lisa A. Waddell, https://doi.org/10.4315/0362-028X.JFP-19-108

NB : Merci à Doug Powell du barfblog de m'avoir signalé cet article.