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mardi 15 novembre 2022

Attention aux plastiques !

Le dernier numéro de Microcosm, le magazine numérique réservé aux membres de l'American Society for Microbiology (ASM), sort le 18 novembre ! En attendant, le numéro du printemps 2022 est en accès libre.  

Le thème de ce nouveau numéro est «Water Microbiology : Bringing microbes to the surface» (Microbiologie de l'eau : Faire remonter les microbes à la surface).

Voic un article parmi d’autres et qui s’intitule «Beware the plastics» (Attention aux plastiques) par Geoff Hunt, qui est responsable du programme de sensibilisation du public à l'American Society for Microbiology.

Nous vivons dans un monde de plastique. Plus de 400 millions de tonnes de matières, utilisées dans des matériaux allant des emballages aux dispositifs médicaux en passant par les pièces automobiles, sont désormais produites chaque année. Cette quantité stupéfiante de pollution a un impact délétère sur l'environnement, les chaînes alimentaires, la prévention des maladies et l'économie mondiale. Le plastique est un danger pour la santé des animaux marins, une toxine potentielle pour les humains et une présence perturbatrice pour le commerce maritime. Quel rôle la communauté de la microbiologie peut-elle jouer pour aider à améliorer et finalement résoudre ce défi ?

Combien en faut-il?
Moins de 10% des matières plastiques finissent par être recyclées. Le reste est soit dans des décharges à travers le monde, soit encombre les environnements marins de la planète. Les plastiques se décomposent par plusieurs voies, y compris la décomposition physique, les réactions chimiques et la biodégradation par les microbes. Au fur et à mesure que le plastique se dégrade et se décompose sur terre, il finit par se retrouver dans les flux de déchets et les eaux souterraines, avant d'être transporté par les rivières vers les océans du monde. Le plastique a été signalé pour la première fois dans les océans en 1972 ; 50 ans plus tard, la quantité de plastique entrant dans la mer est estimée entre 5 et 13 millions de tonnes métriques par an.

L'attention générale liée à la pollution plastique marine a tendance à se concentrer sur les «îlots de déchets» visibles. L'exemple le plus notoire est le «Great Pacific Garbage Patch» (GPGP), situé dans l'océan Pacifique et dont la taille (et la croissance) est estimée à environ 1,6 million de km2. Cependant, ces poches observables ne font qu'effleurer la surface du problème. Des études estiment qu'à peine 0,5 % du plastique aqueux se trouve à la surface de l'océan. Tout comme un iceberg, le volume en vrac se trouve soit sous la surface, soit s'est sédimenté au fond de l'océan.

Assez effrayant, toutes ces estimations, qui sous-estiment sûrement la véritable ampleur du problème, ne tiennent pas non plus compte des microplastiques, des particules de plastique de moins de 5 millimètres de diamètre. Générés principalement par la fragmentation et la décomposition d'articles en vrac comme les bouteilles d'eau, les sacs en plastique et les pneus d'automobile, ces polluants invisibles sont exponentiellement plus difficiles à détecter et à éliminer en raison de leur petite taille.

Micro-problèmes
Les microplastiques dans l'océan créent également des surfaces artificielles auxquelles les microbes peuvent s'adsorber. Les chercheurs s'efforcent de caractériser la nature de ces interactions, et les résultats sont loin d'être concluants. Plusieurs rapports ont montré que différents types de surfaces microplastiques aqueuses attirent différentes espèces microbiennes, avec des colonies microbiennes distinctes se trouvant entre les surfaces en polyéthylène, polystyrène et polypropylène.

D'autres recherches montrent soit aucun effet de la composition microplastique sur la composition de la communauté microbienne adhérente, soit attribuent des effets à la morphologie microplastique plutôt qu'à la composition. Dans certaines études, une signature microbienne géographique distincte a été observée en fonction de l'endroit où les échantillons de microplastiques ont été collectés ; dans d'autres, aucune différence n'a été signalée dans la composition de la surface microbienne adhérente entre les différents sites d'échantillonnage.

Une question peut-être plus importante est la suivante : que font les microbes sur ces surfaces microplastiques ? Une préoccupation croissante au sein de la communauté scientifique est que les microplastiques trouvés dans les plans d'eau peuvent fournir de nouvelles plateformes pour la formation de biofilms. Malheureusement, cette peur semble se jouer. Un rapport récent a démontré que les bactéries se rassemblant sur les microplastiques aquatiques se livraient à des quantités accrues de transferts horizontaux de gènes par rapport aux bactéries libres ou aux microbes se rassemblant sur les surfaces naturelles. L'implication évidente, sur laquelle spéculent les auteurs, est que ce comportement conduira à une propagation accrue des gènes de résistance aux antimicrobiens (RAM), déjà un défi majeur relevé par la communauté de la microbiologie.

Comment répondre ?
Avec autant d'acteurs différents et des résultats aussi variables provenant du monde entier, une première étape cruciale pour le domaine serait de s'entendre sur des méthodologies communes qui pourraient être utilisées pour mener des expériences sur le comportement microbien lié aux plastiques. Comme le souligne la Dr Nicole Fahrenfeld, professeur agrégé de génie civil et environnemental à l'Université Rutgers, «si nous avons un contaminant (c'est-à-dire un microplastique) qui peut se déplacer vers tous ces différents endroits, il serait utile de avoir des normes universelles afin de collecter des informations à travers le monde.

Malheureusement, selon Fahrenfeld, «les méthodes d'échantillonnage et d'analyse des microplastiques eux-mêmes sont encore en développement». Étant donné que les méthodes actuelles de surveillance, d'étude et de notification de ces phénomènes ne sont pas cohérentes d'un lieu et d'une institution à l'autre, «il existe un assez large éventail d'informations dans les bases de données sur l'occurrence des microplastiques», a dit Fahrenfeld.

Le simple fait d'améliorer les efforts de communication ne suffira pas. La lutte contre la propagation de la RAM induite par les microplastiques nécessitera d'aller au-delà des efforts actuels de recherche de nouveaux antibiotiques. Le sentiment d'urgence qui se profile autour de cette question aux multiples facettes suggère la nécessité d'une approche plus radicale. Une idée est d'expérimenter le déploiement sélectif de microbes génétiquement modifiés qui pourraient potentiellement supplanter les organismes pathogènes.

Elise Phillips, chercheuse à l'Université du Tennessee à Knoxville, suggère de «passer à l'application réelle des connaissances» sur les organismes responsables de la propagation des gènes de la RAM, en particulier ceux retrouvés adsorbés sur les microplastiques. «Comment», a-t-elle demandé, «utilisons-nous ces communautés ou les modifions-nous de manière à nous aider à résoudre le problème» de la propagation de la RAM induite par les microplastiques ? Phillips suggère que les chercheurs étudient cette piste d'enquête comme un moyen de lancer la recherche de solutions potentielles.

Mettre les microbes au travail
De telles approches radicales de résolution de problèmes ont déjà lieu dans d'autres domaines et visent à éliminer le plastique qui existe déjà tout en minimisant (ou en modifiant) la production de nouveaux produits en plastique. Une grande partie de la recherche se concentre actuellement sur la caractérisation et l'application d'enzymes microbiennes pour décomposer les plastiques, en particulier le polyéthylène téréphtalate (PET) largement utilisé. Par exemple, un rapport de 2016 par des chercheurs au Japon a identifié deux enzymes, la PETase et la MHETase, capables de décomposer le PET en molécules pouvant être métabolisées par différents microbes.
Cependant, la dégradation microbienne des plastiques, qui dépend d'une grande variété de facteurs biologiques, chimiques et environnementaux, est très variable en termes d'efficacité. Le simple fait de permettre à ce processus de se dérouler naturellement ne supprimera pas la pollution plastique à une échelle ou sur une période de temps qui permettrait aux humains de poursuivre leur mode de vie. Au lieu de cela, les microbiologistes travaillent dur pour trouver des moyens de faire passer ce processus à la vitesse supérieure. Les chercheurs intensifient leurs efforts pour identifier des microbes jusque-là inconnus et de nouvelles enzymes qui peuvent contribuer au processus de biodégradation. Pendant ce temps, d'autres scientifiques utilisent l'apprentissage automatique pour concevoir de nouvelles enzymes de biodégradation qui peuvent être déployées à grande échelle.
Accélérer les choses
Malheureusement, la science évolue lentement et ses découvertes et solutions ont tendance à avoir une portée limitée au-delà de la communauté scientifique sans interventions externes. C'est là que la politique entre en jeu. L'adoption de politiques fondées sur la science, que ce soit au niveau local, national ou international, peut avoir un impact significatif en sensibilisant la masse à un problème et en effectuant rapidement des changements à grande échelle.

Un exemple de politique simple, mais efficace, qui a eu un impact énorme sur la pollution plastique a été la mise en œuvre de lois fiscales sur les sacs en plastique. Les municipalités du monde entier ont institué des réglementations qui facturent aux consommateurs un montant nominal (généralement de l'ordre de 0,05 $ à 0,10 $) pour chaque sac en plastique qu'ils utilisent lors de leurs achats. Bien que le coût soit faible, la simple pensée de devoir payer pour un sac est apparemment suffisante pour induire un changement de comportement généralisé. Des études indiquent que les taxes adoptées à Chicago ont entraîné une réduction de 30 % de l'utilisation des sacs en plastique, tandis qu'une politique similaire adoptée dans le comté de Montgomery, dans le Maryland, a entraîné une baisse de 42 %. D'autres recherches montrent que la mise en place de taxes sur les sacs est corrélée à une diminution significative du volume de sacs en plastique collectés des voies navigables municipales, ce qui donne à penser que les taxes fonctionnent comme prévu.

Un changement de politique de haut niveau est également en cours. En mars 2022, les Nations Unies ont annoncé que 175 pays travailleront à l'élaboration d'un accord juridiquement contraignant pour mettre fin à la pollution plastique. Les signataires chercheront à promouvoir la production et la consommation durables de plastiques, à améliorer le développement d'outils complets de mesure et de rapport sur la pollution plastique et à mettre en œuvre des efforts d'éducation et de sensibilisation aux niveaux national et international. De tels accords internationaux ont fonctionné dans le passé. Le modèle le plus notable (et le plus réussi) est le Protocole de Montréal de 1987, qui a défini des mesures concrètes, telles que l'élimination progressive de l'utilisation des hydrochlorofluorocarbures, qui ont mis la planète sur la bonne voie pour avoir une couche d'ozone entièrement restaurée d'ici 2050.

En dehors du laboratoire et au-delà de l'arène politique, les microbiologistes peuvent contribuer par leurs actions personnelles. Les étapes potentielles comprennent l'utilisation de moins de produits en plastique, en veillant à recycler lorsque cela est possible et en participant à des journées de nettoyage qui éliminent les déchets de l'environnement et empêchent les plastiques de pénétrer dans l'approvisionnement en eau en premier lieu.

Nettoyer le problème du plastique de la Terre peut sembler insoluble, mais des solutions réalisables sont à portée de main, en particulier à travers le prisme de la recherche microbiologique. Les membres de la communauté de la microbiologie ont la capacité et la responsabilité de faire leur part en tant que scientifiques et en tant que citoyens pour relever et finalement surmonter le défi de la pollution plastique.

lundi 4 juillet 2022

Plastiques et micro-organismes.

Deux articles parus dans ASM News traitent des plastiques et des micro-organismes.

1. «Le prétraitement chimique déconstructif accélère la décomposition microbienne des plastiques», source ASM News.

Selon des chercheurs de la Michigan Technological University, un prétraitement chimiques qui déconstruit certains types de plastiques peut aider les communautés microbiennes naturelles à décomposer plus rapidement les déchets plastiques. L’étude a été présentée à ASM Microbe, la réunion annuelle de l'American Society for Microbiology, le 12 juin 2022 à Washington D.C.

Les composés dérivés de la déconstruction chimique du polyéthylène téréphtalate (PET) ou des plastiques polycarbonate ou de la pyrolyse du plastique polyéthylène haute densité (HDPE) peuvent soutenir avec succès la croissance. Les génomes des communautés microbiennes dérivées de plusieurs sols montrent que ces organismes sont capables de dégrader des composés carbonés complexes, tels que ceux que l'on trouve dans l'essence, le pétrole et les plastiques. La décomposition du plastique avec un prétraitement chimique rend le carbone, l'oxygène et l'hydrogène de la structure moléculaire du plastique plus accessibles aux bactéries pour les utiliser comme nutriments.

«Les bactéries se développent rapidement avec ce régime de plastiques déconstruits et fabriquent plus de cellules bactériennes, décomposant efficacement le plastique. Nous pouvons utiliser ces communautés bactériennes nourries de plastique pour créer du lubrifiant et même de la poudre de protéines, transformant véritablement les déchets en trésor tout en résolvant le problème des déchets plastiques», a dit le Dr Stephen Techtmann, professeur de sciences biologiques à Michigan Tech.

Selon le Programme environnemental des Nations-Unies, sur les 6,3 milliards de tonnes de plastique fabriquées chaque année, 79% s'accumulent dans les décharges. D'ici 2050, les déchets plastiques auront triplé, mettant des dizaines ou des milliers d'années à se dégrader. Les chercheurs ont démontré que des méthodes de dégradation chimiques et biologiques combinées peuvent être utilisées pour dégrader efficacement plusieurs types de plastique sur une période relativement courte et peuvent constituer une future voie pour gérer les déchets plastiques qui s'accumulent rapidement.

«Ces résultats ont soutenu notre hypothèse selon laquelle l'environnement naturel est un réservoir inexploité de micro-organismes capables de dégrader les éléments constitutifs du plastique, et que les communautés microbiennes mixtes peuvent simultanément dégrader les intrants de déchets plastiques mixtes», a dit Lindsay Putman, postdoc au département de sciences biologiques. à Michigan Tech, qui a conçu et dirigé l'étude.

2. «La pollution plastique dans l'océan peut héberger de nouveaux antibiotiques, selon une étude», source ASM News.

La pollution plastique dans l'océan pourrait servir de source de nouveaux antibiotiques, selon une nouvelle étude menée par des étudiants en collaboration avec la Scripps Institution of Oceanography. L’étude a été présentée à la conférence de l'American Society for Microbiology à Washington, D.C. du 9 au 13 juin 2022.

Les scientifiques estiment qu'entre 5 et 13 millions de tonnes métriques de pollution plastique pénètrent dans les océans chaque année, allant des gros débris flottants aux microplastiques sur lesquels les microbes peuvent former des écosystèmes entiers. Les débris plastiques sont riches en biomasse et pourraient donc être un bon candidat pour la production d'antibiotiques, qui a tendance à se produire dans des environnements naturels hautement compétitifs.

Pour explorer le potentiel de la plastisphère en tant que source de nouveaux antibiotiques, les chercheurs ont modifié l'approche scientifique citoyenne Tiny Earth (développée par le Dr Jo Handelsman) aux conditions marines. Les chercheurs ont incubé du plastique polyéthylène haute et basse densité (le type couramment observé dans les sachets dans les magasins) dans l'eau près de Scripps Pier à La Jolla, Californie, pendant 90 jours.

Les chercheurs ont isolé 5 bactéries productrices d'antibiotiques à partir de plastique océanique, y compris des souches de Bacillus, Phaeobacter et Vibrio. Ils ont testé les isolats bactériens contre une variété de cibles Gram positif et négatif, trouvant que les isolats sont efficaces contre les bactéries couramment utilisées ainsi que contre deux souches résistantes aux antibiotiques.

«Compte tenu de la crise actuelle des antibiotiques et de la montée des superbactéries, il est essentiel de rechercher des sources alternatives de nouveaux antibiotiques», a dit l'auteur principal de l'étude, Andrea Price, de la National University. «Nous espérons étendre ce projet et caractériser davantage les microbes et les antibiotiques qu'ils produisent.»

Aux lecteurs du blog
La revue PROCESS Alimentaire censure pour une triste question d’argent les 10 052 articles initialement publiés gracieusement par mes soins de 2009 à 2017 sur le blog de la revue, alors que la revue a bénéficié de la manne de la publicité faite lors de la diffusion de ces articles. La revue PROCESS Alimentaire a censuré le blog et refuse tout assouplissement. Derrière cette revue, il faut que vous le sachiez, il y a une direction aux éditions du Boisbaudry, pleine de mépris, et un rédacteur en chef complice !

mercredi 26 mai 2021

Le plastique et les vagues

«Le plastique flottant de l'océan peut améliorer son transport induit par les vagues en raison de sa taille», source Université d'Oxford.

La pollution plastique et les autres débris océaniques sont un problème environnemental mondial complexe. On estime que chaque année, dix millions de tonnes de plastique sont mal gérées, entraînant une entrée dans l'océan, dont la moitié flottera dans un premier temps. Pourtant, on ne trouve que 0,3 million de tonnes de plastique flottant à la surface de l'océan. 

Où est passé le reste du plastique?

Les principaux mécanismes du transport du plastique sont les courants, le vent et les vagues. Les courants et le vent transportent les débris océaniques d'une manière simple comme les forces sur un voilier. Cependant, les vagues océaniques déplacent principalement les objets sur des orbites circulaires. Les orbites ne se ferment pas tout à fait, ce qui entraîne une soi-disant dérive de Stokes dans la direction dans laquelle les vagues se déplacent.

Une équipe conjointe des universités d’Oxford, de Plymouth, d’Édimbourg, d’Auckland et de TU Delft a étudié la manière dont les vagues transportent les débris océaniques flottants tout en incluant, pour la première fois, les effets de la taille, de la flottabilité et de l’inertie d’un objet sur son transport. Leurs résultats sont publiés dans The Journal of Fluid Mechanics.

Le Dr Ross Calvert du Département des sciences de l’ingénierie de l’Université d’Oxford et ses co-auteurs ont découvert que les plus gros débris flottants océaniques peuvent être transportés à un rythme plus rapide que la dérive de Stokes en raison des effets d’inertie.

Il a été démontré que la dérive de Stokes induite par les vagues est importante pour le mouvement des débris océaniques vers la côte, ce qui entraîne un échouage plastique, qui peut être l'endroit où se trouve une partie de la pollution plastique non comptabilisée. Il a également été démontré qu'elle augmentait la pollution plastique transportée vers les régions polaires.

De très petits objets traceront exactement ce que fait l'eau et sont ainsi transportés avec la dérive exacte de Stokes.

Le Dr Calvert a déclaré: «Les objets plus gros étant transportés plus rapidement que les objets plus petits étaient un résultat peu intuitif. Nous nous attendions à ce que l'inertie réduise la vitesse à laquelle les débris flottants étaient transportés dans les vagues, comme le vent et les courants. Après avoir vérifié nos résultats expérimentalement et numériquement, nous avons ensuite découvert les mécanismes par lesquels ces objets inertiels se déplaçaient plus vite que l'eau qui les entourait.»

Après avoir observé que les plus grosses sphères en plastique flottantes étaient transportées plus rapidement que les plus petites dans le réservoir à vagues COAST de l'Université de Plymouth, l'équipe a développé un modèle pour approfondir le résultat.

Grâce à ce modèle, qui incluait la gravité, la flottabilité, la traînée et les forces de masse ajoutée dans un système de coordonnées qui tournait et se traduisait avec l'onde, ils ont constaté que la taille de l'objet par rapport à la longueur d'onde était le facteur prédominant pour un changement de transport, avec un secondaire. effet de la densité de l'objet.

Le professeur Ton van den Bremer de l'Université d'Oxford et TU Delft, qui a dirigé la recherche, a déclaré: «Bien que toute personne marchant sur la plage sache que les vagues transportent des débris flottants vers le rivage, la vitesse à laquelle elles le font dépend de nombreux facteurs existants. les modèles, qui sont très simplifiés, ignorent. Des exemples de tels facteurs sont la rupture des vagues et la taille des débris flottants. Cette recherche fournit un fondement théorique à ce dernier.»

Cette recherche est le début pour comprendre les mécanismes d'une augmentation de la dérive induite par les vagues. Une étude plus approfondie de l'effet de la forme des objets, y compris le canal des vagues et des tests numériques de débris océaniques idéalisés et réels, est en cours.

La recherche a été soutenue par la Royal Academy of Engineering.

jeudi 3 septembre 2020

L'empreinte généralisée des microfibres du blue jean


L'empreinte généralisée des microfibres du blue jean, source ACSNews.

«The Widespread Environmental Footprint of Indigo Denim Microfibers from Blue Jeans », Environmental Science & Technology Letters. (L'empreinte environnementale généralisée des microfibres du denim indigo des Blue Jeans)

Avec de nombreuses personnes travaillant à domicile pendant la pandémie de COVID-19, le blue jean est un choix de vêtement plus populaire que jamais. Mais la plupart des gens ne pensent pas aux restes microscopiques de leurs jeans confortables et autres vêtements qui sont diffusés lors du lavage. À présent, des chercheurs ont publié un article dans Environmental Science & Technology Letters de l’ACS ont détecté des microfibres de denim indigo non seulement dans les effluents d’eaux usées, mais également dans les lacs et les sédiments marins éloignés de l’Arctique.

Au cours des 100 dernières années, la popularité des jeans en denim a énormément augmenté, de nombreuses personnes portant ce type de vêtements presque tous les jours. Des études ont montré que le lavage du denim et d'autres tissus libère des microfibres, de minuscules particules allongées, dans les eaux usées. Bien que la plupart des microfibres soient éliminées par les usines de traitement des eaux usées, certaines pourraient encore pénétrer dans l'environnement par rejet d'eaux usées, également appelées effluents. Le denim du blue jean est composé de fibres de coton cellulose naturelles, traitées avec un colorant indigo synthétique et d'autres additifs chimiques pour améliorer les performances et la durabilité. Miriam Diamond, Samantha Athey et leurs collègues se sont demandés si les blue-jeans étaient une source majeure de microfibres de cellulose anthropiques pour l'environnement aquatique.

Les chercheurs ont utilisé une combinaison de microscopie et de spectroscopie Raman pour identifier et compter les microfibres de denim indigo dans divers échantillons d'eau prélevés au Canada. Le denim indigo constituait respectivement 23, 12 et 20% de toutes les microfibres des sédiments des Grands Lacs, des lacs de banlieue peu profonds près de Toronto, au Canada, et de l'archipel arctique canadien. Malgré une abondance élevée de microfibres de denim dans les sédiments des Grands Lacs, l'équipe n'a détecté qu'une seule microfibre de denim dans le tube digestif d'un type de poisson appelé l'éperlan arc-en-ciel. Sur la base des niveaux de microfibres retrouvés dans les effluents d'eaux usées, les chercheurs ont estimé que les usines de traitement des eaux usées de l'étude rejetaient environ 1 milliard de microfibres de denim indigo par jour. Lors d'expériences de blanchissage, les chercheurs ont découvert qu'une seule paire de jeans usagés pouvait libérer environ 50 000 microfibres par cycle de lavage. Bien que l'équipe ne connaisse pas les effets, le cas échéant, des microfibres sur la vie aquatique, un moyen pratique de réduire la pollution par les microfibres de denim serait que les consommateurs lavent leurs jeans moins fréquemment, disent-ils. De plus, trouver des microfibres dans les blue-jeans dans l’Arctique est un puissant indicateur de l’impact des humains sur l’environnement, ajoutent les chercheurs.
Lire le communiqué de l’Académie nationale de médecine : Masquez-vous, masquez-vous, masquez-vous

dimanche 16 août 2020

Les contaminants retrouvés dans les huîtres pourraient laisser présager un problème environnemental et de sécurité des aliments plus important, selon une étude


« Les contaminants retrouvés dans les huîtres pourraient laisser présager un problème environnemental et de sécurité des aliments plus important », source article de Mark Godfrey paru dans SeafoodSource.

Une nouvelle étude suggère que la contamination des parcs à huîtres par des plastiques, de la peinture et des préparations pour nourrissons d'Asie pourrait révéler un risque émergent plus important pour la santé publique mondiale.

Des scientifiques de l'Université de Californie à Irvine, en collaboration avec Environmental Defence Fund, Cornell University et Australia's University of Queensland, ont trouvé des traces de plastique, de kérosène, de peinture, de talc et des compléments de lait en poudre dans les lits de l'est de la mer d'Andaman au Myanmar.

Les scientifiques ont retrouvé des agents pathogènes et des microplastiques similaires dans certains mollusques cultivés dans les eaux américaines.

Leur étude, Coastal urbanization influences human pathogens and microdebris contamination in seafood ou L'urbanisation côtière influence les agents pathogènes humains et la contamination par des microdébris dans les produits de la mer, publiée le 30 juillet, a été menée dans l'est de la mer d'Andaman au Myanmar avec l'aide de chercheurs locaux dans la région rurale de Tanintharyi. En utilisant une technologie de pointe pour examiner les contaminants dans les huîtres, les chercheurs ont conclu que l'urbanisation dans les zones côtières et le manque de traitement des eaux usées entraînent une contamination des fruits de mer, ce qui présente des risques potentiels pour la santé humaine.

Les scientifiques ont concentré leurs efforts de recherche sur neuf récifs coralliens au large de l'archipel de Mergui au Myanmar, situé à environ 64 km de Myeik, une ville d'environ 250 000 habitants. En utilisant le séquençage de l'ADN, les chercheurs ont découvert 5 459 agents pathogènes humains potentiels liés à 87 espèces de bactéries tout en recherchant des contaminants dans l'eau de mer et dans les huîtres. Plus de la moitié des agents pathogènes examinés seraient dangereux pour la santé des personnes, ont-ils conclu.

De plus, en utilisant la spectroscopie infrarouge, les scientifiques ont découvert 78 types de matériaux contaminants dans les huîtres qu'ils ont étudiées, sur les 1 225 microdébris individuels examinés.

« Alors que 48% des microparticules étaient des microplastiques - une constatation représentative dans de nombreux écosystèmes océaniques - de nombreuses autres particules n'étaient pas en plastique et provenaient d'une variété de matériaux d'origine humaine qui sont des constituants de carburants, de peintures et de cosmétiques », selon Joleah Lamb de l’UC Irvine, l'un des principaux auteurs de l'étude, dans un communiqué de presse. « Nous avons été particulièrement surpris de trouver trois marques différentes de formule de lait en poudre, qui correspondaient à 14 pour cent des contaminants microdebris. »

Outre les bactéries pathogènes humaines, la contamination des microplastiques et d'autres types de microparticules détectées dans les fruits de mer pourrait avoir des effets négatifs à la fois sur l'environnement et la santé humaine. Plusieurs particules de plastique peuvent contenir des toxines, qui peuvent être ingérées par les humains via les fruits de mer prélevés dans l'océan.

« L'absorption de microplastiques dans l'environnement marin pourrait avoir des conséquences de grande portée sur la consommation humaine de fruits de mer et peut constituer un risque émergent pour la santé publique dans le monde », indique l'étude.

Plus de la moitié des microdébris contaminants retrouvés dans les tissus des huîtres du Myanmar étaient formés de matériaux non polymères, tels que le kérosène, la saponine et le talc, dont l’ingestion peut nuire à la santé des personnes.

« Cette étude est importante dans ses implications mondiales. Il existe des preuves solides de la transférabilité des résultats du Myanmar à d'autres sources de produits de la mer à travers le monde », a dit Douglas Rader, scientifique en chef du programme EDF Oceans et collaborateur de l'étude. « Cela montre également clairement la nécessité d'une meilleure science liée aux impacts potentiels de ces contaminants, et la nécessité de meilleurs programmes de test afin que les consommateurs de fruits de mer puissent compter sur sa salubrité. »

Avec une part importante des exportations de produits de la mer provenant des pays en développement, l'étude suscitera l'inquiétude des entreprises d'approvisionnement et des consommateurs. La gestion des déchets ayant du mal à suivre l'urbanisation rapide dans les pays en développement, de meilleurs programmes d’analyses seront nécessaires pour que les consommateurs puissent avoir l'assurance que les fruits de mer qu'ils consomment sont exempts de contamination qui pourrait être dangereuses pour leur santé, a dit Rader.

« Nous n’avons pas fait cela spécifiquement pour enquêter sur le Myanmar - par rapport à d’autres endroits - mais comme un nouveau travail dans le cadre d’une étude plus large des impacts sur le milieu marin du Myanmar, y compris ses pêcheries », explique Rader. « Je m'attendrais pleinement à des résultats similaires dans toute l'Asie et dans beaucoup sinon la plupart des régions du monde. »

Rader a expliqué comment de grands volumes de fruits de mer sont expédiés du Myanmar vers la Chine et d'autres pays de transformation, puis se rendent dans de nombreux autres endroits dans le monde.

« À titre d'exemple, la langouste, les crabes de boue, les crevettes grimpantes et de nombreux poissons se déplacent de cette région du Myanmar vers les chaînes de valeur chinoises », a dit Rader. Il a souligné une énorme installation de «rejet» pour les crabes de boue à Myeik, qui s'approvisionnent dans les zones côtières sur de nombreux kilomètres à la ronde pour l'exportation vers la Chine et ailleurs.

Les contaminants retrouvés dans cette étude indiquent que même l'archipel de Mergui, dans une grande partie rurale du Myanmar, a une pollution importante et généralisée due au ruissellement de déchets agricoles et humains qui peuvent affecter les sources de nourriture en aval comme les parcs à huîtres.

Les auteurs de l’étude ont dit qu’ils craignaient que l’absorption de microplastiques dans le milieu marin pourraient avoir des conséquences importantes sur la consommation humaine de fruits de mer. Les agents pathogènes rencontrés dans l'étude comprennent une longue liste de contaminants qui peuvent rendre les humains malades avec une exposition suffisante. Par exemple, Clostridium perfringens est parmi les agents responsables les plus importants d’«intoxications alimentaires», tandis que Collinsella aerofaciens contribue à toute une série de problèmes du système digestif, y compris le syndrome du côlon irritable.

Coxiella burnetii est responsable de la «fièvre Q», qui ressemble à la grippe dans les cas bénins, mais qui peut être mortelle.

« En fait, les maladies diarrhéiques prises ensemble sont parmi les causes les plus importantes de mortalité prématurée, dans le monde, représentant environ 1,6 million de décès par an - dont plus d'un demi-million d'enfants de moins de cinq ans », a dit Rader. « Ainsi, la contamination du système alimentaire est un gros problème. »

Il faut beaucoup plus de recherche scientifique pour comprendre les risques.

« À mon avis, l'étude souligne un besoin plus général de comprendre tout ce que les filtreurs accumulent, et ce que cela signifie pour la santé des écosystèmes et la santé des consommateurs humains, à la fois dans les pays producteurs de fruits de mer et dans les chaînes de valeur », dit Rader. « [Il y a] un besoin clair d'améliorer ce que nous savons dans ce domaine en développement - dans quelle mesure ces problèmes sont-ils généraux et que signifient-ils? Il y a [aussi] clairement un besoin pour un meilleur suivi des chaînes d'approvisionnement de fruits de mer à travers le monde, et bien sûr pour des systèmes améliorés de collecte et de traitement des eaux usées, des systèmes de gestion des déchets pour les plastiques, des réductions des plastiques à usage unique, puis une gestion de la contamination au niveau des bassins versants en motifs de source de fruits de mer. »

L'Asie devenant une source de plus en plus grande d'approvisionnement mondial en fruits de mer, il y a « de nombreuses raisons pour que les pays consommateurs s'associent aux pays sources pour protéger les personnes qui consomment des fruits de mer ici et là, a dit Rader, un sentiment repris par le chercheur en postdoc, Raechel Littman, auteur principal de l'étude.

« Il est important de garder à l’esprit qu’une grande partie de nos fruits de mer est importée d’outre-mer, d’endroits susceptibles d’être contaminés, ce qui souligne l’importance de tests adéquats et d’améliorations de la qualité des eaux côtières dans le monde entier », a dit Littman.
Lire le communiqué de l’Académie nationale de médecine : Masquez-vous, masquez-vous, masquez-vous

jeudi 29 août 2019

L’intoxication à la ciguatera causée par des poissons est en train de devenir un risque croissant en Europe


Des filets de red snapper du Vietnam avaient causé une intoxication à la ciguatera
chez 11 personnes en Allemagne en 2017.
« L’intoxication à la ciguatera causée par des poissons est en train de devenir un risque croissant en Europe », selon la source FoodNavigator. Extraits.

L’intoxication par la ciguatera devient un risque croissant en Europe avec une augmentation de 60% des cas liés à la ciguatoxine au cours de la dernière décennie, selon l’AESAN (Agence espagnole de sécurité alimentaire et de nutrition).

S'exprimant lors de la conférence FSAI (Food Safety Authority of Ireland) à Dublin (21-22 août) à l'occasion de son 20e anniversaire, AnaCanals, de l'AESAN, a évoqué l'avancement du ‘EuroCigua project’ d’une durée de quatre ans avec l'EFSA (European Food Safety Authority), composée de 15 organisations européennes appartenant à six États membres participants (Espagne, Portugal, France, Allemagne, Grèce et Chypre), qui étudie la caractérisation des risques d'intoxication alimentaire à la ciguatera en Europe, qui sera terminé pour septembre 2020.

La maladie transmise par les poissons est généralement causée par la consommation de poissons ayant accumulé des ciguatoxines dans leur sang, produits par certaines cellules de microalgues (Gambierdiscus).

Les consommateurs qui consomment du poisson infecté peuvent présenter divers symptômes, notamment des effets gastro-intestinaux, cardiovasculaires et neurologiques.

Alors que les cas de ciguatera touchaient des régions tropicales et subtropicales du monde, l’Espagne et le Portugal ont signalé des foyers d’empoisonnement à la ciguatoxine aux îles Canaries et à Madère depuis 2008. En Allemagne également, il y a eu au moins un foyer de ciguatera concernant près de 20 personnes et ce type de foyer se reproduit chaque année depuis 2012.

Canals a déclaré qu'il travaillait à sensibiliser les États membres et les consommateurs à la maladie, car c'est le seul moyen de l'enregistrer. Un élément important du projet est la prévention de la ciguatera, où les experts ont créé un dépliant contenant des recommandations pour réduire le risque d’intoxication alimentaire dans les régions touchées.

« L’intoxication à la ciguatera est un problème mondial et les épidémies sont en augmentation en Europe et plus précisément, la ciguatoxine a augmenté de 60% au cours de la dernière décennie. Il est difficile de constituer un matériau de référence car la concentration de ciguatoxine chez les poissons frais est très faible, vous ne pouvez pas le nettoyer et elle peut être présente sur le foie et les organes », a-t-elle déclaré.

Jusqu'à présent, le projet a conclu qu'il existe un certain nombre de facteurs contributifs, notamment le changement climatique et les marchés mondialisés, mais que la maladie nécessite davantage de recherche pour développer des matériaux et des normes de référence et pour contrôler les statistiques sur la contamination du poisson.

« L’intoxication à la ciguatera est une intoxication causée par une toxine de l’eau de mer. La ciguatoxine est produite par des organismes microscopiques produisant des symptômes gastro-intestinaux, neurologiques et cardio-vasculaires. Il s’agit d’un syndrome assez méchant qui peut durer longtemps et qui est le type le plus courant d’intoxication alimentaire à base de biotoxines marines », a ajouté Canals.

« On estime qu’il peut toucher entre 10 000 et un demi-million de patients par an, mais seulement environ 20% des cas d’empoisonnement par la ciguatera sont enregistrés. Nous ne faisons donc que regarder le sommet de l’iceberg. »

« La plupart du temps, les victimes d’une intoxication alimentaire à la ciguatera ne consultent pas leur médecin, elles ne sont donc pas signalées. »

« Nous entendons aujourd'hui beaucoup de reportages sur le changement climatique et la question de savoir si le changement climatique est la cause de cette épidémie en raison de la montée du niveau de l'eau de mer dans certaines zones est encore en discussion, mais il existe un lien indéniable entre la toxine et la température à la surface de la mer. »

« Nous savons que les premiers foyers enregistrés en Europe se sont produits aux îles Canaries en 2004 avec un Amberjack ou sériole (Seriola rivoliana) 26 kg: neuf personnes ont été infectées à Madère en 2008 et avec un Amberjack (Seriola rivoliana) 30kg: 16 personnes infectées. »

« Cela devient un risque croissant pour les pays européens et cela devient indigène au sein des Etats membres de l'Union européenne. »

Mise à jour du 11 mars 2022. On lira ce document de l'AnsesLa ciguatera : surveiller les intoxications pour identifier les espèces de poissons contaminés.

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