vendredi 17 avril 2020

La nouvelle épidémie de coronavirus en Chine à Wuhan s'est propagée deux fois plus vite que nous le pensions, selon une étude


Les épidémies de maladies ne sont pas un scénario « Si », mais un scénario « Quand » et plus, nous somme plus préparés, plus nous sommes meilleurs, Source Les épidémies de maladie se produisent tout le temps, mais … le COVID-19 nous rappelle que le fait de ne pas se préparer peut conduire à une catastrophe, Scientific American.

« La nouvelle épidémie de coronavirus en Chine à Wuhan s'est propagée deux fois plus vite que nous le pensions », selon une nouvelle étude, source Boomberg.

Chaque porteur infectait 5,7 personnes en moyenne, selon des chercheurs américains, qui affirment que l'estimation précédente avait utilisé des données incomplètes.

Le nouveau coronavirus a traversé la Chine beaucoup plus rapidement que prévu, a déclaré une équipe de recherche américaine, suggérant qu'une vaccination ou une immunité extrêmement répandue serait nécessaire pour mettre fin à la pandémie.

Selon une analyse mathématique du Los Alamos National Laboratory, chaque personne infectée au début de l'épidémie à Wuhan a probablement transmis le virus à 5,7 autres personnes en moyenne. C’est plus du double de ce que l’Organisation mondiale de la santé et d’autres autorités de santé publique ont rapporté en février.

Les résultats de l'équipe sont spécifiques à l'épidémie chinoise. S'ils se vérifient ailleurs dans le monde, la pandémie pourrait être plus difficile à contrôler que certaines autorités ne l’avaient modélisé.

Avec le taux de propagation calculé dans l'étude, environ 82% de la population aurait besoin d'être immunisée, soit via un vaccin, soit parce qu'elle avait déjà eu la maladie, afin de prévenir le virus de se propager, selon l'équipe de Los Alamos. Sans une telle protection, des niveaux élevés de distanciation sociale seront nécessaires si plus d'une personne infectieuse sur cinq n'est pas diagnostiquée, ont déclaré les auteurs.

Les gouvernements du monde entier tentent de déterminer quand et comment sortir de semaines du confinement, alors même que certaines parties de la Chine renouvellent des restrictions après une nouvelle poussée. Près de 1,5 millions de personnes ont été testées positives dans le monde, y compris un certain nombre de cas récents en Chine ne présentant aucun des symptômes typiques de Covid-19.

« Penser que nous sommes proches d'un objectif serait dangereux », a déclaré mercredi Hans Kluge, directeur régional de l'OMS pour l'Europe. L'OMS a déclaré qu'il faut un effort renouvelé pour tester les patients, les isoler et retrouver leurs contacts étroits sera nécessaire à mesure que les pays assoupliront progressivement les restrictions à la vie publique.

L’étude de Los Alamos, publié dans Emerging Infectious Diseases a utilisé des données de voyage des téléphones portables et les rapports de cas avec le coronavirus à l'extérieur de l'épicentre précoce de la province chinoise du Hubei pour calculer sa propagation. Le recul des nouveaux cas confirmés en Chine et en Corée du Sud en mars montre qu'il peut être contenu, selon l’article.

Selon les auteurs,
Nos résultats suggèrent qu'une combinaison de mesures de contrôle, y compris une surveillance précoce et active, la mise en quarantaine, et en particulier de forts efforts de distanciation sociale, sont nécessaires pour ralentir ou arrêter la propagation du virus. Si ces mesures ne sont pas mises en œuvre rapidement et fortement, le virus a le potentiel de se propager rapidement et d'infecter une grande partie de la population, écrasant les systèmes de santé. Heureusement, la baisse des nouveaux cas confirmés en Chine et en Corée du Sud en mars 2020 et les incidences stables à Taiwan, Hong Kong et Singapour suggèrent fortement que la propagation du virus peut être contenue par des mesures précoces et appropriées.

COVID-19: Vos papiers ! Avez-vous votre certificat ou passeport d'immunité?

Je ne sais si le président du conseil scientifique du chef de l'Etat sera concerné par ce genre d'action, lui qui est aussi une personne âgée, et qui entend encore confiner, terme qui vient du latin cum (avec) et finis (frontières), pendant un certain temps ou un temps certain, ceux qu'on appelle aussi, les anciens, les aînés, les vieux, les vieillards, les seniors .. dans le fil de ce que préconisait la présidente de la Commission européenne ... mais de quel droit! Ah mais ... voilà pour coup de gueule !

Sur ce sujet, on lira,


Dans un précédent d'article, j'avais évoqué le notion de 'passeport d'immunité'. Quid chez nous ? 
Pas encore d'actualité chez nous, car les tests promis à grande échelle n'ont pas encore commencé, comme vous le savez les tests c'est comme ... vous connaissez la suite !

« Le Dr Fauci dit que des certificats d'immunité sont ‘possibles’ après la pandémie de coronavirus. Voici ce que cela signifie. », source article d’Adrianna Rodriguez de USA TODAY du 16 avril 2020.

Alors que la Maison Blanche et les représentants de l'État se disputent le pouvoir de lever les restrictions de distanciation sociale aux États-Unis, les pays européens ayant déjà dépassé leur pic de cas de COVID-19 réfléchissent à des stratégies de réouverture.

Le commissaire spécial de l'Italie pour l'urgence virale, Domenico Arcuri, a déclaré que la sortie du confinement comprendrait une augmentation des tests de détection de virus, le déploiement d'une application de recherche des contacts volontaires et des tests sanguins d'anticorps obligatoires alors que le pays cherche à mettre en place un système de ‘passeports d'immunité’.

Des chercheurs allemands ont également des idées flottantes pour des « certificats d'immunité » basés sur une étude de test sanguin d'anticorps au Helmholtz Center for Infection Research à Braunschweig, a déclaré l'auteur et épidémiologiste Gerard Krause au magazine allemand Der Spiegel du 27 mars 2020.

Même le principal expert américain des coronavirus, le Dr Anthony Fauci, directeur de l'Institut national des allergies et des maladies infectieuses, a déclaré la semaine dernière sur CNN que les certificats d'immunité étaient en discussion.

« C’est l’une de ces choses dont nous parlons lorsque nous voulons nous assurer qui sont les personnes vulnérables et non », a-t-il déclaré. « Je pense que cela pourrait avoir un certain mérite. »

Certains experts soutiennent que les certificats d'immunité, documents attestant qu'une personne est immunisée contre le coronavirus qui cause le COVID-19, pourraient aider à rouvrir l'économie en permettant à certaines personnes de retourner en toute sécurité au travail, de manger au restaurant et de participer à des activités interdites par les restrictions de distanciation sociale.
Le Dr Jeffrey Kahn, directeur de l'Institut de bioéthique Johns Hopkins Berman, a déclaré que l'adoption d'une telle politique n'était pas si facile.

Une catégorisation au-delà de l'immunité et non de l'immunité serait nécessaire, a déclaré Kahn, par exemple en fonction de l'âge ou de la résidence. Les jeunes plus résistants au virus seraient probablement favorisés pour recevoir la certification.

Et si un ménage entier n'était pas immunisé, la personne avec le certificat d'immunité pourrait ramener le virus à la maison et infecter la famille.

« Ce serait super compliqué à mettre en place, nous n'avons pas obtenu de réponse claire sur la façon dont cela fonctionnerait en raison de toutes ces complications », a déclaré Kahn.

Quand allons-nous rouvrir le pays?: Les tests d'anticorps peuvent aider les responsables à décider, selon les experts.

Tests «révolutionnaires»: les tests liés au coronavirus sont un acte de promesses haut de gamme par rapport à la réalité.

Il existe également des inquiétudes quant à la stigmatisation des personnes immunisées ou non immunisées, a-t-il ajouté.

« Chaque fois que vous marquez publiquement des personnes, que ce soit pour elles ou non, cela peut avoir cet effet stigmatisant », a-t-il déclaré. « Tout cela devrait être géré d'une manière ou d'une autre. »

Harald Schmidt, professeur à l'Université de Pennsylvanie, a comparé les documents d'immunité aux croix qui marquaient les maisons des personnes infectées par la peste en Europe au cours des siècles passés. Un certificat d'immunité serait un « insigne d'honneur », a-t-il dit, et ceux qui n'en ont pas seraient marginalisés.

Schmidt s'inquiète également des conséquences politiques sur les sans-papiers. Si la certification nécessite une preuve de résidence, a-t-il dit, ils seraient moins susceptibles d’être testé pour leur immunité. Et il pourrait y avoir d'autres impacts à long terme.

« Ce n'est pas utile si nous leur accordons l'immunité contre l'expulsion tout en évaluant l'immunité virologique, mais ensuite pendant deux ans, ils font la queue, frappent à notre porte et on les jettent hors du pays », a-t-il déclaré.

Alors que les représentants de l'État envisagent des options pour rouvrir leurs économies, les experts estiment que les certificats d'immunité sont loin d'être mis en œuvre car les tests d'anticorps peuvent être peu fiables et ne sont pas encore largement disponibles. Ils disent qu'un certificat d'immunité n'a de sens que si les chercheurs ont une grande confiance dans les résultats des tests.

Elitza Theel, directrice du laboratoire de sérologie des maladies infectieuses de la clinique Mayo, a déclaré que plus de 50 fabricants commerciaux demandaient l'approbation de la FDA pour les tests d'anticorps et que certains de ces tests avaient été vérifiés pour leur précision clinique. Les entreprises qui commercialisent 90 tests d'anticorps ont informé l'agence fédérale de leur intention de proposer des tests.

« Nous ne pouvons introduire ces mesures qui présentent des risques de conséquences négatives que si nous pouvons être sûrs d'évaluer de manière fiable l'immunité », a déclaré Schmidt.

Kahn a déclaré qu'avec des tests fiables et répandus, il était possible de rouvrir le pays sans certificat d'immunité.

« Nous recherchons tout moyen d'aider à atténuer la situation », a-t-il déclaré. « C'est parmi les choses auxquelles les personnes pensent et parlent parce qu'ils ont besoin de penser et de parler de tout. »

COVID-19 et la France: La courbe des nouveaux cas s'est-elle aplatie, épisode 2


Episode 2, l’Université John Hopkins propose un exercice qui tente de répondre à la question suivante, « La courbes’est-elle aplatie ? », jugez plutôt …

Cette courbe fait suite à un premier épisode du 16 avril 2020 où toutes les explications vous sont fournies sur la méthodologie retenue.

Cela permet de suivre l’évolution de l’épidémie pour les 10 pays les plus touchés actuellement. Pour plus de clarté, j’ai effacé les données des 9 autres pays pour ne garder que la France. Cette page a été mise à jour le jeudi 16 avril 2020 à 20 h57 UTC-04:00.
Bien entendu, en allant sur le lien précité, vous pouvez retrouver les autres pays.

Nouveaux cas confirmés quotidiennement (moyenne mobile sur 5 jours)


Autre courbe, celle du Financial Times, qui montre que la courbe s’est effectivement aplatie en France mais avec un niveau de nouveaux cas encore élevé …

Il s’agit des nouveaux cas confirmés sur une moyenne mobile ou glissante de 7 jours, par nombre de jours depuis que le pays a déclaré 30 cas par jour. Les étoiles indique la date du confinement.
 

jeudi 16 avril 2020

Les vraies failles de notre système de santé


Le Dr Jérôme Marty propose dans Figaro Vox une tribune, mieux que je ne saurais faire, avec ce titre, « Les vraies failles de notre système de santé ».

Voici d’amples extraits ...

La France partait avec de nombreuses longueurs d’avance: un système de santé borné par de nombreuses agences de surveillance, de mesure, de prévoyance. Une administration relais de l’état présente à chaque étage du soin, garante de ses bons usages, de son efficience, sa pertinence, un système hospitalier public et privé et une médecine de ville prête à agir sous le commandement de ces différentes instances. Il n’en était rien…

Dès les premiers jours de la crise du «Covid 19» les dysfonctionnements succédèrent aux dysfonctionnements. Une fois de plus la France allait tomber dans ses travers, bousculée par des dirigeants trop sûrs d’eux. Le Covid 19 ne pouvait l’atteindre… Il y avait très peu de risque qu’il l’atteigne… La France était prête et armée, tout était sous contrôle …

Brique par brique le mur illusoire de protection allait tomber.

Alors que les pays asiatiques nous montraient le chemin et devaient nous faire gagner un temps précieux, ce temps allait être consommé en atermoiements et en ajustements aux possibilités de la nation en lien avec une pénurie que la technostructure allait tout faire pour cacher puis justifier à la population.

La France avait dès lors pris du retard, se mettait alors en place une communication paradoxale de «transparence» puisque censée masquer les manques et les errements, conséquences directes des politiques sanitaires successives et de l’architecture du système. La France était prête, il y avait des stocks de masques, il y avait des commandes en nombre, les masques arrivaient, ils allaient arriver, ils arriveraient, il n’y avait pas besoin de masques de protection respiratoire pour tout une catégorie de soignants, il fallait réserver les moyens de protections à l’hôpital, la ville n’avait pas à être mise à contribution en phase 1 et 2….

Une communication, désormais vidée de tout sens scientifique construite sur le seul manque apparaissait.

(…)

Loin de s’améliorer, le défaut de matériel allait s’aggraver, potentialisé par l’augmentation de l’épidémie. Masques, sur-blouses-charlottes, écrans de protection, sur-chausses, solutés hydroalcoolique, traitements de réanimation, traitement de soins palliatif, tests, écouvillons, réactifs, automates …

Il fallait pourtant soigner, il fallait pourtant combattre, il fallait lutter pour la vie.

Les soignants de toutes régions manifestaient une solidarité, les entreprises de l’agro-alimentaire, les cantines, la grande distribution, les agriculteurs, les carrossiers etc. répondaient à l’appel des soignants pour leur fournir le matériel qui leur faisait défaut. Les entreprises du textile se lançaient dans la confection de masques, une société d’article de sport livrait des masques de plongée à l’utilisation détournée pour les réanimations respiratoires, les collectivités locales se levaient et commandaient des masques et des moyens de protections. Toute cette organisation tenait de la débrouillardise, de la réactivité, de la nécessité…

Face à elle, les agences relais de l’État, l’administration, tentaient à plusieurs reprises de freiner les ardeurs, multipliaient les circulaires de durées de vie limitées puisque tuées par les circulaires suivantes, à un rythme effréné lié au retard irrattrapable pris au début de la crise, à l’adaptation au manque et à son camouflage décidé en haut lieu, et à une déconnexion totale avec la réalité du terrain.

Le Covid 19 par son pouvoir de désorganisation, faisait apparaître la réalité d’un système sanitaire qui avait éliminé le soin de son pilotage et avait livré sa destination à des commandants sans grade, et sans formation, obéisseurs interchangeables, prenant leurs ordres auprès d’un ministère sans pouvoir autre que celui donné par Bercy…

Nous avions jusqu’alors un système de santé, hyperadministré, encadré, normé, surveillé, dirigé, mesuré, orienté par une forteresse non soignante qui paraissait imprenable, le Covid 19 l’avait pulvérisé, ne restait debout que le soin.

Viendra le jour d’après, viendra demain... J’appelle les dirigeants des partis politiques à prendre conscience de l’échec de notre modèle de gouvernement sanitaire.

Complément. On lira cet article paru le 15 avril 2020 sur le blog Hastable, « Coronavirus: le coût de l’incompétence » par Nasier Ockham et h16.

Complément du 18 avril 2019. Dans une interview au Figaro du 18 avril, la directrice générale de Santé publique de France persiste dans son aveuglement sur le port du masque en ville, elle reste alignée sur la doxa du gouvernement et du président de la République ...

A la question sur le port du masque pour le grand public, quelles sont vos recommandations ?
Nos recommandations concernent les personnels de santé, et les personnes avec des symptômes. Nous estimons que nous ne disposons pas assez d'informations assez robustes pour se prononcer pour le reste de la population, et nous étudions le sujet avec le Haut Conseil de la santé publique.

La décision est renvoyée à comité Théodule alors qu'il faut encourager le port d'un masque en ville et compris celui fait maison !!! 

Complément du 19 avril 2020. On lira le communiqué de l’Académie nationale de médecine du 18 avril 2020 : Âgisme et tensions intergénérationnelles en période de Covid-19.

COVID-19 : Des gouttelettes orales peuvent voyager plus loin que les règles de distanciation physique



Des recherches menées avant l'émergence du nouveau virus suggèrent que la règle des deux mètres n'est pas une protection contre la toux directe.

Une étude américaine montre que des gouttelettes portent sur une distance considérable lors de propos non protégées, ce qui justifie le masque.

« Une ‘chambre de la toux’ montre que la distance de 1,80 m n’est peut-être pas assez loin pour une distance physique », source communiqué du 14 avril 2020 de la Western University (Canada).

Selon une nouvelle étude menée par la Western University, la règle de la distance physique recommandée de 1,80 m et reconnue à l'échelle mondiale, pour prévenir la propagation du COVID-19, peut ne pas faire beaucoup de différence si quelqu'un tousse dans votre direction. 

Les résultats ont récemment été acceptés pour publication dans la revue Indoor Air.
Pour cette étude, Eric Savory, du Département de génie mécanique et des matériaux de la Western University, a fabriqué une ‘chambre de la toux’ pour analyser les flux d'air expulsifs (toux) produits par des sujets humains, naturellement infectés par la grippe saisonnière.

Savory et ses collaborateurs ont découvert que si vous vous tenez à 1,80 sans obstacle de quelqu'un qui tousse, les gouttelettes résultantes vous atteindront dans les trois secondes et continueront à projeter en avant bien au-delà des 1,80 m recommandés.

« Même lorsque vous êtes à 2,5 mètres de distance, le flux d'air dans la toux peut toujours se déplacer à 200 millimètres par seconde », explique Savory, qui a travaillé avec des virologues de l'hôpital Sunnybrook à Toronto pour l'analyse finale. « Cela signifie que les très fines gouttelettes vont rester suspendues pendant longtemps, même après quatre secondes. »

L'étude montre qu'environ 10% des gouttelettes de toux initialement expulsées sont toujours dans l'air à une distance de 1,8 m.

La chambre de la toux de Western Engineering est un cube fermé de deux mètres avec une ouverture et une mentonnière à l'avant, qui est utilisé comme point d'accès pour les participants à l'étude pour tousser. Dans le cube, une caméra et un laser sont utilisés pour déterminer la vitesse des gouttelettes expulsées de la toux.

Et bien que les tests physiques aient été menés jusqu'à la saison de grippe 2017-18 incluse, bien avant l'épidémie mondiale de COVID-19, l'étude fournit des données et des analyses précieuses aux responsables gouvernementaux et aux professionnels de la santé du monde entier qui luttent actuellement contre la propagation la maladie mortelle.

En collaboration avec Eric Arts de la Schulich School of Medicine & Dentistry de la Western University et Franco Berruti du Département de génie chimique et biochimique de la Western University, l'équipe de recherche interdisciplinaire a l'intention d'examiner les voies de pénétration des gouttelettes COVID-19 dans l'air et d'analyser différentes surfaces de matériaux afin de vérifier sa capacité de survie dans différentes conditions de température et d'humidité.


Cette investigation supplémentaire sera menée dans le laboratoire de confinement ImPaKT de la Western University, où Arts et ses collaborateurs développent activement un vaccin COVID-19 efficace.

Dans une lettre au New England Journal of Medicine, des scientifiques rapportent la visualisation des gouttelettes du fluide oral générées par la parole avec la diffusion de la lumière laser (Visualizing Speech-Generated Oral Fluid Droplets with Laser Light Scattering).

En voici quelques extraits, et aller lire l’article pour voir une vidéo assez étonnante ...

Les aérosols et les gouttelettes générés pendant la parole ont été impliqués dans la transmission de virus de personne à personne et il existe un intérêt actuel à comprendre les mécanismes responsables de la propagation de Covid-19 par ces moyens.

L'acte de parler génère des gouttelettes de liquide buccal dont la taille varie considérablement, et ces gouttelettes peuvent héberger des particules virales infectieuses. Alors que les grosses gouttelettes tombent rapidement au sol, les petites gouttelettes peuvent se déshydrater et s'attarder comme des « noyaux de gouttelettes » dans l'air, où elles se comportent comme un aérosol et augmentent ainsi l'étendue spatiale des particules infectieuses émises.

Nous rapportons les résultats d'une lumière laser - expérience de diffusion dans laquelle les gouttelettes générées par la parole et leurs trajectoires ont été visualisées.



Nous avons dirigé cette feuille de lumière à travers des fentes sur les côtés d'une boîte en carton de 53 × 46 × 62 cm. L'intérieur de la boîte a été peint en noir. L'enceinte a été placée sous un filtre à air à haute efficacité (HEPA) pour éliminer la poussière.

Lorsqu'une personne parlait à travers l'extrémité ouverte de la boîte, les gouttelettes générées pendant le discours parcouraient environ 50 à 75 mm avant de rencontrer la nappe lumineuse.

Des clips vidéo des événements pendant que la personne parlait, avec et sans masque facial, sont disponibles avec le texte intégral de cette lettre sur NEJM.org.

Nous avons constaté que lorsque la personne a dit « être en bonne santé », de nombreuses gouttelettes allant de 20 à 500 μm ont été générées. Ces gouttelettes ont produit des éclairs lors de leur passage à travers la nappe lumineuse.

Nous avons constaté que le nombre de flashs augmentait avec l'intensité de la parole; cette constatation était conforme aux observations antérieures d'autres chercheurs. Dans une étude, les gouttelettes émises pendant un discours étaient plus petites que celles émises pendant la toux ou les éternuements.

Certaines études ont montré que le nombre de gouttelettes produites en parlant est similaire au nombre produit par la toux.

Nous n'avons pas évalué les rôles relatifs des gouttelettes générées lors de la parole, des noyaux de gouttelettes et des aérosols dans la transmission des virus. Notre objectif était de fournir une preuve visuelle des gouttelettes générées par la parole et de décrire qualitativement l'effet d'une couverture de tissu humide sur la bouche pour limiter l'émission de gouttelettes.

Complément du 18 avril 2019. Dans une interview au Figaro du 18 avril, la directrice générale de Santé publique de France persiste dans son aveuglement sur le port du masque en ville, elle reste alignée sur la doxa du gouvernement et du président de la République ...

A la question sur le port du masque pour le grand public, quelles sont vos recommandations ?
Nos recommandations concernent les personnels de santé, et les personnes avec des symptômes. Nous estimons que nous ne disposons pas assez d'informations assez robustes pour se prononcer pour le reste de la population, et nous étudions le sujet avec le Haut Conseil de la santé publique.

La décision est renvoyée à comité Théodule alors qu'il faut encourager le port d'un masque en ville et compris celui fait maison !!! 

La réémergence du coronavirus sera une menace jusqu'en 2024, selon une étude modélisation de Harvard


« La réémergence du coronavirus sera une menace jusqu'en 2024 », selon une étude de Harvard parue dans ScienceProjecting the transmission dynamics of SARS-CoV-2 through the postpandemic period.
La distanciation sociale pourrait devoir continuer ou être utilisée par intermittence pendant les deux prochaines années, même si le virus était apparemment éliminé, selon les chercheurs.
Résumé
Il est urgent de comprendre l'avenir de la transmission du syndrome respiratoire aigu sévère - coronavirus 2 (SRAS-CoV-2). Nous avons utilisé des estimations de la saisonnalité, de l'immunité et de l'immunité croisée pour les bêtacoronavirus OC43 et HKU1 à partir de données de séries chronologiques des États-Unis pour éclairer un modèle de transmission du SRAS-CoV-2.

Nous avions prévu que des flambées hivernales récurrentes de SRAS-CoV-2 se produiraient probablement après la première vague pandémique la plus grave.

En l'absence d'autres interventions, une mesure clé du succès de la distanciation sociale est de savoir si les capacités de soins critiques sont dépassées. Pour éviter cela, une distanciation sociale prolongée ou intermittente peut être nécessaire jusqu'en 2022.

Des interventions supplémentaires, y compris une capacité de soins intensifs accrue et une thérapeutique efficace, amélioreraient le succès de la distanciation intermittente et accéléreraient l'acquisition de l'immunité collective.

Il est urgent de réaliser des études sérologiques longitudinales pour déterminer l'étendue et la durée de l'immunité contre le SRAS-CoV-2. Même en cas d'élimination apparente, la surveillance du SRAS-CoV-2 devrait être maintenue car une résurgence de la contagion pourrait être possible jusqu'en 2024.

Les auteurs notent en résumé,

l'incidence totale de la maladie à COVID-19 au cours des cinq prochaines années dépendra de façon critique de son entrée ou non en circulation régulière après la première vague pandémique, qui à son tour dépend principalement de la durée de l'immunité que l'infection au SRAS-CoV-2 confère. L'intensité et le moment des épidémies pandémiques et postpandémiques dépendront de la période de l'année où l'infection généralisée par le SRAS-CoV-2 s'établira et, dans une moindre mesure, de l'ampleur de la variation saisonnière de la transmissibilité et du niveau d'immunité croisée. qui existe entre les bétacoronavirus.

Les stratégies de distanciation sociale pourraient réduire la mesure dans laquelle les infections par le SRAS-CoV-2 pèsent sur les systèmes de santé. Une distance très efficace pourrait réduire suffisamment l'incidence du SRAS-CoV-2 pour rendre possible une stratégie basée sur la recherche des contacts et la quarantaine, comme en Corée du Sud et à Singapour.

Des efforts de distanciation ponctuelle moins efficaces peuvent entraîner une épidémie prolongée à un seul pic, l'étendue de la pression sur le système de santé et la durée de distanciation requise dépendant de l'efficacité.
Une mise à distance intermittente peut être nécessaire jusqu'en 2022, à moins que la capacité de soins intensifs ne soit considérablement augmentée ou qu'un traitement ou un vaccin ne soit disponible.

Les auteurs sont conscients qu'une distanciation prolongée, même intermittente, est susceptible d'avoir des conséquences économiques, sociales et éducatives profondément négatives. Notre objectif dans la modélisation de ces politiques n'est pas de les approuver, mais d'identifier les trajectoires probables de l'épidémie dans le cadre d'approches alternatives, d'identifier des interventions complémentaires telles que l'augmentation des capacités des soins intensifs et l'identification de traitements pour réduire la demande en soins intensifs, et de stimuler des idées innovantes pour étendre la liste des options pour maîtriser la pandémie sur le long terme. Notre modèle présente une variété de scénarios destinés à anticiper la dynamique de transmission possible du SRAS-CoV-2 sous des hypothèses spécifiques.

Nous ne prenons pas position sur l'opportunité de ces scénarios étant donné le fardeau économique qu'une distanciation soutenue peut imposer, mais nous notons le fardeau potentiellement catastrophique pour le système de santé qui est prédit si la distanciation est peu efficace et/ou n'est pas maintenue assez longtemps.

Le modèle devra être adapté aux conditions locales et mis à jour à mesure que des données plus précises seront disponibles. Il est urgent de réaliser des études sérologiques longitudinales pour déterminer l'étendue et la durée de l'immunité contre le SRAS-CoV-2, et une surveillance épidémiologique devrait être maintenue au cours des prochaines années pour anticiper la possibilité d'une résurgence.

COVID-19 et la Suisse: le Conseil fédéral assouplit les règles de déclaration des produits alimentaires


C'est une surprise chez nos amis suisses, j’apprends que s’agissant de l’épidémie de coronavirus, « le Conseil fédéral assouplit les règles de déclaration des produits alimentaires ».
Avec la crise du coronavirus, certains ingrédients et matériaux d’emballage viennent à manquer dans l’industrie alimentaire et doivent être remplacés. En conséquence, les informations figurant sur l’emballage de certaines denrées alimentaires ne correspondent plus au contenu. Afin de garantir la disponibilité de ces produits et d’éviter le gaspillage alimentaire, le Conseil fédéral a adopté une modification de l’ordonnance sur les denrées alimentaires et les objets usuels lors de sa séance du 16 avril.
La modification de l’ordonnance permet de tolérer temporairement certains écarts. Il faut cependant que les denrées alimentaires concernées soient marquées d’un autocollant rouge. Celui-ci renvoie à un site internet qui fournit des informations sur les propriétés réelles du produit (composition, provenance des ingrédients, méthode de production) et explique la raison de l’écart. En effet, ces exceptions provisoires ne sont autorisées que si elles ne mettent en aucune façon la santé des consommateurs en danger (par exemple problème d’allergies).

Cette modification entre en vigueur immédiatement et pour six mois.

En effet , cette modification comprend :
les indications figurant sur la denrée alimentaire peuvent s’écarter de la réalité si les conditions suivantes sont réunies :

a. cela est manifestement dû aux difficultés d’approvisionnement résultant de la pandémie de COVID-19 ; 
b. cela n’est pas pertinent pour la protection de la santé du consommateur, notamment en ce qui concerne les ingrédients susceptibles de provoquer des allergies ou d’autres réactions indésirables ; 
c. la denrée alimentaires arbore un autocollant rond et rouge bien reconnaissable pour le consommateur, avec la mention « Déclaration correcte sous : ... », suivie d’une adresse internet où l’on trouve facilement des informations sur les indications qui s’écartent de la réalité ainsi que des explications.

NB : Cela me semble d'autant plus curieux pour la présence d’allergènes dont les produits ne sont pas toujours bien étiquetés, car le communiqué de l’OSAV (Office fédéral de de la sécurité alimentaire et des affaires vétérinaires) du 16 avril 2020 précise, « Sur l'emballage d'un aliment figurent des informations sur les ingrédients et sur la composition. Les allégations de santé et les informations pour les personnes allergiques font également partie de l’information des consommateurs. »

Complément du 18 avril 2020. En France aussi c'est pareil qu'en Suisse, si l'on croit l'AFPRAL, association pour la prévention des allergies :

Alerté par un article paru dans le magazine des industriels de l'agro-alimentaire sur un potentiel assouplissement des mesures d'étiquetage des aliments par la DGCCRF (Direction générale de la Concurrence, de la Consommation et de la Répression des fraudes) pour contrecarrer la pénurie de certaines denrées alimentaires nous attirons l'attention des consommateurs allergiques et leur demandons d'être vigilant. Pour en savoir plus, nous vous invitons à prendre connaissance de notre communiqué de presse.

Le guide précise la mise à jour du document unique d’évaluation des risques avec comme maîtres mots, prévention information et formation. La politique d’utilisation des masques fait l’objet d’une mise au point très précise dans un contexte de grande tension sur le sujet. L’objectif est de continuer d’assurer une sécurité sanitaire totale pour des produits sains et surs. Enfin, pour faire face à un fonctionnement en mode dégradé, le document détaille des mesures permettant l’adaptation de la chaîne d’approvisionnement, comme la vérification des plans de continuité des fournisseurs clients et prestataires.

Des chercheurs révèlent les mécanismes d'un tueur naturel de bactéries


« Des chercheurs révèlent les mécanismes d'un tueur naturel de bactéries », source communiqué de UCLA du 15 avril 2020.

Les résultats d'une équipe dirigée par l'UCLA pourraient éclairer le développement d'antibiotiques de précision.

Des scientifiques sont sur le point d'adapter le pouvoir de destruction de bactéries par une nanomachine naturelle, une minuscule particule qui effectue une action mécanique.
Tronc de la pyocine
Dans une étude publiée dans Nature, une équipe de chercheurs dirigée par l'UCLA décrit comment la nanomachine reconnaît et tue les bactéries et rapporte qu'elles l'ont imagée avec une résolution atomique. Les scientifiques ont également conçu leurs propres versions de la nanomachine, ce qui leur a permis de produire des variations qui se sont comportées différemment de la version naturelle.

Leurs efforts pourraient éventuellement conduire à la mise au point de nouveaux types d'antibiotiques capables de se focaliser sur des espèces spécifiques de microbes. Les médicaments conçus pour ne tuer qu'une certaines espèces ou souches de bactéries pourraient offrir de nombreux avantages par rapport aux antibiotiques conventionnels, notamment en réduisant la probabilité que les bactéries développent une résistance. De plus, les médicaments adaptés pourraient détruire les cellules dangereuses sans éliminer les microbes bénéfiques dans le microbiome intestinal, et ils pourraient éventuellement offrir la possibilité d'être déployés pour prévenir les infections bactériennes, pour tuer les agents pathogènes dans les aliments et pour créer des microbiomes humains afin que les bactéries favorables prospèrent.

La particule à l'étude, une pyocine de type R, est un complexe protéique libéré par la bactérie Pseudomonas aeruginosa comme moyen de sabotage des microbes qui lui font concurrence pour des ressources. Lorsqu'une pyocine identifie une bactérie rivale, elle tue la bactérie en la perforant d’un trou dans la membrane de la cellule. P. aeruginosa, souvent une cause de maladie nosocomiale, se trouve dans le sol, dans l'eau et sur les produits frais. Le germe est couramment étudié et sa biologie est bien connue.

L'observation de la structure moléculaire d'une pyocine, dans ses configurations avant et après cette perforation, a permis aux scientifiques de comprendre les mécanismes par lesquels elle reconnaît sa proie et déclenche son coup mortel.

La recherche s'inscrit dans le cadre d'une discipline appelée ingénierie bioinspirée, qui vise à développer une technologie qui s'inspire de la nature de sa conception. Les résultats de la nouvelle étude pourraient contribuer au développement d'antibiotiques ciblés à base de pyocine.

« Si vous avez essayé de concevoir une pyocine à partir de rien, vous ne pourriez probablement pas le faire », a déclaré Z. Hong Zhou, co-auteur de l'étude et directeur du Electron Imaging Center for Nanomachines au California NanoSystems Institute à UCLA. « Il est bon d'apprendre de la nature, car la nature a développé et testé ces systèmes pendant des milliards d'années. Cela devrait nous aider d'un point de vue technique. »

Avec ses collègues, Zhou, qui est également professeur de microbiologie, d'immunologie et de génétique moléculaire à l'UCLA, a utilisé deux technologies d'imagerie: la cristallographie aux rayons X, qui révèle la structure des molécules cristallisées à l'aide des rayons X, et la microscopie cryoélectronique, qui forme images en détectant les électrons rebondissant à partir d'échantillons congelés. L'équipe a été aidée par les récents progrès de la microscopie électronique, notamment des caméras à haute vitesse qui détectent directement les électrons; les versions précédentes de la technique détectaient les électrons indirectement et, par conséquent, avec moins de détails.

Comme décrit dans l'étude, les pyocines sont des machines à tuer élégamment simples et spécifiques.

Des recherches antérieures menées par les responsables de la nouvelle étude ont décrit la structure globale de la pyocine, quoique de manière moins détaillée. La plus grande partie d'une pyocine est un tronc cylindrique comprenant une gaine extérieure qui entoure un tube intérieur, la partie qui perce. Au bas du tronc se trouve une base avec six vrilles saillantes. Lorsque la nanomachine rencontre une cellule bactérienne, elle atterrit sur la cellule et les vrilles se lient à des structures spécifiques à la surface de la cellule.

Dans le nouvel article, les scientifiques ont décrit pour la première fois un collier à six brins au sommet du tronc de la pyocine, qui relie la gaine et le tube interne et qui est important pour la transmission d'énergie dans le processus de déclenchement de la pyocine.

La dernière étude a également fourni des informations jusque-là inconnues sur l'action mécanique qui se produit lorsqu'une pyocine est déclenchée: lorsqu'au moins trois des six vrilles se lient à la surface d'une cellule bactérienne, la pyocine reconnaît que la cellule est le type spécifique de bactérie dont elle est destinée à attaquer. À ce stade, les vrilles ancrent la pyocine à la cellule et provoquent l'évasement de la base. Ceci, à son tour, provoque l'effondrement de la gaine extérieure, entraînant le tube intérieur vers le bas et à travers la surface de la cellule cible.

Au-delà des dommages causés par la perforation, le tube intérieur libère l'énergie de la cellule bactérienne, ce qui provoque la mort de la cellule, un détail précédemment révélé par les chercheurs.

« Il s'agit d'un système mécanique qui est parfaitement réglé pour coupler la reconnaissance spécifique d'une cellule cible avec le déploiement de son coup mortel », a déclaré le co-correspondant auteur Jeff F. Miller, professeur de NanoSystems Sciences et directeur du CNSI. « Comprendre comment le système est construit et comment son activité est contrôlée pourrait être utilisé pour construire de nouveaux types de nanomachines. »

En utilisant des techniques de biologie moléculaire standard pour modifier l'ADN de P. aeruginosa, les chercheurs ont conçu des variations d'une pyocine. Parmi les variantes figuraient des versions dans lesquelles le déclencheur était plus ou moins sensible aux structures à la surface de ses bactéries cibles et à son environnement. Par exemple, certains ajustements ont permis à la nanomachine de surmonter sa vulnérabilité aux environnements acides. Dans la nature, la pyocine se déclenche automatiquement lorsqu'elle est exposée à un pH de 3,4, l'acidité de la choucroute, mais par rapport à la version naturelle, moins de pyocines modifiées se sont déclenchées à ce niveau de pH.

La capacité d'ajuster la sensibilité du déclencheur de la pyocine a des implications pour les antibiotiques qui pourraient éventuellement être développés sur la base de l'étude: une infection systémique mortelle pourrait être rencontrée avec un déclencheur plus large qui ne discrimine pas autant quelles bactéries les particules attaquent, tandis qu'une fonction de déclenchement plus discriminante pourrait être utilisée pour cibler certaines infections intestinales sans causer de dommages collatéraux au microbiome.

Un scientifique de Pylum Biosciences, une startup du sud de San Francisco cofondée par Miller, a participé à la recherche. Pylum a conçu différentes classes de pyocines comme base pour développer des thérapies qui n'attaquent que des espèces spécifiques de bactéries, tout en surmontant la résistance aux antibiotiques et en prévenant les dommages aux microbes bénéfiques. Une telle thérapie cible étroitement une bactérie qui cause la colite. La thérapie a été testée en laboratoire et sur des modèles animaux précliniques, et des essais cliniques sur des patients humains sont en cours de planification.

Cette recherche a été soutenue par les Instituts nationaux de la santé, le Fonds scientifique national suisse et la Fondation Kavli. L'imagerie a été réalisée au Electron Imaging Center for Nanomachines, qui est financé par le NIH et la National Science Foundation.

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