Je vous souhaite un très bon et très joyeux Noël, de belles fêtes de fin d’année
«Des
isolats de Listeria monocytogenes associés aux ruminants
appartiennent préférentiellement à
des clones hypervirulents qui
sont associés aux produits
laitiers: une étude longitudinale dans 19 élevages»,
source article publié dans
Environmental
microbiology du 4 décembre 2021. L’article est disponible en
intégralité.
Les objectifs de la présente étude étaient: (i) déterminer la
prévalence de Listeria spp. Chez des ruminants laitiers
individuels et l'environnement de l'exploitation dans des exploitations laitières espagnoles selon une étude longitudinale;
(ii) caractériser la diversité génétique et la structure des
populations
de L. monocytogenes
dans les exploitations
laitières en utilisant le séquençage du génome entier; et (iii)
pour comprendre la transmission de L.
monocytogenes au niveau de
l’exploitation laitière
et les facteurs de risque [saison, hygiène de production, nombre de
lactation et les jours de lactation
actuelle] qui l'influencent.
Résumé
Des études ont montré que les ruminants
constituent des réservoirs de Listeria
monocytogenes, mais l'épidémiologie
et la diversité génétique de ce pathogène au sein des élevages
sont mal connues. Ici, nous avons mené une étude longitudinale à
grande échelle pour surveiller Listeria
spp. dans 19 exploitations
laitières pendant trois saisons consécutives (N = 3251
échantillons). L. innocua
était l'espèce la plus répandue, suivie de L.
monocytogenes. L.
monocytogenes a été détecté dans
52,6% des élevages et plus fréquemment chez les bovins (4,1%) et
les ovins (4,5%) que dans les élevages caprins (0,2%). La lignée I
représentait 69% des isolats de L.
monocytogenes. Parmi les
échantillons d'animaux, les sous-lignées (SL) et les complexes
clonaux (CC) les plus répandus étaient SL1/CC1, SL219/CC4,
SL26/CC26 et SL87/CC87, tandis que SL666/CC666 était le plus répandu
dans les prélèvements
environnementaux. 61 types différents de
cgMLST* de L.
monocytogenes ont été retrouvés,
28% sont communs
à différents animaux et/ou surfaces au sein de la même
exploitation laitière et
21% précédemment signalés ailleurs dans le cadre de la
surveillance alimentaire et humaine. La prévalence de L.
monocytogenes n'a pas été affectée
par l'hygiène de l'élevage mais par la saison: une prévalence plus
élevée a été observée pendant l'hiver chez les bovins, et
pendant l'hiver et le printemps dans les élevages d’ovins.
Les vaches dans leur deuxième lactation avaient une probabilité
plus élevée d'excrétion fécale de L.
monocytogenes. Cette étude met en
évidence les exploitations
laitières comme réservoir de L.
monocytogenes hypervirulent.
Discussion
Comprendre la dynamique de la population de L.
monocytogenes et sa biodiversité
est essentiel pour une surveillance efficace des maladies et le
développement de stratégies de contrôle. À notre connaissance, il
s'agit de la plus grande étude longitudinale sur la prévalence,
l'écologie et les caractéristiques génomiques de L.
monocytogenes chez des ruminants
laitiers individuels et l'environnement de l’exploitation laitière.
D'autres études
ont soit appliqué une conception d'étude longitudinale avec un
nombre réduit d'exploitations laitières
(une à trois exploitations laitières)
et/ou analysé des échantillons de matières fécales de ruminants
d'élevage choisis au hasard, ce qui limite la compréhension des
modèles d'excrétion fécale globale et individuelle au fil du temps
Dans cette étude, la prévalence de L.
monocytogenes détectée dans les
exploitations laitières (3,8% dans des
échantillons de matières fécales et 2,5% dans des
échantillons de l'environnement de l’exploitation laitière)
était inférieure à celle précédemment signalée dans les
exploitations laitières sans cas clinique de listériose (prévalence
de l'échantillon fécal de 0% à 60% chez les bovins et 14,2% chez
les ovins) dans des exploitations laitères
des États-Unis et d'Europe. Les
différences de climat et de gestion de l'exploitation (par exemple,
les aliments utilisés) entre les différentes régions géographiques
peuvent expliquer la faible prévalence de L.
monocytogenes dans notre étude par
rapport aux études précédentes réalisées dans les pays du Nord.
L. monocytogenes a
été détecté plus fréquemment chez
des
élevages bovins que dans des
élevages de petits ruminants, en accord avec des études antérieures
concernant l'épidémiologie de la listériose chez les ruminants
Fait intéressant, l'espèce pathogène, L.
ivanovii, souvent signalée chez les
petits ruminants n'a été détectée dans aucune de nos
exploitations laitières,
ce qui pourrait être dû à sa prévalence relativement faible ou à
d'éventuels biais des protocoles d'isolement qui ont généralement
été optimisés pour la récupération de L.
monocytogenes. Nos résultats sont
en accord avec d'autres rapports utilisant des approches basées sur
la culture montrant que l'incidence de L.
innocua dans les fèces des
ruminants est plus élevée (9,7% à 22,7%) que celle de L.
monocytogenes (1,8% à 9,3%), bien
qu'il ait été démontré que L.
innocua peut devenir plus
important que L. monocytogenes
au cours des
protocoles d'enrichissement masquant sa détection.
Bien que la consommation d'ensilage contaminé
soit considérée comme la principale
source d'infection pour les ruminants, jusqu'à un tiers des cas de
listériose animale n'ont pas de lien évident entre la listériose
et l'alimentation en ensilage. Dans cette étude, dans 50% des
exploitations laitières où
des excrétions fécales ont été détectées, aucune
souche de L
. monocytogenes pourrait être
détecté dans les aliments pour animaux, les mangeoires
ou les abreuvoirs. Il a été suggéré que la faune, le personnel de
l’exploitation laitière ou
les visiteurs, l'acquisition de nouveaux animaux et/ou de matériel
agricole pourraient également véhiculer L.
monocytogenes dans les
exploitations.
La majorité des isolats récupérés ici
appartenaient à la lignée I (en particulier à SL1/CC1, SL219/CC4
et SL87/CC87) qui est significativement associée à une origine
clinique à la fois chez l'homme et l'animal. Il a été démontré
que CC1 et CC4 sont fortement associés aux produits laitiers, étant
plus invasifs (hypervirulents) et colonisant mieux la lumière
intestinale et une cause de plusieurs épidémies de listériose
humaine. CC87 a déjà été signalé comme prédominant dans les
isolats d'origine alimentaire et cliniques en Chine et lié à deux
épidémies dans le nord de l'Espagne.
Il est intéressant de noter que 21% des CTs
(cgMLST types -aa) détectés ici
n'étaient pas uniques à cette étude et comprenaient des génotypes
précédemment détectés dans le contexte de la surveillance de la
listériose en Europe et en Océanie. Ces résultats soulignent
l'importance des programmes de surveillance chez les animaux des
exploitations laitières,
même en l'absence de signes de maladie, pour prévenir
la transmission de
pathogènes à l'homme à travers la chaîne alimentaire. Cela serait
également particulièrement important chez les vaches lors de leur
deuxième lactation et pendant les périodes hivernales, lorsque la
prévalence de L. monocytogenes
était significativement plus élevée. Des études
antérieures
ont également montré que la prévalence de L.
monocytogenes dans les élevages
bovins était plus élevée pendant l'hiver et qu'une transition
inadéquate de la première à la deuxième lactation pouvait altérer
le système immunitaire et prédisposent à la colonisation de L.
monocytogenes. Nos résultats
soulignent également l'importance de la gestion des antibiotiques en
médecine vétérinaire, puisque la résistance à la tétracycline a
été détectée plus fréquemment dans les isolats de L.
innocua provenant des exploitations
laitières utilisant
cet antibiotique.
ici, les mêmes
génotypes ont été retrouvés
chez plusieurs animaux et surfaces au sein des mêmes exploitations
laitières,
bien que la majorité d'entre eux
(72%) étaient sporadiques. De plus, à l'exception d'un mouton, des
génotypes identiques n'ont pas pu être détectés chez le même
animal au cours de différentes saisons, ce qui suggère que la
période d'excrétion fécale est plus courte que le laps de temps
entre nos dates d'échantillonnage (14 à 135 jours). En effet, le
transport fécal de L. monocytogenes
chez les humains adultes en bonne santé est également signalé
comme transitoire et des études expérimentales antérieures chez
des moutons inoculés par voie orale avec une dose élevée de L.
monocytogenes (1010unités
formant colonies)
ont montré que l'excrétion fécale n'a duré que 10 jours. Des
études chez les ruminants sauvages et domestiques suggèrent que les
animaux peuvent héberger
silencieusement L. monocytogenes
dans les amygdales même sans rejet fécal, ce qui pourrait expliquer
pourquoi L. monocytogenes
n'a pas été détecté dans le excréments d'un troupeau de moutons
où s'est déclarée une épidémie de listériose.
En résumé, nos données montrent que (i) L.
innocua
et L.
monocytogenes
étaient les Listeria spp.
dans les fèces des ruminants laitiers et les environnements associés
aux exploitations
laitière;
(ii) les ruminants isolés peuvent héberger L.
monocytogenes seul ou avec
L. innocua
sans signes cliniques d'infection; (iii) L.
monocytogenes a pu être isolé dans
la moitié des exploitations laitières échantillonnées; (iv) les
clones hypervirulents de L.
monocytogenes CC1 et CC4, qui sont
parmi les CC les plus courants de L.
monocytogenes responsables de
l'infection humaine, représentaient 30% des isolats de L.
monocytogenes récupérés dans
cette étude et ont été principalement obtenus à partir
d'échantillons associés à l'hôte (fèces); (v) la prévalence
globale de L. monocytogenes
était plus élevée en hiver qu'en automne dans les élevages de
bovins et plus élevée en hiver et au
printemps qu'en automne dans les élevages ovins; et (vi) l'excrétion
fécale de L. monocytogenes
était intermittente et les vaches étaient plus susceptibles
d'excréter L. monocytogenes
lors de leur deuxième lactation.
Nos données sont cohérentes avec l'hypothèse
selon laquelle des exploitations laitières peuvent favoriser la
sélection de clones invasifs de L.
monocytogenes, qui sont excrétés
dans les fèces plus efficacement que les clones hypovirulents, et
constituent un réservoir de souches hypervirulentes qui peuvent
coloniser les produits laitiers. Cette étude améliore la
compréhension de Listeria
spp. la prévalence et l'écologie dans l'environnement des ruminants
laitiers et peuvent contribuer à l'élaboration de stratégies
efficaces de surveillance et de contrôle des maladies pour réduire
à la fois le
nombre de cas humains et animaux de
listériose.
*Analyses cgMLST (core
genome MLST): cgMLST (core genome MLST): Les séquences d’une série
de gènes du 'génome de base' sont obtenues par ‘Whole genome
sequencing’ et comparées à une base de données en ligne
(Institut Pasteur, Paris).
Merci à Joe Whitworth de Food safety News d'avoir communiqué cette information.
