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samedi 17 octobre 2020

Les infections à Campylobacter devraient augmenter en raison du changement climatique en Europe du Nord

Des chercheurs scandinaves ont présenté les résultats de leur étude dans
Nature Scientific reports, Les infections à Campylobacter devraient augmenter en raison du changement climatique en Europe du Nord. L'article est disponible en accès libre.

Résumé
On prévoit que le changement climatique mondial modifiera les régimes de précipitations et de température à travers le monde, affectant une gamme de maladies infectieuses et en particulier les infections d'origine alimentaire telles que Campylobacter.

Dans cette étude, nous avons utilisé des données de surveillance nationales pour analyser la relation entre le climat et la campylobactériose au Danemark, en Finlande, en Norvège et en Suède et pour estimer l'impact des changements climatiques sur les tendances futures des maladies.

Nous montrons que les incidences de Campylobacter sont liées à des augmentations de température et surtout des précipitations dans la semaine précédant la maladie, suggérant une voie de transmission non alimentaire.

Ces quatre pays pourraient connaître un doublement des cas de Campylobacter d'ici la fin des années 2080, ce qui correspond à environ 6 000 cas excédentaires par an dus uniquement aux changements climatiques.

Compte tenu de la lourde charge mondiale de la campylobactériose, il est important d'évaluer les impacts locaux et régionaux du changement climatique afin de lancer en temps opportun des stratégies de gestion et d'adaptation de la santé publique.

Les auteurs notent aussi,

Dans le contexte de l'exploration des liens entre le climat et la maladie, il est important de noter que nombre de ces associations sont probablement indirectes. Pour Campylobacter en particulier, la transmission de la maladie reflète les taux d'infection des troupeaux de poulets et le comportement humain (barbecues, activités de plein air) qui dépendent également fortement des conditions météorologiques et sont donc susceptibles d'être modifiés dans un climat changeant. En outre, l'incidence des maladies est également déterminée par la structure et la fonction des systèmes socio-économiques et de santé publique qui, compte tenu des contraintes différentes, peuvent également apparaître différentes à l'avenir.

Par rapport à cela, nos résultats surestiment probablement le nombre futur de cas, car les systèmes de santé publique s'adapteront à des incidences plus élevées en prenant des mesures plus fortes pour réduire l'incidence.

Enfin, étant donné que Campylobacter est une infection zoonotique, afin de comprendre les tendances de la maladie dans le présent et le futur, il est nécessaire d'adopter une approche One Health où les preuves et les connaissances des secteurs de la santé publique, de la sécurité des aliments, de la médecine vétérinaire et de l'environnement sont examinées ensemble.

À notre connaissance, il s'agit de l'une des premières tentatives pour décrire une association entre la campylobactériose et les facteurs climatiques en utilisant des données de surveillance de haute qualité collectées en routine et en modélisant l'effet des changements climatiques sur cette maladie aux niveaux local et national.

Dans l'ensemble, les résultats de nos modèles sont en corrélation avec les preuves publiées d'une association Campylobacter-climat. Compte tenu de leurs limites, les modèles montrent que les changements climatiques - en particulier l'augmentation des précipitations et de l'intensité des précipitations - pourraient potentiellement conduire à une augmentation de l'incidence de Campylobacter dans les pays nordiques. Compte tenu du lourd fardeau de la campylobactériose dans le monde, les effets des changements climatiques sur cette maladie sont importants à évaluer pour que les décideurs politiques identifient les zones potentiellement vulnérables ainsi que les futures stratégies de gestion de la santé publique et les mesures d'adaptation.

dimanche 3 mai 2020

L'EFSA revoit les options de maîtrise de Campylobacter chez le poulet


L’EFSA publie le 30 avril 2020 une « mise à jour et une revue des options de maîtrise de Campylobacter dans les poulets en production primaire par le groupe scientifique de l'EFSA sur les risques biologiques (BIOHAZ) ».

L'avis de l'EFSA de 2011 sur Campylobacter a été mis à jour à l'aide de données scientifiques plus récentes.

La réduction du risque relatif de campylobactériose humaine dans l'UE attribuable à la viande de poulet a été estimée pour des options de maîtrise en élevage en utilisant la FAP ou fraction attribuable au risque (fraction de tous les cas d'une maladie particulière ou d'une autre affection indésirable dans une population attribuable à une exposition spécifique -aa) pour les interventions qui réduisent la prévalence de Campylobacter dans les troupeaux de poulets, en mettant à jour l'approche de modélisation pour les interventions qui réduisent les concentrations caecales et en examinant la littérature scientifique.

Selon les analyses de la FAP calculées pour six options de maîtrise, les réductions de risque relatives moyennes qui pourraient être obtenues en adoptant individuellement chacune de ces six options de maîtrise sont estimées de façon substantielle, mais la largeur des intervalles de confiance de toutes les options de maîtrise indique un degré élevé d'incertitude sur les potentiels spécifiques de réduction des risques.

Le modèle mis à jour a entraîné des estimations d'impact plus faibles que le modèle utilisé dans l'avis précédent. Une réduction de 3 log10 des concentrations caecales de poulets a été estimée afin de réduire le risque relatif de campylobactériose humaine attribuable à la viande de poulet de 58% par rapport à une estimation supérieure de 90% dans l'avis précédent.

L'expertise des connaissances a été utilisée pour classer les options de maîtrise, pour pondérer et intégrer les différents flux de preuves et évaluer les incertitudes. Les médianes des réductions de risque relatives des options de maîtrise sélectionnées avaient des intervalles de probabilité se chevauchant largement, de sorte que l'ordre de classement était incertain: vaccination, 27% (intervalle de probabilité (IP) 90% 4-74%); additifs dans les aliments et dans l’eau de boisson, 24% (90% PI 4-60%); dépopulation partielle, 18% (90% PI 5-65%); emploi de peu de personnel mais bien formé, 16% (90% IP 5-45%); éviter les abreuvoirs qui permettent à l'eau de stagner, 15% (90% IP 4-53%); ajout de désinfectants dans l'eau potable, 14% (90% IP 3-36%); sas hygiène, 12% (90% PI 3-50%); outils dédiés à chaque poulailler, 7% (90% PI 1-18%). Il n'est pas possible de quantifier les effets des activités de maîtrise combinées car les estimations fondées sur des preuves sont interdépendantes et il existe un niveau élevé d'incertitude associé à chacune.

Résumé
Les FAP ont été calculés pour six options de maîtrise à partir de plusieurs études et comprenaient un sas hygiène, une lutte efficace contre les nuisibles, ne pas avoir d'animaux à proximité du poulailler, l’ajout de désinfectant à l'eau potable, employer peu de personnel mais bien formé et en évitant les abreuvoirs qui permettent l'eau stagnante. La variation était plus grande entre les différentes options de maîtrise que pour les mêmes options de maîtrise dans différentes études, ce qui a accru la confiance dans le potentiel d'extrapolation des résultats à l'Union européenne (UE).

Selon les analyses de la FAP, les réductions de risque relatives moyennes qui pourraient être obtenues par l’adoption de chacune de ces six options de maîtrise individuellement est substantielle, mais la largeur des intervalles de confiance de toutes les options de maîtrise indique un degré élevé d'incertitude dans les potentiels de réduction des risques spécifiques. Par exemple, l'estimation moyenne de la réduction du risque relatif pour l'option de maîtrise, ‘Ajout de désinfectants à l'eau de boisson’ se situait entre 5 (IC 95% 0,6-8,2) et 32% (IC 95% 6,0-54,9) sur la base de trois études disponibles.

L'approche de modélisation des réductions des risques relatifs obtenue par une réduction des concentrations de Campylobacter dans les cæca, précédemment utilisée dans l'avis de 2011, a été mise à jour.

Une plus grande variété de modèles de phase de consommation et un modèle dose-réponse récemment publié ont également été inclus. De plus, des données publiées récemment et plus complètes sur la relation entre les concentrations de Campylobacter dans les caeca et les échantillons de peau de carcasses de poulets correspondants ont été utilisées. Le modèle mis à jour a entraîné des estimations plus faibles de la pente de la droite de régression linéaire décrivant la relation entre les concentrations dans le contenu caecal et sur la peau. En raison de la diminution de cette pente, des estimations plus faibles ont été obtenues pour l'efficacité des options de maîtrise visant à réduire les concentrations caecales. Par exemple, pour une réduction de 2 log10 des concentrations caecales, l'estimation médiane était désormais une réduction du risque relatif de campylobactériose attribuable à la consommation de viande de poulet produite dans l'UE de 42% (IC à 95% 11-75%), alors que dans l'avis précédent, cette réduction du risque relatif était de 76 à 98% sur la base des données de quatre États membres. De même, une réduction de 3 log10 des concentrations caecales de poulet a été estimée afin de réduire le risque relatif de campylobactériose humaine attribuable à la viande de poulet de 58% (IC à 95% de 16 à 89%), par rapport à une estimation de la réduction du risque relatif de plus de 90% dans quatre États membres, ce qui a été constaté précédemment.

Dans l'ensemble, le classement des options de maîtrise a été éclairé par trois flux de preuves différents: effet des options de maîtrise pour réduire la prévalence des troupeaux (étayé par les calculs du FAP basés sur les données de la littérature), effet des options de maîtrise pour réduire les concentrations dans les caecas (étayé par les estimations obtenues par une combinaison de modèles) et l'effet des options de maîtrise directement obtenues à partir de la littérature (non soutenu par la FAP ou la modélisation). En outre, les preuves issues d'études régionales et d'expériences en laboratoire devaient être traduites en effets à l'échelle de l'UE dans les conditions de terrain, et l'application actuelle des mesures de maîtrise, ainsi que les hypothèses de modélisation, devaient être prises en compte lors de l'évaluation de l'efficacité des optionsde maîtrise. Par conséquent, un jugement d'expert était nécessaire pour classer les options de maîtrise compte tenu des incertitudes associées. Le groupe scientifique a convenu de l'utilisation d'une approche structurée, fondée sur les orientations de l'EFSA (2014) sur l'élicitation des connaissances d’experts  (ECE), pour garantir que toutes les preuves et incertitudes identifiées ont été prises en compte de manière équilibrée et pour améliorer la rigueur et la fiabilité du jugements en cause.

L'efficacité de 20 options de maîtrise, si elles sont mises en œuvre par toutes les élevages de poulets de l'UE, en tenant compte du niveau de mise en œuvre actuel, a été estimée à l'aide d'un processus ECE en deux étapes reposant sur les résultats de la modélisation des preuves scientifiques mises à jour, une revue de la littérature (y compris l'avis précédent de l'EFSA) ainsi que les connaissances et l'expérience des experts. Dans le délai imparti pour cet avis, les experts ont effectué des sélections à travers la première étape où toutes les options ont été examinées et pour la deuxième étape où huit options de maîtrise ont été classées par ordre de priorité pour une évaluation plus approfondie de l'ampleur de leurs effets.

Dans la première étape de l'ECE, pour chacune des options de maîtrise, les experts (c'est-à-dire les membres du groupe de travail et certains membres de l'EFSA) ont estimé individuellement la probabilité que la réduction du risque relatif soit supérieure à 10%. Ce 10% a été choisi pour son pouvoir discriminant à différencier l'efficacité des options de maîtrise. La réduction du risque relatif a été jugée plus susceptible d'être supérieure à 10% pour 12 options de maîtrise: sas hygiène à l'entrée du poulailler, pas d'animaux à proximité des poulaillers; employer peu de personnel mais bien formé, ajout de désinfectants à l'eau de boisson, éviter les abreuvoirs qui permettent à l'eau de stagner, nettoyage et désinfection efficaces entre les troupeaux, âge d'abattage réduit, dépopulation partielle, des outils conçus pour chaque poulailler, additifs pour l'alimentation et l'eau de boisson, bactériophages et vaccination.

Les huit options de maîtrise restantes, qui ont été jugées comme ayant une probabilité plus faible de réduire le risque relatif de plus de 10%, comprenaient: une maîrtise efficace des nuisibles, ajuster les temps d'arrêt entre les troupeaux, système de destruction des insectes volants et garder les insectes hors du poulailler, litière propre, densité de peuplement et taille du troupeau, nombre de poulaillers sur le site, élevage sélectif et structure alimentaire.

Parmi les 12 options de maîtrise sélectionnées, huit options ont été sélectionnées pour une priorisation du risque basée sur la qualité des preuves disponibles et la faisabilité pratique de la mise en œuvre de l'option de maîtrise.

Les valeurs médianes de la réduction du risque relatif des huit options de maîtrise prioritaires ont été jugées comme suit; vaccination, 27% (intervalle de probabilité (IP) 90% 4-74%); additifs dans les aliments et dans l’eau de boisson, 24% (90% PI 4-60%); dépopulation partielle, 18% (90% PI 5-65%); emploi de peu de personnel mais bien formé, 16% (90% IP 5-45%); éviter les abreuvoirs qui permettent à l'eau de stagner, 15% (90% IP 4-53%); ajout de désinfectants dans l'eau potable, 14% (90% IP 3-36%); sas hygiène, 12% (90% PI 3-50%); outils dédiés à chaque poulailler, 7% (90% PI 1-18%).Il n'a pas été possible de classer les options de maîtrise sélectionnées en fonction de leur efficacité sur la base des jugements de l’ECE car il existe un chevauchement substantiel des intervalles de probabilité, en raison des grandes incertitudes impliquées.

Il y a des avantages et des inconvénients associés à chaque option de contrôle.

Les avantages comprennent la facilité d'application (par exemple sas hygiène, ajout d'additifs aux aliments pour les animaux), l'amélioration de la santé des oiseaux (par exemple actions de biosécurité), meilleur bien-être des poulets (par exemple, dépopulation partielle), une protection croisée contre d'autres agents pathogènes (par exemple traitements de l'eau potable, additifs alimentaires).

Les inconvénients d'une option de maîtrise donnée peuvent inclure une exigence d'investissements (par exemple, si des changements structurels sont nécessaires pour installer un sas), un manque de maîtrise (par exemple, l'agriculteur peut ne pas être le propriétaire des champs adjacents au poulailler et ne peut donc pas empêcher d'autres animaux d'être à proximité), une croissance réduite des poulets due à une diminution de la consommation d'aliments et/ou d'eau (par exemple si un additif affecte les propriétés sensorielles (odeur, goût ou apparence) rendant l'aliment ou l'eau moins agréable au goût).

De multiples activités de maîtrise devraient avoir un effet plus élevé sur Campylobacter spp. d'entrer dans le poulailler et d'infecter les oiseaux. Pour minimiser le risque de colonisation par Campylobacter, toutes les activités de maîtrise liées à la biosécurité devraient être mises en œuvre intégralement. Il n'est pas possible d'évaluer de manière fiable l'effet des activités combinées de maîtrise car elles sont interdépendantes et il existe un niveau élevé d'incertitude associé à chacune. Certaines options de maîtrise s'améliorent tandis que d'autres réduisent l'effet des autres. La combinaison de deux mesures de maîtrise ciblant respectivement la prévalence et la concentration peut entraîner un effet additif si leurs cibles spécifiques ne sont pas liées.

NB : Le terme ‘control’ en anglais a été traduit par ‘maîtrise’ dans le texte proposé.

vendredi 13 décembre 2019

Surveillance et suivi de Campylobacter dans l’UE avec un focus sur la France


Annonce : S’agissant de l’information à propos des rappels de produits alimentaires, pour le moment, il ne faut pas faire confiance à nos autorités sanitaires (Ministère de l’agriculture et DGCCRF). Ces deux entités ont fait et font toujours preuve d’une incroyable légèreté et d’un manque d’informations fiables vis-à-vis des consommateurs avec comme corollaire une absence de transparence en matière de sécurité des aliments.

Suite à la publication du rapport de l’EFSA/ECDC sur « The European Union One Health 2018 Zoonoses Report », voici quelques éléments à propos de Campylobacter chez l’homme dans l’UE avec un focus sur la France.

La notification de la campylobactériose (humaine) est obligatoire dans 21 États membres de l'UE, en Islande, en Norvège et en Suisse. Dans six États membres, la notification est basée sur un système volontaire (Belgique, France, Grèce, Italie, Luxembourg et Pays-Bas) et dans un pays sur un autre système (Royaume-Uni). La Grèce a commencé à communiquer des données sur la campylobactériose en 2018. Les systèmes de surveillance de la campylobactériose couvrent l'ensemble de la population dans tous les États membres sauf dans quatre (France, Italie, Pays-Bas et Espagne). La couverture estimée du système de surveillance est de 20% en France et de 52% aux Pays-Bas.

Pour 2018, 246 571 cas confirmés de campylobactériose humaine ont été signalés par 28 États membres de l'UE, ce qui correspond à un taux de notification dans l'UE de 64,1 cas pour 100000 habitants. Il s'agit du même niveau qu'en 2017 (64,9 cas pour 100 000 habitants).

En tenant compte de ce qui a été dit plus haut, pour la France, le nombre de cas humains de campylobactériose est respectivement pour 2018, 2017, 2016, 2015 et 2014, de 7 491, 7 491, 6 579, 6 698, 6 074, 5 958.

Au niveau des pays, 13 États membres (Autriche, République tchèque, Estonie, France, Hongrie, Irlande, Italie, Lettonie, Malte, Pologne, Slovaquie, Slovénie et Espagne) ont signalé des tendances à la hausse significatives entre 2009 et 2018. Chypre et les Pays-Bas ont déclaré une baisse (p < 0,05), à la fois sur la période 2009-2018 et 2014-2018.

Campylobacter a été identifié dans 29 foyers de cas avec des preuves solides et 495 foyers de cas avec des preuves faibles avec 135 hospitalisations et aucun décès. Parmi les sources de contamination dans les foyers de cas avec des preuves solides, 10 provenaient du lait et 10 de la viande de poulet de chair, ce qui signifie que ces catégories restent les aliments les plus fréquemment signalés comme causant la campylobactériose.

Campylobacter jejuni a été rapporté dans 273 foyers de cas et 18 pour Campylobacter coli. Campylobacter a été la principale cause de foyers deca en Autriche et en Allemagne avec des chiffres en légère augmentation en 2018. De grande éclosions de plus de 100 cas de maladie ont été rapportées en Hongrie, France et Suède.

dimanche 27 octobre 2019

Revue systématique de l'attribution de l’origine de la campylobactériose humaine à l'aide du typage par MLST


Un article récent vient de paraître dans Eurosurveillance, A systematic review of source attribution of human campylobacteriosis using multilocus sequence typing ou Revue systématique de l'attribution de l’origine de la campylobactériose humaine à l'aide du typage par multilocus sequence typing (MLST).

Je serais tenté de dire étude systématique mais aussi critique de l'attribution de l’origine de la campylobactériose humaine.

Voici, pour vous, quelques extraits de l’introduction et de la discussion.

Introduction
La gastro-entérite à Campylobacter est l'une des principales causes de gastro-entérite bactérienne aiguë dans les pays à revenu élevé, faible et moyen.
Le nombre de cas confirmés a continué d'augmenter dans tous les pays de l'Union européenne (de 214 000 en 2013 à 246 000 en 2016 et 2017) et on estime que plus de 800 000 cas se produiraient chaque année aux États-Unis (données de 2000 à 2008). Dans les pays à faible revenu, Campylobacter est de plus en plus impliqué dans le ralentissement de la croissance chez les enfants de moins de 2 ans.

Les produits de poulet ont été identifiés comme un facteur de risque important d'infection humaine par diverses techniques, notamment des expériences naturelles, des études cas-témoins et, de plus en plus, par l'application de méthodes génotypiques. Les autres sources d'infection identifiées par les études épidémiologiques d'observation incluent les bovins, les ovins, les porcins, les oiseaux sauvages et l'environnement.

Parallèlement aux études épidémiologiques, on a eu de plus en plus recours à des analyses génétiques de population pour attribuer des cas humains à des sources probables. Dans ces analyses, la diversité génétique des isolats humains est comparée à celle des collections d’isolats de Campylobacter provenant de sources d’infection possibles, ce qui permet une attribution quantitative à ces sources.

Discussion
Cette revue considère que les volailles et les ruminants sont les principales sources de campylobactériose humaine dans les milieux étudiés, plus de la moitié des cas de campylobactériose humaine étant attribués à la volaille.

Les études variaient selon les populations étudiées, les algorithmes utilisés et les méthodes de choix des jeux de données de référence pour les sources potentielles, mais ont systématiquement identifié l’importance de la volaille en tant que source. Toutes les études portaient sur des pays à revenu élevé, avec un écart de preuves substantiel pour les pays à revenu faible et intermédiaire.
(...)
Cette revue systématique rassemble des preuves irréfutables selon lesquelles la volaille est la principale source de campylobactériose humaine et donne des résultats cohérents dans plusieurs pays et périodes, et utilise différents algorithmes et approches analytiques pour rassembler des données isolées à partir de sources potentielles. Les études ont principalement été réalisées en Europe et en Nouvelle-Zélande et mettent en évidence le manque de preuves pour les pays à revenu faible et intermédiaire dans lesquels Campylobacter pourrait avoir un fardeau de santé particulièrement important.

Cette revue montre également des limites marquées en termes de qualité et de comparabilité, la plupart des études n'évaluant pas leur propre précision. De plus, aucune des études ayant mesuré la précision et les biais n’a utilisé cela pour ajuster les estimations de la proportion d’infections humaines provenant de chaque source potentielle ou d’une analyse de sensibilité. L'absence d'évolution vers des méthodes optimales convenues dans le contexte de presque toutes les études utilisant les mêmes données MLST est frappante.

À mesure que les données WGS deviennent de plus en plus disponibles, permettant l'utilisation de données génétiques différentes d'une étude à l'autre, il peut être encore plus difficile d'adopter une approche cohérente ou optimale, bien que cela soit important pour assurer la comparabilité. La réalisation de tests de précision et de biais tels que l'auto-attribution et les analyses de sensibilité pour prendre en compte l'imputation imparfaite de la source sera encore plus importante. Nous recommandons que les validations, utilisant des approches telles que l'attribution d'isolats de sources connues, et l'ajustement pour les biais identifiés, soient incluses dans les futures études et rapports d'attribution de sources génétiques de population.

NB : Cet article est dédié à la DGAL, qui considère que la présence de Campylobacter y compris supérieur à 1000 UFC/g dans des carcasses de poulets de chair au stade de l’abattoir, il n’y a « aucunemesure de gestion mise en œuvre suite aux résultats ».

samedi 17 août 2019

La Lituanie enregistre une forte augmentation de cas à Campylobacter et à Salmonella cette année


« La Lituanie enregistre une forte augmentation de cas à Campylobacter et à Salmonella cette année », source Food Safety News.

Selon le Centre pour les maladies transmissibles et le sida (ULAC)le nombre de personnes atteintes d'infections à Campylobacter et à Salmonella a augmenté d'environ 20% en Lituanie depuis le début de l'année.

Un total de 434 cas de salmonellose et 630 patients atteints de campylobactériose ont été rapportés au cours des sept premiers mois de cette année.

Par rapport à la même période de l’année dernière, l’incidence de la salmonellose a augmenté de 18% et celle de la campylobactériose de 23%.

Des épidémies à Salmonella ont été enregistrées dans six établissements préscolaires, touchant 57 enfants cette année.

Tendances au fil du temps
La campylobactériose et la salmonellose sont les zoonoses d'origine alimentaire les plus couramment signalées en Lituanie et dans toute l'Europe. La Lituanie enregistre plus de 1 000 patients atteints de ces maladies chaque année, mais le nombre réel d’infections n’est pas connu car tous les patients ne consultent pas un médecin.

La plupart des gens sont infectés par la salmonellose et la campylobactériose par le biais du poulet, des œufs et de produits similaires.

Selon les données de l'ULAC, 794 patients avec une salmonellose, 925 avec une campylobactériose et 20 avec listériose ont été enregistrés en Lituanie l'année dernière.

Les infections liées à des zoonoses d'origine alimentaire ont diminué l'année dernière par rapport à 2017, la plupart étant due à la toxoplasmose, suivie de la salmonellose, de la yersiniose et de la campylobactériose.

Au cours de la dernière décennie, l'incidence de la salmonellose a diminué, la campylobactériose a augmenté, reflétant une tendance similaire dans d'autres pays de l'UE. Le nombre de cas de listériose variait de cinq en 2009 à 20 en 2018.

Problèmes rencontrés avec des volailles polonaises
Plus tôt cette année, le State Food and Veterinary Service (VMVT) a révélé qu'au cours des cinq premiers mois de 2019, il avait interdit la vente de près de 80 tonnes de poulets en raison de contrôles alimentaires renforcés.

De janvier à mai, plus de 500 échantillons de poulets frais et congelés ont été examinés et 40 ont montré une contamination microbienne par divers types de Salmonella, tels que Infantis, Livingstone, Enteritidis et Kentucky.

L'agence a constaté que la majorité des poulets non conformes microbiologiquement provenait de Pologne et était liée à deux épidémies d'origine alimentaire.

Les épidémies dans des écoles maternelles de Kaunas et de Šiauliai ont fait que 18 enfants ont développé une infection à Salmonella, à cause  de plats préparés à partir de poulets polonais contaminés.

En juillet, des cuisses de poulet congelées en provenance de Pologne et contaminées par Salmonella étaient suspectées d'avoir causé huit cas de maladie à des personnes de Šiauliai, une ville du nord de la Lituanie. Les malades faisaient partie d'une fête d’un mariage dans une maison de campagne « Lakštingalų salae » (ou Île Nightingale » en anglais).

Une enquête a révélé plus de 70 kg de matières premières non étiquetées, dont certaines avaient une date de péremption en 2017 et 2018. Les cuisses de poulet congelées avaient une date de péremption en décembre 2019.

Enfin, des contrôles effectués sur des fruits et légumes au cours du premier semestre de 2019 ont mis en évidence des résidus de pesticides anormaux dans deux échantillons d'aneth cultivé en Lituanie. Des contaminants chimiques ont été détectés dans des oranges d'Egypte, des pamplemousses de Turquie, des épinards d'Italie et du persil de Géorgie.