Angleterre : Un projet sur les phages bénéficie d'un financement accru

«Angleterre : Un projet sur les phages bénéficie d'un financement accru», source article publié dans Food safety News du 20 octobre 2023.

Les travaux menés en Angleterre pour développer des bactériophages destinés à lutter contre les maladies ont reçu un soutien financier.

La subvention de 800 000 £ (916 100 euros) du Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC) contribuera à faire progresser la production de phages pour lutter contre les maladies dans le domaine vétérinaire et à les commercialiser.

Les bactériophages sont des virus qui infectent et tuent les bactéries. Ils sont naturellement présents dans l’environnement et pourraient constituer une alternative aux antibiotiques dans certaines situations.

La professeur Martha Clokie, directrice du Leicester Center of Phage Research, et la Dr Anisha Thanki, travailleront sur le projet de deux ans qui débutera au début de l'année prochaine avec le Dr Robert Atterbury, de l'École de médecine et de sciences vétérinaires de l'Université de Nottingham.

Plus tôt cette année, Thanki a développé un produit liquide de bactériophages pour prévenir la présence de Salmonella chez les poulets de chair. Ceci sera utilisé comme étude de cas pour faire progresser la manière dont les phages peuvent être produits en toute sécurité saniataire à plus grande échelle afin de respecter les directives britanniques.

«Nous savons que le développement de bactériophages contribuera à contrer la résistance croissante aux antimicrobiens existants. Si un produit comme celui-ci était finalement commercialisé, il pourrait permettre à l’industrie agricole d’économiser des milliards de livres chaque année tout en empêchant Salmonella d’entrer dans notre chaîne alimentaire», a-t-elle déclaré.

«Cependant, nous disposons actuellement d’un produit efficace, mais aucun moyen connu de le commercialiser à plus grande échelle. Notre travail est si nouveau qu’il n’existe pas encore de protocoles, ni de réglementations permettant que cela se produise. Nous sommes très heureux que ce financement nous permette de traduire ce travail pour déterminer comment utiliser efficacement les phages à une échelle beaucoup plus grande et dans le cadre des directives réglementaires britanniques. Une fois que nous aurons fait cela, nous visons un plan réussi pour amener d’autres produits à base de phages efficaces sur le marché commercial.

Réglementation et travail jusqu'à présent

En Europe, il n’existe aucune réglementation sur l’utilisation des phages dans l’industrie alimentaire. Il est donc difficile de savoir s’ils seraient classés comme décontaminants, additifs ou auxiliaires technologiques. Certains pays de l’UE autorisent leur utilisation limitée en vertu des règles nationales. Certains produits à base de phages sont approuvés pour prévenir les agents pathogènes présents dans les aliments aux États-Unis, en Australie, en Nouvelle-Zélande et au Canada.

Il n’existe pas encore de processus d’autorisation standardisé pour l’utilisation des bactériophages au Royaume-Uni.

«Nous étudions les possibilités de réformer le processus d'approbation des produits réglementés tout en maintenant les normes de sécurité des denrées alimentaires et des aliments pour animaux. Dans le cadre de ce travail, nous envisageons de futures options de réforme qui conviendraient le mieux au marché britannique, notamment en réglementant les substances qui ne relèvent pas actuellement du cadre des produits réglementés, telles que les auxiliaires technologiques et les traitements de réduction des agents pathogènes. Nous nous efforcerons de maximiser les opportunités de réforme du droit européen retenu et de collaborer avec les parties prenantes lors de l’élaboration de notre approche», a dit un porte-parole de la Food Standards Agency (FSA).

Les chercheurs étudient les systèmes d’administration des phages à base d’aliments et d’eau.

Une étude a examiné si un cocktail de phages administré dans les aliments pouvait réduire la colonisation par Salmonella chez les poulets soumis à des épreuves expérimentales et déterminer la dose optimale.

Les résultats publiés dans la revue Emerging Microbes and Infections ont montré que l'administration de phages via l'alimentation réduisait efficacement Salmonella chez les poulets.

Atterbury a dit que le projet contribuerait à surmonter certains des principaux obstacles qui empêchent actuellement leur utilisation plus large dans des secteurs tels que l'agroalimentaire.

«La résistance aux antimicrobiens est l’un des principaux défis mondiaux de santé publique du 21e siècle. Les bactériophages sont très prometteurs dans le traitement des infections causées par des bactéries multirésistantes chez les animaux et chez l’homme.

La résistible ascension des phages dans la chaîne alimentaire

Les phages peuvent être utilisés pour maîtriser les pathogènes alimentaires du début à la fin du processus de production alimentaire. Source Enderson L., and Coffrey A./Current Opinion in Food Science, 2020. Image licensed under CC BY 4.0. .

Quels sont les avantages et les défis associés au déploiement de phages dans l’industrie alimentaire ? Découvrez-le ci-dessous avec cet article paru dans ASM News, «Phages and Food: Combatting Bacteria From Farm to Fork».

Bacteriophages are used to combat bacterial pathogens at every stage of the food production process. 🥗❌🦠 What are the benefits and challenges associated with deploying phages in the food industry? Find out here: https://t.co/mSnoRANrx2 #NFSEM #FoodSaftey

— ASM (@
ASMicrobiology) September 19, 2023

L'UE pourrait-elle être au bord d'un changement de paradigme à propos des phages ?

«L'UE pourrait-elle être au bord d'un changement de paradigme à propos des phages ?», source Poultry World du 18 juillet 2023.

Nous pourrions être au bord d'un changement de paradigme du phage dans l'Union européenne. C'est l'avis de divers experts lors d'un webinaire en ligne organisé le 11 juillet par PhageEU, une coalition d'acteurs représentant les phages dans l'industrie, la communauté scientifique et la société civile.

Un additif alimentaire basé sur la technologie des phages pourrait être autorisé par la Commission européenne dans un proche avenir, ont-ils convenu, ajoutant qu'il s'agirait d'un modèle pour le développement de produits révolutionnaires de phages chez la volaille et d'autres animaux producteurs denrées alimentaires.

Le webinaire a été l'occasion de discuter des défis techniques liés à la conception de produits bactériophages, des obstacles réglementaires en Europe pour cette nouvelle catégorie de produits ainsi que d'analyser le récent débat politique au sein des institutions européennes et les perspectives d'avenir.

Résistance antimicrobienne

En outre, les phages sont également reconnus comme un traitement alternatif pour lutter contre la résistance aux antimicrobiens, a rapporté Phage EU. Le récent webinaire a offert une discussion intéressante sur la manière dont les bactériophages feront partie du cadre pour relever des défis tels que la résistance aux antimicrobiens et l'approche One Health de l’UE.

Barrières à la conception d'un cocktail de phages

La Dr Alison Low de l'Institut Roslin de l'Université d'Édimbourg a présenté les obstacles scientifiques à la conception d'un cocktail de phages. Elle a confirmé : «La sélection d'un phage pour cibler une infection spécifique peut présenter un obstacle à la phagothérapie. Elle a ajouté que les chercheurs de l'Institut Roslin utilisent une approche axée sur la génomique pour prédire les cocktails de phages actifs à partir de la séquence d'ADN de la souche bactérienne infectante.

Un cocktail de bactériophages ciblant Salmonella dans la volaille

La Dr Elinor McCartney, directeur technique chez Pen & Tec Consulting, a présenté une étude de cas de bactériophages basée sur le processus d'enregistrement du Bafasal, un cocktail de bactériophages produit par Proteon Pharmaceuticals et utilisé comme additif alimentaire ciblant Salmonella chez la volaille. «Nous sommes au bord d'un changement de paradigme du phage dans l'UE», a dit McCartney.

À la suite d'un examen minutieux de l'EFSA et des États membres de l'UE, début 2023, l'EFSA a émis un avis confirmant l'efficacité du Bafasal contre les sérotypes de Salmonella. Bien que quelques questions demeurent, selon McCartney, «une fois que le Bafasal sera approuvé dans l'UE, il y aura un modèle pour le développement de produits phages révolutionnaires chez la volaille et d'autres animaux producteurs de denrées alimentaires, ainsi que de nombreux autres pathogènes bactériens graves chez les animaux de compagnie et les humains.»

Des phages dans le débat politique

L'intérêt croissant pour la phagothérapie parmi les décideurs européens a été confirmé par Margareta Przybyla, conseillère aux affaires publiques de l'UE et représentante à Bruxelles de Phage EU. «Alors que la résistance aux antimicrobiens et l'approche One Health de lutte contre le changement climatique et la mise en place de sous-systèmes alimentaires durables ont été reconnues par toutes les institutions de l'UE comme des questions prioritaires, il existe de plus en plus d'opportunités de positionner les phages dans le débat politique et de sensibiliser à leur potentiel», a dit Przybyla.

Accroître la sensibilisation

Dans son allocution de clôture, le professeur Jarosław Dastych, PDG de Proteon Pharmaceuticals S.A. et membre fondateur de PhageEU, a souligné qu'en ce qui concerne l'autorisation, le processus réglementaire et le débat politique, le principal obstacle est l'acceptation et la sensibilisation croissante à la technologie des phages.

NB : L’image est issue du compte Twitter de PhageEU.

Phages et aliments : lutter contre les bactéries de la ferme à la fourchette

Les phages sont utilisés pour maîtriser les pathogènes bactériens à chaque étape de la production alimentaire, de la promotion de la santé du bétail et des cultures à la destruction des pathogènes sur les aliments prêts à consommer. Quels sont les avantages et les défis associés au déploiement des phages dans l'industrie alimentaire ?

«Phages et aliments : lutter contre les bactéries de la ferme à la fourchette», source ASM News du 1er juin 2023.

Qu'elles tuent du bétail et des cultures ou qu'elles contaminent des aliments prêts à consommer, les bactéries causent de gros problèmes à l'industrie alimentaire. Pour résoudre ces problèmes, des scientifiques pensent petit. De nombreuses études ont montré que les bactériophages (c'est-à-dire les phages ou les virus qui infectent les bactéries) peuvent anéantir les bactéries problématiques dans tout le système alimentaire, du contrôle des agents pathogènes des plantes à la destruction des bactéries sur les produits, la viande et d'autres produits alimentaires. Alors que divers produits commerciaux à base de phages sont sur le marché, l'exploration continue du potentiel bactéricide des phages dans la production alimentaire et l'optimisation de leur utilisation seront essentielles pour l'expansion des applications.

Les phages peuvent être utilisés pour contrôler les pathogènes bactériens du début à la fin du processus de production alimentaire. Source : Enderson L. et Coffrey A./Current Opinion in Food Science, 2020. Image sous licence CC BY 4.0.

Que sont les phages et comment sont-ils utilisés dans l'industrie alimentaire ?

Partout où il y a des bactéries, il y a des phages, c'est-à-dire que les phages sont à peu près partout. En fait, il y a environ 100 nonillions (10³¹) de phages sur la planète. Cette population gargantuesque est incroyablement diversifiée, car chaque phage individuel possède une gamme définie d'espèces et de souches bactériennes qu'il peut infecter. Néanmoins, tous les phages ont une chose en commun : ils attaquent les bactéries, et uniquement les bactéries. Les humains, les plantes, les animaux et autres microbes ne sont pas ciblés.

En tant que tels, les phages peuvent être utilisés pour réduire les pathogènes bactériens dans tous les secteurs de la société. Par exemple, la phagothérapie implique l'isolement et le déploiement de phages qui tuent spécifiquement les bactéries provoquant une infection. Dans l'industrie alimentaire, les phages ont été explorés et appliqués pour gérer les bactéries du début à la fin des procédés de transformation des aliments.

À la ferme et au champ : applications de phages avant la récolte

La perte d'animaux et de plantes à cause de maladies bactériennes avant abattage ou au stade de la pré-récolte a des coûts économiques importants (des milliards de dollars) et menace la stabilité du système alimentaire. Dans l'élevage, les antibiotiques sont depuis longtemps la méthode de choix pour réduire les infections et promouvoir la santé animale, bien que cette pratique ait exacerbé la propagation de la résistance aux antimicrobiens. Les phages peuvent offrir une solution. En effet, des chercheurs ont découvert que 3 phages isolés des eaux usées d'une ferme laitière étaient tout aussi efficaces que les antibiotiques pour soulager les symptômes de la mammite (une infection du pis entraînant une perte annuelle estimée à 2 milliards de dollars aux États-Unis) causée par Escherichia coli résistant aux antibiotiques chez les vaches. Des résultats positifs similaires ont été démontrés pour le contrôle de divers agents pathogènes, y compris ceux qui pourraient rendre des personnes malades, comme Salmonella, E. coli O157:H7 et Campylobacter jejuni, entre autres, et chez divers animaux (par exemple, volaille, poisson, etc.).

Les phages peuvent également être utilisés pour minimiser la perte de cultures due aux maladies bactériennes. L'application de phages sélectionnés sur les graines ou les feuilles de cultures peut réduire la charge pathogène et diminuer la gravité et l'incidence de la maladie pendant la phase de croissance. Il existe déjà des produits commerciaux  à base de phages enregistrés auprès de l'Agence américaine de protection de l'environnement (EPA) conçus pour tuer les agents pathogènes qui infectent les aliments comme les tomates, les agrumes, les pommes, les poires et plus encore.

Phages pour lutter contre les agents pathogènes d'origine alimentaire

En plus de prévenir et de traiter les maladies animales et végétales, les phages sont utiles pour détecter et entraver la croissance des agents pathogènes d'origine alimentaire pendant et après la transformation des aliments. Par exemple, des scientifiques ont conçu des phages rapporteurs qui ont permis la détection basée sur la bioluminescence de l'agent pathogène d'origine alimentaire, Listeria monocytogenes, dans le lait, la charcuterie et la laitue contaminés. Les aliments peuvent également être trempés ou pulvérisés avec des solutions de phages conçues pour tuer les agents pathogènes qui les contaminent couramment. Cette application du biocontrôle par des phages (c'est-à-dire l'utilisation de phages comme agents antimicrobiens pour réduire les concentrations d'agents pathogènes dans un environnement traité) dans l'industrie alimentaire a connu le plus grand succès commercial à ce jour, avec divers produits sur le marché conçus pour combattre Salmonella, E. coli, L. monocytogenes et d'autres bactéries. Les phages peuvent également être appliqués pour stériliser les surfaces dans les installations de transformation des aliments, telles que les tapis de cnvoyage et les supports de transport des aliments, qui peuvent servir de vecteurs de contamination bactérienne.

Quels sont les avantages du biocontrôle par les phages ?

De nombreuses caractéristiques des phages les rendent utiles à des fins de lutte biologique. Thomas Denes, professeur de microbiologie alimentaire moléculaire à l'Université du Tennessee qui étudie les applications basées sur les phages pour la sécurité des aliments, a souligné la gamme d'hôtes définie des phages comme un avantage clé. Il a noté que les phages peuvent être dirigés vers des agents pathogènes tout en laissant intactes d'autres bactéries associées à un aliment (par exemple, des bactéries bénéfiques dans des aliments comme le yogourt, le kimchi et le fromage).

De plus, les phages ne sont pas limités par la concentration du eur application, ils se répliquent. «Dans l'environnement de la transformation des aliments, il existe souvent des niches ou des structures complexes qui rendent difficile l’accès à un antimicrobien», a dit Denes. «Ainsi, avoir un antimicrobien qui se réplique lorsqu'il entre en contact avec son hôte signifie que le traitement sera amplifié là où cela est nécessaire, alors que les désinfectants conventionnels peuvent avoir du mal à atteindre les zones où les agents pathogènes survivent ou se reproduisent réellement», comme les coins et les recoins de l'équipement de transformation des aliments (ou l’aliment lui-même).

Amit Vikram, chercheur principal chez Intralytix, Inc., une société de biotechnologie qui fabrique des produits à base de phages pour éliminer les agents pathogènes d'origine alimentaire, a souligné la sécurité sanitaire des phages comme un autre avantage. Par rapport aux produits chimiques dangereux qui peuvent nuire aux salariés et doivent être éliminés correctement, les phages ne présentent aucun risque pour les personnes qui travaillent avec ou qui consomment les aliments. De plus, «[les phages] ont une grande efficacité sans affecter les aliments, la texture, les propriétés et les goûts», a expliqué Vikram, ce qui les rend même attrayants pour les producteurs d'aliments soucieux d'éliminer les contaminants microbiens tout en maintenant l'intégrité et l'essence d'un aliment.

Quels sont les défis associés au biocontrôle par des phages ?

Pourtant, les phages ne sont pas parfaits. D'une part, la gamme d'hôtes définie qui rend les phages formidables peut également être une chute. «Dans des contextes de sécurité des aliments, un producteur alimentaire achèterait un produit à base de phages pour gérer le risque d'un agent pathogène cible», a dit Denes. Cependant, les phages contenus dans ce produit peuvent ne pas être efficaces contre toutes les souches d'une bactérie qui pourraient être présentes, dont il pourrait y en avoir plusieurs. Vikram a noté que l'utilisation de mélanges de phages avec différentes gammes d'hôtes peut être une façon de faire face à cette limitation, bien que de tels mélanges puissent toujours ne pas couvrir toutes les souches d'un agent pathogène qui pourraient constituer une menace.

Les phages ne se déplacent pas non plus à la recherche de leurs hôtes. Pour cette raison, il est essentiel de recouvrir adéquatement les aliments de phages pour s'assurer qu'ils rencontrent leurs agents pathogènes cibles. C'est plus facile à dire qu'à faire. «Différents aliments ont différents types de surfaces», a expliqué Vikram. «Les produits de volaille crus ont une surface plus rugueuse par rapport à une saucisse, qui a une surface plus lisse. Les légumes verts à feuilles ont une surface vraiment grande, très rugueuse et très ondulée», ce qui rend l'application du biocontrôle par des phages «extrêmement difficile», et c’est quelque chose qui nécessite une optimisation supplémentaire.

La résistance bactérienne aux phages peut également poser un problème. Denes a déclaré que le risque de résistance peut dépendre de la manière dont les phages sont utilisés : sont-ils appliqués aux aliments prêts à consommer à la fin de la production, ou les aliments sont-ils traités au début de la transformation ? Dans ce dernier cas, il peut y avoir plus de possibilités pour les phages de sélectionner la résistance. Dans cet esprit, le laboratoire de Denes a découvert que des expériences de co-évolution in vitro avec des phages et L. monocytogenes permettaient d'isoler des phages développés en laboratoire qui pourraient infecter des souches résistantes de l'agent pathogène. Les résultats suggèrent que de telles expériences pourraient aider à améliorer la gamme d'hôtes et l'efficacité du biocontrôle par des phages. L'utilisation de mélanges de phages avec différentes stratégies d'infection est également utile dans ce contexte, car ils peuvent réduire la fréquence d'émergence de mutants bactériens résistants aux phages. Dans le cas où un mutant résistant émergerait, Vikram a souligné qu'il est possible d'isoler des phages ayant une activité contre ce mutant à partir de sources naturelles.

Les bactéries peuvent résister aux phages de plusieurs manières, notamment en empêchant la liaison des phages et en interférant avec l'assemblage des particules de phage. Source : Seed D.K./PLOS Pathogens, 2015. Image sous licence CC BY 4.0.

Quelles sont les prochaines étapes?

Jusqu'à présent, les phages sont principalement utilisés pour des applications après-récolte, en particulier pour maîtriser la croissance de Salmonella dans la viande de volaille, bien que leur potentiel dans d'autres facettes du système alimentaire (par exemple, les cultures, le bétail, les produits) soit de plus en plus apprécié. Vikram a souligné que l'éducation sera essentielle pour élargir l'utilisation des phages dans l'industrie alimentaire. «Il y a encore beaucoup d'entreprises qui ne comprennent pas vraiment la technologie des phages en elle-même», a-t-il dit, décrivant le nombre d'entreprises confondant les phages avec des produits chimiques ou craignant de mettre des virus sur les aliments (rappelez-vous, ce sont des virus qui infectent uniquement bactéries). Vikram pense également que l'éducation des agences de réglementation, y compris la FDA des États-Unis, sur le fonctionnement des phages peut aider à faciliter une approbation plus rationalisée des produits à base de phages.

Pour Denes, l'avenir passe par la recherche. «Je pense que nous sommes maintenant à un stade dans le domaine de la recherche appliquée sur les phages où nous identifions des voies pour surmonter certains des défis [associés au biocontrôle par des phages], tels que l'émergence de la résistance aux phages, la diversité des conditions environnementales dont nous avons besoin. pour fonctionner et la diversité des agents pathogènes que nous devons pouvoir cibler», a-t-il dit. «Je pense que nous y arrivons en comprenant les mécanismes des interactions [phage-hôte] et en identifiant des outils, tels que évolution [ou] ingénierie du phage.

Cela étant dit, les phages ne sont pas la solution ultime pour maîtriser les pathogènes bactériens dans le système alimentaire. Ils ne sont qu'un outil de plus qui, lorsqu'il est associé à la manipulation, au stockage et à d'autres méthodes de maîtrise des aliments, aide à combattre les agents pathogènes et à assurer la sécurité des aliments, de la ferme à la fourchette.

Des phages candidats prometteurs pour le contrôle biologique de Bordetella avium

Des chercheurs ont isolé et caractérisé 7 phages ciblant Bordetella avium, la cause de la bordetellose chez la volaille. Avec leur large gamme d'hôtes et leurs effets lytiques, les phages peuvent être des candidats prometteurs pour le contrôle biologique de Bordetella avium. L’étude, «Characterization of Temperate LPS-Binding Bordetella avium Phages That Lack Superinfection Immunity», a été publiée en accès libre dans Microbiology Spectrum.

Résumé

Bordetella avium provoque une maladie des voies respiratoires supérieures hautement contagieuse chez les dindes et autres volailles avec des pertes économiques élevées. Compte tenu de la crise de la résistance aux antimicrobiens, les bactériophages (phages) peuvent constituer une approche alternative pour traiter les infections bactériennes telles que la bordetellose. Nous décrivons ici sept phages de B. avium, isolés de l'eau potable et des excréments d'élevages de poulets et de dindes. Ils ont montré une forte activité bactériolytique avec une large gamme d'hôtes et ont utilisé des lipopolysaccharides (LPS) comme récepteur hôte pour leur adsorption. Tous les phages sont des myovirus d'après leur structure observée par microscopie électronique à transmission. Les analyses de la séquence du génome ont révélé des tailles d'assemblage du génome allant de 39 087 à 43 144 bp. Leurs génomes permutés ont été organisés de manière colinéaire, avec un ordre de module conservé, et ont été conditionnés selon une stratégie de conditionnement prédite. Notamment, ils contenaient des gènes codant pour des marqueurs putatifs de la lysogénie, indicatifs de phages tempérés, malgré leur phénotype lytique. Une investigation plus approfondie a révélé que les phages pouvaient en effet subir un cycle de vie lysogène avec une fréquence variable. Cependant, les bactéries lysogènes étaient toujours sensibles à la surinfection avec les mêmes phages. Cette absence d'immunité stable contre la surinfection après lysogénisation semble être une caractéristique des phages de B. avium, ce qui est favorable en termes d'utilisation thérapeutique potentielle des phages pour le traitement de la bordetellose aviaire.

Importance

Pour maintenir l'efficacité des antibiotiques sur le long terme, des alternatives pour traiter les maladies infectieuses sont nécessaires de toute urgence. Par conséquent, les phages sont récemment revenus sur le devant de la scène car ils peuvent infecter et lyser spécifiquement les bactéries et sont d'origine naturelle. Cependant, il existe peu d'informations sur les phages qui peuvent infecter les bactéries pathogènes des animaux, comme l'agent causal de la bordetellose de la volaille, B. avium. Par conséquent, dans cette étude, les phages de B. avium ont été isolés et caractérisés de manière exhaustive, y compris l'analyse du génome entier. Bien que l'on pense phénotypiquement que les phages subissent un cycle lytique, nous avons démontré qu'ils subissent une phase lysogène, mais que l'infection ne confère pas une immunité stable à la surinfection de l'hôte. Ces résultats fournissent des informations importantes qui pourraient être pertinentes pour le contrôle biologique potentiel de la bordetellose aviaire en utilisant la phagothérapie.

Réduction de Salmonella Enteritidis chez des poulets de chair à l'aide d'un cocktail de phages, selon une étude

Une étude parue dans Frontiers in Microbiology rapporte une réduction efficace de Salmonella Enteritidis chez des poulets de chair à l'aide du cocktail de phages UPWr_S134.

Résumé

Salmonella est un agent pathogène associé à la volaille qui est considéré comme l'un des agents bactériens zoonotiques les plus importants des aliments contaminés d'origine animale, dont les produits de volaille.

De nombreux efforts sont déployés pour l'éliminer de la chaîne alimentaire, et les phages sont l'un des outils les plus prometteurs pour maîtriser Salmonella dans la production de volaille.

Nous avons étudié l'utilité du cocktail de phages UPWr_S134 pour réduire Salmonella chez des poulets de chair. À cette fin, nous avons analysé la capacité de survie de phages dans l'environnement difficile rencontré dans le tractus gastro-intestinal du poulet, qui a un pH faible, des températures élevées et une activité digestive. Les phages du cocktail UPWr_S134 ont montré la capacité de rester actifs après stockage à des températures allant de 4 à 42°C, reflétant les températures des conditions de stockage, la manipulation des poulets de chair et le corps du poulet, et ont présenté une stabilité robuste au pH. Nous avons constaté que bien que le fluide gastrique simulé ait provoqué l'inactivation des phages, l'ajout d'aliments au suc gastrique a permis le maintien de l'activité du cocktail de phages UPWr_S134. En outre, nous avons analysé l'activité anti-Salmonella du cocktail de phages UPWr_S134 chez des animaux vivants tels que des souris et des poulets de chair.

Dans un modèle d'infection aiguë chez la souris, l'application de doses de 10⁷ et 10¹⁴ UFP/ml de cocktail de phages UPWr_S134 a retardé les symptômes d'infection intrinsèque dans tous les schémas de traitement analysés. Chez les poulets infectés par Salmonella traités par voie orale avec le cocktail de phages UPWr_S134, le nombre d'agents pathogènes dans les organes internes par rapport aux oiseaux non traités était significativement plus faible. Par conséquent, nous avons conclu que le cocktail de phages UPWr_S134 pourrait être un outil efficace contre ce pathogène dans l'industrie avicole.

Conclusion

Cette étude a révélé que le cocktail de phages UPWr_S134 est un outil efficace contre Salmonella Enteritidis. Le cocktail de phages polyvalents UPWr_S134 peut maintenir son activité après stockage à des températures représentant les températures des conditions de stockage, de la manipulation des poulets de chair et du corps du poulet et présente une stabilité robuste au pH. Bien que l'activité du cocktail de phages UPWr_S134 dans le fluide gastrique simulé ait été complètement perdue, la présence d'aliments pour poulets a permis le maintien de la capacité à lutter contre Salmonella, confirmant la grande efficacité de ce cocktail. Une efficacité anti-Salmonella élevée a également été corroborée chez des souris et des poulets de chair infectés expérimentalement. Ainsi, ces observations placent le cocktail de phages UPWr_S134 parmi les agents de biocontrôle efficaces dans la lutte contre Salmonella Enteritidis chez les poulets de chair.

Quand les phages attaquent : Un taux de réussite élevé pour la phagothérapie, selon des chercheurs

«Des chercheurs israéliens signalent un taux de réussite élevé pour la phagothérapie à usage compassionnel», source article de Chris Dall paru 24 avril 2023 dans CIDRAP News.

Un traitement compassionnel permet l'utilisation thérapeutique de médicaments sans autorisation de mise sur le marché (AMM) pour des malades en impasse thérapeutique.

Des chercheurs de l’Israeli Phage Therapy Center (IPTC)  ont rapporté la semaine dernière dans Open Forum Infectious Diseases que 78% des traitements avec des bactériophages à usage compassionnel administrés aux patients depuis 2018 ont abouti à un résultat favorable.

Depuis sa création en 2018 par le Hadassah Medical Center et l'Hebrew University de Jérusalem, l'IPTC a reçu 159 demandes d'utilisation compassionnelle de la phagothérapie pour des infections qui avaient précédemment échouées, 145 en Israël et le reste aux États-Unis, en Finlande et en Allemagne. Parce qu'il n'y a pas de normalisation sur l'autorisation ou l'approbation des phages, qui sont des virus spécifiques aux bactéries qui sont apparus comme une thérapie prometteuse pour les infections résistantes aux antibiotiques, tous les traitements de phagothérapie sont considérés comme une thérapie compassionnelle.

Les infections osseuses et respiratoires étaient les indications les plus courantes des demandes de phages, et les bactéries les plus courantes étaient Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumannii et Staphylococcus aureus. Dans les cas où la phagothérapie a été administrée, la résistance aux antibiotiques représentait 50% des cas, les bactéries multirésistantes étant la raison la plus fréquente (38%) de la demande de phages.

Dans 53 cas, des correspondances potentielles de phages ont été trouvées, mais seulement 20 traitements chez 18 patients ont été administrés ; dans les 33 cas restants, la phagothérapie n'a pas été poursuivie pour diverses raisons. Sur les 18 patients ayant reçu une phagothérapie intraveineuse, 14 (78%) ont obtenu une rémission clinique et 4 (22%) ont été classés comme échec thérapeutique. Aucun effet secondaire majeur n'a été signalé.

«L'utilisation de phages avec une thérapie supplémentaire a entraîné un taux de réponse élevé», ont écrit les auteurs de l'étude. «Le succès observé a également entraîné une augmentation substantielle des demandes de phagothérapie, ce qui est difficile en raison de la disponibilité réduite des phages de qualité humaine et du manque d'indications autorisées appropriées.»

Les auteurs disent que bien que la taille de l'échantillon soit petite, ils espèrent que le partage de ces informations, ainsi que la conduite d'essais cliniques, aideront à mieux définir les indications futures de la phagothérapie et à améliorer les résultats.

Une nouvelle découverte arrête la contamination des phages

«Une nouvelle découverte arrête la contamination via un virus bactérien», source EurekAlert!

Une nouvelle découverte par des chercheurs de l'Université de Warwick pourrait aider à arrêter la contamination des bactéries par des virus, réduisant ainsi les perturbations et les coûts de l'industrie et de la recherche.

Les bactéries sont couramment utilisées dans la recherche biologique et biomédicale. Ils sont cruciaux dans la production alimentaire et les biotechnologies industrielles émergentes, où les «usines» bactériennes peuvent être utilisées pour produire de nouveaux matériaux, médicaments et produits chimiques. La biotechnologie industrielle utilise des micro-organismes comme alternatives aux processus industriels traditionnels et est cruciale pour le développement durable. Cependant, ces micro-organismes, comme nous, sont susceptibles de contracter une infection.

Les virus ciblant les bactéries, les infections par des ‘phages’, peuvent facilement contaminer les laboratoires et les usines microbiennes. Cela entraîne des temps d'arrêt importants dans la recherche et les processus industriels, qui coûtent de l'argent, ainsi que des protocoles de désinfection rigoureux et lents à rectifier.

L’étude publiée dans le Journal of the American Chemical Society montre comment un simple produit ajouté aux bactéries peut prévenir l'infection. Cette nouvelle découverte, issue des départements de chimie, de la faculté de médecine et des sciences de la vie de l'Université de Warwick, en collaboration avec la société de biosciences Cytiva Ltd, vise à développer des biotechnologies industrielles de nouvelle génération et à éliminer un goulot d'étranglement dans la recherche fondamentale.

Le professeur Matthew Gibson, Département de chimie et Warwick Medical School à l'Université de Warwick, a déclaré : «Notre équipe interdisciplinaire a examiné comment nous pouvons déployer des biomatériaux pour relever les défis de la santé et de la biotechnologie, et le problème de la contamination par les phages est un gros problème. Nous avons criblé un grand nombre de polymères (grosses molécules) et en avons trouvé un qui était particulièrement actif, empêchant les phages de tuer les bactéries et stoppant leur réplication.

«Ce qui est très excitant, c'est que le polymère que nous avons découvert est déjà produit à l'échelle industrielle et est facile à utiliser en l'ajoutant simplement aux liquides déjà utilisés pour la croissance bactérienne. Notre découverte peut aider à la fabrication durable de produits chimiques, de matériaux et de médicaments à l'aide de bactéries, en empêchant la contamination et la perte d'usines bactériennes dues à l'infection.»

Spray de phages antimicrobiens efficaces contre les bactéries d'origine alimentaire

«’Des milliards de petits soldats’ : des chercheurs exploitent des virus mangeurs de bactéries pour créer une nouvelle arme puissante contre ,la contamination et les infections», source Université McMaster.

Des chercheurs de l'Université McMaster ont créé une nouvelle arme puissante contre la contamination bactérienne et les infections.

Ils ont mis au point un moyen d'inciter les bactériophages, des virus inoffensifs qui mangent des bactéries, à se lier entre eux et à former des billes microscopiques. Ces billes peuvent être appliquées en toute sécurité sur des aliments et autres matériaux pour les débarrasser des agents pathogènes dangereux tels que E. coli O157. Chaque bille mesure environ 20 microns (un 50e de millimètre) de diamètre et est chargée de millions de phages.

L'équipe d'ingénieurs de McMaster à l'origine de l'invention, dirigée par les professeurs Zeinab Hosseinidoust, titulaire de la Chaire de recherche du Canada en bioingénierie des bactériophages, et Tohid Didar, titulaire de la Chaire de recherche du Canada en nano-biomatériaux, et l'étudiant diplômé Lei Tian, ont créé un vaporisateur utilisant rien que les microbilles.

Le nouveau super-désinfectant pulvérisable des chercheurs est sans danger pour les aliments et très efficace, comme ils le décrivent dans un article publié dans la revue Nature Communications.

«Lorsque nous le vaporisons sur les aliments, nous rassemblons essentiellement des milliards de mini-soldats pour protéger nos aliments de la contamination bactérienne», explique Tian, qui a dirigé l'étude dans le cadre de sa recherche doctorale.

La recherche s'appuie sur le même travail de chimie que le laboratoire d'Hosseinidoust avait précédemment utilisé pour déclencher la connexion des phages les uns aux autres en quantités suffisantes pour former un gel.

«Ils s'enchaînent comme des pièces microscopiques de Lego», dit-elle. «Cette structure naturelle organisée les rend beaucoup plus durables et plus faciles à conditionner, à stocker et à utiliser.»

Avant l'introduction de la pénicilline dans les années 1940, la recherche sur les désinfectants et les thérapies à base de phages était très prometteuse, mais l'intérêt pour le développement de leur potentiel s'est estompé une fois que les antibiotiques à base de pénicilline sont arrivés sur le marché. La résistance aux antimicrobiens sapant désormais le pouvoir des antibiotiques existants, la recherche sur les phages suscite un nouvel intérêt intense.

Lorsque les phages, qui se produisent naturellement dans le corps et dans l'environnement, entrent en contact avec les bactéries cibles, ils se multiplient, augmentant de manière explosive leur pouvoir antimicrobien au cours de leur action.

«C'est une réaction en chaîne, créant une réponse dynamique et continue qui est encore plus puissante que les antibiotiques», explique Didar.

«Aucun autre produit antibactérien, pas même l'eau de Javel, n'a les propriétés spéciales des phages.»

Un autre avantage majeur de l'utilisation des phages dans l'agriculture et la production alimentaire est qu'ils peuvent être dirigés très spécifiquement pour éliminer les souches de bactéries nocives sans tuer les bactéries bénéfiques qui améliorent le goût, l'odeur et la texture des aliments.

Le nouveau spray de phages a un potentiel prometteur pour une application commerciale, selon les chercheurs, d'autant plus que les phages ont déjà obtenu l'approbation de la Food and Drug Administration des États-Unis pour une utilisation dans les aliments.

Le document de recherche montre que le matériau pulvérisable peut éliminer E. coli O157 dans la laitue et la viande, qui sont souvent à l'origine d'épidémies.

Les chercheurs affirment que la même approche peut facilement être utilisée contre d'autres bactéries qui causent des intoxications alimentaires, telles que Salmonella et Listeria, individuellement ou en combinaison.

Les pulvérisations de phages pourraient être utilisées dans la transformation, le conditionnement et le nettoyage des aliments, et même comme traitement de l'eau d'irrigation et des équipements, arrêtant la contamination à la source, selon les chercheurs.

La recherche, achevée sous l'égide du McMaster’s Global Nexus for Pandemics and Biological Threats, combine et étend les travaux antérieurs du laboratoire de Hosseinidoust avec les travaux que Didar et d'autres collègues de McMaster avaient réalisés pour créer des capteurs et des surfaces microscopiques pour détecter et repousser les agents pathogènes alimentaires.

Le groupe prévoit ensuite de tester les applications prometteuses du nouveau matériel en médecine, où il pourrait être utilisé pour désinfecter les plaies, par exemple. Les applications médicales mettront plus de temps à prouver leur innocuité et leur efficacité, mais un produit conçu pour la désinfection dans la transformation des aliments pourrait arriver sur le marché beaucoup plus rapidement.

NB : La photo est extraite de l'article paru dans Nature Communications.

Des souches de Escherichia coli rendues résistantes aux phages développées pour réduire l'échec de la fermentation

«Des souches de Escherichia coli rendues résistantes aux phages développées pour réduire l'échec de la fermentation», source KAIST News.

Une stratégie systématique basée sur l'ingénierie du génome pour développer des souches de Escherichia coli résistantes aux phages a été développée avec succès grâce aux efforts de collaboration d'une équipe dirigée par le professeur Sang Yup Lee, le professeur Shi Chen et le professeur Lianrong Wang. Cette étude de Xuan Zou et al. a été publié dans Nature Communications en août 2022 et présenté dans Nature Communications Editors’ Highlights. La collaboration entre la School of Pharmaceutical Sciences à Wuhan University, la First Affiliated Hospital of Shenzhen University et le KAIST Department of Chemical and Biomolecular Engineering a fait une avancée importante dans l'industrie du génie métabolique et de la fermentation, car elle résout un gros problème d'infection par les phages. entraînant un échec de la fermentation.

L'ingénierie métabolique des systèmes est un domaine hautement interdisciplinaire qui a rendu possible le développement d'usines de cellules microbiennes pour produire divers bioproduits, notamment des produits chimiques, des carburants et des matériaux, de manière durable et respectueuse de l'environnement, réduisant l'impact de l'épuisement des ressources mondiales et du changement climatique. Escherichia coli est l'une des souches microbiennes de base les plus importantes, compte tenu de ses nombreuses applications dans la production biosourcée d'une gamme variée de produits chimiques et de matériaux. Avec le développement d'outils et de stratégies pour l'ingénierie métabolique des systèmes utilisant E. coli, une usine cellulaire hautement optimisée et bien caractérisée jouera un rôle crucial dans la conversion de matières premières bon marché et facilement disponibles en produits de grande valeur économique et industrielle.

Cependant, le problème constant de la contamination par les phages dans la fermentation impose un impact dévastateur sur les cellules hôtes et menace la productivité des bioprocédés bactériens dans les installations de biotechnologie, ce qui peut entraîner un échec généralisé de la fermentation et une perte économique incommensurable. Les systèmes de défense contrôlés par l'hôte peuvent être développés en solutions de génie génétique efficaces pour lutter contre la contamination par les bactériophages dans la fermentation à l'échelle industrielle ; cependant, la plupart des mécanismes de résistance ne restreignent que étroitement les phages et leur effet sur la contamination par les phages sera limité.

Il y a eu des tentatives pour développer diverses capacités/systèmes d'adaptation environnementale ou de défense antivirale. Les efforts de collaboration de l'équipe ont permis de développer un nouveau système de défense de type II par phosphorothioation (Ssp pour single-stranded DNA phosphorothioation) de l'ADN simple brin dérivé de E. coli 3234/A, qui peut être utilisé dans plusieurs souches industrielles de E. coli (par exemple, E. coli K-12, B et W) pour fournir une large protection contre divers types de coliphages d'ADNdb. De plus, ils ont développé une stratégie systématique d'ingénierie du génome impliquant l'intégration génomique simultanée du module de défense Ssp et des mutations dans des composants essentiels au cycle de vie du phage. Cette stratégie peut être utilisée pour transformer des hôtes E. coli très sensibles aux attaques de phages en souches ayant de puissants effets de restriction sur les bactériophages testés. Cela confère aux hôtes une forte résistance contre un large spectre d'infections par les phages sans affecter la croissance bactérienne et la fonction physiologique normale. Plus important encore, les souches résistantes aux phages modifiées résultantes ont maintenu les capacités de production des produits chimiques et des protéines recombinantes souhaités même sous des niveaux élevés de provocation par cocktail de phages, ce qui offre une protection cruciale contre les attaques de phages.

Il s'agit d'une avancée majeure, car elle fournit une solution systématique pour l'ingénierie de souches bactériennes résistantes aux phages, en particulier les souches de bioproduction industrielle, afin de protéger les cellules d'un large éventail de bactériophages. Compte tenu de la fonctionnalité de cette stratégie d'ingénierie avec diverses souches de E. coli, la stratégie rapportée dans cette étude peut être largement étendue à d'autres espèces bactériennes et applications industrielles, ce qui sera d'un grand intérêt pour les chercheurs du milieu universitaire et de l'industrie.

Figure. Un modèle schématique de la stratégie systématique d'ingénierie des souches industrielles de E. coli sensibles aux phages en souches avec de larges activités antiphages. Grâce à l'intégration génomique simultanée d'un module de défense Ssp basé sur la phosphorothioation de l'ADN et de mutations de composants essentiels au cycle de vie du phage, les souches de E. coli modifiées présentent une forte résistance contre divers phages testés et maintiennent les capacités de production d'exemples de protéines recombinantes, même sous des niveaux élevés de challenge par un cocktail de phages.

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Phagothérapie : un modèle pour prédire son efficacité face aux bactéries pathogènes

«Phagothérapie : un modèle pour prédire son efficacité face aux bactéries pathogènes», source communiqué de l’Inserm du 17 mai 2022.

L’antibiorésistance constitue aujourd’hui un défi majeur de santé publique, associé à une mortalité importante. Les bactériophages, ces virus «tueurs» de bactéries, pourraient constituer une solution afin de lutter contre les pathogènes résistants aux antibiotiques, mais leur développement clinique se heurte à plusieurs obstacles. Pour lever les freins, des chercheurs et chercheuses de l’Inserm, Université Sorbonne Paris Nord et Université Paris-Cité au sein du laboratoire IAME, en étroite collaboration avec des scientifiques de l’Institut Pasteur et de l’AP-HP, ont développé un modèle qui permet de mieux prédire l’efficacité de la phagothérapie. Il pourrait être utilisé pour mettre au point des essais cliniques plus robustes. Les résultats sont publiés dans la revue Cell Reports.

La découverte des antibiotiques a révolutionné l’histoire de la médecine au 20e siècle, permettant de lutter efficacement contre des bactéries pour lesquelles il n’y avait jusqu’alors pas de traitement. Cependant, l’antibiorésistance – phénomène durant lequel les bactéries deviennent résistantes aux antibiotiques suite à une utilisation massive et répétée de ces médicaments – est devenue un problème de santé publique majeur au cours des dernières décennies. On estime que ces bactéries résistantes sont responsables chaque année de 700 000 décès à travers le monde. Or, la découverte de nouveaux agents antibactériens stagne depuis plusieurs années.

Dans ce contexte, la phagothérapie a récemment suscité un regain d’intérêt. Cette approche thérapeutique se fonde sur l’utilisation de bactériophages qui ciblent et détruisent les bactéries pathogènes, mais sont incapables d’infecter l’être humain. Si le concept existe depuis longtemps, son développement clinique a été entravé par plusieurs limites.

Afin de lever certains de ces obstacles, l’équipe de recherche menée par le chercheur Inserm Jérémie Guedj, en collaboration avec l’équipe de chercheurs de l’Institut Pasteur, dirigée par Laurent Debarbieux, a développé un nouveau modèle mathématique qui permet de mieux définir les interactions entre les bactériophages et la bactérie pathogène Escherichia coli chez l’animal et d’identifier les paramètres clés qui conditionnent l’efficacité de la phagothérapie.

Accompagner le développement clinique

Plusieurs données issues d’expériences in vitro et in vivo ont été utilisées pour construire ce modèle. Les chercheurs et chercheuses se sont notamment appuyés sur les paramètres d’infection des bactériophages déterminés au laboratoire (par exemple la durée du cycle infectieux des bactéries, le nombre de virus libérés quand une bactérie est détruite…) et sur des informations collectées lors d’expériences réalisées à l’aide d’un modèle d’infection pulmonaire chez la souris.

Une partie des animaux avait été infectée par une souche d’E. coli bioluminescente (pour mieux la suivre dans l’organisme). Parmi eux, certains avaient été traités avec des bactériophages, selon différentes doses et voies d’administration. Les quantités de bactéries et de bactériophages ainsi mesurées au cours du temps ont permis d’alimenter le modèle mathématique et de tester quels étaient les paramètres les plus importants pour obtenir une phagothérapie efficace.

En utilisant leur modèle, les scientifiques montrent que la voie d’administration est un paramètre important à prendre en compte pour améliorer la survie des animaux: plus celle-ci permet une arrivée rapide des bactériophages au contact des bactéries, plus elle est efficace. Dans le modèle animal, la phagothérapie par voie intraveineuse était ainsi moins performante que la voie intra-trachéale car le nombre de bactériophages atteignant les poumons était plus faible. Par contre, par voie intra-trachéale, le modèle suggère que la dose de médicament donnée conditionne peu l’efficacité de cette thérapie.

Autre point important : cette modélisation intègre des données portant sur la réponse immunitaire des animaux, dans le contexte de la phagothérapie. Le modèle confirme et étend le principe que les bactériophages agissent en synergie avec le système immunitaire des animaux infectés, permettant une élimination plus efficace des bactéries pathogènes.

«Dans cette étude, nous proposons une nouvelle approche pour rationaliser le développement clinique de la phagothérapie, qui connait encore à l’heure actuelle des limites. Notre modèle pourrait être réutilisé pour prédire l’efficacité de n’importe quel bactériophage contre la bactérie qu’il cible, dès lors qu’un nombre limité de données in vitro et in vivo sont disponibles sur son action. Au-delà de la phagothérapie, le modèle pourrait aussi être utilisé pour tester des thérapies anti-infectieuses fondées sur l’association entre bactériophages et antibiotiques», conclut Jérémie Guedj.

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Création de cocktails de phages efficaces pour la maîtrise des pathogènes

Les effets de la maîtrise des pathogènes par différentes combinaisons de phages.

«Création de cocktails de phages efficaces pour la maîtrise des pathogènes», source commentaires des éditeurs de la revue Applied and Environmental Microbiology. 

Li et al. (e02323-21) ont créé des mutation, chez le pathogène du poisson Vibrio alginolyticus qui confèrent une résistance aux infections à un phage unique. Les cellules résistantes ont été utilisées pour sélectionner au hasard des phages avec différentes stratégies d'infection. Le cocktail de phages a supprimé la résistance de l'hôte, ce qui rend cette méthode utile pour développer des thérapies efficaces par des phage. 

«Une nouvelle méthode pour créer des cocktails de phages efficaces via l'utilisation de bactéries résistantes aux phages», source article paru dans Applied and Environmental Microbiology.

Résumé

La mutation antiphage rapide de pathogènes est un grand défi souvent rencontré dans l'application des phages dans l'aquaculture, l'élevage et la prévention des maladies humaines. Un cocktail composé de phages avec différentes stratégies d'infection peut mieux supprimer la résistance aux antiphages des pathogènes. Cependant, la sélection aléatoire de phages avec différentes stratégies d'infection prend du temps et demande beaucoup de travail. Ici, nous avons vérifié que l'utilisation d'un pathogène résistant évoluait rapidement sous une infection à un seul phage, car le nouvel hôte peut facilement obtenir des phages avec différentes stratégies d'infection. Nous avons isolé au hasard deux phages lytiques (c'est-à-dire Va1 et Va2) qui infectent le pathogène opportuniste Vibrio alginolyticus. Qu'ils aient été utilisés seuls ou en combinaison, le pathogène a facilement acquis une résistance. En utilisant un pathogène muté résistant à Va1 comme nouvel hôte, un troisième phage lytique Va3 a été isolé. Ces trois phages ont un cycle d'infection et une capacité lytique similaires, mais des morphologies et des informations génomiques assez différentes. Notamment, le phage Va3 est un phage jumbo contenant un génome plus grand et plus complexe (240 kb) que Va1 et Va2. De plus, les 34 ARNt et plusieurs gènes codant pour les protéines de liaison aux récepteurs et les protéines de synthèse NAD+ dans le génome Va3 impliquaient sa stratégie d'infection assez différente de celle de Va1 et Va2. Bien que le pathogène de type sauvage puisse encore développer facilement une résistance sous une infection à un seul phage par Va3, lorsque Va3 a été utilisé en combinaison avec Va1 et Va2, la résistance au pathogène a été fortement supprimée. Cette étude fournit une nouvelle approche pour l'isolement rapide des phages avec différentes stratégies d'infection, ce qui sera très bénéfique lors de la conception de cocktails de phages efficaces.

Importance

La mutation antiphage rapide de pathogènes est un grand défi souvent rencontré en phagothérapie. L'utilisation d'un cocktail composé de phages avec différentes stratégies d'infection permet de mieux pallier ce problème. Cependant, la sélection aléatoire de phages avec différentes stratégies d'infection prend du temps et demande beaucoup de travail. Pour résoudre ce problème, nous avons développé une méthode pour obtenir efficacement des phages avec des stratégies d'infection disparates. L'astuce consiste à utiliser les caractéristiques des bactéries pathogènes susceptibles de développer une résistance à l'infection par un seul phage pour obtenir rapidement le variant antiphage du pathogène. L'utilisation de ce variant antiphage comme hôte permet d'isoler efficacement d'autres phages avec différentes stratégies d'infection. Nous avons également vérifié la fiabilité de cette méthode en démontrant les effets idéaux de contrôle des phages sur deux pathogènes et ainsi révélé son importance potentielle dans le développement de thérapies par les phages.

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