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mardi 27 octobre 2020

Un rapport est publié après une épidémie de cas de listériose dans des hôpitaux d'Angleterre

Des recommandations formulées dans un examen visent à améliorer la qualité, la valeur nutritionnelle et la sécurité des aliments servis dans les hôpitaux anglais suite à une
éclosion à Listeria liée à des sandwichs en 2019.

Il est toujours utile, voire très utile, de lire un rapport sur ce type de question ainsi que les propositions et les éléments de preuves apportées ...

« La FSA salue les résultats d'un examen des aliments à l'hôpital », source Food Standards Agency (FSA) du 26 octobre 2020.

L'examen indépendant des aliments pour les hôpitaux du NHS a été annoncé par le secrétaire à la Santé et aux Affaires sociales, Matt Hancock, à la suite d'une épidémie de listériose en 2019.

Le rapport final, publié, comprend un certain nombre de recommandations visant à améliorer la sécurité sanitaire des aliments, basées en grande partie sur des preuves fournies par la FSA. Ces recommandations incluent la présence de spécialistes dédiés à la sécurité des aliments dans chaque hôpital la mise en œuvre par les hôpitaux d'un système robuste de management de la sécurité aliments et une fonction obligatoire pour signaler les préoccupations dans toute la chaîne alimentaire des hôpitaux. Fondamentalement, les NHS Trusts doivent également reconnaître qu'ils sont des exploitants du secteur alimentaire et qu'ils doivent s'assurer que les aliments qu'ils fournissent sont sûrs.

Emily Miles, directrice générale de la Food Standards Agency, a déclaré:
«Nous avons vu les conséquences dévastatrices que peuvent avoir les épidémies de maladies d’origine alimentaire, et nous nous félicitons des recommandations visant à améliorer la sécurité des aliments dans ce rapport.»
«Il est d’une importance vitale que tous les NHS Trusts reconnaissent leurs responsabilités légales pour s’assurer que les aliments qu’ils vendent et servent sont sûrs.»
«Nous sommes impatients de soutenir le document pour voir ces recommandations mises en œuvre dans les hôpitaux à travers l'Angleterre.»
Le comité d'examen était présidé par Philip Shelley, ancien chef de l'Association des traiteurs hospitaliers et responsable de la restauration pour Taunton and Somerset NHS Foundation Trust, avec le restaurateur et célèbre chef Prue Leith agissant en tant que conseiller indépendant. Les membres du groupe comprenaient la FSA, Public Health England, des représentants du NHS et un certain nombre d'associations de l'industrie de la restauration et de l'alimentation. L'examen a examiné de nombreux aspects différents de l'alimentation hospitalière et a formulé des recommandations sur l'amélioration des choix, la valeur nutritionnelle et la réduction du gaspillage alimentaire.

Pour coïncider avec la publication du rapport, la FSA a publié aujourd'hui son ensemble de preuves qui a servi à éclairer les discussions du groupe sur la sécurité alimentaire. Les preuves présentent les principales conclusions d’examens détaillés des précédentes épidémies de maladies d’origine alimentaire dans les hôpitaux et présentent les conseils de la FSA sur les mesures à prendre pour améliorer la sécurité sanitaire des aliments.

Des bactéries hospitalières résistantes aux antibiotiques persistent même après un nettoyage en profondeur, selon une étude de génomique

« Des bactéries hospitalières résistantes aux antibiotiques persistent même après un nettoyage en profondeur, selon une étude de génomique », source Université de Cambridge.

Des scientifiques ont utilisé le séquençage du génome pour révéler la mesure dans laquelle une bactérie gastro-intestinale résistante aux antibiotiques peut se propager dans un hôpital, soulignant le défi auquel les hôpitaux sont confrontés pour contrôler les infections.

Enterococcus faecium est une bactérie que l'on trouve couramment dans le tractus gastro-intestinal, où elle réside généralement sans causer de problèmes à l'hôte. Cependant, chez les patients immunodéprimés, elle peut entraîner une infection potentiellement mortelle.

Au cours des trois dernières décennies, des souches sont apparues résistantes aux antibiotiques de première ligne, y compris l'ampicilline et la vancomycine, limitant les options de traitement, et particulièrement inquiétant ces souches sont souvent celles trouvées dans les infections nosocomiales à E. faecium.

Une équipe de scientifiques de l'Université de Cambridge et de la London School of Hygiene and Tropical Medicine a lancé une approche combinant des informations épidémiologiques et génomiques pour cartographier la propagation des bactéries dans les établissements de santé. Cela a aidé les hôpitaux à identifier les sources d'infection et à orienter les mesures de contrôle des infections.

Dans une étude publiée aujourd'hui dans Nature Microbiology, l'équipe a appliqué cette technique à la propagation de E. faecium résistant aux antibiotiques en milieu hospitalier.

Le Dr Theodore Gouliouris du Département de médecine de l'Université de Cambridge, et coauteur de l'étude, a déclaré: «Nous savons depuis plus de deux décennies que les patients hospitalisés peuvent attraper et propager E. faecium résistant aux antibiotiques. Pour empêcher sa propagation, nous devons comprendre où vit la bactérie - ses «réservoirs» - et comment elle se transmet.

«La plupart des études à ce jour se sont appuyées sur la culture des bactéries à partir d'échantillons. Mais comme nous l'avons montré, le séquençage du génome entier - en examinant l'ADN de la bactérie - combiné à un échantillonnage détaillé des patients et de l'environnement peut être un outil puissant pour nous aider à cartographier sa propagation et à informer des moyens de prévenir de nouvelles épidémies.»

L'équipe a suivi 149 patients en hématologie admis à l'hôpital d'Addenbrooke, Cambridge University Hospitals NHS Foundation Trust, sur une période de six mois. Ils ont prélevé des échantillons de selles des patients et des écouvillons dans l'environnement hospitalier et les ont cultivés pour E. faecium.

L'analyse génomique de la bactérie a été beaucoup plus efficace pour identifier E. faecium nosocomial chez 101 patients pouvant être suivis, l'analyse génomique a révélé que les deux tiers des patients avaient contracté E. faecium, contre moins de la moitié en utilisant uniquement des méthodes de culture.

Un peu moins de la moitié (48%) des écouvillons prélevés en milieu hospitalier étaient positifs pour E. faecium résistant à la vancomycine. Cela comprenait 36% des dispositifs médicaux, 76% des zones non tactiles telles que les bouches d'aération, 41% des lits et 68% des toilettes communes testées.

Les chercheurs ont montré que même un nettoyage en profondeur ne pouvait pas éradiquer les bactéries. L'hôpital a entrepris un nettoyage en profondeur dans un service sur une période de trois jours au cours de l'étude, lorsque les patients ont été déplacés ailleurs; cependant, lorsque l'équipe a échantillonné des emplacements avant le retour des patients dans le service, elle a constaté que 9% des échantillons étaient toujours positifs pour la bactérie. Dans les trois jours suivant le retour des patients dans le service, environ la moitié des sites échantillonnés ont été testés positifs.

Les trois quarts (74%) des patients (111/149) étaient porteurs du clade A1 - une souche multi-résistante de E. faecium couramment observée dans les hôpitaux, résistante à l'antibiotique ampicilline et qui acquiert fréquemment une résistance à la vancomycine. Parmi ces 111 patients, 67 avaient des liens épidémiologiques et génomiques forts avec au moins un autre patient et/ou leur environnement direct.

«Le fait que ces cas étaient tous liés à un autre patient ou à leur environnement suggère fortement qu'ils avaient attrapé la bactérie multi-résistante pendant leur séjour à l'hôpital», a déclaré le premier auteur, le Dr Francesc Coll de la London School of Hygiene and Tropical Medicine.

Une analyse génomique plus poussée a montré qu'au sein de cette souche multi-résistante, il y avait plusieurs sous-types (définis par leur similitude génétique). Cependant, il n'était pas rare qu'un patient soit porteur de plus d'un sous-type, ce qui - sans analyse génomique détaillée - pouvait confondre les tentatives d'identification de la voie de transmission d'une infection.

Notamment, malgré la circulation de pas moins de 115 sous-types, 28% des acquisitions de E. faecium ont été provoquées par seulement deux sous-types de surinfecteurs. Les auteurs n'ont trouvé aucune preuve de résistance ou de tolérance aux désinfectants courants pour expliquer le succès de ces sous-types.

Six patients de l’étude ont contracté une «infection invasive», ce qui signifie qu’ils étaient porteurs de E. faecium de manière asymptomatique dans leur intestin, mais ont ensuite développé une infection symptomatique. En comparant les génomes des souches infectieuses et intestinales, les auteurs ont déterminé que les infections invasives à E. faecium provenaient de l’intestin des patients.

«Notre étude s'appuie sur des observations antérieures selon lesquelles des souches résistantes aux antibiotiques de E. faecium peuvent persister dans l'environnement hospitalier malgré un nettoyage standard - nous étions encore surpris de constater à quel point l'effet du nettoyage en profondeur était de courte durée», a ajouté le Dr Gouliouris.

«Nous avons trouvé des niveaux élevés de E. faecium adaptés à l'hôpital malgré l'utilisation de produits de nettoyage et des procédures qui se sont avérées efficaces contre le microbe. Il souligne à quel point il peut être difficile de lutter contre les flambées dans les hôpitaux

L'auteur principal, le professeur Sharon Peacock, du Département de médecine de l'Université de Cambridge, a ajouté: «Les taux élevés d'infection par E. faecium pharmacorésistant dans des groupes de patients vulnérables spécifiques et sa capacité à échapper aux mesures de nettoyage posent un défi important au contrôle des infections. Le dépistage des patients, la fourniture adéquate d'installations d'isolement et de toilettes attenantes, des procédures de nettoyage améliorées et plus fréquentes et des pratiques d'hygiène plus strictes par les agents de santé seront tous nécessaires pour enrayer cette épidémie mondiale.»

«Mais c'est aussi un signe de l'urgence dont nous avons besoin pour lutter contre l'utilisation inappropriée d'antibiotiques dans le monde, ce qui est largement reconnu comme constituant une menace catastrophique pour notre santé et notre capacité à contrôler les infections.»

La recherche a été financée par le ministère de la Santé et Wellcome.

vendredi 25 septembre 2020

Royaume-Uni: Des Listeria retrouvés depuis des années sur le site d'un producteur de sandwichs

Un nouvel exemple de Listeria persistants sur des surfaces ?

Quoi qu’il en soit voici que « Listeria est retrouvé depuis des années sur le site d'un producteur de sandwichs », source article de Joe Whitworth paru le 25 septembre 2020 dans Food Safety News.

L'usine d'un producteur de sandwichs en Angleterre lié à des cas de maladie a été contaminée par Listeria pendant près de trois ans, a révélé un rapport sur l'incident.

En juillet 2017, Listeria monocytogenes a été isolé du sang d'une personne de 53 ans dans un hôpital du Yorkshire et Humberside avec un problème de santé sous-jacent. L'homme avait consommé des sandwichs préparés par l'entreprise pendant son séjour à l'hôpital au moins 12 fois au cours des trois semaines précédant la maladie.

L'isolat était génétiquement impossible à distinguer de ceux des sandwichs et des salades produits par la société basée à Bradford qui approvisionnait les hôpitaux du National Health Service (NHS), d'autres institutions et distributeurs dans tout le pays.

Listeria monocytogenes a été détecté dans les produits de l'entreprise entre décembre 2016 et août 2017, dans les locaux du fabricant et à partir d'un échantillonnage interne de deux hôpitaux. L'entreprise et les autorités locales tentaient de contrôler la bactérie sur le site de production depuis décembre 2016. La souche de Listeria monocytogenes impliquée a été retrouvée sur le site et dans les produits jusqu'en juillet 2019.

La société a continué à approvisionner les hôpitaux du NHS mais s'est arrêtée en septembre 2019 pour des raisons commerciales, selon le rapport. Food Safety News comprend que l'entreprise mentionnée est Tiffin Sandwiches. La société n'a pas répondu à des demandes de commentaires.

Dans son rapport stratégique pour l'année se terminant le 31 mai 2019, Tiffin Sandwiches a indiqué que depuis la fin de cet exercice, il avait cessé d'approvisionner le NHS.

« L'entreprise a consulté Public Health England et la Food Standards Agency et, suite à ces consultations, a proposé ce changement. Compte tenu de toutes les informations dont dispose l'entreprise, il a été décidé de cesser la fourniture de produits aux hôpitaux. »

Contamination inférieure aux exigences légales
Une équipe de gestion des incidents a été mise en place en août et fermée en novembre 2017. Ce groupe impliquait Public Health England, la Food Standards Agency et le Bradford Council. Au cours de l'enquête, la récupération de Listeria monocytogenes auprès de l'entreprise et des hôpitaux a été réduite.

Tous les échantillons d'aliments testés, lorsqu'ils sont mis sur le marché et pendant la durée de conservation, présentaient des niveaux de Listeria monocytogenes inférieurs à la limite légale de 100 unités formant colonie par gramme.

La souche impliquée a été isolée après la fin de l'enquête en janvier, février, mai, août, octobre, novembre et décembre 2018 ainsi qu'en janvier, mai et juillet 2019.

L'entreprise produisait 40 000 sandwichs par jour, dont 12 000 pour le NHS. L'usine a fabriqué 88 sandwichs, salades et autres aliments différents avec une durée de conservation de deux jours. Ils ont fourni les 213 points de vente du NHS à travers le pays et 1 250 autres établissements, y compris des universités, des stations-service et des gares. L'entreprise était un fournisseur du Support, Training & Services (STS) approuvé par le NHS, et des audits récents ont montré qu'elle fonctionnait selon des normes élevées.

Les procédures étaient généralement bonnes, mais des changements d'agencement pour étendre la zone de production avaient été mis en œuvre et des problèmes ont été identifiés, tels que les systèmes de désinfection des machines à laver. Les chariots à roulettes n'ont pas été désinfectés avant de passer des zones à faible risque vers les zones à haut risque. Le banc de changement de chaussures extérieur-intérieur était également une préoccupation. L'un des étages s'écoulait d'une zone à risque faible vers une zone à risque élevé.

Prélèvements négatifs par un laboratoire commercial
L'entreprise a remplacé la machine à laver les salades, amélioré le revêtement de sol et le système de drainage avec des siphons de sol nettoyés tous les jours et nettoyés en profondeur le week-end. Il lui a également été demandé de laver le réservoir à beurre avant utilisation.

Listeria monocytogenes n'avait été détecté dans aucun des échantillons envoyés par la société à un laboratoire commercial accrédité par l'UKAS. Après l'incident, le producteur a fait des tests effectués par le laboratoire PHE Food Water & Environmental (FW&E) à York.

« La société a eu la fausse impression que son système de management de la sécurité des aliments contrôlait la bactérie puisque tous les échantillons testés par le laboratoire commercial étaient satisfaisants et ont été signalés comme ne contenant pas de Listeria monocytogenes », selon le rapport.

Entre octobre 2016 et juin 2017, le laboratoire PHE York FW&E a testé des échantillons de sandwichs provenant de deux hôpitaux du Yorkshire et de Humber et il a isolé Listeria monocytogenes de 38 échantillons sur 297 de salades, sandwichs et autres produits. Listeria a été récupérée à partir de 84 des 861 échantillons d'aliments préparés par l'entreprise et collectés dans les hôpitaux, notamment un sandwich à la mayonnaise aux œufs et au thon, du maïs prêt à consommé et de la laitue lavée.

Risque lié aux sandwichs à l'hôpital
Des enquêtes ont été menées dans quatre hôpitaux. Aucune communication n’a été envoyée à d’autres hôpitaux ou destinataires des produits de la société. Selon le rapport, diverses mesures ont été mises en œuvre dans les hôpitaux, ce qui souligne la nécessité de suivre les directives de la FSA publiées en 2016.

Une évaluation des risques a indiqué que dans des conditions de stockage sous-optimales, on pouvait s'attendre à un cas de listériose tous les trois ans causé par la consommation de ces sandwichs, réduite à un en 20 ans dans des conditions de stockage optimales.

Le rapport a révélé que les mesures de contrôle pour réduire ou éliminer Listeria monocytogenes de l’environnement de l'usine et le maintien de la chaîne du froid dans les hôpitaux sont importants pour réduire la listériose.

PHE a dit qu'il était au courant de 10 incidents similaires en Angleterre et au Pays de Galles de listériose liés à la consommation de sandwichs préparés servis dans les hôpitaux. Des cas d’infection se sont également produits en Irlande du Nord et en Écosse.

En 2019, six personnes sont décédées après avoir consommé des sandwichs au poulet fournis aux hôpitaux par la Good Food Chain. La viande était produite par North Country Cooked Meats et distribuée par North Country Quality Foods. Les trois entreprises ont été liquidées et ont cessé leurs activités.

La British Sandwich and Food to Go Association a mis à jour ses directives en janvier 2020 sur le contrôle de Listeria dans les aliments réfrigérés prêts à consommer (PAM) de la chaîne d'approvisionnement.

Un rapport publié en 2016 au nom de la FSA a révélé que la plupart des épidémies dans les hôpitaux étaient liées aux sandwichs, et principalement aux sandwichs prêts à consommer.

Commentaire. Interdire les aliments prêts à consommer dans les hôpitaux, comme les sandwichs, serait une très bonne mesure de maîtrise de Listeria monocytogenes ...

jeudi 17 septembre 2020

Compréhension fondamentale des différents mécanismes d'adhésion des bactéries

 Pourquoi les germes hospitaliers se lient-ils plus fortement à certaines surfaces qu'à d'autres? Source EurekAlert.

Les bactéries multirésistantes sont un problème sérieux dans les environnements hospitaliers et de soins de santé. En formant un biofilm, ces agents pathogènes peuvent coloniser les poignées de porte et les interrupteurs d'éclairage et leur présence sur les implants médicaux peut entraîner de graves cas d'infection postopératoire. Une équipe de physiciens de l'Université de la Sarre a maintenant montré pourquoi les germes des hôpitaux adhèrent fortement aux surfaces d'où l'eau s'écoule tout simplement, mais se lient si mal aux surfaces facilement mouillées par l'eau.

Principe du mécanisme d'adhésion de la bactérie Staphylococcus aureus sur des surfaces hydrofuges et hydrophobes (à gauche) par rapport aux surfaces hydrophiles attirant l'eau (à droite). Alors que sur la gauche, de nombreuses molécules de la paroi cellulaire (représentées ici sous forme de plumes) sont responsables de l'adhérence, il y en a relativement peu sur la droite. À cette fin, l'équipe de physiciens de Sarrebruck a reproduit des courbes expérimentales force-distance dans des simulations.

Compréhension fondamentale des différents mécanismes d'adhésion des bactéries Source communiqué de l’Université de la Sarre.

Les bactéries multi-résistantes sont une menace constante dans les hôpitaux. Là, ils peuvent coloniser les poignées de porte et les interrupteurs d'éclairage, par exemple, et entraîner de graves infections sur les implants. Une équipe de physique de l'Université de la Sarre a maintenant montré pourquoi les germes hospitaliers adhèrent particulièrement bien aux matériaux d'où l'eau perle et particulièrement mal aux surfaces mouillées par l'eau.

Ces résultats de recherche issus de la physique expérimentale et théorique peuvent aider à améliorer les surfaces antibactériennes. Ils ont été publiés dans le célèbre revue de recherche Nanoscale.

La bactérie Staphylococcus aureus est l'une des causes les plus courantes d'infections que les patients contractent lors d'un séjour à l'hôpital. Les pathogènes sont particulièrement redoutés car ils peuvent former des biofilms robustes sur des surfaces naturelles et artificielles difficiles à éliminer. « Les bactéries individuelles de ces biofilms sont elles-mêmes bien protégées des antibiotiques et du système immunitaire humain. C'est pourquoi il est si dangereux, par exemple, qu'ils se déposent sur des implants et y provoquent des infections après une opération », explique Karin Jacobs, professeur de physique expérimentale à l'Université de la Sarre. Il est donc important de prévenir la formation de biofilms dès le départ.

Pour ce faire, les chercheurs de Sarrebruck ont d’abord dû comprendre les mécanismes par lesquels les bactéries adhèrent à divers matériaux. À l'aide d'un microscope à force atomique, ils ont pressé les minuscules cellules bactériennes sur diverses surfaces et ont déterminé la force nécessaire pour détacher à nouveau les cellules. Des courbes dites force-distance ont été enregistrées dans les expériences. « Nous avons utilisé des surfaces de silicium extrêmement lisses comme surfaces modèles, qui ont été préparées une fois pour qu'elles puissent être bien mouillées par l'eau et une fois pour qu'elles soient hydrofuges. Il s'est avéré que les cellules adhèrent beaucoup plus fortement aux surfaces hydrophobes, c'est-à-dire à celles qui repoussent l'eau, qu'aux surfaces hydrophiles et facilement mouillables », explique Karin Jacobs. Mais pas seulement les forces adhésives, mais aussi les formes des courbes force-distance diffèrent fondamentalement entre les deux surfaces (voir illustration). Sur les surfaces hydrophobes, on obtient des courbes très lisses avec une «forme de coupe» caractéristique. D'autre part, les surfaces hydrophiles présentent des formes de courbes individuelles avec de nombreux «bords dentelés».

Afin de comprendre ces résultats expérimentaux, le groupe de Ludger Santen, professeur de physique théorique à l'Université de la Sarre, a réalisé des simulations de Monte Carlo à l'aide desquelles la dynamique de systèmes complexes peut être modélisée. Le modèle décrit la bactérie comme une sphère rigide et les molécules de la paroi cellulaire à la surface comme de petites plumes. « Afin de décrire correctement les expériences, il est plus important de considérer la composante aléatoire dans la liaison à la surface que d'augmenter la complexité du modèle théorique. Nous avons découvert pourquoi les bactéries se comportent si différemment selon la surface: de nombreuses molécules de la paroi cellulaire adhèrent à des matériaux hydrofuges, ce qui dans l'ensemble conduit à une forte adhérence et à une forme uniformément lisse des courbes force-distance », explique Ludger Santen. En revanche, seules quelques molécules se sont collées sur les surfaces hydrophiles, la cellule n'a donc pas bien adhéré et la forme de la courbe est devenue moins uniforme. « Cette forme de courbe irrégulière est causée par quelques molécules de paroi cellulaire individuelles qui se détachent individuellement de la surface. En conséquence, les bactéries dans leur ensemble ne peuvent pas adhérer à la surface du matériau hydrophile », explique Erik Maikranz, qui a réalisé les simulations dans le cadre de sa thèse. « En conséquence, les bactéries dans leur ensemble ne peuvent pas adhérer à la surface du matériau hydrophile », explique Erik Maikranz, qui a réalisé les simulations dans le cadre de sa thèse de doctorat, molécules individuelles de la paroi cellulaire qui se détachent individuellement de la surface.

Les physiciens ont pu identifier diverses interactions et une soi-disant barrière potentielle associée comme raison du nombre différent de molécules de paroi cellulaire adhérentes. »Si la barrière potentielle sur les surfaces hydrophiles est comparativement élevée et ne peut être surmontée que par quelques molécules dans un certain temps, elle est négligeable sur les surfaces hydrophobes, de sorte qu'un grand nombre de molécules peuvent adhérer directement », explique Christian Spengler, docteur en physique.

La recherche a été menée dans le cadre d'un domaine de recherche spécial de la Fondation allemande pour la recherche (SFB 1027), consacré au thème « Modélisation physique des processus de non-équilibre dans les systèmes biologiques ».

Publication originale

E. Maikranz, C. Spengler, N. Thewes, A. Thewes, F. Nolle, M. Bischoff, L. Santen et K. Jacobs, «Différents mécanismes de liaison de Staphylococcus aureus aux surfaces hydrophobes et hydrophiles». Nanoscale (2020).

mercredi 8 juillet 2020

COVID-19 : L'hôpital a-t-il été accessible aux personnes âges des EHPAD ? La réponse est non pour deux représentantes des syndicats


Qu’est-il arrivé aux personnes âges des EHPAD lors de l’épidémie du Covid-19 ?

Voici deux témoignages accablants lors de table ronde réunissant les organisations représentatives des personnels hospitaliers dans le cadre de la commission, Impact, gestion et conséquences de l’épidémie du Covid 19.

Les deux témoignages sont de Mme Astrid Petit, CGT Santé Action sociale et de Mme Clotilde Cornière, CFDT Santé Sociaux ... sont sans appel ...



L’enregistrement vidéo intégral de cette table-ronde est ici.

mardi 9 juin 2020

COVID-19: Le rôle clé du masque mis en évidence dans une récente méta-analyse


Selon un article parue dans la revue The Lancet, la distance physique, le port du masque et la protection oculaire sont des éléments clés pour la prévention du COVID-19.

Le choix de divers mécanismes de protection respiratoire, y compris les masques et les masques respiratoires, a été un problème épineux, dans la pandémie H1N1 de 2009 à l'épidémie d'Ebola en Afrique de l'Ouest en 2014, jusqu'à la pandémie actuelle du COVID-19.

Les directives COVID-19 publiées par l'OMS, les Centers for Disease Control and Prevention des États-Unis et d'autres agences ont été cohérentes quant à la nécessité d'une distance physique de 1 à 2 m, mais contradictoires sur la question de la protection respiratoire avec un masque facial ou un masque respiratoire.

Cet écart reflète des preuves incertaines et aucun consensus sur le mode de transmission du coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2). Pour la protection des yeux, les données sont encore moins certaines. D'où conséquent, un examen systématique et une méta-analyse par Derek Chu et ses collègues publiée dans The Lancet est une étape importante dans notre compréhension de l'utilisation des équipements de protection individuelle (EPI) et de la distance physique pour le COVID-19.

Aucun essai contrôlé randomisé n'était disponible pour l'analyse, mais Chu et ses collègues ont systématiquement examiné 172 études observationnelles et synthétisé rigoureusement les preuves disponibles de 44 études comparatives sur le SRAS, le syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS), COVID-19 et les bêtacoronavirus qui causent ces maladies.

Les résultats ont montré une réduction du risque de 82% avec une distance physique de 1 m dans les établissements de santé et les milieux communautaires. Chaque 1 m supplémentaire de séparation a plus que doublé la protection relative, avec des données disponibles jusqu'à 3 m. Ces preuves sont importantes pour étayer les directives communautaires sur la distance physique et montrent que la réduction des risques est réalisable par la distance physique. De plus, cette découverte peut éclairer la levée des restrictions sociétales et des moyens de rassemblement plus sûrs dans la communauté.

La règle de la distance de 1 à 2 m dans la plupart des directives hospitalières est basée sur des résultats obsolètes des années 40, avec des études de 2020 montrant que de grosses gouttelettes peuvent voyager jusqu'à 8 m.

La séparation des gouttelettes et de la transmission aéroportée est probablement quelque peu artificielle, les deux voies faisant probablement partie d'un continuum pour les infections respiratoires transmissibles.

La protection contre les infections présumées par gouttelettes par l'utilisation de respirateurs, mais pas de masques, prend en charge un continuum plutôt que des états discrets de gouttelettes ou de transmission aéroportée. Des études expérimentales et hospitalières ont montré des signes de transmission par aérosol du SRAS-CoV-2.

Une étude a trouvé un virus viable dans l'air 16 h après aérosolisation et a montré une plus grande propension aéroportée au SARS-CoV-2 par rapport au SARS-CoV et au MERS-CoV.

Chu et ses collègues ont rapporté que les masques et les masques respiratoires réduisaient le risque d'infection de 85%, avec une plus grande efficacité dans les milieux de santé que dans la communauté. Ils attribuent cette différence à l'utilisation prédominante de masques N95 (FFP2) dans les établissements de santé que dans la communauté; dans une sous-analyse, les masques respiratoires étaient efficaces à 96% par rapport aux autres masques, qui étaient efficaces à 67%. L'autre constatation importante pour le personnel de santé par Chu et ses collègues est que la protection oculaire a entraîné une réduction de 78% de l'infection; une infection par voie oculaire peut survenir par transmission par un aérosol ou auto-inoculation.

Pour les personnels de santé dans les locaux COVID-19, un masque respiratoire devrait être la norme minimale de soins. Cette étude réalisée par Chu et ses collègues devrait inciter à revoir toutes les lignes directrices recommandant un masque médical pour les agents de santé s'occupant de patients COVID-19. Bien que les masques médicaux protègent, la santé et la sécurité au travail des agents de santé devraient être la priorité absolue et le principe de précaution devrait être appliqué. Les infections évitables chez les personnels de santé peuvent entraîner non seulement des décès, mais aussi la mise en quarantaine de nombreux personnels de santé et des éclosions nosocomiales. Dans les établissements du National Health Service au Royaume-Uni, jusqu'à un personnel de santé sur cinq a été infecté par le COVID-19, ce qui est un risque inacceptable pour les personnels de première ligne. Pour répondre aux pénuries mondiales d'EPI, les pays devraient assumer la responsabilité de l'augmentation de la production plutôt que de s'attendre à ce que les personnels de santé travaillent dans des EPI sous-optimaux.

Chu et ses collègues signalent également que les masques respiratoires et les masques multicouches sont plus protecteurs que les masques monocouches. Cette découverte est vitale pour informer sur la prolifération des modèles de masques en tissu faits maison, dont beaucoup sont à une seule couche. Un masque en tissu bien conçu doit avoir un tissu résistant à l'eau, plusieurs couches et un bon ajustement facial.

Cette étude prend en charge l'utilisation universelle des masques, car les masques étaient tout aussi efficaces dans les établissements de santé que dans les milieux communautaires lorsqu'ils étaient ajustés pour le type d'utilisation du masque.

Une preuve croissante pour la transmission présymptomatique et asymptomatique de SARS-CoV-2 prend également en charge l'utilisation universelle du masque et la distanciation. Dans les régions à forte incidence de COVID-19, l'utilisation d'un masque universel combinée à une distance physique pourrait réduire le taux d'infection (aplatir la courbe), même avec des masques légèrement efficaces.

L'utilisation d'un masque universel pourrait permettre de lever en toute sécurité les restrictions dans les communautés cherchant à reprendre leurs activités normales et pourrait protéger les personnes dans des lieux publics surpeuplés et au sein des ménages. Les masques portés dans les ménages de Pékin, en Chine, ont empêché la transmission secondaire du SRAS-CoV-2 s'ils étaient portés avant l'apparition des symptômes du cas index.

Enfin, Chu et ses collègues réitèrent qu'aucune intervention n'est totalement protectrice et que des combinaisons de distanciation physique, d'utilisation de masques faciaux et d'autres interventions sont nécessaires pour atténuer la pandémie de COVID-19 jusqu'à ce que nous ayons un vaccin efficace. Jusqu'à ce que des données d'essais contrôlés randomisés soient disponibles, cette étude fournit les meilleures preuves spécifiques pour la prévention du COVID-19.

mercredi 29 avril 2020

Une analyse aérodynamique démontre une transmission potentielle du COVID-19 par aérosols


« Une analyse aérodynamique démontre une transmission potentielle du COVID-19 par aérosols », source xinhuanet du 28 avril 2020, adapté par mes soins -aa.

Des scientifiques chinois ont effectué une analyse aérodynamique des aérosols chargés de nouveau coronavirus, confirmant que le virus pouvait être transmis par aérosols.

Cette étude, menée par l'Université de Wuhan, basée dans la ville qui était autrefois l'épicentre de l'épidémie dans la province chinoise du Hubei, a examiné la nature aérodynamique du nouveau coronavirus en mesurant l'ARN viral dans les aérosols de différentes zones à Wuhan lors de l'épidémie de COVID-19 en février et mars.

Des échantillons d'aérosols ont été recueillis à l'hôpital Renmin de l'Université de Wuhan, à l'hôpital temporaire de Wuchang, ainsi que dans des zones résidentielles et des supermarchés.

Lan Ke, directeur du laboratoire clé d'Etat de virologie de l'Université de Wuhan et membre clé de l'équipe de recherche, a déclaré que la concentration du virus dans les aérosols détectés dans les salles d'isolement et les chambres ventilées des patients était très faible, mais qu'elle était élevée dans les toilettes des patients.

Les niveaux d'ARN du SARS-CoV-2 en suspension dans l'air dans la majorité des zones publiques étaient indétectables sauf dans deux zones sujettes à encombrement, probablement en raison de porteurs infectés dans la foule. Nous avons constaté que certaines zones du personnel médical avaient initialement des concentrations élevées d'ARN viral avec des distributions de taille d'aérosol montrant des pics dans les régions submicrométriques et/ou supermicrométriques, mais ces niveaux ont été réduits à des niveaux indétectables après la mise en œuvre de procédures de désinfection rigoureuses.
L'équipe a également constaté que les aérosols chargés de virus descendaient au sol ou sur les vêtements des personnes avant d'être emportés par les personnes et remis en suspension dans l'air.

En raison des connaissances limitées sur la transmission par aérosols, beaucoup de gens considèrent souvent qu'il s'agit d'un « mode de transmission aérienne impossible à éviter », ce qui les rend anxieux et confus, a indiqué M. Lan.

Selon les auteurs,
Nos résultats indiquent que la ventilation des pièces, les espaces ouverts, la désinfection des vêtements de protection, ainsi que l'utilisation et la désinfection appropriées des toilettes peuvent limiter efficacement la concentration d'ARN du SRAS-CoV-2 dans les aérosols. Les travaux futurs devraient explorer l'infectiosité du virus aérosolisé.

L’étude a été publiée le 27 avril 2020 dans la revue Nature, Aerodynamic analysis of SARS-CoV-2 in two Wuhan hospitals.

lundi 27 avril 2020

COVID-19 et France: Données corrigées sur le nombre de cas et remarques sur les chiffres



De fait ce nouvel article explique les raisons cette ou de ces modifications de l’exclusion de cas, entre cas probables et cas confirmés …

Voici quelques données corrigées sur la France (source CEBM de l'université d'Oxford) et la baisse de nouveaux cas se poursuit et souhaitons que cela se poursuive encore pour les prochains jours:

- 26 avril : 612 nouveaux cas et 242 nouveaux décès en France [source]
- 25 avril : 1 660 nouveaux cas et 369 nouveaux décès en France [source]
- 24 avril : 1 645 nouveaux cas et 349 nouveaux décès en France
- 23 avril : 2 239 nouveaux cas et 516 nouveaux décès en France

Le gouvernement français a corrigé son nombre de cas après qu'un processus de qualité et de vérification des données des établissements ESMS et EHPAD a mis en évidence la surdéclaration et la surestimation des cas cumulatifs [source]. Pour refléter la correction apportée par le gouvernement français, Worldmeter a ajusté les chiffres pour aujourd'hui et historiquement. [source]

- 22 avril : 2 413 nouveaux cas et 544 nouveaux décès en France [source]
- 21 avril : 3 253 nouveaux cas et 531 nouveaux décès en France [source]
- 20 avril : 2 434 nouveaux cas et 547 nouveaux décès en France
- 19 avril : 1 062 nouveaux cas et 395 nouveaux décès en France [source] [source] [source]
- 18 avril: 3 666 nouveaux cas et 642 nouveaux décès en France [source]
- 17 avril: 2 344 nouveaux cas et 761 nouveaux décès en France

Note: La France a indiqué qu'une partie des cas des EHPAD et des ESMS - représentant environ 33% du total des cas EHPAD et des ESMS - ont été confirmés (plutôt que probable, comme les 67% restants) et en tant que tels doivent être considérés comme déjà inclus dans le nombre total de cas nationaux [source]. Le gouvernement français a désormais commencé à signaler la répartition entre les cas confirmés et probables des EHPAD et des ESMS [source]. Nous avons ajusté les données historiques de la France au 4 avril sur la base de ces informations. Le 3 avril, le gouvernement français avait signalé 17 827 cas supplémentaires et 532 décès supplémentaires dans les EHPAD et ESMS qui n'avaient pas été signalés auparavant. Le 2 avril, il avait signalé 884 décès supplémentaires.

- 16 avril: 7 128 nouveaux cas et 753 nouveaux décès en France [source
- 15 avril : 3 391 nouveaux cas et 1 438 nouveaux décès en France [source
- 14 avril: 5 955 nouveaux cas et 762 nouveaux décès en France [source]
- 13 avril: 3 655 nouveaux cas et 574 nouveaux décès en France [source]
- 12 avril: 2 455 nouveaux cas et 561 nouveaux décès en France [source]
- 11 avril: 4 4251 nouveaux cas et 635 nouveaux décès en France [source]
- 10 avril: 6 231 nouveaux cas et 987 nouveaux décès en France [source]
- 09 avril: 4 635 nouveaux cas et 1 341 nouveaux décès en France [source] [source]
- 08 avril: 3 881 nouveaux cas et 541 nouveaux décès en France

Je me fie depuis le début de l’épidémie de COVID-19 à ces trois sites Internet,

Université John Hopkins (Etats-Unis)

Voici, selon ces trois sites, la situation en France au 27 avril 2020 à 10h30
Site Internet
Nombre de cas
Nombre de décès
South China Morning Post
162 220
22 890
CEBM de l’Université d’Oxford
162 100
22 856
Université John Hopkins
162 220
22 890

Santé publique de France fournit le nombre de décès en France au 26/04/2020 à 14h (mis en ligne en fin de journée): 22 856. 

Remarques sur quelques données
Selon le CEBM de l’Université d’Oxford, la France avec 14,1% est le deuxième pays au monde pour le taux de létalité, mis à jour au 27 avril 2020.
Correctif. A la date du 29 avril, dans l'ordre du premier au troisième, Royaume-Uni avec 15,80%, Belgique avec 15,65 et France avec 14,47%

Le taux de létalité est le nombre de décès rapportés par nombre de cas rapportés. Le premier pays est la Belgique.

Cette information n’est pas prête à être fournie par le directeur général de la santé qui commence invariablement son discours par les chiffres des Etats-Unis, qui ont, il est vrai, le plus grand nombre de cas ; si l’on rapporte cette donnée au nombre d’habitants à la date du 26 avril 2020 ; les Etats-Unis sont devant nous, si l’on peut dire, avec 2 983 cas par million d’habitants versus 2 483 cas par million d’habitants en France. 

Cela étant, concernant les décès, la France est loin devant les Etats-Unis avec 350 décès par million d’habitants versus 166 décès par million d‘habitants aux Etats-Unis. Source CEBM.

La deuxième enquête de MG France confirme la place des soignants de ville dans la lutte contre l’épidémie, source communiqué de MG France du 26 avril 2020.
1,8 million de personnes consultant pour Covid en médecine générale depuis le 17 mars, 340 000 durant la semaine du 6 au 12 avril, près de 9 000 décès en ville en rapport avec le virus : telles sont les principales estimations tirées de la deuxième enquête réalisée par MG France entre le 14 et le 21 avril, à laquelle 2339 médecins généralistes ont répondu.
Mise à jour du 28 avril 2020. Selon Le Monde du 27 avril 2020Coronavirus : la mortalité en réanimation beaucoup plus forte qu’annoncée en France.

Le taux serait de 30 % à 40 %, selon les données du Réseau européen de recherche en ventilation artificielle, soit beaucoup plus que les 10 % évoqués par le gouvernement le 17 avril.