mardi 19 mai 2020

Suisse: Résultats 20019 des contrôles à la frontière sur les aliments d’origine végétale et les objets usuels


« Résultats des contrôles à la frontière sur les aliments d’origine végétale et les objets usuels », source Office fédéral de la sécurité alimentaire et des affaires vétérinaires (OSAV).
L’OSAV mène chaque année plusieurs programmes de contrôle à la frontière en collaboration avec l’Administration fédérale des douanes (AFD) et les autorités cantonales.
Sur les 428 échantillons analysés en 2019, 100 (23 %) n’étaient pas conformes à la législation.
Les bureaux de douane prélèvent tout au long de l’année des échantillons de marchandises importées par camion, par bateau et par avion. Ces échantillons sont prélevés dans le cadre de programmes planifiés en fonction des risques ou spontanément pour des marchandises suspectes.
L’analyse détaillée des résultats et la description des mesures prises sont disponibles dans le rapport actuel, Rapport annuel 2019 sur les programmes de contrôle à la frontière.
Les résultats en bref
Sur les 428 échantillons prélevés à la frontière analysés en 2019, 100 (23%) ont fait l’objet d’une contestation de la part des autorités cantonales de contrôle des denrées alimentaires, contre 13% en 2018. Cependant, le nombre d’échantillons est trop faible au regard de la grande diversité des importations pour tirer des conclusions pertinentes quant à la conformité de tous les produits importés. Il convient par ailleurs de noter que les échantillons ont été prélevés en fonction des risques et donc de manière ciblée, ce qui entraîne automatiquement des taux de contestation plus élevés. À la suite d’une contestation, les coûts des analyses sont facturés aux établissements concernés sous forme d’émoluments et des mesures de droit administratif sont prises à leur encontre. Dans la plupart des cas, cela permet d’améliorer immédiatement la situation. L’OSAV exploite en outre les données issues des programmes de contrôle à la frontière pour définir des mesures ultérieures, comme l’adaptation du cadre législatif ou la planification de nouveaux contrôles fondés sur les risques.
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NB : Chez nous, nous avons les résultats des contrôles parfois plus d'un an après ...

Effectivement, pour confirmer cela, voici un document fourni par la DGCCRF le 13 mai 2020 sur les contrôles réalisés en 2018: Contrôle à l’importation des denrées alimentaires,une étape essentielle pour garantir la sécurité sanitaire.

L'Assemblée de l’organisation mondiale de la santé s'ouvre au milieu de tensions liées à la pandémie de COVID-19 et des appels à une enquête


« L'Assemblée de l’organisation mondiale de la santé s'ouvre au milieu des tensions liées à la pandémie de COVID-19 et des appels à une enquête », source article de Lisa Schnirring paru le 18 mai 2020 dans CIDRAP News.

Les appels à des enquêtes sur le rôle de l'Organisation mondiale de la santé (OMS) dans la réponse à la pandémie de COVID-19 et à une enquête sur l’origine du virus en Chine ont dominé l'ouverture de l'Assemblée mondiale de la Santé (AMS) le 18 mai 2020, qui se tient virtuellement et réduite à deux jours.

Pendant ce temps, le total mondial a dépassé 4,75 millions de cas le 18 mai 2020, avec des décès atteignant 317 515, selon le tableau de bord en ligne de Johns Hopkins.

Enquête sur la pandémie lors de l’AMS
Plus de 100 pays, y compris tous les pays de l'Union européenne, soutiennent une résolution de l’AMS qui appelle à une enquête indépendante sur la pandémie de COVID-19, ont rapporté plusieurs médias. L’assemblée devrait voter sur la mesure aujourd’hui 19 mai.

Après des flambées majeures telles que l'épidémie d'Ebola en Afrique de l'Ouest en 2014, l'OMS effectue régulièrement des examens internes et externes de ses actions. Cependant, des pays, y compris les États-Unis, ont demandé une enquête plus tôt, accusant l'OMS de n'avoir pas averti le monde assez tôt pour qu'elle se range du côté de la Chine. Les États-Unis - avec le plus grand nombre de cas et de décès au monde - font face à leurs propres critiques pour leur réponse lente et inégale.

Dans ses remarques d'ouverture à l'Assemblée mondiale de la Santé le 18 mai 2020, le Directeur général de l'OMS, Tedros Adhanom Ghebreyesus a défendu la réponse de l'OMS, disant qu'elle avait donné l'alarme tôt et souvent et a informé les pays et publié des directives à l'intention des personnels de santé dans les 10 premiers jours. Il a ajouté que l'OMS avait émis le niveau d'alerte le plus élevé le 30 janvier, alors qu'il y avait moins de 100 cas et aucun décès en dehors de la Chine.

Il a détaillé les efforts de l'OMS pour expédier des tests et des fournitures à plus de 120 pays, former 2,6 millions de personnels de la santé et organiser des efforts massifs pour accélérer la recherche sur les traitements et les vaccins. « Chaque pays et chaque organisation doivent examiner leur réponse et tirer des leçons de leur expérience », a déclaré M. Tedros.
Tedros a déclaré que l'OMS se félicite de la proposition d'examen et commencera une évaluation indépendante « au plus tôt ».

Idéalement, les leçons tirées de la pandémie devraient permettre au monde de mieux se préparer, mais les revues après les épidémies de SRAS, de H1N1 et d'Ebola en 2009 ont abouti à des recommandations pour les pays afin de combler les lacunes de la sécurité sanitaire mondiale, dont certaines sont restées lettre morte.

Il a déclaré que le monde doit renforcer les systèmes dont il dispose déjà, y compris l'OMS, et de disposer de tous les outils, de la science et des ressources pour rendre le monde plus sûr contre les pandémies, mais l'engagement à les utiliser fait défaut.

« Aujourd'hui, j'appelle toutes les nations à décider qu'elles feront tout ce qui est en leur pouvoir pour que la pandémie de coronavirus de 2020 ne se répète jamais », a-t-il dit.

L’AMS, composée des ministres de la santé de 194 pays, est l'organe de décision de l'OMS.

La Chine annonce le soutien pour une enquête
Le président chinois Xi Jinping a déclaré le 18 mai 2020 dans un discours à l’AMS qu'il soutenait un examen complet de la pandémie, une fois le virus sous contrôle, a rapporté Reuters.

La Chine s'était opposée aux appels précédents à des enquêtes similaires des États-Unis et de l'Australie, mais Xi a déclaré que le pays serait ouvert à un examen impartial qui partagerait les leçons et mettrait en évidence les faiblesses, dirigé par l'OMS avec objectivité et équité.

Il a défendu les actions de la Chine comme transparentes et opportunes, et il a promis 2 milliards de dollars au cours des deux prochaines années pour aider à la réponse contre le COVID-19. En outre, Xi a promis que le vaccin chinois, qui est entré dans les essais humains le 16 mars, serait disponible pour le reste du monde pour aider à ralentir la propagation du virus.

Des tensions fortes aux États-Unis
Pendant ce temps, le représentant américain auprès de l'AMS - le secrétaire à la santé et aux services sociaux (HHS pour Health and Human Services) Alex Azar - a vivement critiqué l'OMS le 18 mai 2020 dans ses remarques devant l’assemblée.

« Nous devons être francs sur l'une des principales raisons pour lesquelles cette épidémie est devenue incontrôlable: cette organisation n'a pas réussi à obtenir les informations dont le monde avait besoin, et cet échec a coûté de nombreuses vies », a-t-il déclaré.

Il a déclaré que les États-Unis étaient transparents quant aux résultats des essais de traitements médicamenteux et vaccinaux, qui bénéficieront au monde entier: « Les opérations de l'OMS doivent également être transparentes, et nous soutenons un examen indépendant de tous les aspects de la réponse de l'OMS à la pandémie. »

Dans une critique à peine voilée de la Chine, Azar a déclaré qu'un pays, en dissimulant son apparition, a fait une « moquerie » de ses obligations de transparence, ce qui a entraîné des coûts énormes pour le reste du monde.
Les systèmes de santé sous pression en Russie et au Brésil
Alors que les dirigeants mondiaux se réunissaient, deux des principaux points chauds actuels - la Russie et le Brésil - ont dû faire face aux effets de l'épidémie de COVID-19.

La Russie a le deuxième total le plus élevé au monde, juste derrière les États-Unis, et le Brésil est maintenant le quatrième pays le plus durement touché.

La Russie a signalé le 18 mai 2020 8 926 cas de plus, en baisse ces derniers jours, mais elle a déclaré que la situation était difficile et a demandé aux États-Unis une aide médicale réciproque, a rapporté Reuters. Moscou est le plus grand point chaud du pays, mais le président Vladimir Poutine a dit que la région sud du Daghestan a été submergée, avec 3 460 cas et son système de santé mis à rude épreuve, selon un rapport distinct de Reuters.

Un autre article du service de presse a déclaré que l'armée russe avait installé un hôpital temporaire dans la plus grande mine d'or du pays, située en Sibérie, pour traiter les mineurs infectés à la suite de la détection de cas dans le cadre de tests étendus pour les employés.

Pendant ce temps, le système de santé de la capitale du Brésil, Sao Paulo, est sur le point de s'effondrer, avec 90% des lits d'urgence dans les hôpitaux publics pleins et devrait dépasser la capacité d'ici 2 semaines, a rapporté la BBC le 18 mai 2020.

Le Brésil a signalé 4 515 cas supplémentaires le 18 mai 2020, portant son total à 245 959. Jusqu'à présent, 16 370 Brésiliens sont décédés de l’infection, le sixième nombre de décès le plus élevé au monde.

Des pays après le pic ont de nouveaux défis à relever
En Europe, où plusieurs pays touchés au début de la pandémie assouplissent certaines restrictions, les magasins, restaurants et coiffeurs en Italie ont rouvert le 18 mai 2020, avec des mesures de distanciation en place, et les églises et le Vatican ont repris après un arrêt de 2 mois, après l'assainissement des installations et avec une distanciation et d’autres mesures de protection incorporées dans les services.

L'Allemagne a dit le 18 mai 2020 qu'elle espérait décider d'ici le 15 juin si elle autoriserait la reprise des voyages internationaux, dans l'espoir de sauver une partie de la saison touristique, et l'Espagne a indiqué qu'elle pourrait rouvrir ses frontières d'ici fin juin, lorsque toutes ses mesures de confinement se termineront

En France, le ministre de l'éducation a averti le 18 mai 2020 qu'une semaine après la réouverture de certaines écoles en France, 70 cas liés aux écoles avaient été signalés, selon CBS News, qui citait un reportage de la radio française. Il n'est pas clair si les cas concernaient des élèves ou des enseignants ou si les expositions se sont produites à la maison ou à l'école. Les écoles concernées ont été fermées immédiatement.

Dans un développement au Royaume-Uni, des chercheurs de l'Université d'Oxford, en partenariat avec AstraZeneca, recevront 84 millions de livres sterling d’un nouveau financement gouvernemental pour le développement de vaccins, et les partenaires ont conclu un accord de licence mondial pour commercialiser et fabriquer le vaccin, selon Alok Sharma, la secrétaire au commerce du gouvernement. Dans le cadre de l'accord, si le vaccin réussit, AstraZeneca pourrait fabriquer jusqu'à 30 millions de doses pour le Royaume-Uni d'ici septembre, ce qui en ferait le premier pays à s'approvisionner.

En Asie, la Chine a signalé le 18 mai 2020 sept nouveaux cas, quatre importés de Mongolie intérieure et trois locaux: deux de la province de Jilin, où les autorités luttent contre un groupe récent de cas et un de Shanghai, selon la Commission nationale de la santé.
Le pays a également signalé 18 cas asymptomatiques supplémentaires, dont 2 importés.

La Corée du Sud, qui suit les groupes de cas liés aux boîtes de nuit de Séoul, a signalé 15 nouveaux cas, dont 10 importés; sur 5 cas locaux, 2 étaient liés aux boîtes de nuit, ont annoncé le 18 mai 2020 les Centres coréens de contrôle et de prévention des maladies. Jusqu'à présent, 170 cas ont été signalés dans ce cluster.

Les Noirs américains sont les plus touchés par l’épidémie de COVID-19, selon une étude


« Etats-Unis : Les résidents Noirs sont les plus touchés par l’épidémie de COVID-19, selon une étude », source CIDRAP News du 18 mai 2020.

Selon une étude publiée à la fin de la semaine dernière dans Annals of Epidemiology, près de 22% des comtés américains avec des proportions plus élevées de Noirs américains représentaient 52% des cas de COVID-19 et 58% des décès liés.

Les chercheurs ont accédé aux données publiques le 13 avril pour comparer les cas d’infections à COVID-19 et les décès dans les comtés avec 13% ou plus de Noirs et ceux avec des pourcentages inférieurs.

Près de 97% des comtés à forte proportion de résidents Noirs (656 sur 677) ont signalé un cas du nouveau coronavirus et 49% (330/677) ont signalé un décès, contre 81% pour tous les autres comtés ayant signalé un cas (1 987/2 465) et 28% (684/2 465) qui ont déclaré un décès.

Au 13 avril, les autorités avaient signalé 283 750 cas de coronavirus et 12 748 décès dans des comtés à forte proportion de résidents Noirs. En revanche, 263 640 cas et 8 886 décès ont été signalés dans d'autres comtés.

Après ajustement pour les caractéristiques du comté telles que l'âge, le niveau de pauvreté, le taux de maladie sous-jacente et la durée de l'épidémie, les comtés avec des proportions plus élevées de Noirs ont déclaré plus de cas de COVID-19 (risque relatif [RR], 1,24; intervalle de confiance à 95% [IC] , 1,17 à 1,33) et les décès (RR, 1,18; IC à 95%, 1,00 à 1,40) que dans les autres comtés.

Les auteurs ont noté qu'environ 91% des comtés avec une proportion élevée de résidents Noirs se trouvent dans le Sud et que ces comtés ont une prévalence plus élevée de maladies sous-jacentes, plus de pollution de l'air, moins de ressources en soins de santé et des proportions plus élevées de résidents non assurés, sans emploi et des personnes âgées que les autres comtés.

« Nous continuons à ne pas lutter contre les inégalités de longue date jusqu'à ce que nous nous engagions à éliminer le racisme structurel et les racines systémiques qui maintiennent et même renforcent ces injustices », ont écrit les auteurs.

Une excrétion prolongée du virus COVID-19 observée en Chine


« Une excrétion prolongée du virus COVID-19 observée en Chine », source article de Mary Van Beusekom paru le 19 mai 2020 dans CIDRAP News.

Les patients atteints de COVID-19 à l'extérieur de Wuhan, en Chine, ont excrété le virus pendant une médiane de 17 jours, selon une étude de cohorte rétrospective publiée le 18 mai 2020 dans International Journal of Infectious Diseases.

En outre, une étude dans le même journal a révélé que la transmission de l'épidémie de COVID-19 de troisième génération de cas a probablement commencé du 17 au 20 janvier à Wuhan, puis s'est propagée au reste de la province du Hubei du 23 au 24 janvier, tandis que la première et la deuxième génération de cas ont interagi pour aggraver l'épidémie.

Éxcrétion du virus pendant 6 semaines
Dans la première étude, des chercheurs ont étudié les facteurs cliniques, les résultats de laboratoire, les traitements et les résultats de 147 patients adultes attients de COVID-19 dans un seul hôpital à Changsha, Chine, la capitale de la province du Hunan, adjacente à la province du Hubei.

Fièvre à l'admission à l'hôpital (odds ratio [OR], 5,200; intervalle de confiance à 95% [IC], 1,190 à 22,726; P = 0,028), temps plus long entre le début des symptômes et l'admission (OR, 1,740; IC à 95%, 1,296 à 2.337; P <0,001) et un séjour hospitalier plus long (OR, 1,604; IC à 95%, 1,262 à 2,040; P <0,001) étaient associés à de plus longues périodes d’excrétion virale.

Le délai médian entre l'apparition des symptômes et l'admission était de 6 jours (intervalle interquartile, 3 à 10). Sur les 147 patients, 127 (86%) avaient une maladie modérée, tandis que 20 (14%) avaient une maladie grave. La durée de l'excrétion virale variait de 6 à 47 jours. Aucun patient n'a eu besoin d'une assistance respiratoire avancée ou n'est décédé.

L'âge, le sexe, l'indice de masse corporelle (IMC), les antécédents d'exposition et les maladies sous-jacentes n'étaient pas significativement différents entre 82 patients qui ont éliminé le virus pendant moins de 17 jours et les 65 qui ont éliminé le virus plus longtemps.

La charge virale chez les patients qui ont éliminé le virus pendant moins de 17 jours était indétectable pour 15 des 30 patients 12 jours après l'apparition des symptômes, alors qu'il a fallu 22 jours pour la charge virale chez 16 des 31 patients présentant une excrétion virale prolongée pour éliminer le virus.

L'âge médian des patients était de 42 ans et 54% étaient des femmes. L'IMC médian était de 23,2 kg/m2. Soixante-treize patients avaient été exposés à d'autres patients COVID-19, tandis que 113 des 147 patients (77%) étaient associés à un groupe familial.

Trente des 147 patients (20%) avaient une ou plusieurs maladies sous-jacentes. Les symptômes les plus courants étaient la fièvre (115 sur 147 [78%]), la toux (122/147 [83%]) et la fatigue (62/147 [42%]). Tous les patients sauf six présentaient des résultats de radiographie thoracique anormaux, 85% (124 sur 147) avec atteinte pulmonaire bilatérale. Les patients présentant une excrétion prolongée avaient également une oxygénation artérielle significativement plus faible et des niveaux de fer plus élevés que les autres patients.

Les auteurs ont déclaré que les facteurs de risque identifiés pour l'excrétion virale prolongée devraient être pris en compte lors de la formulation des stratégies de quarantaine et ont appelé à une grande étude multicentrique pour explorer davantage ces facteurs.

Contrôle de la propagation de la seconde génération
Dans la deuxième étude, des chercheurs utilisant des données spatio-temporelles de cas COVID-19 en Chine continentale et des données d'appareils mobiles n'ont détecté aucune propagation de troisième génération du nouveau coronavirus en dehors du Hubei.

NB : le temps de génération est l’intervalle entre la date de l’infection d’une personne et la date de l’infection de son infecteur’.

La première génération ou génération primaire de la transmission de maladies s'est reflétée dans les mouvements du marché des fruits de mer de Wuhan, et la transmission de deuxième génération, ou transmission secondaire, s'est reflétée dans les voyages de la ville de Wuhan vers ailleurs dans le Hubei. La transmission de troisième génération ou génération tertiaire a été généralement causée par des cas locaux plutôt qu'importés.

Ils ont noté que plusieurs millions de voyageurs en provenance de Wuhan ont quitté la ville pour les vacances annuelles du Nouvel An chinois dans la première moitié de janvier, et le premier cas de COVID-19 à l'extérieur du Hubei a été signalé le 19 janvier. L'épidémie s'est propagée rapidement au cours des 3 ou 4 jours suivants, malgré des procédures strictes de filtrage des transports mises en place dans de nombreuses villes.

La propagation de la première et de la deuxième génération s'est produite en même temps dans de nombreuses villes au début de l'épidémie, ce qui a accru la propagation.

Les auteurs ont déclaré que leurs résultats fournissent une image plus claire de l'effet du mouvement humain sur la transmission des épidémies et identifient les mesures de confinement actuelles et futures importantes.

« Les associations entre la propagation de l'épidémie diminuaient avec la distance et avaient des modèles temporels différents des sources épidémiques, impliquant une évolution potentielle de génération en génération de l'épidémie à l'échelle spatiale régionale », ont-ils dit.

Ils ont proposé des mesures de contrôle à différents niveaux qui pourraient varier selon le lieu et l'heure dans différentes zones, les villes avec une transmission de troisième génération appliquant les contrôles les plus stricts à la fois sur ceux en quarantaine et les cas exportés, et les villes avec transmission simultanée de première et deuxième génération se concentrant sur ceux en quarantaine et les cas importés. D'autres villes pourraient se concentrer sur le contrôle des cas importés.

« Une plus grande attention devrait être accordée au contrôle de la tendance à la propagation de deuxième génération et à l'élimination de la propagation potentielle de troisième génération », ont-ils écrit.

Une étude révèle que l'obésité et la pauvreté a augmenté le risque de COVID-19 au Royaume-Uni


« Une étude révèle que l'obésité et la pauvreté a augmenté le risque de COVID-19 au Royaume-Uni », source CIDRAP News.

Le 18 mai 2020, dans le Lancet Infectious Diseases, des chercheurs britanniques ont identifié plusieurs facteurs de risque associés à un test COVID-19 positif, notamment le fait d'être un homme, d'être obèse, de vivre dans la pauvreté et d'avoir une maladie rénale chronique.

L'étude d'observations, basée au Royaume-Uni, a inclus 3 802 personnes testées pour le SRAS-CoV-2, le virus qui cause le COVID-19, avec 587 cas positifs identifiés grâce aux dossiers électroniques de santé du 28 janvier au 4 avril.

Les hommes de 40 à 64 ans étaient plus susceptibles de présenter un test positif pour le COVID-19 (18,5%, 243 sur 1 316 personnes) que 13,3% (291 sur 2 190) des femmes. Parmi 499 enfants âgés de 0 à 17 ans testés, seuls 4,6% avaient des résultats positifs.

Sur 207 personnes atteintes d'insuffisance rénale chronique, 32,9% (68) se sont révélées positives, contre 14,4% (519/3 595) sans insuffisance rénale.

Alors que 20,9% des personnes obèses se sont révélées positives (142/680), contre 13,2% (171/1 296) des personnes de poids santé.

Les personnes vivant en milieu urbain par rapport aux zones rurales et celles vivant dans la pauvreté étaient également plus susceptibles d’être testées positifs pour le nouveau coronavirus.

Dans un commentaire d'accompagnement, Rachel E. Jordan et Peymane Adab, toutes deux de l'Université de Birmingham ont écrit: « … la pandémie de COVID-19 exacerbe les inégalités socio-économiques existantes, et cela doit être exploré et réduit dans les mois et années futures. Alors que le Royaume-Uni se prépare à assouplir les mesures de confinement, il est essentiel de savoir qui est le plus à risque d'infection. »

« Cette étude met en évidence les sous-groupes les plus sensibles parmi ceux qui présentent des symptômes pertinents, bien que nous ne puissions pas savoir pourquoi ils sont plus sensibles. »

COVID-19 et les masques où il parait que nous n'avons jamais été en rupture ...



La phrase de la semaine prononcée par le chef de l’État, Emmanuel Macron à propos des masques : 

« Nous n’avons jamais été en rupture, c’est vrai, il y a eu des manques, des tensions ... »

Le masque est un moyen de protection complémentaire qui ne remplace pas les gestes barrières
Soit, mais le port du masque est un geste barrière de plus !

Une autre affiche nous explique les 'nouveaux' gestes barrières:
En complément de ces gestes, porter un masque quand la distance d’un mètre ne peut pas être respectée.
On n'est plus à une contradiction près !

Pas d’accord, porter un masque, pas seulement quand la distance d'un mètre ne peut pas être respectée, quand on sort faire ses courses depuis son domicile à son retour chez soi !


Le masque « fait maison »
Dans le cadre de l'épidémie de Covid-19, des initiatives apparaissent et proposent des masques constitués d’une ou plusieurs bandes de tissu généralement en coton. À titre d’exemple, il peut s’agir de masques « fait maison » ou mentionnés dans les tutoriels de masque « do it yourself » des réseaux sociaux. Dans le cadre du déconfinement, la population est invitée à privilégier aux masques «fait maison» les masques « grand public », à filtration garantie.
Pas de garantie sur le niveau d’efficacité

Le port d’un masque « fait maison » peut avoir une efficacité à condition de suivre les recommandations ci-dessous. Il ne sera toutefois pas possible d’apporter une garantie sur le niveau d’efficacité de ces masques. Pour ces raisons, ces masques faits artisanalement ne peuvent pas être utilisés dans un cadre de travail que ce soit par les professionnels de santé ou hors santé. Ils ne pourront en aucun cas remplacer les équipements de protection individuelle (EPI) ou le masque à usage médical lorsque leur port est rendu nécessaire par le poste de travail.
Le 'ci-dessous'  signifie allez sur le site de l'Afnor ...

Mais on s'en fout de ce genre de préconisations et des spécifications de l'Afnor, voir à ce sujet l'article du blog, COVID-19: Alorscomme ça, vous n'avez pas réalisé votre masque conformément à lanorme Afnor !

Pour mémoire, les usagers, le public, souhaitent avoir des masques fait maison et c'est très bien pour aller et venir et faire leurs courses ...

Des chercheurs de l'Université de Guelph développent une méthode pour un test COVID-19 rapide à 1 $


« Des chercheurs de l'Université de Guelph développent une méthode pour un test COVID-19 rapide à 1 $ », source communiqué de l’Universite de Guelph du 15 mai 2020.

Des chercheurs de l'Université de Guelph ont mis au point une méthode permettant potentiellement de fournir un test COVID-19 rapide pour 1 $ en analysant simultanément un grand nombre d'échantillons.

Le professeur Paul Hebert, directeur du Centre for Biodiversity Genomics (CBG) à l'Université de Guelph et ses collègues appliquent des approches créées pour la surveillance des espèces basées sur l'ADN à la détection du SRAS-CoV-2, le virus qui cause le COVID-19 .

Ce projet de recherche a récemment été présenté dans le Globe and Mail.

La capacité de traiter quotidiennement des milliers d'échantillons est essentielle pour surveiller la propagation du virus et prendre des décisions éclairées sur l'application et l'assouplissement du confinement, a dit Hebert.

« Étant donné qu'il n'y a pas de vaccin contre le COVID-19, il est urgent de procéder à un dépistage rapide et peu coûteux dans le monde », a dit Hebert, titulaire de la Canada Research Chair en Molecular Biodiversity.

« Pour l'instant, des programmes de tests intensifs sont le seul moyen de supprimer COVID-19. Notre test rend cela économiquement réalisable car les coûts sont minimisés en utilisant des réactifs en vrac et en automatisant les étapes clés du flux de travail grâce à la robotique, au séquençage à haut débit et au support informatique spécialisé. »

Les tests COVID-19 actuels coûtent entre 40 et 100 $ et sont toujours en quantité limitée.

À l'aide d'écouvillons nasaux ou d'échantillons de salive, la méthode du CBG peut cribler des milliers d'échantillons en huit à 16 heures pour 1 $ par échantillon.

« Cette approche est idéale pour les programmes de test à grande échelle », a dit Hebert. « La capacité d'exécuter plusieurs milliers de tests chaque semaine est cruciale pour les efforts de notre gouvernement pour rapprocher la vie de la normalité. Par exemple, la réouverture en toute sécurité des écoles et des lieux de travail nécessitera plus de 100 000 tests par semaine. Ce volume de tests pourrait être effectué dans une ou deux installations de production, comme le CBG, permettant un contrôle de qualité supérieur par rapport à la réalisation du même nombre de tests dans de nombreuses installations. »

Hebert a été le premier scientifique à proposer que la diversité des séquences dans des régions génétiques courtes et standardisées puisse identifier les espèces.

Le CBG est le leader mondial de la technologie issue de cette découverte, connue sous le nom de code-barres ADN, et son installation centrale traite désormais plus de 1,5 millions d'échantillons par an pour soutenir la recherche sur la biodiversité dans le monde.

La science derrière le nouveau test COVID-19 implique d'examiner la variation de séquence dans un seul gène dans le SRAS-CoV-2, a dit Hebert.

« Nous marquons génétiquement 10 000 échantillons afin qu'ils puissent être regroupés pour analyse en une seule cycle de séquençage. Nous utilisons ensuite ces balises pour connecter les séquences à leur échantillon source afin de vérifier la présence ou l'absence de COVID-19. Cette dernière tâche est facilitée par des plateformes informatiques spécialisées qui absorbent et analysent les données », a dit Hebert.

L'élaboration des nouveaux protocoles requis pour appliquer la technologie de codes à barres ADN aux tests COVID-19 a été financée par la Canada Foundation for Innovation, le Canada Research Chairs program, l’Ontario Ministry of Research and Innovation et par des donnateurs Ann et Christopher Evans.

« Avec l'effort mondial de cribler des dizaines de millions d'échantillons pour COVID-19 chaque semaine, il est certain que des protocoles évolutifs et peu coûteux sont essentiels, et notre méthode répond à ce besoin », a dit Hebert.