Dans une étude publiée l'année dernière dans The
Lancet, une équipe internationale de chercheurs a estimé
que 1,27 million de personnes sont décédées en 2019 d'une
infection résistante aux antibiotiques, et près de 5 millions
de décès étaient associés à la résistance aux antimicrobiens
(RAM).
L'étude,
l'une des premières à chiffrer concrètement le fardeau mondial de
la résistance aux antimicrobiens, a révélé que les pathogènes
bactériens résistants aux médicaments constituent une menace
majeure pour la santé mondiale et sont aussi meurtriers que les
maladies infectieuses comme le VIH et le paludisme. Et bien qu'ils
constituent une menace pour le monde entier, la charge de la
mortalité la plus élevée se trouve dans les pays à revenu faible
et intermédiaire (LMICs pour low- and middle-income countries), en
particulier ceux d'Afrique subsaharienne et d'Asie du Sud.
«Les charges élevées de la RAM liée aux bactéries sont fonction
à la fois de la prévalence de la résistance et de la fréquence
sous-jacente des infections critiques telles que les infections des
voies respiratoires inférieures, les infections du sang et les
infections intra-abdominales, qui sont plus élevées dans ces
régions», ont écrit les auteurs de l'étude.
L'étude, ainsi que de nombreuses autres qui ont été menées dans
les LMICs, a cité plusieurs raisons pour lesquelles la RAM a un
impact disproportionné dans les milieux à faibles ressources. Parmi
eux : l'utilisation inappropriée d'antibiotiques qui peuvent être
facilement achetés sans ordonnance, les antibiotiques contrefaits et
de qualité inférieure, et le manque d'assainissement et d'hygiène.
Tous jouent un rôle dans l'augmentation des taux de résistance.
Mais le facteur le plus important est peut-être le manque d'outils
de diagnostic qui peuvent déterminer le bon antibiotique nécessaire
pour l'infection d'un patient ou si un antibiotique est nécessaire.
La disponibilité limitée de ces diagnostics dans les pays pauvres,
qu'il s'agisse d'un système automatisé capable d'identifier la
bactérie spécifique à l'origine d'une infection et de tester la
sensibilité aux antibiotiques, ou d'un test rapide capable de
déterminer si une infection est bactérienne ou virale, entrave la
capacité de ces pays à faire face à la menace croissante de la
résistance aux antimicrobiens au niveau le plus élémentaire.
«La disponibilité d'aides au diagnostic pour soutenir ou informer
l'utilisation prudente des médicaments antimicrobiens», a déclaré
à CIDRAP News Otridah Kapona, scientifique au laboratoire spécialisé
dans la résistance aux antimicrobiens à l'Institut national de
santé publique de Zambie. «Et l'inverse est vrai : le manque de
capacité de diagnostic, je dirais, soutient l'utilisation
inappropriée des médicaments antimicrobiens.»
Manque de capacité de diagnostic dans les hôpitaux et en ville
Kapona, qui a participé à l'élaboration et à la mise en œuvre du
premier plan d'action national de la Zambie sur la résistance aux
antimicrobiens, affirme que le manque de capacité de diagnostic dans
des pays comme la Zambie se manifeste à plusieurs niveaux.
Dans la plupart des hôpitaux des pays riches, les cliniciens ont
accès à des systèmes automatisés coûteux qui peuvent fournir une
identification rapide des agents pathogènes et effectuer des tests
de sensibilité aux antibiotiques (TSA) directement à partir
d'échantillons de patients. Mais dans de nombreux hôpitaux des
LMICs, les bactéries provenant d'échantillons de patients doivent
être cultivées pour identifier l'agent pathogène spécifique et
effectuer des tests de sensibilité aux antibiotiques, un processus
qui peut prendre 2 à 3 jours.
En conséquence, les cliniciens dans ces milieux ne connaissent
souvent pas la bactérie spécifique qui cause l'infection et
finissent par traiter les patients en fonction de leurs symptômes et
de leur propre expérience clinique. Le résultat typique est un
traitement avec des antibiotiques à large spectre qui couvrent un
large éventail de bactéries mais peuvent favoriser la résistance.
«Nous ciblons à peu près tout», a déclaré Kapona. "Nous ne
sommes pas spécifiques dans notre gestion, et l'utilisation de tels
médicaments accélère le rythme auquel la résistance aux
antimicrobiens se développe dans des pays comme la Zambie.»
Des scénarios similaires sont observés dans d'autres LIMCs
dépourvus du type de systèmes de diagnostic sophistiqués qui
pourraient permettre aux cliniciens de déterminer rapidement
l'antibiotique spécifique nécessaire. Une étude
menée en 2020 par des chercheurs du Center for Disease Dynamics,
Economics & Policy a révélé que l'utilisation d'antibiotiques
«Watch», un étiquetage donné aux antibiotiques à large spectre
qui, selon l'OMS, ne devrait pas être utilisée pour les infections
de routine en raison de leur potentiel plus élevé de promotion de
la résistance a augmenté de 165% dans les LIMCs de 2000 à 2015.
Les capacités de diagnostic limitées dans les hôpitaux et le
manque de laboratoires de référence clinique capables d'effectuer
des tests pour les hôpitaux ne sont pas les seules raisons de cette
augmentation ; un mauvais assainissement et une incidence plus
élevée d'infections résistantes aux médicaments sont également
des facteurs. Mais le manque de capacité de diagnostic joue un rôle
important.
«Il y a très peu de laboratoires capables de faire de la
microbiologie, où ils peuvent identifier correctement un organisme
et effectuer des tests de sensibilité aux antimicrobiens pour
informer les antimicrobiens que le médecin doit utiliser pour
traiter ce patient ou client particulier», a déclaré Kapona.
Et cela a un effet en cascade, selon Cecilia Ferreyra, directrice du
programme RAM de la Foundation
for Innovative New Diagnostics (FIND). Si les
cliniciens hospitaliers n'envoient pas d'échantillons bactériens
pour être cultivés et testés pour la sensibilité parce que le
processus prend trop de temps, alors les hôpitaux n'ont pas une idée
des profils de résistance pour divers agents pathogènes et ne
peuvent pas élaborer de directives de traitement précises.
«Lorsqu'un patient se rend à l'hôpital et que nous n'avons pas de
diagnostics qui peuvent rapidement me dire si ce patient a une
infection à Klebsiella ou une infection à staphylocoque…
je ne saurai pas quoi utiliser», a déclaré Ferreyra. «Et parce
qu'il y a ce manque général de données sur ce qu'est un profil
résistant dans ces contextes, je vais prescrire quelque chose qui
pourrait ou non être vraiment utile du tout.»
Le manque de diagnostics affecte également la prescription
d'antibiotiques au niveau communautaire dans les milieux à faibles
ressources, où les petites cliniques de soins primaires ont encore
moins de ressources. Comme Ferreyra, Kapona et leurs collègues l'ont
noté dans un article publié
l'année dernière dans PLOS Global Public Health, le test le
plus largement utilisé dans ces contextes pour déterminer si une
infection est virale ou bactérienne, le test de la protéine C
réactive (CRP), ne peut pas distinguer si les niveaux élevés de
CRP sont causés par des bactéries ou par le paludisme, la dengue ou
la COVID-19. Et d'autres tests sur le marché sont trop chers pour
les milieux à faibles ressources.
Sans tests rapides, précis et abordables au point de service qui
peuvent rapidement distinguer si une infection est bactérienne ou
virale, les adultes et les enfants qui entrent avec de la fièvre ou
des symptômes respiratoires causés par un virus sont susceptibles
de repartir avec des antibiotiques, ce qui sont souvent considérés
comme une solution simple et rapide.
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