Une excrétion prolongée du virus COVID-19 observée en Chine

« Une excrétion prolongée du virus COVID-19 observée en Chine », source article de Mary Van Beusekom paru le 19 mai 2020 dans CIDRAP News.

Les patients atteints de COVID-19 à l'extérieur de Wuhan, en Chine, ont excrété le virus pendant une médiane de 17 jours, selon une étude de cohorte rétrospective publiée le 18 mai 2020 dans International Journal of Infectious Diseases.

En outre, une étude dans le même journal a révélé que la transmission de l'épidémie de COVID-19 de troisième génération de cas a probablement commencé du 17 au 20 janvier à Wuhan, puis s'est propagée au reste de la province du Hubei du 23 au 24 janvier, tandis que la première et la deuxième génération de cas ont interagi pour aggraver l'épidémie.

Éxcrétion du virus pendant 6 semaines

Dans la première étude, des chercheurs ont étudié les facteurs cliniques, les résultats de laboratoire, les traitements et les résultats de 147 patients adultes attients de COVID-19 dans un seul hôpital à Changsha, Chine, la capitale de la province du Hunan, adjacente à la province du Hubei.

Fièvre à l'admission à l'hôpital (odds ratio [OR], 5,200; intervalle de confiance à 95% [IC], 1,190 à 22,726; P = 0,028), temps plus long entre le début des symptômes et l'admission (OR, 1,740; IC à 95%, 1,296 à 2.337; P <0,001) et un séjour hospitalier plus long (OR, 1,604; IC à 95%, 1,262 à 2,040; P <0,001) étaient associés à de plus longues périodes d’excrétion virale.

Le délai médian entre l'apparition des symptômes et l'admission était de 6 jours (intervalle interquartile, 3 à 10). Sur les 147 patients, 127 (86%) avaient une maladie modérée, tandis que 20 (14%) avaient une maladie grave. La durée de l'excrétion virale variait de 6 à 47 jours. Aucun patient n'a eu besoin d'une assistance respiratoire avancée ou n'est décédé.

L'âge, le sexe, l'indice de masse corporelle (IMC), les antécédents d'exposition et les maladies sous-jacentes n'étaient pas significativement différents entre 82 patients qui ont éliminé le virus pendant moins de 17 jours et les 65 qui ont éliminé le virus plus longtemps.

La charge virale chez les patients qui ont éliminé le virus pendant moins de 17 jours était indétectable pour 15 des 30 patients 12 jours après l'apparition des symptômes, alors qu'il a fallu 22 jours pour la charge virale chez 16 des 31 patients présentant une excrétion virale prolongée pour éliminer le virus.

L'âge médian des patients était de 42 ans et 54% étaient des femmes. L'IMC médian était de 23,2 kg/m². Soixante-treize patients avaient été exposés à d'autres patients COVID-19, tandis que 113 des 147 patients (77%) étaient associés à un groupe familial.

Trente des 147 patients (20%) avaient une ou plusieurs maladies sous-jacentes. Les symptômes les plus courants étaient la fièvre (115 sur 147 [78%]), la toux (122/147 [83%]) et la fatigue (62/147 [42%]). Tous les patients sauf six présentaient des résultats de radiographie thoracique anormaux, 85% (124 sur 147) avec atteinte pulmonaire bilatérale. Les patients présentant une excrétion prolongée avaient également une oxygénation artérielle significativement plus faible et des niveaux de fer plus élevés que les autres patients.

Les auteurs ont déclaré que les facteurs de risque identifiés pour l'excrétion virale prolongée devraient être pris en compte lors de la formulation des stratégies de quarantaine et ont appelé à une grande étude multicentrique pour explorer davantage ces facteurs.

Contrôle de la propagation de la seconde génération

Dans la deuxième étude, des chercheurs utilisant des données spatio-temporelles de cas COVID-19 en Chine continentale et des données d'appareils mobiles n'ont détecté aucune propagation de troisième génération du nouveau coronavirus en dehors du Hubei.

NB : le temps de génération est l’intervalle entre la date de l’infection d’une personne et la date de l’infection de son ‘infecteur’.

La première génération ou génération primaire de la transmission de maladies s'est reflétée dans les mouvements du marché des fruits de mer de Wuhan, et la transmission de deuxième génération, ou transmission secondaire, s'est reflétée dans les voyages de la ville de Wuhan vers ailleurs dans le Hubei. La transmission de troisième génération ou génération tertiaire a été généralement causée par des cas locaux plutôt qu'importés.

Ils ont noté que plusieurs millions de voyageurs en provenance de Wuhan ont quitté la ville pour les vacances annuelles du Nouvel An chinois dans la première moitié de janvier, et le premier cas de COVID-19 à l'extérieur du Hubei a été signalé le 19 janvier. L'épidémie s'est propagée rapidement au cours des 3 ou 4 jours suivants, malgré des procédures strictes de filtrage des transports mises en place dans de nombreuses villes.

La propagation de la première et de la deuxième génération s'est produite en même temps dans de nombreuses villes au début de l'épidémie, ce qui a accru la propagation.

Les auteurs ont déclaré que leurs résultats fournissent une image plus claire de l'effet du mouvement humain sur la transmission des épidémies et identifient les mesures de confinement actuelles et futures importantes.

« Les associations entre la propagation de l'épidémie diminuaient avec la distance et avaient des modèles temporels différents des sources épidémiques, impliquant une évolution potentielle de génération en génération de l'épidémie à l'échelle spatiale régionale », ont-ils dit.

Ils ont proposé des mesures de contrôle à différents niveaux qui pourraient varier selon le lieu et l'heure dans différentes zones, les villes avec une transmission de troisième génération appliquant les contrôles les plus stricts à la fois sur ceux en quarantaine et les cas exportés, et les villes avec transmission simultanée de première et deuxième génération se concentrant sur ceux en quarantaine et les cas importés. D'autres villes pourraient se concentrer sur le contrôle des cas importés.

« Une plus grande attention devrait être accordée au contrôle de la tendance à la propagation de deuxième génération et à l'élimination de la propagation potentielle de troisième génération », ont-ils écrit.