Résistance de E. coli provenant de denrées alimentaires d’origine animale destinés à l'alimentation en Europe

«Une étude révèle une gamme de résistance chez E. coli provenant de denrées alimentaires d’origine animale destinés à l'alimentation en Europe», source CIDRAP News.

Une analyse de Escherichia coli provenant d'animaux producteurs de denrées alimentaires en Europe a révélé que la sensibilité aux antibiotiques variait considérablement selon les antibiotiques, les espèces animales et les pays, avec quelques signes de déclin ces dernières années, a rapporté une équipe de chercheurs européens dans Journal of Antimicrobial Chemotherapy, European-wide antimicrobial resistance monitoring in commensal Escherichia coli isolated from healthy food animals between 2004 and 2018.

Pour décrire la sensibilité de E. coli provenant de denrées alimentaires d’origine animale à des antibiotiques médicalement importants, des chercheurs ont réalisé au hasard des prélèvements du contenu intestinal de bovins, de porcs et de poulets de chair sains à l'abattoir dans cinq ou six pays de l'Union européenne sur quatre périodes (2004-2006, 2008-2009, 2013-2014 et 2017-2018). 2013-2014 et 2017-2018). Ils ont effectué des tests de sensibilité pour 11 antibiotiques jugés médicalement importants par l'OMS et ont recherché la présence des gènes de résistance à la colistine MCR-1 à MCR-10.

Au total, 10 613 souches de E coli ont été récupérées. En règle générale, l'occurrence de la résistance était plus faible parmi les isolats de E coli provenant de bovins que parmi ceux provenant de porcs et de poulets de chair. Chez les poulets de chair, les pourcentages de résistance étaient les plus faibles en 2017-2018. La résistance au méropénem et à la tigécycline était absente et la résistance à l'azithromycine était de 0,2% à 2,0%. De plus, une faible résistance aux céphalosporines de troisième génération (1,1% à 7,4%) a été détectée chez les poulets de chair. La résistance à la colistine variait de 0,1% à 4,8%.

Les E coli des poulets de chair a montré une résistance élevée à la ciprofloxacine (7,3% à 23,3%), alors que pour les bovins et les porcs, elle était de 0,2% à 2,5%. Une résistance faible et/ou modérée au chloramphénicol (9,3% à 21,3%) et à la gentamicine (0,9% à 7,0%) a été observée chez les porcs et les poulets de chair. La résistance la plus élevée a été notée pour l'ampicilline (32,7% à 65,3%), la tétracycline (41,3% à 67,5%), le triméthoprime (32,0% à 35,7%) et l’association triméthoprime et sulfaméthoxazole (27,5% à 49,7%) chez les porcs et les poulets de chair, avec des différences selon les pays.

Les valeurs globales regroupées pour la multirésistance aux antibiotiques (MDR pour multidrug-resistance) étaient de 3,5% chez les bovins, 23,7% chez les porcs et 25,9% chez les poulets de chair. Une diminution significative de la MDR au fil du temps a également été observée pour les poulets de chair et une tendance à la baisse chez les porcs, alors qu'aucune tendance constante n'a été observée chez les bovins.

Les chercheurs disent que la baisse de la résistance chez les poulets de chair dans plusieurs pays, en particulier pour les antibiotiques les plus couramment utilisés en médecine vétérinaire, est probablement influencée par la baisse de l'utilisation globale d'antibiotiques vétérinaires depuis 2011.