vendredi 28 octobre 2022

Espagne : Retour sur la plus grande épidémie à L. monocytogenes jamais signalée en Europe

Alors que la justice est saisie dans cette pénible affaire, voici un article paru dans Eurosurveillance qui traite «Listeriosis outbreak caused by contaminated stuffed pork, Andalusia, Spain, July to October 2019 » (Épidémie de listériose causée par du porc farci contaminé, Andalousie, Espagne, juillet à octobre 2019).

Le blog vous propose le résumé, la discussion et la conclusion.

Résumé
Entre le 1er juillet et le 26 octobre 2019 en Andalousie, Espagne, une importante épidémie avec 207 cas confirmés de listériose a été identifiée. Les cas confirmés avaient un âge médian de 44 ans (intervalle : 0–94) et 114 étaient des femmes (55,1%). La plupart des cas (n = 154) avaient une gastro-entérite légère, 141 (68,1%) ont nécessité une hospitalisation et trois sont décédés ; cinq des 34 femmes enceintes ont fait une fausse couche. La période d'incubation médiane était de 1 jour (plage : 0-30) et était significativement plus courte chez les cas présentant une gastro-entérite par rapport à ceux présentant sans gastro-entérite (respectivement,1 jour contre 3 jours, p < 0,001). Le porc farci, un produit prêt à consommer non chauffé, provenant d'un seul producteur contaminé par Listeria monocytogenes ST388 a été identifié comme la source de l'infection. La souche de l'éclosion a été identifiée dans 189 échantillons humains et 87 échantillons non humains (82 alimentaires et 5 environnementaux). La notification de nouveaux cas a brusquement diminué après la mise en œuvre des mesures de contrôle. Celles-ci comprenaient le rappel d'aliments contaminés, des protocoles de prise en charge clinique des cas suspects et de prophylaxie après exposition chez les femmes enceintes et des campagnes de communication avec des messages concis à la population via les réseaux sociaux. Étant donné qu'il y avait 3 059 cas probables, il s'agissait de la plus grande épidémie à L. monocytogenes jamais signalée en Europe.

Discussion
À notre connaissance, nous signalons la plus grande épidémie de listériose en Espagne et l'une des plus importantes d'Europe à ce jour. De 2018 à 2019, une importante épidémie s'est produite en Allemagne, impliquant 112 cas confirmés de listériose invasive associée à du boudin contaminé. Aucune épidémie européenne avec 200 cas confirmés ou plus n'avait été signalée depuis 1992, date à laquelle 279 cas confirmés de listériose liés à la consommation de langue de porc en gelée avaient été enregistrés en France. Dans la présente étude, la contamination de porc farci d'un seul producteur a entraîné une grande épidémie à l'échelle nationale en Espagne, affectant principalement quatre provinces de la région d'Andalousie sur une période de 17 semaines. Une fois l'épidémie détectée début août, la source alimentaire a été rapidement identifiée dans les 10 jours grâce à des entretiens épidémiologiques et confirmée par la suite par WGS, qui a détecté la souche de l'éclosion (IVb; CC388; ST-388; CT-8466, disponible dans la base de données Pasteur MLST de Listeria) dans les isolats cliniques et les isolats non humains d'échantillons alimentaires prélevés à l'établissement X. La notification de nouveaux cas a cessé après la mise en œuvre de mesures de contrôle précoces, c'est-à-dire le rappel de produits, ce qui suggère que les produits alimentaires provenant d'autres établissements n'ont pas joué un rôle significatif dans la développement de l'épidémie.

La listériose invasive était le résultat clinique le plus fréquent selon les critères microbiologiques (L. monocytogenes détecté dans le sang) et les symptômes gastro-intestinaux étaient les manifestations les plus fréquentes. Fait remarquable, seulement 12% des cas étaient associés à la grossesse (listériose gestationnelle et néonatale) et peu de cas étaient gravement immunodéprimés, bien qu'il s'agisse principalement de groupes à risque touchés par la listériose invasive. Un tel paradoxe clinique peut avoir été influencé par une sensibilité accrue de la détection clinique en partie à cause de l'attention des médias.

Contrairement aux estimations d'autres grandes éclosions de listériose, une létalité relativement faible (1,5%) a été observée dans cette éclosion. Par exemple, le taux de létalité était de 6,3% (7/112) dans l'éclosion susmentionnée de listériose invasive en Allemagne. Au Danemark, le taux de létalité lors d'une épidémie à l'échelle nationale en 2013-2014 était de 41,5% (17/41), et un taux de létalité de 13,0% (14/108) a été signalé lors d'une épidémie dans plusieurs États des États-Unis en 1998. L'épidémie de listériose causant le plus grand nombre de décès enregistrés s'est produite en Afrique du Sud de 2017 à 2018 et a eu un taux de mortalité de 26,5% (193/728). Cependant, plusieurs mises en garde doivent être prises en compte lors de la comparaison de ces taux.

Premièrement, cette épidémie comprenait des cas sans symptômes de listériose invasive, qui ne sont pas systématiquement notifiés dans d'autres systèmes de surveillance épidémiologique.

Deuxièmement, en ce qui concerne les résultats, les pertes de grossesse ont été classées comme séquelles au lieu de décès.

Troisièmement, tous les aliments ne favorisent pas la croissance de L. monocytogenes, qui varie selon le type de produit, sa préparation, son stockage et sa consommation. Des disparités existent même parmi les produits prêts à consommer, comme le montrent les valeurs de UFC/g de L. monocytogenes dans les échantillons d'aliments observés dans cette étude. Cela contraste avec les résultats de l'épidémie en Allemagne (tous les échantillons de boudins non ouverts inférieurs à 100 UFC/g) dans lesquels la contamination s'est probablement produite après la production.

Enfin, les caractéristiques cliniques des personnes infectées constituent l'un des déterminants les plus importants de la gravité des résultats. Bien que les trois patients décédés dans cette éclosion aient plus de 70 ans et qu'un ait eu une tumeur maligne, la plupart des cas signalés ici étaient pour la plupart en bonne santé avec un âge médian de 44 ans. Ce profil ne coïncide généralement pas avec celui des cas des études citées. Par exemple, l'épidémie du Danemark comprenait des patients hospitalisés avec un âge médian de 71 ans, dont plus de la moitié avaient un cancer diagnostiqué. Néanmoins, malgré le taux de mortalité relativement faible calculé dans cette étude selon les définitions de cas, l'impact de l'épidémie a été considérable, étant donné que cinq pertes de grossesse supplémentaires ont été prises en compte.

La période médiane d'incubation était de 1 jour. Reconnaissant la rareté des données sur la période d'incubation des grandes épidémies de listériose d'origine alimentaire, cette constatation est dans une certaine mesure conforme à celles signalées dans de telles épidémies.

Presque tous les cas ont été diagnostiqués par hémocultures et trois des quatre patients ont présenté une gastro-entérite ; la bactériémie et la gastro-entérite ont été associées à une courte période d'incubation, avec une durée médiane respectivement de 1 à 7 jours et 2 jours. De plus, après que les médias aient diffusé l'alerte de santé publique, il est probable que les patients étaient bien conscients de l'épidémie et ont demandé des soins médicaux plus tôt. D'autres facteurs pouvant avoir contribué à la brève période d'incubation observée incluent la dose d'exposition élevée, influencée par le degré de contamination par L. monocytogenes, la quantité d'aliments ingérés, la façon dont ils ont été préparés et consommés (par exemple, lorsque les établissements alimentaires vendaient des sandwichs de porc farci, les personnes n'ont pas toujours déclaré les manger ou les réfrigérer immédiatement) et les conditions environnementales en été.

Comme les produits prêts à consommer peuvent être consommés sans chauffage préalable et que leur consommation est en augmentation, ils deviennent rapidement un vecteur pertinent pour les épidémies de listériose. En Andalousie, le porc farci est très populaire localement, car il s'agit d'un aliment prêts à consommer traditionnel à faible coût. Il se compose d'une charcuterie de porc rôti avec de l'ail, des épices et du sel. Souvent consommée en été et lors d'occasions spéciales, elle constitue l'une des «tapas» les plus populaires et est un ingrédient courant des apéritifs et des sandwichs. Les marques de porc farci de l'établissement X figuraient également parmi les marques les plus populaires dans au moins trois des provinces touchées par cette épidémie (Séville, Huelva et Cadix) ; cependant, les produits de ces marques étaient rarement vendus dans le reste de l'Espagne.

Au-delà des risques attribuables aux produits prêts à consommer, les mesures de sécurité des aliments optimales pour éviter les épidémies de L. monocytogenes n'ont pas été entièrement élucidées. Alors que certains pays ont mis en place des réglementations plus strictes (par exemple, les États-Unis suivent une politique de tolérance zéro), la prévention des incidents de sécurité des aliments nécessite la convergence de plusieurs éléments, tels que HACCP ou la formation appropriée des employés dans les usines de transformation des aliments, car la plupart des maladies d'origine alimentaire résultent de mauvaises pratiques d'hygiène des employés. Dans cette épidémie, cependant, il n'y avait aucune preuve de telles pratiques concernant les employés, mais les mauvaises conditions d'hygiène dans l'établissement X auraient pu expliquer la contamination des produits carnés, qui aurait pu se produire après le traitement thermique et avant leur livraison aux magasins ou aux vendeurs. En outre, des améliorations sont nécessaires en ce qui concerne les registres de distribution alimentaire. Bien que la collaboration entre les professionnels de la sécurité des aliments et les professionnels de la santé publique dans cette épidémie ait été adéquate, l'identification de tous les établissements auxquels le porc farci avait été distribué n'a pas été aussi rapide que souhaité. Dans la région d'étude, cette alerte de santé publique a stimulé l'élaboration d'un plan en trois étapes pour la maîtrise de L. monocytogenes.

Nos résultats illustrent les avantages de combiner les données épidémiologiques et le WGS pour identifier et contrôler les épidémies d'origine alimentaire, et soulignent l'importance de la collaboration transfrontalière - par le biais de la décision 1082/2013 de l'UE et du Règlement sanitaire international de 2015 - pour identifier de nouveaux cas et le partage des résultats entre les pays. L'étendue de la transmission internationale signalée par Moura et al. suggère que certaines épidémies causées par L. monocytogenes ne sont pas détectées, soulignant la nécessité d'améliorer la coordination entre les systèmes d'information de surveillance (microbiologie, sécurité des aliments et santé humaine). Pour adapter la réponse à la listériose, nous recommandons d'enquêter sur la transmission d'origine alimentaire dans tous les cas confirmés en laboratoire et de limiter la fenêtre d'exposition à 10 jours avant le diagnostic pour les cas présentant une gastro-entérite.

Cette étude n'est pas exempte de limites.

Premièrement, le nombre réel de cas confirmés a probablement été sous-estimé pour les raisons suivantes : les cas asymptomatiques et bénins ne consultent pas toujours un médecin, les milieux de culture non spécifiques sont peu sensibles pour détecter L. monocytogenes, tous les isolats n'étaient pas disponibles pour le typage WGS et des données manquaient pour 11 cas détectés dans les six régions espagnoles en dehors de l'Andalousie. Néanmoins, nous pensons que cette sous-estimation n'a pas eu beaucoup d'impact sur l'enquête puisque la plupart des résultats des tests positifs provenaient d'échantillons de sang. De plus, la mise en place d'une campagne de communication a permis de mieux faire connaître l'alerte sanitaire.

Deuxièmement, nous n'avons pas pu accéder aux dossiers électroniques des patients hospitalisés dans des hôpitaux privés (11,3 %), ce qui nuit à la qualité des données cliniques.

Troisièmement, nous avons utilisé une définition complexe des cas confirmés qui incluaient la consommation alimentaire, alors qu'idéalement, les définitions de cas devraient être limitées aux catégories de résultats de la maladie et aux caractéristiques démographiques.

Quatrièmement, nous n'avons pas montré d'analyses de parenté génétique car les comparaisons de génomes selon le schéma MLST du génome central de Ruppitsch sont en cours d'évaluation dans un travail différent dans le cadre du projet LISMOAN.

Cinquièmement, un véhicule alimentaire spécifique a été suspecté en identifiant une exposition commune à un produit à travers les entretiens épidémiologiques, en raison de la forte proportion de cas confirmés interrogés (95,2%). Cependant, un biais de rappel ne peut être exclu et l'exposition alimentaire a été évaluée à un moment donné, car il n'y a pas eu d'entretiens de suivi. Enfin, lors des enquêtes sur les épidémies, les comparaisons cas-témoins peuvent permettre d'identifier les expositions alimentaires, mais elles nécessitent beaucoup de ressources. Lors de cette épidémie, la croissance épidémique exponentielle et le nombre élevé d'hospitalisations ont empêché les épidémiologistes locaux de mener une étude analytique appropriée.

Conclusion
Cette épidémie avec 207 cas confirmés et trois décès était parmi les plus importantes signalées en Europe. Le porc farci provenant d'une seule installation contaminée par L. monocytogenes ST388 a été identifié comme la source d'infection par des enquêtes épidémiologiques et de traçabilité. La notification de nouveaux cas a brusquement diminué après l'application de mesures de contrôle, y compris un important rappel d'aliments. Les efforts visant à intégrer le WGS dans les enquêtes sur les flambées et à coordonner différents secteurs aux niveaux régional et national sont essentiels pour la prévention et le contrôle de la listériose.

Commentaire
Étude qui permet de faire le plein de références, certaines sont citées ci-dessus.
Le blog a publié de nombreux articles à ce sujet dont le dernier a été cité en début d’article.
Tout le monde sait de quel groupe alimentaire il s’agit, la presse en a abondamment parlé, mais les auteurs continuent de l’appeler établissement X, n’est-ce pas un peu hypocrite ?
Notons aussi que les responsabilités des autorités sanitaires sont aussi à prendre en compte mais là, pas d’information, voir Espagne: Sept personnes font face aux accusations dans une épidémie mortelle à Listeria, mais la Ville de Séville est épargnée.

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