Une étude détaille comment la résistance aux antimicrobiens frappe l'Europe

«Une étude détaille comment la résistance aux antimicrobiens frappe l'Europe», source article de Chris Dal dans CIDRAP News.

Une nouvelle analyse du la charge de la résistance aux antimicrobiens (RAM) en Europe estime que les bactéries résistantes aux médicaments étaient liées à plus d'un demi-million de décès dans la région en 2019.

L'étude, publiée dans The Lancet Public Health, a révélé que, dans les 53 pays de la région européenne de l'Organisation mondiale de la santé (OMS), 541 000 décès étaient associés à la RAM d’origine bactérienne et 133 000 décès étaient directement attribuables aux pathogènes résistants aux antibiotiques. Les taux de mortalité les plus élevés à la fois attribuables et associés à la RAM se trouvaient en Europe de l'Est, suivie de l'Europe centrale.

La grande majorité des décès dus à la RAM ont été causés par sept pathogènes bactériens, Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM) et Escherichia coli résistant à l'aminopénicilline étant les principaux coupables.

Les auteurs de l'étude disent que l'analyse fournit l'évaluation la plus détaillée et la plus complète à ce jour de la charge de la RAM en Europe.

«Les niveaux élevés de résistance de plusieurs pathogènes bactériens importants et de combinaisons pathogène-antibiotique, ainsi que les taux de mortalité élevés associés à ces pathogènes, montrent que la résistance aux antimicrobiens est une menace sérieuse pour la santé publique dans la région européenne de l'OMS», ont-ils écrit.

Décès attribuables et associés

L'étude, menée par une équipe internationale de scientifiques et dirigée par des chercheurs de l'Institute for Health Metrics and Evaluation de l'Université de Washington, a utilisé des données provenant de diverses sources pour estimer, grâce à la modélisation statistique, les décès et les années de vie ajustées sur l'incapacité (DALYs) attribuables et associés à 23 pathogènes bactériens et 88 médicaments utilisés contre les pathogènes dans la Région européenne de l'OMS en 2019.

Dans l'ensemble, 471 millions de dossiers individuels ou d'isolats bactériens ont été obtenus auprès de sources telles que le Réseau européen de surveillance de la résistance aux antimicrobiens, le Réseau de surveillance de l'Asie centrale et de l'Europe de la résistance aux antimicrobiens et le Système mondial de surveillance de la résistance aux antimicrobiens (GLASS pour Global Antimicrobial Resistance Surveillance System) de l'OMS.

La méthodologie de l'étude était similaire à l'approche utilisée dans le rapport de la recherche mondiale sur la résistance aux antimicrobiens (GRAM pour Global Research on Antimicrobial Resistance) publié plus tôt cette année, qui estimait que 1,27 million de décès dans le monde étaient directement attribuables à la RAM en 2019 (sur 4,95 millions qui étaient associés à pathogènes résistants aux antibiotiques). Les auteurs disent que cette étude étend ces résultats tout en fournissant des estimations plus granulaires et spécifiques à chaque pays en Europe.

Comme dans le rapport GRAM, les chercheurs ont calculé la charge de la RAM (décès et DALYs) en utilisant une approche basée sur deux scénarios contrefactuels. Pour estimer les décès directement attribuables aux bactéries résistantes, ils ont envisagé un scénario dans lequel ces infections étaient remplacées par des infections sensibles aux antibiotiques. Pour estimer les décès associés, ils ont considéré un scénario dans lequel les infections résistantes étaient remplacées par une absence d'infection.

Sur les 133 000 décès attribuables estimés (intervalle d'incertitude à 95% [II], 90 100 à 188 000) et 541 000 décès associés (II à 95%, 370 000 à 763 000), la plus grande charge mortelle due à la RAM provenait des infections du sang, avec 47 200 décès attribuables et 195 000 décès associés liés à toute combinaison antibiotique-pathogène résistant. Les autres principales causes de décès dues à toute combinaison antibiotique-pathogène résistant étaient les infections intra-abdominales (31 200 décès attribuables et 127 000 décès associés) et les infections respiratoires (28 500 décès attribuables et 120 000 décès associés).

Sept principaux pathogènes bactériens étaient responsables de 112 784 décès attribuables et de 457 591 décès associés : E. coli, S aureus, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Enterococcus faecium, Streptococcus pneumoniae et Acinetobacter baumannii.

Le SARM était la principale combinaison antibiotique-pathogène pour les décès attribuables à la RAM dans 27 pays (51% de la région), tandis que E. coli résistant à l'aminopénicilline était la principale combinaison antibiotique-pathogène pour les décès associés dans 47 pays (89% de la région) . Une distribution similaire a été observée avec les DALYs pour les combinaisons pathogène-antibiotique.

Les taux de mortalité estimés pour 100 000 habitants observés en Europe de l'Est (19,9/100 000 attribuables et 74,0/100 000 associés) et en Europe centrale (16,6/100 000 attribuables et 68,0/100 000 associés) étaient considérablement plus élevés qu'en Europe de l'Ouest (11,7/100 000 attribuables et associés) et 52,5/100 000 associés). Compte tenu des taux de mortalité normalisés selon l'âge pour 100 000 habitants, les pays les plus touchés par la RAM étaient concentrés en Asie centrale (qui est considérée par l'OMS comme faisant partie de la Région européenne).

L'analyse a également révélé que les pays de la région dotés de plans d'action nationaux sur la résistance aux antimicrobiens élaborés, approuvés, financés et mis en œuvre se situaient dans le 50e centile le plus bas des taux de mortalité normalisés selon l'âge, tant pour les décès attribuables que pour les décès associés. Les pays ayant des scores d'indice sociodémographique (SDI) inférieurs - une mesure du développement global - avaient une charge de mortalité liée à la RAM plus élevée.

De plus, une corrélation positive entre le taux brut de mortalité liés à la RAM et l'utilisation d'antimicrobiens ont été observés, la relation la plus forte étant observée en Europe occidentale et centrale.

Nécessité de stratégies de réduction de la résistance aux antimicrobiens

Par rapport aux estimations du rapport GRAM, la région européenne de l'OMS, qui représente environ 12% de la population mondiale, représente 10,5% des 1,27 million de décès estimés dans le monde attribuables à la RAM, et 10,9% des 4,95 millions estimés associés des décès.

Dans un commentaire d'accompagnement, des experts en maladies infectieuses des Hôpitaux universitaires et de la Faculté de médecine de Genève disent que les résultats illustrent l'impact négatif substantiel sur la santé des infections liées à la RAM dans toute l'Europe. Ils ajoutent que les futures stratégies de réduction de la résistance aux antimicrobiens dans la région nécessiteront de développer et de maintenir des réseaux de surveillance de la résistance aux antimicrobiens de haute qualité pour faire progresser les connaissances sur la véritable charge de la résistance aux antimicrobiens, en finançant la recherche pour évaluer la charge de combinaisons spécifiques d'agents résistants et de développer des interventions spécifiques aux pathogènes, et la quantification de l'impact économique et des coûts indirects attribuables à la RAM.

«Tous ces éléments peuvent combler les lacunes dans les connaissances et ouvrir la voie à une stratégie de sortie de cette pandémie silencieuse», ont écrit Nasreen Hassoun-Kheir et Stephan Harbarth.

Ils disent également que les résultats devraient encourager les cliniciens et les décideurs politiques de toute l'Europe à approuver et à mettre en œuvre des plans de contrôle de la résistance aux antimicrobiens spécifiques à chaque pays, en mettant parallèlement l'accent sur la mise en œuvre des meilleurs programmes de contrôle des infections et de gestion des antibiotiques dans les établissements de santé.