Qu'est-ce que le test salivaire de détection du COVID-19 ?

« Qu'est-ce que le test salivaire de détection du COVID-19 ? », source American Society for Microbiology.

Qu'est-ce que le test salivaire direct ?

Il s'agit d'un test pour détecter l'acide nucléique du virus SARS-CoV-2 qui cause le COVID-19. Comme d'autres tests COVID qui recherchent l'acide nucléique du virus (c'est-à-dire l'ARN), il doit toujours être testé dans un laboratoire clinique certifié. Ce n'est pas un test rapide qui peut être fait près du patient; les patients doivent encore attendre que leurs résultats reviennent du laboratoire.

Pourquoi ce test reçoit-il autant d'attention?

• Facile à collecter: Ce test ne nécessite que la collecte de salive dans un récipient stérile, par opposition à un écouvillon nasal profond (c'est-à-dire l'écouvillon nasopharyngé ou NP), qui peut être inconfortable pour le patient et nécessite un personnel formé portant une protection individuelle spéciale équipement (EPI) à collecter.
• Moins de fournitures de collecte requises: la salive peut être collectée dans des conteneurs stériles largement disponibles, bon marché et ne nécessitant pas de conservateurs ou de conteneurs spéciaux. En ces temps, pendant lesquels les approvisionnements sont rares, c'est très souhaitable.
• Moins d'étapes dans le test: le test de recherche d'acides nucléiques par amplification moléculaire (c.-à-d. PCR) nécessitent généralement que l'ARN viral soit retiré de l'échantillon et purifié. C'est ce qu'on appelle l'extraction, et les réactifs utilisés pour l'extraction ont également été rares tout au long de cette pandémie. Le test salivaire direct (ou SalivaDirect) utilise une procédure simple qui ne nécessite pas d'instrumentation pour ouvrir le virus et enlever l'ARN viral. Cet ARN est ensuite testé par amplification moléculaire.
• Accessibilité de l'instrumentation: De nombreux tests ARN SARS-CoV-2 actuels sont conçus pour être exécutés sur des instruments spécifiques, généralement fabriqués par le fabricant du test. Le test SalivaDirect peut être effectué sur plusieurs types d'instruments trouvés dans des laboratoires moléculaires cliniques spécialisés, permettant potentiellement à ces laboratoires de commencer les tests sans acquérir d'instruments supplémentaires et coûteux.



Les tests moléculaires typiques du SARS-CoV-2 par rapport au test SalivaDirect de la collecte des échantillons aux résultats. Source American Society for Microbiology.

Quelles sont les limites de ce test?

• Professionnels qualifiés: Le test nécessite un personnel de laboratoire hautement qualifié avec une expérience en microbiologie et en biologie moléculaire pour exécuter le test.
• Dépenses: Bien que les développeurs de tests aient déclaré que le coût prévu serait inférieur à 5 dollars par test, en réalité, le coût sera plus élevé si l'on tient compte des coûts des produits chimiques, de l'instrumentation, de la main-d'œuvre hautement qualifiée, de la maintenance des tests et des frais généraux du laboratoire. Les coûts réels seront similaires à ceux des tests ARN SARS-CoV-2 actuels, les économies de réactifs étant plus que compensées par une main-d'œuvre accrue.
• Problèmes de collecte: La salive peut être difficile à collecter chez certains patients, peut encore présenter un risque d'aérosol et a tendance à contaminer l'extérieur du contenant. Des précautions doivent être prises pour éviter la contamination du sang et des expectorations, car ceux-ci peuvent interférer avec les tests moléculaires.
• Difficile à manipuler: La salive peut être collante et épaisse et difficile à manipuler pour les laboratoires de manière sûre et précise. Les machines automatisées de manipulation d'échantillons ont des problèmes avec cela.
• Sensibilité du test: La salive est 10 à 50 fois moins sensible en tant que type d'échantillon qu'un écouvillon nasopharyngé. Les patients ayant une faible charge virale peuvent être faussement testés négatifs. D'autres recherches sur les tests de salive ont montré une perte de sensibilité similaire.
• Développement et utilisation des tests: Les tests PCR manuels, comme le test SalivaDirect, nécessitent une main-d'œuvre nettement plus qualifiée que les autres tests disponibles. Ce test est également difficile à adapter à des volumes élevés et utilise encore de nombreux réactifs et consommables.

S'agit-il d'un test rapide qui peut être effectué là où les échantillons sont prélevés? Qui peut effectuer le test?

Non, il ne s'agit pas d'un test au point de service qui peut être effectué dans les cabinets médicaux ou à proximité du patient, ni à la maison. Par conséquent, il n'est pas considéré comme un test rapide. Il est à peu près aussi rapide que les tests en laboratoire existants.

Le test SalivaDirect nécessite un laboratoire de haute complexité avec une expérience dans les tests moléculaires manuels avec 3 zones de test physiquement séparées, une avec des enceintes de sécurité biologique. La plupart des laboratoires hospitaliers ne peuvent pas faire cela. Les tests sont effectués par des techniciens de laboratoire hautement qualifiés. Les laboratoires doivent respecter toutes les exigences réglementaires avant de fournir des tests.

Document préparé par l’American Society for Microbiology’s Clinical and Public Health.

Lire le communiqué de l’Académie nationale de médecine : Masquez-vous, masquez-vous, masquez-vous