Épidémie dans plusieurs États d'infections à Escherichia coli O157:H7 liées à une chaîne nationale de restauration rapide au États-Unis en 2022

Le paradoxe de l'œuf et de la poule est un très ancien paradoxe : «Qu'est-ce qui est apparu en premier : l'œuf ou la poule ?»
De façon similaire, Joe Whitworth se demande ci-dessous, qui a contaminé les consommateurs, la viande hachée bovine ou les légumes verts à feuilles ?
Le résultat se trouve dans l’article très intéressant ci-dessous ...

Was it the leafy greens or beef? #ecoli https://t.co/J75pOjq1rz

— joewhitworth (@joewhitworth) June 30, 2023

«Notes du terrain : Épidémie dans plusieurs États d'infections à Escherichia coli O157:H7 liées à une chaîne nationale de restauration rapide au États-Unis en 2022», source MMWR du 30 juin 2023.

En août 2022, le Michigan Department of Health and Human Services a alerté le CDC d'une multiplication par cinq environ des cas régionaux d'infection à Escherichia coli O157:H7. Le séquençage du génome entier a été utilisé pour caractériser les isolats de cas d’infection confirmés en laboratoire chez des personnes malades.

Les premiers entretiens avec les patients ont indiqué que beaucoup avaient consommé des repas à la même chaîne nationale de restauration rapide. Les autorités fédérales, étatiques et locales ont lancé une investigation pour identifier la source de l'épidémie et prévenir d'autres cas. Cette activité a été examinée par le CDC et a été menée conformément à la loi fédérale applicable et à la politique du CDC.

Le CDC a défini un cas comme une infection à E. coli O157:H7 avec un isolat fortement lié à la souche épidémique (entre 0 et 2 allèles) par typage multilocus du génome central, avec apparition de la maladie du 26 juillet au 24 août 2022. PulseNet, le réseau national de typage moléculaire du CDC pour la surveillance des maladies entériques a détecté 109 cas dans six États, dont le Michigan (67 ; 61%), l'Ohio (24 ; 22%), l'Indiana (11 ; 10%), la Pennsylvanie (quatre ; 4%), le Kentucky (deux ; 2%) et New York (un ; 1%). L'âge médian des patients était de 22 ans (intervalle = 1 à 94 ans) et 49 (45 %) étaient des femmes. Cinquante-deux (48%) patients ont été hospitalisés et 13 (12%) ont développé un syndrome hémolytique et urémique, une complication reconnue de l'infection à E. coli O157:H7 ; aucun décès n'est survenu.

Des entretiens générateurs d'hypothèses ont été menés auprès de 84 (77%) patients ; parmi ceux-ci, 70 (83%) ont déclaré avoir mangé dans la même chaîne de restauration rapide au cours de la semaine précédant le début de la maladie. L'investigation a identifié 11 groupes de restaurants (groupes de personnes malades non apparentées qui ont mangé dans le même restaurant). Les personnes malades ont déclaré avoir mangé des ingrédients alimentaires couramment servis ensemble sur plusieurs plats du menu. Parmi les 68 patients qui ont fourni des informations détaillées, les expositions les plus fréquemment signalées étaient les galettes de bœuf (53 ; 78%) et la laitue romaine sur les sandwichs (46 ; 68%). Au début de l'investigation, l'exposition à la laitue romaine a dépassé 90%, ce qui a incité la chaîne de restauration rapide à retirer la laitue dans les États où des cas associés à une éclosion se sont produits.

Des manipulateurs d'aliments infectés par la souche de l'éclosion ont été identifiés, mais il est peu probable qu'ils en soient la source ultime. Bien que les manipulateurs d'aliments malades aient pu amplifier l'épidémie dans certains endroits, de nombreux cas groupés dans des restaurants n'avaient aucun manipulateur d'aliments affecté.

Compte tenu des éléments du menu signalés par des personnes malades et du fait que les éclosions d'origine alimentaire à E. coli O157:H7 sont souvent liées aux légumes verts à feuilles et à la viande bovine, la Food and Drug Administration (FDA) a tracé la laitue romaine et l’U.S. Department of Agriculture’s Food Safety and Inspection Service (USDA-FSIS) a tracé les galettes de viande bovine pour déterminer leur source. Aucun des deux traçabilités n'a identifié un seul lot de production qui pourrait expliquer toutes les maladies associées aux épidémies. En l'absence d'un autre cas groupé de restaurants en dehors de la chaîne nationale de restauration rapide, la FDA et l'USDA n'ont pas été en mesure d'utiliser la triangulation pour identifier la convergence d'un aliment spécifique vers une source commune. Les États ont testé les aliments des restaurants et la FDA a testé les aliments et les prélèvements environnementaux de la chaîne d'approvisionnement ; cependant, la souche épidémique n'a pas été identifiée dans les prélèvements analysés.

Les investigateurs ont établi un lien entre cette large éclosion d'infections à E. coli O157:H7 dans plusieurs États et le fait de manger dans une chaîne nationale de restauration rapide. Malgré les enquêtes épidémiologiques, de traçabilité et microbiologiques, l'ingrédient contaminé n'a pas été confirmé. Cette épidémie met en évidence les défis récurrents associés aux investigations sur les éclosions liées à des chaînes uniques de restaurants. La colinéarité des ingrédients (c'est-à-dire le partage de nombreux ingrédients entre plusieurs éléments de menu) a empêché l'identification d'un seul élément associé à des maladies. La contamination croisée entre les ingrédients ou par des manipulateurs d'aliments malades a également compliqué l'identification de la source. L'absence de cas groupés de restaurants avec un système d'approvisionnement indépendant en dehors de la chaîne de restauration rapide a empêché l'utilisation de la triangulation pour identifier la source. Malgré ces défis, une communication claire avec les partenaires de l'État, la FDA, l'USDA-FSIS et la chaîne de restaurants a conduit à une action de santé publique rapide pour retirer la laitue romaine suspectée des restaurants identifiés. Aucun cas de maladie associée à l'éclosion n'a été signalée après le retrait de la laitue romaine présumée.

Commentaire

Une confirmation de ce qui a été dit plus haut dans le récent avis de l’Anses sur les STEC, il était rapporté,

L’Agence constate que les sources de contamination ne sont que rarement identifiées lors d’investigations épidémiologiques des cas d’infection. Or, les épidémies récentes en France et à l’étranger pointent vers de nouvelles sources (p.ex. farines). Aussi, dans une approche «Une seule Santé», l’Anses recommande de conduire des études d’attribution des sources afin d’identifier et de quantifier la contribution relative des réservoirs animaux, de l’environnement et des aliments au fardeau sanitaire. En complément de la filière bovine (viande hachée et fromages au lait cru), d’autres filières alimentaires devraient faire l’objet d’une surveillance microbiologique (contrôles officiels et autocontrôles) incluant le séquençage des souches isolées. L’Agence souligne enfin l’importance d’une collaboration des différents acteurs impliqués dans la surveillance des maladies et des dangers, notamment dans le cadre de la plateforme de surveillance sanitaire de la chaîne alimentaire.

Vu le temps qui a été mis identifier la farine comme nouvelle source, on peut sans doute espérer une meilleure prise en compte de la bibliographie internationale qui avait identifiée le sujet depuis 2009, c'est-à-dire il y a 14 ans ...

L’étude américaine du CDC montre que la ou les sources de contamination n’ont pas été identifiées. Néanmoins, la laitue romaine suspectée, mais non prouvée sur le plan microbiologique, une fois retirée du marché, a permis la fin de cette importante épidémie.