Une étude met en évidence des gènes de résistance chez les E. coli producteurs de shigatoxines

Comme le relate Joe Whitworth dans un tweet, «Comme si les pathogènes alimentaires ne suffisaient pas, ils sont aussi résistants aux antimicrobiens ...».

«Une étude met en évidence des gènes de résistance chez les E. coli producteurs de shigatoxines», source article de Chris Dall paru le 7 août 2023 dans CIDRAP News.

Le séquençage du génome entier d'e Escherichia coli producteurs de shigatoxines (STEC) à partir de prélèvements fécaux humains a révélé que près de 15% hébergeaient des gènes de résistance aux antimicrobiens (RAM), ont rapporté des chercheurs anglais dans Journal of Antimicrobial Therapy.

Dans l'étude, des chercheurs de la UK Health Security Agency ont extrait et séquencé l'ADN de prélèvements fécaux de patients en Angleterre suspectés d'infections gastro-intestinales, qui sont testés pour une gamme de pathogènes gastro-intestinaux. Ils se sont concentrés sur STEC O157:H7, le sérotype de STEC le plus fréquemment détecté au Royaume-Uni, et ont utilisé un séquençage à lecture longue pour décrire l'occurrence et la fréquence des déterminants de la RAM dans les isolats de STEC O157:H7.

Dans l'ensemble, 216 (14,7%) des 1 473 isolats de STEC O157:H7 avaient au moins un déterminant de la RAM, bien que la proportion d'isolats présentant une RAM variait selon la sous-lignée. Les proportions les plus élevées de déterminants de la RAM ont été détectées dans les sous-lignées Ib (28/64, 43,7%), I/II (18/51, 35,3%) et IIc (122/440, 27,7%).

Dans les sept sous-lignées, les gènes de la RAM les plus couramment détectés conféraient une résistance aux aminoglycosides (11,7%), aux tétracyclines (11,3%), aux sulfamides (11,7%) et aux bêta-lactamines (8,8%). Les gènes de l’AMR conférant une résistance aux fluoroquinolones, aux macrolides et aux céphalosporines de troisième génération ont été rarement détectés, et aucun gène de carbapénèmase n'a été détecté.

Les auteurs de l'étude disent que la proportion d'isolats de STEC O157:H7 en Angleterre présentant une résistance à au moins une classe d'antibiotiques a diminué au cours des deux dernières décennies, passant de 20% dans les études précédentes à 14,7% dans cette étude, une conclusion qu'ils suggèrent. pourrait être lié à une utilisation plus réglementée des antibiotiques dans le bétail britannique. En outre, ils notent que les souches associées aux voyages en dehors du Royaume-Uni étaient plus susceptibles d'héberger des gènes de résistance.

Ils disent que la mise en œuvre du séquençage à lecture longue dans la surveillance de routine permettra aux responsables de la santé publique de surveiller l'émergence et la propagation d'agents pathogènes entériques résistants aux médicaments.

«La surveillance de la RAM dans les agents pathogènes gastro-intestinaux peut fournir une alerte précoce des risques émergents pour la santé publique concernant la gestion clinique et le traitement empirique des maladies infectieuses», ont-ils écrit.