Etats-Unis : Souche persistante de Salmonella Infantis (REPJFX01) liée à du poulet

«Souche persistante de Salmonella Infantis (REPJFX01) liée à du poulet», source communication du CDC du 21juillet 2023.

REPJFX01 est une souche persistante et multirésistante de la bactérie Salmonella Infantis qui a provoqué des cas de maladie et des épidémies aux États-Unis et dans le monde.

La maladie causée par cette souche a été signalée pour la première fois à PulseNet en 2012. Au 31 décembre 2022, les informations de 2 900 patients infectés par REPJFX01 ont été signalées à PulseNet. L'âge médian des patients était de 54 ans (intervalle interquartile, 27-70 ans) et 62% étaient des femmes. La source de l'isolat était les selles dans 65% des cas et l'urine dans 27% des cas. Les maladies causées par cette souche surviennent toute l'année, mais sont plus fréquentes en juillet et en août. Dans le passé, REPJFX01 s'est propagé aux personnes par le biais de poulets contaminés aux États-Unis et par des expositions lors de voyages internationaux.

Parmi un sous-ensemble de 251 patients ayant des dossiers dans le Foodborne Disease Active Surveillance Network (FoodNet) entre 2018 et 2020, 10% des patients ont voyagé à l'étranger dans les 7 jours précédant le début de leur maladie ; la plupart se sont rendus en République Dominicaine (45%), au Pérou (25%) ou en Équateur (10%). Parmi le même sous-ensemble de patients, 29% ont été hospitalisés, 7% ont été admis en unité de soins intensifs et moins de 1% sont décédés. Parmi les 85 patients qui ont reçu des antibiotiques recommandés comme traitement de première ligne ou alternatif pour la salmonellose, 78% avaient un isolat résistant à cet antibiotique.

Cette souche de Salmonella Infantis est génétiquement relativement diversifiée. Les bactéries de la souche ont des différences de 82 allèles de l’une par rapport l’autre par cgMLST**. Ceci est plus diversifié sur le plan génétique que les épidémies d'origine alimentaire dans plusieurs États typiques, dans lesquelles les bactéries se situent généralement à moins de 10 d'allèles différents les uns des autres.

Points rapides

Bactéries	Salmonella enterica
Sérotype	Infantis
Profil de résistance aux antimicrobiens	Multirésistant aux antibiotiques (voir détails ci-dessous)
Souche persistante	REPJFX01
Première détection	Juin 2012
Nombre de cas signalés dans PulseNet	2900
Investigations d’épidémies	7
Origine identifiées des épidémies	- Produits de poulet cru (confirmé) : 1 épidémie - Poulet séparé mécaniquement (suspecté) : 1 épidémie

*Selon la Société Française de Microbiologie, le cgMLST est une première approche standardisée qui permet de se repérer dans la classification des souches d’une espèce, et apporte le plus souvent une discrimination suffisante pour exclure des relations clonales.

**Des sources confirmées ont été impliquées par des données épidémiologiques
ainsi que des données de traçabilité ou de laboratoire. Sources suspectées n'ont été mis en cause que par des données épidémiologiques. Plus d’information ici.

La suite est à découvrir dans le document du CDC.

Complément

On lira l’article de Bill Marler dans le Marler Blog, «Sérieusement, pourquoi diable l'USDA et le CDC ne protègent-ils pas le public de Salmonella Infantis dans le poulet ?»

Les dangers de manger de la pâte crue

Il s’agit ci-après du dernier communiqué relatif à une éclosion à Salmonella liée à de la pâte crue à biscuits aux Etats-Unis. Le blog profite de ce communiqué pour y adjoindre à la suite d’autres élements sur les dangers de manger de la pâte crue.

Un communiqué de la FDA du 13 juillet rapporte que l’investigation sur une éclosion à Salmonella liée à de la pâte à biscuits crue (mai 2023)

L'investigation de la FDA est terminée. Le CDC déclare l'épidémie terminée.

La FDA et le CDC, en collaboration avec des partenaires étatiques et locaux, ont enquêté sur une épidémie d'infections à Salmonella Enteritidis liées à de la pâte pour Chocolate Chip Cookie et S’mores Bars vendues dans les magasins franchisés de Papa Murphy's et achetées avant le 23 mai 2023.

La FDA a mené une enquête de traçabilité et identifié deux fournisseurs d'intérêt. La FDA et plusieurs partenaires étatiques ont collecté des prélèvements chez les deux fournisseurs, et les partenaires étatiques ont également collecté des prélèvements dans plusieurs magasins Papa Murphy's.

Tous les prélèvements collectés ont été signalés comme négatifs pour la contamination par Salmonella. Le 13 juillet 2023, le CDC a annoncé que l'épidémie était terminée. Le CDC signale un total de 26 cas de personnes malades dans six États. La dernière apparition de la maladie remonte au 22 mai 2023. L'investigation de la FDA est terminée.

En réponse à cette investigation, Papa Murphy's a informé les propriétaires franchisés à l'échelle nationale et a cessé de vendre toute pâte à Chocolate Chip Cookie et S’mores Bars dans tous les magasins et a cessé d'utiliser des mélanges de pâte à biscuits secs non préparés datant d'avril 2023 pour s'assurer que des ingrédients potentiellement contaminés ne soient pas utilisés. Au 13 juillet 2023, Papa Murphy's n'a pas relancé les ventes de pâte à biscuits. De plus, l'entreprise revoit les articles et les étiquettes de son menu de desserts pour améliorer encore les instructions aux consommateurs afin de souligner que leurs produits ne sont pas destinés à être consommés crus.

Nombre de cas

- Nombre total de cas : 26

- Hospitalisations : 4

- Décès : 0

- Début de la dernière maladie : 22 mai 2023

- États avec cas : Cafifornie, Idaho, Montana, Oregon, Washington, Utah.

- Distribution des produits : à l'échelle nationale.

 Selon le CDC,

«Le nombre réel de personnes malades dans cette épidémie était probablement beaucoup plus élevé que le nombre signalé, et l'épidémie n'a peut-être pas été limitée aux États où les maladies sont connues. En effet, de nombreuses personnes se rétablissent sans soins médicaux et ne sont pas testées pour Salmonella.»

Des tests spécifiques sont nécessaires pour diagnostiquer une infection à Salmonella, qui imite d'autres maladies.

Les cas de maladie ont commencé à des dates allant du 24 février au 28 mai, selon le CDC. Le 23 mai, Papa Murphy’s a temporairement cessé de vendre sa pâte crue à biscuits Chocolate Chip Cookie et S’mores Bars en réponse à cette épidémie.

Les enquêteurs de la santé publique ont utilisé le système PulseNet pour identifier les cas de maladie qui faisaient partie de cette éclosion. PulseNet du CDC gère une base de données nationale d'empreintes ADN de bactéries qui causent des maladies d'origine alimentaire. L'empreinte ADN est réalisée sur des bactéries à l'aide d'une méthode appelée séquençage du génome entier (WGS). Le WGS a montré que les bactéries provenant de prélèvements de personnes malades sont étroitement liées génétiquement. Cela suggère que les personnes concernées par cette épidémie sont tombées malades à cause du même aliment.

Les responsables de la santé publique conseillent toujours aux personnes de ne pas manger de pâte ou de pâte crue, car elle contient des ingrédients crus tels que la farine, qui peuvent héberger des bactéries telles que Salmonella et E. coli.

Le CDC propose les conseils suivants pour une utilisation sécuritaire de la pâte crue, de la pâte à frire et de la farine :

- Ne manger jamais de pâte crue censée être cuite au four.
- Se laver toujours les mains et nettoyer et désinfecter soigneusement les surfaces de travail et les ustensiles après tout contact avec de la pâte crue ou de la pâte à frire.
- Conserver les aliments crus ou la pâte à l'écart des autres aliments lors de leur préparation pour éviter toute contamination possible de se propager.

«Les dangers de manger de la pâte crue», source Society of Risk Analysis, décembre 2022.

De nouvelles études montrent que de nombreux consommateurs ne savent peut-être pas que la farine non cuite provoque des maladies d'origine alimentaire

Au cours de la dernière décennie, la farine crue ou non cuite a été identifiée comme une source émergente d'intoxication alimentaire. L'un des problèmes peut être le suivant : dans une enquête récente, jusqu'à deux tiers des participants ont admis avoir mangé de la pâte à biscuits crue. De nouvelles études montrent que les consommateurs ne savent peut-être pas que, comme les œufs, la farine est un aliment cru qui peut être contaminé par des bactéries comme Salmonella et E. coli.

Deux nouvelles études sur les coûts et les dangers de la consommation de farine non cuite ont été présentées lors d'un symposium sur les risques pour la sécurité des aliments lors de la réunion annuelle de la Society for Risk Analysis, du 4 au 8 décembre 2022 à Tampa, Floride. Dans sa présentation, «Ne pas manger de pâte crue - Une étude de cas sur la communication des risques de sécurité des aliments avec les consommateurs» (Do Not Eat Raw Dough – A Case Study of Communicating Food Safety Risks with Consumers), Betty Feng de l'Université Purdue décrit ses recherches sur la sensibilisation des consommateurs aux risques liés à la manipulation de farine crue. Dans une deuxième étude, Rubait Rahman de la Michigan State University identifie les épidémies associées à la farine et aux produits à base de farine de 2001 à 2021 et estime le fardeau économique des maladies d'origine alimentaire associées à ces produits.

Le Centers for Disease Control (CDC) estime qu'un Américain sur six contracte une maladie d'origine alimentaire chaque année et Salmonella et E. coli font partie des cinq principaux agents pathogènes qui envoient des personnes à l'hôpital. Ces deux bactéries ont récemment été identifiées comme la cause de maladies liées à la farine. (En 2021, une épidémie à E. coli dans 12 États était liée à un mélange à gâteau.)

L'année dernière, Feng et ses collègues ont rapporté que 85% des consommateurs interrogés n'étaient pas au courant des rappels de farine ou des épidémies, et seulement 17% de ceux qui utilisent de la farine pour cuisiner pensaient qu'ils seraient affectés. Malgré le fait que le CDC et la FDA ont récemment publié des fiches d'information sur les dangers de manger de la pâte crue, 66% des consommateurs interrogés ont déclaré qu'ils mangeaient de la pâte à biscuits ou de la pâte crue.

Feng a présenté les résultats d'une récente étude de suivi oculaire dans laquelle seuls deux participants sur 47 ont trouvé les messages de sécurité sanitaire de la farine sur les 10 emballages de mélange à pâte ou de farine disponibles dans le commerce.

«Nos recherches ont montré que les messages de sécurité saniatire de la farine sur les emballages actuels ne sont pas efficaces pour transmettre des informations et modifier le comportement des consommateurs», a déclaré Feng.

Dans une étude distincte, «Foodborne Illness Outbreaks in Flour and Flour-Based Food Products from Microbial Pathogens in the US and Their Economic Burden from 2001-2021», Rahman et ses collègues constatent que neuf éclosions de maladies d'origine alimentaire associées à la farine et aux aliments à base de farine produits sont apparus aux États-Unis au cours des 20 dernières années (2001-2021). Ces flambées ont entraîné 752 cas de maladie signalés, dont 30% ont nécessité une hospitalisation. La plupart de ces cas signalés, causées par des infections à Salmonella et E. coli, impliquaient la consommation de farine crue ou la manipulation non sécuritaire d'un produit à base de farine.

Mais les recherches de l'équipe indiquaient que plus de 19 000 cas de maladies d'origine alimentaire associés à ces produits peuvent survenir chaque année aux États-Unis, soit plus de 500 fois le nombre de cas signalés. Leur analyse tient compte de facteurs tels que la sous-déclaration et le sous-diagnostic, ce qui entraîne un fardeau pour la santé publique dépassant de loin les statistiques officiellement publiées.

Sur la base de leur estimation du nombre de cas de 2001 à 2021, Rahman et ses collègues constatent que le coût économique moyen d'une intoxication alimentaire à la farine peut atteindre 258 millions de dollars par an. Cela comprend les coûts associés aux soins médicaux directs, les pertes de productivité, la mortalité prématurée et comprend des mesures de la douleur et de la souffrance résultant de ces maladies.

«Beaucoup de ces coûts peuvent être évités en sensibilisant davantage le public aux risques liés à la consommation de farine crue et de produits à base de farine», déclare Rahman.

Etats-Unis : Augmentation sensible des infections à Cyplospora. Á propos d'une note du terrain sur une épidémie liée à de la salade en Floride.

«Notes du terrain : Doublement des cas de cyclosporose partiellement attribuables à un kit de salade en Floride, 2021-2022», source MMWR du 7 juillet 2023.

Le CDC publie cette note du terrain qui souligne l’importance du parasite Cyclospora aux Etats-Unis.

La cyclosporose est une infection gastro-intestinale causée par un parasite protozoaire, Cyclospora cayetanensis. Cette espèce n'est connue que pour infecter les humains et est acquise lorsque les oocystes sont ingérés par des aliments ou de l'eau contaminés par des matières fécales contenant le parasite. La maladie a été signalée pour la première fois en 1979, et l'organisme a été identifié et nommé en 1994. Historiquement, les infections étaient généralement acquises en dehors des États-Unis ou à partir de produits importés aux États-Unis. Ces dernières années, le nombre de cas signalés aux États-Unis a augmenté : les cas ont plus que doublé, passant de 537 en 2016 à 1 194 en 2017, puis ont presque triplé pour atteindre 3 519 cas en 2018 ; en 2019, 4 703 cas de cyclosporose ont été signalés. Récemment, le parasite a été retrouvé sur des produits cultivés localement et des infections ont été attribuées à ces aliments. Le lavage des produits diminuera mais n'éliminera pas le parasite.

Investigation et résultats

En Floride, le nombre de cas signalés de cyclosporose a augmenté au cours des 10 dernières années† ; 254 cas ont été signalés en Floride en 2021, et le nombre a doublé pour atteindre 513 en 2022, dont 486 (95%) cas confirmés en laboratoire et 27 (5%) cas probables. Des prélèvements de 276 (54 %) patients atteints de cyclosporose ont été soumis au projet de génotypage de Cyclospora du CDC, dont 211 (76%) qui ont été appariés à un code de cluster génétique temporel spécifique. Parmi les 513 cas signalés en 2022, 469 (91%) patients ont signalé un début de maladie entre le 1er mai et le 31 août 2022, avec un pic début juillet.

Le Florida Department of Health a exigé que le personnel de santé publique du comté remplisse le questionnaire national de génération d'hypothèses sur la cyclosporose du CDC (CNHGQ pour CDC Cyclosporiasis National Hypothesis Generating Questionnaire) pour tous les patients dont la maladie est apparue entre le 1er mai et le 31 août 2022. Parmi les 457 questionnaires remplis, 330 (72%) répondants ont déclaré des informations sur l'exposition sans voyage international, dont 200 (61%) qui ont déclaré avoir été exposés à de la salade en sachet, un sachet de salade prélavée produit commercialement. Parmi les répondants ayant déclaré avoir été exposés à de la salade heten sac, 85 (43 %) ont mentionné une marque spécifique de kits de salade César contenant uniquement de la laitue romaine, d'une chaîne spécifique de magasins. Les dates d'apparition de ce cluster de cas se sont produites entre le 23 juin et le 16 juillet, avec une date médiane d'apparition de la maladie du 1er juillet. 76 personnes supplémentaires atteintes de cyclosporose ont déclaré avoir été exposées à des kits de salade César, mais ces personnes ne pouvaient pas se souvenir des marques de salade ou avaient achetés auprès d'une chaîne différente pour un total de 161 cas potentiellement liés. Des éclosions de cyclosporose ont déjà été associées à des salades en sachet dans le passé. Cette activité a été examinée par le CDC.

Le CDC utilise un outil de génotypage pour faciliter le couplage épidémiologique des cas en temps quasi réel. Parmi 211 spécimens génotypés avec succès de Floride, 153 (73%) ont été assignés au même groupe génétique temporel (2022_001), dont 43 (96%) des 45 spécimens génotypés liés au cluster de salade en sachet et 30 (39%) des 76 les personnes déclarant des kits de salades César sans autre information d'identification. Ces informations ont été partagées avec la Food and Drug Administration ainsi que des informations sur l’origine du produit impliqué de la chaîne de magasins afin de faciliter la traçabilité du produit ; cependant, la source du produit probablement contaminé n'a pas été identifiée.

Conclusions préliminaires

Dans cette investigation, les résultats de l'analyse de génotypage ont démontré une forte concordance entre les données de génotypage et épidémiologiques. La combinaison du CNHGQ rempli et des données génétiques renforce les preuves pour identifier les cas potentiellement liés à la même source d'infection et peut guider les futures enquêtes.

NB : La photo est du CDC.

Etats-Unis : Aucune preuve que l'eau de Javel ait été consommée pour guérir de la COVID-19 pendant la pandémie, selon une étude

«Aucune preuve que l'eau de Javel ait été consommée pour guérir de la COVID-19 pendant la pandémie, selon une étude», source article de Stéphanie Soucheray paru dans CIDRAP News.

Un nouvel article dissipe les récits selon lesquels les Américains ont bu de l'eau de Javel pour guérir ou prévenir le COVID-19, une pratique contre laquelle même les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) ont mis en garde pendant les premiers mois de la pandémie. L’article a été publié dans PLOS One.

n juin 2020, le CDC a partagé les résultats d'une enquête en ligne qui a montré que 39% des Américains se livraient à au moins une pratique de nettoyage non recommandée par le CDC depuis avril 2020, avec 4% des répondants disant qu'ils buvaient ou se gargarisaient de l'eau de Javel diluée pour éviter la COVID-19. Ces réponses, associées à une augmentation des rapports d'appels au centre antipoison du CDC, ont créé un récit selon lequel la consommation d'eau de Javel se produisait parmi les Américains inquiets.

Les auteurs de l'étude ont interrogé 600 répondants au cours de l'été 2020 et ont appliqué plusieurs analyses qui traitent de multiples caractéristiques connues du biais problématique des répondants. L'enquête qui a suivi a révélé que les «répondants problématiques» représentaient 23,3% à 33,0% des répondants à l'enquête du CDC.

«Dans deux études portant sur près de 1 300 répondants, nous avons reproduit les conclusions du CDC montrant qu'environ 4% des répondants ont déclaré avoir adopté chacun des trois comportements hautement dangereux : boire ou se gargariser avec du nettoyant ménager, de l'eau savonneuse et de l'eau de Javel diluée», ont dit les auteurs. «Cependant, nous avons également observé que 3 à 7% des personnes interrogées ont déclaré n'avoir jamais utilisé Internet lors de l'enquête en ligne et avoir eu une crise cardiaque mortelle.»

Les chercheurs doivent vérifier rigoureusement les répondants problématiques, en particulier lorsque l'enquête vise à mesurer des événements rares.

Après avoir retiré les réponses à l'enquête de tous les participants qui ont fourni des réponses inattentives, consentantes et négligentes, il n'y avait aucune preuve que quelqu'un ait bu des produits de nettoyage pendant les premiers mois de la pandémie.

«Les répondants problématiques aux enquêtes posent un défi fondamental à toute recherche par sondage et menacent la validité de la politique de santé publique», ont conclu les auteurs. «Pour réduire ces menaces, les chercheurs doivent vérifier rigoureusement les répondants problématiques, en particulier lorsque l'enquête vise à mesurer des événements rares.»

États-Unis : Les infections à Cronobacter chez les bébés sont désormais une maladie à déclaration obligatoire

«États-Unis : Les infections à Cronobacter chez les bébés sont désormais une maladie à déclaration obligatoire», source article de Coral Beach paru le 29 juin 2023 dans Food Safety News.

Le CDC a annoncé qu'il commencerait à suivre les infections causées par Cronobacter, qui était à l'origine d'une épidémie en 2021-22 chez des bébés et a provoqué une pénurie de préparations pour nourrissons qui a tourmenté le pays pendant des mois.

Le conseil est l'organisme qui recommande les maladies «à déclaration obligatoire». Cette liste comprend déjà des maladies causées par d'autres agents pathogènes d'origine alimentaire, notamment E. coli, Salmonella et Listeria. Environ 120 autres maladies figurent sur la liste des agents pathogènes «à déclaration obligatoire au niveau national». Le conseil et le CDC gèrent la liste.

Lorsque la recommandation deviendra active, les infections à Cronobacter identifiées chez les nourrissons de moins d'un an seront signalées par les médecins et les laboratoires aux services de santé de l'État. Ces départements informeront alors le CDC.

Les groupes de défense des consommateurs, notamment STOP Foodborne Illness, Consumer Reports et Environmental Working Group, ont plaidé en faveur du changement pendant des années, mais ont intensifié leurs efforts lors de l'épidémie de 2021-22.

Bien que peu de données soient disponibles car les infections causées par la bactérie n'ont pas été systématiquement suivies, les chiffres actuels montrent que 40% des bébés infectés par Cronobacter décèdent.

Le Minnesota et le Michigan sont les seuls États qui ont signalé des infections à Cronobacter au CDC. La recommandation peut être adoptée désormaist par n'importe quel État, mais n'entrera officiellement en vigueur qu'en 2024.

Sur la base d'une recommandation du Council of State and Territorial Epidemiologists, les responsables du Centers for Disease Control and Prevention des États-Unis ont annoncé leur décision le jeudi 29 juin.

Les responsables du Minnesota ont découvert la première infection infantile à cronobacter de l'épidémie de 2021-22 et l'ont signalée à la FDA. Cela a conduit les responsables de la santé publique locaux, étatiques et fédéraux à mettre en commun des informations et à découvrir des patients au Texas et dans l'Ohio. Après l'épidémie, des groupes de consommateurs ont déclaré que si l'infection à Cronobacter avait été une maladie à déclaration obligatoire, les maladies auraient pu être évitées et des vies auraient pu être sauvées.

«Ces efforts aideront les agences de santé publique à quantifier et à identifier la cause des infections à Cronobacter», a dit Janet Hamilton, directrice exécutive du Council of State and Territorial Epidemiologists, dans un communiqué. «(Cela) contribuera à protéger la santé des personnes les plus vulnérables. En fin de compte, nous voulons que ces infections soient évitées.»

Observation

Pour la France, la liste des maladies à déclaration obligatoire établie par Santé publique France se trouve ici.

Épidémie dans plusieurs États d'infections à Escherichia coli O157:H7 liées à une chaîne nationale de restauration rapide au États-Unis en 2022

Le paradoxe de l'œuf et de la poule est un très ancien paradoxe : «Qu'est-ce qui est apparu en premier : l'œuf ou la poule ?»
De façon similaire, Joe Whitworth se demande ci-dessous, qui a contaminé les consommateurs, la viande hachée bovine ou les légumes verts à feuilles ?
Le résultat se trouve dans l’article très intéressant ci-dessous ...

Was it the leafy greens or beef? #ecoli https://t.co/J75pOjq1rz

— joewhitworth (@joewhitworth) June 30, 2023

«Notes du terrain : Épidémie dans plusieurs États d'infections à Escherichia coli O157:H7 liées à une chaîne nationale de restauration rapide au États-Unis en 2022», source MMWR du 30 juin 2023.

En août 2022, le Michigan Department of Health and Human Services a alerté le CDC d'une multiplication par cinq environ des cas régionaux d'infection à Escherichia coli O157:H7. Le séquençage du génome entier a été utilisé pour caractériser les isolats de cas d’infection confirmés en laboratoire chez des personnes malades.

Les premiers entretiens avec les patients ont indiqué que beaucoup avaient consommé des repas à la même chaîne nationale de restauration rapide. Les autorités fédérales, étatiques et locales ont lancé une investigation pour identifier la source de l'épidémie et prévenir d'autres cas. Cette activité a été examinée par le CDC et a été menée conformément à la loi fédérale applicable et à la politique du CDC.

Le CDC a défini un cas comme une infection à E. coli O157:H7 avec un isolat fortement lié à la souche épidémique (entre 0 et 2 allèles) par typage multilocus du génome central, avec apparition de la maladie du 26 juillet au 24 août 2022. PulseNet, le réseau national de typage moléculaire du CDC pour la surveillance des maladies entériques a détecté 109 cas dans six États, dont le Michigan (67 ; 61%), l'Ohio (24 ; 22%), l'Indiana (11 ; 10%), la Pennsylvanie (quatre ; 4%), le Kentucky (deux ; 2%) et New York (un ; 1%). L'âge médian des patients était de 22 ans (intervalle = 1 à 94 ans) et 49 (45 %) étaient des femmes. Cinquante-deux (48%) patients ont été hospitalisés et 13 (12%) ont développé un syndrome hémolytique et urémique, une complication reconnue de l'infection à E. coli O157:H7 ; aucun décès n'est survenu.

Des entretiens générateurs d'hypothèses ont été menés auprès de 84 (77%) patients ; parmi ceux-ci, 70 (83%) ont déclaré avoir mangé dans la même chaîne de restauration rapide au cours de la semaine précédant le début de la maladie. L'investigation a identifié 11 groupes de restaurants (groupes de personnes malades non apparentées qui ont mangé dans le même restaurant). Les personnes malades ont déclaré avoir mangé des ingrédients alimentaires couramment servis ensemble sur plusieurs plats du menu. Parmi les 68 patients qui ont fourni des informations détaillées, les expositions les plus fréquemment signalées étaient les galettes de bœuf (53 ; 78%) et la laitue romaine sur les sandwichs (46 ; 68%). Au début de l'investigation, l'exposition à la laitue romaine a dépassé 90%, ce qui a incité la chaîne de restauration rapide à retirer la laitue dans les États où des cas associés à une éclosion se sont produits.

Des manipulateurs d'aliments infectés par la souche de l'éclosion ont été identifiés, mais il est peu probable qu'ils en soient la source ultime. Bien que les manipulateurs d'aliments malades aient pu amplifier l'épidémie dans certains endroits, de nombreux cas groupés dans des restaurants n'avaient aucun manipulateur d'aliments affecté.

Compte tenu des éléments du menu signalés par des personnes malades et du fait que les éclosions d'origine alimentaire à E. coli O157:H7 sont souvent liées aux légumes verts à feuilles et à la viande bovine, la Food and Drug Administration (FDA) a tracé la laitue romaine et l’U.S. Department of Agriculture’s Food Safety and Inspection Service (USDA-FSIS) a tracé les galettes de viande bovine pour déterminer leur source. Aucun des deux traçabilités n'a identifié un seul lot de production qui pourrait expliquer toutes les maladies associées aux épidémies. En l'absence d'un autre cas groupé de restaurants en dehors de la chaîne nationale de restauration rapide, la FDA et l'USDA n'ont pas été en mesure d'utiliser la triangulation pour identifier la convergence d'un aliment spécifique vers une source commune. Les États ont testé les aliments des restaurants et la FDA a testé les aliments et les prélèvements environnementaux de la chaîne d'approvisionnement ; cependant, la souche épidémique n'a pas été identifiée dans les prélèvements analysés.

Les investigateurs ont établi un lien entre cette large éclosion d'infections à E. coli O157:H7 dans plusieurs États et le fait de manger dans une chaîne nationale de restauration rapide. Malgré les enquêtes épidémiologiques, de traçabilité et microbiologiques, l'ingrédient contaminé n'a pas été confirmé. Cette épidémie met en évidence les défis récurrents associés aux investigations sur les éclosions liées à des chaînes uniques de restaurants. La colinéarité des ingrédients (c'est-à-dire le partage de nombreux ingrédients entre plusieurs éléments de menu) a empêché l'identification d'un seul élément associé à des maladies. La contamination croisée entre les ingrédients ou par des manipulateurs d'aliments malades a également compliqué l'identification de la source. L'absence de cas groupés de restaurants avec un système d'approvisionnement indépendant en dehors de la chaîne de restauration rapide a empêché l'utilisation de la triangulation pour identifier la source. Malgré ces défis, une communication claire avec les partenaires de l'État, la FDA, l'USDA-FSIS et la chaîne de restaurants a conduit à une action de santé publique rapide pour retirer la laitue romaine suspectée des restaurants identifiés. Aucun cas de maladie associée à l'éclosion n'a été signalée après le retrait de la laitue romaine présumée.

Commentaire

Une confirmation de ce qui a été dit plus haut dans le récent avis de l’Anses sur les STEC, il était rapporté,

L’Agence constate que les sources de contamination ne sont que rarement identifiées lors d’investigations épidémiologiques des cas d’infection. Or, les épidémies récentes en France et à l’étranger pointent vers de nouvelles sources (p.ex. farines). Aussi, dans une approche «Une seule Santé», l’Anses recommande de conduire des études d’attribution des sources afin d’identifier et de quantifier la contribution relative des réservoirs animaux, de l’environnement et des aliments au fardeau sanitaire. En complément de la filière bovine (viande hachée et fromages au lait cru), d’autres filières alimentaires devraient faire l’objet d’une surveillance microbiologique (contrôles officiels et autocontrôles) incluant le séquençage des souches isolées. L’Agence souligne enfin l’importance d’une collaboration des différents acteurs impliqués dans la surveillance des maladies et des dangers, notamment dans le cadre de la plateforme de surveillance sanitaire de la chaîne alimentaire.

Vu le temps qui a été mis identifier la farine comme nouvelle source, on peut sans doute espérer une meilleure prise en compte de la bibliographie internationale qui avait identifiée le sujet depuis 2009, c'est-à-dire il y a 14 ans ...

L’étude américaine du CDC montre que la ou les sources de contamination n’ont pas été identifiées. Néanmoins, la laitue romaine suspectée, mais non prouvée sur le plan microbiologique, une fois retirée du marché, a permis la fin de cette importante épidémie.  

États-Unis : Investigations d'une épidémie dans plusieurs États de cas d’infection à Salmonella Thompson liées à une exposition aux produits de la mer en 2021

Voici le compte-rendu en provenance des États-Unis d'une épidémie dans plusieurs États de cas d’infection à Salmonella Thompson liées à une exposition aux produits de la mer en 2021, source MMWR

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Résumé

Que sait-on déjà sur ce sujet

Salmonella Thompson est un sérotype relativement rare qui n'est généralement pas associé aux produits de la mer. Des épidémies précédentes ont été associées au bœuf, au poulet, aux tiges de vigne et aux légumes verts à feuilles.

Qu'apporte ce compte-rendu ?

De mai à octobre 2021, 115 personnes dans 15 États sont tombées malades avec S. Thompson. La plupart des patients ont déclaré avoir consommé des produits de la mer au Colorado avant l'apparition de la maladie. La souche épidémique a été identifiée chez un seul distributeur et transformateur de produits de la mer à Denver, où des possibilités de contamination croisée, en raison d'une désinfection inadéquate, ont été identifiées.

Quelles sont les implications pour la pratique de la santé publique ?

Les pratiques de nettoyage dans les installations de transformation doivent prévenir la contamination croisée. La collaboration de plusieurs agences pour fournir des informations sur la sécurité des aliments lors des rappels de produits est essentielle pour assurer l'élimination de tous les produits rappelés.

En juillet 2021, le Colorado Department of Public Health and Environment (CDPHE) a identifié un groupe de cinq isolats de sérotype Thompson de Salmonella enterica liés les uns aux autres au sein d'une différence d'allèle, en utilisant le typage cgMLST. Ces cinq isolats, soumis au laboratoire de santé publique dans le cadre d’un processus de routine pour les tests de confirmation de Salmonella, étaient étroitement liés à ceux identifiés dans une investigation dans plusieurs États de 2020, au cours de laquelle une traçabilité a été effectué pour le thon et le saumon de qualité sushi ; un fournisseur commun n'a pas été identifié. L'investigation de 2021 a débuté le 5 août 2021, avec cinq patients vivant dans le Colorado et un dans le Missouri, Washington et le Wisconsin. D'août à décembre 2021, le CDC, le CDPHE, les responsables de la santé publique et de la réglementation de plusieurs États et la Food and Drug Administration (FDA) ont mené des investigations épidémiologiques, environnementales et de laboratoire sur cette épidémie dans plusieurs États à Salmonella Thompson. Les isolats étaient génétiquement liés les uns aux autres et aux isolats de 2020 avec une différence de zéro à un allèle. Les produits de la mer en cause ont été tracés jusqu'à un seul distributeur de produits de la mer, chez qui la souche épidémique a été identifiée par un échantillonnage environnemental et chez qui l'inspection a révélé une désinfection inadéquate et des possibilités de contamination croisée du poisson cru. Le distributeur a émis un rappel volontaire de 16 produits de la mer à fort potentiel de contamination et a pris des mesures correctives. Cette épidémie a illustré l'importance de procédures de nettoyage et de désinfection efficaces et de la mise en œuvre de contrôles. Lorsque plusieurs produits sont rappelés au cours d'une investigation sur une épidémie, la collaboration entre les agences de santé publique et les établissements concernés peut aider à fournir des informations sur la sécurité des aliments aux restaurants, aux distributeurs et aux consommateurs, et à assurer l'élimination de tous les produits rappelés.

Discussion

L'investigation sur l'épidémie a donné lieu à une grande quantité de données liées aux entretiens, à la traçage amont et aval, aggravant le challenge d'identifier un véhicule ou une source alimentaire spécifique et limitant les résultats. Par exemple, de nombreux patients ont dit avoir mangé des produits de la mer à divers endroits au cours de leurs périodes d'exposition. L'analyse des sous-groupes a permis aux investigateurs de cibler ces informations et de prioriser la collecte de données auprès des établissements couramment signalés par les patients. Cependant, la petite taille et la nature complexe de chaque sous-groupe ont limité la puissance de cette analyse. Le plus grand sous-groupe ne contenait que quatre patients confirmés de l'épidémie, et trois sous-groupes ne comprenaient que deux patients chacun. Dans un cas, un seul patient a déclaré avoir consommé de la nourriture dans plus d'un établissement du sous-groupe, ce qui a encore compliqué l'analyse. Réinterroger les patients et poser des questions sur l'historique des repas dans les restaurants couramment signalés pourrait être bénéfique pour élargir la taille des sous-groupes et la puissance des données collectées. Tout au long de l'investigation, des priorités concurrentes ont limité la capacité des agences de santé publique, entraînant des retards dans la collecte des reçus d’achat, des factures et des listes de clients. Les actions de traçabilité ont permis aux investigateurs de compléter les informations sur les fournisseurs collectées par les agences locales de santé publique et de réglementation avec des listes de clients fournies par les distributeurs afin d'identifier les modèles de distribution communs parmi les installations signalées. De plus, les investigateurs ont dû faire face à la résistance des établissements de restauration préoccupés par le partage d'informations exclusives sur les plats ou les factures des fournisseurs.

Cette investigation illustre l'importance d'une communication claire et directe avec le public et des partenariats avec les responsables locaux de la santé publique et de la réglementation qui peuvent tirer parti des relations existantes avec les établissements locaux. Lorsqu'une investigation sur une épidémie entraîne le rappel de plusieurs produits, la collaboration entre les agences de santé publique et les établissements concernés peut servir à fournir des renseignements sur la sécurité des aliments aux restaurants, aux distributeurs et aux consommateurs, et à assurer l'élimination de tous les produits rappelés. Mettre en œuvre de façon appropriée des pratiques de nettoyage dans les installations de transformation axées sur la prévention de la contamination croisée sont importantes.

Etats-Unis : 57% des produits de poulet crus, farcis et panés provenant des foyers domestiques et de magasins contenaient Salmonella, selon une nouvelle étude

Une nouvelle étude sur les produits de poulet, crus, farcis et panés, et, je serais tenté de dire une énième étude, rapporte que 57% de ces produits provenant des foyers domestiques et de magasins contenaient Salmonella, source article de Marie Van Beusekom paru le 4 mai 2023 dans CIDRAP News.

Aux États-Unis, de 1998 à 2022, 11 épidémies à Salmonella étaient liées à des produits de poulet crus, farcis et panés, et une moyenne de 57% des échantillons prélevés dans les maisons et les magasins ont révélé la bactérie, selon une étude publiée le 4 mai dans le Morbidity and Mortality Weekly Report (MMWR).

L'étude dirigée par le Centers for Disease Control and Prevention (CDC) fait suite à un communiqué du 25 avril du Département américain de l'agriculture (USDA) sur sa proposition de déclarer Salmonella un contaminant dans les produits de poulet crus, panés et farcis lorsque les bactéries dépassent un très faible taux. Cette décision s'appuierait sur le cadre réglementaire du Food Safety and Inspection Service (FSIS) de 2022 dafin de réduire les infections à Salmonella liées à la volaille.

187 cas d’infection dans 21 États

Les chercheurs ont analysé les données du Foodborne Disease Outbreak Surveillance System du CDC, du ministère de la Santé du Minnesota et du FSIS, ainsi que des questionnaires sur les épidémies et des posts sur Internet.

De 1998 à 2022, 11 épidémies à Salmonella liées à ces produits ont été signalées ; 57% des échantillons par épidémie provenant des domiciles des patients et des magasins de détail étaient positifs pour Salmonella, ont dit les auteurs de l'étude. «Les épidémies continuent de se produire, bien qu'un plus petit pourcentage de patients ait déclaré avoir fait cuire le produit au micro-ondes [méthode dangereuse] après les changements d'étiquetage.»

Les épidémies comprenaient 187 cas à Salmonella et 42 hospitalisations, mais aucun décès, dans 21 États.

«Des produits de poulet farcis ont été produits dans au moins trois établissements», ont écrit les chercheurs. «Dans les sept épidémies les plus récentes, 0 à 75 % des répondants malades ont déclaré avoir fait cuire le produit au micro-ondes et ont déclaré qu'ils pensaient que le produit était vendu entièrement cuit ou ne savaient pas s'il était vendu cru ou entièrement cuit.»

Selon sa proposition, le FSIS échantillonnerait et testerait le poulet dans ces produits avant de le farcir et de le paner, le considérant comme contaminé s'il avait plus d'une unité formant colonie par gramme. S'il est jugé contaminé, «le composant du poulet représenté par le lot échantillonné devrait être détourné vers une utilisation autre que les produits de poulet crus, farcis et panés», indique l'avis de l'USDA.

«Des mesures de maîtrise supplémentaires de la contamination par Salmonella par les fabricants pourraient réduire les maladies liées à Salmonella associées à ces produits», ont écrit les chercheurs.

Etats-Unis : La farine Gold Medal officiellement liée à l'épidémie à Salmonella qui s'est étendue d'un océan à l'autre

«Etats-Unis : La farine Gold Medal officiellement liée à l'épidémie à Salmonella qui s'est étendue d'un océan à l'autre», source article de Coral Beach du 1er mai 2023 dans Food Safety News.

La Food and Drug Administration a officiellement lié une épidémie à Salmonella Infantis à la farine Gold Medal produite par General Mills.

La société a rappelé des produits de farine le 28 avril 2023 en raison d'une contamination par Salmonella Infantis, mais n'a pas mentionné l'épidémie dans son avis de rappel. L'entreprise n'a pas indiqué combien de kg de farine a été rappelée.

Les analyses effectuées par la FDA ont maintenant montré que la farine produite par General Mills est contaminée par la souche épidémique de Salmonella.

Le 30 mars, le Centers for Disease Control and Prevention a annoncé une épidémie de Salmonella Infantis liée à la farine, mais n'ont pas nommé de farine spécifique. A cette époque, il y avait 12 patients confirmés avec trois hospitalisations.

Au moment de la publication de l'avis d'épidémie par la FDA, il y avait 13 patients dans 11 États d'un océan à l'autre. Ces États et le nombre de personnes malades sont la Californie (1), Illinois (2), Iowa (1), Minnesota (1), Missouri (1), Nebraska (1), New Jersey (1), New York (1), Ohio (1), Oregon (1), Tennessee (1) et Virginie (1).

Les personnes malades sont âgées de 12 à 81 ans et 92% d'entre elles sont des femmes. Dans son annonce d'épidémie du 30 mars, le CDC a signalé que les responsables de la santé publique des États et locaux interrogeaient les personnes sur les aliments qu'ils avaient consommés la semaine précédant leur maladie. Sur les 7 personnes interrogées, 6 ont déclaré avoir consommé de la pâte crue ou de la pâte à frire. La farine était le seul ingrédient commun dans la pâte crue ou la pâte à frire que les personnes ont déclaré avoir consommé.

Il y aura probablement d'autres personnes malades identifiées en raison du temps nécessaire pour les analyses, la confirmation et le signalement aux autorités fédérales.

Parmi les patients interrogés jusqu'à présent, la FDA rapporte que cinq d'entre eux sur neuf se souviennent spécifiquement d'avoir été exposés à de la farine crue de la marque Gold Medal avant de tomber malade. le CDC rapporte que sept des huit cas ont déclaré avoir consommé de la pâte ou de la pâte crue. 

«L'enquête de traçabilité de la FDA a identifié une seule installation de production de la farine consommée par les patients. La FDA a lancé une inspection à l'usine de General Mills Kansas City, Missouri, et a collecté des échantillons de produits. Un échantillon s'est avéré positif pour Salmonella, et une analyse ultérieure par séquençage du génome entier (WGS) a révélé que Salmonella dans l'échantillon positif correspondait à la souche de Salmonella rendant les personnes malades dans cette épidémie», selon l'annonce de l'épidémie.

Informations actuelles sur les rappels de produits

General Mills a émis un rappel national de sacs de 2,2 et 10 pounds de sa farine tout usage non blanchie et blanchie de marque Gold Medal avec une date «Meilleure si utilisée avant» du 27 mars 2024 et du 28 mars 2024. Aucun autre type de farine Gold Medal n'est concerné par ce rappel pour le moment.

On craint que les consommateurs aient la farine rappelée chez eux en raison de sa longue durée de conservation. Si les consommateurs ont de la farine mGold Medal chez eux mais n'ont pas l'emballage d'origine pour vérifier les informations d'identification, il est recommandé de jeter la farine.

Ce rappel volontaire inclut les dates de code suivantes actuellement dans les magasins ou les garde-manger des consommateurs, toutes avec les dates «Meilleur si utilisé avant» du 27 mars 2024 et du 28 mars 2024 : voir le tableau des produits rappelés sur l’article original.

Rappels antérieurs de General Mills et épidémies

En janvier 2016, General Mills Inc. a lancé un rappel de tous les sacs de 5 pounds de sa farine non blanchie de marque Gold Medal avec la date «meilleure si utilisée avant» du 20 avril 2020, après avoir retrouvé Salmonella dans un échantillon .

L'entreprise emblématique n'a pas indiqué le nombre de sacs ou le nombre total de pounds concernés par le rappel dans son avis de rappel du 23 janvier. General Mills a exhorté les consommateurs à vérifier chez eux la farine rappelée, leur conseillant de jeter le produit s'ils en avaient.

Le président de la division de la boulangerie de General Mills a déclaré dans l'avis de rappel que les consommateurs ne devraient pas consommer de farine - ou tout ce qui en contient, comme de la pâte à biscuits - qui n'a pas été cuite à une température suffisamment élevée pour tuer les bactéries telles que Salmonella.

En mai 2016, General Mills Inc. a lancé un rappel national de trois marques de farine en réponse à une épidémie à E. coli dans 20 États qui avait rendu malade au moins 38 personnes à ce moment-là.

Bien que des responsables gouvernementaux aient apparemment enquêté sur l'épidémie, aucune agence étatique ou fédérale n'avait publié d'informations à ce sujet au moment où la société basée à Minneapolis a annoncé le rappel.

«Les autorités étatiques et fédérales ont trouvé 38 cas de maladies dans 20 États liés à un type spécifique de E. coli O121, entre le 21 décembre 2015 et le 3 mai 2016», selon un communiqué de presse publié à l'époque par General Mills Inc.

«Tout en essayant de suivre la cause de la maladie, le CDC a découvert qu'environ la moitié des personnes ont déclaré avoir fait quelque chose de fait maison avec de la farine à un moment donné avant de tomber malade. Certains ont déclaré utiliser une marque de farine de chez General Mills.

Le rappel comprend six SKUs (stock keeping units ou codes UPC)  de farine de marque Gold Medal, deux SKUs de farine de marque Signature Kitchens et une SKU de farine de marque Gold Medal Wondra. 

En juin 2016, General Mills Inc. et les responsables fédéraux ont travaillé ensemble pour rendre compte de la farine rappelée qui était liée à l'épidémie à E. coli et qui a été envoyée aux producteurs alimentaires en plus des distributeurs et des restaurants.

Ni l'entreprise ni le gouvernement n'ont inclus d'informations sur la farine envoyée aux producteurs alimentaires dans les avis de rappel ou d'éclosion publiés. General Mills a rappelé 10 millions de pounds de farine après que le CDC ait informé l'entreprise que la farine était liée à une épidémie à E. coli qui dure depuis décembre 2015.

General Mills et la Food and Drug Administration des États-Unis ont confirmé pour Food Safety News qu'une partie de la farine rappelée avait été envoyée en vrac à des entreprises de production alimentaire. L'épidémie a touché 20 États en juin 2016.

General Mills Inc. a triplé la taille de son rappel de farine à 30 millions de pounds en juillet 2016. Les investigations ont donné peu de résultats en termes de cause profonde de la contamination. Mais, les enquêteurs de la FDA sur les épidémies ont rapporté un nombre croissant de preuves ADN révélant que la souche épidémique de E. coli O121 était présente dans la farine de l'usine General Mills à Kansas City, Missouri.

L'usine de General Mills au 2917 Guinotte Ave. à Kansas City, Missouri, se trouve au milieu d'une propriété industrielle entourée de gares de triage. La zone est juste au nord de la rivière Missouri et à quelques pâtés de maisons à l'ouest de l'Interstate 29.

Une entreprise de distribution de volaille se trouve juste en face de l'usine de farine et la zone est une voie de transport régulière pour les camions et les trains transportant des animaux vivants et de la volaille.

Dan Cohen de la société de recherche et développement agricole Maccabee Seed à Davis, en Californie, a été intrigué par toute la situation.

«Il est encore un peu difficile d'imaginer comment la contamination s'est produite», a déclaré Cohen, qui travaille dans la recherche et le développement en agriculture et en sécurité des aliments depuis plus de 30 ans.

«S'il s'agissait de céréales, je chercherais du blé provenant des parcs d'engraissement à cause des problèmes de contamination par la poussière.»

En septembre 2016, le CDC a déclaré l'épidémie terminée. Les responsables fédéraux de la santé ont conclu leur investigation concernant la farine de General Mills impliquée dans l'épidémie à E. coli qui a finalement rendu malade au moins 63 personnes entre décembre 2015 et septembre 2016, mais ils disent que davantage de personnes devraient tomber malades.

«Bien que l'investigation sur l'épidémie soit terminée, les maladies devraient se poursuivre pendant un certain temps», selon le rapport du CDC. «Les consommateurs qui ne sont pas au courant des rappels pourraient continuer à consommer les produits et tomber malades. Une liste des produits rappelés et comment les identifier est disponible sur la page Conseils aux consommateurs.»

Les 63 victimes confirmées de l'épidémie provenaient de 24 États et étaient âgées de 1 à 95 ans. Aucun n'est décédé, mais 17 présentaient des symptômes si graves qu'ils ont dû être hospitalisés. Une personne a développé une complication potentiellement mortelle, le syndrome hémolytique et urémique, un type d'insuffisance rénale. L'apparition des maladies des victimes s'est étendue du 21 décembre 2015 au 5 septembre 2016.

General Mills a émis son premier rappel de farine lié à l'épidémie le 31 mai. Après que des analyses ont montré la présence de la souche épidémique dans des sacs de farine collectés au domicile des victimes de l'épidémie dans trois États, la société a étendu le rappel à deux reprises, rappelant finalement 45 tonnes de farine.

NB : Photos des produits rappelés et de l'usine de General Mills à Kansas City, Missouri. (Photo de Coral Beach).