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lundi 17 juin 2019

Nouveaux résultats fournis par les distributeurs sur le dénombrement de Campylobacter dans des poulets entiers réfrigérés au Royaume-Uni



Un communiqué de la Food Standards Agency (FSA) du 13 juin 2019 rapporte que « Les principaux détaillants publient les résultats sur Campylobacter pour janvier-mars 2019 ».

Comme vous le savez une telle action est tout à fait impossible en France, et pourtant, la campylobactériose représente de nombreux cas de maladies infectieuses d’origine alimentaire, si l’on en croit cet article de l’InVS de janvier 2018
Les 9 principaux distributeurs alimentaires publient les résultats sur Campylobacter dans les poulets réfrigérés achetés au Royaume-Uni entre janvier et mars 2019.


Les neuf principaux distributeurs du Royaume-Uni ont publié leurs derniers résultats de tests sur la contamination par Campylobacter chez des poulets entiers réfrigérés produits au Royaume-Uni (couvrant des échantillons analysés de janvier à mars 2019).

Les derniers chiffres montrent qu'en moyenne, dans l'ensemble des principaux distributeurs, 3,5% des poulets ont été testés positifs au plus haut niveau de contamination. Ce sont les poulets ayant plus de 1000 unités formant colonies par gramme (ufc/g) de Campylobacter.
Rebecca Sudworth, directrice de la réglementation à la Food Standards Agency, a déclaré:
« Les niveaux de Campylobacter sont restés stables et sont en deçà de notre objectif de 7% pour le niveau de contamination le plus élevé. Néanmoins, nous continuerons de collaborer étroitement avec les distributeurs afin de réduire les niveaux autant que raisonnablement possible.
Notre conseil aux consommateurs reste le même: soyez prudent lorsque vous manipulez du poulet cru, ne le lavez pas et veillez à ce qu'il soit bien cuit à cœur avant de le servir. » 
Pour Joe Whitworth dans un article paru dans Food Safety News, il y a une « Augmentation du nombre de poulets britanniques positifs pour les taux les plus élevés de Campylobacter », à vous de voir ...
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Les résultats par distributeurs pour janvier à mars 2019

L'échantillonnage et les analyses sont effectués conformément aux protocoles établis par la FSA et approuvés par l'industrie.

dimanche 2 juin 2019

Différence de com entre l'Allemagne et la France à propos de la consommation de lait cru


Différence de com évidente entre l'Allemagne et la France à propos du lait cru et des fromages au lait cru. Alors qu'en France le ministère de l'agriculture (qui est surtout le ministère de l'agriculture de ce que faisaient nos grands-parents) y est allé en solo, et d'une façon décousue, sans associer les autorités de santé publique, l'Allemagne associe le BVL et le BfR dans sa communication.

En effet, dans un article du 30 mai 2019 paru dans Eurosurveillance sur l'épidémie à E. coli O26 en France liée à la consommation de fromages au lait cru, les auteurs indiquent dans la conclusion,
Ces épidémies mettent en évidence le risque de consommation de fromage au lait cru, en particulier chez les jeunes enfants. Sensibiliser davantage le public au risque est donc une mesure préventive importante. Un groupe interdisciplinaire d'autorités de santé publique et de sécurité des aliments travaille actuellement à l'élaboration de stratégies de communication en France afin de sensibiliser davantage les consommateurs à ces risques.

On cherchera en vain dans la com du ministère de l'agriculture,« l'élaboration de stratégies de communication en France afin de sensibiliser davantage les consommateurs à ces risques. »

Journée mondiale du lait en Allemagne
« Le BVL informe sur le risque de maladie lié au lait cru », source Food Safety News.

Une agence allemande a informé le public des risques liés à la consommation de lait cru avant la Journée mondiale du lait, le 1er juin.

L'annonce de l'Office fédéral allemand pour la Protection des Consommateurs et la Sécurité Alimentaire (BVL) couvrait les différentes formes d'approvisionnement et la contamination bactérienne associée.

Le BVL a conseillé aux groupes à risque de ne pas consommer de lait cru et de lait cru certifié (Vorzugsmilch) en raison de la charge microbienne potentielle. Le lait cru n'étant pas soumis à un traitement thermique comme le lait de consommation pasteurisé, les germes pathogènes ne sont pas détruits et peuvent provoquer des maladies.

Les consommateurs peuvent acheter du lait au supermarché, mais les « distributeurs de lait cru », également appelés distributeurs automatiques, sont de plus en plus populaires dans le pays.

Le lait cru non pasteurisé peut contenir des agents zoonotiques provenant de l'animal ou introduits par le biais du processus de traite. Salmonella, Campylobacter ou Listeria peuvent être transmis d'animaux à l'homme et déclencher une maladie.

On pourrait aussi ajouter les STEC ...-aa

L’Institut fédéral pour l’évaluation des risques (BfR) recommande aux groupes de la population les plus sensibles, tels que les enfants, les femmes enceintes ou âgées et les personnes immunodéprimées, de ne pas consommer de lait cru non bouilli.

L'agence a ajouté qu'il existe un risque d'infection pour les adultes en bonne santé qui boivent du lait cru qui n'a pas été bouilli, ce qui peut entraîner des maladies bénignes ou graves, en fonction de l'agent pathogène.

L'Organisation des Nations Unies pour l'alimentation et l'agriculture (FAO) a choisi le 1er juin Journée mondiale du lait à partir de 2001.

Analyse des produits à base de lait cru
Les autorités alimentaires des États fédéraux ont effectué des analyses sur le lait cru proposé dans les distributeurs de lait cru en 2016. Des échantillons d'agents pathogènes ont été analysés dans le cadre du suivi des zoonoses et du plan de surveillance fédéral coordonné par BVL.

Le lait cru ne peut être livré aux consommateurs directement de l'exploitation laitière que si ce qui suit est visible: « lait cru, bouillir avant consommation » (« lait de la ferme »).

Jusqu'à 4 pour cent des échantillons de lait cru destinés à une transformation ultérieure, ainsi que du lait provenant de distributeurs automatiques de produits de la ferme, étaient contaminés par Campylobacter spp., Listeria monocytogenes et E. coli producteurs de shigatoxines (STEC).

Les résultats des invetsigations sur le « lait de ferme » pour les indicateurs d'hygiène tels que E. coli et les staphylocoques à coagulase positive ont également montré que le lait cru livré directement au consommateur présentait des problèmes d'hygiène.

Un total de 18 foyers de cas ont été signalés au BVL en 2017, causés par la consommation de lait cru non bouilli. Un total de 221 personnes ont été infectées par Campylobacter, tandis que d'autres ont contracté des E. coli entérohémorragiques (EHEC) et le virus de l'encéphalite virale à tique.

Les responsables du BVL ont déclaré que les résultats confirment que le lait cru peut présenter un risque d'infection et doit toujours être chauffé avant d'être consommé.

Le lait certifié est du lait cru conditionné provenant de certaines exploitations laitières préalablement approuvées et contrôlées. Les animaux, le lait de ferme et le lait certifié sont soumis à des mesures d'hygiène spéciales. Dans les échantillons de lait certifié, aucun agent pathogène n'a été détecté dans les programmes de surveillance, de sorte que les exigences élevées en matière d'hygiène atténuent la contamination.

Cependant, le BVL recommande aux consommateurs vulnérables de ne pas boire de lait certifié car celui-ci est destiné à la consommation directe et la présence d'agents pathogènes ne peut être totalement exclue.

Un risque pour la santé peut également provenir de produits tels que le fromage au lait cru, à la suite de la surveillance zoonotique de 2014 et 2015.

Jusqu'à 1,6% des échantillons de fromage au lait cru étaient positifs pour Salmonella spp., STEC et Listeria monocytogenes.

dimanche 26 mai 2019

Après la viande bovine, de la volaille de Pologne contaminée par Salmonella est une nouvelle pomme discorde avec la République tchèque


Je vous avais déjà narré les problèmes de la République tchèque et de la Pologne dans l'article, Le bœuf polonais et accessoirement Salmonella pomme de discorde entre la République tchèque, la Pologne et la Commission européenne.

Voici que cela se poursuit avec « Des analyses et essais tchèques révèlent la présence de Salmonella dans des volailles de Pologne », source article de Joe Whitworth paru le 25 mai 2019 dans Food Safety News.

Salmonella a été détectée dans 16 tonnes de volaille importée de Pologne vers la République tchèque depuis la mi-avril, selon l'Administration vétérinaire tchèque (SVS).

SVS a ordonné des mesures vétérinaires d'urgence pour 12 destinataires d'envois de volailles depuis la mise en place des règles en avril. Onze incidents ont impliqué du poulet et un lié à la dinde. Si Salmonella est présente dans de la viande de volaille, l'importateur doit effectuer des analyses de laboratoire supplémentaires.

La plupart des viandes contaminées ont probablement été consommées car les résultats des analyses n'ont pas été reçues avant la date de péremption des produits, mais aucun cas de maladie n'a été rapporté.

Les destinataires de la viande de volaille pour lesquels l'Administration vétérinaire de l'État a identifié la présence de Salmonella doivent faire examiner les envois ultérieurs provenant du même pays par un laboratoire avant de remettre la viande sur le marché. Ce n'est qu'après avoir reçu un résultat satisfaisant d'un laboratoire accrédité qu'ils pourront libérer le produit.

Si Salmonella est présente dans la viande, le lot entier doit être détruit et les sanctions peuvent atteindre jusqu'à 50 millions de couronnes tchèques (2 millions de dollars).

La semaine dernière, la République tchèque a émis 11 alertes au système d'alerte rapide pour les denrées alimentaires et les aliments pour animaux (RASFF) concernant la détection de Salmonella dans la viande de Pologne. Les produits concernés sont les poitrines de poulet réfrigérées et les cuisses et les souches de dinde réfrigérées comprennent Bardo, Infantis et Newport.

Les mesures ne concernent que la viande de volaille et ont été approuvées en avril par SVS et le ministre de l'Agriculture, Miroslav Toman, en raison de la présence répétée de salmonelles dans ce produit au printemps.

Ce sont des mesures ciblées et individuelles visant à protéger la santé publique liées à des envois spécifiques, à la différence des contrôles généraux du bœuf polonais plus tôt cette année.

La République tchèque a levé les contrôles sur le bœuf en provenance de Pologne fin mars, après que la Commission européenne les ait qualifiés de « disproportionnés ».

Les mesures vétérinaires extraordinaires consistaient à analyser toute la viande bovine polonaise par un laboratoire accrédité aux frais de l’importateur avant sa mise sur le marché à la suite de la détection de Salmonella.

Elles ont été mis en place après la révélation qu’un abattoir en Pologne qui avait abattu des vaches malades et avait envoyé la viande dans les pays de l’UE.

Les autorités polonaises ont présenté, à la mi-mai, lors d'une réunion du groupe de travail sur la sécurité biologique de la chaîne alimentaire du Comité permanent des plantes, des animaux, des denrées alimentaires et des aliments pour animaux, les actions entreprises suite à la découverte de l'abattage illégal de vaches en janvier.

jeudi 4 avril 2019

La contamination croisée en laboratoire responsable d'un faux positif à Salmonella dans un produit fini


« La contamination croisée en laboratoire responsable d'un faux positif à Salmonella », source article de Joe Whitworth du  4 avril 2019 paru dans Food Safety News.

Selon une étude, « Whole genome sequencing used in an industrial context reveals a Salmonella laboratory cross-contamination »
la contamination croisée dans un laboratoire a été à l'origine de la découverte d'un produit fini positif pour Salmonella.

En 2013, lors d'une analyse de routine de prélèvements d'aliments, un produit fini au chocolat d'une usine européenne a donné un résultat positif à la recherche de Salmonella Hadar. Parallèlement, la surveillance de l'environnement dans le laboratoire a révélé la présence d'un prélèvement positif pour Salmonella dans le thermocouple d'un incubateur.

Huit mois plus tôt, le laboratoire, dont le nom n’avait pas été identifié, avait effectué un essai d’aptitude sur lequel un échantillon de Salmonella Hadar avait été enrichi. Ce même laboratoire a analysé l'échantillon d’aliments pour l'usine européenne. Le laboratoire a effectué des analyses régulières pour la recherche de Salmonella en 2013, mais il n’y a eu qu’un résultat positif au cours de l’année.

En raison de suspicions de contamination croisée en laboratoire entre l'isolat de Salmonella Hadar utilisé dans l‘essai d'aptitude et celui retrouvé sur le produit fini par le même laboratoire, le séquençage du génome entier (WGS) a été utilisé.

L'analyse a révélé un maximum de dix SNP (Single Nucleotide Polymorphisms) entre les isolats provenant du laboratoire et le produit fini, confirmant ainsi la contamination croisée.

Les résultats, combinés à l'investigation complémentaire en usine, ont permis la libération des lots de produits finis et évité le gaspillage inutile d’aliments et des pertes économiques pour l'usine.

Dans le cadre des systèmes de management de la sécurité des aliments dans les installations de production, les usines disposent de programmes d’analyses de surveillance de l'environnement et  des produits permettant de détecter les problèmes survenant dans la zone de production et aux alentours. Les échantillons prélevés peuvent être envoyés aux laboratoires pour analyses afin de contrôler la qualité et la sécurité microbiologiques.

Lors des analyses microbiologiques de routine en 2013, un laboratoire a retrouvé Salmonella Hadar positif dans un échantillon de chocolat produit dans une usine européenne.

L'usine a conservé le lot de produits finis, a commencé le nettoyage et la désinfection, et augmenté le nombre de tests analytiques. Une investigation sur les causes profondes a été lancée en récupérant toutes les données de production et les données analytiques afin d'identifier la source possible de contamination.

Aucune des informations collectées n'a indiqué d'anomalies sur le site de production. Aucune Salmonella n'a été détecté dans les matières premières ou les échantillons environnementaux prélevés à l'usine.

En raison de l'échantillon environnemental positif au laboratoire et du test d’aptitude, l'hypothèse était qu'une contamination croisée dans le laboratoire aurait entraîné un résultat faussement positif du produit alimentaire. La participation à des essais d’aptitude démontre une compétence lors de la réalisation d’examens microbiologiques spécifiques.

La confirmation de la contamination croisée en laboratoire était nécessaire en utilisant une méthode plus discriminante que le sérotypage phénotypique classique de Salmonella par agglutination sur lame basée sur le schéma de Kauffmann-White-Le Minor.

L'analyse du sérotypage de Salmonella a mis en évidence un éventuel incident de contamination croisée en laboratoire qui a été confirmé par WGS dans une étude publiée dans International Journal of Food Microbiology.

Quatre isolats de Salmonella Hadar issus de la contamination croisée en laboratoire et 12 isolats séquencés publics échantillonnés en Europe ont été ajoutés à l'analyse.

Aucun des 12 isolats publics collectés jusqu'en 2014 n'était génétiquement similaire aux isolats de l'étude. L'analyse des SNP a montré que quatre isolats étaient génétiquement très similaires, avec un maximum de 11 SNP entre eux suggérant qu'ils partageaient un ancêtre commun.

Les chercheurs ont déclaré que le test d’aptitude avait probablement provoqué une contamination de l'environnement du laboratoire.

« La raison pour laquelle l'isolat est resté en dormance pendant plusieurs mois et n'a été détectée qu'en décembre reste incertaine. Normalement, le thermocouple n'est pas placé dans un milieu de croissance. Il est possible que cet événement ait permis à Salmonella de s'enrichir à un niveau élevé, ce qui augmente le risque de contamination des autres échantillons analysés. Après l’incident, les BPL ont été révisés et la surveillance de l’environnement a été renforcée dans le laboratoire. »

Précédents de contamination croisée

Ce n'est pas la première fois qu’une contamination croisée dans un laboratoire a lieu mettant en cause du chocolat et Salmonella.

En 2012, l'entrée de chocolat en provenance de Belgique vers les États-Unis a été empêchée car une souche de Salmonella Rissen a été isolée d'une des barres de chocolat par un laboratoire alimentaire belge.

Cependant, une étude rétrospective des isolats envoyés du laboratoire au laboratoire national belge de référence pour Salmonella a révélé que sept semaines auparavant, une souche de Salmonella Rissen avait été isolée de la farine de poisson dans le même laboratoire. C'était la première fois qu'une telle souche était isolée en laboratoire depuis septembre 2009.

La contamination croisée dans le laboratoire des produits alimentaires a conduit à un résultat faussement positif, entraînant de graves conséquences économiques pour le fabricant de barres de chocolat, car le conteneur contenant le lot de barres de chocolat présumées positives pour Salmonella a été détruit.

La cause de la contamination croisée n’a pas été découverte, mais il est possible que de la poussière de farine de poisson se soit répandue dans l’air, où elle a continué de circuler dans le laboratoire pendant des semaines ou des jours
ou que la souche isolée de la farine de poisson ait été stockée dans un tube qui a été mal manipulé par un employé.

A signaler aussi un autre cas en 2011, au Canada, que le blog a rapporté ici et ces informations de Campden et d’un fournisseur de consommables de laboratoire.

vendredi 8 mars 2019

Lutte contre les germes indésirables dans le lait et le fromage

« Nouveaux tests pour lutter contre les germes indésirables dans le lait et le fromage », source communiqué d'Agroscope.ch du 5 mars 2019.
Dans la transformation fromagère, les bactéries propioniques ainsi que la bactérie lactique nocive Lactobacillus parabuchneri sont très redoutées, car de faibles quantités de ces germes provoquent de graves défauts du fromage. Des chercheuses et des chercheurs d’Agroscope ont développé des méthodes d’analyse très sensibles pour détecter ces germes rapidement et de manière fiable. Des essais pratiques confirment que les tests permettent de dépister et de corriger facilement les contaminations chroniques dans les installations de traite.
Ces deux germes résistent bien à une température élevée, ce qui leur permet, lors de conditions défavorables, de se nicher dans les installations de traite. Par conséquent, le lait cru livré est contaminé de manière chronique par ces germes et parvient dans le processus de transformation. Étant donné que les germes pathogènes survivent pendant plusieurs minutes à des traitements thermiques de 52–54º C, ils ne sont pas éliminés du lait cru lors de la fabrication du fromage et peuvent se multiplier au cours de l’affinage. Un défaut d’arôme, des trous atypiques ou des lainures dans le fromage ainsi que la formation d’histamine, qui a un effet nocif pour la santé, en sont les conséquences.

Un test de biologie moléculaire permet d’identifier rapidement le foyer
Ces dernières années, Agroscope a développé de nouvelles méthodes de biologie moléculaire permettant de détecter de manière indubitable des bactéries dans une citerne à lait, même après un à deux jours. La réaction en chaîne par polymérase (qPCR) permet d’une part de raccourcir énormément la durée d’analyse par rapport à la méthode de détection classique utilisée jusqu’à présent, dans laquelle les bactéries doivent tout d’abord se développer dans un milieu de culture et, d’autre part, grâce à sa spécificité élevée, elle permet aussi de différencier clairement les différentes espèces de bactéries lactiques et propioniques présentes dans le lait. La comparaison des bactéries dans le fromage à celles du lait livré permet de déterminer l’exploitation d’origine. Grâce à ce diagnostic rapide, les exploitations concernées peuvent éliminer plus rapidement les défauts. Elles peuvent reprendre plus rapidement la livraison de leur lait et diminuer ainsi les pertes financières. Les consommateur peuvent se réjouir d’une sécurité et d’une qualité alimentaire accrues.
L’acide propionique provoque des défauts au niveau des trous dans le fromage à raclette (photo Agroscope, Jürg Maurer)
On lira aussi Éviter les contaminations persistantes dans les installations de traite. Jürg Maurer, Daniel Wechsler, Stefan Irmler et Thomas Berger ;Agroscope, 3003 Berne, Suisse.

dimanche 3 mars 2019

Un outil de détection des micro-organismes plus rapide et moins cher dévoilé

« Un outil de détection des maladies plus rapide et moins cher dévoilé », source article de Jim Romahan paru le 28 février 2019 sur son blog Agri007.

Des chercheurs de la Kansas State University ont dévoilé un outil de détection des maladies plus rapide et moins coûteux.

Axiom Microbiome Array, ou AMA, est la plate-forme de détection de micro-organismes la plus complète jamais construite et le premier microarray à haut débit, a déclaré l'équipe universitaire.

« L'array réseau présente deux avantages: il est plus rapide et moins cher », a déclaré Raymond "Bob" Rowland, professeur de diagnostic médical et de pathobiologie à la faculté de médecine vétérinaire du Kansas State University.

« Je vis dans le monde de la médecine vétérinaire et le coût est critique. »

« Si nous devons faire une analyse avec le LLMDA (Lawrence Livermore Microbial Detection Array), cela nous coûterait environ 250 dollars pour les réactifs; alors qu'avec l'AMA, nous pouvons faire les mêmes tests pour 40 dollars. »

Lorsque des biologistes et des informaticiens ont dévoilé pour la première fois le LLMDA polyvalent en 2010, il pouvait analyser des échantillons de près de 3 000 bactéries et virus, le tout en 24 heures. Mais il ne pouvait analyser que quatre échantillons par jour.

Avec l'AMA à 96 puits, le nouveau système de détection peut analyser 96 échantillons en trois jours. De plus, chacun des 96 puits contient environ 1,4 million de sondes, de sorte que les échantillons sont analysés par environ 132 millions de sondes.

« L'une des conclusions les plus importantes de notre étude est qu'il s'agit du premier microarray à haut débit mis au point », a déclaré Crystal Jaing, biologiste au Lawrence Livermore National Laboratory, qui dirige les efforts dU LLMDA/AMA.

« Cela augmente le débit de 10 à 20 fois et diminue le coût de cinq fois. »

Le LLMDA a été concédée sous licence en 2016 à Thermo Fisher Scientific, basée à Waltham, dans le Massachusetts, et a été mise en vente plus tard au cours de la même année sous le nom d'Applied Biosystems AMA.

Référence. Thissen JB, Be NA, McLoughlin K, Gardner S, Rack PG, Shapero MH, et al. (2019) Axiom Microbiome Array, the next generation microarray for high-throughput pathogen and microbiome analysis. PLoS ONE 14(2): e0212045. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0212045