Le bœuf est l’une des principales sources d’infection à STEC, selon un rapport mondial de la FAO et de l’OMS

« Le bœuf est l’une des principales sources d’infection à STEC, selon un rapport mondial de la FAO et de l’OMS », source article de Joe Whitworth paru le 3 octobre 2019 dans Food Safety News.

Les produits à base de viande de bœuf sont l'une des principales sources d'infections à E. coli producteurs de shigatoxines (STEC) dans le monde, selon un rapport publié par la FAO et l'OMS. Les produits réfrigérés constituaient également une source importante.

Les chiffres de l'Organisation de l'alimentation et de l'agriculture des Nations Unies (FAO) et de l'Organisation mondiale de la santé (OMS) basés sur les estimations de 2010 montrent que les infections à STEC sont à l'origine de plus d'un million de cas de maladie et à 128 décès par an.

Le rapport analysait les données des enquêtes mondiales sur les épidémies d’origine alimentaire liées aux STEC, ainsi qu’un examen systématique et une méta-analyse des études cas-témoins d’infections sporadiques pour toutes les dates et tous les lieux.

Il a conclu que la priorité donnée aux interventions visant à maîtriser les chaînes d'approvisionnement en viande bovine pourrait fournir le retour le plus important sur investissement lors de la mise en œuvre de stratégies de maîtrise des STEC.

Sources alimentaires de STEC

Au total, 957 foyers de STEC provenant de 27 pays et couvrant la période de 1998 à 2017 ont été inclus. Les données ont révélé que 16% des épidémies étaient attribuables au bœuf, 15% à des produits comprenant des fruits et des légumes et 6% à des produits laitiers.

Cependant, les sources alimentaires impliquées dans 57% des éclosions n'ont pas pu être identifiées et les données n'étaient disponibles que dans trois des six régions de l'OMS. Les chercheurs ont pris en compte le nombre d'épidémies causées par chaque aliment et non le nombre de personnes malades pour chaque aliment.

Un total de 236 éclosions à E. coli impliquant des cas de syndrome hémolytique et urémique (SHU) ont été signalées et presque toutes dans les Amériques. Près de 30% de toutes les éclosions signalées étaient associées au SHU ou au décès. La plupart des 45 foyers mortels ont également été enregistrés dans la région des Amériques. Le SHU est un type d'insuffisance rénale pouvant entraîner de graves problèmes de santé et la mort tout au long de la vie.

Beaucoup plus d'informations étaient disponibles pour les STEC O157 que pour les autres sérogroupes des STEC.

Variations régionales

Dans les sous-régions européenne et américaine de l'OMS, les principales sources d'épidémies étaient le bœuf et ses produits. Toutefois, des produits de base et des produits laitiers étaient les principales causes dans la sous-région du Pacifique occidental de l’OMS.

« Les explications possibles de la variabilité régionale incluent les différences dans la proportion d'aliments spécifiques dans le régime alimentaire et dans la manière dont ils sont préparés pour la consommation, le degré de contamination des aliments par des STEC et les animaux vivants à partir desquels les aliments sont dérivés, les caractéristiques de virulence des souches de STEC prédominantes dans la région, ou des différences dans la manière dont les épidémies sont détectées, étudiées et rapportées », selon le rapport.

Le bœuf et les fruits et légumes étaient à l’origine de la plus forte proportion de cas dans les sous-régions américaines, avec une estimation de l’attribution de la source de 40% pour le bœuf, 35% pour les produits, fruits et légumes, et 12% pour les produits laitiers.

Dans la région européenne, le classement des sources de cas était similaire, avec une proportion d'attribution globale de 31% pour le bœuf; 30% pour les produits, fruits et légumes, et 16,4% pour les produits laitiers.

Dans la sous-région du Pacifique occidental, la source la plus répandue était les produits (43%), suivis des produits laitiers (27%) et le gibier et le bœuf, respectivement troisième et quatrième avec respectivement 9 et 8%.

L'analyse des données d'études cas-témoins des infections sporadiques a montré que la viande bovine était la principale source de STEC dans le monde. Dans la région du Pacifique occidental, le poulet était le facteur de risque le plus important.

Le rapport, qui fait partie de la série d’évaluation des risques microbiologiques, fait suite à un autre document publié l’année dernière concernant la charge, l’attribution de la source, la caractérisation des dangers et la surveillance des STEC.

Il a proposé des critères de classification du risque potentiel de gravité de la maladie associée aux STEC dans les aliments, présenté les premiers résultats sur l'attribution de la source des STEC d'origine alimentaire et présenté un examen des programmes de surveillance et la méthodologie pour le pathogène.

La Commission du Codex Alimentarius a décidé cette année, lors de sa réunion annuelle, de commencer à élaborer des directives pour maîtriser les STEC dans le bœuf, les légumes à feuilles, le lait cru et le fromage ainsi que les graines germées.

Rapport sur E. coli en Irlande

En juin 2019, l’Autorité de sécurité des aliments d’Irlande (FSAI) a publié un avis sur la détection des STEC dans les aliments.

Depuis 2008 - et sauf en 2011, année où l'Allemagne affichait le taux le plus élevé en raison d'un important foyer à E. coli O104:H4 -, l'Irlande affichait le taux de déclaration de STEC le plus élevé d'Europe.

De 2012 à 2016, 3 531 notifications de STEC ont été notifiées en Irlande. Sur ce nombre, 2 910 étaient symptomatiques et 582 asymptomatiques. Parmi les cas symptomatiques, 1 sur 20 a développé un SHU. Parmi les cas symptomatiques, 40,3% ont été hospitalisés. De 2004 à 2016, cinq décès ont été attribués aux STEC et deux étaient des cas mortels liés à un SHU.

Garvey et al. (2016) ont examiné les données sur les épidémies à STEC en Irlande de 2004 à 2012 comprenant 219 éclosions. Les aliments ont été signalés comme voie de transmission présumée pour 21 d'entre elles. Aucune preuve épidémiologique microbiologique ou analytique n'a été rapportée mettant en cause des aliments spécifiques dans aucun des foyers. Des aliments suspects ont été signalés dans quatre foyers, de,ma viande hachée bovine pour deux et de la viande de chèvre et d'agneau pour chacune une.

Le rapport a permis d’établir en Irlande le risque associé à la consommation d’aliments dans lesquels des STEC ont été détectés.