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dimanche 8 août 2021

Comment les microbiomes urbains contribuent à l'écologie de la vie en ville

«Comment les microbiomes urbains contribuent à l'écologie de la vie en ville», source article de Madeleine Baron dans ASM News.

Chaque ville a un microbiome. En fait, les paysages urbains hébergent des communautés microbiennes résidentes et transitoires qui peuplent tout, du sol et de l'air aux eaux usées et à l'intérieur et à l'extérieur des bâtiments. La composition de ces communautés varie d'une ville à l'autre. Il est important de noter que les microbes citadins jouent de nombreux rôles, largement inexplorés, dans la structure et la fonction des espaces urbains et la santé de ceux qui les habitent. Une meilleure compréhension des microbiomes urbains pourrait faciliter la conception de villes avec des microbes et leur importance pour le bien-être de la ville et des citoyens.

Comme le microbiome humain se compose de consortiums microbiens habitant des régions du corps (c'est-à-dire l'intestin, la peau, les poumons, etc.), les microbiomes urbains sont un ensemble de communautés microbiennes qui occupent divers réservoirs dans les paysages urbains, des profondeurs des égouts aux sommets des bâtiments. En tant que tel, il existe plusieurs réservoirs avec des rôles connus et émergents dans la santé et le fonctionnement des villes et de leurs habitants.

Sol

Le sol est l'une des substances les plus microbiennes et les plus diversifiées de la planète, et les écologistes microbiens découvrent les merveilles du microbiome du sol depuis des décennies. Les sols urbains (en particulier ceux des espaces verts, comme les parcs) contiennent une biodiversité considérable. En fait, Central Park à New York conserve un degré de diversité microbienne comparable à celui des paysages naturels du monde entier, y compris les sols tropicaux et désertiques. Comme dans les milieux naturels, les microbes du sol remplissent des fonctions biochimiques importantes pour l'écosystème urbain, notamment en facilitant le cycle des nutriments et le stockage du carbone.

Au-delà de ces fonctions, les microbes du sol urbain peuvent affecter la santé des habitants de la ville. Il est bien établi que les interactions avec les microbes environnementaux, y compris ceux du sol, sont nécessaires au bon développement et au bon fonctionnement du système immunitaire. Les sols urbains peuvent également héberger des pathogènes issus de la contamination par les eaux usées et d'autres déchets, ainsi que de nouveaux produits naturels dérivés de microbes ayant un potentiel thérapeutique. Des gènes microbiens censés coder un certain nombre de produits naturels thérapeutiquement pertinents, y compris l'agent anticancéreux épothilone et l'antibiotique érythromycine, ont été identifiés dans les sols des parcs de la ville de New York.

Air

L'air contient des populations microbiennes transitoires dont les compositions varient en fonction de l'utilisation des terres (par exemple, quelle partie du paysage est recouverte de végétation par rapport au béton). Les microbes qui occupent les surfaces des plantes peuvent être balayés dans l'atmosphère et aider à façonner la composition d’«aérobiome». En tant que telles, les communautés bactériennes planant au-dessus des parcs urbains sont distinctes et plus diversifiées sur le plan de la composition que celles au-dessus des parkings. De plus, le type de végétation dans les zones urbaines influence la diversité des aérobiomes urbains, avec une plus grande diversité microbienne observée dans les régions riches en arbres par rapport aux zones herbeuses.

Du point de vue de la santé, des études ont établi un lien entre les aérobiomes urbains et de moins bons résultats pour la santé par rapport aux zones rurales, notamment une prévalence accrue d'affections telles que l'asthme et les allergies. Cela peut être dû à l'abondance et à la diversité microbiennes accrues dans l'air rural par rapport aux zones urbaines, bien que seules quelques études aient évalué expérimentalement le lien entre les aérobiomes ruraux et urbains et la santé humaine. Ces études suggèrent que, par rapport aux espaces urbains, les aérobiomes ruraux orientent la réponse immunitaire vers une réponse T-régulatrice et de type Th1 (cellules T helper de type 1) plutôt qu'une réponse Th2 associée à l'allergie et l'asthme. Néanmoins, il existe un plus grand besoin d'explorations mécanistes sur les facteurs qui façonnent les communautés microbiennes aéroportées et leurs effets sur les citadins.

Eaux usées

Sous les villes animées se trouvent des réseaux de canalisations d'égouts; à travers ces tuyaux s'écoulent les déchets humains, les produits chimiques et les eaux de ruissellement. Les systèmes d'égouts contiennent des consortiums microbiens qui maintiennent des taxons de communautés sources (par exemple, des microbes dérivés d'excréments humains), mais diffèrent également de ces sources, suggérant une adaptation des microbes à l'environnement nutritionnellement et chimiquement distinct du système d'égouts. 

De plus, les biofilms bactériens le long de l'intérieur des tuyaux sont uniques du point de vue de la composition des populations transitoires dans les déchets qui s'écoulent, mettant l'accent sur la diversité de l'habitat au sein du système d'égout lui-même. Notamment, les eaux usées peuvent être utilisées pour surveiller la prévalence et la propagation des microbes pathogènes, y compris le SRAS-CoV-2, ainsi que des organismes résistants aux antibiotiques. Les microbes sont également bénéfiques pour la purification des déchets ; les usines de traitement des eaux usées s'enrichissent en micro-organismes qui digèrent les boues (c'est-à-dire les eaux usées filtrées pour éliminer le sable) pour les étapes ultérieures de purification de l'eau.


Bâtiments
Les villes ne sont pas appelées «jungles de béton» pour rien, les surfaces artificielles sont les fondements de la vie urbaine. L'intérieur des bâtiments héberge des assemblages de microbes largement dérivés de l'homme, comme ceux de la peau, ainsi que ceux introduits par l'air, le sol et l'eau. Les interactions avec ces microbes peuvent conduisent principalement à l'acquisition de microbes pathogènes et bénéfiques.

L'extérieur des bâtiments, qui communique avec l'air et d'autres réservoirs, héberge des communautés microbiennes qui influencent l'intégrité structurelle de la ville. Par exemple, les bactéries oxydant les sulfures déposées sur les surfaces des bâtiments peuvent produire des acides qui dégradent les métaux, tandis que certains champignons peuvent se transformer en pierre et produire des métabolites qui causent des dommages physiques et biochimiques. D'autre part, les microbes peuvent également protéger contre une telle dégradation et destruction. Par exemple, certains microbes non corrosifs produisent des antimicrobiens qui inhibent la croissance des espèces corrosives. Une meilleure compréhension des attributs structurels et fonctionnels des communautés habitant l'environnement ‘bâti’ peut favoriser l'application de méthodes microbiologiques pour préserver l'architecture de la ville, y compris les éléments précieux comme les monuments.

Bien que chacun des réservoirs ci-dessus soit caractérisé par son propre profil microbien, le microbiome urbain dans son ensemble est un ensemble de ceux associés à son sol, son atmosphère, son eau et ses surfaces. Les communautés microbiennes au sein des réservoirs se croisent pour façonner l'écosystème microbien à l'échelle de la ville. De plus, il existe des réservoirs au-delà de ceux discutés ici, tels que les animaux et les humains, qui contribuent aux assemblages microbiens des paysages urbains.

La composition des microbiomes urbains est spécifique à la ville

Il existe des variations considérables dans la composition des microbiomes urbains à travers le monde. Des facteurs tels que l'abondance d'espaces verts et l'exposition du sol, l'architecture urbaine et la composition des eaux usées varient d'une ville à l'autre. D'autres facteurs comme la géographie et le climat influencent également le type de microbes qui survivent dans les paysages urbains. Par conséquent, aucune ville n'a le même microbiome. Lorsque les scientifiques ont effectué des analyses du microbiome sur des échantillons prélevés sur diverses surfaces dans des immeubles de bureaux à Toronto, au Canada, Flagstaff, Arizona et San Diego, Californie, ils ont découvert que chacun présentait une structure de communauté bactérienne spécifique à la ville.

Plus récemment (et à plus grande échelle), le séquençage métagénomique d'échantillons prélevés dans des stations de transport en commun dans 60 villes du monde, de Denver à Tokyo, a révélé que chaque ville avait une empreinte microbienne unique. Il est important de noter que ces empreintes n'étaient pas des reflets directs des microbiomes humains ou du sol, illustrant que le microbiome urbain dans son ensemble est plus que la somme de ses parties. De plus, les chercheurs ont identifié 750 bactéries et plus de 10 900 virus dont les séquences ne correspondaient à aucune base de données de référence, soulignant qu'une grande partie de la vie microbienne habitant les espaces urbains, et leurs implications fonctionnelles en termes de structure de la ville et de santé des résidents, restent à explorer. Cette variation microbienne offre une excellente occasion de comprendre comment l'emplacement, la conception et les opérations de la ville influencent son microbiome, ce qui pourrait donner un aperçu de la façon dont les villes peuvent façonner leur microbiome pour un avantage fonctionnel maximal.

Vers une compréhension fonctionnelle des microbiomes urbains

Les progrès technologiques ont rendu de plus en plus évidents la complexité, le dynamisme et l'importance potentielle des microbiomes urbains, et de nombreuses questions restent sans réponse. Par exemple, l'importance relative des réservoirs microbiens spécifiques (par exemple, le sol, l'air, etc.) dans le paysage urbain varie-t-elle en fonction de la ville et du temps ? Comment les populations microbiennes au sein de ces réservoirs interagissent-elles et s'influencent-elles les unes les autres ? Une meilleure compréhension de ces interactions fournirait une vision plus nuancée des réseaux microbiens complexes qui définissent les microbiomes urbains dans leur ensemble.

De plus, une grande partie de ce que l'on sait sur les microbiomes urbains provient d'analyses d'acides nucléiques microbiens (principalement bactériens) dispersés dans les espaces urbains. Bien que cette approche donne un aperçu de la composition et des fonctions potentielles des communautés microbiennes, elle fait peu pour révéler les fonctions biologiques et écologiques réelles des microbes urbains et ce qu'elles signifient pour la santé humaine. Détecter les fragments d'ADN de pathogènes, par exemple, ne signifie pas nécessairement qu'ils sont largement répandus, ou même vivants. En effet, une analyse métagénomique du métro de New York a détecté Yersinia pestis et Bacillus anthracis (bactéries respectivement responsables de la peste et de la fièvre charbonneuse), bien que l'absence de cas signalés de peste ou de fièvre charbonneuse dans la ville suggère que ces pathogènes ne posent pas de problème de risque net pour la santé humaine. En fin de compte, obtenir des informations phénotypiques sur les communautés microbiennes urbaines, couplées à des enquêtes approfondies sur si et comment elles interagissent avec les humains et les infrastructures, permettrait de faire la lumière sur le rôle et l'utilisation potentielle de ces microbes dans la modulation de la santé de nos villes.

jeudi 10 juin 2021

La recherche établit des seuils d'eau sûrs pour les antimicrobiens, faisant progresser la lutte contre la résistance

«La recherche établit des seuils d'eau sûrs pour les antimicrobiens, faisant progresser la lutte contre la résistance», source Université d’Exeter.

Les chercheurs ont progressé vers un engagement du G7 à établir des normes sûres pour la libération d'antimicrobiens dans l'environnement, en élaborant un nouveau cadre qui établit des seuils sûrs.

La menace que les bactéries développent une résistance aux médicaments antimicrobiens (souvent appelés antibiotiques) utilisés pour traiter les infections est l'un des plus grands défis de santé mondiale, pouvant entraîner 10 millions de décès par an d'ici 2050.

Un problème majeur est la propagation des antimicrobiens et des bactéries résistantes par les systèmes d'approvisionnement en eau. Lorsque nous prenons des antibiotiques, 70 pour cent passent par notre corps dans les eaux usées. Les animaux d’élevage sont traités avec des antibiotiques qui peuvent également se retrouver dans les systèmes aquatiques par ruissellement et inondations. Les recherches de l'Université d'Exeter ont déjà montré que même lorsque les antimicrobiens sont présents dans ces eaux à de faibles niveaux, ils peuvent contribuer à l'évolution de bactéries résistantes. Ces bactéries peuvent pénétrer dans nos intestins, causant potentiellement des problèmes de santé.

Le mois dernier, le communiqué de la réunion des ministres du climat et de l'environnement du G7 a reconnu que la libération d'antimicrobiens dans l'environnement peut favoriser la résistance aux antimicrobiens (RAM) et avoir un impact sur la santé humaine, animale et environnementale. Le communiqué se lit comme suit : «Nous notons avec inquiétude qu'il n'existe actuellement aucune norme internationale sur les concentrations sûres d'antimicrobiens rejetés dans l'environnement provenant, entre autres, de la fabrication pharmaceutique, des effluents des établissements de santé, de l'agriculture et de l'aquaculture. Nous reconnaissons également le travail de l'AMR Industry Alliance à cet égard. Nous nous engageons à accumuler des connaissances sur la RAM dans l'environnement. Nous travaillerons avec nos collègues ministériels responsables des régulateurs de la santé, de l'alimentation, de l'agriculture et des médicaments lorsqu'ils sont indépendants du gouvernement, le cas échéant, pour développer et convenir de telles normes.»

Désormais, dans un article publié dans Water Research, l'équipe d'Exeter a travaillé avec la société pharmaceutique mondiale AstraZeneca pour faire un pas important vers la satisfaction de ce besoin.

Après avoir examiné les preuves disponibles sur le terrain, ils ont développé un cadre qui fournit efficacement des conseils sur la manière d'effectuer une évaluation des risques pour garantir que les niveaux d'antimicrobiens libérés dans l'environnement sont sûrs. Actuellement, il n'y a pas de seuils pour les niveaux sûrs d'antimicrobiens dans les eaux usées et les systèmes aquatiques, bien que les gouvernements de l'UE et du Royaume-Uni surveillent les preuves émergentes.

Le Dr Aimee Murray, de l'Université d'Exeter, auteur principal de l'article, a déclaré : «Au cours des dernières années, nos recherches ont aidé à comprendre la menace urgente posée par l'évolution de la RAM dans nos eaux et dans l'environnement. Nous sommes ravis de voir la réunion des ministres du climat et de l'environnement du G7 s'engager à agir. Notre nouveau document est une étape importante vers une politique d'information qui peut garantir que les niveaux d'antimicrobiens que nous rejetons dans l'environnement sont sûrs.»

L'examen de l'équipe d'Exeter résume et évalue de manière critique les approches actuelles qui étudient les concentrations d'antimicrobiens qui augmentent la résistance aux antimicrobiens. Ils ont consolidé la terminologie et recommandé la meilleure façon d'analyser les données (y compris les données générées à Exeter) sur la sélection pour la RAM afin d'établir des seuils sûrs de rejet dans l'environnement. En rassemblant et en évaluant les données disponibles, ils ont recommandé quels pourraient être ces seuils de sécurité, pour permettre aux gouvernements d'agir pour les réduire.

Le professeur Will Gaze, de l'Université d'Exeter, a déclaré : «Si nous n'agissons pas maintenant, la RAM pourrait être une plus grande menace pour l'humanité que COVID-19 au cours des prochaines décennies. Nos travaux au cours de la dernière décennie représentent une contribution significative à la compréhension du rôle de l'environnement dans l'évolution et la transmission de la RAM. Il existe encore des incertitudes concernant les processus complexes qui conduisent à la mobilisation des gènes de résistance aux antimicrobiens des bactéries environnementales aux agents pathogènes humains et comment la présence d'antimicrobiens dans les environnements naturels entraîne ce phénomène.»

Le professeur Jason Snape, responsable mondial de l'environnement chez AstraZeneca, a déclaré : «Ce cadre est le dernier résultat de notre partenariat avec l'Université d'Exeter, qui nous a aidés au cours des huit dernières années à établir des objectifs de rejet fondés sur la science et les risques. concentrations d'antibiotiques, à la fois pour respecter nos engagements en tant qu'entreprise et pour notre industrie, en comblant les lacunes critiques en matière de connaissances à l'appui d'une politique fondée sur la science pour faire face aux risques environnementaux associés à la RAM.»

mercredi 26 mai 2021

Des scientifiques trouvent une solution pour mesurer les particules de plastique dangereuses dans les eaux usées humaines

Carte des pixels représentant des microplastiques détectés à partir d'un échantillon d'eaux usées brutes.

«Des scientifiques trouvent une solution pour mesurer les particules de plastique dangereuses dans les eaux usées humaines», source Université de Portsmouth.

Des scientifiques se sont rapprochés des eaux usées humaines pour déterminer la meilleure façon de mesurer les plastiques cachés et potentiellement dangereux.

Comme la façon dont les microplastiques sont mesurés et comptés varie d'un endroit à l'autre, il n'y a pas de compréhension commune du poids du problème. Tant que les scientifiques ne parviendront pas à s'entendre sur un moyen de les mesurer, la vie sur terre et sur mer continuera à ingérer qui sait combien de plastique, affectant la santé pendant des générations.

Une nouvelle étude, publiée dans Analytical and Bioanalytical Chemistry, par l'Université de Portsmouth a examiné une méthode, utilisant une solution chimique appelée «réactif de Fenton» pour éliminer la matière organique des eaux usées. Il a été constaté que cela présente des avantages significatifs en termes de temps de traitement et de coûts par rapport aux autres méthodes de test actuellement disponibles.

Le Dr Fay Couceiro, chargé de recherche principal en biogéochimie à l'Université de Portsmouth, a déclaré: «La digestion multiple avec le réactif de Fenton consiste à mélanger les eaux usées avec du peroxyde d'hydrogène et du sulfure de fer plusieurs fois pour décomposer la matière organique. Lorsqu'elle est suivie d'une séparation par densité, où vous faites flotter les plastiques de tout le reste, cela fournit un échantillon plus propre afin que la taille et le type de microplastique puissent être déterminés avec beaucoup moins d'interférences. "

Le professeur Steve Fletcher, directeur de l'initiative Revolution Plastics de l'Université, a déclaré: «Avoir une idée de la quantité de microplastiques dans l'environnement est essentiel pour comprendre et arrêter les impacts nocifs potentiels que cette nouvelle catégorie de polluants émergents pourrait avoir sur la vie sur Terre. Le besoin de protocoles robustes, simples et fiables ainsi que leur standardisation sont d'une importance cruciale dans la lutte contre la pollution plastique. "

L'étude visait la détection de microplastiques dans la gamme de taille inférieure à cent microns, qui sont souvent manqués en raison de leur petite taille, mais ils présentent des risques pour la santé potentiellement plus élevés qui leur sont associés. Cette taille de particule dispose également de données limitées provenant de recherches antérieures sur les eaux usées.

Pour montrer la valeur de cette méthode, des échantillons d'eaux usées brutes, d'effluent final et de boues ont été mélangés avec deux tailles et types de microplastiques différents. La digestion multiple avec la méthode de réactif de Fenton a montré une bonne récupération des microplastiques ajoutés. Compte tenu des différentes étapes nécessaires à la séparation des microplastiques, le temps est un facteur limitant dans le traitement des échantillons. La digestion multiple à l'aide du réactif de Fenton est une procédure peu coûteuse et rapide par rapport aux autres méthodes actuellement disponibles lors de l'analyse d'un grand nombre d'échantillons.

Le Dr Couceiro déclare: «La méthode du réactifs de Fenton utilisée dans cette étude a un énorme potentiel pour aboutir à une standardisation indispensable de la mesure des microplastiques. Sans pouvoir comparer et contraster les concentrations de microplastiques, notre capacité à faire des progrès significatifs dans la limitation de la pollution seront limités. Nous serions heureux de poursuivre les recherches qui pourraient étudier d'autres types de plastiques et la récupération de particules de plastique encore plus petites.»

mercredi 28 avril 2021

Utiliser des microbes pour éliminer les microplastiques de l'environnement

«Utiliser des microbes pour éliminer les microplastiques de l'environnement», source Microbiogy Society via EurkAlert!

Les microbiologistes ont trouvé un moyen d'utiliser des bactéries pour piéger les microplastiques, les retirer de l'environnement et les rendre plus faciles à recycler.

A la conférence annuelle de la Microbiology Sociéty, Yang Liu, chercheur à l'Université polytechnique de Hong Kong, discutera d'une nouvelle technique pour piéger et récupérer les microplastiques.

La méthode utilise des biofilms bactériens, une substance collante créée par des micro-organismes, pour piéger les particules microplastiques. Le biofilm est ensuite traité et dispersé, libérant les particules microplastiques pour le traitement et le recyclage.

Liu et ses collègues ont utilisé la bactérie Pseudomonas aeruginosa pour capturer des microplastiques dans un bioréacteur. Cette espèce de bactérie se trouve dans tous les environnements et il a déjà été démontré qu'elle colonisait les microplastiques dans l'environnement.

Les biofilms de P. aeruginosa provoquent l'agrégation des microplastiques, les faisant finalement couler. Dans les bioréacteurs, cela rend les microplastiques plus faciles à collecter, selon Liu. Une fois que les microplastiques ont été capturés par les biofilms et ont coulé au fond du réacteur, les chercheurs ont utilisé un gène de dispersion du biofilm, qui a provoqué la libération des microplastiques par le biofilm. Liu a expliqué que cela «permet une libération commode des microplastiques de la matrice de biofilm, qui est par ailleurs difficile et coûteux à dégrader, de sorte que les microplastiques peuvent être récupérés plus tard pour être recyclés.»

Les microplastiques sont extrêmement problématiques et posent un risque majeur pour les chaînes alimentaires et la santé humaine, selon Liu: «Ils ne sont pas facilement biodégradables, car ils restent dans les écosystèmes pendant des durées prolongées. Cela se traduit par l'absorption des microplastiques par les organismes, ce qui entraîne au transfert et à la rétention des microplastiques le long de la chaîne alimentaire. En raison de leur grande superficie et de leur capacité d'adsorption, les microplastiques peuvent adsorber les polluants toxiques, tels que les pesticides, les métaux lourds et les résidus de médicaments à des concentrations élevées. Cela entraîne une toxicité biologique et chimique pour les organismes dans les écosystèmes et les humains après une consommation non intentionnelle prolongée de ces microplastiques. De plus, les microplastiques sont également difficiles à éliminer dans les usines de traitement des eaux usées, ce qui entraîne leur rejet indésirable dans l'environnement.»

Les prochaines étapes de la recherche consistent à déplacer la preuve de concept du laboratoire vers un environnement environnemental. «Nous prévoyons ensuite d'isoler et d'identifier des isolats bactériens naturels formant des pro-biofilm provenant des eaux usées ou des environnements aquatiques, où ils s'affichent de manière accrue les capacités à coloniser et à former des biofilms sur les microplastiques.»

Liu et ses collègues espèrent que cette technique sera éventuellement utilisée dans les usines de traitement des eaux usées pour aider à empêcher les microplastiques de s'échapper dans les océans. Ils doivent également trouver des composés naturels pour stimuler la dispersion du biofilm des isolats bactériens formant le pro-biofilm, affirmant que «cela fournit une base pour de futures applications dans les usines de traitement des eaux usées, où les microplastiques peuvent être éliminés de manière sûre et respectueuse de l'environnement.»

Les microplastiques sont un énorme problème, et plus de techniques sont nécessaires pour les éliminer en toute sécurité de notre environnement, Liu déclare l'importance de cela, affirmant qu'«il est impératif de développer des solutions efficaces qui piègent, collectent et même recyclent ces microplastiques pour arrêter la plastification «de nos milieux naturels.»

Les biofilms se produisent lorsque des communautés bactériesnne se regroupent et créent un bouclier, ou biofilm, à partir de substances exopolymères collantes. Les biofilms peuvent être problématiques car ils protègent les bactéries contre les influences extérieures telles que les changements environnementaux et les antibiotiques.

Les microplastiques sont des particules de plastique de moins de 5 mm de diamètre. Ils peuvent pénétrer dans l'environnement par un certain nombre de sources, y compris la décomposition de plus gros morceaux de plastique, le lavage de vêtements synthétiques, la dégradation des pneus de voiture et les déchets plastiques directement de l'industrie. Les méthodes actuelles d'élimination des microplastiques, telles que l'incinération ou le stockage en décharge, sont limitées et présentent leurs propres inconvénients.

Mise à jour du 21 mai 2021. On lira ce document de l'Anses, Microplastiques et nanomatériaux.

samedi 20 mars 2021

Une nouvelle étude montre que les microplastiques se transforment en 'hubs ' pour les agents pathogènes et les bactéries résistantes aux antibiotiques

Une seule utilisation d'un exfoliant pour le visage peut libérer de 5 000 à 100 000 microplastiques dans l'environnement. Crédit photo Dung Pham, Chen Wu, NJIT.
«Une nouvelle étude montre que les microplastiques se transforment en 'hubs ' pour les agents pathogènes et les bactéries résistantes aux antibiotiques», source New Jersey Institute of Technology (NJIT).

On estime qu’une usine de traitement des eaux usées de taille moyenne desservant environ 400 000 résidents rejettera chaque jour jusqu’à 2 000 000 de particules microplastiques dans l’environnement.

Pourtant, les chercheurs apprennent tous les jours sur l'impact environnemental et sur la santé humaine de ces particules de plastique ultra-fines, de moins de 5 millimètres de longueur, présentes dans tout, des cosmétiques, du dentifrice et des microfibres de vêtements, à nos aliments, notre air et notre eau potable.

Désormais, des chercheurs du New Jersey Institute of Technology ont montré que les microplastiques omniprésents peuvent devenir des 'plaques tournantes' ou hubs pour la croissance de bactéries et des agents pathogènes résistants aux antibiotiques une fois qu'ils ont lavé les égouts ménagers et pénétré dans les usines de traitement des eaux usées - formant une couche visqueuse d'accumulation, ou biofilm, sur leur surface qui permet aux micro-organismes pathogènes et aux déchets d'antibiotiques de se fixer et de se mélanger.

Dans des résultats publiés dans le Journal of Hazardous Materials Letters d'Elsevier, les chercheurs ont découvert que certaines souches de bactéries augmentaient la résistance aux antibiotiques jusqu'à 30 fois tout en vivant sur des biofilms liés aux microplastiques qui peuvent se former à l'intérieur des unités de boues activées dans les usines de traitement des eaux usées municipales.

«Un certain nombre d'études récentes se sont concentrées sur les impacts négatifs que des millions de tonnes de déchets microplastiques par an ont sur nos environnements d'eau douce et océanique, mais jusqu'à présent, le rôle des microplastiques dans les processus de traitement des eaux usées de nos villes a été en grande partie inconnu», a dit Mengyan Li, professeur de chimie et de sciences de l'environnement au NJIT et auteur correspondant de l'étude.

«Ces usines de traitement des eaux usées peuvent être des points chauds où convergent divers produits chimiques, bactéries résistantes aux antibiotiques et agents pathogènes et ce que notre étude montre, c'est que les microplastiques peuvent servir de vecteurs, posant des risques imminents pour le biote ou écosystème aquatique et la santé humaine s'ils contournent le processus de traitement de l'eau.»

«La plupart des usines de traitement des eaux usées ne sont pas conçues pour l'élimination des microplastiques, elles sont donc constamment rejetées dans le milieu récepteur», a ajouté Dung Ngoc Pham, en doctorat au NJIT et premier auteur de l'étude. «Notre objectif était de déterminer si les microplastiques enrichissent ou non les bactéries résistantes aux antibiotiques des boues activées dans les usines de traitement des eaux usées municipales, et si oui, en savoir plus sur les communautés microbiennes impliquées.»

Dans l'étude, l'équipe a collecté des lots d'échantillons de boues de trois usines de traitement des eaux usées domestiques dans le nord du New Jersey, inoculant les échantillons dans le laboratoire avec deux microplastiques commerciaux répandus - le polyéthylène (PE) et le polystyrène (PS). L'équipe a utilisé une combinaison de PCR quantitative et de techniques de séquençage de nouvelle génération pour identifier les espèces de bactéries qui ont tendance à se développer sur les microplastiques, en suivant les changements génétiques des bactéries en cours de route.

L'analyse a révélé que trois gènes en particulier - sul1, sul2 et intI1 - connus pour favoriser la résistance aux antibiotiques courants, les sulfamides, se sont révélés jusqu'à 30 fois plus importants sur les biofilms liés aux microplastiques que dans les tests témoins au laboratoire utilisant des biofilms de sable après seulement trois jours.

Lorsque l'équipe a enrichi les échantillons avec l'antibiotique sulfaméthoxazole, ils ont constaté qu'il amplifiait encore plus les gènes de résistance aux antibiotiques jusqu'à 4,5 fois.

«Auparavant, nous pensions que la présence d'antibiotiques serait nécessaire pour améliorer les gènes de résistance aux antibiotiques dans ces bactéries associées aux microplastiques, mais il semble que les microplastiques peuvent naturellement permettre l'absorption de ces gènes de résistance par eux-mêmes» a dit Pham. «La présence d'antibiotiques a cependant un effet multiplicateur significatif.»

Huit espèces différentes de bactéries ont été retrouvées hautement enrichies sur les microplastiques. Parmi ces espèces, l'équipe a observé deux agents pathogènes humains émergents généralement liés à une infection respiratoire, Raoultella ornithinolytica et Stenotrophomonas maltophilia, faisant fréquemment de l'auto-stop sur les biofilms liés aux microplastiques.

L'équipe affirme que la souche de loin la plus courante trouvée sur les microplastiques, Novosphingobium pokkalii, est probablement un initiateur clé dans la formation de biofilm collant qui attire ces agents pathogènes - car elle prolifère, elle peut contribuer à la détérioration du plastique et étendre le biofilm. Dans le même temps, l’étude de l’équipe a mis en évidence le rôle du gène intI1, un élément génétique mobile principalement responsable de l’échange de gènes de résistance aux antibiotiques entre les microbes liés aux microplastiques.

«Nous pourrions considérer les microplastiques comme de minuscules perles, mais ils fournissent une énorme surface de résidence aux microbes», a expliqué Li. «Lorsque ces microplastiques pénètrent dans l'usine de traitement des eaux usées et se mélangent aux boues, des bactéries comme Novosphingobium peuvent accidentellement se fixer à la surface et sécréter des substances extracellulaires semblables à de la colle. Au fur et à mesure que d'autres bactéries se fixent à la surface et se développent, elles peuvent même échanger de l'ADN entre elles. C'est ainsi que les gènes de résistance aux antibiotiques se propagent dans la communauté.»

«Nous avons la preuve que la bactérie a développé une résistance à d'autres antibiotiques de cette manière, comme les aminosides , les bêta-lactames et le triméthoprime», a ajouté Pham.

Maintenant, Li dit que le laboratoire étudie plus en détail le rôl de Novosphingobium dans la formation de biofilm liés aux microplastiques. L'équipe cherche également à mieux comprendre dans quelle mesure ces microplastiques porteurs d'agents pathogènes peuvent contourner les processus de traitement de l'eau, en étudiant la résistance des biofilms liés aux microplastiques pendant le traitement des eaux usées avec des désinfectants tels que les rayons UV et le chlore.

«Certains États envisagent déjà de nouvelles réglementations sur l'utilisation des microplastiques dans les produits de consommation. Cette étude appelle à approfondir les recherches sur les biofilms liés aux microplastiques dans nos systèmes de traitement des eaux usées et à développer des moyens efficaces pour éliminer les microplastiques dans les environnements aquatiques », a dit Li.

Mise à jour du 21 mai 2021. On lira ce document de l'AnsesMicroplastiques et nanomatériaux.

jeudi 21 janvier 2021

Le séquençage des eaux usées est utile pour le contrôle du SRAS-CoV-2

En France, nous avons le réseau Obépine, dont vous trouverez les objectifs ici, et qui nous dit à propos de ses réalisations,

Le réseau en cours de construction repose sur l’identification des quelques 150 STEU (Station de Traitement des Eaux Usées) dans lesquelles une analyse bi-hebdomadaire sera réalisée. Si, dans l’une d’entre elle, on mesure une augmentation de la concentration en trace de génome SARS-Cov-2, la première réaction, après la vérification qui s’impose, sera d’augmenter la fréquence des analyses. Ensuite, le réseau étant construit de façon hiérarchique, nous irons observer une dizaine de stations complémentaires, que nous pensons statistiquement semblables, pour y évaluer la dynamique de la concentration en génome.

C'est un bon début, mais comme nous allons le voir, il faut aussi vérifier quel type de variant se trouve dans les eaux usées car le «Séquençage des eaux usées est utile pour le contrôle du SRAS-CoV-2», source ASM News.

Le séquençage du génome viral des eaux usées peut détecter de nouveaux variants du SRAS-CoV-2 avant qu'ils ne soient détectées par séquençage clinique local, selon une nouvelle étude publiée dans mBio, une revue en accès libre de l'American Society for Microbiology. La capacité de suivre les mutations du SRAS-CoV-2 dans les eaux usées pourrait être particulièrement utile pour suivre de nouveaux variants, comme la souche B.1.17 qui est désormais répandue au Royaume-Uni et qui a déjà été introduite aux États-Unis. (en France aussi hélas -aa).

«Le virus du SRAS CoV-2 est excrété par les individus infectés par le COVID-19 et les déchets fécaux se retrouvent dans les systèmes de traitement des eaux usées. En prélevant les eaux usées, nous pouvons obtenir des informations sur les infections pour toute une population. Certains systèmes d'assainissement desservent plusieurs milliers de personnes. Certains servent des centaines de milliers de personnes», a déclaré la chercheuse principale de l'étude, Kara Nelson, professeur de génie civil et environnemental, au College of Engineering de l'Université de Californie-Berkeley. «Le prélèvement des eaux usées est un moyen très efficace d'obtenir des informations. C'est aussi une source d'information moins biaisée, car nous pouvons obtenir des informations de toutes les personnes du bassin d'égouts, qu'elles soient ou non testées dans une clinique. Nous savons qu'il y a des personnes qui ont des infections asymptomatiques qui pourraient ne jamais être testées.»

Dans la nouvelle étude, les chercheurs ont développé et utilisé une nouvelle méthode d'échantillonnage des eaux usées. Lorsque les chercheurs séquencent l'ARN concentré et extrait des échantillons d'eaux usées, de nombreuses souches différentes peuvent être présentes car de nombreuses personnes contribuent à l'échantillon. Cependant, il est difficile de distinguer le signal génétique du SRAS-CoV-2 des milliards de bactéries et de virus que les humains excrètent chaque jour. Les chercheurs doivent identifier le SRAS CoV-2 au milieu d'une soupe entière d'autres matériels génomiques.

«La manière dont nous devons traiter les informations de séquence est complexe. Une contribution de cet article est la capacité de préparer des échantillons pour le séquençage à partir des eaux usées. Au lieu de séquencer directement tout ce qui est présent, nous avons utilisé une approche d'enrichissement où vous essayez d'abord d'enrichir l'ARN qui vous intéresse», a dit le Dr Nelson. «Nous avons ensuite développé une nouvelle approche d'analyse bioinformatique suffisamment sensible pour détecter une seule différence nucléotidique. Vous ne pouvez pas être plus sensible que cela.»

Les chercheurs ont séquencé l'ARN directement à partir des eaux usées collectées par les districts municipaux de la baie de San Francisco pour générer des génomes complets et presque complets du SRAS-CoV-2. Les chercheurs ont découvert que les principaux génotypes de consensus SRAS-CoV-2 détectés dans les eaux usées étaient identiques aux génomes cliniques de la région. Alors que les variants d'eaux usées observés étaient plus similaires aux génotypes locaux dérivés de patients californiens qu'ils ne l'étaient à ceux d'autres régions, ils ont également détecté des variants de nucléotides uniques qui n'avaient été signalés qu'ailleurs aux États-Unis ou dans le monde. Ainsi, les chercheurs ont découvert que le séquençage des eaux usées peut fournir des preuves d'introductions récentes de lignées virales avant qu'elles ne soient détectées par séquençage clinique local. En comprenant quelles souches de SRAS-CoV-2 sont présentes dans les populations au fil du temps, les chercheurs peuvent avoir un aperçu de la façon dont la transmission se produit et si de nouveaux variants, comme le B.1.1.7, dominent la transmission.

«Parmi tous ceux qui sont testés, seule une fraction de ces échantillons est séquencée. Lorsque vous échantillonnez les eaux usées, vous obtenez des données plus complètes et moins biaisées sur votre population», a dit le Dr Nelson. «Il semble que nous pourrions être en mesure d'obtenir un signal plus tôt dans les eaux usées si un nouveau variant apparaît par rapport au fait de ne compter que sur le séquençage des échantillons cliniques. Le simple fait de savoir que le SRAS-CoV-2 est présent dans une population est la première étape pour fournir des informations pour aider à contrôler la propagation du virus, mais savoir quels variants sont présents fournit des informations supplémentaires mais très utiles.

mardi 15 décembre 2020

Des bactéries tolérantes au sel avec un appétit pour les boues d'épuration produisent des bioplastiques biodégradables

Les bactéries Zobellella denitrificans ZD1 se nourrissent de boues (toutes deux présentes dans le tube à essai) pour fabriquer des bioplastiques biodégradables. Crédit Dr. Kung-Hui (Bella) Chu

« Des bactéries tolérantes au sel avec un appétit pour les boues d'épuration produisent des plastiques biodégradables », source Texas A&M University.

En utilisant une souche bactérienne trouvée dans la mangrove, des chercheurs du Texas A&M ont découvert une méthode durable et peu coûteuse pour produire des bioplastiques à partir de boues d'épuration et d'eaux usées.

Les États-Unis produisent annuellement sept millions de tonnes de boues d'épuration, suffisamment pour remplir 2 500 piscines olympiques. Bien qu'une partie de ces déchets soit réutilisée pour le fumier et d'autres applications terrestres, une quantité substantielle est toujours éliminée dans les décharges. Dans une nouvelle étude, des chercheurs de l'Université Texas A&M ont découvert un moyen efficace d'utiliser les restes de boues pour fabriquer des plastiques biodégradables.

Dans le numéro de septembre de la revue Omega de l'American Chemical Society (ACS), les chercheurs rapportent que la bactérie Zobellella denitrificans ZD1, retrouvée dans une mangroves peut consommer des boues et des eaux usées pour produire du polyhydroxybutyrate, un type de biopolymère qui peut être utilisé à la place de plastiques à base de pétrole. En plus de réduire le fardeau sur les décharges et l'environnement, les chercheurs ont dit que Zobellella denitrificans ZD1 offre un moyen de réduire les coûts en amont de la fabrication des bioplastiques, une étape vers des prix plus compétitifs par rapport aux plastiques ordinaires.

«Le prix des matières premières pour cultiver des bactéries productrices de biopolymères représente 25 à 45% du coût de production total de la fabrication de bioplastiques. Certes, ce coût peut être considérablement réduit si nous pouvons exploiter une ressource alternative moins chère et facilement accessible», a déclaré Kung-Hui (Bella) Chu, professeur au Zachry Department of Civil and Environmental Engineering. «Nous avons démontré un moyen potentiel d'utiliser des boues activées par les eaux usées municipales et les eaux usées industrielles de l'agriculture et de l'aquaculture pour fabriquer des plastiques biodégradables. De plus, la souche bactérienne ne nécessite pas de processus de stérilisation élaborés pour éviter la contamination par d'autres microbes, réduisant encore davantage l'exploitation. et les coûts de production des bioplastiques.»

Le polyhydroxybutyrate, une classe émergente de bioplastiques, est produit par plusieurs espèces bactériennes lorsqu'elles subissent un déséquilibre des nutriments dans leur environnement. Ce polymère agit comme des réserves énergétiques supplémentaires de la bactérie, comme les amas graisseux chez les animaux. En particulier, une abondance de sources de carbone et un épuisement de l'azote, du phosphore ou de l'oxygène poussent les bactéries à consommer de manière erratique leurs sources de carbone et à produire du polyhydroxybutyrate en réponse au stress.

Un tel milieu qui peut forcer les bactéries à fabriquer du polyhydroxybutyrate est le glycérol brut, un sous-produit de la fabrication de biodiesel. Le glycérol brut est riche en carbone et ne contient pas d'azote, ce qui en fait une matière première appropriée pour la fabrication de bioplastiques. Cependant, le glycérol brut contient des impuretés telles que des acides gras, des sels et du méthanol, qui peuvent empêcher la croissance bactérienne. Comme le glycérol brut, les boues d'eaux usées contiennent également plusieurs des mêmes acides gras et sels. Chu a dit que les effets de ces acides gras sur la croissance bactérienne et, par conséquent, sur la production de polyhydroxybutyrate n'avaient pas encore été examinés.

«Il existe une multitude d'espèces bactériennes qui produisent du polyhydroxybutyrate, mais seules quelques-unes qui peuvent survivre dans des environnements à forte teneur en sel et encore moins parmi ces souches peuvent produire du polyhydroxybutyrate à partir de glycérol pur», a dit Chu. «Nous avons examiné la possibilité de savoir si ces souches tolérantes au sel peuvent également se développer sur du glycérol brut et des eaux usées.»

Pour leur étude, Chu et son équipe ont choisi Zobellella denitrificans ZD1, dont l'habitat naturel est les eaux salées des mangroves. Ils ont ensuite testé la croissance et la capacité de cette bactérie à produire du polyhydroxybutyrate dans du glycérol pur. Les chercheurs ont également répété les mêmes expériences avec d'autres souches bactériennes qui sont des producteurs connus de polyhydroxybutyrate. Ils ont découvert que Zobellella denitrificans DZ1 était capable de prospérer dans du glycérol pur et produisait la quantité maximale de polyhydroxybutyrate proportionnellement à son poids sans eau.

Ensuite, l'équipe a testé la croissance et la capacité de Zobellella denitrificans ZD1 à produire du polyhydroxybutyrate dans du glycérol contenant du sel et des acides gras. Ils ont constaté que même dans ces conditions, les bactéries produisaient du polyhydroxybutyrate efficacement, même dans des conditions nutritives équilibrées. Lorsqu'ils ont répété les expériences sur des échantillons d'eaux usées synthétiques à haute résistance et de boues activées par les eaux usées, ils ont découvert que les bactéries étaient toujours capables de fabriquer du polyhydroxybutyrate, bien qu'à des quantités inférieures à celles du glycérol brut.

Chu a noté qu'en tirant parti de la tolérance de Zobellella denitrificans ZD1 pour les environnements salés, les processus de stérilisation coûteux qui sont normalement nécessaires lorsque l'on travaille avec d'autres souches de bactéries pourraient être évités.

«La préférence naturelle de Zobellella denitrificans ZD1 pour la salinité est fantastique car nous pouvons, si nécessaire, modifier la composition chimique des déchets en ajoutant simplement des sels communs. Cet environnement serait toxique pour d'autres souches de bactéries», a-t-elle dit. «Donc, nous offrons un faible coût, une méthode durable pour fabriquer des bioplastiques et une autre façon de réutiliser les biodéchets dont l'élimination est coûteuse.»

mardi 25 août 2020

Le COVID-19 dans les eaux usées pourrait-il être infectieux?


« Le COVID-19 dans les eaux usées pourrait-il être infectieux? »

Une étude internationale menée par des chercheurs de l'Université Ben-Gurion indique que les eaux usées contenant du COVID-19 pourraient constituer une menace sérieuse. Source American Associates, Université Ben-Gurion du Néguev d’après EurekAlert.

Les eaux usées contenant des coronavirus peuvent constituer une menace sérieuse, selon une nouvelle étude mondiale menée par des chercheurs de l'Institut Zuckerberg pour la recherche sur l'eau de l'Université Ben-Gourion du Néguev (BGU).

Le nouvel article, publié dans Nature Sustainability, par une collaboration internationale de 35 chercheurs, évalue des études récentes sur les coronavirus dans les eaux usées et les précédentes maladies infectieuses aéroportées, notamment le SRAS et le MERS. L'objectif est d'évaluer les menaces potentielles, les pistes de recherche et les solutions possibles, ainsi que de recueillir des perspectives bénéfiques pour l'avenir.

« Il y a de nombreuses raisons de s'inquiéter de la durée de survie des coronavirus dans les eaux usées et de son impact sur les sources d'eau naturelles », déclare l'auteur principal, le Dr Edo Bar-Zeev, du BGU Zuckerberg Institute. « Les eaux usées peuvent-elles contenir suffisamment de coronavirus pour infecter les gens? La simple vérité est que nous n'en savons pas assez et que cela doit être rectifié le plus rapidement possible. »

Bar-Zeev et son étudiante en postdoc, Anne Bogler, ainsi que d'autres chercheurs renommés, indiquent que les eaux usées qui fuient dans les cours d'eau naturels pourraient entraîner une infection par pulvérisation aérienne. De même, les eaux usées traitées utilisées pour remplir les installations d'eau récréative, comme les lacs et les rivières, pourraient également devenir des sources de contagion. Enfin, les fruits et légumes irrigués avec des eaux usées qui n'ont pas été correctement désinfectés pourraient également être une voie d'infection indirecte.

L'équipe de recherche recommande de nouvelles recherches immédiates pour déterminer le niveau d'infection potentielle, le cas échéant, et la durée de vie des coronavirus dans divers plans d'eau et pulvérisations.

« Les usines de traitement des eaux usées doivent mettre à niveau leurs protocoles de traitement et dans un proche avenir, elles progressent également vers le traitement tertiaire grâce à des membranes de microfiltration et d'ultrafiltration, qui éliminent avec succès les virus », disent Bar-Zeev et ses collègues.

Dans le même temps, les eaux usées peuvent servir d’indicateurs, car elles peuvent être surveillées pour suivre les épidémies de COVID-19. Les coronavirus commencent à apparaître dans les selles avant que d'autres symptômes tels que la fièvre et la toux n'apparaissent chez des personnes autrement asymptomatiques. Une surveillance régulière peut donc avertir les autorités à l'avance des points chauds. Les chercheurs du BGU ont récemment terminé une étude pilote à Ashkelon, en Israël, en utilisant une nouvelle méthodologie pour détecter et tracer la présence du virus et calculer sa concentration pour localiser les points chauds émergents du COVID-19. D'autres chercheurs du BGU travaillent au développement de technologies de nanofiltration de l'eau.
Lire le communiqué de l’Académie nationale de médecine : Masquez-vous, masquez-vous, masquez-vous

mardi 14 juillet 2020

Le COVID-19, les eaux usées, les coquillages et l'Ifremer


Selon France info du 10 juillet 2029, Covid-19 : « Nous n'avons observé aucune trace du génome du coronavirus, ni dans les eaux marines ni dans les coquillages », annonce l'Ifremer.
L'institut français de recherche pour l'exploitation de la mer réalisera des tests régulièrement, indique son président directeur général. François Houllier se réjouit, par ailleurs, de l'amélioration générale de la qualité des eaux du littoral.
Vous lirez l’article qui n’apporte pas grand-chose à mon sens, mais voyons plutôt ce que disent les deux communiqués de l’Ifremer à propos de cette annonce …

« Aucune trace de SARS-CoV-2 dans les premiers échantillons d’eau de mer et de coquillages analysés », selon le communiqué de l’Ifremer du 18 mai 2020.
Deux échantillons de moules et 19 échantillons d'huîtres creuses ont ainsi été prélevés entre le 22 et le 27 avril 2020.
Parmi les 21 échantillons de coquillages analysés : 6 ont présenté des traces de norovirus signant une contamination par des rejets humains.
Aucun échantillon de coquillages n’a présenté de trace de SARS-CoV-2.
Autre type de résultat, sur de l’eau de mer
Quatre échantillons d’un litre d’eau marine potentiellement soumise à des rejets humains ont été prélevés dans des zones identifiées grâce au réseau d'observatoires pour la recherche en microbiologie environnementale intégrée (ROME).
Aucun échantillon d’eau de mer n’a présenté de traces de SARS-CoV-2.
Nouveau communiqué de l’Ifremer du 28 mai 2020, « De nouvelles analyses confirment l’absence du SARS-CoV-2 dans les coquillages alors qu’elles le détectent dans des eaux usées du Grand Ouest ».
Du génome de SARS-CoV-2 a été détecté dans 9 des 13 échantillons d'eaux usées prélevés.
« Nos analyses échelonnées dans le temps suggèrent que le virus circule moins qu’au début de l’épidémie, explique Soizick Le Guyader, virologiste et responsable du laboratoire nantais ‘Santé environnement et microbiologie’ de l’Ifremer.
« Les 7 échantillons d’eaux usées prélevés avant le 24 avril sont tous positifs au SARS-CoV-2. A partir du 24 avril, sur les 6 échantillons analysés, 4 se sont révélés négatifs ».
Sous la loupe des équipes de l’Ifremer : un échantillon de palourdes, deux de moules et 16 d'huîtres creuses prélevés entre le 4 et le 11 mai 2020 sur la côte normande, les côtes bretonnes et les façades atlantique et méditerranéenne. Parmi ces 19 échantillons analysés :
Aucun échantillon de coquillages n’a présenté de trace de SARS-CoV-2.
« L’un de ces échantillons de coquillage a été prélevé juste à proximité des rejets d’une station d’épuration dans laquelle nous avions détecté des traces de SARS-CoV-2 avant traitement. Le fait qu’aucune trace de SARS-CoV-2 n’y ait été détectée laisse à penser que les traitements des eaux usées sont de nature à diminuer le risque de propagation du virus dans le milieu marin », constate Soizick Le Guyader.
Commentaire. Sans être un expert, le nombre d’échantillons ne me semble pas très significatif. Souhaitions qu'il y ait très régulièrement ce type de prélèvements pour confirmer ces résultats. Par ailleurs, comme attendu, certains échantillons prélevés de coquillages sont contaminés par norovirus, principal agent responsable des gastro-entérites aiguës … le sujet norovirus est récurrent dans les coquillages ...

jeudi 9 juillet 2020

Choses lues sur ce qu’on trouve dans l’air et dans les eaux usées, ici et là ...


Selon l’Anses, à propos de la présence de pesticides dans l’air, « A terme, les résultats de cette campagne contribueront à définir une stratégie nationale de surveillance des pesticides dans l’air extérieur. »

Le communiqué de l’Anses du 2 juillet 2020 nous dit « Pesticides dans l’air extérieur : l’Anses identifie les substances nécessitant une évaluation approfondie ».

On lira cela avec intérêt … car selon l’Anses, « La campagne exploratoire a permis de mesurer 75 substances sur 50 sites pendant un an. »
Elle constitue une photographie nationale inédite des substances présentes dans l’air extérieur.
La France est un des seuls pays en Europe (avec la Belgique) à avoir engagé ce type de campagne pour mesurer les pesticides dans l’air extérieur à l’échelle nationale.
Autres analyses, dans les eaux usées, il a été retrouvé « De nouvelles traces de Covid-19 dans les eaux usées de Paris »
La surveillance des eaux usées à Paris et dans certains départements d'Ile-de-France confirme le retour de traces minimes de Covid-19, pouvant annoncer un possible rebond du virus.
C’est bien, mais n’est-ce pas déjà le cas ? Pourquoi n’a-t-on pas de données quotidiennes ? Pourquoi ne rend-on pas ces données publiques ? On ne sait pas !

Mais où sont passés les 500 000 à 700 000 tests par semaine dans la population promis par l’ancien Premier ministre, puisqu’on nous annonce comme inévitable une seconde vague …

Et l’Académie nationale de médecine de proposer une « surveillance de la circulation du SARS-Cov-2 dans les eaux usées, indicateur simple de suivi de la pandémie de Covid-19 »

L’Académie nationale de médecine recommande :
  • de suivre la circulation du SARS-Cov-2 dans la population par l’analyse microbiologique des eaux usées des stations d’épuration ;
  • de rendre systématique cette surveillance virologique par des tests quantitatifs utilisant une méthodologie rigoureuse, tant que le virus circulera dans la population.
  • d’étendre cette surveillance systématique à d’autres virus (myxovirus, rotavirus, virus respiratoire syncytial…).
  • de constituer une banque de prélèvements permettant rétrospectivement de détecter tout nouveau virus ou agent pathogène qui apparaîtrait dans la population en fixant ainsi le début de l’épidémie.
Pendant ces temps de Covid-19, à Helsinki, en Finlande, on a d’autres préoccupations …

En effet, là-bas, on apprend par l’Institut finlandais de la santé et du bien-être (THL) que dans les eaux usées, « l'utilisation d'amphétamines a continué d'augmenter dans la région d'Helsinki dans des circonstances exceptionnelles - l'augmentation est également visible en ville. »
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Cela a même atteint des records, avant l'arrivée du Covid-19, sans compter la cocaïne et l’ecstazy …