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jeudi 31 août 2023

Les virus gastro-intestinaux ont pratiquement disparu pendant la COVID, mais ont réapparu deux ans plus tard

«Les virus gastro-intestinaux ont pratiquement disparu pendant la COVID, mais ont réapparu deux ans plus tard» source ASM News, du 9 août 2023.

Suite aux premières ordonnances de confinement émises aux États-Unis pour freiner la propagation de la COVID-19, les virus gastro-intestinaux, tels que les norovirus, les rotavirus et les adénovirus, ont pratiquement disparu des communautés californiennes et sont restés à des niveaux très faibles pendant près de 2 ans. L’étude publiée dans Journal of Clinical Microbiology, une revue de l'American Society for Microbiology.

Il est intéressant de noter que ces virus sont revenus aux niveaux d’avant la pandémie fin 2022, a déclaré Niaz Banaei, professeur de pathologie et de médecine (maladies infectieuses) à l’Université de Stanford et directeur médical du laboratoire de microbiologie clinique de Stanford Health Care. «L'adénovirus de type 40 et 41, les souches d'adénovirus les plus fréquemment associées à la gastro-entérite, a en fait atteint des niveaux 2 fois plus élevés que les niveaux pré-pandémiques.»

Banaei soupçonne que la flambée des infections virales a été rendue possible par la diminution de l’immunité collective de la communauté due au manque d’exposition pendant la pandémie. «Quelque chose de similaire a été décrit pour la flambée des infections par le virus respiratoire syncytial en 2022», a-t-il dit.

Pour identifier les changements dans la prévalence des agents pathogènes gastro-intestinaux, les chercheurs ont comparé les taux de détection des agents pathogènes gastro-intestinaux acquis dans la communauté avant, pendant et après le confinement lié à la COVID en Californie. À cette fin, ils ont utilisé un panel de tests par PCR appelé panel BioFire FilmArray GI, qui teste 22 des agents pathogènes les plus courants causant la diarrhée, et ont analysé environ 18 000 tests effectués entre janvier 2018 et décembre. 2022.

Selon Banaei, la motivation de la recherche était le changement du taux de positifs pour certains agents pathogènes pendant la pandémie de COVID-19. «Il est immédiatement devenu clair que le confinement pandémique et le confinement à la maison avaient créé une expérience naturelle pour étudier la dynamique de transmission des agents pathogènes responsables de la gastro-entérite.»

La recherche offre une fenêtre unique sur la biologie des agents pathogènes gastro-intestinaux, soulevant de nouvelles questions de recherche, a dit Banaei. «Pourquoi certains ont-ils disparu alors que d’autres sont restés inchangés pendant le confinement ? Pourquoi certains atteignent-ils maintenant des niveaux que nous n’avons jamais vus auparavant ?» Une meilleure compréhension de ces phénomènes pourrait permettre de trouver des moyens d'interrompre la propagation des agents pathogènes, en particulier dans les pays à revenu faible ou intermédiaire où la gastro-entérite reste une cause majeure de maladie et de décès, notamment chez les enfants. «Cela pourrait également nous aider à nous préparer à de futures pandémies imprévues.»

lundi 1 août 2022

Danemark : Des mesures préventives contre la COVID-19 ont coïncidé avec une baisse marquée d'autres maladies infectieuses

«Des mesures préventives contre la COVID-19 ont coïncidé avec une baisse marquée d'autres maladies infectieuses au Danemark, au printemps 2020», source Epidemiology & Infection. L’article est disponible en intégralité.

Résumé
Notre objectif était d'analyser de manière descriptive l'impact possible des interventions nationales de la COVID-19 sur l'incidence des maladies infectieuses courantes au Danemark au printemps et à l'été 2020. Cette étude observationnelle s'est concentrée sur les données du registre national sur les infections causées par 16 agents pathogènes bactériens et viraux différents. Nous avons inclus les nouveaux cas enregistrés entre le 1er janvier 2016 et le 31 juillet 2020. Le nombre hebdomadaire de nouveaux cas a été analysé par rapport aux interventions liées à la COVID-19 introduites en 2020.

Nous avons constaté une diminution marquée des infections associées à la transmission par gouttelettes coïncidant avec les Interventions liées à la COVID-19 au printemps et à l'été 2020. Celles-ci comprenaient une diminution des infections virales et bactériennes des voies respiratoires ainsi qu'une diminution des infections invasives causées par Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae et Neisseria meningitidis. Il y a également eu une réduction des cas associés à la transmission d'origine alimentaire pendant la période de confinement de la COVID-19. Nous n'avons trouvé aucun effet du confinement sur les infections par les streptocoques bêta-hémolytiques invasifs des groupes B, C et G, la bactériémie à Staphylococcus aureus, Neisseria gonorrhoeae ou Clostridioides difficileEn conclusion, nous avons constaté que les interventions généralisées telles que la distanciation physique, la réduction des déplacements, les mesures d'hygiène et le confinement des écoles, des restaurants et des lieux de travail coïncidaient avec une baisse marquée des infections respiratoires et, dans une moindre mesure, de certaines infections transmises par les aliments.

En conclusion, nous constatons que les interventions non pharmaceutiques généralisées liées à la COVID-19, telles la distanciation physique, la réduction des déplacements et le confinement des écoles, des restaurants et des lieux de travail, ont coïncidé avec une baisse importante des infections respiratoires, des infections invasives liées à la transmission des voies respiratoires et, dans une moindre mesure, certaines infections transmises par les aliments. Les effets, s'il y en a, de chacune de ces interventions ne peuvent cependant pas être isolés. Des changements de comportement supplémentaires au sein de la population dus à la peur d'être infecté, ainsi que des changements dans les routines des tests de diagnostic dans les établissements de santé sont également susceptibles d'avoir eu un impact sur les baisses observées. Bien que de telles interventions drastiques ne devraient pas être introduites dans une situation non pandémique, nos résultats suggèrent de manière rassurante que les interventions non pharmaceutiques fonctionnent très efficacement et peuvent avoir un impact substantiel sur le fardeau plus large des maladies infectieuses.

NB : Merci à Joe Whiworth de m'avoir signalé cette information.

Aux lecteurs du blog
La revue PROCESS Alimentaire censure pour une triste question d’argent les 10 052 articles initialement publiés gracieusement par mes soins de 2009 à 2017 sur le blog de la revue, alors que la revue a bénéficié de la manne de la publicité faite lors de la diffusion de ces articles. La revue PROCESS Alimentaire a fermé le blog et refuse tout assouplissement. Derrière cette revue, il faut que vous le sachiez, il y a une direction aux éditions du Boisbaudry, pleine de mépris, et un rédacteur en chef complice !

vendredi 5 novembre 2021

L'Europe de nouveau l’épicentre mondial de la COVID-19

Cliquez sur l'image pour l'agrandir. Source ECDC.

«L'Europe de nouveau l’épicentre mondial de la COVID-19», source article de Lisa Schnirring dans CIDRAP News.

Dans une évaluation qui donne à réfléchir de la situation de la COVID-19 en Europe et en Asie centrale le 4 novembre, le chef du bureau régional européen de l'Organisation mondiale de la santé (OMS) a averti que les pays pourraient voir un autre demi-million de décès d'ici février et que 43 pays pourraient faire face à une pression extrême sur lits d'hôpitaux.


Les hospitalisations ont doublé la semaine dernière
Hans Henri Kluge a déclaré que les modes de transmission de la région sont une grave préoccupation, les cas approchant à nouveau des niveaux records alimentés par le variant Delta (B1617.2) plus transmissible. Au cours des derniers mois, les cas de la région ont augmenté de 55%.

Tous les groupes d'âge sont désormais balayés par l’épidémie, avec une augmentation inquiétante des groupes plus âgés qui est en cours depuis fin septembre, a déclaré Kluge, ajoutant que 67% des décès surviennent chez les 65 ans et plus. Il a également ajouté que les taux d'admission à l'hôpital ont doublé au cours de la semaine dernière.

Kluge a attribué cette augmentation à deux facteurs : une couverture vaccinale insuffisante et un assouplissement des mesures liées à la COVID-19. Malgré des cas records, les décès sont la moitié de ce qu'ils étaient lors des pics précédents, ce qui montre les avantages vitaux de la vaccination et les efforts massifs des autorités sanitaires. Cependant, les pays européens varient considérablement en termes de couverture vaccinale.

«Là où la vaccination est faible - dans de nombreux pays des pays baltes, d'Europe centrale et orientale et des Balkans - les taux d'admission à l'hôpital sont élevés», a-t-il déclaré, exhortant les responsables des pays à s'attaquer aux problèmes de prestation de services et au manque de confiance chez certains groupes.

En ce qui concerne les autres mesures liées à la COVID-19, Kluge a déclaré qu'il était encouragé par le fait qu'au cours des 2 dernières semaines, 23 pays ont resserré leurs mesures. Cependant, il s'est dit préoccupé par le fait que 7 ont assoupli leurs mesures.

Il a souligné que les mesures préventives permettent aux gens de continuer leur vie. «En d'autres termes, le meilleur moyen d'éviter le confinement – qui est un dernier recours absolu – est d'appliquer de telles mesures et de maintenir la transmission de la COVID-19 à un niveau bas.»

Autres nouvelles mondiales

Le Royaume-Uni est devenu aujourd'hui le premier pays à approuver le molnupiravir, le premier médicament oral pour le traitement de la COVID-19, pour une utilisation d'urgence. Dans un communiqué, l'Agence britannique de réglementation des médicaments et des produits de santé (MHRA) a déclaré qu'elle autorisait le médicament, développé par Merck et Ridgeback Biotherapeutics, pour une utilisation chez les personnes atteintes de COVID léger à modéré et d'au moins un facteur de risque, tel que l'obésité, chez les plus de 60 ans, ayant un diabète ou d’une maladie cardiaque. La MHRA a déclaré que les responsables n'avaient pas encore finalisé les plans pour déployer le médicament, mais a déclaré qu'il serait utilisé dans le cadre d'une étude nationale dès que possible.

L'Allemagne a signalé le 4 novembre un record quotidien de cas de COVID-19, bien que le total ait probablement été affecté par un jour férié du 1er novembre, selon Reuters. L'augmentation du nombre de cas dans le pays survient alors que les ministres de la Santé des États sont sur le point de se réunir.

Le total mondial atteint le 4 novembre 248 466 545 cas, ainsi que 5 027 473 décès, selon le tableau de bord en ligne de Johns Hopkins.


Aux lecteurs du blog
Grâce à la revue PROCESS Alimentaire, vous n'avez plus accès aux 10 052 articles initialement publiés par mes soins de 2009 à 2017 sur le lien suivanthttp://amgar.blog.processalimentaire.com/. Triste histoire de sous ...

vendredi 30 avril 2021

COVID 19 en France, prendre les gens pour des idiots

Je reprends bien volontiers une partie de l'article de MaximeTandonnet paru le 30 avril 2021 sur son blog personnel, «COVID 19 prendre les gens pour des idiots».

Ceci remonte à la fin de l’année dernière, quand il était question des conditions de la levée du deuxième confinement: «Le 15 décembre, si nous sommes bien arrivés autour des 5000 contaminations par jour et environ 2500 à 3000 personnes en réanimation, nous pourrons alors franchir un nouveau cap» […] Si ces objectifs sont atteints, «alors le confinement pourra être levé et remplacé par un couvre-feu sans restrictions de déplacements.»

Aujourd’hui le pouvoir politique annonce un calendrier complet de sortie du confinement avec rétablissement de la liberté de circulation, réouverture des restaurants et des spectacles. Or, le nombre moyen des contaminations (même si la courbe décroît légèrement) reste à près de 30 000 soit 6 fois plus – 6 fois – que le seuil prévu en décembre pour sortir du confinement et le nombre des personnes en réanimation à 5 ou 6 000 soit 2 fois plus.

Où est la cohérence? Où est la logique?

Sans doute est-il infiniment difficile de piloter un pays en de telles circonstances. Mais cette difficulté n’affranchit pas le pouvoir politique de son devoir d’explication, de vérité, d’honnêteté et de transparence. L’échec français dans le contrôle de l’épidémie est patent – si l’on compare les statistiques à celles de tous nos voisins. 

On écoutera sans modération ce débat sur le nombre de doses (premières et deuxièmes) en France versus Angleterre, et l'on appréciera encore plus le discours à l'emporte pièce du variant breton, où l'on n'est plus dans la fable du lièvre et de la tortue … l'Angleterre est à un million en deuxième dose près là où nous sommes en premère dose, c'est-à-dire loin devant ... Il y a trois semaines, nous étions au même niveau de seconde dose que l'Angleterre et en trois semaines nous avons pris un retard, non seulement sur les premières doses mais aussi sur les deuxièmes doses ...

Voir aussi les données fournies par CovidTracker qui montre que l'on ne vaccine toujours beaucoup moins, mais vraiement beaucoup moins le week-end en France ... 
Cliquez sur l'image pour l'agrandir
Pendant ce temps là en Allemagne,

Complément du 1er mai 2021. On lira dans Le Figaro (réservé aux abonnés) du 27 avril 2021, une tribune, «Les épidémiologistes qui se sont trompés gagneraient à le reconnaître»

Commettre des erreurs et en prendre acte pour progresser fait partie intégrante de la science. Cette règle a été parfois perdue de vue par certains scientifiques à l’occasion de la crise sanitaire, argumente l’historienne des sciences, Liv Grjebine.

Comment préserver la confiance des citoyens dans la science quand elle se trompe ou échoue? Cette interrogation a pris une importance toute particulière en France pendant la pandémie, alors que la recherche médicale a connu maints échecs. L’abandon d’un vaccin contre le Covid-19 par l’Institut Pasteur en début d’année a mis en évidence les faiblesses financières et structurelles de la recherche française. Au même moment, la défiance envers la science a atteint des niveaux inégalés. 

Autre complément. Covid-19 : n’importe quel pays peut se retrouver dans la situation de l’Inde, alerte l’OMS, selon Le Parisien du 29 avril 2021.

mardi 13 avril 2021

Les mesures liées au COVID-19 ont probablement entraîné une baisse des maladies d'origine alimentaire en Espagne

«Les mesures liées au COVID-19 ont probablement entraîné une baisse des maladies d'origine alimentaire en Espagne», source Food Safety News.

La distanciation sociale pour lutter contre le COVID-19 a conduit à une diminution des maladies infectieuses d'origine alimentaire en Espagne, selon des chercheurs.

Les données du réseau de surveillance épidémiologique de Madrid couvrant janvier 2020 à fin juin 2020, qui chevauchent le début de la pandémie de coronavirus, montrent que par rapport au premier semestre 2019, il y a eu une baisse marquée des rapports d'infections d'origine alimentaire.

Les infections à Campylobacter sont passées de 1 308 en 2019 à 391 au cours des six premiers mois de 2020 et les infections à Salmonella de 462 en 2019 à 111 cas l'année dernière.

L'étude, publiée dans le Journal of Travel Medicine (La distanciation sociale pour lutter contre le COVID-19 a conduit à une diminution marquée des infections d'origine alimentaire et des maladies sexuellement transmissibles en Espagne) s'est également penchée sur les maladies sexuellement transmissibles (MST).

«L'un des moteurs importants de la réduction des infections gastro-intestinales et des MST au premier semestre 2020 est la distanciation sociale pendant les mois où Madrid a été touchée par la pandémie. Nous pensons également que la peur de l'infection au coronavirus peut avoir conduit les patients à ne pas demander une assistance médicale appropriée», ont dit les scientifiques.

«Il serait intéressant de voir si le diagnostic de ces maladies augmente dans la période à venir où le confinement est réduit, ou si les leçons tirées de cette pandémie aideront à réduire la transmission des infections de personne à personne.»

Les chercheurs ont déclaré que limiter la consommation alimentaire à l'extérieur des ménages en raison de mesures de confinement pourrait avoir eu un impact sur la réduction de l'incidence des infections d'origine alimentaire.

«Mais, au contraire, une étude en Catalogne, dans la région du nord-est de l'Espagne, a montré que les épidémies à Salmonella sur une période de 10 ans étaient en augmentation dans les foyers domestiques par rapport aux autres établissements.»

Les restrictions de voyage peuvent également avoir joué un rôle dans la réduction des maladies infectieuses pendant le COVID-19, ont ajouté les chercheurs.

lundi 22 mars 2021

Royaume-Uni : Un sondage explore la tendance à acheter des plats ou des repas auprès de vendeurs à domicile en ligne

«Royaume-Uni : Un sondage explore la tendance à acheter dex repas auprès de vendeurs à domicile en ligne», source Food Safety News.

Plus d'un tiers des personnes au Royaume-Uni ignoraient que les plats à emporter et les entreprises alimentaires étaient légalement tenus de se soumettre à des contrôles de sécurité sanitaire et d'hygiène, selon un sondage d'Oliver's Kitchen.

Les consommateurs au Royaume-Uni qui achètent des repas maison en ligne et auprès de chefs sur les réseaux sociaux pendant le confinement sont devenus de plus en plus populaires au cours des 12 derniers mois. Oliver’s Kitchen a commandé un sondage auprès de 5 000 résidents britanniques pour connaître leurs opinions et leurs expériences en consommant ce type de plats à emporter.

Plus des trois quarts, 79%, des personnes interrogées avaient commandé des plats ou des repas d'un takeaway ou d'un chef présent sur les réseaux sociaux non enregistré pendant le confinement.

Un dixième des sondés ont déclaré avoir souffert de maux d'estomac ou de diarrhée suite à un achat auprès d'un chef présent sur les réseaux sociaux, et plus d'un tiers étaient préoccupés par l'apparence ou l'odeur des plats et de son emballage à son arrivée.

Croissance des entreprises à domicile

(En france, on dirait des repas faits maison-aa). Oliver’s Kitchen a dit que le sondage était important en raison du grand nombre de personnes qui ont lancé des entreprises alimentaires depuis leur domicile depuis le premier confinement.

La Natasha Allergy Research Foundation avait précédemment exprimé des préoccupations en matière de sécurité des aliments concernant l'augmentation du nombre d'entreprises opérant dans des domiciles. Ainsi 44% des nouvelles entreprises alimentaires qui ont débuté depuis le premier confinement sont des entreprises alimentaires à domicile. Le Chartered Institute of Environmental Health (CIEH) a également exprimé ses inquiétudes face à cette tendance.

Lors de la création d'une entreprise alimentaire à domicile, les vendeurs doivent s'inscrire auprès de leurs autorités locales et se soumettre à une inspection en hygiène alimentaire dans leurs résidences.

La pizza était le choix de repas le plus courant sur les réseaux sociaux, plus de la moitié d'entre eux ayant déclaré en avoir commandé une, suivie de rôtis à 38%) de la nourriture indienne à 27% et des gâteaux et desserts faits maison à 21%. La cuisine de pub, italienne, des hamburgers et des plats chinois ont également fait partie du Top 10.

Tendance émergente mais qui peut être risquée

Lorsqu'on leur a demandé d'où ils achetaient ces plats à emporter faits maison, la majorité, 77%, a déclaré Facebook. Snapchat est arrivé à 5% et Gumtree à 10%.

Oliver Warburton, fondateur d’Oliver’s Kitchen, s’est dit surpris de voir combien de personnes ne savaient pas que chaque établissement alimentaire devrait avoir une note ou un score légal en hygiène alimentaire.

«Depuis l'émergence du coronavirus en mars de l'année dernière, le secteur de l'hôtellerie a été l'un des plus durement touchés, avec environ trois confinement pour chaque nouvelle ouverture», a-t-il dit.

«Ainsi, alors que les consommateurs passent de plus en plus de temps à l’intérieur, incapables de se rendre dans leurs restaurants préférés, il n’est pas étonnant que tant de consommateurs se soient tournés vers des vendeurs non enregistrés vendant des plats faits maison uniques et sur mesure.»

«C’est une tendance croissante pour le moment, mais malheureusement, cela n’est pas sans risques. Nous exhortons vraiment les consommateurs à s'assurer qu'ils savent d'où ils achètent leurs plats ou repas car une mauvaise intoxication alimentaire n'est amusante pour personne et, dans les cas graves, elle peut être très dangereuse.»

Ainsi en france, nos autorités ne semblent guère s'intéresser à ce type de restauration. Rappellons que selon Open Data d'Alim'confiance, il y a eu depuis le début de l'année 2021, 1 321 restaurants inspectés en France …

NB : Tous les liens de cet article sont de mont fait -aa.

vendredi 19 mars 2021

Le confinement de trop ?

Le gouvernement vient d'annoncer un nouveau confinement qui est vraisemblablement «Le confinement de trop?» nous dit avec justesse Maxime Tandonnet sur son blog.

Il serait question d’un reconfinement le WE ou d’avancer à 17H le couvre-feu. Quelle est la logique? Empoisonner la vie quotidienne des Français pour donner le sentiment de fermeté face au covid-19, l’illusion de l’action. Les gens souffrent, ils sont malheureux.  Le désespoir engendré par les contraintes bureaucratiques est censé recouvrir d’un voile pudique l’inefficacité, l’échec, la débâcle (masques, tests, places en hôpital, vaccination, etc). Vous souffrez de nos décisions: preuve que nous agissons pour votre bien. La politique du coup de menton est en train de dévaster la France. Il est monstrueux que les moyens de réanimation n’aient quasiment pas augmenté un an après le début de la crise. 

Parlons donc de la sitaution en France, à la façon de Raymond Devos, c'est ce qu'il y a de plus utile certainement à faire aujourd'hui...

lundi 15 mars 2021

Cas de botulisme en hausse au Colorado

«Les responsables de la santé du Colorado émettent des avertissements sur la sécurité des aliments à domicile après une hausse des cas de botulisme d'origine alimentaire», source Journal-Advocate.

Un passe-temps populaire pendant la pandémie s’avère plus dangereux qu’il n’aurait pu l’être à l’origine.

La mise en conserve domestique et la conservation des aliments ont connu une popularité croissante à l'automne 2020, comme en témoigne la rareté des fournitures de mise en conserve dans les rayons des magasins et chez les distributeurs en ligne, peut-être en raison d'une récolte abondante de ceux qui ont planté des jardins potagers au printemps au début de période de confinement.

Cependant, des aliments incorrectement mis en conserve sont à l'origine d'au moins certains des nombreux cas de botulisme d'origine alimentaire confirmés et suspectés sur lesquels le Colorado Department of Public Health and Environment (CDPHE) a enquêté dans l'État depuis septembre, selon un communiqué du CDPHE. Les tests des Centers for Disease Control and Prevention ont confirmé quatre des cas, un est toujours sous enquête et deux résultats de tests sont en attente. Tous les cas confirmés se sont produits le long du Front Range, et l'un des cas non confirmés s'est produit sur Western Slope.

La majorité des cas ne semblent pas liés car aucun aliment courant n'a été identifié. Les deux derniers cas confirmés étaient le résultat d'un aliment partagé en conserve incorrectement préparé dans le même ménage, provoquant un avertissement du CDPHE concernant la sécurité des aliments à domicile.

«Le botulisme ne se propage pas d'une personne à l'autre, il n'y a donc aucun risque pour le public. Cependant, ces cas nous rappellent à quel point il est important de conserver et de manipuler correctement les aliments à la maison», a déclaré Nicole Comstock, sous-chef de la direction générale des maladies transmissibles.

Une variété d'aliments peut être associée au botulisme d'origine alimentaire, y compris les aliments faits maison qui n'ont pas été correctement mis en conserve ou conservés. La source la plus courante de cas de botulisme liés à la mise en conserve à domicile provient d'aliments à faible teneur en acide, tels que les piments, les haricots verts, les pommes de terre, les betteraves, le maïs et les asperges.

Pour prévenir le botulisme, il est important de suivre les procédures appropriées de mise en conserve et de conservation des aliments. Le site Internet Preserve Smart de Colorado State University Extension fournit des informations sur les considérations relatives au choix des méthodes de conservation testées et sur l'importance d'ajuster les méthodes de mise en conserve en fonction de l'élévation afin de garantir que les produits alimentaires conservés à la maison sont sûrs.

lundi 1 février 2021

Évaluation dans 10 pays dont la France des effets du confinement et de la fermeture d'entreprises sur la propagation des cas de COVID-19

Voici un article de chercheurs de l'Univesité de Stanford utile à lire dans le contexte d'un confinement éventuel ou qui ne dirait pas son nom, «Évaluation des effets du séjour au domicile obligatoire (ou confinement) et de la fermeture d'entreprises sur la propagation du COVID-19», source European Journal of Clinical Investigation. L'article est disponible en intégralité.

Résumé

Contexte et objectifs

Les interventions non pharmaceutiques (INP) les plus restrictives pour contrôler la propagation du COVID-19 sont un séjour obligatoire à domicile et une fermeture d'entreprises. Compte tenu des conséquences de ces règles, il est important d'évaluer leurs effets. Nous évaluons les effets sur la croissance des cas épidémiques liés aux INP plus restrictives (INPpr), au-dessus et au-delà de ceux des Inp moins restrictives (NPmr).

Méthodes

Nous estimons d'abord la croissance des cas de COVID-19 par rapport à toute mise en œuvre des Inp dans les régions infranationales de 10 pays: Angleterre, France, Allemagne, Iran, Italie, Pays-Bas, Espagne, Corée du Sud, Suède et États-Unis.

En utilisant des modèles à effets fixes et à effets aléatoires, nous isolons les effets des INPpr en soustrayant les effets combinés des INPmr et de la dynamique épidémique de toutes les INPs. Nous utilisons la croissance des cas en Suède et en Corée du Sud, deux pays qui n'ont pas mis en œuvre de confinement obligatoire à la maison et d'entreprises, comme pays de comparaison pour les 8 autres pays (16 comparaisons au total).

Résultats

La mise en œuvre de toutes les INPs était associée à des réductions significatives de la croissance des cas dans 9 des 10 pays étudiés, y compris la Corée du Sud et la Suède qui ne mettaient en œuvre que des INPmr (l'Espagne avait un effet non significatif). Après avoir soustrait les effets de l'épidémie et des lNPpr, nous ne trouvons aucun effet bénéfique clair et significatif des INPpr sur la croissance des cas dans aucun pays. En France, par exemple, l'effet des INPpr était de +7% (IC à 95 ‐5% ;‐19%) par rapport à la Suède, et de +13% (‐12% ;‐38%) par rapport à la Corée du Sud (positif signifie en faveur de la contagion). Les intervalles de confiance à 95% excluaient des baisses de 30% dans les 16 comparaisons et de 15% dans 11 des 16 comparaisons.

Conclusions

Bien que de petits bénéfices ne puissent pas être exclus, nous ne trouvons pas d’avantages significatifs sur la croissance des cas des INPs plus restrictives. Des réductions similaires de la croissance des cas peuvent être réalisables avec des interventions moins restrictives.

vendredi 29 janvier 2021

Choses lues sur la science, le vaccin et le confinement ...

Trois sujets bien distincts et pourtant complémentaires dans ces choses lues récemment ...

J'ai bien aimé cet article d'Éric Zemmour paru dans Le Figaro du 28 janvier 2021, «Quand la science régente nos vies», une étude du livre de Charles Percy Snow, Les deux cultures.

En 1959, Percy Snow prononçait une conférence oubliée sur l’opposition des deux cultures, littéraire et scientifique. Qui résonne étrangement à notre époque de primauté du sanitaire.

Cet article a retenu mon attention pour «une phrase d'une lucidité prophétique» de Percy Snow et va bien avec le contexte actuel :

«D’une part, les hommes de science peuvent éventuellement donner de mauvais conseils ; or, ceux à qui les décisions incombent ne sont pas à même de juger si ces conseils sont bons ou mauvais. D’autre part, les hommes de science, lorsqu’une culture est divisée, sont seuls à connaître certaines potentialités. Tout cela rend le processus politique extrêmement complexe et aussi, dans un sens, extrêmement dangereux.»

Un autre article de Charles Jaigu dans le même Figaro du 28 janvier m'a intéressé car il s'agit du vaccin développé par l'Institut Pasteur, et intitulé «Le mystère du vaccin français interrompu».

Le professeur Frédéric Tangy copublie un livre très instructif sur les batailles de l’homme contre le virus. Et il revient, pour «Le Figaro», sur l’échec de son candidat vaccin conçu par l’Institut Pasteur.

Eh oui, contrairement à ce que les médias ont rapporté, ce n'est pas l'Institut Pasteur qui a arrêté le vaccin !

Frédéric Tangy, le patron du laboratoire d’innovation vaccinale de l’Institut Pasteur vient d’apprendre que le vaccin anti-Covid sur lequel il travaille avec son équipe depuis onze mois ne sera pas développé par le géant du médicament américain Merck. Ils espéraient qu’il serait mis sur le marché avant ou après l’été. La déception est immense.

On ne change pas une formule qui marche. Son équipe a donc instillé une dose du virus du Sars-Cov-2 dans le vaccin anti-rougeole. «
Les premiers résultats montrent que sur les douze candidats vaccins testés, certains induisent de très bonnes réponses immunitaires.» écrit-il dans son livre (L'Homme façonné par les virus de Frédéric Tanguy et Jean-Nicolas Tournier) dont le dernier chapitre est le récit minutieux des premières étapes de l'incubation vaccinale. Mais la suite de l'histoire n'était plus du ressort de l'Institut Pasteur. Tester les vaccins sur l'homme est beaucoup trop cher pour un institut de recherche pure.

On apprend que la licence de trois candidats vaccins est confiée à une entreprise autrichienne avec laquelle l'Institut Pasteur avait développé un partenariat. A aucun moment, Sanofi s'est manifesté pour développer ce vaccin anti-Covid.

Mais en avril 2020, ce laboratoire autrichien est racheté par le géant américain Merck.

Pendant plusieurs mois, Merck communique de manière positive sur le déroulement des premières séries d'essais liés à la phase 2. Et puis, au cours du week-end du 24-25 janvier, les services de Merck ont prévenu le patron de Pasteur qu'ils renonçaient au vaccin faute de résultats satisfaisants. Il ne s'agit donc pas d'une décision de l'Institut Pasteur, même si son communiqué en donne l'impression.

Comme la géopolitique n'est jamais très loin, certains suspectent déjà une opération de sabotage de la part d'une entreprise américaine. Pourtant cette dernière a aussi mis fin aux essais d'un vaccin développé aux Etats-Unis. Merck a-t-il décidé de renoncer à un vaccin parce qu'il le juge peu rentable, et trop en retard sur les vaccins à ARN messager ? La question reste en suspens.

Dernière chose lue, dans cet article de Luc Ferry, sur Le Figaro du 28 janvier, «La liberté plus que la vie?», qui s'inscrit dans l'optique d'un futur confinement,

Déplorer les erreurs commises par nos gouvernants ne doit pas nous empêcher de reconnaître qu’ils ont eu globalement raison de mettre, pour la première fois dans l’histoire, la vie au-dessus de l’argent.

Bien entendu, chacun reste libre de critiquer les actions du gouvernement, cela me paraît normal, un peu à la manière des 66 millions de sélectionneurs de l'équipe de France de foot-ball la veille d'un match, voir de 66 millions d'épidémiologistes ...

vendredi 22 janvier 2021

COVID-19: Le risque associé à l'introduction et à la propagation préoccupante de variants en Europe a été porté à élevé/très élevé, selon l'ECDC

«Des responsables mettent en garde contre la menace pour l'Europe du variant COVID-19», source article de Lisa Schnirring de CIDRAP News.

Le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC), Risk related to the spread of new SARS-CoV-2 variants of concern in the EU/EEA – first update, a le 21 janvier élevé le risque de propagation des nouvelles variantes du SRAS-CoV-2 à très élevé, car l'activité du COVID-19 au Royaume-Uni, où la variante B117 est dominante, maintient une emprise serrée malgré le troisième confinement du pays.

Pendant ce temps, des pays d'autres parties du monde, dont la Chine, ont annoncé de nouvelles mesures pour contrer la propagation tenace du virus.

L'ECDC augmente la menace du variant à 'très élevée'

Dans sa première mise à jour de son évaluation des risques des variants du SRAS-CoV-2 le 21 janvier, l'ECDC a dit que les variants les plus transmissibles ont conduit à une détérioration des situations épidémiologiques. Sur la base de nouvelles informations, le risque d'introduction du B117 et de sa propagation dans la communauté est très élevé et son impact sur les systèmes de santé est considéré comme élevé.

Pour le variant 501Y.V2 retrouvé pour la première fois en Afrique du Sud, des cas ont été confirmés dans 10 pays européens, avec un cluster en cours d'investigation en France et au Royaume-Uni et en Israël signalant également des cas ou des groupes d'infections 501Y.V2 non liées aux voyages.

Bien que le Royaume-Uni ait récemment vu des cas reculer par rapport à des sommets quotidiens records, salués comme un signe prometteur, une analyse mise à jour par l'Imperial College de Londres publiée le 20 janvier a dit que la prévalence du SRAS-CoV-2 est toujours très élevée, sans preuve de déclin. L'analyse du groupe couvre les 10 premiers jours du troisième confinement du pays.

Ils ont dit avoir vu une légère baisse initiale, suivie d'un plateau ou d'une augmentation possible des cas. Ils notent que les données de mobilité de Facebook montrent une baisse marquée d'ici la fin décembre, suivie d'une hausse qui a suivi le début de l'année de travail début janvier.

L'augmentation de la prévalence était associée aux grands ménages, aux quartiers les plus pauvres et à l'appartenance ethnique noire et asiatique. Les taux de positivité étaient plus élevés chez les personnels de la santé et des centre de santé, ainsi que chez d'autres personnels clés.

«Tant que la prévalence dans la communauté ne sera pas considérablement réduite, les services de santé resteront sous une pression extrême et le nombre cumulé de vies perdues pendant cette pandémie continuera d'augmenter rapidement», ont-ils écrit.

Dans un autre développement au Royaume-Uni, des chercheurs de l'Université d'Oxford ont dit le 20 janvier que les tests à flux latéral, également appelés aussi tests immunochromatographiques à flux latéral ou tests rapides identifieraient probablement les cas les plus infectieux chez des personnes ayant une charge virale plus élevée, malgré les préoccupations concernant la précision des tests, selon Reuters. La nouvelle survient alors que les responsables de la santé britanniques considèrent les tests rapides de masse comme un moyen de sortir du confinement actuel.

La Grande-Bretagne a été le premier pays d'Europe à subir une poussée qui était en partie liée au variant B117, qui alimente maintenant des épidémies dans d'autres parties du continent. Le Portugal fait partie des pays qui connaissent un tel pic, et la ministre de la Santé du pays, Marta Temido a déclaré le 20 janvier lors d'une émission de radio qu'environ 20% des cas consistaient au variant le plus transmissible, selon Reuters. Elle a prédit que ce nombre pourrait atteindre 60% dès la semaine prochaine.

Un représentant de l'un des syndicats de médecins du Portugal a dit le 21 janvier que les hôpitaux sont débordés, sans personnel suffisant pour ajouter plus de lits dans les unités de soins intensifs (USI), selon un autre article de Reuters. Le gouvernement a annoncé la fermeture de toutes les écoles et universités pendant 2 semaines afin de freiner la propagation du virus.

Pendant ce temps, l'Espagne voisine aujourd'hui - pour la deuxième journée consécutive - a signalé un record en une seule journée de 44 357 nouveaux cas, selon l'agence Anadolu, qui a dit que de nombreux hôpitaux du pays étaient débordés et que 157 variants de cas avaient été identifiées. Les responsables de la santé espagnols ont averti que le B117 pourrait devenir la souche dominante d'ici la mi-mars.

dimanche 22 novembre 2020

« Mr le Président, je ne vous autorise plus à vous occuper de moi » par Jean-Paul Pelras

A lire sans modération ...

 L'écrivain @JeanPelras "Mr le Président, je ne vous autorise plus à vous occuper de moi." #confinementSaison2 #Macron pic.twitter.com/9WmL8Y8JpL

Radio France offre de la pub aux lobbies verts. La radio publique veut offrir de la pub aux ONG environnementales, qui désinforment pourtant massivement sur l'agriculture. De quel droit ?
est écrivain, ancien syndicaliste agricole et journaliste. Rédacteur en chef du journal « L'Agri » des Pyrénées-Orientales et de l'Aude, il est l'auteur d'une vingtaine d'essais, de nouvelles et de romans.

mercredi 18 novembre 2020

Ruralité: qui, du virus ou de l’oubli, sera le plus meurtrier?, par Jean-Paul Pelras

Excellent article dont je vous livre quelques extraits, «Ruralité: qui, du virus ou de l’oubli, sera le plus meurtrier?», article de Jean-Paul Pelras, paru dans le journal L'Opinion le 17 novembre 2020.

Vu de l’ultraruralité, le confinement et les restrictions sanitaires prennent un tour surréaliste. Le reste du temps, personne ne se demande si les habitants risquent de mourir faute de médecin ou s’ils sont coupés du monde faute de téléphone, raconte l’écrivain

Plus aucun bruit ne monte de la vallée, le brouillard plonge le reste du monde dans l’étoupe des lointains. Le confinement, ici, dans les hauts cantons des Pyrénées-Orientales, ils l’évoquent en haussant les omoplates comme s’il n’était que le prolongement d’une fatalité. Cette fatalité qui les tient à bonne distance du progrès depuis des décennies.

Au début ils descendaient à la sous-préfecture, ils écrivaient aux députés. Et puis, ils se sont habitués à se rendre sous le clocher pour capter une barre sur le téléphone portable, les jours où « ça voulait bien passer ». Télétravail obligatoire, ils ont dit à ParisLa belle affaire quand, pour envoyer un mail, tu y passes tout un après-midi.

Fermetures. A l’entrée du village, le bar est fermé, il ne rouvrira pas. A presque 60 ans, le propriétaire en a assez de tout ce cinéma. C’était déjà compliqué à cause des normes, à cause des taxes, à cause de la déprise ambiante, à cause du printemps dernier où ils ont été obligés de fermer, à cause du fils qui, finalement, ne reprendra pas. Idem pour le petit restaurant qui dépannait les habitants du village et complétait son revenu avec les clients de passage. Les tables en formica sont empilées sous le préau, le rideau est baissé, les parasols ne reverront pas l’été.

Il reste bien la coiffeuse et l’épicier. Mais pour eux aussi, c’est devenu trop compliqué. Le premier va essayer de tenir encore un peu, la seconde a décidé d’arrêter. A quoi bon s’obstiner derrière une devanture fermée la moitié de l’année ? Et puis il y a l’éleveur qui n’arrive plus à vendre ses bêtes, le mécano qui travaille de moins en moins car personne n’ose circuler, trois ados qui s’ennuient entre deux parties de jeux vidéo et le tour de vélo qui va du lavoir au petit ruisseau. Jeunesse privée de flirt, de fêtes, de voyages, de découvertes et de tout ce qui fait l’aubaine furtive de son âge. Arrivent ensuite les conversations matinées d’incertitudes car peut-être là-haut cet hiver, la saison sera de nouveau foutue si les stations n’ouvrent pas. Comment fixer les populations quand le travail s’en va ?

Et l’ancien qui ne peut plus aller voir son épouse dans cette maison de repos à quelques kilomètres de là. Bien sûr, enfant, il a connu la guerre. Mais, cette fois, c’est différent, les autorités lui ont dit que la zone libre s’arrêtait au cimetière. De temps en temps, il écoute la télévision même s’il n’a plus confiance en ceux qui parlent, le soir, aux informations. D’une annonce à l’autre, la réalité migre vers la fiction. Et les scénarios invraisemblables deviennent de plus en plus envisageables.

A lire la suite sur le journal L'Opinion ...