Quatorze pour cent des isolats d’Aspergillus fumigatus cultivés à partir de sols de jardin étaient résistants à un médicament antifongique triazole agricole, le tébuconazole. La résistance au tébuconazole confère une résistance aux triazoles médicaux utilisés pour traiter l'aspergillose, une infection pulmonaire qui peut être grave et qui résulte de l'inhalation de spores d'A. fumigatus. La recherche est publiée dans Applied and Environmental Microbiology, une revue de l'American Society for Microbiology.
Dans l'étude, qui était la thèse de doctorat de l'auteur principal Jennifer Shelton, elle et ses collaborateurs ont découvert que le compost et les sols enrichis en compost contiennent de fortes concentrations de spores d'A. fumigatus.
«La recherche suggère que la manipulation du compost présente un risque pour la santé publique lorsque les individus sont exposés à un grand nombre de spores en aérosols et soulève la question de savoir si les sacs de compost doivent porter des recommandations sanitaires supplémentaires, si le compost doit être stérilisé avant l'expédition et s'il convient de conseiller aux individus de porter des masques lors de la manipulation du compost», a dit Shelton.
Un nouvel aspect de cette étude est que les échantillons de sol - 509 d'entre eux - ont été prélevés dans des jardins par 249 scientifiques citoyens que Shelton a enrôlés dans cet effort via les réseaux sociaux et par le biais de l'Aspergillosis Trust, une organisation caritative sensibilisant au problème. Les échantillons ont tous été prélevés le même jour, le 21 juin 2019. À partir de ceux-ci, les chercheurs ont cultivé 5 174 isolats d'A. fumigatus. Bon nombre de ces isolats d'A. fumigatus contenaient des polymorphismes dans le gène cyp51A, qui est fréquemment associé à la résistance au triazole. Les échantillons de sol contenant du compost étaient significativement plus susceptibles de développer des souches d'A. fumigatus résistantes au tébuconazole que ceux qui n'en avaient pas, et les échantillons de compost produisaient un nombre significativement plus élevé d'A. fumigatus que les autres échantillons de sol.
L'étude a été motivée par un nombre croissant de cas causés par des spores d'A. fumigatus résistantes au triazole au Royaume-Uni, a déclaré Shelton, qui a mené la recherche à l'Imperial College de Londres et au UK Centre for Ecology and Hydrology. «On estime que plus de 185 000 personnes au Royaume-Uni vivent avec l'aspergillose, avec des conditions allant de l'hypersensibilisation sévère, «asthme fongique» et la colonisation chronique ou l'invasion des poumons qui peuvent se propager à d'autres organes, y compris le cerveau», a dit Shelton. «Les formes chroniques d'aspergillose limitent la vie et sont difficiles à traiter, et les infections invasives ont des taux de mortalité compris entre 40 et 70%, et plus élevés si elles sont infectées par A. fumigatus résistant au triazole.»
Les personnes inhalent normalement des spores de l'environnement, y compris celles d'A. fumigatus. Les personnes dont l'immunité est faible, en raison de médicaments immunosuppresseurs, d'affections telles que le diabète ou la polyarthrite rhumatoïde, ou de lésions pulmonaires dues à une infection par la tuberculose, le COVID-19, une grippe grave ou le tabagisme, sont particulièrement vulnérables, mais même celles sans conditions prédisposantes peuvent développer une aspergillose s'ils inhalent un nombre suffisant de spores.
«Nos recherches suggèrent que la manipulation de compost et de sols enrichis en compost expose les individus à un grand nombre de spores et que des changements de comportement de leur part, et les mesures prises par l'industrie du compostage pourraient réduire ces expositions», a dit Shelton.
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