Irlande : Une étude révèle une augmentation des cas de SHU lié aux STEC

«Une étude révèle une augmentation des cas de SHU lié à E. coli en Irlande», source article des Joe Whitworth paru le 26 octobre 2023 dans Food Safety News.

Selon des chercheurs, le taux de complications graves après une infection à E. coli est resté globalement stable pendant plusieurs années, mais a augmenté en Irlande.

Le syndrome hémolytique et urémique (SHU) est une complication rare mais grave associée aux infections à E. coli qui provoque une insuffisance rénale.

Les chiffres précédents ne montraient aucun changement notable en Angleterre, au Pays de Galles ou en Irlande du Nord. En Irlande, cependant, on estime que l’incidence a triplé. Les raisons de cette situation sont inconnues mais coïncident avec une augmentation des infections à E. coli producteurs de shigatoxines (STEC).

Le SHU reste un problème de santé publique important quatre décennies après son apparition, sans aucune réduction de son incidence au fil du temps. Cependant, le nombre de décès a diminué, disent les scientifiques.

L'étude, publiée dans Epidemiology and Infection, fournit des estimations de l'incidence du SHU pédiatrique en Angleterre, au Pays de Galles, en Irlande du Nord et en République d'Irlande.

Détails des patients et E. coli

Entre octobre 2011 et 2014, 288 patients atteints de SHU ont été inclus dans l'étude, dont 256 ont été diagnostiqués comme étant un SHU typique. L'incidence était la plus élevée en Irlande.

La plupart des cas typiques de SHU concernaient des femmes âgées de 1 à 4 ans. En Irlande, l'incidence était la plus élevée chez les nourrissons de moins d'un an.

Les symptômes cliniques comprenaient de la diarrhée et une diarrhée sanglante, des douleurs abdominales et de la fièvre. Le délai médian entre l’apparition des symptômes diarrhéiques et l’admission à l’hôpital ou le diagnostic du SHU était de six jours.

64 cas ont été admis en unité de soins intensifs pédiatriques.

Les cliniciens ont signalé que 177 cas s’étaient apparemment complètement rétablis après avoir rempli un questionnaire. Les lésions rénales, l'hypertension et les troubles neurologiques étaient les complications les plus courantes à la sortie. Même si un seul décès a été enregistré, d’autres problèmes étaient relativement fréquents, avec 69% de cas de guérison complète.

Là où des STEC ont été isolés, 141 souches étaient E. coli O157 et 11 étaient E. coli O26.

Pour E. coli O157, 137 isolats ont été lysotypés ; le type le plus fréquent était PT21/28. Lorsque le type de shigatoxine était disponible, la principale était uniquement stx2, avec seulement huit souches stx1+2.

Sensibilité du système de surveillance

La British Pediatric Surveillance Unit (BPSU) s'occupe des maladies infantiles rares au Royaume-Uni et en Irlande. Deux études antérieures sur le SHU pédiatrique au Royaume-Uni et en Irlande ont été menées de 1985 à 1988 et de 1997 à 2001.

De 2011 à 2014, l’Angleterre a enregistré 228 cas, le Pays de Galles 10 et l’Irlande du Nord neuf. De 1997 à 2001, l’Angleterre a enregistré 287 cas, le Pays de Galles 17 et l’Irlande du Nord 16. Les cas ont augmenté en République d’Irlande de 30 à 41.

Une lacune dans la confirmation des STEC à culture positive via des échantillons fécaux restreint la capacité de l’UKHSA à détecter les épidémies, limite les possibilités de mise en œuvre de mesures de protection de la santé et réduit la capacité à déterminer le véritable fardeau des STEC et du SHU par différents sérogroupes, ont dit les scientifiques.

Une comparaison des cas de la BPSU avec les données du système de surveillance national a indiqué que 166 cas supplémentaires de SHU ont été capturés dans le cadre de l'étude. Beaucoup étaient connus comme patients STEC mais n’étaient pas confirmés comme cas de SHU. Certains cas de SHU ont été signalés dans les systèmes de surveillance mais pas dans le cadre de l'étude du BPSU.

«Notre étude a mis en évidence les limites du système de surveillance actuel des STEC pour surveiller le fardeau clinique des STEC et capturer les cas de SHU. En raison de la morbidité élevée du SHU chez les enfants, la surveillance et le contrôle continus des STEC restent une priorité élevée de santé publique», ont dit les chercheurs.

Ils ont ajouté que des études supplémentaires sont nécessaires pour évaluer si certains antibiotiques peuvent réduire la gravité et la durée des symptômes chez les patients STEC.

Le Royaume-Uni fait face à des épidémies à E. coli et à Salmonella

«Le Royaume-Uni fait face à des épidémies à E. coli et à Salmonella», source article de Joe Whitworth paru le 27 septembre 2023 dans Food Safety News.

Le Royaume-Uni est confronté à une grave épidémie à E. coli et de plusieurs souches de Salmonella Enteritidis, selon la Food Standards Agency (FSA).

Un cas supplémentaire s'est ajouté à l'épidémie actuelle à E. coli producteurs de shigatoxines (STEC) O183, portant le total à 25 personnes malades depuis mai.

Une personne est décédée ; alors que la plupart des patients vivent en Angleterre, d’autres sont malades en Irlande du Nord, en Écosse et au Pays de Galles.

La FSA et l'UK Health Security Agency (UKHSA) tentent d'en trouver la source avec l'aide d'autres agences de santé publique. Plusieurs chaînes d’approvisionnement de produits ont été étudiées, mais aucun véhicule d’infection n’a encore été identifié.

Les symptômes signalés sont graves, avec six personnes hospitalisées. Les patients sont âgés de 0 à 74 ans, la plupart des cas étant âgés de 0 à 9 ans. Une personne a développé un syndrome hémolytique et urémique (SHU). Le SHU est une complication grave associée aux infections à E. coli qui provoque une insuffisance rénale.

E. coli O183 est un sérotype extrêmement rare, avec seulement 15 cas au Royaume-Uni depuis 2016.

La FSA enquête également sur des épidémies de souches distinctes de Salmonella Enteritidis liées aux œufs et aux produits de volaille polonais. 

Une épidémie est à l'origine de 47 cas confirmés, dont 25 étaient liés à un restaurant et 18 autres personnes malades avaient probablement été exposées à un restaurant.

Les autorités polonaises ont découvert Salmonella Enteriditis sur un site qui envoyait des œufs au Royaume-Uni. Des œufs provenant de cette source ont également été associés à un deuxième restaurant britannique lié à l'épidémie.

Un autre sérotype a été associé à 87 cas de maladie, dont 35 signalés en juin et juillet. La plupart des cas enregistrés cette année sont liés à des boulangeries de Cornouailles, et les enquêtes épidémiologiques suggèrent que les œufs utilisés dans les tartes à la crème sont la cause probable de l'épidémie. Des enquêtes sur la chaîne d'approvisionnement alimentaire ont révélé que les œufs provenaient probablement de Pologne, mais le travail avec le fabricant et le fournisseur est en cours.

Implication dans un incident de l'AHPA

Par ailleurs, l'Animal and Plant Health Agency (APHA) a révélé qu'aucune enquête sur les foyers de STEC n'avait été menée au deuxième trimestre 2023.

L'APHA a analysé sept foyers de cas à Cryptosporidium parvum d'avril à juin, dont cinq en Angleterre et deux au Pays de Galles.

L’un d’entre eux était un incident de cryptosporidiose attribué à un distributeur automatique de lait. Trois étaient liés à des fermes ouvertes, deux à des fermes commerciales et un à des locaux commerciaux avec des animaux sur place.

Pour l'enquête sur les distributeurs automatiques à la ferme, 32 échantillons de bovins ont été prélevés. L'ADN de Cryptosporidium parvum a été détecté dans quatre échantillons de veaux et deux échantillons de vaches. Les mêmes profils que ceux de la souche épidémique humaine ont été confirmés dans deux échantillons de veaux.

Lors d'un autre foyer avec échantillonnage dans une ferme ouverte, 30 échantillons de matières fécales ont été prélevés. Six échantillons d'agneaux étaient positifs par PCR, dont trois ont été confirmés comme étant Cryptosporidium parvum du même sous-type que les cas humains.

L'APHA a également aidé lors d'un incident impliquant un boucher tombé malade et hospitalisé pour une méningite bactérienne. L'infection à Streptococcus suis a été confirmée.

Les conseils visant à réduire le risque d’infection comprenaient un examen des pratiques d’hygiène et de travail. Les mesures préventives comprennent le port de gants lors de la transformation ou de l'abattage de la viande de porc et le lavage des mains après avoir manipulé de la viande de porc crue. Une bonne cuisson du porc est également essentielle. La FSA conseille que les produits de porc soient bien cuits car cela éliminera Streptococcus suis dans la viande.

France : Facteurs de risque des STEC associés au SHU

«Des scientifiques étudient les facteurs de risque des STEC associés au SHU en France», source article de Joe Whitworth paru le 23 septembre 2023 dans Food Safety News.

Des chercheurs ont constaté une tendance à la hausse significative des cas sporadiques de SHU à E. coli O26 et E. coli O80 au cours d'une décennie en France, mais une diminution notable pour E. coli O157.

Le syndrome hémolytique et urémique (SHU) associé à E. coli constitue un risque important de santé publique en France, selon les scientifiques. Le SHU est une complication grave associée aux infections à E. coli qui provoque une insuffisance rénale et peut entraîner des lésions cérébrales et d'autres complications à vie.

Les chercheurs ont mené une étude sur 1 255 cas pédiatriques sporadiques signalés entre 2012 et 2021, et les résultats ont été publiés dans la revue du CDC, Emerging Infectious Diseases, «Sporadic Shiga Toxin–Producing Escherichia coli-Associated Pediatric Hemolytic Uremic Syndrome, France, 2012–2021».

Les notifications annuelles de cas variaient entre 109 en 2014-2015 et 163 en 2017. La plupart concernaient des enfants de moins de trois ans. Les sérogroupes O26, O80 et O157 de E. coli représentaient 78% des cas, et 13 groupes importants ont été identifiés.

Cas sporadiques enregistrés

En France, la surveillance des E. coli producteurs de shigatoxines (STEC) repose sur une surveillance clinique et microbiologique volontaire du SHU chez les enfants de moins de 15 ans. Les taux d'incidence annuels du SHU à STEC pédiatrique sont relativement élevés. Les cas suspects de SHU à STEC chez les moins de 15 ans sont signalés à Santé Publique France.

La surveillance microbiologique des STEC est volontaire et coordonnée par le Centre National de Référence (CNR) des E. coli, Salmonella et Shigella de l'Institut Pasteur et son laboratoire associé.

Déterminer la source de contamination des cas sporadiques est difficile pour des raisons telles que les données épidémiologiques limitées, les multiples sources potentielles de contamination et les lacunes dans les connaissances sur les interactions source-vecteur du pathogène, ont dit les scientifiques.

Un prélèvement a été envoyé au CNR pour 1 132 cas, et 717 ont eu un sérogroupe STEC identifié. Les trois principaux sérogroupes représentaient 559 des 717 cas : O26 avec 228 cas, O80 avec 149 et O157 avec 182 cas.

La proportion de patients de sexe féminin et masculin était comparable sur la période d’étude. Près de 800 des 1 255 cas concernaient des patients âgés de moins de trois ans. Les taux d'incidence variaient selon le groupe d'âge, les plus élevés chez les enfants de 1 à 2 ans. L'incidence la plus élevée s'est produite de juillet à octobre.

Pour les STEC O26 et STEC O80, les régions de la moitié est de la France présentaient des taux d'incidence légèrement plus élevés. Pour les STEC O157, les taux les plus élevés se situent essentiellement dans le nord-ouest de la France.

Clusters trouvés

L'analyse par sérogroupe a identifié deux clusters significatifs : STEC O26 en 2019 dans le Sud-Est de la France et STEC O80 en 2017 dans le Nord-Est de la France. Les données WGS pour les isolats du cluster O26 2019 ont identifié trois clusters liés au WGS de deux isolats chacun. Cependant, les enquêtes épidémiologiques n’ont pas permis d’identifier une source commune d’infection.

Le Sud-Est de la France est la deuxième région la plus densément peuplée du pays et comprend une grande ville, Lyon, mais aussi des zones rurales et une forte densité de bétail.

L'analyse annuelle a identifié 13 clusters importants. Il y avait au moins un cluster chaque année, sauf en 2014 et 2017, avec un maximum de trois en 2018. La taille moyenne des clusters était de 10 cas mais variait de deux à 20 cas. Des clusters se sont produites de juin à novembre et la plupart correspondaient au pic saisonnier observé dans les notifications des SHU à STEC de juillet à octobre.

Les auteurs notent dans leur étude,

Notre étude s'ajoute à un corpus de recherches existant démontrant l'effet de l'application de statistiques d'analyse pour décrire la dynamique spatio-temporelle des maladies sporadiques, même pour des événements plus rares. Nos résultats fournissent des informations importantes sur le contexte épidémiologique et ont des implications pour la détection et l'enquête sur les épidémies ainsi que pour les perspectives de recherche visant à améliorer la connaissance des facteurs de risque associés aux disparités géographiques de la maladie.

L’identification de plusieurs zones géographiques présentant des clusters récurrents de SHU à STEC sporadiques confirme statistiquement, et à une échelle géographique beaucoup plus fine, les observations antérieures de disparités d’incidence régionale du SHU à STEC pédiatrique en France. La prise en compte des différences géographiques est pertinente pour l'analyse des données de surveillance à des fins de détection des épidémies, en particulier pour évaluer les signaux épidémiologiques et la décision d'ouvrir des enquêtes. Les différents risques relatifs géographiques identifiés dans cette étude seront intégrés dans SaTScan dans le cadre des recherches en cours sur son application à la détection des épidémies en France. Par rapport au WGS, la détection statistique de clusters spatio-temporels offre une approche réactive qui peut être appliquée aux données de notification de cas avant que les données WGS ne soient disponibles (par exemple, des délais de ≈3 semaines en France) ou en l'absence d'isolement de souche.

Notre étude fournit également les données et justifications nécessaires pour des recherches plus approfondies sur les facteurs géographiques associés à un risque de base plus élevé de SHU à STEC en France. Des études écologiques menées dans plusieurs pays à l'aide des données de surveillance des STEC ont identifié des associations significatives avec la densité des ruminants, la classification rurale et les sources d'eau, en particulier l'utilisation de puits privés. Les résultats d'une étude réalisée en France par Haus-Cheymol et al. ont suggéré une association entre l'incidence pédiatrique du SHU à STEC et la densité des bovins laitiers et des veaux. La répartition géographique décrite dans cette étude pour une densité plus élevée de bovins laitiers chevauche en partie les zones géographiques à plus haut risque identifiées dans notre étude dans le nord-ouest et l'est de la France. L’étude mérite cependant d’être mise à jour car elle date du début des années 2000, se limite à un niveau géographique plus macroscopique et couvre une période antérieure à plusieurs évolutions observées dans l’épidémiologie des STEC en France.

Notre analyse a également identifié des groupes spatio-temporels significatifs et récurrents constitués de cas appartenant à différents sérogroupes. Cette découverte suggère des conditions favorables à la transmission des STEC qui pourraient contribuer à un risque plus élevé de SHU à STEC, notamment des différences géographiques susceptibles d'influencer le risque de STEC en raison de différents modes d'exposition alimentaire et environnementale par diverses voies de transmission. Nous prévoyons d'utiliser nos résultats dans d'autres études visant à explorer l'association avec des paramètres environnementaux potentiellement sous-jacents au risque de SHU à STEC en France. Mener une telle étude à une échelle géographique plus fine viserait à fournir de meilleures informations aux professionnels de la santé publique pour cibler et adapter les interventions de santé publique, y compris la communication avec la population générale, visant la prévention des STEC.

Le rappel s'est élargi en Norvège alors que l'épidémie à E. coli se poursuit

Le blog vous avait rapporté le 13 septembre que Des hamburgers soupçonnés d'être à l'origine d'une épidémie à E. coli en Norvège.

«Le rappel s'est élargi en Norvège alors que l'épidémie à E. coli se poursuit», source article de Joe Whitworth paru le 20 septembre 2023 dans Food Safety News.

Un rappel de produits carnés dans le cadre d'une épidémie à E. coli en Norvège a été élargi.

Nordfjord Kjøtt a émis un rappel élargi la semaine dernière. Il couvre désormais certaines dates de conservation de neuf produits, dont Hamburger Classic, Prima Hamburger, Bacon Burger, viande hachée et Big Beef burger.

Cette décision a été motivée par le fait que les produits sont fabriqués avec la même matière première. Les articles ont été vendus dans les magasins Rema 1000. Ils ont été retirés de la vente, mais les consommateurs peuvent toujours les avoir chez eux dans les congélateurs.

Les autorités norvégiennes ont déclaré qu’il s’agissait de l’une des épidémies à E. coli les plus importantes du pays depuis 2006.

L'Institut norvégien de santé publique (FHI) a signalé que E. coli O26:H11 avait été détecté chez 17 personnes.

Le FHI a dit que des personnes sont tombées malades en juillet et août. Les patients sont âgés de moins de 5 à 55 ans.

Cinq personnes ont développé une maladie grave, un syndrome hémolytique et urémique (SHU). Le SHU est une complication grave associée aux infections à E. coli qui provoque une insuffisance rénale et peut entraîner des lésions cérébrales et d'autres complications à vie.

Investigation en cours

Les soupçons selon lesquels ces produits pourraient être à l'origine de l'infection ont été renforcés après de nouveaux entretiens avec des patients et des travaux de traçabilité dans la chaîne d'approvisionnement alimentaire.

L'Autorité norvégienne de sécurité des aliments (Mattilsynet) a reçu des patients ce qui restait de deux paquets de hamburgers. Une analyse préliminaire de l'Institut vétérinaire a contribué à renforcer les soupçons à l'égard des hamburgers.

Les responsables de la santé ont souligné que la congélation ne tue pas E. coli et que les produits de viande hachée bovine doivent être bien cuits. Cela signifie une température à cœur de 70°C. L'USDA affirme que la viande hachée crue doit être cuite à une température interne de 71°C, mesurée avec un thermomètre alimentaire.

Il a également été conseillé aux personnes de se laver les mains et de laver les ustensiles après avoir touché des hamburgers surgelés ou réfrigérés.

Les groupes vulnérables tels que les jeunes enfants, les femmes enceintes et les personnes dont le système immunitaire est affaibli ne devraient pas manger de hamburgers légèrement ou moyennement cuits.

Lors du hachage de la viande, les bactéries présentes à la surface peuvent se propager dans tout le produit. Si la viande hachée n'est pas suffisamment cuite, les bactéries présentes au milieu peuvent survivre.

Des hamburgers soupçonnés d'être à l'origine d'une épidémie à E. coli en Norvège

«Des hamburgers soupçonnés d'être à l'origine d'une épidémie à E. coli en Norvège», source article de Food Safety News du 12 septembre 2023.

Les autorités norvégiennes ont identifié la source présumée d'une épidémie à E. coli qui a touché 15 personnes.

L'Institut norvégien de santé publique (FHI) a dit que le même type de E. coli O26:H11 avait été détecté chez toutes les personnes infectées.

Deux types d’hamburger qui sont probablement à l'origine de l'épidémie en cours ont été rappelés.

En août, il a été signalé que six personnes à travers le pays avaient été malades.

Cinq cas de SHU

Dans une mise à jour de la semaine dernière, le FHI a dit que des personnes étaient tombées malades en juillet et août. Les patients sont âgés de moins de 5 à 55 ans. Huit vivent au Trøndelag, quatre à Viken, deux à Vestfold og Telemark et un dans le Nordland.

Cinq personnes ont développé une maladie grave, un syndrome hémolytique et urémique (SHU). Le SHU est une complication grave associée aux infections à E. coli (STEC) qui provoque une insuffisance rénale.

Les responsables de la santé ont interrogé des personnes sur ce qu'elles mangeaient avant de tomber malade et ont examiné les détails de leurs achats ainsi que les reçus de leurs achats alimentaires.

Sur la base de ces informations, l'Autorité norvégienne de sécurité des aliments (Mattilsynet) a lancé un travail de traçabilité qui suggère que les hamburgers pourraient être la source de l'infection.

Rappel de produits

Nordfjord Kjøtt a retiré de la vente le Hamburger Classic surgelé, 800 g, avec des DDM allant du 24 et 25 mars 2024, et le Big Beef Burger Thick and Juicy, 360 g, avec une DDM au 16 juillet 2023.

Les produits ont été vendus dans les magasins Rema 1000. Ils ont été retirés du marché, mais les autorités craignent que les consommateurs puissent toujours les avoir chez eux, dans leurs congélateurs.

L'enquête sur l'épidémie se poursuit dans le but d'établir avec certitude que les produits sont à l'origine d'infections. Il ne peut être exclu que d’autres articles soient rappelés.

Les groupes vulnérables tels que les jeunes enfants, les femmes enceintes et les autres personnes dont le système immunitaire est affaibli ne devraient pas manger de hamburgers légèrement ou moyennement cuits.

Lors du hachage de la viande, les bactéries présentes à la surface peuvent se propager dans tout le produit. Si la viande hachée n’est pas suffisamment cuite à coeur , les bactéries présentes au milieu pourront survivre. Une bonne hygiène en cuisine et un traitement thermique correct éviteront que les consommateurs ne tombent malades à cause des produits rappelés.

La source d’une autre éclosion à E. coli O157 signalée en juin demeure inconnue. Cette épidémie a touché six personnes, mais aucune n’a développé de maladie grave. Deux personnes sont tombées malades en octobre et novembre 2022, tandis que les quatre autres sont tombées malades en février, mars et mai de cette année. Ils sont âgés de 14 à 49 ans et cinq sont des hommes.

La Norvège touchée par une deuxième éclosion plus grave à E. coli

«La Norvège touchée par une deuxième éclosion plus grave à E. coli», source article paru le 8 août 2023 dans Food Safety News.

Les autorités norvégiennes tentent de trouver la source d'une autre éclosion à E. coli qui a touché six de personnes.

L'Institut norvégien de santé publique (FHI) a déclaré que six personnes, vivant dans différentes régions du pays, étaient malades.

Des analyses préliminaires montrent que E. coli O26:H11 a été détecté chez toutes les personnes infectées. Le FHI procède actuellement au séquençage du génome entier pour confirmation.

Une éclosion à E. coli O157 a été signalée en juin. Cette épidémie a également touché six personnes, mais personne n'a développé des cas de maladie grave. Deux personnes sont tombées malades en octobre et novembre 2022, tandis que les quatre autres sont tombées malades en février, mars et mai de cette année. Ils ont entre 14 et 49 ans, et cinq sont des hommes.

Deux cas de SHU

Lors de l'éclosion à E. coli O26, les personnes infectées sont tombées malades en juillet et aucune d'entre elles n'a déclaré avoir voyagé à l'étranger. Quatre patients vivent dans le Trøndelag

Les personnes concernées sont âgées de moins de 5 à 45 ans. Deux d'entre eux ont développé la maladie grave du syndrome hémolytique et urémique (SHU). Le SHU est une complication grave associée aux infections à E. coli qui provoque une insuffisance rénale.

Un autre cas de SHU lié à E. coli a été signalé, mais il n'est pas encore clair si cette personne fait également partie de l'éclosion à E. coli O26.

Les deux éclosions font l'objet d'une enquête par le FHI, les médecins-chefs municipaux, l'Autorité norvégienne de sécurité alimentaire (Mattilsynet) et l'Institut vétérinaire. L'Institut vétérinaire norvégien analysera des prélèvements d'aliments suspectés d'être des sources possibles d'infection. L'Autorité norvégienne de sécurité des aliments aide à obtenir des informations auprès des personnes malades et de leurs proches.

La Norvège a signalé 518 cas à E. coli en 2022 et une éclosion a concerné sept personnes.

France : Rappel de précaution de produits laitiers d'Italie

Notification d’alerte au RASFF de l’UE par l’Italie le 27 juillet 2023 de produits laitiers d’Italie en raison de la présence de Eschercichia coli producteurs de shigatoxines O26.

L’analyse a été réalisé le 14 juillet 2023.

La notification n’indique pas dans quel(s) pays les produits ont été distribués.

Le tweet de joe Whitworth ci-dessous rapporte qu’une fillette de 4 ans est atteinte d’un syndrome hémolytique et urémique et est hospitalité dan un hôpital de Padoue après avoir consommé du fromage de Malga di Coredo situé dans le Trentin. Mais cela peut aussi être dû à la qualité de l’eau ou à la visite de la ferme pédagogique située dans l’exploitation agricole.

L’enquête est menée par les carabiniers de la Nas qui ont saisi le lot de fromages et acquis des documents sur les méthodes de production et les ingrédients.

This STEC O26 RASFF alert https://t.co/pizapV03Kz could well be this https://t.co/lft5Wg9jHV

— joewhitworth (@joewhitworth) July 28, 2023

Le 28 juillet, RappelConso informe du rappel de tous produits laitiers de la marque Malga di Coredo en raison de la suspicion de présence de bactérie pathogène E. coli STEC en lien avec un syndrome hémolytique et urémique survenu chez une enfant en bas âge résidant dans le Trentin (Italie).

Quelques unités de produits laitiers issus de cette ferme sont susceptibles d'avoir été achetés par des consommateurs français en visite touristique. La date de commercialisation est jusqu'au 14 juillet 2023.

Aucun rappel n’a eu lieu en Italie, mais un rappel a eu lieu en Allemagne le 28 juillet 2023 de 'Caciotta - Caciotta', meules de fromage non emballées, 400 g.

A suivre ...

L'Allemagne lance une alerte à E. coli et au SHU après des voyages en Égypte

«L'Allemagne lance une alerte à E. coli et au SHU après des voyages en Égypte», source article de Joe Whitworth paru le 17 juillet 2023 dans Food Safety News.

Les responsables allemands de la santé publique ont mis en garde contre une augmentation des cas à E. coli parmi les voyageurs en Égypte.

Des experts de l'Institut Robert Koch (RKI) ont dit avoir également constaté une augmentation des cas connexes de syndrome hémolytique et urémique (SHU). Le SHU est une complication grave associée aux infections à E. coli qui provoque une insuffisance rénale.

Depuis le début de 2023, 31 cas à E. coli et 10 de SHU chez des personnes susceptibles d'avoir été infectées lors de vacances en Égypte ont été signalés.

Une grande partie des patients, 12 cas à E. coli et six cas de SHU, ont été enregistrés en mai et juin. Ils avaient séjourné dans différents hôtels, principalement à Hurghada, qui est également le lieu de voyage le plus fréquent du pays.

Augmentation générale

En 2019, il y a eu un nombre similaire de cas à E. coli et de SHU liés à l'Égypte au cours du premier semestre de l'année, mais au cours de toutes les autres années récentes, il y a eu beaucoup moins de rapports.

Parmi les cas à E. coli en 2023, 13 sont des femmes et 18 des hommes. L'âge médian est de 3 ans avec une fourchette de 3 mois à 71 ans. Parmi les cas de SHU, six sont des femmes et quatre des hommes âgés de 1 à 30 ans. Au moins cinq cas à E. coli et tous les cas de SHU ont été hospitalisés, mais personne n'est décédé.

Le sérotype E. coli est connu pour six cas et il existe cinq types différents.

Jusqu'à présent, les enquêtes n'ont fourni aucune indication d'une épidémie par une source d'infection ou dans un seul hôtel, mais ont mis en évidence des problèmes plus généraux d'hygiène alimentaire ou de l'eau.

Ces hôtels proposent généralement des choix de salades et de buffets, mais il ne faut manger que des plats bien cuits et des fruits qu'ils ont eux-mêmes épluchés, ce qui est plus difficile pour les voyageurs. Là où l'eau du robinet n'est pas désignée comme eau potable, les responsables de la santé publique disent que l'eau en bouteille doit être utilisée.

Les responsables du RKI ont mis en garde contre l'attente d'un plus grand nombre de cas et ont déclaré que lorsque les personnes revenaient d'Égypte avec de la diarrhée, des prélèvements de selles devraient être analysés pour E. coli et une attention particulière devrait être portée aux symptômes du SHU, en particulier chez les jeunes enfants.

Les laboratoires cliniques ont été invités à envoyer un isolat ou un prélèvement de selles des cas diagnostiqués à E. coli chez les personnes ayant des antécédents de voyage en Égypte au Centre national de référence pour Salmonella et autres agents pathogènes bactériens au RKI pour typage. Les isolats ou les prélèvements de selles des cas de SHU peuvent également être envoyés au laboratoire du SHU de l'hôpital universitaire de Münster.

NB : Illustration de la station balnéaire d’Hurghada.

L'Angleterre et le Pays de Galles signalent une baisse des infections à E. coli pour 2020

Assez tardif ce bilan 2020, sans doute pire qu’en France, c’est dire ...« L'Angleterre et le Pays de Galles signalent une baisse des infections à E. coli pour 2020», source article de Joe Whitworth paru le 30 juin 2023 dans Food Safety News.

Il est probable que la pandémie de la COVID-19 ait contribué à une baisse de 25% des cas à E. coli O157 en Angleterre en 2020 par rapport à 2019, selon les chiffres récemment publiés par la UK Health Security Agency (UKHSA).

En 2020, 1 419 cas confirmés à E. coli producteurs de shigatoxines (STEC) ont été signalés en Angleterre et au Pays de Galles. Cela comprenait 402 cas confirmés par culture de E. coli O157 et 690, où un sérogroupe autre que O157 a été isolé. Cinq personnes sont décédées. Pour 329 autres cas, les prélèvementss ont été retrouvés positifs par PCR pour les gènes des shigatoxines, mais STEC n'a pas été cultivé. En 2019, 539 cas d’infection à E. coli O157 et 768 E. coli non-O157 ont été notées.

La transmission peut se produire par contact direct ou indirect avec des animaux ou leur environnement, par la consommation d'aliments ou d'eau contaminés et par la propagation interhumaine.

Sept cas confirmés ont été infectés par plusieurs types en 2020, dont O145 et O157 ; O26 et O157 ; O26 et O168 ; O91 et O146 et O87 et O113. Il s'agit du taux le plus bas signalé depuis 1996, lorsque les tests ont commencé en Angleterre pour STEC O157 sur tous les prélèvements fécaux de patients suspects d'infection gastro-intestinale. Cependant, il est probable que la pandémie ait joué un rôle, la tendance doit donc être interprétée avec prudence, ont déclaré les responsables de la santé.

Données de E. coli O157

Sur 365 cas confirmés à STEC O157 en Angleterre, 195 étaient des femmes. Les enfants âgés de 5 à 9 ans présentaient l'incidence d'infection la plus élevée. Les 1 à 4 ans avaient été les plus touchés les années précédentes.

Le syndrome hémolytique et urémique (SHU) est survenu dans 10 cas confirmés à STEC O157. Deux cas de SHU avaient moins de 5 ans, avec une fourchette de 1 à 93. Deux décès ont été signalés parmi les cas confirmés.

La baisse des voyages à l'étranger signalés par les cas de STEC O157, de 30% les années précédentes à 8% en 2020, indique un nombre limité de voyages à l'étranger.

L'incidence la plus élevée était dans le sud-ouest et la plus faible à Londres. L'hospitalisation est survenue dans 121 cas, soit un tiers des cas, avec une durée allant de un à 14 jours avec une médiane de trois jours.

Une baisse des infections liées aux voyages a été observée, avec seulement 30 personnes déclarant être à l'étranger pendant leur période d'incubation, qui était de sept jours avant le début, contre respectivement, 28% et 31% en 2018 et 2019, Sur ces 30 personnes, cinq ont passé toute leur période d'incubation à l'étranger. Les destinations les plus fréquentes étaient la Turquie, l'Espagne et Malte.

En Angleterre, 557 cas positifs à la culture de 95 sérogroupes différents ont été confirmés, et au Pays de Galles, le nombre était de 132 cas de 53 types différents.

Au total, 85 cas de STEC non-O157 ont été hospitalisés. Le SHU est survenu dans 28 cas confirmés. Les sérogroupes les plus fréquemment isolés étaient O26 10 fois et O145 à quatre reprises. Les cas de SHU variaient de 10 mois à 6 ans et 10 avaient entre 1 et 4 ans. Trois personnes sont décédées.

Chiffres des E. coli non-O157

La détection des infections à STEC non-O157 a diminué par rapport à 2019. Le sérogroupe le plus couramment isolé était le STEC O26, suivi de O146 et O91.

Dix pour cent des cas confirmés à O26 ont développé un SHU, contre 3% des cas confirmés à O157, et une proportion plus élevée de cas à O26 ont signalé une hospitalisation par rapport aux patients à O157.

En août 2020, la UKHSA, Public Health Scotland (PHS) et Public Health Wales (PHW) ont enquêté sur une épidémie avec 20 cas confirmés, dont 15 en Angleterre, quatre au Pays de Galles et un en Écosse. L'âge médian était de 42 ans. Cinq personnes ont été hospitalisées.

Trois foyers de cas enregistrés

Trois éclosions à E. coli O157 impliquant 63 cas ont été signalées en 2020, mais aucun cas de SHU ou décès lié n'a été signalé.

La UKHSA et la PHW ont enquêté sur une autre épidémie et identifié le véhicule de l'infection comme étant des concombres importés consommés dans le cadre d'un produit de restauration rapide. Il y avait 36 cas confirmés, dont 27 vivaient en Angleterre et neuf au Pays de Galles. Treize personnes ont déclaré avoir été hospitalisées.

La UKHSA a enquêté sur une troisième éclosion avec 18 cas confirmés. Trois personnes ont été hospitalisées, mais la source n'a pas été retrouvée.

Les STEC vus par l'Anses

«Infections alimentaires à E. coli : comment protéger davantage de consommateurs ?», source communiqué de l’Anses du 27 juin 2023.

Les bactéries Escherichia coli entérohémorragiques (EHEC) sont responsables d’infections d’origine alimentaire parfois sévères, principalement chez les jeunes enfants, les personnes âgées ou immunodéprimées. Dans une nouvelle expertise (63 pages), l’Anses classe les souches de la bactérie responsables des formes graves d’infection. Elle émet des recommandations pour améliorer la surveillance des risques de contamination dans les produits en amont de leur mise sur le marché. L’Agence rappelle à cette occasion l’importance de continuer à respecter les mesures d’hygiène et les recommandations de cuisson et d’éviction de certains aliments par des populations sensibles.

Les EHEC sont responsables d’infections alimentaires

Si la plupart des souches d’E. coli sont sans danger pour la santé, certaines souches comme les E. coli entérohémorragiques ou EHEC sont pathogènes car elles produisent une toxine, nommée shigatoxine. Elles sont aussi dénommées STEC (Shigatoxin-producing E. coli).

Les EHEC sont responsables de troubles variés, allant d’une diarrhée bénigne à des formes plus graves, comme des diarrhées hémorragiques et des atteintes rénales sévères appelées syndrome hémolytique et urémique (SHU). Les infections touchent principalement les jeunes enfants, surtout de moins de 5 ans, les personnes âgées et les personnes immunodéprimées. Chaque année, environ 140 cas de SHU infantiles sont recensés.

Les EHEC se transmettent principalement par l’alimentation. En France, les aliments les plus souvent mis en cause lors d’épidémies d’infections à EHEC sont les steaks hachés, consommés crus ou insuffisamment cuits, et les fromages au lait cru. Les farines pouvant également être contaminées, la consommation de pâte à pizza crue ou insuffisamment cuite a été à l’origine d’une épidémie en 2022. 

L’Anses propose une nouvelle classification des souches en quatre groupes en fonction de leur potentiel de virulence, c’est-à-dire en fonction de leur capacité à induire des formes cliniques graves (syndrome hémolytique et urémique - SHU, diarrhée sanglante). La classification ainsi proposée intègre les nouvelles connaissances sur les déterminants de la virulence des STEC, ainsi que les données sur les caractéristiques des souches à l’origine des cas d’infections en France (2017-2021). Cette classification, cohérente avec les résultats des travaux internationaux, met en exergue la virulence accrue des souches STEC possédant les sous-types stx2a et/ou stx2d. A la différence de la précédente basée sur les données de SHU infantiles, la nouvelle classification de l’Anses prend également en compte les cas de SHU chez l’adulte. L’Agence va d’ailleurs intégrer ces résultats pour actualiser sa fiche de danger microbiologique relative aux STEC, dont la dernière édition date de 2019.

L’Anses constate que les sources de contamination ne sont que rarement identifiées lors d’investigations épidémiologiques des cas d’infection. Or, les épidémies récentes en France et à l’étranger pointent vers de nouvelles sources (p.ex. Farines). … l’Anses recommande de conduire des études d’attribution des sources afin d’identifier et de quantifier la contribution relative des réservoirs animaux, de l’environnement et des aliments au fardeau sanitaire.

La liste de recommandations de l’Anses ne me paraît pas assez complète, voici celle provenant de Santé publique France, pour qui «Une prévention du SHU basée sur l’hygiène et l’éviction de certains aliments à risque».

Quelques conseils simples pour limiter les risques de transmission :

En cuisine :

- Le lavage des mains doit être systématique avant la préparation des repas ;
- les viandes, et surtout la viande hachée de bœuf, mais aussi les préparations à base de viande hachée, doivent être bien cuites à cœur pour atteindre 70°C (et non pas rosées ou saignantes) ;
- le lait cru, les fromages à base de lait cru et les produits laitiers fabriqués à partir de lait cru ne doivent pas être consommés par les enfants de moins de 5 ans (préférez les fromages à pâte pressée cuite (type Emmental, Comté, gruyère, Beaufort), les fromages fondus à tartiner et les fromages au lait pasteurisé) ;
- les préparations à base de farine (pizza/pâte à cookies/gâteau/tarte/crêpe...) ne doivent pas être consommées crues ou peu cuites ;
- les légumes, la salade, les fruits et les herbes aromatiques, en particulier ceux qui vont être consommés crus doivent être soigneusement lavés avant consommation, après épluchage le cas échéant ;
- les aliments crus doivent être conservés séparément des aliments cuits ou prêts à être consommés ;
les plats cuisinés et les restes alimentaires doivent être rapidement mis au réfrigérateur et suffisamment réchauffés avant consommation ;
- les ustensiles de cuisine (surtout lorsqu’ils ont été en contact au préalable avec des aliments crus tels que la viande ou les fromages), ainsi que les plans de travail, doivent être soigneusement lavés pour éviter un risque de contamination croisée.

Lors des activités et loisirs : 

- Les enfants ne doivent pas boire d’eau non traitée (eau de puits, rivière, torrent, etc.) et éviter d’en avaler lors de baignades (lac, rivière, étang, etc.).
- Il faut éviter le contact des très jeunes enfants (moins de 5 ans) avec les vaches, veaux, moutons, chèvres, etc., et leur environnement ; en cas de contact avec ces animaux le lavage des mains (eau et savon) doit être systématique avant que l’enfant ne porte ses doigts à sa bouche.

Commentaire

J’ajouterais que les graines crues et germes de graines crues ne doivent être consommées par les personnes à risques dont les enfants.

Pour la cuisson, comment atteint 70°C à cœur sans thermomètre alimentaire, la question n’est toujours pas résolue …

Concernant le nombre de cas de SHU pédiatriques, l’Anses coupe la poire en deux en signalant 140 cas (curieux), car Santé publique France évoque de 100 à 160 cas de SHU pédiatrique par an. L’année 2022, hélas, mettra tout le monde d’accord, avec, me semble-t-il, une nette hausse.

A noter aussi que l’Anses souhaite intégrer tous les SHU, pédiatriques et adultes, ce qui n’est pas le cas actuellement.

Enfin, rappelons qu’un article paru dans NEJM en 2017 rapportait que «la farine a été le vecteur présumé d'éclosion d'infections à Escherichia coli producteurs de shigatoxines (STEC) depuis 2009, lorsqu'une éclosion de maladies d'origine alimentaire dans plusieurs États des États-Unis a été liée à la pâte à cookies préemballée.» On savait donc depuis 2009 ...

Les références de cette éclosion est dans l’article suivant :

- Novel Vehicle for Transmission of Escherichia coli O157:H7 to Humans: Multistate Outbreak of E. coli O157:H7 Infections Associated With Consumption of Ready-to-Bake Commercial Prepackaged Cookie Dough—United States, 2009.

Il me semble aussi qu’il était enfin temps d'aller sur le terrain, l’Anses et l’Actia engagent un partenariat (ouf !).

Last but not the least, le titre du communiqué, comment protéger davantage de consommateurs, ne me semble pas le reflet de cet expertise.

Une forte augmentation des infections à E. coli O26 est notée en Angleterre

«Forte augmentation des infections à E. coli O26 notée en Angleterre», source article de Joe Whitworth paru le 26 mai 2023 dans Food Safety News.

Une augmentation d'un type de E. coli au cours de la dernière décennie a incité les scientifiques à mettre en garde contre une menace émergente pour la santé publique en Angleterre.

Bien qu'une partie de l'augmentation soit due à une meilleure détection des E. coli producteurs de shigatoxines (STEC) non-O157 dans les laboratoires, il est prouvé que davantage de personnes tombent malades.

Des chercheurs ont examiné le complexe clonal* (CC) 29 des STEC O26:H11 en Angleterre. Entre janvier 2014 et décembre 2021, 834 isolats humains provenant de 724 patients appartenant au CC 29 ont été séquencés à la UK Health Security Agency (UKHSA).

Les notifications des STEC O26:H11 en 2021 étaient huit fois plus élevées que celles enregistrées en 2014. Les diagnostics de STEC O26 en Angleterre ont augmenté chaque année, passant de 19 en 2014 à 144 en 2021. La plupart des cas étaient de sexe féminin et la plus forte proportion appartenait aux groupes d'âge de 0 à 5 ans, selon l'étude parue dans le Journal of Infection, «The epidemiology of Shiga toxin-producing Escherichia coli O26:H11 (clonal complex 29) in England, 2014–2021.»

Le syndrome hémolytique et urémique (SHU) a été diagnostiqué dans 40 cas et trois enfants sont décédés. Le SHU est une complication grave associée aux infections à E. coli qui provoque une insuffisance rénale.

Augmentation continue des signalements

STEC O157:H7 a été le sérotype dominant au Royaume-Uni avec des systèmes de surveillance de la santé publique axés sur sa détection et sa surveillance. Cependant, l'évolution des méthodes de laboratoire a amélioré la détection de tous les sérotypes de STEC.

Les diagnostics d'infection causée par CC 29 ont augmenté chaque année sauf en 2020. La saisonnalité des STEC O26:H11 suit des schémas similaires à O157, où les cas augmentent pendant les mois d'été, culminent en août et diminuent aux niveaux de référence pendant l'hiver.

Le sérotype le plus courant était O26:H11, suivi de O111:H8 et O177:H11. Les isolats restants étaient de 16 types différents. La plupart des isolats appartenaient à la séquence type (ST) 21, ST29 et ST16.

Le sud-est de l'Angleterre a signalé le plus grand nombre de cas de STEC appartenant au CC 29, suivi de Londres.

Sur 40 patients qui ont développé un SHU, 21 étaient de sexe masculin. La plupart des cas étaient âgés de 5 ans ou moins. Le nombre est passé de deux cas en 2014 à 11 en 2021.

Pour CC 29, 133 des 680 cas ont déclaré avoir voyagé hors du Royaume-Uni dans les sept jours précédant l'apparition des symptômes. Les destinations les plus courantes étaient l'Égypte, la Turquie, le Maroc et le Mexique.

Epidémies enregistrées

Les épidémies à O26:H11 en Angleterre avant 2020 comprenaient six clusters liés à des voyages et un lié à de la salade dans les sandwichs préemballés. De janvier 2020 à décembre 2021, six autres clusters avec trois cas ou plus ont été retrouvés

.Les deux plus grands clusters comptaient 16 cas sur 14 mois et 11 cas sur 44 mois. Il y avait des preuves épidémiologiques impliquant de la salade comme véhicule potentiel d'infection, mais cela n'a pas été confirmé. Une autre épidémie était liée à une ferme pédagogique pour enfants et la source était inconnue pour les autres.

Les données ont montré que STEC O26:H11 contenait un type de shigatoxine connu sous le nom de stx1a (47%), stx1a, stx2a (n = 24%) ou stx2a (n = 28%).

Ces profils entraînent des résultats cliniques graves, car plus de la moitié ont signalé une diarrhée sanglante et un quart a été hospitalisé. Les directives ont été mises à jour en juillet 2021 pour inclure un suivi de santé publique sur tous les cas de STEC O26:H11, quel que soit le profil stx.

Tous les isolats de STEC causant un SHU avait stx2a soit seul (n = 33) ou en association avec stx1a 

Dans leur conclusion, les auteurs notent,

Les STEC O26:H11 sont une menace émergente cliniquement significative pour la santé publique en Angleterre. Il est difficile de déterminer l'incidence et la prévalence réelles en raison de stratégies nationales de surveillance incohérentes. Des diagnostics et des algorithmes de surveillance améliorés sont nécessaires pour surveiller la véritable charge, détecter les épidémies et mettre en œuvre des interventions efficaces», ont écrit les chercheurs.

*Un complexe clonal est un groupe de bactéries génotypiquement assez proches pour que leur soit attribuée une origine commune.