vendredi 12 novembre 2021

Les différences de microbiote intestinal observées chez les personnes autistes peuvent être dues à des préférences alimentaires

Cette illustration représente de nouvelles recherches suggérant que la diversité des espèces bactériennes retrouvées dans les intestins des enfants autistes peut être due à leurs préférences alimentaires restreintes associées à l'autisme, plutôt qu'à la cause de leurs symptômes.

«Les différences de microbiote intestinal observées chez les personnes autistes peuvent être dues à des préférences alimentaires», source EurekAlert!

La recherche a suggéré que des troubles du spectre autistique (TSA) peuvent être au moins en partie causés par des différences dans la composition du microbiote intestinal, sur la base de l'observation que certains types de microbes sont plus fréquents chez les personnes autistes. Mais un article paru le 11 novembre dans la revue Cell suggère que le lien peut en fait fonctionner dans l'autre sens: la diversité des espèces retrouvées dans les intestins des enfants autistes peut être due à leurs préférences alimentaires restreintes associées à l'autisme, plutôt qu'à la cause de leurs symptômes.

«Le rôle du microbiome intestinal dans l'autisme suscite beaucoup d'intérêt, mais pas beaucoup de preuves tangibles», déclare l'auteur principal Jacob Gratten, de Mater Research en partenariat avec l'Université du Queensland à Brisbane, en Australie. «Notre étude, qui est la plus importante à ce jour, a été conçue pour surmonter certaines des limites des travaux antérieurs.»

Au cours de la dernière décennie, alors que le séquençage de nouvelle génération des espèces microbiennes dans l'intestin a rendu l'analyse du microbiome plus automatisée et moins longue, un certain nombre d'études ont examiné le lien entre des espèces particulières de microbes dans l'intestin et la santé mentale. . L'axe intestin-cerveau a été lié non seulement aux TSA, mais aussi à l'anxiété, à la dépression et à la schizophrénie. La possibilité de cibler le microbiote est un domaine de recherche croissant pour de nouveaux traitements.

Dans l'étude parue dans Cell, les chercheurs ont analysé des échantillons de selles d'un total de 247 enfants âgés de 2 à 17 ans. Les échantillons ont été collectés auprès de 99 enfants diagnostiqués avec un TSA, 51 frères et sœurs appariés non diagnostiqués et 97 enfants non apparentés et non diagnostiqués. Les sujets inclus dans l'analyse provenaient de l’Australian Autism Biobank et du Queensland Twin Adolescent Brain Project.

Les chercheurs ont analysé les échantillons par séquençage métagénomique, qui examine l'ensemble du génome des espèces microbiennes plutôt que de courts codes-barres génétiques (comme avec l'analyse 16S). Il fournit également des informations au niveau des gènes plutôt que des informations au niveau des espèces, et fournit une représentation plus précise de la composition du microbiome que l'analyse 16S, une technique utilisée dans de nombreuses études antérieures liant le microbiome à l'autisme.

«Nous avons également soigneusement pris en compte le régime alimentaire dans toutes nos analyses, ainsi que l'âge et le sexe», explique la première auteure Chloe Yap, étudiante en PhD qui travaille avec Gratten. «Le microbiome est fortement affecté par l'environnement, c'est pourquoi nous avons conçu notre étude avec deux groupes de comparaison.»

Sur la base de leur analyse, les chercheurs ont trouvé des preuves limitées d'une association directe de l'autisme avec le microbiome. Cependant, ils ont trouvé une association hautement significative entre l'autisme et l'alimentation et qu'un diagnostic d'autisme était associé à une alimentation moins diversifiée et à une moins bonne qualité alimentaire. De plus, les mesures psychométriques du degré de traits autistiques (y compris les intérêts restreints, les difficultés de communication sociale et la sensibilité sensorielle) et les scores polygéniques (représentant un proxy génétique) pour les TSA et les comportements impulsifs/compulsifs/répétitives étaient également liés à un régime moins diversifié.

«Prises ensemble, les données soutiennent un modèle étonnamment simple et intuitif, dans lequel les traits liés à l'autisme favorisent des préférences alimentaires restreintes», explique Yap.

«Cela conduit à son tour à une plus faible diversité du microbiome et à davantage de selles ressemblant à de la diarrhée.»

Les chercheurs reconnaissent plusieurs limites aux travaux actuels. La première est que la conception de l'étude ne peut exclure les contributions du microbiome avant le diagnostic de TSA, ni la possibilité que les changements liés à l'alimentation dans le microbiome aient un effet de rétroaction sur le comportement. Une autre est qu'ils ne pouvaient rendre compte de l'effet possible des antibiotiques sur le microbiome qu'en excluant ceux qui prenaient ces médicaments au moment de la collecte des selles. Enfin, aucun ensemble de données comparables n'est actuellement disponible pour confirmer les résultats.

«Nous espérons que nos résultats encourageront d'autres membres de la communauté de la recherche sur l'autisme à collecter régulièrement des métadonnées dans les études «omiques» pour tenir compte des facteurs de confusion potentiels importants (mais souvent sous-estimés) tels que l'alimentation», déclare Gratten. «Nos résultats mettent également l'accent sur la nutrition des enfants diagnostiqués autistes, qui est un contributeur cliniquement important (mais sous-estimé) à la santé et au bien-être en général.»

Les chercheurs prévoient de générer de nouvelles données dans un échantillon plus large pour reproduire leurs résultats.


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