Microbiologie : Comment et pourquoi des bactéries dévoreusent de chair «mangent» de la chair ?

La capsule est essentielle à la virulence de V. vulnificus. Sur la photo ici, colonies de V. vulnificus encapsulées et non encapsulées. Source Oliver J.D. Microbiology Spectrum, 2015.

Comment et pourquoi des bactéries dévoreusent de chair «mangent» de la chair ?, source ASM News du 11 octobre 2023.

Les États-Unis ont constaté une augmentation des infections causées par ce qu’on appelle les «bactéries mangeuses de chair», alias Vibrio vulnificus, une bactérie qui habite les eaux saumâtres. Mais ce microbe «mange»-t-il réellement de la chair ? Comment cause-t-il les dégâts qu’il provoque et pourquoi ?

Qu'est-ce que représente un nom ?

Comme d'autres espèces de Vibrio, V. vulnificus vit dans les eaux côtières des estuaires et est généralement associé aux coquillages, tels que les huîtres. Dans le contexte de la santé humaine, la bactérie est surtout connue pour provoquer des maladies gastro-intestinales pouvant évoluer vers une septicémie chez les personnes ayant ingéré des coquillages crus ou insuffisamment cuits qui hébergent l'organisme. Cependant, ce microbe marin peut également faire des ravages à la surface du corps.

Si une personne présentant une plaie ouverte (par exemple, un tatouage ou une coupure récente) entre en contact avec V. vulnificus, le microbe peut pénétrer et infecter ladite plaie. Ce qui peut commencer par un gonflement et une douleur au niveau de la plaie peut, en quelques jours, entraîner une destruction cutanée généralisée, donnant l'impression que quelque chose a rongé la chair.

Cependant, ce n’est pas tout à fait exact. Au contraire, V. vulnificus déclenche des infections de plaies qui peuvent évoluer vers une fasciite nécrosante (FN), une affection caractérisée par la mort des fascias (tissu conjonctif entourant les fibres musculaires et d'autres structures corporelles) et des tissus sous la peau. À mesure que l’infection progresse, la peau finit par se détériorer, donnant lieu à des lésions vésiculeuses et béantes. S'il n'est pas traité rapidement par un traitement antimicrobien et une intervention chirurgicale pour éliminer les tissus nécrotiques (débridement), V. vulnificus peut devenir systémique, en particulier chez les hôtes présentant certaines conditions préexistantes (par exemple, une maladie du foie), et s'avérer mortel.

«Le temps presse : vous devez suivre un traitement antibiotique immédiatement», a dit James Oliver, professeur émérite à l'Université de Caroline du Nord à Charlotte qui a étudié V. vulnificus pendant plus de 45 ans. «Souvent, les personnes [ayant des infections de plaies] le voient [et pensent que] cela ressemble à une morsure d'araignée ou quelque chose de ce genre ; ils n'y prêtent pas beaucoup d'attention. Et puis 24 heures plus tard, ils vont à l'hôpital parce qu'ils ont maintenant des lésions bulleuses.»

Bien qu'elle ait fait la une des journaux ces derniers mois, V. vulnificus n'est pas la seule bactérie à causer la FN, ni la plus courante. Par exemple, alors que V. vulnificus est à l'origine de 150 à 200 cas aux États-Unis chaque année, Streptococcus du groupe A (SGA), un autre «mangeur de chair» qui habite la peau, le nez et la gorge des humains et se propage via des gouttelettes respiratoires ou des surfaces contaminéesn a causé environ 700 à 1 150 infections par an depuis 2010.

Cela pourrait cependant changer. À mesure que le changement climatique augmente la température des eaux côtières, ce qui favorise la croissance de V. vulnificus (la présence de l'organisme se produit généralement entre mai et octobre, lorsque l'eau est la plus chaude) et élargit sa répartition géographique, les infections causées par la bactérie devraient augmenter. Déjà, les cas dans l’Est des États-Unis ont été multipliés par 8 entre 1988 et 2018, soulignant la nécessité de comprendre et de sensibiliser à ce microbe marin.

Comment V. vulnificus détruit-il la chair ?

Malgré des années d'études, la manière dont V. vulnificus provoque des infections des tissus mous reste encore un mystère. Bien que la bactérie possède un arsenal de facteurs de virulence connus et putatifs, la plupart des études se sont concentrées sur leur rôle dans l’apparition de la gastro-entérite et de la septicémie qui en résulte. Selon Oliver, cette attention est probablement due aux différences de mortalité entre la plaie et les infections intestinales (~ 20% pour les infections de plaie et 50% pour l'ingestion).

Ce que l'on sait, c'est que la destruction des tissus est liée à un répertoire de protéases, d'hémolysines, de collagénases, de toxines et d'autres protéines sécrétées par la bactérie ou associées à celle-ci. Certains de ces facteurs sont mieux compris que d’autres. Par exemple, RtxA1, une toxine sécrétée par V. vulnificus et impliquée dans les infections gastro-intestinales et les plaies, tue les cellules en modifiant le cytosquelette de l'hôte et l'agrégation d'actine ; il anatgonise également les cellules immunitaires phagocytaires. La capsule (un revêtement extracellulaire collant) est essentielle pour V. vulnificus, en raison de sa capacité à résister aux réponses immunitaires de l'hôte et à favoriser la survie bactérienne. Les facteurs d'adhésion (pour adhérer aux tissus), les flagelles (qui permettent à la bactérie de se déplacer et de proliférer sur le site de l'infection) et la capacité de s'engager dans une chimiotaxie (un processus qui facilite l'invasion dans les tissus plus profonds) semblent également être impliqués.

Les bactéries V. vulnificus ne sont pas les seules responsables de la progression de la FN : des facteurs liés à l'hôte sont également en jeu. En effet, les cellules immunitaires qui contrôlent l'infection, comme les neutrophiles, peuvent également exacerber la maladie en libérant des composés inflammatoires. Le milieu nutritionnel fourni par l'hôte influence également la susceptibilité et les conséquences de la maladie. Par exemple, V. vulnificus, C'est un microbe avide de fer : la capacité à acquérir du fer est essentielle à sa survie et joue un rôle important dans sa pathogenèse. Ainsi, la bactérie est plus susceptible de se propager au-delà du site de la plaie chez les personnes présentant une élévation du taux de fer sérique, comme celles souffrant d'une maladie du foie, conduisant à une infection systémique mortelle.

Pourtant, pour Oliver, il reste beaucoup à élucider sur la pathogenèse de V. vulnificus et les infections des plaies. «J'aimerais en savoir plus sur les toxines réellement impliquées», a-t-il dit, soulignant que les plaies présentent un environnement très différent de l'intestin, où se sont concentrées la plupart des recherches sur la virulence de V. vulnificus.

Pourquoi V. vulnificus «mange»-t-il de la chair ?

Pourquoi un microbe provoque-t-il une destruction dans (ou sur) un hôte ? D’un point de vue bactérien, les facteurs qui perturbent les cellules hôtes aident probablement, d’une manière ou d’une autre, le microbe lui-même. Il est également important de considérer que les humains ne sont pas l’hôte naturel de V. vulnificus. Le microbe est omniprésent dans les eaux côtières, souvent en association avec les coquillages ; il a évolué pour prospérer dans ces environnements. Ainsi, s'il se retrouve dans une blessure humaine, V. vulnificus déploie son répertoire d'outils préexistant pour survivre. Le fait que ce répertoire contienne les outils nécessaires pour réussir à infecter l'hôte humain varie en fonction de la souche de la bactérie. Dans tous les cas, la destruction des tissus est le résultat malheureux du fait que les cellules bactériennes utilisent ce qu’elles possèdent déjà pour se débrouiller dans l’environnement hôte dans lequel elles se trouvent.

Une meilleure question est peut-être alors de savoir comment V. vulnificus bénéficie de la destruction des tissus de l'hôte ? Il y a plusieurs éléments à considérer. D’une part, les tissus endommagés peuvent servir de source de nutriments pour V. vulnificus. «La destruction des tissus [libère] toutes sortes de protéines, de lipides [et] tant d'autres choses que les bactéries pourraient utiliser comme nutriments», a dit Oliver. Bien que l'utilisation de nutriments dérivés de tissus n'ait pas été explicitement démontrée pour V. vulnificus, l'utilisation de nutriments libérés par les cellules hôtes lors de l'infection a été illustrée pour des agents pathogènes comme V. cholerae (un parent de V. vulnificus) et Streptococcus du groupe A, une autre micro-organisme responsable de la FN.

La capacité de V. vulnificus à se propager aux tissus plus profonds, et ainsi à provoquer une destruction supplémentaire, peut également être bénéfique sur le plan nutritionnel pour la bactérie, en permettant sa migration vers des réservoirs de nutriments frais afin de minimiser la compétition. Les facteurs qui tuent les cellules hôtes protègent V. vulnificus des réponses immunitaires visant à y mettre fin, améliorant ainsi sa survie. Cependant, pour l’essentiel, ce que V. vulnificus «retire» de l’infection nécessite des investigations plus approfondies.

Protégez votre chair

Malgré toute l'intrigue derrière le comment et le pourquoi sous-jacents aux infections de plaies à V. vulnificus et à la FN, une chose est claire : il est préférable de les éviter en premier lieu. Le Centers for Disease Control and Prevention (CDC) des États-Unis recommande aux personnes présentant des plaies ouvertes d'éviter les eaux saumâtres, y compris de patauger sur la plage. S'il n'est pas possible de l'éviter, laver les plaies avec du savon après avoir été en contact avec de l'eau susceptible d'héberger V. vulnificus ou des produits de la mer crus ou insuffisamment cuits, est une bonne idée.

Oliver a souligné que la sensibilisation à V. vulnificus est essentielle. «Je pense que la meilleure chose à faire est de sensibiliser les personnes, surtout s’ils souffrent de maladies sous-jacentes», a-t-il dit, ce qui les expose à un plus grand risque d’infection. «[Si] ils se coupent alors qu'ils sont dans l'eau et que celle-ci s'infecte, ils doivent immédiatement consulter un médecin et ils doivent mentionner qu'ils ont eu une coupure alors qu'ils étaient dans l'eau de mer pour essayer de leur faire alerter le médecin.» Il a noté que V. vulnificus est «extrêmement sensible aux antibiotiques», ce qui est une bonne chose, il s'agit simplement de détecter l'infection le plus tôt possible.

New York et le Connecticut signalent des cas mortels à Vibrio

«New York et le Connecticut signalent des cas mortels à Vibrio», source article de Lisa Schnirring paru le 17 août 2023 dans CIDRAP News.

Le 16 août, le New York State Department of Health (NYSDOH) a exhorté les résidents à prendre des précautions après le décès par Vibrio d'un patient du comté de Suffolk, ainsi que des cas mortels similaires signalés récemment dans le Connecticut.

Dans un communiqué, des responsables de New York ont déclaré que l'affaire faisait toujours l'objet d'une enquête pour déterminer si le patient avait été exposé à l'eau de New York ou ailleurs. Le NYSDOH a exhorté les prestataires de santé à prendre en compte Vibrio vulnificus lors de l'évaluation des patients présentant des infections graves des plaies ou une septicémie avec ou sans infection des plaies. Il a également exhorté les personnes blessées à éviter de nager dans l'eau de mer chaude et les personnes dont le système immunitaire est affaibli à éviter de manipuler ou de manger des fruits de mer crus qui pourraient être porteurs de la bactérie.

Fin juillet, le Connecticut State Department of Health a averti les résidents du risque de manger des coquillages crus et de l'exposition à l'eau salée ou saumâtre le long de Long Island Sound après des rapports de cas graves à Vibrio. Depuis le 1er juillet, l'État a reçu des informations sur trois cas, dont l'un mortel. Les patients avaient entre 60 et 80 ans et tous ont été hospitalisés.

Un patient avait mangé des huîtres crues dans un endroit situé dans un autre État. Les deux autres ont été exposés à de l'eau salée ou saumâtre dans le détroit de Long Island Sound. Tous deux avaient des coupures ou des blessures ouvertes préexistantes ou avaient subi de nouvelles blessures au cours de leurs activités.

Manisha Juthani, commissaire à la santé du Connecticut, a déclaré que pendant les mois les plus chauds de l'été, les bactéries sont plus susceptibles de proliférer et de contaminer les coquillages crus. «Compte tenu de notre vague de chaleur actuelle, c'est peut-être le moment de faire preuve d'une prudence particulière dans ce que vous consommez.»

Le Connecticut a enregistré cinq cas en 2020, mais aucun en 2021 ou 2022. La Caroline du Nord a signalé trois décès à Vibrio en juillet.

Etats-Unis : Une personne décède après avoir mangé des huîtres crues. Vibrio vulnificus inside ?

«Un homme décède d'une infection bactérienne après avoir mangé des huîtres», source article de Coral Beach paru le 13 juin 2023.

Un homme du Missouri est décédé après avoir mangé des huîtres crues, selon les responsables locaux de la santé publique.

Le St. Louis County Department of Public Health a signalé le décès le 12 juin lorsqu'il a été notifié par l'hôpital St. Claire. L'homme est décédé le 8 juin d'une infection causée par la bactérie Vibrio vulnificus.

Les responsables du comté ont émis un avertissement de santé publique concernant les huîtres crues, qui provenaient de «The Fruit Stand & Seafood» de Manchester, Missouri. Quiconque a mangé des huîtres crues de l'endroit et qui est tombé malade doit immédiatement consulter un médecin.

Les infections causées par la bactérie Vibrio vulnificus provoquent des symptômes tels que des crampes abdominales, des nausées, des vomissements, de la fièvre, des frissons et des cloques. Quiconque a mangé des huîtres crues de l'entreprise et est tombé malade doit informer ses prestataires de soins de santé qu'il a consommé des coquillage crus susceptibles d'avoir été contaminés par Vibrio vulnificus.

«Il n'y a aucune preuve que l'entreprise ait fait quoi que ce soit pour contaminer les huîtres, qui étaient probablement déjà contaminées lorsque l'établissement les a reçues», ont déclaré les responsables de la santé du comté de St. Louis.

L'homme de 54 ans n'a pas été identifié par les autorités sanitaires. Il a consommé des huîtres crues de The Fruit Stand & Seafood au cours de la semaine dernière.

Les autorités continuent d'enquêter sur la situation. Ils mènent des efforts de traçabilité pour déterminer d'où viennent les huîtres, selon le département de la santé.

Toutes les huîtres de l'entreprise étaient sous embargo par le département de la santé.

Plusieurs types de bactéries Vibrio peuvent provoquer des maladies, bien que Vibrio vulnificus soit le type le plus susceptible de provoquer une maladie grave, selon les responsables de la santé du comté. La vibriose est une maladie très différente du choléra, qui est causée par une autre espèce de vibrion, Vibrio cholerae.

Vibrio vulnificus peut être trouvé dans les eaux côtières chaudes, généralement pendant les mois d'été. Des personnes tombent généralement malades avec Vibrio vulnificus en consommant des huîtres crues ou insuffisamment cuites et d'autres coquillages. Vibrio vulnificus peut également provoquer une infection des plaies si une personne présentant des lésions cutanées nage ou est exposée à de l'eau contaminée par la bactérie. Les infections causées par Vibrio vulnificus ne se transmettent pas d'une personne à l'autre.

Les personnes infectées par Vibrio vulnificus commencent généralement à ressentir des symptômes 12 à 72 heures après avoir consommé des coquillages crus ou insuffisamment cuits, bien que cela puisse prendre jusqu'à une semaine avant l'apparition des symptômes. Les symptômes d'infection apparaissent généralement très rapidement. Contrairement à d'autres types de vibriose, Vibrio vulnificus ne provoque généralement pas de diarrhée, bien que certaines personnes présentent des symptômes gastro-intestinaux.

La maladie causée par Vibrio vulnificus peut être très grave. Aux États-Unis, le taux de mortalité associé à l'infection par Vibrio vulnificus est d'environ une personne sur trois infectée par la bactérie, selon le département de la santé.

Vibrio vulnificus cause plus de 95% des décès liés aux produits de la mer aux États-Unis. Les personnes atteintes d'une maladie hépatique chronique ou qui abusent de l'alcool, ainsi que les personnes immunodéprimées, courent un risque accru de développer une maladie grave et doivent éviter de manger des huîtres et autres coquillages crus ou insuffisamment cuits.

Des scientifiques mettent en garde contre l'augmentation des infections bactériennes potentiellement mortelles en raison du réchauffement climatique

Cette fois-ci, loin de les négliger, ce n’est pas une zoonose qui est en cause, du coup One Health ?

Voici que «Des scientifiques mettent en garde contre l'augmentation des infections bactériennes potentiellement mortelles en raison du réchauffement climatique», source communiqué de l'Université d'East Anglia.

La poursuite du réchauffement climatique entraînerait une augmentation du nombre et de la propagation d'infections potentiellement mortelles causées par des bactéries présentes le long de certaines parties de la côte des États-Unis.

La bactérie Vibrio vulnificus se développe dans les eaux côtières chaudes peu profondes et peut infecter une coupure ou une piqûre d'insecte lors d'un contact avec l'eau de mer. Une nouvelle étude menée par l'Université britannique d'East Anglia (UEA), «Climate warming and increasing Vibrio vulnificus infections in North America», montre que le nombre d'infections à V. vulnificus le long de la côte Est des États-Unis, un point chaud mondial pour de telles infections, est passé de 10 à 80 par an sur une période de 30 ans.

De plus, chaque année, des cas surviennent plus au nord. À la fin des années 1980, des cas ont été découverts dans le golfe du Mexique et le long de la côte sud de l'Atlantique, mais étaient rares au nord de la Géorgie. Aujourd'hui, on les trouve aussi loin au nord que Philadelphie.

Les chercheurs prédisent que d'ici 2041-2060, les infections pourraient se propager pour englober les principaux centres de population autour de New York. Combiné à une population croissante et de plus en plus âgée, qui est plus susceptible d'être infectée, le nombre de cas annuels pourrait doubler.

D'ici 2081-2100, des infections pourraient être présentes dans tous les États de l'Est des États-Unis dans des scénarios d'émissions et de réchauffement futurs moyens à élevés.

Les résultats, publiés dans la revue Scientific Reports, sont importants car bien que le nombre de cas aux États-Unis ne soit pas important, une personne infectée par V. vulnificus a une chance sur cinq de mourir. C'est aussi l'agent pathogène marin le plus coûteux à traiter aux États-Unis.

La maladie culmine en été et voit la bactérie se propager rapidement et endommager gravement la chair de la personne. En conséquence, on l'appelle communément une maladie «mangeuse de chair» et de nombreuses personnes qui survivent ont été amputées des membres.

L'auteur principal de l'étude, Elizabeth Archer, chercheuse à l'UEA, a dit : «L'expansion prévue des infections met en évidence la nécessité d'une sensibilisation accrue à la santé individuelle et publique dans les zones touchées. Ceci est crucial car une action rapide lorsque des symptômes apparaissent est nécessaire pour prévenir des conséquences majeures pour la santé.»

«Les émissions de gaz à effet de serre provenant de l'activité humaine modifient notre climat et les impacts peuvent être particulièrement aigus sur les côtes du monde, qui constituent une frontière majeure entre les écosystèmes naturels et les populations humaines et sont une source importante de maladies humaines.»

«Nous montrons que d'ici la fin du 21e siècle, les infections à V. vulnificus s'étendront plus au nord, mais la distance au nord dépendra du degré de réchauffement supplémentaire et donc de nos futures émissions de gaz à effet de serre.»

«Si les émissions sont maintenues à un niveau bas, les cas peuvent s'étendre vers le nord uniquement jusqu'au Connecticut. Si les émissions sont élevées, des infections devraient se produire dans tous les États américains de la côte Est. D'ici la fin du 21e siècle, nous prévoyons qu'environ 140 à 200 cas d’infection à V. vulnificus pourraient être signalées chaque année.»

L'équipe de recherche suggère que les individus et les autorités sanitaires pourraient être avertis en temps réel des conditions environnementales particulièrement à risque grâce à des systèmes d'alerte précoce spécifiques à la mer ou à Vibrio.

Les mesures de contrôle actif pourraient inclure des programmes de sensibilisation plus importants pour les groupes à risque, par exemple les personnes âgées et les personnes souffrant de problèmes de santé sous-jacents, et une signalisation côtière pendant les périodes à haut risque.

Le co-auteur, le Professeur Iain Lake de l'UEA a déclaré : «L'observation que les cas à V. vulnificus se sont étendus vers le nord le long de la côte Est des États-Unis est une indication de l'effet que le changement climatique a déjà sur la santé humaine et le littoral. Savoir où les cas sont susceptibles de se produire à l'avenir devrait aider les services de santé à planifier l'avenir.»

L'étude est la première à cartographier comment les emplacements des cas de V. vulnificus ont changé le long de la côte est des États-Unis. C'est également le premier à explorer comment le changement climatique peut influencer la propagation des cas à l'avenir.

Les informations sur l'endroit où les personnes ont attrapé l'infection à V. vulnificus ont été obtenues auprès du Centers for Disease Control and Prevention des États-Unis. Cela a permis à l'équipe de cartographier comment les cas à Vibrio vulnificus se sont étendus vers le nord sur 30 ans de 1988 à 2018.

Les informations sur la température basées sur des observations et des modèles climatiques informatisés ont ensuite été utilisées pour prédire où, aux États-Unis, des cas pourraient se produire d'ici la fin du 21e siècle.

Le co-auteur, le professeur James Oliver de l'Université de Caroline du Nord à Charlotte, aux États-Unis, a déclaré : «Il s'agit d'un article historique qui non seulement lie le changement climatique mondial à la maladie, mais fournit des preuves solides de la propagation environnementale de ce pathogène bactérien extrêmement mortel.»

Plusieurs cas à Vibrio en Suède au cours de l'été 2021

L'Agence suédoise de santé publique (Folkhälsomyndigheten) signale au cours de l'été 2021, 29 cas d'infection plus grave par Vibrio dans des plaies ou du sang en juillet et août. Source Outbreaks News du 18 septembre 2021.

Mise à jour au 17 septembre 2021

Au cours de l'été 2021, 29 cas d'infections à Vibrio plus graves dans les plaies ou le sang (parfois appelées fièvre ulcéreuse de bain) ont été signalés. La plupart de ces cas ont été signalés au cours du mois de juillet (24 cas) qui était chaud avec des températures d'eau élevées. Lorsque l'eau saumâtre et salée, mais aussi l'eau douce, atteint 20°C et plus, les bactéries vibrions naturelles se développent et le risque d'infection lors de la baignade augmente. Les cas ont principalement été signalés dans les paysages côtiers du Götaland et du Svealand et, comme auparavant, la majorité des cas ont plus de 65 ans et plus d'hommes que de femmes.Pour prévenir les cas de maladie, le bain est déconseillé si vous avez des plaies importantes, surtout si vous êtes âgé et/ou avez un système immunitaire affaibli.

Le premier cas documenté de Vibrio vulnificus en Suède remonte à 1995 chez une femme de 90 ans qui présentait de la fièvre, un malaise et une cellulite après avoir subi un léger traumatisme à un orteil.

Par ailleurs, selon une mise à jour de l’ECDC du 27 août 2021,

Au 26 août 2021, l'adéquation environnementale pour la croissance de Vibrio dans la mer Baltique a été identifiée comme très faible. Pour les cinq prochains jours dans l'ensemble, l'aptitude environnementale à la croissance de Vibrio dans la mer Baltique est considérée comme très faible.

En dehors des pays de l'UE/EEE, l'adéquation environnementale de la croissance de Vibrio dans la mer Baltique a été identifiée comme très faible et elle le restera au cours des cinq prochains jours.

Au 26 août 2021, la Finlande a signalé 12 cas supplémentaires d'infections à Vibrio. Au total, 18 cas ont été confirmés en 2021, dont neuf sont issus de prélèvements sanguins et ces cas incluent un décès.

En 2021 et au 12 août, l'Allemagne a signalé un décès après une infection à Vibrio.

Avis aux lecteurs

Pour mémoire, il y a eu 114 produits alimentaires rappelés du 13 au 18 septembre 2021et 209 produits alimentaires rappelés depuis le début du mois de septembre 2021, et nous n'en sommes qu'à mi chemin de septembre ...

Voici une liste des causes de ces rappels du 13 au 18 septembre :

- oxyde d’éthylène: 102

- Salmonella: 3

- étiquetage: 2

- Listeria monocytogenes: 1

- Escherichia coli: 1

- Bacillus cereus: 1

- acariens: 1

- allergène: 1

- défaut d’étanchéité: 1

- moisissures: 1

E. coli, Listeria et Vibrio dans les produits de la mer selon une étude

 

Il va être question d'un article paru dans Foodborne Pathognes and Disease au sujet de la présence d'agents pathogènes d'origine alimentaire dans les produits de la mer et un classement des risques. Source Food Safety News.

Des chercheurs ont étudié la présence de certains agents pathogènes d'origine alimentaire dans les produits de la mer collectés en Turquie.

L'étude a examiné les niveaux de bactéries coliformes, E. coli, Listeria monocytogenes, Vibrio vulnificus et Vibrio cholerae dans 700 échantillons de poissons de mer crus, de moules crues, de crevettes crues et de calamars crus.

Près de la moitié des produits de la mer analysés étaient contaminés par des bactéries coliformes. Près d'un sur cinq, soit 131 échantillons sur 700, était contaminé par E. coli, 60 par Listeria monocytogenes et 24 par Vibrio vulnificus. Vibrio cholerae n'a pas été retrouvé.

La qualité microbiologique des produits de la mer peut varier en fonction des conditions environnementales, de la qualité de l'eau, de la température de l'eau, de la salinité, de la distance des zones résidentielles et de la pollution, de la flore bactérienne naturelle de l'eau, de la nourriture consommée par les poissons, des méthodes de pêche et des conditions de refroidissement.

Les produits de la mer et les poissons étant sensibles à une contamination secondaire, la phase d’achat, les traitements pendant le processus de préparation et le respect des règles d’hygiène par les consommateurs sont importants pour la sécurité des aliments.

Résultats pour E. coli et Listeria

Tous les échantillons ont été collectés à Istanbul, Turquie, sur les marchés de gros de poisson, les marchés aux poissons, les marchands de poisson et les bazars. Selon l'étude publiée dans la revue Foodborne Pathogens and Disease (article disponible en intégralité -aa), 400 échantillons de poissons crus tels que de la dorade royale, du bar, le loup et du chinchard, et 100 des autres types, figuraient parmi eux.

Le nombre d'échantillons positifs pour les bactéries coliformes pour le poisson cru, les moules crues, les crevettes crues et les calmars crus était respectivement de 210, 47, 41 et 39.

E. coli a été détecté dans 67 échantillons de poisson cru, 21 moules crues, 24 crevettes crues et 19 échantillons de calamars crus. Listeria monocytogenes a été retrouvé dans 29 échantillons de poisson cru, 16 de moules crues, 11 de crevettes crues et quatre de calamars crus.

Les études sur la présence de Listeria monocytogenes dans les produits de la mer sont limitées. Les chercheurs ont déclaré que leurs résultats montrent qu'il existe un risque sérieux dans ces produits. En particulier, on considère que le manque de compréhension de l'épidémiologie des produits de la mer augmente le risque pour la santé des consommateurs.

Le risque Vibrio

Le nombre d'échantillons positifs pour Vibrio vulnificus pour le poisson cru, les moules crues, les crevettes crues et les calmars crus était respectivement.de 11, neuf, quatre et zéro.

« Lorsque la pathogénicité de Vibrio vulnificus et les résultats possibles de l'infection sont pris en compte, les moules crues vendues non contrôlées par les marchands ambulants sont des facteurs de risque très sérieux pour la santé publique. Un autre danger important lié au Vibrio vulnificus est qu'il ne provoque pas de troubles de l'apparence, de l'odeur et du goût des produits de la mer, tels que les poissons, les huîtres et les moules, dont l'agent est isolé », ont it les chercheurs.

D'autres études sont nécessaires pour révéler les comportements détaillés des agents pathogènes des produits de la mer, le mode de contamination, l'épidémiologie et les structures génétiques des contaminants afin de maximiser la santé des consommateurs.

Pour sensibiliser le public, la formation des employés des produits de la mer à chaque étape de la production est considérée comme importante pour réduire l'incidence des agents pathogènes menaçant la santé publique. L'efficacité des agences gouvernementales dans la chaîne d'approvisionnement des produits de la mer est également importante, selon l'article.

Un management de la qualité globale et des bonnes pratiques d'hygiène devraient être appliquées à tous les points de vente d'aliments prêts à consommer et devraient être contrôlées au niveau ministériel pour minimiser le risque de microbes et de parasites afin de protéger la santé des consommateurs, ont dit des chercheurs.

OMS/FAO : Outils d'évaluation des risques pour Vibrio parahaemolyticus et Vibrio vulnificus associés aux produits de la mer

Vient de paraître « Outils d'évaluation des risques pour Vibrio parahaemolyticus et Vibrio vulnificus associés aux produits de la mer », OMS, février 2020.

Il y a eu une augmentation des foyers rapportés et des cas de maladies d'origine alimentaire attribués aux espèces pathogènes de Vibrio. En conséquence, il y a eu plusieurs cas où la présence de Vibrio spp. pathogène. dans les produits de la mer a entraîné une perturbation du commerce international. Le nombre d'espèces de Vibrio reconnues comme pathogènes humains potentiels augmente. Les préoccupations en matière de sécurité sanitaire des aliments associées à ces micro-organismes ont conduit à la nécessité d'une évaluation des risques microbiologiques pour appuyer la prise de décisions en matière de management des risques pour leur contrôle.

V. parahaemolyticus est considéré comme faisant partie de la microflore autochtone dans les environnements estuariens et côtiers des zones tropicales à tempérées. Les problèmes de sécurité sanitaire des aliments ont été particulièrement évidents avec V. parahaemolyticus. Il y a eu une série de flambées épidémiques de maladies d'origine alimentaire à V. parahaemolyticus dues à la consommation de fruits de mer. En outre, des foyers à V. parahaemolyticus se sont déclarés dans des régions du monde où il n'avait pas été signalé auparavant. La grande majorité des souches isolées de patients atteints d'une maladie clinique produisent une Thermostable Direct Hemolysin (TDH) codée par le gène tdh. Les souches cliniques peuvent également produire une TRH (TDH-Related Hemolysin) codée par le gène trh. Il a donc été considéré que les souches qui possèdent les gènes tdh et/ou trh et produisant de la TDH et/ou de la TRH devraient être considérées comme les plus susceptibles d'être pathogènes. V. vulnificus peut occasionnellement provoquer une gastro-entérite légère chez des individus en bonne santé après la consommation de mollusques bivalves crus. Il peut provoquer une septicémie primaire chez les personnes atteintes de maladies chroniques préexistantes, en particulier les maladies du foie ou l'alcoolisme, le diabète, l'hémochromatose et le VIH/sida. Il peut s'agir d'une maladie grave, souvent mortelle, avec l'un des taux de mortalité les plus élevés de tous les pathogènes bactériens d'origine alimentaire connus.

La 41e session du Comité du Codex sur l'hygiène alimentaire (CCFH) a demandé à la FAO/OMS de convoquer une réunion d'experts pour examiner un certain nombre de questions relatives à V. parahaemolyticus et V. vulnificus, notamment:

procéder à la validation des modèles de risque prédictifs développés par les États-Unis d'Amérique sur la base des évaluations des risques FAO/OMS, en vue de construire des modèles plus applicables pour une utilisation plus large entre les pays membres, y compris des ajustements pour les variations de virulence des souches et les facteurs écologiques;

passer en revue les informations disponibles sur la méthodologie de test et recommander des méthodes microbiologiques pour Vibrio spp. utilisé pour surveiller les taux de Vibrio spp. pathogènes dans les fruits de mer et/ou l'eau ; et,

effectuer une validation des taux de croissance et des temps de doublement pour V. parahaemolyticus et V. vulnificus chez Crassostrea virginica (huître de l'Est ou américaine) en utilisant des souches isolées de différentes parties du monde et de différentes espèces de mollusques bivalves.

La réunion d'experts demandée s'est tenue les 13 et 17 septembre 2010, et ce rapport est le résultat de cette réunion. Plutôt que d'entreprendre un exercice de validation, la réunion a jugé plus approprié d'entreprendre une évaluation des calculateurs de risques existants en vue de déterminer le contexte dans lequel ils sont applicables et les modifications potentielles qui devraient être apportées pour étendre leur application au-delà de ce contexte. Un outil de calcul simplifié pourrait alors être développé pour répondre régulièrement à d'autres questions spécifiques. Cela dépendrait de la disponibilité des données appropriées et des efforts doivent être déployés dans ce sens.

Le développement de méthodes de surveillance microbiologique, en particulier de méthodes moléculaires pour V. parahaemolyticus et V. vulnificus, évolue rapidement. Cela signifie que l'identification de toute méthode unique aux fins de la surveillance de ces pathogènes est difficile et aussi de valeur limitée car la méthode est susceptible d'être dépassée d'ici quelques années. Par conséquent, plutôt que de faire une seule recommandation, la réunion a jugé plus approprié d'indiquer quelques-unes des options de suivi disponibles, tandis que la décision finale sur la méthode choisie dépendra dans une large mesure de l'objectif spécifique de l'activité de suivi, du coût, la rapidité avec laquelle les résultats sont requis et la capacité technique du laboratoire.

La réunion a estimé que la surveillance de l'eau de mer pour V. parahaemolyticus et V. vulnificus dans les zones de croissance et de récolte des bivalves a une valeur limitée en termes de prévision de la présence de ces pathogènes chez les bivalves. Aucune relation linéaire entre les taux des vibrions dans l'eau de mer et les bivalves n'a été retrouvée et la relation qui existe peut varier d'une région à l'autre, les Vibrio spp. etc. De plus, les taux d'espèces préoccupantes de Vibrio dans l'eau de mer ont tendance à être très bas. Cela représente un défi supplémentaire car la méthode utilisée devrait avoir un niveau de sensibilité approprié pour leur détection. Néanmoins, cela n'empêche pas de tester l'eau de mer pour ces vibrions; par exemple, dans certaines situations, les tests peuvent permettre de comprendre la microflore aquatique dans les zones de croissance. La surveillance des fruits de mer pour ces vibrions pathogènes a été considéré comme le moyen le plus approprié pour avoir un aperçu des taux des pathogènes dans ces produits au moment de la récolte. La surveillance continue pourrait être coûteuse, il pourrait donc être envisagé d'entreprendre une étude au cours d'une année et de l'utiliser comme moyen d'établir une relation entre V. parahaemolyticus total et pathogène et V. vulnificus dans les fruits de mer et les facteurs abiotiques tels que la température et la salinité de l'eau. Une fois qu'une telle relation est établie pour la zone de récolte d'intérêt, la mesure de ces facteurs abiotiques peut être un moyen de surveillance plus rentable. 

La réunion a entrepris un exercice d'évaluation plutôt que de tenter de valider les modèles de croissance existants. Les experts ont estimé que le modèle de croissance JEMRA pour V. vulnificus et le modèle de croissance FDA pour V. parahaemolyticus étaient appropriés pour estimer la croissance de l'huître américaine (Crassostrea virginica). Le modèle de croissance JEMRA pour V. vulnificus était approprié pour estimer la croissance d'au moins une autre espèce d'huître, Crassostrea ariakensis. Le modèle de la FDA pour V. parahaemolyticus était également approprié pour estimer la croissance d'au moins une autre espèce d'huître, Crassostrea gigas, mais n'était pas approprié pour prédire la croissance de l'huître creuse de Sydney (Saccostrea glomerata). Il existe certaines preuves que les modèles de V. parahaemolyticus actuellement utilisés prévoient une croissance à des températures plus élevées (par exemple > 25°C) dans les huîtres vivantes. Ce phénomène nécessite une enquête plus approfondie. 

Les études sur les modèles de croissance ont été principalement entreprises en utilisant des populations naturelles de V. parahaemolyticus car celles-ci étaient considérées comme les plus représentatives. Les données étaient limitées et incohérentes en ce qui concerne l'impact de la souche sur le taux de croissance, bien que des études récentes sur des huîtres vivantes suggèrent qu'il existe des différences entre les populations possédant tdh/trh (pathogènes) par rapport aux populations totales ou non pathogènes de V. parahaemolyticus. Il n'y avait pas de données pour évaluer la performance des modèles de croissance dans d'autres espèces d'huîtres ou d'autres mollusques filtrants ou autres fruits de mer et, par conséquent, son utilisation dans ces produits n'a pas pu être appuyée. Si les modèles sont utilisés, il devrait y avoir une compréhension claire de l'incertitude associée. Cela indique un manque de données qui doit être comblé avant que les évaluations des risques puissent être étendues de manière significative.

A la recherche de Vibrio vulnificus en France et en Europe

La DGAL du ministère de l’agriculture vient de publier une instruction technique, DGAL/SDSSA/2019-486, du 2 juillet 2019 concernant le « Jugement de conformité des lots de produits de la pêche et de coquillages vivants trouvés contaminés par des Vibrio suite à des contrôles officiels (version modifiée de l'IT 2014-487) ».

La présente note a pour objet de définir les critères de jugement de conformité d'un lot de produits de la pêche ou de coquillages vivants trouvés contaminés par des Vibrio. Les informations contenues dans l'Instruction technique 2014-487 ont été actualisées, notamment pour ce qui concerne la méthode d'analyse et les modalités de gestion des lots contaminés. Les modifications apportées à la précédente version de 2014 sont surlignées. 

L’annexe I, « Les Vibrio spp. d’intérêt en santé publique », est bien faite, mais il y a une petite ‘erreur’ me semble-t-il,

A ce jour, aucune infection à Vibrio vulnificus d’origine alimentaire n’a été rapportée en Europe ou en France Métropolitaine.

Ce constat est assez répandu comme nous le verrons en fin d’article, mais il me semble que c’est faux … et voici différents éléments pour étayer mon propos,

En mai 2015, l’Anses et la DGAL du ministère de l’agriculture nous avaient proposé un Bulletin épidémiologique n°68, 2015, « spécial vigilance sur la chaîne alimentaire » dans lequel il était question de « Vibrio impliqués en pathologie humaine: une étude de leur répartition dans des produits de la mer consommés en France ».

Il est indiqué que « Ces premiers résultats révèlent que les produits de la mer peuvent présenter un danger potentiel pour la sécurité du consommateur en France et soulignent l’importance d’une surveillance de ces espèces. »

La conclusion souligne

Les résultats collectés au cours de cette étude donnent une indication intéressante sur la présence des espèces V. parahaemolyticus, V. cholerae et V. vulnificus dans les produits locaux ou importés mis en vente sur le marché français, et en particulier sur la présence de souches portant des gènes codant pour des facteurs de pathogénicité connus.

Ceci souligne la nécessité d’une vigilance accrue et d’un contrôle régulier des produits régionaux ou importés, dont la mise en œuvre systématique pourrait évoluer à la faveur du développement récent de méthodes de détection et de quantification. Un renforcement de la surveillance des produits de la mer permettra de mieux anticiper la menace potentielle de ces pathogènes en santé humaine.

La menace potentielle de ces pathogènes en santé humaine existe …

Ainsi un document de l’InVS rapporte des informations sur « Les infections à vibrions non cholériques en France : cas identifiés de 2001 à 2003 par le Centre national de référence des vibrions et du choléra ».

Pour 13 cas, le contexte de contamination sur le territoire français a pu être clairement établi. Parmi ces cas, 6 infections étaient consécutives à la consommation de produits de la mer (5 infections à V. cholerae, se manifestant par des syndromes divers, 1 infection à V. parahaemolyticus), 3 infections à V. cholerae et 4 infections à V. vulnificus étaient consécutives à une exposition à l’eau de mer ou de piscine. 

En août 2008, en France, il est rapporté,

Lundi 4 août, un homme de 73 ans est décédé à l'hôpital de Sète d'une septicémie. L'infection résulte d'une  blessure à la main (par piqûre de la nageoire dorsale et l'hameçon) acquise le Jeudi 31 Juillet lors d'une partie de pêche dans l'étang de Vic (Hérault). 

La symptomatologie, l'évolution clinique et les analyses biologiques permettent de fortement suspecter une infection par Vibrio vulnificus. Une confirmation par le Centre national de référence est attendue en début de semaine prochaine. Il s'agirait du 1er cas confirmé de contamination en région méditerranéenne en France.

L’Allemagne a rapporté en juillet 2019 son premier décès dû à Vibrio vulnificus depuis quatre ans.

Le rapport de 2017 du Centre national de référence (CNR) des Vibrions et du Choléra (VNRVC) indique :

L'analyse des données de surveillance cliniques, microbiologiques et épidémiologiques, des cas confirmés depuis 1995 en France a été menée en 2017 conjointement par le CNR et Santé Publique France; 10 cas de vibriose en moyenne ont été rapportés annuellement par le CNRVC, une augmentation sans précédents a été enregistrée en 2017 avec 26 cas d’infections à vibrions non cholériques, associés à 6 espèces de Vibrio, majoritairement V. cholerae (n = 10) et V. parahaemolyticus (n = 8). Un lien avec le milieu marin, consommation de produits de la mer ou contact direct avec l'eau de mer, a été établi dans 80% des cas, qui se sont manifestés majoritairement par des gastroentérites.

Les cas ont été fréquemment signalés dans les zones côtières et particulièrement sur la côte atlantique, mais une notion d'exposition probable à l'étranger, dans des pays à risque, a été signalée dans 40% des cas. Cette augmentation du nombre de cas pourrait être attribuée aux températures élevées enregistrées en 2017 et/ou à l'évolution des techniques de diagnostic. 

Autres documents,

• « The emergence of Vibrio pathogens in Europe: ecology, evolution, and pathogenesis (Paris, 11–12th March 2015) », paru dans Fontiers in Microbiology, qui relate des cas d’infection à infection à Vibrio vulnificus …
• Environmental occurrence and clinical impact of Vibrio vulnificus and Vibrio parahaemolyticus: a European perspective. Environmental Microbiology Reports, 2, 7-18.

L’EFSA note aussi dans ce document de 2012 que des cas sporadiques à Vibrio vulnificus ont été identifiés en Europe,

Dans un article de Food Safety News de mai 2019, Les lignes directrices sur la sécurité sanitaire des produits de la mer se rapprochent après une réunion sur Vibrio.

« La situation en Europe est très différente, alors que nous avons des infections à Vibrio parahaemolyticus, mais nous ne voyons pas à la taille et l’ampleur de celles qui ont lieu aux Etats-Unis », a déclaré Rachel Hartnell, du Cefas Weymouth Laboratory.

Vibrio vulnificus peut être fatal dans une forte proportion de cas, il est donc grave mais rare, nous ne voyons pas de cas en Europe. Même sans réseau de surveillance épidémiologique si des personnes décédaient, nous le saurions. Si vous présentez Vibrio parahaemolyticus ou Vibrio vulnificus, cela n’est pas notifié et c'est là le problème.

A suivre …