Présence de Listeria et de Escherichia coli dans des fruits et des légumes surgelés collectés en distribution et en restauration en Angleterre, 2018-2019

Voici une étude parue dans International Journal of Food Microbiology à propos de la présence de Listeria et de Escherichia coli dans des fruits et des légumes surgelés collectés en distribution et en restauration en Angleterre, 2018-2019.

Faits saillants

• La qualité microbiologique de plus de 1 000 fruits et légumes surgelés a été étudiée.
• Listeria a été détectée dans 2% des fruits et 24% des légumes.
• Dix clusters de L. monocytogenes ont été identifiés indiquant une origine commune.
• Dans huit des clusters, des isolats ont été récupérés à partir d'un seul type de légume.
• Des souches de L. monocytogenes provenant de légumes ont également été isolées de patients infectés.

Résumé

Des légumes surgelés ont déjà été associés à des épidémies de listériose aux États-Unis et en Europe. Une épidémie à Listeria monocytogenes sérogroupe 4 a provoqué 53 cas dans cinq pays européens entre 2015 et 2018. Le séquençage du génome entier a indiqué que du maïs doux congelé d'un producteur hongrois était à l'origine de la maladie. Cependant, des données limitées sont disponibles sur la prévalence de Listeria dans les produits surgelés. Une étude sur les fruits et légumes surgelés des établissements de restauration et de distribution en Angleterre a donc été réalisée pour évaluer leur qualité microbiologique vis-à-vis de Listeria et Escherichia coli.

Entre décembre 2018 et avril 2019, 1 050 échantillons de fruits et légumes surgelés ont été prélevés. Parmi ceux-ci, 99% étaient de qualité microbiologique satisfaisante ou limite. Onze échantillons (1%) contenaient plus de 100 ufc/g de Escherichia coli (considéré comme insatisfaisant si les produits sont étiquetés comme prêts à consommer). Listeria monocytogenes ou d'autres espèces de Listeria ont été détectées dans six échantillons (2%) de fruits par rapport à 167 échantillons (24%) de légumes et six échantillons (26%) de mélanges de fruits et légumes, mais aucun n’était supérieur à 100 ufc/g. La caractérisation par séquençage du génome entier de 74 isolats de L. monocytogenes a identifié dix groupes génétiques indiquant une source commune. Pour 8 des 10 clusters, les isolats provenaient de types d'aliments homogènes: quatre étaient du maïs doux et il y avait une cluster chacun pour des haricots, des petits pois, des poivrons et du brocoli. Il y avait cinq associations génétiques entre les isolats de légumes surgelés et des cas cliniques de listériose, y compris deux cultures de haricots surgelés qui ne se distinguaient pas de la souche épidémique de maïs doux de 2015-2018.

Cette étude indique que L. monocytogenes était présent dans 10% des légumes surgelés et même si les produits ne sont généralement pas prêts à consommer et sont destinés à être cuits avant la consommation, ceux-ci peuvent provoquer des cas de maladie. Des instructions claires de cuisson et de manipulation sont donc requises sur ces produits pour garantir que la santé des consommateurs n'est pas mise en danger, et des mesures de bonnes pratiques de fabrication appropriées doivent être suivies par toutes les usines de congélation de fruits et légumes afin de réduire la contamination par Listeria pendant la transformation.

Mots clés

Sécurité des aliments ; Séquençage du génome complet ; Listeria monocytogenes ; maladies infectieuses d'origine alimentaire ; Surveillance des aliments.

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Un fromager suisse sous enquête après 34 cas de listériose dont 10 décès

« Un fromager suisse sous enquête après 10 décès à la listeria », selon Le Figaro avec l’AFP.

La justice suisse enquête sur un fromager dont les produits infestés de listeria auraient tué dix personnes depuis 2018 et rendu 24 autres malades (soit un total de 34 cas -aa), ont indiqué les autorités jeudi.

Cette enquête fait suite à une plainte pénale déposée en juillet par le chimiste intercantonal à l'encontre de ce fromager installé dans le canton de Schwyz, dans le centre de la Suisse, et qui est désormais fermée. Selon la plainte, «dix des 34 personnes tombées malades sont décédées», a indiqué à l'AFP la procureure de la région de Innerschwyz, Franziska Steiner. Suite à la plainte, «une procédure pénale en rapport avec l'infestation de listeria dans les produits» de la fromagerie a été ouverte, a-t-elle ajouté. 

Le parquet régional, en collaboration avec la police cantonale de Schwyz, enquête désormais pour savoir si le fromager est «responsable» des décès et «s'il a enfreint la loi sur les denrées alimentaires», a-t-elle détaillé, en soulignant que la présomption d'innocence s'applique. Entre les mois de mars et de mai, quatre patients du Centre hospitalier du Valais romand, à Sion, avaient été infectés après avoir consommé un fromage schwyzois, avaient révélé des journaux suisses début mai. L'un des patients, souffrant d'une forme grave de cancer, est décédé, selon l'agence de presse suisse ATS. 

Selon cette même source, le fromage incriminé est du brie. Début mai, la fromagerie avait informé ses clients après avoir découvert de la listeria dans ses produits. La fromagerie avait aussi alerté l'Office fédéral de la sécurité alimentaire et des affaires vétérinaires, qui avait lancé une mise en garde auprès des consommateurs.

Selon Food Safety News,

Plus de 25 articles vendus dans toute la Suisse ont été rappelés et la distribution comprenait également la Belgique et l'Allemagne.

Au cours du même mois, des responsables de l'Office fédéral de la sécurité alimentaire et des affaires vétérinaires (OSAV) ont déclaré à Food Safety News qu'au moins 11 personnes avaient été infectées par Listeria avec deux décès et qu'une analyse était en attente pour 10 autres infections pour voir si elles appartenaient aux cas groupés de l’éclosion.

Sur les 11 cas confirmés, cinq étaient des hommes et six étaient des femmes âgées de 66 à 86 ans. Les cas d’infection se sont produits dans sept cantons ou régions du pays. Le fromage était fabriqué à partir de lait pasteurisé.

Le Centre Hospitalier du Valais Romand avait précédemment indiqué que de fin mars à début mai, quatre patients avaient reçu un diagnostic de listériose invasive. Les patients infectés ont consommé du fromage pendant l'hospitalisation mais la marque n'était pas claire. Trois personnes se sont rétablies mais une personne souffrant de problèmes de santé sous-jacents est décédée.

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Rentrée des chroniques de l'ignorance ou de l'agribashing systémique sur Europe 1

On lira l’article de seppi sur « Mme Fanny Agostini : les chroniques matinales de l'ignorance reprennent sur Europe 1 »

Les Rendez-vous à la ferme, chroniques matinales de Mme Fanny Agostini sur Europe 1 s'étaient arrêtées le 8 mai 2020. On pouvait pousser un ouf de soulagement tant quelques-unes de ses interventions étaient nullissimes et concouraient à la désinformation sur les réalités de l'agriculture.

Elles viennent de reprendre le lundi 24 mai 2020 avec « Culture de la betterave : les abeilles menacées à cause des néonicotinoïdes ».

Un festival !

Même écho sur agri-mutuel, « Chronique de Fanny Agostini sur Europe 1, les agris veulent un droit de réponse ».

Pour sa rentrée chez Europe 1, lundi 24 août, Fanny Agostini consacrait sa rubrique « Rendez-vous à la ferme » aux betteraves et à la dérogation accordée pour utiliser les néonicotinoïdes pour les semis 2021. Et cela n'a pas manqué de faire réagir les acteurs du monde agricole sur les réseaux sociaux notamment. Certains dénombrent en 2 min 24 de chronique pas moins de 11 contrevérités. Les agriculteurs réclament un droit de réponse.

Pour le retour de la rubrique « Rendez-vous à la ferme » en cette rentrée 2020 sur Europe 1, Fanny Agostini a choisi de s’intéresser, lundi 24 août, à un sujet phare de l’actualité agricole de l’été : les betteraves et la dérogation d’utilisation des néonicotinoïdes en enrobage de semences pour les semis 2021 contre les pucerons. Depuis sa ferme pédagogique de Boisset en Haute-Loire, la journaliste dénonce cette décision politique et le « danger qu’elle représente pour les abeilles ».

@emma_ducros @nicole_ouvrard @europe1presse @Fanny_Agostini @RemDumDum @ChrRousseau @ChLambert_FNSEA @LaVieagricoleYP @agribuzztv @LCDAgri @antoinedabbundo @artepierre @jmleluc @agribuzztv @FBenabadji @DavidBarroux https://t.co/u3tKbaaNEE

— JEAN-MARIE SERONIE (@jmseronie) August 25, 2020

 Autre élément à charge Agriculteur dans l’Aisne, Vincent Guyot reprend également, point par point, la chronique radio et demande un droit de réponse dans va vidéo à voir ...

– « La betterave sucrière est une plante bisanuelle, donc elle ne fleurit pas la première année, c’est-à-dire celle où je la produis. »

– « Les néonicotinoïdes ont été interdits en France il y a deux ans sur la betterave, mais sont toujours disponibles pour les colliers anti-puces des chiens et chats et pour les tue-mouches. »

– « Les guêpes ne consomment pas forcément de pucerons car elles arrivent trop tard. »

– « Je suis un agriculteur qui ne pratique pas la monoculture de betterave, parce que ça n’existe pas. Les betteraves font suite à des céréales, c’est la rotation. »

– « Je ne suis pas un agriculteur productiviste, je suis un agriculteur producteur, dessinateur du paysage, je suis un agriculteur nourricier d’une France qui souhaite bien manger »

– « Et si à terme, il n’y a plus de de betteraves à sucre, c’est tant mieux il y aura plus d’abeilles, reprenant les termes exacts de la journaliste. Et bien, je ne serai plus là », conclut l’agriculteur.

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Qu'est-ce que le test salivaire de détection du COVID-19 ?

« Qu'est-ce que le test salivaire de détection du COVID-19 ? », source American Society for Microbiology.

Qu'est-ce que le test salivaire direct ?

Il s'agit d'un test pour détecter l'acide nucléique du virus SARS-CoV-2 qui cause le COVID-19. Comme d'autres tests COVID qui recherchent l'acide nucléique du virus (c'est-à-dire l'ARN), il doit toujours être testé dans un laboratoire clinique certifié. Ce n'est pas un test rapide qui peut être fait près du patient; les patients doivent encore attendre que leurs résultats reviennent du laboratoire.

Pourquoi ce test reçoit-il autant d'attention?

• Facile à collecter: Ce test ne nécessite que la collecte de salive dans un récipient stérile, par opposition à un écouvillon nasal profond (c'est-à-dire l'écouvillon nasopharyngé ou NP), qui peut être inconfortable pour le patient et nécessite un personnel formé portant une protection individuelle spéciale équipement (EPI) à collecter.
• Moins de fournitures de collecte requises: la salive peut être collectée dans des conteneurs stériles largement disponibles, bon marché et ne nécessitant pas de conservateurs ou de conteneurs spéciaux. En ces temps, pendant lesquels les approvisionnements sont rares, c'est très souhaitable.
• Moins d'étapes dans le test: le test de recherche d'acides nucléiques par amplification moléculaire (c.-à-d. PCR) nécessitent généralement que l'ARN viral soit retiré de l'échantillon et purifié. C'est ce qu'on appelle l'extraction, et les réactifs utilisés pour l'extraction ont également été rares tout au long de cette pandémie. Le test salivaire direct (ou SalivaDirect) utilise une procédure simple qui ne nécessite pas d'instrumentation pour ouvrir le virus et enlever l'ARN viral. Cet ARN est ensuite testé par amplification moléculaire.
• Accessibilité de l'instrumentation: De nombreux tests ARN SARS-CoV-2 actuels sont conçus pour être exécutés sur des instruments spécifiques, généralement fabriqués par le fabricant du test. Le test SalivaDirect peut être effectué sur plusieurs types d'instruments trouvés dans des laboratoires moléculaires cliniques spécialisés, permettant potentiellement à ces laboratoires de commencer les tests sans acquérir d'instruments supplémentaires et coûteux.



Les tests moléculaires typiques du SARS-CoV-2 par rapport au test SalivaDirect de la collecte des échantillons aux résultats. Source American Society for Microbiology.

Quelles sont les limites de ce test?

• Professionnels qualifiés: Le test nécessite un personnel de laboratoire hautement qualifié avec une expérience en microbiologie et en biologie moléculaire pour exécuter le test.
• Dépenses: Bien que les développeurs de tests aient déclaré que le coût prévu serait inférieur à 5 dollars par test, en réalité, le coût sera plus élevé si l'on tient compte des coûts des produits chimiques, de l'instrumentation, de la main-d'œuvre hautement qualifiée, de la maintenance des tests et des frais généraux du laboratoire. Les coûts réels seront similaires à ceux des tests ARN SARS-CoV-2 actuels, les économies de réactifs étant plus que compensées par une main-d'œuvre accrue.
• Problèmes de collecte: La salive peut être difficile à collecter chez certains patients, peut encore présenter un risque d'aérosol et a tendance à contaminer l'extérieur du contenant. Des précautions doivent être prises pour éviter la contamination du sang et des expectorations, car ceux-ci peuvent interférer avec les tests moléculaires.
• Difficile à manipuler: La salive peut être collante et épaisse et difficile à manipuler pour les laboratoires de manière sûre et précise. Les machines automatisées de manipulation d'échantillons ont des problèmes avec cela.
• Sensibilité du test: La salive est 10 à 50 fois moins sensible en tant que type d'échantillon qu'un écouvillon nasopharyngé. Les patients ayant une faible charge virale peuvent être faussement testés négatifs. D'autres recherches sur les tests de salive ont montré une perte de sensibilité similaire.
• Développement et utilisation des tests: Les tests PCR manuels, comme le test SalivaDirect, nécessitent une main-d'œuvre nettement plus qualifiée que les autres tests disponibles. Ce test est également difficile à adapter à des volumes élevés et utilise encore de nombreux réactifs et consommables.

S'agit-il d'un test rapide qui peut être effectué là où les échantillons sont prélevés? Qui peut effectuer le test?

Non, il ne s'agit pas d'un test au point de service qui peut être effectué dans les cabinets médicaux ou à proximité du patient, ni à la maison. Par conséquent, il n'est pas considéré comme un test rapide. Il est à peu près aussi rapide que les tests en laboratoire existants.

Le test SalivaDirect nécessite un laboratoire de haute complexité avec une expérience dans les tests moléculaires manuels avec 3 zones de test physiquement séparées, une avec des enceintes de sécurité biologique. La plupart des laboratoires hospitaliers ne peuvent pas faire cela. Les tests sont effectués par des techniciens de laboratoire hautement qualifiés. Les laboratoires doivent respecter toutes les exigences réglementaires avant de fournir des tests.

Document préparé par l’American Society for Microbiology’s Clinical and Public Health.

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De la consommation des œufs, selon l'Anses

L'Anses propose une infographie sur la Consommation des œufs.

Cliquez sur l'image pour l'agrandir.

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Des responsables danois tentent de trouver l’origine de trois éclosions

« Des responsables danois tentent de trouver l’origine de trois éclosions », source article de Joe Whitworth paru le 26 août 2020 dans Food safety News.

Les responsables de la santé publique au Danemark étudient trois éclosions qui ont rendu malade près de 50 personnes, une causée par le virus de l’hépatite A et deux par des souches rares de Salmonella.

Depuis juin, le Statens Serum Institut (SSI), le Fødevarestyrelsen (Administration vétérinaire et alimentaire danoise) et le DTU Food Institute ont investigué sur trois éclosions suspectées d'origine alimentaire qui ont fait que 29 personnes ont eu un traitement hospitalier et des cas répartis dans tout le pays. Les sources sont encore inconnues.

L'éclosions d'hépatite A concerne 14 personnes et 11 d'entre elles ont été hospitalisées. Une éclosion à Salmonella Strathcona comprend 23 personnes et une autre à Salmonella Kasenyi compte 11 patients.

Les soupçons pèsent sur les aliments importés

Luise Müller, épidémiologiste au SSI, a dit que les malades n'avaient pas voyagé à l'étranger ni participé à des événements communs.

« Cela suggère donc que les éclosions sont dues aux aliments vendus dans tout le pays. Et puisque ni le virus de l'hépatite A, ni les deux types de Salmonella en question ne sont quelque chose que nous voyons normalement au Danemark, nous recherchons probablement un aliment importé dans les trois cas », a-t-elle dit.

Müller a ajouté que le meilleur conseil que l’agence puisse actuellement donner est de suivre les conseils de l’Administration vétérinaire et alimentaire danoise sur une bonne hygiène en cuisine, rincer les fruits et légumes, faire bouillir les baies surgelées et séparer la viande crue des aliments prêts à consommer.

L'éclosion d'hépatite A a touché huit femmes et six hommes âgés de 17 à 63 ans. Ils sont tombés malades d'avril à juillet 2020. Les patients vivent dans tout le pays et 11 ont été hospitalisés. Les virus des personnes touchées ont été typés du génotype 1B.

Statens Serum Institut interroge les patients pour savoir comment ils sont tombés malades. Les premiers entretiens ont montré qu'ils ne sont pas aller en voyage, ne se connaissent pas et n'ont pas participé à des événements communs.

L'infection par le virus de l’hépatite A n'est pas une maladie qui provoque généralement des éclosions au Danemark. Une éclosions, avec un génotype différent, en 2017 et 2018 comptait 27 patients et était liée à des dattes importées d'Iran. Une éclosion de 2012 et 2013 qui a touché 71 Danois a été attribuée à des fraises congelées produites en Afrique du Nord.

Une infection par le virus de l'hépatite A (VHA) peut varier en gravité d'une maladie bénigne durant quelques semaines à une maladie grave qui dure plusieurs mois. La maladie survient généralement dans les 15 à 50 jours suivant la consommation ou la consommation d'aliments ou d'eau contaminés. Les symptômes de l'infection comprennent la fatigue, les nausées, les vomissements, les douleurs abdominales, la jaunisse, les urines foncées et les selles pâles.

Première éclosion à Salmonella Kasenyi

De fin mai à août, 23 personnes ont été enregistrées avec Salmonella Strathcona au Danemark.

Les malades vivent dans tout le pays et il y a 19 femmes et 4 hommes âgés de 3 à 95 ans. Au total, 15 patients ont été hospitalisés.

Le séquençage du génome entier a révélé que les souches étaient étroitement liées les unes aux autres et que le type de séquence était 2559. Strathcona est un sérotype très rare et n'a provoqué qu'une seule éclosion au Danemark dans le passé en 2011, qui a été attribuée à de petites tomates d'Italie.

Du 10 juin au 16 juillet 2020, 11 personnes ont été enregistrées avec Salmonella Kasenyi dans le pays.

Les patients sont neuf femmes et deux hommes âgés de 27 à 78 ans. Trois d'entre eux ont dû être hospitalisés. Sept de ces malades vivent à Hovedstaden, deux à Midtjylland et un chacun à Sjælland et Syddanmark.

Le séquençage du génome entier a révélé que les souches étaient étroitement liées et du type de séquence était 4546. Il s'agit d'un sérotype rare et au Danemark, une éclosion avec ce sérotype n'a jamais été observée auparavant.

La plupart des personnes infectées par Salmonella développent des signes 12 à 72 heures après avoir été exposées à la bactérie. Les symptômes peuvent inclure la diarrhée, la fièvre, des crampes abdominales et des vomissements qui durent plusieurs jours.

Sinon, les adultes en bonne santé sont généralement malades pendant quatre à sept jours. Les personnes âgées, les enfants, les femmes enceintes et les personnes dont le système immunitaire est affaibli, comme les patients cancéreux, sont plus susceptibles de développer une maladie grave et des affections graves, parfois mortelles.

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Envois mystérieux de semences non sollicités, une suite ...

« Les envois mystérieux de semences se poursuivent dans le monde entier », source Food Safety News.

Partout dans le monde, des personnes continuent de recevoir des sachets non sollicités de semences qui semblent provenir principalement de Chine.

Les États-Unis, le Canada, l'Inde, Israël, la Pologne, le Japon, l'Irlande, l'Allemagne, l'Australie, le Royaume-Uni et la France font partie des pays concernés.

L’Animal and Plant Health Inspection Service (APHIS) de l’USD, les douanes et la protection des frontières du Département de la sécurité intérieure, le FBI et les départements de l’agriculture de l’État mènent une enquête. La principale préoccupation est le potentiel des semences d'introduire des ravageurs ou des maladies nuisibles qui pourraient nuire à l'agriculture américaine.

Semences identifiées jusqu'à présent

« Nous n'avons connaissance d'aucun risque pour la santé humaine à l'heure actuelle. Avec beaucoup de prudence, les personnes doivent porter des gants et limiter le contact avec les semences. Les personnes qui pensent avoir un problème de santé après avoir touché ces semences doivent contacter leur médecin », ont déclaré des responsables de l'USDA.

Image de la police du Surrey en Angleterre

Les autorités ont également recommandé aux personnes qui manipulaient les semences de se laver soigneusement les mains et de désinfecter tout objet entrant en contact avec elles.

Sur la base d'une analyse préliminaire des échantillons prélevés, les sachets de semences semblent être un mélange d'espèces ornementales, de fruits et légumes, d'herbes et de mauvaises herbes.

Bien que le nombre exact de sachets de semences qui sont entrés dans le pays soit inconnu, des rapports ont été reçus des 50 États.

Les responsables pensent qu'il s'agit d'une «arnaque au brushing» sur Internet, où des vendeurs envoient des articles non sollicités à des consommateurs sans méfiance, puis publient de faux avis pour stimuler les ventes. Les destinataires semblent être des personnes qui ont récemment acheté quelque chose en ligne ou qui ont acheté des semences par le passé.

La source des emballages de semences n'a pas été identifiée et, bien qu'ils semblent provenir de Chine, des rapports ont fait état de paquets provenant de pays comme Taiwan et Singapour.

Déclaré comme jouet ou bijou

Au début du mois d'août, l'Agence canadienne d'inspection des aliments (ACIA) avait reçu des rapports de plus de 750 personnes de toutes les provinces qui avaient reçu des emballages sans demande de semences inconnues.

Les colis sont timbrés comme provenant de plusieurs pays différents et beaucoup sont déclarés comme jouets ou bijoux. Sur la base des inspections visuelles effectuées à ce jour, les semences semblent présenter un faible risque.

Les graines proviennent d’espèces végétales, notamment la tomate, la fraise, la rose et les agrumes, ainsi que de certaines graines de mauvaises herbes courantes au Canada, comme la Capsella bursa-pastoris et la sagesse des chirurgiens.

L'Agence britannique pour la santé animale et végétale (APHA) a dit aux personnes qui ont reçu des semences par la poste de ne pas les planter, ni de les composter car il est possible qu'elles soient porteuses de phytoravageurs ou de maladies qui présentent un risque pour les cultures ou l'environnement.

L'APHA teste des échantillons de semences et recherche s'il s'agit d'une arnaque au brushing. Cependant, le problème est que les articles entrent dans le pays étiquetés comme autre chose et ne sont pas déclarés comme semences, donc ne passent pas par les contrôles phytosanitaires et douaniers pertinents qui s'appliquent au matériel végétal importé.

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Les rotavirus des troupeaux de volailles peuvent échanger des gènes avec les rotavirus de mammifères, mais le risque d'infection pour l'homme est faible

« Les rotavirus des troupeaux de volailles peuvent échanger des gènes avec les rotavirus de mammifères, mais le risque d'infection pour l'homme est faible », source BfR, Résumé du rapport de recherche sur le projet du BfR, « Characterisation of the zoonotic potential of rotaviruses in poultry » du 17 août 2020.

Les rotavirus aviaires sont répandus dans les troupeaux de volailles destinées à l'alimentation. Cependant, ils ne sont que lointainement liés aux rotavirus qui se produisent chez les mammifères et les humains et qui peuvent conduire à des cas de maladie en. Dans le projet de recherche du BfR «Caractérisation du potentiel zoonotique des rotavirus chez les volailles», financé par la Fondation allemande pour la recherche (DFG), le professeur Reimar Johne et son groupe de recherche ont montré que les rotavirus des oiseaux peuvent échanger du matériel génétique contenant des rotavirus de mammifères, ce qui peut conduire au développement de nouveaux types de rotavirus. Les scientifiques considèrent, cependant, que le risque de développer de tels types de virus, connus comme des «virus réassortis», dans la nature comme étant faible. En effet, les nouveaux virus capables de se répliquer n'apparaissent que dans quelques cas dans des conditions de laboratoire. De plus, il était difficile pour eux de se reproduire efficacement. Le risque d'infection pour l'homme est donc estimé à relativement faible. Néanmoins, des études sur la diversité des rotavirus chez l'homme devraient à l'avenir également inclure des rotavirus éloignés tels que ceux des oiseaux afin de pouvoir déterminer l’apparition de nouveaux types à un stade précoce.

Contrairement aux rotavirus des mammifères, les rotavirus des oiseaux n'ont été que peu étudiés jusqu'à maintenant. L'objectif du BfR était d'analyser la diversité génétique des rotavirus, en particulier chez les oiseaux, et de déterminer leur potentiel de transmission et d'adaptation aux mammifères et aux humains. Une question importante était de savoir si les rotavirus des oiseaux échangeaient du matériel génétique avec ceux des mammifères, ce qui pourrait éventuellement entraîner de nouveaux types de rotavirus. Le projet a identifié une grande variété d'espèces de rotavirus connues et inconnues auparavant et des types chez les oiseaux et les mammifères. Le génome de ces virus était généralement entièrement séquencé à l'aide de méthodes nouvellement développées, ce qui permettait de caractériser précisément leurs propriétés et leur relation avec les rotavirus connus.

Dans l'ensemble, les analyses indiquent qu'il faut s'attendre à un large répertoire de souches de rotavirus divergentes dans le règne animal, qui pourrait éventuellement être transmis directement à l'homme ou, par échange de segments de génome, et cela pourrait conduire à la formation de nouveaux rotavirus. Pour les rotavirus des oiseaux, cependant, cela semble être très rare.

Les rotavirus sont parmi les agents pathogènes les plus courants à l'origine de maladies gastro-intestinales chez les humains et dans de nombreuses espèces animales. Il existe de nombreux types de rotavirus qui évoluent constamment à travers les mutations et l'échange de segments de génome. Les maladies humaines sont principalement causées par des rotavirus humains. Mais il est également connu que certains rotavirus peuvent être transmis de l'animal à l'homme et vice versa. Des vaccins contre les maladies à rotavirus chez homme existent depuis 2006 et sont généralement très efficaces. Cependant, si de nouveaux rotavirus contenant du matériel génétique d'animaux se développent, l'immunité acquise par la vaccination contre de telles infections pourrait devenir inefficace.

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