Des chercheurs américains rapportent une infection des voies urinaires causée par E. coli pan-résistant

«Des chercheurs américains rapportent une infection des voies urinaires causée par E. coli pan-résistant», source article de Chris Dall paru 18 mai 2023 dans CIDRAP News.

Des chercheurs de la Johns Hopkins University School of Medicine ont rapporté avoir identifié ce qu'ils pensent être le premier cas clinique aux États-Unis d'un patient atteint d'une infection présentant une résistance à tous les antibiotiques bêta-lactamines disponibles.

Dans un article de cas publié dans Open Forum Infectious Diseases, les chercheurs ont dit que l'homme de 66 ans s'était rendu en Inde pour recevoir une greffe de rein en janvier 2022 et avait été traité au Johns Hopkins Health System pour une cystite (inflammation de la vessie) plusieurs fois depuis de juin à septembre 2022. L'homme a ensuite développé une pyélonéphrite (infection rénale) causée par Escherichia coli producteurs de New Delhi métallo-bêta-lactamase (NDM).

Bien que les résultats des tests de sensibilité aux antimicrobiens aient indiqué une résistance à la fois au céfidérocol et à la ceftazidime-avibactam plus aztréonam (CZA-ATM), les schémas thérapeutiques préférés pour les infections productrices de NDM, il a continué à prendre du CZA-ATM et a connu une rechute 3 semaines plus tard.

D'autres tests de sensibilité aux antimicrobiens ont indiqué une résistance à toutes les bêta-lactamines. Le séquençage du génome entier (WGS) d'isolats de E. coli prélevés sur le patient après sa greffe du rein et pendant le traitement de l'infection a montré qu'ils appartenaient à la séquence type (ST) 167, qui a été reconnu comme un clone international à haut risque. Le ST contenait une seule copie du gène blaNDM-5, ainsi que des gènes conférant une résistance aux pénicillines, aux céphalosporines de première génération, aux aminoglycosides, au triméthoprime, au sulfaméthoxazole et aux macrolides.

Le WGS a également révélé une mutation dans la protéine de liaison à la pénicilline 3, la protéine mutante CirA et l'expression du gène blaCMY, une combinaison qui, selon les auteurs de l'étude, assure presque la résistance au céfidérocol et au CZA-ATM. Ils pensent que le patient a probablement été colonisé par E. coli producteurs de NDM alors qu'il était en Inde.

«Indépendamment des coupables probables de la pan-résistance aux-β-lactames observées, ce cas est inquiétant étant donné que les isolats cliniques de E. coli ST167 hébergeant les gènes blaNDM-5 sont de plus en plus reconnus comme un clone international à haut risque», ont-ils écrit. «E. coli ST167 a été associé à des facteurs de virulence uniques (par exemple, de nouveaux groupes de gènes de synthèse capsulaire) ; la combinaison de la résistance et de la virulence les rend mûrs pour une diffusion mondiale.»

Commentaire
Récemment un rapport de l'ECDC avait noté une augmentation des cas à E. coli NDM-5, une superbactérie en expansion.

NB : La photo représente E. coli producteur de bêta-lactamases à spectre étendu (CDC).