Les mycobactériophages pourraient utiles pour développer de nouvelles molécules antimicrobiennes

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Une approche de dépistage basée sur le séquençage de nouvelle génération (SGN) pour identifier les protéines codées par les mycobactériophages qui sont toxiques pour les mycobactéries. Les résultats de l’étude, Identification de protéines toxiques codées par le mycobactériophage TM4 à l'aide d'une méthode basée sur le séquençage de nouvelle génération, pourraient être utiles pour développer de nouvelles molécules antimicrobiennes.

Résumé

Les mycobactériophages sont des virus qui infectent spécifiquement les mycobactéries et qui, du fait de leur diversité, représentent un pool génétique important. La caractérisation de la fonction de ces gènes devrait fournir des informations utiles sur les interactions hôte-phage. Nous décrivons ici une approche de dépistage à haut débit basée sur le SGN pour l'identification des protéines codées par les mycobactériophages qui sont toxiques pour les mycobactéries. Une bibliothèque dérivée des plasmides représentant le génome du mycobactériophage TM4 a été construite et transformée en Mycobacterium smegmatis . Les tests de SGN et de croissance ont montré que l'expression de TM4 était toxique pour M. smegmatis. Bien que les gènes associés à la toxicité bactérienne aient été exprimés lors de l'infection par le phage, ils n'étaient pas nécessaires à la réplication lytique du mycobactériophage TM4. En conclusion, nous décrivons ici une approche basée sur le NGS qui a nécessité beaucoup moins de temps et de ressources que les méthodes traditionnelles et a permis l'identification de nouveaux produits géniques de mycobactériophages qui sont toxiques pour les mycobactéries.

Importance

La large propagation de Mycobacterium tuberculosis résistant aux antibiotiques a entraîné un besoin urgent de développement de nouveaux médicaments.

Les mycobactériophages sont des tueurs naturels de M. tuberculosis, et leurs produits géniques toxiques pourraient fournir des candidats anti-Mycobacterium vis-à-vis de la tuberculose.

Cependant, l'énorme diversité génétique des mycobactériophages pose des défis pour l'identification de ces gènes. Ici, nous avons utilisé une méthode de dépistage simple et pratique, basée sur le SGN, pour identifier les gènes de mycobactériophages codant pour les produits toxiques pour les mycobactéries. Grâce à cette approche, nous avons ciblé et validé plusieurs produits toxiques codés par le mycobactériophage TM4. De plus, nous avons également découvert que les gènes codant pour ces produits toxiques ne sont pas essentiels à la réplication lytique de TM4. Notre travail décrit une méthode prometteuse pour l'identification de gènes de phage qui codent pour des protéines toxiques pour les mycobactéries et qui pourrait faciliter l'identification de nouvelles molécules antimicrobiennes.