Suède : Cas d’infection à Shigella liés à des voyages au Cap-Vert

Les voyages exotiques reprennent, les maladies infecteuses d’origien alimentaire aussi … le blog vous en avait parlé le 15 novembre dans Cas groupés à Shigella sonnei liés à des vacances de touristes européens au Cap-Vert.

Il y a une suite avec des «Cas d’infection à Shigella liées à des voyages au Cap-Vert», source Fölkhalsomyndigheten, agence suèdoise de la santé publique du 22 décembre 2022.

Depuis la mi-novembre, un nombre croissant de cas d'infection à Shigella avec un lien de voyage vers le Cap-Vert ont été signalés en Suède.

Jusqu'à présent, 30 cas d'infection à Shigella liés à un voyage au Cap-Vert ont été signalés en Suède depuis la mi-novembre. Onze isolats bactériens ont jusqu'à présent été déterminés à l'espèce : neuf cas à Shigella sonnei et deux cas à Shigella boydii. La propagation de l'infection au Cap-Vert a également été remarquée par plusieurs autres pays européens et abordée avec l'ECDC et l'OMS.

Parmi les voyageurs suédois, des infections par d'autres agents pathogènes intestinaux, par exemple EHEC, Campylobacter, Cryptosporidium et Giardia, ont également été notées. L'infection à Shigella lors de voyages au Cap-Vert est un problème récurrent. Ceci est dû à la présence de diverses espèces de Shigella et d'autres agents pathogènes intestinaux suggèrant une contamination via les aliments.

Shigella sonnei et Shigella boydii sont deux des quatre espèces bactériennes qui peuvent causer la dysenterie intestinale. L'infection à Shigella est une maladie à déclaration obligatoire.

On lira aussi des informations sur la maladie liée à l'infection à Shigella.

Le plus faible nombre de cas d'hépatite A enregistrés, cinq autres maladies d'origine alimentaire et hydrique atteignant les niveaux pré-pandémiques, selon l'ECDC

L’ECDC revient sur quelques maladies infectieuses d’origine alimentaire avec cet article intitulé, «Le plus faible nombre de cas d'hépatite A enregistrés, cinq autres maladies d'origine alimentaire et hydrique atteignant les niveaux pré-pandémiques», qui est sensé fournir des explications.

Les chapitres couvrent des maladies causant le plus grand nombre d'infections d'origine alimentaire et hydrique dans l'UE et l’EEE (Espace Économique européen), à savoir la campylobactériose, la salmonellose, la yersiniose, l'infection à Escherichia coli producteurs de shigatoxines, la listériose et l'hépatite A.

Dans l'UE et l’EEE, le taux de notification de l'hépatite A était exceptionnellement faible en 2021, avec 0,92 cas pour 100 000 habitants, contre 2,2 cas en 2019. Cela peut être attribué principalement à la pandémie de la COVID-19 et aux restrictions, y compris la réduction des voyages internationaux.

Cependant, une forte baisse de la tendance des cas d'hépatite A a également été observée dans l'UE et l’EEE au cours des cinq dernières années. D'autres facteurs contribuant à cela peuvent être la sensibilisation accrue à la transmission de l'hépatite A, l'augmentation des mesures préventives telles que la pratique d'une bonne hygiène et l'augmentation de la vaccination parmi les groupes à risque. Une immunité naturelle accrue dans les groupes à risque à la suite d'une grande épidémie dans plusieurs pays survenue en 2017 et 2018 peut également être importante.

En 2020, le nombre de cas de campylobactériose et de salmonellose, les deux infections gastro-intestinales les plus fréquemment signalées dans l'UE et l’EEE, a notamment diminué en raison de la pandémie de COVID-19. Contrairement à l'hépatite A, ceux-ci ont semblé augmenter en 2021, mais les niveaux sont encore bien inférieurs à ceux des années pré-pandémiques. Cela pourrait être en partie un effet de la réduction des voyages, car les infections liées aux voyages étaient à leur plus bas niveau en 2021.

Les tendances de la listériose, des infections, à Escherichia coli producteurs de shigatoxines et de la yersiniose ont diminué moins sensiblement en 2020 et le nombre de cas est revenu aux niveaux pré-pandémiques en 2021. Cela pourrait être dû aux symptômes plus graves causés notamment par la listériose et les infections à Escherichia coli producteurs de shigatoxines, qui sont alors plus susceptibles d'être diagnostiqués et rapportés. De plus, de nombreux cas sont acquis au sein de l'UE et de l’EEE, et les données ne sont pas aussi affectés par les restrictions de voyage internationales.

En 2021, bien que la pandémie de la COVID-19 soit toujours en cours, la réduction progressive des mesures de restriction lies à la COVID-19, ainsi que le retour à la vie quotidienne normale (événements sociaux, visites chez le médecin, voyages), la réouverture des bars, restaurants et traiteurs (par exemple les écoles, les lieux de travail), peuvent expliquer l'augmentation des cas des cinq maladies d'origine alimentaire et hydrique.

Mise à jour du 4 janvier 2023

On lira avec intérêt l’article paru le 4 janvier dans Food Safety News, Recent data shows Salmonella and E. coli infections rose in Europe in 2021.

Zoonoses dans l'UE en 2021 : Salmonella est souvent à l'origine d'intoxications alimentaires, mais la plupart des décès sont causés par Listeria

«Salmonella est souvent à l'origine d'intoxications alimentaires dans l'UE, mais la plupart des décès sont causés par Listeria», source article de Joe Whitworth paru le 16 décembre 2022 dans Food Safety News.

Salmonella a causé le plus des toxi-infections alimentaires collectives et des cas de maladies, mais Listeria était à l'origine du plus grand nombre de décès en Europe en 2021, selon un nouveau rapport.

Salmonella représentait l’agent causal dans près de 20% de toutes les toxi-infections alimentaires collectives. Les principales sources de toxi-infections alimentaires collectives à Salmonella étaient les œufs, les ovoproduits et les aliments composés, qui sont des repas composés de divers ingrédients.

Les toxi-infections alimentaires collectives causées par Listeria monocytogenes étaient au plus haut niveau jamais enregistré, mais le nombre de malades et de décès n'a pas augmenté. Cela pourrait être lié à l'utilisation accrue du séquençage du génome entier, qui permet aux scientifiques de mieux détecter les épidémies, selon le rapport.

Les toxi-infections alimentaires collectives en 2021 ont augmenté par rapport à 2020, mais étaient inférieures aux années précédant la pandémie de la COVID-19, ont déclaré l'Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA) et le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC).

Plus de 4 000 toxi-infections alimentaires collectives, 32 543 personnes atteintes, 2 495 hospitalisations et 31 décès ont été enregistrés en 2021. En outre, 83 toxi-infections alimentaires collectives, 1 270 patients, 65 hospitalisations et deux décès ont été signalés en Bosnie-Herzégovine, Islande, Monténégro, Norvège, Macédoine du Nord, Serbie et Suisse.

La plus grande toxi-infection alimentaire collective a eu lieu en Finlande et la plupart des décès ont eu lieu en France. La Belgique, France, Pays-Bas et Pologne ont représenté près de 75% de toutes les toxi-infections alimentaires collectives. La France en comptait 1 286 toxi-infections alimentaires collectives, les Pays-Bas 838, la Belgique 547 et la Pologne 299.

La Finlande a rapporté une toxi-infection alimentaire collective causée par Salmonella Typhimurium dans des légumes précoupés impliquant 728 patients. Cette toxi-infection alimentaire collective était la plus importante en 2021 et la plus importante causée par cet agent pathogène depuis le début de la collecte de données en 2004.

Avec 17 décès, la France représente plus de la moitié de tous les décès dans l'UE. C'est le plus élevé d'un seul pays depuis 2012. Au niveau de l'UE, 15 décès étaient liés aux soins de santé et aux établissements résidentiels, ce qui met l'accent sur les risques de dangers d'origine alimentaire pour les personnes vulnérables, ont rapporté les chercheurs.

L'agent était inconnu pour 1 831 toxi-infections alimentaires collectives, avec plus de 10 100 patients et trois décès. Salmonella était responsable de la majorité des toxi-infections alimentaires collectives, des cas et des hospitalisations. Des toxines bactériennes non spécifiées étaient à l'origine de 484 toxi-infections alimentaires collectives et norovirus en a causé 251. Listeria monocytogenes était associée au plus grand nombre de décès avec 12 cas.

La France a signalé 176 foyers de toxi-infections alimentaires collectives à Salmonella tandis que la Pologne en comptait 165, la Slovaquie 154 et l'Espagne 93. Salmonella Enteritidis était le sérovar le plus élevé, suivi de Typhimurium. Salmonella était la principale cause de toxi-infections alimentaires collectives dans 17 pays de l'UE.

E. coli producteurs de shigatoxines (STEC) était le troisième agent bactérien le plus courant avec 31 éclosions et 275 patients. C'était la première cause en Irlande. Les sérogroupes identifiés dans 24 éclosions étaient O157, O26, O103 et une fois chacun pour O12, O145, O146 et O91.

Campylobacter était le quatrième agent le plus signalé dans les épidémies avec 249 toxi-infections alimentaires collectives. L'Allemagne était en tête avec 64, suivie de la France et de la Slovaquie avec 55. Six toxi-infections alimentaires collectives graves entraînant des décès ou des hospitalisations ont été signalées par le Danemark, la France, l'Espagne et la Suède. Les six décès étaient le nombre le plus élevé signalé depuis 2007.

Yersinia a été détecté dans 21 foyers de toxi-infections alimentaires collectives dans 12 pays avec 125 patients. Six pays ont signalé 11 toxi-infections alimentaires collectives causées par Shigella avec 63 cas. Six étaient dues à Shigella sonnei.

Un foyer a été causé par Cronobacter sakazakii en Allemagne. Il a impliqué quatre nouveau-nés et a causé un décès. L'aliment en cause était une préparation probiotique pour nourrissons mélangée à l'hôpital. Il s'agissait de la première épidémie depuis que l'EFSA a commencé à collecter des données en 2004. Vibrio cholerae a également été signalé pour la première fois avec 47 cas. Il a été détecté en Espagne, dans une institution résidentielle (maison de retraite, prison ou internat) et était lié à une alimentation mixte.

Facteurs contributifs et liens alimentaires

La France a enregistré 90% de toutes les toxi-infections alimentaires collectives causées par des toxines bactériennes avec plus de 600. Trois toxi-infections alimentaires collectives ont entraîné 708 cas et 97 hospitalisations. Sept décès concernaient des personnes vivant dans des établissements de soins de santé et résidentiels. Bacillus cereus était associé au plus grand nombre de toxi-infections alimentaires collectives parmi les toxines bactériennes, Clostridium perfringens a causé le plus grand nombre de cas et de décès, et Staphylococcus aureus était en tête des hospitalisations.

Norovirus était le principal agent en Belgique, République tchèque, Danemark, Finlande, Lettonie et Suède. Treize foyers ont impliqué plus de 100 personnes. La France en a eu le plus avec 112 foyers.

La République tchèque a signalé une importante épidémie d'hépatite A, impliquant 199 cas, dont 195 ont nécessité une hospitalisation. Un aliment mélangé était le véhicule suspecté. L'hépatite E en Suisse a touché 105 personnes avec 29 hospitalisations et deux décès. La Slovaquie a signalé une épidémie avec cinq cas causés par le virus de l'encéphalite à tiques lié à du lait cru de chèvre.

Près de 50 toxi-infections alimentaires collectives et plus de 200 cas étaient dus à l'histamine et à la scombrotoxine, souvent causées par des produits de la pêche. Les biotoxines marines telles que la ciguatera étaient à l'origine de 17 toxi-infections alimentaires collectives et les champignons étaient liés à six. Deux des toxi-infections alimentaires collectives liées à de la lectine ont été signalées au Danemark et un incident lié à l'atropine lié aux légumes a été signalé en Italie.

Les aliments d'origine animale ont été impliqués dans 202 toxi-infections alimentaires collectives, 2 221 cas, 316 hospitalisations et 11 décès. Il y a eu une augmentation des toxi-infections alimentaires collectives liées aux légumes et aux jus. Salmonella dans cette catégorie de produits a causé le plus de cas de maladie avec plus de 1 100.

Salmonella dans les aliments mélangés était responsable de la plupart des hospitalisations, suivie de Salmonella dans les ovoproduits et dans les légumes et les jus. Listeria dans les produits de poisson était responsable du plus grand nombre de décès, suivie des toxines de Clostridium perfringens dans les produits de viande de porc.

La contamination croisée a été signalée comme facteur contributif dans 34 toxi-infections alimentaires collectives. Un manipulateur d'aliments infecté a été identifié dans 26 foyers de toxi-infections alimentaires collectives. Une durée ou une température de stockage abusives, un traitement thermique inadéquat et un refroidissement inadéquat ont également été signalés.

Les STEC dans l'UE en 2021, selon l'EFSA et l'ECDC

Les données ci-après sont issues du rapport 2021 sur les zoonoses de l'EFSA et de l'ECDC.

Pour la France, le rapport indique 297 cas à Escherichia coli producteurs de shigatoxines, STEC.

La France assure la surveillance du «syndrome hémolytique et urémique (SHU) secondaire à une infection à Escherichia coli producteurs de shigatoxines touche principalement le jeune enfant. Cette complication, rare mais grave, affecte essentiellement le rein et survient dans 5 à 8% des cas.» Les données sur le nombre de cas de SHU pédiatrique, selon Santé publique France, en 2021 est de 128 cas, soit une incidence annuelle de 1,62 pour 100 000 personnes.

Faits marquants

- En 2021, le nombre de cas confirmés d'infection humaine à STEC était de 6 084. Cela a rendu l'infection à STEC la quatrième infection gastro-intestinale d'origine alimentaire la plus fréquemment signalée chez l'homme dans l'UE.

- Le taux de notification de l'UE en 2021 était de 2,1 pour 100 000 habitants, ce qui représente une augmentation de 36,9% par rapport au taux de 2020 (1,5 pour 100 000 habitants).

• Par rapport au taux avant la pandémie de la COVID-19 (moyenne annuelle 2017-2019), le taux de notification dans l'UE a augmenté de 9,9% et de 14,2% respectivement avec et sans les données du Royaume-Uni.

- En 2020, les cas à STEC signalés à l'ECDC ont affiché le taux le plus bas depuis 2007, lorsque la surveillance de la maladie a commencé. Le reporting a très probablement été impacté par la COVID-19 pandémie et le retrait du Royaume-Uni de l'UE.

- La tendance générale des infections à STEC n'a montré aucune augmentation ou baisse en 2017-2021.

- En 2021, 22 États membres ont signalé la présence de STEC dans 3,6% des 17 516 échantillons alimentaires prélevés selon une stratégie «d’échantillonnage objectif», contre respectivement 2,4% et 2,8% en 2020 et 2019,.

- Les «graines germées» ont été testées par 10 États membres dans le cadre du règlement (CE) n°2073/2005 et un lot était positif aux STEC sur 617 unités de prélèvement.

- Dans l'ensemble, les STEC se trouvaient le plus souvent dans de la ‘viande fraîche provenant de différentes espèces animales’ (7% de STEC positifs), suivis des produits de boulangerie (6,3%) et du lait et des produits laitiers ‘non prêt à consommer’ (2%), alors que ‘fruits et légumes’ était la catégorie la moins contaminée (0,5%).

- Seize États membres ont testé 7 444 échantillons d'aliments prêts à consommer pour les STEC avec 112 (1,5%) positifs, dont 20 (1,6%) à partir d'«échantillons de viande et de produits à base de viande », 39 (1,7 %) à partir d’échantillons ‘lait et de produits laitiers’, 1 (0,3%) de la catégorie ‘épices et herbes’ et 10 échantillons positifs à STEC de la catégorie ‘fruits, légumes et jus’ (0,5%).

- Parmi les isolats alimentaires, 27,4% ont eu des informations sur le sérogroupe et bon nombre ceux-ci appartenaient aux 20 principaux sérogroupes STEC signalés dans les infections humaines à l'ECDC en 2021.

- La plupart des virulotypes d'isolats de STEC provenant d'aliments et d'animaux ont également été identifiés dans des infections à STEC chez l'homme. Seulement 32,5% (N = 284) des STEC isolés des aliments en 2021 ont été rapportés avec des informations sur le typage des gènes de virulence (stx1 ou stx2 et eae) et 9% (N = 79) ont reçu les sous-types du gène stx.

- Les tests à partir d’échantillons d'animaux ont augmenté par rapport aux années précédentes, mais n'étaient toujours pas largement réalisées dans l'UE. En fait, 3 746 échantillons d'animaux ont été déclarés par sept États membres en 2021 avec 6,1% de positifs. La plupart des unités d'échantillonnage (88,5%) provenaient d'une seule espèce animale, le bétail.

Les auteurs du rapport indiquent dans la discussion,

En 2020, il y a eu une baisse des taux de notification des infections à STEC, probablement en raison de la pandémie de covid19. En 2021, le nombre de cas signalés était comparable à ceux signalés durant la période pré-pandémique (2017-2019).

En 2021, plus de la moitié des cas humains confirmés signalés par les États membres de l'UE disposaient d'informations sur la sérogroupe avec le plus souvent O157, suivi de O26, bien que les proportions ne divergeaient que de 0,4%.

NB : La photo est issue de ce site. 

Mise à jour du 16 décembre 2022

On lira l’article de Joe Whitworth de Food Safety News, «Salmonella is often behind EU outbreaks, but most deaths are caused by Listeria» (Salmonella est souvent à l'origine d'épidémies dans l'UE, mais la plupart des décès sont causés par Listeria).

Listeria en France et dans l'UE en 2021, selon l'EFSA et l'ECDC

Les données ci-après sont issues du rapport 2021 sur les zoonoses de l'EFSA et de l'ECDC.

Santé publique France indique encore en ce moment sur la page Internet de la Listériose, 300 à 400 cas de listériose invasive sont déclarés chaque année en France.

Désormais pour 2021, il faudra dire 435 cas de listériose, soit 0,64 cas pour 100 000 habitants. La France a aussi rapporté le nombre de cas le plus élevé de décès (75).

Faits marquants

- En 2021, 27 États membres ont signalé 2 183 cas humains invasifs confirmés d’infection à Listeria monocytogenes à l'ECDC. Ces cas ont entraîné 923 hospitalisations et 196 décès dans l'UE.

La listériose a été la cinquième zoonose la plus fréquemment signalée chez l'homme dans l'UE et est l'une des maladies d'origine alimentaire les plus graves sous surveillance de l'UE.

- Le taux de notification de l'UE était de 0,49 pour 100 000 habitants, soit 14,0% de plus que le taux de 2020 (0,43 pour 100 000 habitants). Le rapport de 2020, qui a montré le plus faible nombre de cas humains (taux le plus faible) depuis le début de la surveillance de la listériose en 2007, a été impacté par la pandémie de la COVID-19 et la sortie du Royaume-Uni de l'UE.

- Par rapport au taux avant la pandémie de la COVID-19 (moyenne annuelle 2017-2019), le taux de notification de l'UE a augmenté de 4,3% et diminué de 2,0 % respectivement avec et sans les données du Royaume-Uni,.

- La tendance globale de l'UE pour la listériose au cours de la période 2017-2021 n'a pas montré d’augmentation ou diminution importante.

- Le taux global de létalité dans l'UE était élevé (13,7%), similaire à celui de 2020 et légèrement inférieur respectivement à 2019 (13,0% et 17,6%,).

- Les infections à L. monocytogenes ont été le plus souvent signalées dans le groupe d'âge «plus de 64 ans» et particulièrement dans la tranche d'âge «plus de 84 ans».

- Les 24 États membres ont déclaré un total de 244 357 échantillons de différentes catégories d'aliments «prêts à consommer», lors des étapes de distribution ou de fabrication.

 - L’occurrence de L. monocytogenes donne une indication de l'incidence raisonnablement prévisible du taux de contamination dans ces catégories d'aliments «prêts à consommer». Les résultats variaient selon le «prêt à consommer», la phase d'échantillonnage, le nombre d'échantillons testés et le nombre de pays déclarants. Dans le cadre d'un échantillonnage objectif, tous les échantillonneurs et unités d'échantillonnage incluses, les occurrences sont restées généralement rares (< 0,1%) à faibles (> 1% à 10%) dans ces catégories. Les valeurs les plus élevées (de 2% à 5%) ont été observées pour le poisson et les produits de la pêche, les produits de viande bovine ou porcine, les fruits et légumes et les fromages au lait de brebis.

- Au stade de la distribution, les proportions de résultats positifs pour les essais de dénombrement à échantillon unique pour L. monocytogenes effectués par les Autorités Compétentes dans le cadre de la vérification des critères de sécurité des aliments pour L. monocytogenes dénombrés selon le règlement (CE) n°2073/2005 sont restés très faibles à faibles (<1,0%) dans 9 des 11 catégories d'aliments prêts à consommer. Les proportions les plus élevées au stade de la distribution ont été observés dans les catégories «produit carné, charcuterie fermentée» (3,1%) et «poisson» (1,5%).

- Lors de la fabrication, les proportions d'échantillons uniques positifs pour L. monocytogenes sur la base d’essais de détection étaient systématiquement plus élevés par rapport à ceux au niveau de la distribution, pour toutes les catégories d'aliments «prêts à consommer». Les proportions les plus élevées en fabrication ont été observées pour les produits de la pêche (3,1%), les produits d'origine carnée autres que la charcuterie fermentée (2,5%) et le poisson (1,8%).

- En production primaire, le pourcentage d'unités positives est très faible chez les bovins (1,1%), qui est l'espèce animale la plus échantillonnée dans l'UE. Le faible nombre de données communiquées par les États membres reflète l'absence d'exigences légales minimales pour un échantillonnage et un rapport harmonisés au primaire production.

Dans la discussion, les auteurs du rapport notent,

En 2021, le nombre de cas confirmés de listériose humaine était de 2 183, ce qui correspond à un taux de notification dans l'UE de 0,49 pour 100 000 habitants et a entraîné une augmentation de 14% du taux de notification par rapport au taux de 2020.

Moins de cas ont été signalés en 2020, ce qui pourrait s'expliquer en partie par l'impact de la pandémie de COVID-19 sur les systèmes de santé nationaux et le retrait du Royaume-Uni de l'UE. La listériose reste l'une des maladies d'origine alimentaire les plus graves sous surveillance de l'UE en raison du taux élevé d'hospitalisations et de la morbidité et de la mortalité élevées, en particulier chez les personnes âgées.

La tendance générale de la listériose en 2017-2021 n'a montré aucune augmentation ou diminution statistiquement significative, à l'exception de la Roumanie avec une diminution statistiquement significative. La listériose a eu un taux de notification assez stable même pendant la pandémie de COVID-19, par rapport à d'autres maladies d'origine alimentaire.

Mise à jour du 16 décembre 2022

On lira l’article de Joe Whitworth de Food Safety News, «Salmonella is often behind EU outbreaks, but most deaths are caused by Listeria» (Salmonella est souvent à l'origine d'épidémies dans l'UE, mais la plupart des décès sont causés par Listeria).

Aperçu des toxi-infections alimentaires collectives en France et au sein de l'UE en 2021, selon l'EFSA et l'ECDC

Que signifient ces chiffrent mis en exergue par le blog ci-dessus ? 

Ces chiffres de la série de gauche sont ceux fournis par Santé publique France, à savoir les toxi-infections alimentaires collectives (tiac) ont augmenté en 2019 de +9% par rapport à 2018 et elles ont baissé en 2020 de +43% par rapport à l’année 2019.

La série de chiffres de droite représente une baisse des tiac de –27,9% par rapport à 2019, mais +21,5% par rapport à 2020.

Ces données sont issues du rapport 2021 sur les zoonoses et les toxi-infections alimentaires de l’EFSA et de l’ECDC. Nous aurons, je pense, prochainement les chiffres officiels de la part de Santé publique France.

Pour la France, en 2021, il y a eu 1 286 toxi-infections alimentaires collectives (dont 93 avec des preuves évidentes) ont été déclarées en France, affectant 10 836 personnes (6 814 personnes en 2020), dont 561 (396 en 2020) personnes hospitalisées et 17 (9 en 2020) sont décédées. A noter que les tiac semblent une spécialité française puisqu’elles représentent 54,8% de l’ensembles des tiac rapportées au sein de l’UE.

Comme le rappelle Santé publique France, «… les TIAC ne sont que la partie la plus visible d’un problème plus vaste. Le fardeau des infections d’origine alimentaire reste important avec entre 1,28 à 2,23 millions de personnes affectées chaque année, dont la majorité des cas surviennent de façon sporadique sans lien apparent entre eux.»

Voici ci-après les données globales fournies par l'EFSA.

Faits marquants

- En 2021, 27 États membres de l'UE et le Royaume-Uni (Irlande du Nord) ont signalé 4 005 toxi-infections alimentaires collectives affectant 32 543 cas de maladie, 2 495 hospitalisations et 31 décès. Dans le même temps, 83 épidémies, 1 270 cas de maladie, 65 hospitalisations et 2 décès ont été signalés par sept non États membres.

- En 2021, les toxi-infections alimentaires collectives dans l'UE ont augmenté de 29,8% par rapport à l'année précédente (3 086 en 2020). Les cas humains et les hospitalisations ont également augmenté, de 62,6% (20 017 cas en 2020) et 49,0% (1 675 hospitalisations en 2020), respectivement. Cependant, le nombre total des épidémies, les cas et les hospitalisations signalés en 2021 étaient en moyenne plus faibles que dans la plupart des dernières années prépandémiques (2017-2019), entraînant une diminution relative de 28,5% des foyers de cas (5 601 éclosions en 2017-2019, en moyenne), 34,2% pour les cas (49 444 cas rapportées en 2017-2019, en moyenne) et 44,3% pour les hospitalisations (4 482 hospitalisations en 2017-2019, en moyenne). Le nombre de décès signalés a diminué par rapport à 2020 et la période 2017-2019, respectivement de 8,8% (34 décès en 2020) et 30,1% (44 décès/an en 2017-2019, en moyenne).

- En 2021, le taux de notification des toxi-infections alimentaires collectives dans l'UE était de 0,89% pour 100 000 habitants. Cela représente une augmentation de 29,0% par rapport à 2020 (0,69 pour 100 000 habitants) et une diminution de 18,3% par rapport aux années prépandémiques (1,09 pour 100 000 habitants en 2017-2019).

- Ces résultats suggèrent que l'impact de la pandémie de la COVID-19 était encore considérable en 2021 dans l'UE, en ce qui concerne à la fois l'apparition de toxi-infections alimentaires collectives et leur détection, enquête et rapport. Cependant, l'augmentation du nombre de toxi-infections alimentaires collectives par rapport à 2020, pourrait indiquer un retour progressif de la surveillance des toxi-infections alimentaires collectives à une stabilité pré-pandémique pour la plupart des États membres, bien qu'une exposition plus élevée des consommateurs à des produits contaminés aliments pourraient avoir contribué à cette hausse en 2021.

- La baisse des toxi-infections alimentaires collectives au cours de la deuxième année de la pandémie de la COVID-19 par rapport aux niveaux prépandémiques, affectait pas tous les agents responsables de la même manière. Par exemple, le nombre d'épidémies causées par Listeria monocytogenes était la plus élevée depuis que l'EFSA a commencé à collecter des données.

- Salmonella a été identifié comme agent causal dans la plupart des épidémies d'origine alimentaire dans l'UE (N = 773), représentant 19,3% du total des éclosions. Ce pathogène était également associé au plus grand nombre de cas (20,8% des cas associés à une éclosion) et d'hospitalisations (45,0% des hospitalisations associées à une flambée). S. Enteritidis était le sérovar prédominant (N = 350 ; 79,7% de toutes les éclosions de Salmonella).

- Un total de 31 décès parmi les cas d'éclosion ont été notifiés à l'EFSA par six États membres et le Royaume-Uni (Irlande du Nord). L. monocytogenes était associé à 12 de ces décès (36,4% de tous les décès), tandis que Campylobacter était associé à six décès (18,2% de tous les décès).

- Un total de 355 toxi-infections alimentaires collectives à preuves solides ont été signalées en 2021 (8,9% de toutes les éclosions). Parmi celles-ci, les véhicules alimentaires d'origine animale (c'est-à-dire «viande et produits de viande», «poisson et produits de la pêche», «œufs et ovoproduits» et «lait et produits laitiers») ont été impliqués dans la plupart des toxi-infections alimentaires collectives (56,9%). Salmonella était l'agent le plus fréquemment associé à divers aliments (par exemple, des œufs et ovoproduits, des aliments composés, des légumes et jus), en termes de nombre de foyers de cas humains et d’hospitalisations.

- Les «aliments composés ou aliments à ingrédients multiples» ont causé le plus grand nombre de cas de toxi-infections alimentaires collectives avec des preuves solides (39,3% de tous les cas), les «aliments mélangés» étant la cause la plus fréquemment signalée. Les éclosions mettant en cause ces aliments étaient associées à un large éventail d’agent causal.

- Les toxi-infections alimentaires collectives associées à la consommation de «légumes et jus et autres produits dérivés» a considérablement augmenté par rapport à 2020 et aux années pré-pandémiques. Cette denrée alimentaire était juste derrière les «aliments mélangés» dans le nombre total de cas signalés parmi les toxi-infections alimentaires collectives en 2021.

- Comme ces dernières années, la plupart des foyers identifiés en 2021 ont eu lieu dans des locaux domestiques (121 les toxi-infections alimentaires collectives ; 34,1%. de toutes les éclosions à preuves solides). «Restaurant ou café ou pub ou bar ou hôtel ou service de restauration» étaient les lieux d'exposition les plus fréquemment signalés pour les épidémies survenues dans les autres types de milieux (77 foyers ; 21,7%). «L'école ou le jardin d'enfants» était le lieu d'exposition associé au plus grand nombre de cas de toxi-infections alimentaires collectives (2 104 cas, 30,0% de tous les cas à forte preuve
d’éclosion). 

Ces résultats soulignent l'importance d'une bonne mise en œuvre de HACCP dans la restauration publique ainsi que la nécessité d'améliorer la sensibilisation à la fois les consommateurs et les opérateurs commerciaux alimentaires sur les procédures correctes de manipulation et de consommation des aliments.

Mise à jour du 16 décembre 2022
On lira l’article de Joe Whitworth de Food Safety News, «Salmonella is often behind EU outbreaks, but most deaths are caused by Listeria» (Salmonella est souvent à l'origine d'épidémies dans l'UE, mais la plupart des décès sont causés par Listeria).

Comme l'inflation, les zonoses et foyers de toxi-infection alimentaire en hausse au sein de l'UE en 2021

Les titres à propos des zoonoses dans l’UE, c’est selon, pour l’EFS, «Zoonoses et foyers de toxi-infection alimentaire en hausse, mais inférieurs aux niveaux pré-pandémiques», pour l’ECDC, «Les maladies zoonotiques et les épidémies d'origine alimentaire en hausse, mais toujours en deçà des niveaux d'avant la pandémie», et pour Joe Whitworth de Food Safety News, «Les maladies d'origine alimentaire grimpent en Europe, mais pas de retour aux niveaux pré-pandémiques».

Ne vous fiez donc pas toujours aux titres, un lecteur habitué aura souvent consaté un décalage entre le titre et le contenu de l'article, retenez tou

t de même que, comme l’inflation, les zoonoses ont augmenté, mais que c’est surtout les foyers de toxi-infection alimentaire qui ont le plus augmenté, et ce, malgré le départ de nos amis britanniques. Le blog reviendra en détail sur ces sujets dans un prochain article, avec un focus sur la France, mais d’ores et déjà voici un aperçu …

Résumé

Comme l’indique le dernier rapport annuel de l’UE sur les zoonoses «Une seule santé» publié par l’EFSA et l’ECDC, en 2021 les cas signalés de zoonoses et de foyers de toxi-infection alimentaire étaient globalement en hausse par rapport à l’année précédente mais leur nombre restent nettement inférieurs à ceux des années précédant la pandémie.

La baisse générale du nombre de cas signalés et de foyers épidémiques par rapport aux années précédant la pandémie est probablement liée aux mesures prises pour lutter contre le COVID-19, mesures toujours en place en 2021. On relève parmi les quelques exceptions à cette tendance la yersiniose et les foyers épidémiques alimentaires de listériose, dont le nombre de cas signalés excèdent les niveaux d’avant la pandémie.

La cause la plus fréquente des foyers épidémiques d'origine alimentaire était Salmonella, qui représentait 19,3% (773) du total. Les foyers de cas de toxi-infection alimentaire (ou toxi-infections alimentaires collectives en France -aa) diffèrent des cas de maladie globalement signalés car il s’agit d’événements dans lesquels au moins deux personnes contractent la même maladie à partir des mêmes aliments contaminés. Les sources les plus courantes de foyers épidémiques de salmonellose étaient les œufs, les ovoproduits et les «aliments mixtes», à savoir des repas composés de divers ingrédients.

Le nombre de foyers épidémiques (23) causés par Listeria monocytogenes a été le plus élevé jamais signalé. L’utilisation accrue de techniques de séquençage du génome entier qui permettent aux scientifiques de mieux détecter et identifier les foyers pourrait expliquer ce niveau record.

Le rapport couvre également l’ensemble des cas signalés de zoonoses, qui ne sont pas nécessairement liés à des foyers épidémiques. La campylobactériose reste la zoonose la plus fréquemment signalée, avec un nombre de cas signalés en hausse (127 840, contre 120 946 en 2020). La viande de poulet et la viande de dinde constituaient la source d’infection la plus courante. La salmonellose était la deuxième zoonose la plus signalée et a touché 60 050 personnes (contre 52 702 en 2020). Les autres maladies fréquemment signalées étaient la yersiniose (6 789 cas), les infections causées par E. coli producteur de shigatoxines (6 084 cas) et la listériose (2 183 cas).

Le rapport contient également des données sur Mycobacterium bovis/caprae, Brucella, Trichinella, Echinococcus, Toxoplasma gondii, la rage, la fièvre Q, les infections du virus du Nil occidental et la tularémie.

L’EFSA publie également plusieurs outils de communication interactifs :

Principaux résultats et tendances en 2021

En 2021, les deux zoonoses les plus fréquemment signalées chez l'homme étaient les maladies gastro-intestinales campylobactériose et salmonellose avec un total respectivement de 127 840 et 60 050 cas humains. Une augmentation d'environ 7 000 cas pour les deux agents pathogènes a été signalée en 2021 par rapport à 2020, correspondant respectivement à +0,86 et +1,96 cas confirmés pour 100 000 habitants pour la campylobactériose et la salmonellose.

En 2020, deux événements majeurs ont affecté la collecte et l'analyse des données au niveau de l'UE : le Royaume-Uni s'est retiré de l'Union européenne1, ce qui a entraîné une réduction du nombre absolu de cas signalés et les confinements partiels ou totaux dus à la pandémie de COVID-19 ont influencé la probabilité d'exposition à des agents pathogènes d'origine alimentaire. Par conséquent, l'augmentation apparente des cas signalés en 2021 doit être interprétée avec prudence à la lumière du retrait progressif des initiatives non pharmaceutiques les plus sévères, principalement l'assouplissement des confinements, contre le COVID-19 en 2021.

Alors que les données humaines du Royaume-Uni n'ont pas été collectés par l'ECDC depuis 2020, l'Irlande du Nord a soumis des données et des rapports nationaux sur les zoonoses en 2021 sur ses résultats de surveillance pour les denrées alimentaires, les animaux, les aliments pour animaux et les foyers de cas de toxi-infections d'origine alimentaire, conformément au retrait du Royaume-Uni de l'Union européenne.

Le contrôle de la présence de micro-organismes zoonotiques chez les animaux producteurs d'aliments est l'un des moyens les plus efficaces de réduire le fardeau de la maladie humaine. Des programmes nationaux de lutte contre Salmonella sont mis en place depuis de nombreuses années dans les populations avicoles (poules reproductrices, poules pondeuses, poulets de chair, dindes d'engraissement et de reproduction) : ces programmes visent à réduire la prévalence des sérovars (sous-groupes aux structures de surface distinctives communes) de Salmonella responsables pour la grande majorité des cas humains.

En 2021, 16 États membres et le Royaume-Uni (Irlande du Nord) ont atteint tous les objectifs fixés en matière de réduction de la prévalence de Salmonella pour les sérotypes pertinents dans des populations de volailles spécifiques. Les tendances de la prévalence des troupeaux positifs pour le sérotype cible de Salmonella ont été raisonnablement stables dans l'UE au cours des dernières années pour les populations de volailles spécifiées.

Pour 2021, dans la catégorie des échantillons d'aliments «prêts à consommer» dans leur ensemble, une très faible proportion (0,23%) d'unités positives à Salmonella a été retrouvée, les pourcentages les plus élevés d'échantillons positifs étant décrits pour la «viande et les produits à base de viande provenant de porcs» (0,82 %) et «épices et herbes» (0,72%). Les échantillons prélevés par les autorités compétentes à l'abattoir pour la détection de Salmonella sur les carcasses de différentes espèces étaient plus fréquemment positifs que ceux rapportés lors des contrôles d'autocontrôle par les exploitants du secteur alimentaire eux-mêmes. Le même constat a été observé pour les populations de volailles testées dans le cadre des programmes nationaux de contrôle de Salmonella au niveau des exploitations, ainsi que pour les résultats de quantification de Campylobacter sur les carcasses de poulets de chair au niveau de l'UE. Cet écart devrait faire l'objet d'une enquête plus approfondie, car les exploitants du secteur alimentaire de l'UE sont principalement responsables de la prévention de la contamination des aliments par des agents pathogènes zoonotiques à tous les niveaux de la chaîne alimentaire et les autocontrôles sont une composante importante de leurs programmes de contrôle.

Le cas des foyers de cas de toxi-infection d'origine alimentaire

En 2021, 27 États membres et le Royaume-Uni (Irlande du Nord) ont signalé 4 005 foyers de cas de toxi-infection d'origine alimentaire (29,8 % de plus qu'en 2020) et 32 543 cas humains (une augmentation de 62,6 %). Ces données sont proches de ce qui avait été rapporté dans la période 2017-2019 avant la pandémie de COVID-19, indiquant un retour progressif probable aux habitudes de consommation alimentaire pré-COVID-19 en 2021 en ce qui concerne les restaurants, les cantines et les autres installations d'administration alimentaire qui peuvent être impliqué dans la transmission d'agents pathogènes d'origine alimentaire.

Salmonella, en particulier S. Enteritidis, est restée l'agent causal le plus fréquemment signalé dans les épidémies d'origine alimentaire.

Selon les données fournies par les États membres, Salmonella de la catégorie «œufs et ovoproduits» et des «aliments composés» étaient les couples agent/aliment les plus souvent impliqués dans les épidémies d'origine alimentaire.

Les foyers liés à la consommation de produits de la catégorie «légumes et jus et autres produits dérivés» ont considérablement augmenté en 2021 par rapport aux années précédentes.

Un sondage
«Répondez à notre sondage» vous demande la Commission européenne ...
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Prenez un moment pour lire notre article sur le dernier rapport annuel de l'UE, OneHealth et les zoonoses que nous avons publié conjointement avec l’ECDC.

🗣️ Time to #HaveYourSay & help us understand how well we are delivering our news on #FoodSafety topics

Take a moment to read our news story on the latest annual EU #OneHealth #zoonosis report we released jointly with @ECDC_EU & answer our survey📜

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— EFSA (@EFSA_EU) December 13, 2022

Rapport épidémiologique annuel 2018 de l’ECDC sur l’hépatitis A

«Rapport épidémiologique annuel 2018 de l’ECDC sur l’hépatitis A», source ECDC.

En 2018, 30 pays de l'Union européenneet de l’Espace économique européen (UE/EEE) ont signalé 15 815 cas d'hépatite A, dont 15 677 (99,1%) ont été confirmés.

Faits saillants
- En 2018, 30 pays de l’UE/EEE ont rapporté 15 815 cas d'hépatite A, dont 15 677 (99,1%) ont été confirmés.
- La Roumanie et l'Espagne représentaient 43,5% de tous les cas confirmés
- Le taux de notification de l'UE/EEE était de 3,0 cas pour 100 000 habitants. Dix pays de l'UE/EEE avaient un taux de notification inférieur à un cas confirmé pour 100 000 habitants. Les pays avec les taux de notification les plus élevés étaient la Bulgarie (19,1 cas pour 100 000 habitants) et la Roumanie (23,2 cas pour 100 000 habitants).
- En 2018, une réduction considérable du nombre de cas déclarés et des taux de notification a été observée par rapport à 2017. En effet, 2017 a été caractérisée par une épidémie dans plusieurs pays sans précédent, importante et prolongée, affectant de manière disproportionnée les hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes (HSH), qui s'est principalement réduite en 2018.
- Comme les années précédentes (hors 2017), les enfants âgés de 5 à 14 ans représentaient une part importante des cas (29%) et le taux de déclaration le plus élevé (8,2 cas pour 100 000 habitants).

Implications pour la santé publique

L'Organisation mondiale de la santé (OMS) énonce ddes recommandations de vaccination suivantes pour réduire l'incidence de l'hépatite A. Dans les pays à très faible et faible endémicité du virus de l’hépatite A (VHA), comme la plupart des pays de l'UE/EEE, l'OMS recommande de vacciner les hommes ayant des rapports HSH, les voyageurs vers les zones endémiques et les consommateurs de drogues injectables. Les mêmes groupes devraient être ciblés par des campagnes de communication pour accroître la sensibilisation concernant l'infection par le VHA et les modes de transmission. Dans les contextes d'endémicité très faible et faible du VHA, l'OMS recommande également de vacciner les personnes à risque d'évolution grave (c'est-à-dire les personnes immunodéprimées et les personnes âgées). Dans les pays d'endémicité intermédiaire, l'OMS recommande la vaccination universelle des enfants. Dans tous les contextes, les actions visant à améliorer l'hygiène et la mise en œuvre rapide de la riposte aux éclosions sont essentielles pour réduire la transmission du VHA, y compris la mise en œuvre rapide de la recherche contractuelle des cas afin de réduire la probabilité de transmission secondaire et tertiaire. De plus, la collaboration entre le secteur de la santé publique et celui de la sécuirté des aliments est importante pour aider à réduire les infections d'origine alimentaire.

Pour la France, voici les données extraites du rapport,