Un champignon récemment découvert aide à détruire une mycotoxine alimentaire dangereuse, la patuline

«Un champignon récemment découvert aide à détruire une mycotoxine alimentaire dangereuse, la patuline», source ScienceDaily via la Tokyo University of Science

Des scientifiques identifient une souche fongique qui transforme la patuline, une mycotoxine dangereuse parfois présente dans les fruits, en sous-produits moins toxiques.

La patuline est une mycotoxine dangereuse produite par des champignons que l'on trouve généralement dans les fruits endommagés, notamment les pommes, les poires et les raisins. Lors d'une récente avancée, des chercheurs japonais ont identifié une nouvelle souche fongique filamenteuse capable de dégrader la patuline en la transformant en substances moins toxiques. Leurs découvertes fournissent des informations importantes sur les mécanismes de dégradation de la patuline présents dans la nature et peuvent conduire à de nouvelles façons de maîtriser la toxicité de la patuline dans nos approvisionnements alimentaires.

La patuline (C7H6O4), une mycotoxine produite par plusieurs types de champignons, est toxique pour diverses formes de vie, notamment les humains, les mammifères, les plantes et les micro-organismes. En particulier, les environnements dépourvus de mesures d'hygiène appropriées pendant la production alimentaire sont susceptibles d'être contaminés par la patuline, car bon nombre de ces espèces de champignons ont tendance à se développer sur des fruits endommagés ou en décomposition, en particulier les pommes, et même à contaminer les produits à base de pommes, tels que la compote de pommes, le jus de pomme, les confitures, et les cidres.

Responsable d'une grande variété de risques pour la santé, notamment des nausées, une congestion pulmonaire, des ulcères, des hémorragies intestinales et des conséquences encore plus graves, telles que des dommages à l'ADN, une immunosuppression et un risque accru de cancer, la toxicité de la patuline est une préoccupation majeure dans le monde entier. En conséquence, de nombreux pays ont imposé des restrictions sur les niveaux autorisés de patuline dans les produits alimentaires, en particulier dans les aliments pour bébés, car les nourrissons sont plus vulnérables aux effets de la patuline.

Le traitement de la toxicité de la patuline comprend l'oxygénothérapie, l'immunothérapie, la thérapie de désintoxication et la thérapie nutritionnelle. Cependant, comme il vaut souvent mieux prévenir que guérir, les scientifiques sont à la recherche de moyens efficaces pour atténuer la toxicité de la patuline dans les produits alimentaires. À cette fin, une équipe de recherche comprenant le professeur Toshiki Furuya de la Tokyo University of Science (TUS) au Japon, a récemment recherché des micro-organismes du sol susceptibles de contribuer à contrôler la toxicité de la patuline. Leur étude, publiée en ligne dans le volume 12, numéro 4 de MicrobiologyOpen le 11 août 2023, a été co-écrite par Mme Megumi Mita, Mme Rina Sato et Mme Miho Kakinuma, toutes de la TUS.

L’équipe a cultivé des micro-organismes à partir de 510 prélèvements de sol dans un environnement riche en patuline, à la recherche de ceux qui prospéreraient en présence de la mycotoxine. Ensuite, dans une deuxième expérience de dépistage, ils ont utilisé la chromatographie liquide à haute performance (HPLC) pour déterminer les survivants les plus efficaces pour dégrader la patuline en d'autres substances chimiques moins nocives. En conséquence, ils ont identifié une souche de champignon filamenteux (moisissure), Acremonium sp. ou «TUS-MM1», appartenant au genre Acremonium.

L’équipe a ensuite réalisé diverses expériences pour faire la lumière sur les mécanismes par lesquels TUS-MM1 a dégradé la patuline. Cela impliquait d'incuber la souche de moisissures dans une solution riche en patuline et de se concentrer sur les substances qui apparaissaient progressivement à l'intérieur et à l'extérieur de ses cellules en réponse à la patuline au fil du temps.

Une découverte importante a été que les cellules TUS-MM1 transformaient toute patuline absorbée en acide désoxypatulinique, un composé beaucoup moins toxique que la patuline, en y ajoutant des atomes d'hydrogène. «Lorsque nous avons commencé cette recherche, une seule autre souche de champignon filamenteux dégradait la patuline», a commenté le Dr Furuya. «Cependant, avant la présente étude, aucun produit de dégradation n'avait jamais été identifié. À cet égard, à notre connaissance, TUS-MM1 est le premier champignon filamenteux capable de dégrader la patuline en acide désoxypatulinique.»

De plus, l’équipe a découvert que certains composés sécrétés par les cellules TUS-MM1 peuvent également transformer la patuline en d’autres molécules. En mélangeant la patuline avec les sécrétions extracellulaires des cellules TUS-MM1 et en utilisant la HPLC, ils ont observé divers produits de dégradation générés par la patuline. Il est encourageant de constater que des expériences sur des cellules de la bactérie E. coli ont révélé que ces produits sont nettement moins toxiques que la patuline elle-même. Grâce à d’autres analyses chimiques, l’équipe a montré que le principal agent responsable de la transformation de la patuline en dehors des cellules était un composé thermiquement stable mais hautement réactif, doté d’un faible poids moléculaire.

Dans l’ensemble, les résultats de cette étude nous rapprochent de solutions efficaces pour maîtriser les niveaux de patuline dans les aliments. Le Dr Furuya a spéculé : «Élucider les voies par lesquelles les micro-organismes peuvent dégrader la patuline serait utile non seulement pour accroître notre compréhension des mécanismes sous-jacents dans la nature, mais également pour faciliter l'application de ces organismes dans les efforts de biocontrôle.»

Comment être un consommateur attentif ? En signalant un problème de sécurité des aliments !

Attention, acheteurs ! J’ai trouvé des saucisses de marque Johnsonville très moisies, mais avec un rabais en vente chez Vons (un supermarché) à Otay Ranch (Californie).

Vons et Johnsonville, une action immédiate pour assurer la sécurité des aliments est nécessaire.

🚨Attention, shoppers! Found #Johnsonville sausages heavily molded but discounted, for sale at #Vons in #OtayRanch.
@Johnsonville @vons Immediate action to ensure the safety of consumers is crucial #FoodSafety #QualityNotQuantity #CustomerCare @US_FDA @CDCgov @foodsafetygov pic.twitter.com/dwUtSeXCZ5

— Ejay's Adventures (@ejay0621) August 29, 2023

Prendre son déjeuner dans un fast food, ce n'était pas une si bonne idée que ça ?

Je suis allée chez Wendy's pour le déjeuner aujourd'hui et ils m'ont servi un sandwich où le pain était plein de moisissures !

Le pire, c'est que j'étais occupée à envoyer des SMS à mon mari et j'ai pris une énorme bouchée avant de m'en rendre compte ...

I went to @Wendys for lunch today and they served me a sandwich where the bread was full of mold!
Worst part was I was busy texting my husband and took a huge bite before noticing 🤢🤢#wendys #foodsafety #mold pic.twitter.com/ziJFvWkoZk

— Ashley Nicole (@ash_of_diamond) August 17, 2023

Réponse de Wend’y’s

Nous n'aimons certainement pas entendre cela. Veuillez nous envoyer par messagerie directe l'adresse complète de l'endroit où vous avez été, ainsi que votre nom et prénom, votre numéro de téléphone et votre adresse mail afin que quelqu'un puisse vous contacter.

Moisissures dans les aliments : identifier les toxines mutagènes et cancérigènes, selon un outil de prédiction de l'Anses

«Moisissures dans les aliments : identifier les toxines mutagènes et cancérigènes», source Anses.

L’utilisation combinée de différents logiciels informatiques pourrait accélérer l’acquisition de connaissances sur les toxines produites par les moisissures se développant dans les aliments, appelées mycotoxines. Cette approche innovante a été utilisée par des scientifiques de l’Anses pour identifier les mycotoxines qui pourraient être mutagènes et/ou cancérigènes.

Les moisissures dans les aliments, notamment ceux d’origine végétale, peuvent produire des toxines, les mycotoxines, dont certaines peuvent favoriser des mutations génétiques ou des cancers chez l’être humain ou les animaux : «Les moisissures peuvent se développer tout le long de la production de l’aliment, depuis sa culture jusqu’au produit fini», explique Denis Habauzit, chargé de projet au sein de l’unité Toxicologie des contaminants, du laboratoire Anses de Fougères. Céréales, fruits ou légumes : de nombreux aliments sont susceptibles d’être contaminés par les mycotoxines.

La réglementation européenne limite strictement la quantité maximale autorisée pour les principales mycotoxines susceptibles d’être présentes dans les aliments mis sur le marché, mais les données manquent pour les autres : «Des travaux de recherche ont montré que les aliments peuvent contenir des mycotoxines pour lesquelles nous n’avons pas ou peu d’information concernant leur toxicité et qui ne sont ni réglementées ni surveillées», indique Valérie Fessard, cheffe de l’unité.

Des outils informatiques pour repérer les molécules les plus toxiques

Afin d’identifier les mycotoxines ayant une activité mutagène ou cancérigène, les scientifiques de l’unité se sont appuyés sur la modélisation informatique. Ils ont utilisé une combinaison de logiciels de type «Quantitative structure-activity relationship» (QSAR), qui permettent de prédire les effets des molécules sur les êtres vivants selon leur structure. Cette méthode a l’avantage de permettre une première caractérisation des mycotoxines, qui sont difficiles à synthétiser et à purifier. Elle évite d’avoir à les tester et particulièrement à avoir recours à l’expérimentation animale. Les résultats sont parus dans la revue Environmental Pollution en avril 2023.

L’équipe a sélectionné les combinaisons de logiciels les plus performantes en les testant sur des mycotoxines dont le potentiel cancérigène ou mutagène est connu. Tous les logiciels sélectionnés étaient gratuits, pour faciliter leur utilisation par d’autres équipes de recherche. Les scientifiques ont ensuite analysé 904 mycotoxines et métabolites de mycotoxines provenant de la base de données créée par l’équipe. Résultats : 127 auraient un potentiel mutagène et 548 pourraient être cancérigènes.

Selon l’Anses, il s’agit d’«Un premier tri à affiner».

 «Les logiciels sont encore en développement, prévient Denis Habauzit, un risque d’erreur est possible. Mais cela permet d’alerter sur certaines molécules et d’identifier celles sur lesquelles il faudrait faire en priorité des études de toxicologie expérimentale.» 

95 de ces mycotoxines seraient à la fois mutagènes et cancérigènes. De ce fait, elles pourraient représenter un risque pour la santé même en petite quantité.

En parallèle, les effets potentiels des mycotoxines devront être croisés avec les quantités de ces molécules retrouvées effectivement dans l’alimentation humaine et animale, pour déterminer le risque qu’elles représentent réellement. 

Commentaire

Nous n’en sommes pour l’instant qu’au stade des prédictions, mais «le changement climatique et la restriction d’usage des fongicides pourraient favoriser le développement de moisissures et la contamination des aliments par des mycotoxines émergentes.»

Je ne sais pas entre deux maux lequel choisir, des fongicides ou les mycotoxines. On n’a pas fini d’en entendre parler, mais rappelez-vous déjà ce qui était rapporté à propos du datura ou les fleurs du mal dans le bulletin des vigilances de l’Anses, Juin 2018),

Il est probable que la mise en œuvre des nouvelles dispositions réglementaires puisse expliquer que ces plantes se développent en ville ce qui était moins le cas dans le passé.

Y’aurait donc du bien dans le passé, du temps pas si lointain, où il y avait des fongicides ?

Des essais sur du fromage montrent que des antibiotiques fongiques peuvent influencer le développement du microbiome bactérien

«Des essais sur du fromage montrent que des antibiotiques fongiques peuvent influencer le développement du microbiome bactérien», source ASM News du 10 mai 2023.

Des moissiures produisent des métabolites que les humains ont utilisés pour améliorer leur santé. Par exemple, ils sécrètent de la pénicilline, qui est ensuite purifiée et utilisée comme antibiotique pour l'homme, conduisant au développement de nombreux autres antibiotiques. Cependant, l'écologie des métabolites fongiques dans les communautés microbiennes n'est pas bien comprise. Dans une nouvelle étude, des chercheurs utilisent des croûtes de fromage pour démontrer que les antibiotiques fongiques peuvent influencer le développement des microbiomes. L'étude est publiée dans mBio, une revue en accès libre de l'American Society for Microbiology.

«Mon laboratoire s'intéresse à la façon dont les champignons (moisissures) façonnent la diversité des communautés microbiennes là où ils vivent. Les moisissures sont répandus dans de nombreux écosystèmes microbiens, des sols à notre propre corps, mais nous en savons beaucoup moins sur leur diversité et leurs rôles dans les microbiomes par rapport aux bactéries plus largement étudiées», a dit le chercheur principal de la nouvelle étude, Benjamin Wolfe, du Département de biologie de l'Université Tufts. Son laboratoire étudie comment les champignons interagissent avec d'autres microbes dans les communautés microbiennes, en mettant l'accent sur les interactions bactériennes fongiques. «Pour étudier l'écologie des champignons et leurs interactions avec les bactéries, nous utilisons des croûtes de fromage comme écosystème microbien modèle pour comprendre ces questions de biologie de base», a dit Wolfe.

Les croûtes de fromage sont des communautés microbiennes qui se forment à la surface des fromages vieillis naturellement comme le brie, le taleggio et certains cheddars. Les couches pelucheuses et parfois collantes à la surface de ces fromages sont des communautés de microbes qui se développent au fur et à mesure que le fromage vieillit. Ils décomposent lentement le caillé du fromage en se développant à la surface et produisent des arômes et des pigments qui confèrent à chaque fromage artisanal des propriétés uniques.

Il y a plusieurs années, un fromager a contacté Wolfe avec un problème de moisissures : une moisissure devenait abondante sur les surfaces des fromages du fromager et perturbait le développement normal de leur croûte. Il semblait que les croûtes disparaissaient alors que la moisissure envahissait leur cave à fromages. Cette invasion de moisissures a fourni une occasion parfaite à Wolfe et à ses collègues d'étudier l'écologie, la génétique et la chimie des interactions fongiques-bactériennes.

L'équipe de Wolfe a commencé une collaboration avec le laboratoire de Nancy Keller à l'Université du Wisconsin pour essayer de comprendre comment cette moisissure avait un impact sur la communauté microbienne de la croûte. Ils voulaient savoir ce que la moisissure faisait aux microbes de la croûte et quels produits chimiques la moisissure pouvait produire et qui pourraient perturber la croûte.

Pour mener leur étude, les chercheurs ont d'abord supprimé un gène (laeA) dans la moisissure Penicillium qui est connu pour contrôler l'expression de produits chimiques que les champignons peuvent sécréter dans leur environnement. Ces composés sont appelés métabolites spécialisés ou secondaires. «Nous savons que de nombreux champignons peuvent produire des métabolites qui sont des antibiotiques parce que nous les avons utilisés comme médicaments pour les humains, mais nous en savons étonnamment peu sur le fonctionnement des antibiotiques fongiques dans la nature», a dit le Dr Wolfe. «Les champignons utilisent-ils réellement ces composés pour tuer d'autres microbes ? Comment ces antibiotiques produits par les champignons affectent-ils le développement des communautés bactériennes ? Nous avons ajouté notre Penicillium normal et notre Penicillium sans laeA à une communauté de bactéries de la croûte de fromages pour voir si la suppression de laeA provoquait des changements dans le développement de la communauté de bactéries.»

Les chercheurs ont découvert que lorsqu'ils supprimaient laeA, la majeure partie de l'activité antibactérienne de la moisissure Penicillium était perdue. C'était passionnant car cela a permis aux chercheurs de réduire les régions spécifiques du génome fongique qui pourraient être responsables de la production des composés antibactériens. Ils ont finalement pu les réduire à une classe de composés appelés pseurotins. Ce sont des métabolites produits par une gamme de champignons qui se sont révélés avoir des activités biologiques intéressantes, notamment la modulation du système immunitaire, la destruction des insectes et l'inhibition bactérienne.

L'étude est la première à montrer que les pseurotins peuvent contrôler la croissance et le développement des communautés bactériennes vivant avec ce champignon. Les pseurotines produites par la moisissure Penicillium dans le fromage sont fortement antibactériennes et inhibent considérablement certaines bactéries par rapport à d'autres (les bactéries inhibées étaient Staphylococcus, Brevibacterium, Brachybacterium et Psychrobacter, que l'on trouve sur de nombreux fromages artisanaux). Cela a provoqué un changement radical dans la composition du microbiome de la croûte du fromage en présence des pseurotines produites par Penicillium.

Cette étude démontre que les antibiotiques sécrétés par les champignons peuvent contrôler le développement du microbiome. Étant donné que de nombreux champignons produisent des métabolites similaires dans une gamme d'autres écosystèmes, du microbiome humain aux écosystèmes du sol, les chercheurs s'attendent à ce que ces mécanismes d'interactions fongiques-bactériennes soient répandus.

«Nos résultats suggèrent que certaines espèces de moisissures embêtantes dans les fromages artisanaux peuvent perturber le développement normal du fromage en déployant des antibiotiques», a dit Wolfe. «Ces résultats nous permettent de travailler avec des fromagers pour identifier quelles moisissures sont les mauvaises et comment les gérer dans leurs caves à fromages. Cela nous aide également à comprendre que chaque fois que nous mangeons du fromage artisanal, nous consommons les métabolites que les microbes utilisent pour rivaliser et coopérer dans les communautés.»

Le microbiome d'un centre commercial est le reflet de ses clients

Les centres commerciaux sont une plaque tournante de l'activité, tant pour les personnes que pour les agents pathogènes. De nouvelles recherches en microbiologie sur le microbiome des centres commerciaux sont publiées sur le site de l’American Society for Microbiology (ASM); cela montre que le microbiome d'un centre commercial reflète ses clients (A Shopping Mall’s Microbiome Mirrors Its Shoppers).

Faits saillants

- Des chercheurs ont analysé les populations microbiennes des surfaces de 20 centres commerciaux en Chine.

- Chaque microbiome du centre commercial était différent, mais l'étude a trouvé un noyau commun, comprenant de nombreux agents pathogènes.

- Une meilleure compréhension des microbiomes des centres commerciaux pourrait améliorer les stratégies de surveillance des menaces émergentes pour la santé publique.

Les gens affluent vers les centres commerciaux pour toutes sortes de raisons. Mais l'argent n'est pas la seule chose qu'ils laissent derrière eux, et les sacs à provisions ne sont pas les seules choses qu'ils rapportent à la maison.

Cette semaine dans mSystems, des chercheurs rapportent (Dynamics of Microbial Community and Potential Microbial Pollutants in Shopping Malls) que les sols, escaliers mécaniques et autres surfaces des centres commerciaux ont leurs propres communautés microbiennes, assemblées à partir des microbes des personnes qui les traversent. Le microbiome du centre commercial comprend une grande partie d'agents pathogènes potentiels, en particulier à l'intérieur du bâtiment, ce qui suggère que la transmission de surfaces à personne pourrait propager la maladie.

«Les surfaces des centres commerciaux agissent comme une voie par laquelle les microbes se déplacent entre les zones des centres commerciaux, même entre des régions très éloignées», a dit Xin-Li An de l'Institut de l'environnement urbain (IUE) de l'Académie chinoise des sciences, à Xiamen. Elle a codirigé l'étude avec Jian-Xin Xu, au même institut. «L'exposition de la population au microbiome du centre commercial modifie peut-être la trajectoire de la santé en mettant des personnes en contact avec des agents pathogènes», a-t-elle dit.

Les résultats suggèrent que le mouvement des agents pathogènes dans un centre commercial ne se limite pas aux rencontres de personne à personne, mais peut également se produire par le biais de transmissions de personnes aux surfaces ou de surfaces aux personnes.

Dans des études précédentes, des chercheurs en Chine ont rapporté que les centres commerciaux avaient été au centre de nombreuses épidémies locales de la Covid-19 pendant la pandémie. Ces études ont amené An et ses collègues à réfléchir au rôle des centres commerciaux, qui rassemblent des personnes pour diverses activités, dans la propagation des agents pathogènes en général.

«Les centres commerciaux pourraient être un environnement de propagation de la contamination microbienne», a dit An.

Les chercheurs ont prélevé des échantillons au printemps et à l'été 2022 sur les sols et les escaliers mécaniques de 20 centres commerciaux de Xiamen, Chine, ainsi que sur l'extérieur immédiat du bâtiment, y compris les sols de la ceinture verte et la poussière des routes. Ils ont utilisé le séquençage de l'ARNr 16s pour analyser les échantillons de populations bactériennes et l'amplification ITS (Internal Transcribed Spacer) pour identifier les espèces fongiques. Ils ont trouvé la plus grande richesse en espèces bactériennes dans les sols des centres commerciaux, suivis des escaliers mécaniques, puis de la poussière des routes, et enfin des sols de la ceinture de verdure.

Les environnements intérieurs ont montré des concentrations plus élevées d'agents pathogènes humains, ainsi qu'une proportion plus élevée de gènes associés à la résistance aux antimicrobiens, que les prélèvements extérieurs. Les espèces qui dominaient la population variaient selon la saison. Et bien que les microbiomes variaient d'un centre commercial à l'autre et d'une saison à l'autre, les chercheurs ont trouvé une communauté microbienne centrale qui était partagée dans plus de 80% des 274 prélèvements totaux. La plupart de ces microbes étaient associés à des agents pathogènes potentiels.

Ce noyau comprenait Acinetobacter baumannii, une bactérie Gram négatif à l'origine de nombreuses infections nosocomiales. Il y avait également Kocuria kristinae, une bactérie Gram positif habituellement inoffensive qui vit sur la peau et peut provoquer des infections chez les patients dont le système immunitaire est affaibli. Cladosprorium, une type de moisissure qui peut provoquer des allergies et, dans certains cas, des infections, faisait également partie de la communauté de base.

Les travaux d'An à l'IUE se concentrent sur les agents pathogènes humains, en particulier les virus et les bactéries dotés de gènes de résistance aux antimicrobiens, dans les environnements urbains. Outre les centres commerciaux, ces environnements comprennent les usines de traitement des eaux usées, les marchés humides et les fermes. Comprendre le microbiome du centre commercial est un élément important d'un objectif plus large de surveillance des menaces potentielles pour la santé publique. La prochaine étape consiste à collecter plus de données sur la façon dont un microbiome de centre commercial change dans le temps et dans l'espace, et à rechercher plus de points communs.

La nouvelle étude suggère une autre direction pour de nouvelles recherches, a ajouté An, pour étudier les expositions microbiennes qui surviennent par la respiration. Dans une future étude, les chercheurs prévoient de se concentrer sur le microbiome de l'air dans les centres commerciaux.

L'OMS identifie des pathogènes fongiques potentiellement mortels

«L'OMS identifie des pathogènes fongiques potentiellement mortels», source article de Chris Dal dans CIDRAP News du 25 octobre 2022.

L'Organisation mondiale de la santé (OMS) a publié le 25 octobre sa toute première liste de «pathogènes prioritaires» fongiques, identifiant 19 champignons qui sont apparus comme des menaces importantes pour la santé publique en raison de leur capacité à provoquer des infections invasives graves et de leur résistance croissante aux antifongiques.

Bien que les données sur la prévalence des infections fongiques invasives et les schémas de résistance aux antifongiques soient rares et que l'on en sache peu sur certains de ces pathogènes, les responsables de l'OMS affirment que de nouvelles preuves suggèrent que l'incidence et l'étendue géographique des maladies fongiques augmentent en raison du changement climatique et de l'augmentation des voyages mondiaux. La pandémie de la COVID-19 a également mis en lumière le problème, l'incidence signalée d'infections fongiques invasives augmentant chez les patients hospitalisés atteints de COVID.

En outre, la population la plus exposée aux infections invasives causées par ces pathogènes, notamment les patients cancéreux, les personnes vivant avec le VIH/sida, les receveurs d'organes et d'autres patients immunodéprimés, est en augmentation.

Les responsables de l'OMS craignent que le nombre limité de médicaments antifongiques, le manque de diagnostics rapides et sensibles et les ressources financières limitées consacrées aux infections fongiques n'entravent la capacité de détecter et de répondre au problème croissant. Ils espèrent que la liste des pathogènes fongiques prioritaires pourrait avoir un impact similaire à celui du document sur lequel elle a été modélisée - la liste 2017 de l'OMS des pathogènes bactériens prioritaires.

En fait, il s’agit de la liste de bactéries contre lesquelles il est urgent d’avoir de nouveaux antibiotiques.-aa.

Nous voulons que ce rapport catalyse la recherche et le développement sur de nouveaux antifongiques et de nouveaux diagnostics sur les maladies fongiques», a dit Haileyesus Getahun, directeur de la coordination mondiale de la résistance aux antimicrobiens (RAM) à l'OMS, lors d'un point de presse.

Il a ajouté que l'identification de ces 19 pathogènes fongiques parmi des milliers de champignons aidera à orienter les efforts de recherche et à orienter les investissements publics et privés indispensables dans les traitements et les diagnostics.

Actuellement, les infections fongiques reçoivent moins de 1,5% de tous les financements de recherche sur les maladies infectieuses.

Focus sur les infections fongiques invasives

Comme le rapport de 2017 sur les pathogènes bactériens prioritaires, le document est divisé en trois catégories en fonction de l'impact sur la santé publique et/ou du risque émergent de résistance aux antifongiques : priorité critique, élevée et moyenne, avec une note indiquant que certains des pathogènes pourraient être plus préoccupants. dans les régions où elles sont endémiques. Pour chaque catégorie, la résistance aux antifongiques était le critère le plus important, suivi de l'incidence annuelle, de la morbidité et de la mortalité.

Parmi les champignons du groupe prioritaire critique se trouve Candida auris, la levure multirésistante qui a été découverte pour la première fois au Japon en 2009 et qui s'est depuis propagée dans le monde entier. Les infections invasives causées par C. auris, qui se propage facilement dans les établissements de santé et, dans certains cas, résiste à toutes les classes de médicaments antifongiques, sont mortelles chez 53% des patients.

Une autre espèce de Candida qui a reçu une priorité critique est Candida albicans, qui est commune dans la bouche, la gorge, l'intestin, le vagin et la peau, mais peut provoquer une maladie grave lorsqu'elle envahit d'autres tissus.

Figurent également dans le groupe prioritaire critique Crytptococcus neoformans, une levure pathogène qui vit dans l'environnement et peut provoquer de graves infections après avoir été inhalée, et Aspergillus fumigatus, une moisissure environnementale qui peut provoquer de graves infections pulmonaires et constitue une menace particulière pour la fibrose kystique, la grippe , et les patients atteints de la COVID-19.

Parmi les champignons répertoriés comme hautement prioritaires figurent trois autres espèces de Candida (Candida glabrata, Candida tropicalis et Candida parapsilosis), Histoplasma spp. et Mucorales (un grand groupe de champignons composé de différents genres). Le groupe de priorité moyenne comprend Scedosporium spp., Candida krusei et Coccidioides spp., qui causent la fièvre de la vallée.

La plus grande préoccupation avec ces pathogènes est lorsqu'ils pénètrent dans la circulation sanguine, en particulier chez les patients gravement malades et immunodéprimés. Carmem Pessoa-Silva, chef d'équipe de l’AMR à l'OMS, a souligné la présence d'espèces de Candida dans les trois groupes, notant la capacité du champignon à provoquer des infections mortelles du sang.

«La mortalité attribuable aux infections du sang à Candida est très élevée», a-t-elle dit. «Les chiffres varient selon les études, mais c'est presque toujours au-dessus de 30%.»

En raison de la mortalité estimée élevée et du besoin de plus de données, Pessoa-Silva a dit que l'OMS avait commencé à surveiller l'incidence des infections à Candida dans le sang dans 23 pays. Elle a également dit que le système mondial de surveillance de la résistance et de l'utilisation des antimicrobiens (GLASS pour Global Antimicrobial Resistance and Use Surveillance System) de l'OMS collectera bientôt des données sur la résistance des isolats d'infections sanguines à Candida, qui sont devenues de plus en plus résistantes aux quatre classes de médicaments antifongiques (azolés, échinocandines, polyènes et pyrimidines) actuellement utilisé en pratique clinique.

«Pour la plupart des pathogènes critiques et hautement prioritaires, les options de traitement sont limitées et très toxiques», a-t-elle dit.

Pessoa-Silva a dit qu'en plus d'une surveillance accrue et du développement antifongique, une plus grande capacité de laboratoire et de meilleurs outils de diagnostic sont aussi désespérément nécessaire. Elle a noté que parce que les infections fongiques invasives ont souvent des symptômes similaires aux infections bactériennes, les patients sont souvent mal diagnostiqués et sont traités avec des antibiotiques au lieu d'antifongiques.

Un problème One Health

Les responsables de l'OMS ont également souligné le fait que l'émergence de pathogènes fongiques résistants en tant que menace mondiale pour la santé publique est un problème d’une seule santé, motivé en partie par l'utilisation inappropriée d'antifongiques dans l'agriculture. Par exemple, le rapport note que l'utilisation généralisée des azolés comme fongicides pour protéger les plantes contre les infections fongiques a contribué à l'augmentation des taux d'infections d’A fumigatus résistantes aux azolés chez l'homme. Les azolés sont le traitement de première intention de l'aspergillose invasive.

Gethun a dit que les organisations quadripartites (l'OMS, la FAO, l'Organisation mondiale de la santé animale et le Programme des Nations Unies pour l'environnement) ont commencé à prendre des mesures pour identifier les antifongiques essentiels à la santé humaine et élaborer des stratégies pour garantir qu'ils ne sont pas utilisés de manière inappropriée dans l'agriculture.

Les responsables de l'OMS ont dit que bien qu'il existe d'importantes lacunes dans les connaissances sur le fardeau mondial des pathogènes fongiques invasifs, il est important de «sonner l'alarme» maintenant et de commencer à stimuler les investissements de recherche ciblés et les interventions de santé publique. Hatim Sati, responsable technique de la division RAM de l'OMS, a dit que si une chose a été apprise de la pandémie de COVID-19, c'est que si vous pouvez faire quelque chose dès le début pour informer la réponse de santé publique, cela devrait être fait.

«Nous n'avons pas besoin d'attendre que les choses soient catastrophiques pour agir», a-t-il dit.

Fiche introductive aux mycotoxines par l'Académie d’Agriculture de France

«Fiche introductive aux mycotoxines », source Académie d’Agriculture de France.

Fiche questions sur n° 08.02.Q10, par Dominique PARENT-MASSIN et Isabelle OSWALD, membres de l'Académie d'Agriculture de France, février 2022

Mots clés : toxine naturelle - toxique - récolte - moisissure - alimentation - risque - sécurité alimentaire – aliment.

À l’heure où le consommateur considère que le naturel est sain et que les produits naturels ne peuvent être toxiques, il est bon de se souvenir que les plus puissants poisons sont d’origine naturelle, et que certaines toxines naturelles sont potentiellement présentes dans les denrées alimentaires ; les mycotoxines de la famille des trichothécènes sont suspectées d’avoir été utilisées comme arme chimique dans la seconde partie du XXe siècle en Asie ou au Moyen-Orient.

Les mycotoxines sont des produits du métabolisme secondaire secrétés par des moisissures appartenant notamment aux genres Aspergillus, Penicillium et Fusarium. Elles peuvent se développer sur la plante au champ ou en cours de stockage, et présentent une toxicité à l'égard de l'Homme et des animaux.

Les mycotoxines peuvent persister sur la denrée alimentaire bien après la disparition de la moisissure, et résistent à de très fortes températures lors de la cuisson.

Certaines mycotoxines présentant une forte toxicité ou une forte prévalence dans les denrées alimentaires, la Commission européenne a mis en place une réglementation qui définit les seuils tolérables et vise à garantir une alimentation saine (règlement européen 1881/2006 du 19 décembre 2006). En 2022, ce règlement est en cours de révision pour certaines denrées et certaines mycotoxines.

Ce qu'il faut retenir : Dans un contexte où les risques induits par la présence de résidus de produits phytopharmaceutiques dans l'alimentation inquiètent le grand public, il est important rappeler que des toxines naturelles – comme les mycotoxines – peuvent faire courir aux consommateurs des risques plus importants que les résidus de produits phytopharmaceutiques.  Sur le terrain, on constate que la diminution de l'usage des fongicides favorise la réémergence de l'ergot de seigle.

Aux lecteurs du blog

Je suis en conflit depuis plusieurs années avec la revue PROCESS Alimentaire pour une triste question d’argent qui permettrait de récupérer et de diffuser correctement les 10 052 articles initialement publiés gracieusement par mes soins de 2009 à 2017 sur le blog de la revue, alors qu’elle a bénéficié de la manne de la publicité faite lors de la diffusion de ces articles. Le départ du blog de la revue a été strictement motivé par un manque de réactivité dans la maintenance du blog, la visibilité de celui-ci devenant quasi nulle. J’accuse la direction de la revue de fuir ses responsabilités et le but de ce message est de leur dire toute ma colère. Elle ne veut pas céder, moi non plus, et je lui offre ainsi une publicité gratuite.

Une nouvelle nanotechnologie qui détruit les bactéries et les cellules fongiques

Une cellule fongique (verte) interactive avec une couche d'une épaisseur nano de phosphore noir (rouge). Image agrandie 25 000 fois.

«Un tueur de supermicrobes une nouvelle nanotechnologie qui détruit les bactéries et les cellules fongiques», source RMIT University.

Le revêtement antimicrobien d'une épaisseur nanométrique pourrait prévenir et traiter des infections potentiellement mortelles.

Des chercheurs ont mis au point un nouveau revêtement destructeur de bactéries qui pourrait être utilisé sur les pansements et les implants pour prévenir et traiter les infections bactériennes et fongiques potentiellement mortelles.

Le matériau est l'un des revêtements antimicrobiens les plus minces développés à ce jour et est efficace contre un large éventail de bactéries et de cellules fongiques résistantes aux médicaments, tout en laissant les cellules humaines indemnes.

La résistance aux antibiotiques est une menace majeure pour la santé mondiale, causant au moins 700 000 décès par an. Sans le développement de nouvelles thérapies antibactériennes, le nombre de morts pourrait s'élever à 10 millions de personnes par an d'ici 2050, ce qui équivaut à 100 milliards de dollars en soins de santé.

Bien que la charge sanitaire des infections fongiques soit moins reconnue, elles tuent environ 1,5 million de personnes chaque année dans le monde et le nombre de décès augmente. Une menace émergente pour les patients hospitalisés COVID-19, par exemple, est une champignon courante, Aspergillus, qui peut provoquer des infections secondaires mortelles.

Le nouveau revêtement d'une équipe dirigée par l'Université RMIT de Melbourne, en Australie, est basé sur un matériau 2D ultra-fin qui, jusqu'à présent, était principalement intéressant pour l'électronique de nouvelle génération.

Des études sur le phosphore noir (PN) ont indiqué qu'il possède certaines propriétés antibactériennes et antifongiques, mais le matériau n'a jamais été examiné méthodiquement pour une utilisation clinique potentielle.

La nouvelle étude, publiée dans la revue Applied Materials & Interfaces de l'American Chemical Society, révèle que le PN est efficace pour tuer les microbes lorsqu'il est répandue en couches nanométriques sur des surfaces comme le titane et le coton, utilisées pour fabriquer des implants et des pansements.

Le co-chercheur principal, le Dr Aaron Elbourne, a dit que la découverte d'un matériau capable de prévenir les infections bactériennes et fongiques était une avancée significative.

«Ces agents pathogènes sont responsables d'énormes fardeaux pour la santé et à mesure que la résistance aux médicaments continue de croître, notre capacité à traiter ces infections devient de plus en plus difficile», a dit Elbourne, boursier postdoc à la School of Science du RMIT.

SARM avant et après exposition au nanorevêtement.

«Nous avons besoin de nouvelles armes intelligentes pour la guerre contre les superbactéries, qui ne contribuent pas au problème de la résistance aux antimicrobiens.»

«Notre revêtement d'une épaisseur nanométrique est un double tueur de microbes qui agit en éclatant les bactéries et les cellules fongiques, ce à quoi les microbes auront du mal à s'adapter. Il faudrait des millions d'années pour développer naturellement de nouvelles défenses contre une attaque physique aussi mortelle.»

«Bien que nous ayons besoin de recherches supplémentaires pour être en mesure d'appliquer cette technologie dans des contextes cliniques, il s'agit d'une nouvelle direction passionnante dans la recherche de moyens plus efficaces pour relever ce grave défi de santé.

Le co-chercheur principal, le professeur Sumeet Walia, de la School of Engineering du RMIT, a précédemment mené des études révolutionnaires sur l'utilisation du PN pour la technologie de l'intelligence artificielle et l'électronique imitant le cerveau.

«Le PN s'arrête de fonctionner en présence d'oxygène, qui est normalement un énorme problème pour l'électronique et quelque chose que nous avons dû surmonter avec une ingénierie de précision minutieuse pour développer nos technologies», a dit Walia.

«Mais il s'avère que les matériaux qui se dégradent facilement avec l'oxygène peuvent être idéaux pour tuer les microbes - c'est exactement ce que recherchaient les scientifiques travaillant sur les technologies antimicrobiennes.»

«Notre problème était donc leur solution.»

Comment fonctionne la nanocouche tueuse de microbes ?

Lorsque le PN se décompose, il oxyde la surface des bactéries et des cellules fongiques. Ce processus, connu sous le nom d'oxydation cellulaire, finit par les éclater.

Dans la nouvelle étude, le premier auteur et chercheur en doctorat Zo Shaw a testé l'efficacité de couches nanométriques de PN contre cinq souches de bactéries courantes, dont E. coli et le SARM résistant aux antibiotiques, ainsi que cinq types de champignons, dont Candida auris.

En seulement deux heures, jusqu'à 99% des cellules bactériennes et fongiques ont été détruites.

Surtout, le PN a également commencé à se dégrader pendant ce temps et a été entièrement désintégré en 24 heures - une caractéristique importante qui montre que le matériau ne s'accumulerait pas dans le corps.

L'étude de laboratoire a identifié les niveaux optimaux de PN qui ont un effet antimicrobien mortel tout en laissant les cellules humaines saines et entières.

Les chercheurs ont désormais commencé à expérimenter différentes formulations pour tester l'efficacité sur une gamme de surfaces médicalement pertinentes.

L'équipe souhaite collaborer avec des partenaires potentiels de l'industrie pour développer davantage la technologie, pour laquelle une demande de brevet provisoire a été déposée.

Burger King: la nouvelle publicité avec un hamburger qui moisit parce qu'il est sans additif

J'emprunte cet article à Roberto LaPira de l'eccelente blog il fatto alimentare : « Burger King: la nouvelle publicité avec un hamburger qui moisit parce qu'il est sans additif».

La chaîne de restauration rapide Burger King a lancé son nouveau hamburger «Moldy Whopper» grâce à une campagne publicitaire anormale, avec une publicité montrant ce qui arrive au sandwich après un mois de conservation. Au début de la publicité, nous voyons le nouveau hamburger «The Moldy Whopper» avec une apparence parfaite qui, cependant, au fil des jours, il progresse pour devenir un sandwich presque totalement moisi. L'idée des annonceurs est de souligner au public que le nouveau hamburger est composé uniquement d'ingrédients frais et donc sans conservateurs.

C'est une décision anormale dans le monde de la communication, où il y a généralement une tendance à présenter les produits sous un jour positif, et non dans leur détérioration. En termes de diffusion, la vidéo, également via la plateforme YouTube, a fonctionné, recueillant plusieurs centaines de milliers de vues en peu de temps. Moldy Whopper de Burger King fera son apparition dans les restaurants au cours des prochains mois. On se demande à quel point ce message fonctionne bien, qui veut inculquer aux consommateurs l'idée d'un produit sans additifs, mais à travers une image visuelle particulièrement provocante qui ne stimule pas l'appétit.

L'évolution du burger de Burger King : fraîchement préparé et après 34 jours.

Beaucoup , en voyant cette vidéo, auront pensé au concurrent, McDonald's, qui à plusieurs reprises a fait la une des journaux pour ses sandwichs «éternels» . Par exemple, le cas de Hjörtur Smárason qui fin octobre 2009, en Islande, a acheté un hamburger McDonald's avec des frites. Après plus de 5 ans, le sandwich était encore en excellent état, il n'y avait aucun signe de moisissure et pour cette raison, il est conservé comme héritage, dans une auberge de la ville de Skógarhlíð.

© Tous droits réservés. Photo: Burger King.

Rappel de Guinness 0,0% pour cause de contamination microbiologique. Sans alcool, la fête microbiologique est plus folle !

Wikipédia nous apprend ce qu'est une bière sans alcool,

C'est une bière à faible titre alcoolique dont la valeur est fixée par la règlementation du pays. En France, le titre alcoolique doit être inférieur à 1,2° (à titre de comparaison, le vin dit sans alcool présente un titre alcoolique de moins de 7°). Ce taux correspond au taux de l'Union européenne.

Grace à la technique d'osmose inverse ou de microgrillage, il est aujourd'hui possible de produire des références au titre « 0,0% » d'alcool ABV (Alcool by volume).

Par ailleurs, on apprenant le 26 octobre 2020, « Guinness fait le buzz et lance la Guinness 0.0, une bière sans alcool ». Une innovation qui divise les habitués de la célèbre 'black stuff'. Ça c'était il y a un peu moins d'un mois.

Mais patatras, voici que voilà selon la Food Standards Agency du Royaume-Uni et la Food Safety Authority of Ireland du 11 novembre 2020:

Diageo rappelle les lots ci-dessus de Guinness Draft 0,0% en raison de la présence possible de moisissures dans les produits. Cela peut rendre les produits dangereux à boire. Les lots concernés n'ont pas été vendus directement aux consommateurs en République d'Irlande, mais une petite quantité des lots concernés a été mise à disposition à titre gratuit.

Le communiqué de Guinness est le suivant:

Avis de rappel de Produit

À nos Consommateurs

Nous voulions vous faire savoir que par mesure de précaution, nous rappelons la Guinness 0.0 en Grande-Bretagne en raison d'une contamination microbiologique qui peut rendre certaines boîtes de Guinness 0.0 dangereuses à consommer.

La Food Standards Agency a maintenant terminé son évaluation et publié ses conclusions. Veuillez trouver l'évaluation complète ici.

Si vous avez acheté de la Guinness 0.0, ne la consommez pas. Veuillez plutôt renvoyer le produit à votre point d'achat pour un remboursement complet. Vous pouvez également contacter Diageo Consumer Careline sur consumercare.gbandireland@diageo.com ou 0345 601 4558 avec les détails de votre achat pour recevoir un bon de remboursement avant de jeter le produit.

Nous sommes désolés que cela se soit produit.

A noter que le communiqué de Guiness ne parle pas du rappel en Irlande ...

Dans un autre article de presse, on peut lire,

«Nos équipes travaillent d’arrache-pied pour en déterminer la cause», précisant qu’«aucune autre variante de Guinness ou marque ne sont concernées».

Que s'est-il passé à mon avis ?

L’osmose inverse est une technologie utilisée pour éliminer une grande majorité de contaminants de l’eau en poussant l’eau sous pression à travers une membrane semi-perméable.

Si un système d'osmose inverse n’est pas nettoyé et désinfecté régulièrement , il y a un potentiel pour la présence de bactéries et de moisissures dans la cuve de rétention, sur la membrane, et sur la paroi de la citerne. 

La contamination biologique, issue d'impuretés concentrées peuvent se déposer sur les membranes, surtout à l'arrêt. La croissance microbiologique sur les membranes, l'échec du prétraitement ou l'échec du dosage chimique peuvent également salir les membranes des osmoseurs.

Ces odeurs géniales de fromages permettent aux microbes de 'se parler' et de se nourrir

« Ces odeurs géniales de fromages permettent aux microbes de 'se parler' et de se nourrir », source communiqué de Tufts university et EurekAlert!

Les chercheurs découvrent que les bactéries qui affinent le fromage réagissent aux gaz volatils produits par les moisissures du fromage.

Des chercheurs de l'Université Tufts ont découvert que ces odeurs distinctement géniales du fromage sont un moyen pour les moisissures de communiquer avec les bactéries, et ce qu'ils disent a beaucoup à voir avec la délicieuse variété de saveurs que le fromage a à offrir.

L'équipe de recherche a découvert que les bactéries communes essentielles à l'affinage du fromage peuvent détecter et réagir aux composés produits par les moisissures dans la croûte et libérés dans l'air, améliorant ainsi la croissance de certaines espèces de bactéries par rapport à d'autres.

La composition des bactéries, des levures et des moisissures qui composent le microbiome du fromage est essentielle à la saveur et à la qualité du fromage, alors déterminer comment cela peut être contrôlé ou modifié ajoute de la science à l'art de la fabrication du fromage.

La découverte, publiée dans Environmental Microbiology, fournit également un modèle pour la compréhension et la modification d'autres microbiomes économiquement et cliniquement importants, comme dans le sol ou le tractus gastro-intestinal.

« Les humains apprécient les divers arômes des fromages depuis des centaines d'années, mais l'impact de ces arômes sur la biologie du microbiome du fromage n'a pas été étudié », a déclaré Benjamin Wolfe, professeur de biologie à l'École des arts et des sciences de l'Université Tufts et correspondant auteur de l'étude. « Nos dernières découvertes montrent que les microbes du fromage peuvent utiliser ces arômes pour changer radicalement leur biologie, et l'importance de ces découvertes s'étend au-delà de la fabrication du fromage à d'autres domaines également. »

De nombreux microbes produisent des composés chimiques aéroportés appelés composés organiques volatils (COV), lorsqu'ils interagissent avec leur environnement.

Un COV microbien largement reconnu est la géosmine, qui est émise par les microbes du sol et peut souvent être sentie après une forte pluie dans les forêts. Au fur et à mesure que les bactéries et les moisissures se développent sur les fromages affinés, ils sécrètent des enzymes qui décomposent les acides aminés pour produire des acides, des alcools, des aldéhydes, des amines et divers composés soufrés, tandis que d'autres enzymes décomposent les acides gras pour produire des esters, des méthylcétones et des alcools secondaires. Tous ces produits biologiques contribuent à la saveur et à l'arôme du fromage et ils sont la raison pour laquelle le camembert, le bleu et le limbourg ont des odeurs caractéristiques.

Les chercheurs de Tufts ont découvert que les COVs ne contribuent pas seulement à l'expérience sensorielle du fromage, mais fournissent également un moyen pour les moisissures de communiquer avec les bactéries du microbiome du fromage et de les «nourrir».

En associant 16 bactéries de fromage communes différentes à 5 moisissures communs de la croûte de fromage, les chercheurs ont découvert que les moisissures provoquaient des réponses chez les bactéries allant d'une forte stimulation à une forte inhibition.

Une espèce de bactérie, Vibrio casei, a répondu en se développant rapidement en présence de COVs émis par les cinq moisissures. D'autres bactéries, telles que Psychrobacter, ne se sont développées qu'en réponse à l'une des moisissures (Galactomyces), et deux bactéries communes du fromage ont diminué de manière significative en nombre lorsqu'elles sont exposées aux COVs produits par les Galactomyces.

Les chercheurs ont découvert que les COVs modifiaient l'expression de nombreux gènes dans les bactéries, y compris des gènes qui affectent la façon dont ils métabolisent les nutriments. Un mécanisme métabolique qui a été amélioré, appelé le shunt glyoxylaique, permet aux bactéries d'utiliser des composés plus simples comme «aliment» lorsque des sources plus complexes telles que le glucose ne sont pas disponibles. En effet, ils ont permis aux bactéries de mieux «manger» certains des COVs et de les utiliser comme sources d'énergie et de croissance.

« Les bactéries sont capables de manger ce que nous percevons comme des odeurs », a déclaré Casey Cosetta, post-doct au département de biologie de l'Université Tufts et premier auteur de l'étude. « C'est important parce que le fromage lui-même fournit peu de sucres facilement métabolisés tels que le glucose. Avec les COVs, les moisissures fournissent vraiment une aide utile aux bactéries pour les aider à prospérer. »

Cette recherche a des implications directes pour les producteurs de fromage du monde entier. Lorsque vous entrez dans une cave à fromages, de nombreux COVs sont libérés dans l'air à mesure que les fromages vieillissent. Ces COVs peuvent avoir un impact sur le développement des fromages voisins en favorisant ou en inhibant la croissance de microbes spécifiques, ou en modifiant la façon dont les bactéries produisent d'autres produits biologiques qui ajoutent à la saveur. Une meilleure compréhension de ce processus pourrait permettre aux producteurs de fromage de manipuler l'environnement des COVs pour améliorer la qualité et la variété des saveurs.

Les implications de la recherche peuvent même s'étendre beaucoup plus loin.

« Maintenant que nous savons que les produits chimiques en suspension dans l'air peuvent contrôler la composition des microbiomes, nous pouvons commencer à réfléchir à la manière de contrôler la composition d'autres microbiomes, par exemple dans l'agriculture pour améliorer la qualité des sols et la production végétale et en médecine pour aider à gérer les maladies affectées par les centaines d'espèces de bactéries dans le corps », a déclaré Wolfe.