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jeudi 31 août 2023

Un traitement bactérien réduit la résistance à l'insuline et protège contre le diabète

«Un traitement bactérien réduit la résistance à l'insuline et protège contre le diabète», source EurekAlert!

Des chercheurs dirigés par Hiroshi Ohno du Centre Riken pour les sciences médicales intégratives (IMS) au Japon ont découvert un type de bactérie intestinale qui pourrait contribuer à améliorer la résistance à l'insuline et ainsi protéger contre le développement de l'obésité et du diabète de type 2. L'étude, publiée le 30 août dans la revue scientifique Nature, impliquait une analyse génétique et métabolique des microbiomes fécaux humains, puis corroborait des expériences sur des souris obèses.

L'insuline est une hormone libérée par le pancréas en réponse à la glycémie. Normalement, cela aide à faire pénétrer le sucre dans les muscles et le foie afin qu’ils puissent utiliser l’énergie. Lorsqu’une personne développe une résistance à l’insuline, cela signifie que l’insuline ne peut plus faire son travail et que, par conséquent, davantage de sucre reste dans son sang et son pancréas continue de produire davantage d’insuline. La résistance à l’insuline peut conduire à l’obésité, au prédiabète et au diabète de type 2 à part entière.

Nos intestins contiennent des milliards de bactéries, dont beaucoup décomposent les glucides que nous consommons alors qu’ils ne seraient pas digérés autrement. Bien que beaucoup aient proposé que ce phénomène soit lié à l’obésité et au prédiabète, les faits restent flous en raison du grand nombre de bactéries différentes et du manque de données métaboliques.

Ohno et son équipe de Riken IMS ont comblé ce manque avec leur étude approfondie et, ce faisant, ont découvert un type de bactéries qui pourrait aider à réduire la résistance à l'insuline.

Premièrement, ils ont examiné autant de métabolites qu’ils pouvaient en détecter dans les selles fournies par plus de 300 adultes lors de leurs examens de santé réguliers. Ils ont comparé ce métabolome aux niveaux de résistance à l’insuline obtenus chez les mêmes personnes. «Nous avons constaté qu'une résistance plus élevée à l'insuline était associée à un excès de glucides dans les matières fécales», explique Ohno, «en particulier des monosaccharides comme le glucose, le fructose, le galactose et le mannose».

Ensuite, ils ont caractérisé le microbiote intestinal des participants à l’étude et leur relation avec la résistance à l’insuline et les glucides fécaux. Les intestins des personnes présentant une résistance à l’insuline plus élevée contenaient plus de bactéries de l’ordre taxonomique des Lachnospiraceae que des autres ordres. De plus, les microbiomes comprenant les Lachnospiraceae étaient associés à un excès de glucides fécaux. Ainsi, un microbiote intestinal dominé par les Lachnospiraceae était lié à la fois à la résistance à l’insuline et aux selles contenant un excès de monosaccharides. Dans le même temps, la résistance à l’insuline et les niveaux de monosaccharides étaient plus faibles chez les participants dont les intestins contenaient plus de bactéries de type Bacteroidales que d’autres types.

L’équipe a ensuite cherché à observer l’effet direct des bactéries sur le métabolisme en culture puis chez la souris. En culture, les bactéries Bacteroidales consommaient les mêmes types de monosaccharides que ceux trouvés dans les selles des personnes présentant une résistance élevée à l'insuline, l'espèce Alistipes indistinctus en consommant la plus grande variété. Chez les souris obèses, l’équipe a examiné comment le traitement avec différentes bactéries affectait la glycémie. Ils ont découvert que A. indistinctus abaissait la glycémie et réduisait la résistance à l'insuline ainsi que la quantité de glucides disponibles pour les souris.

Ces résultats étaient compatibles avec les résultats obtenus auprès de patients humains et ont des implications pour le diagnostic et le traitement. Comme l'explique Ohno : «En raison de son association avec la résistance à l'insuline, la présence de bactéries intestinales Lachnospiraceae pourrait être un bon biomarqueur du pré-diabète. De même, un traitement avec des probiotiques contenant A. indistinctus pourrait améliorer l'intolérance au glucose chez les personnes atteintes de pré-diabète.

Bien que la plupart des probiotiques en vente libre ne contiennent pas actuellement les bactéries identifiées dans cette étude, Ohno appelle à la prudence s'ils deviennent disponibles. «Ces résultats doivent être vérifiés dans des essais cliniques sur l'homme avant que nous puissions recommander un probiotique comme traitement contre la résistance à l'insuline.»

Légende de l’image. L'étude a montré que des personnes dont les bactéries intestinales sont dominées par les Lachnospiraceae tendent à avoir des niveaux plus élevés de résistance à l'insuline et une teneur en monosaccharides fécaux plus élevée. Ceux qui ont plus de Bacteroidales ont tendance à avoir une résistance à l'insuline plus faible et une teneur en monosaccharides fécaux plus faible. Crédit Riken.

mardi 29 août 2023

Un gène identifié comme étant essentiel à l'infection par le virus de la peste porcine africaine

Un gène présent dans le système immunitaire des porcs est essentiel à l’infection par le virus de la peste porcine africaine (PPA). Cette découverte pourrait éclairer le développement de porcs résistants à cette maladie dévastatrice.

ll n'existe actuellement aucun traitement disponible contre la PPA, bien que le Viet-Nam teste actuellement un vaccin.

Le gène porcin est essentiel à l’infection par la peste porcine africaine.
Une étude en laboratoire identifie chez les porcs le gène lié à l’immunité qui est nécessaire à la réplication du virus de la peste porcine africaine. 

lundi 14 août 2023

A propos du séquençage de l'ADN sans cellule microbienne

Le séquençage de l'ADN sans cellule microbienne (mcfDNA pour Microbial cell-free DNA) est un outil de diagnostic émergent des maladies infectieuses. Dans le Journal of Clinical Microbiology, des chercheurs ont utilisé le séquençage de mcfDNA plasmatique de plus de 15 000 patients pour identifier un large éventail d'agents pathogènes. Source ASM Microbiology.

L’étude s’intitule, «Plasma Microbial Cell-Free DNA Sequencing from over 15,000 Patients Identified a Broad Spectrum of Pathogens».

Le séquençage de l'ADN sans cellule microbienne (mcfDNA) est un outil de diagnostic des maladies infectieuses émergentes qui permet une détection et une quantification impartiales des agents pathogènes à partir du plasma. Le test Karius, un test de séquençage commercial de mcfDNA développé par et disponible depuis 2017 auprès de Karius, Inc. (Redwood City, Californie), détecte et quantifie le mcfDNA sous forme de molécules/μL dans le plasma. Les données d'échantillons commerciaux et les résultats de tous les tests effectués d'avril 2018 à la mi-septembre 2021 ont été évalués pour les paramètres de qualité du laboratoire, les agents pathogènes signalés et les données des formulaires de demande de test.

Un total de 18 690 rapports ont été générés à partir de 15 165 patients en milieu hospitalier parmi 39 États et le District de Columbia.

Le délai moyen entre la réception de l'échantillon et le résultat rapporté était de 26 h (intervalle interquartile [IQR] 25 à 28), et 96% des échantillons avaient des résultats de test valides.

Près des deux tiers (65%) des patients étaient des adultes, et 29% au moment des tests de diagnostic avaient des codes CIM-10 (CIM pour classification internationale des maladies) représentant un large éventail de scénarios cliniques. Il y a eu 10 752 (58%) rapports qui ont produit au moins un taxon pour un total de 22 792 détections couvrant 701 taxons microbiens uniques.

Les 50 taxons les plus couramment détectés comprenaient 36 bactéries, 9 virus et 5 champignons. Les champignons opportunistes (374 Aspergillus spp., 258 Pneumocystis jirovecii, 196 Mucorales et 33 champignons dématiés) représentaient 861 (4%) de toutes les détections.

D'autres agents pathogènes difficiles à diagnostiquer (247 agents pathogènes zoonotiques et à transmission vectorielle, 144 Mycobacterium spp., 80 Legionella spp., 78 champignons dimorphes systémiques, 69 Nocardia spp. et 57 parasites protozoaires) représentaient 675 (3%) de toutes les détections.

Il s'agit de la plus grande cohorte rapportée de patients testés à l'aide du séquençage du mcfDNA plasmatique et représente le premier rapport d'un test métagénomique de qualité clinique réalisé à grande échelle.

Les données révèlent de nouvelles informations sur l'étendue et la complexité des agents pathogènes potentiels identifiés.

vendredi 11 août 2023

Des chercheurs explorent l'importance des aliments positifs pour Salmonella au Royaume-Uni

«Des chercheurs explorent l'importance des aliments positifs pour Salmonella au Royaume-Uni», source article de Joe Whitworth paru le 10 août 2023 dans Food Safety News.

Selon une étude, la prévalence de Salmonella dans les aliments analysés en vente au Royaume-Uni était faible mais la plus élevée était pour le poulet surgelé importé.

Des chercheurs du Quadram Institute et de l'Université d'East Anglia en Angleterre ont isolé Salmonella de 42 échantillons d'aliments.

Les isolats de Salmonella collectés à partir d'aliments à l'aide du séquençage du génome entier (WGS) ont été comparés à des isolats humains au Royaume-Uni.

Des aliments crus ont été collectés au détail à Norfolk, dont 311 échantillons de poulet, de légumes verts à feuilles et du porc, 279 échantillons de crevettes et 157 de saumons entre mai 2018 et novembre 2019.

Résultats positifs pour le poulet

Les travaux ont été financés par le Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC) et la Food Standards Agency (FSA) et publiés dans la revue Microbial Genomics.

Une étude précédente menée par certains des mêmes scientifiques a révélé que le poulet et le saumon importés étaient plus susceptibles d'être contaminés que les produits nationaux. Dans les derniers travaux, 17% des 88 échantillons de poulet importés contenaient Salmonella liées à des isolats d'origine humaine, mais chez le poulet domestique, le nombre n'était que de 2,3% sur 214 échantillons. Cependant, la plupart des échantillons de poulet importé étaient congelés tandis que les poulets canadiens étaient principalement réfrigérés, de sorte que les différences peuvent être dues à des pratiques de cuisson dangereuses associées au poulet surgelé. Les échantillons de poulet contenant Salmonella Enteritidis provenaient de plusieurs pays, dont la Pologne.

Salmonella a été isolé à partir de 30 échantillons de poulet, huit de crevettes et quatre échantillons de porc et comprenait 14 sérotypes, dont Salmonella Infantis et Salmonella Enteritidis qui étaient les plus courants. Salmonella Enteritidis n'a été isolé que sur du poulet importé.

Salmonella Newport deux fois et Salmonella Enteritidis (neuf fois) ont été isolées uniquement à partir d'échantillons de poulet importé. Salmonella Kedougou et Salmonella Mbandaka ont été retrouvés une fois et Salmonella Ohio deux fois à partir d'échantillons nationaux. Salmonella Infantis a été isolée 14 fois à partir de poulet domestique et importé.

Relier les prélèvements alimentaires et humains

Salmonella Typhimurium monophasique était le seul type trouvé dans plusieurs produits. Des isolats ont été recueillis à partir de deux échantillons de porc domestique et d'un échantillon de poulet domestique provenant de trois supermarchés.

Tous les échantillons positifs à Salmonella Weltevreden dans l'étude étaient quatre échantillons de crevettes tigrées noires du Vietnam, un échantillon d'Indonésie et un d'origine inconnue. D'autres échantillons étaient positifs pour Salmonella Bovismorbificans, Brunei, Derby, Newport, Reading et Schwarzengrund.

Des isolats humains étroitement apparentés ont été collectés jusqu'à trois ans avant ou un an après ceux des échantillons d'aliments. Selon les chercheurs, des données épidémiologiques supplémentaires sont nécessaires pour évaluer la source des cas humains.

Seules Salmonella Typhimurium monophasique Salmonella Enteritidis et Salmonella Infantis retrouvés dans les aliments étaient similaires aux isolats de personnes malades.

Un quart des aliments contaminés hébergeaient diverses souches de Salmonella qui n'auraient pas été détectées si un seul isolat avait été échantillonné.

«Le séquençage du génome entier a identifié des aliments associés à Salmonella cliniquement importants et des aliments contenant Salmonella génétiquement diversifiés, ce qui peut entraver les enquêtes sur les épidémies et l'attribution des sources», a dit le Dr Samuel Bloomfield du Quadram Institute et auteur principal de l'étude.

Les chercheurs ont examiné chaque séquence à la recherche de gènes conférant une résistance aux antibiotiques. Ils ont découvert que 5,1% des échantillons de poulet et 0,64% des échantillons de porc avaient des gènes qui les rendraient résistants à plusieurs antibiotiques. Ces informations pourraient être utiles pour orienter le traitement.

«Les sources alimentaires, les pratiques agricoles et de production et le comportement des consommateurs changent constamment, modifiant les types d'aliments associés aux maladies d'origine alimentaire. La prévention de futures épidémies de salmonellose repose sur une surveillance continue de Salmonella sur les aliments au détail avec la haute résolution du WGS pour relier les aliments et les isolats humains.»

lundi 24 juillet 2023

La maladie de Lyme et la vaccination

Bravo pour cette avancée à la recherche française ...

Cela étant, un vaccin contre la maladie de Lyme semble être en préparation ...

Selon ce site, VLA15 est le seul candidat vaccin contre la maladie de Lyme actuellement en développement clinique avancé (Phase 3).

L'étude de Phase 3 «Vaccine Against Lyme for Outdoor Recreationists (VALOR)» (NCT05477524), randomisée et contrôlée par placebo, évalue l'efficacité, l’innocuité et l'immunogénicité de VLA15 chez des participants âgés de 5 ans et plus. L'étude est menée sur un maximum de 50 sites situés dans des régions où la maladie de Lyme est fortement endémique, notamment en Finlande, en Allemagne, aux Pays-Bas, en Pologne, en Suède et aux États-Unis.

VLA15 est une protéine recombinante multivalente ciblant six sérotypes de Borréliose représentant les souches les plus Valneva a développé VLA15, un candidat vaccin contre la communes présentes aux États-Unis et en Europe.

Un mélange de probiotiques bloque les bactéries qui causent le syndrome du choc toxique

Il y a probiotiques et probiotiques ...

«Un mélange de probiotiques bloque les bactéries qui causent le syndrome du choc toxique», source ASM News du 20 juillet 2023.

Faits saillants

- Le syndrome du choc toxique (SCT) est une maladie mortelle à évolution rapide associée à des souches de Staphylococcus aureus.
- De nouveaux résultats publiés dans Microbiology Spectrum suggèrent qu'une combinaison de probiotiques pourrait réduire l'incidence du SCT.
- Dans des essais en laboratoire, les probiotiques ont réduit la production du superantigène qui cause le SCT.
- Les chercheurs disent qu'une approche probiotique peut également aider les personnes souffrant d'autres infections à staphylocoques, dont celles atteintes de dermatite atopique ou de diabète de type 2.

Le micro-organisme pathogène répandu Staphylococcus aureus peut coloniser la peau et les muqueuses dans tout le corps, en particulier le vagin et le tractus gastro-intestinal. Une souche virulente de la bactérie produit des protéines qui déclenchent le syndrome de choc toxique (SCT), une maladie caractérisée par l'apparition rapide de fièvre, une éruption cutanée révélatrice et, sans traitement, une défaillance multiviscérale. Dans le vagin, le SCT est associé à une réaction potentiellement mortelle du système immunitaire.

Les probiotiques peuvent aider à prévenir la maladie avant que la cascade de cytokines ne commence. Une étude publiée dans la revue Microbiology Spectrum de l'American Society for Microbiology rapporte que des souches de deux bactéries, Lactobacillus acidophilus et Lacticaseibacillus rhamnosus, ont inhibé avec succès la production des superantigènes responsables du SCT, lors d'expériences en laboratoire. L. acidophilus, en outre, a inhibé la croissance des souches de S. aureus qui produisent les protéines problématiques.

Une combinaison des deux pourrait à la fois empêcher la croissance et inhiber la réponse immunitaire. «C'est en quelque sorte un double coup dur contre S. aureus», a dit le microbiologiste Patrick Schlievert de l'Université de l'Iowa, Carver College of Medicine, Iowa City. «Si une toxine est fabriquée, les probiotiques préviennent l'inflammation.»

Il a noté que l'ajout de ces probiotiques aux tampons ou à d'autres produits menstruels pourrait réduire le risque, et l'incidence mondiale, du SCT associé aux menstruations. Une telle mesure préventive a le potentiel de bénéficier à des millions de personnes vulnérables, selon Schlievert. «Nous savons que 20% des personnes de plus de 12 ans ne peuvent pas fabriquer d'anticorps et ne fabriqueront jamais d'anticorps contre le syndrome de choc toxique», a-t-il dit.

Schlievert étudie le SCT et sa prévention depuis des décennies. Au début des années 1980, il a été le premier chercheur à identifier la toxine qui déclenche une réaction excessive du système immunitaire et à montrer comment les tampons à haute capacité d'absorption facilitaient la production de cette toxine en présence de S. aureus.

Le nouveau travail, a-t-il dit, a été motivé par des observations faites lors d'une étude antérieure. Il y a quelques années, lses collègues et lui ont recruté 205 femmes pour tester si un nouveau mélange moléculaire, ajouté aux tampons, inhiberait les bactéries pathogènes. Cette molécule s'est avérée efficace contre E. coli et d'autres agents pathogènes, mais les chercheurs ont remarqué une conséquence inattendue.

«Certaines des femmes du groupe traitement ont eu cette énorme croissance de Lactobacilli, a dit Schlievert.

D'autres études ont révélé que 9 de ces femmes étaient colonisées uniquement par L. crispatus et aucune autre bactérie. Dans une étude en microbiologie, a déclaré Schlievert, la colonisation par une seule bactérie est souvent considérée comme malsaine. Dans ce cas, cependant, il offrait une action efficace contre S. aureus pathogène.

Les bactéries Lactobacillus se sont déjà révélées sûres, a dit Schlievert, et les nouveaux travaux suggèrent que le traitement avec L. crispatus seul, ou L. acidophilus et L. rhamnosus en combinaison, pourrait réduire considérablement le risque de SCT chez les populations vulnérables. Les souches de S. aureus peuvent également provoquer une entérocolite, une réponse immunitaire potentiellement mortelle dans l'intestin. Les probiotiques peuvent également aider à réduire la production de protéines dangereuses pour cette maladie, a dit Schlievert.

Dans les travaux en cours et futurs, Schlievert et son équipe étudient comment utiliser les probiotiques pour prévenir les infections cutanées à staphylocoques. La peau des personnes atteintes de dermatite atopique ou de diabète de type 2 est souvent colonisée par les souches de S. aureus qui produisent des superantigènes, souvent résistants au traitement par des antibiotiques standards. Chez les patients atteints de diabète de type 2, ces superantigènes pourraient entraîner des ulcères du pied qui, s'ils ne sont pas traités avec succès, pourraient entraîner une amputation.

Schlievert considère les probiotiques comme un moyen prometteur de prévenir ces complications. «Si nous pouvons améliorer leur vie en utilisant cette approche, ce serait merveilleux.»

Complément

En mai 2023, l’Anses avait publié une information sur le «Choc toxique menstruel : respecter les conditions de port des protections intimes».
Une vingtaine de cas de syndrome du choc toxique (SCT) menstruel sont enregistrés chaque année en France. Le SCT menstruel est lié aux conditions d’utilisation des protections intimes internes.

dimanche 16 juillet 2023

Vision mondiale des déterminants des résistances aux antibiotiques

«Vision mondiale des déterminants des résistances aux antibiotiques», source communiqué de l’Institut Pasteur du 11 juillet 2023.

Résumé

Pour comprendre les principaux déterminants de la dynamique mondiale de la résistance aux antibiotiques, des scientifiques de l’Institut Pasteur, de l’Inserm et des universités de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines et de Paris-Saclay ont développé un modèle statistique grâce à une analyse spatio-temporelle de grande ampleur. En utilisant la base de données de suivi de l’antibiorésistance ATLAS, ce modèle a mis en évidence des différences importantes de tendances et de facteurs associés en fonction des espèces de bactéries et des résistances à certains antibiotiques. Par exemple, la bonne qualité du système de santé d’un pays est associée à de faibles niveaux d’antibiorésistance chez toutes les bactéries à Gram négatif* étudiées ; des températures élevées sont à l’inverse associées à des forts niveaux d’antibiorésistance chez les Entérobactéries. De façon inattendue, la consommation d’antibiotique nationale n’est pas corrélée à la résistance chez la majorité des bactéries testées. Ces résultats suggèrent que les mesures de contrôle de l’antibiorésistance doivent s’adapter au contexte local et aux combinaisons bactéries-antibiotiques ciblées. Les résultats de cette étude ont été publiés dans la revue The Lancet Planetary Health le 10 juillet 2023.

La résistance aux antibiotiques ou l’antibiorésistance constitue aujourd’hui l’une des plus graves menaces pesant sur la santé mondiale. Ce phénomène est naturel mais le mauvais usage des antibiotiques y contribue en sélectionnant les résistances et complexifie la lutte contre les infections bactériennes. Une surveillance mondiale de l’antibiorésistance est en place, notamment sous l’égide de l’OMS, et de nombreuses bases de données ont été créées pour répertorier chaque apparition d’antibiorésistance dans le monde, et pouvoir à terme bien comprendre ce phénomène pour mieux lutter contre. Il n’existe pas une résistance aux antibiotiques mais plusieurs, très dépendantes des espèces bactériennes. Une étude récente a estimé qu’en 2019, 1,27 millions de décès dans le monde résultaient de la résistance aux antibiotiques et 4,95 millions y étaient associés.

Pour définir les principaux facteurs associés à la dynamique de l’antibiorésistance au niveau mondial, une équipe de recherche pluridisciplinaire à l’Institut Pasteur a développé un modèle statistique et analysé les données d’antibiorésistance de la base ATLAS, données collectées  depuis 2004 dans plus de 60 pays sur les cinq continents. Les scientifiques ont analysé les données en testant un grand nombre de déterminants afin de faire émerger les principaux facteurs de l’antibiorésistance et de comprendre leur association avec les dynamiques observées au niveau mondial. «Des équipes de recherche étudient comment l’antibiorésistance émerge au sein d’une bactérie dans une boite de Petri ou encore chez un individu… mais il manque aujourd’hui cette vue d’ensemble au niveau populationnel et mondial afin de pouvoir étudier les liens, en fonction des espèces de bactéries pathogènes, entre la résistance et certains facteurs comme la qualité d’un système de santé national. Pour comprendre la dynamique de l’antibiorésistance, il est nécessaire d’étudier toutes les échelles. C’est ce que cette étude propose», explique Eve Rahbe, chercheuse doctorante au sein de l’unité Epidémiologie et modélisation de la résistance aux antimicrobiens à l’Institut Pasteur et première auteure de l’étude.

L’étude a consisté dans un premier temps à sélectionner des facteurs pertinents pouvant influer sur les dynamiques d’antibiorésistance. «Si certains facteurs biologiques sont connus, il était important pour nous d’évaluer également des hypothèses associées à des facteurs socio-économiques et climatiques», continue la chercheuse. Au total, 11 facteurs ont été retenus, notamment la qualité du système de soins (indice GHS), la consommation d’antibiotiques et la richesse du pays (indice PIB), ainsi que des données sur les voyages et des variables climatiques. Puis, des modèles statistiques ont été élaborés pour étudier les associations potentielles entre les données ATLAS et les facteurs retenus.

L’analyse des données au niveau mondial sur la période 2006-2019 a d’abord mis en évidence une augmentation de la résistance aux carbapénèmes chez plusieurs espèces, alors que les tendances restent stables mondialement pour les autres résistances. De plus, cette étude a démontré que les dynamiques et les facteurs associés à l’antibiorésistance sont dépendants des combinaisons bactéries-antibiotiques. Cependant, de façon surprenante, la consommation nationale d’antibiotiques n’est pas associée significativement à la résistance chez la majorité des bactéries testées (sauf pour la consommation de quinolones pour les Escherichia coli et Pseudomonas aeruginosa résistantes aux quinolones ou encore la consommation de carbapénèmes chez Acinetobacter baumannii résistantes aux carbapénèmes).

A contrario la bonne qualité du système de santé d’un pays est associée à de faibles niveaux d’antibiorésistance chez toutes les bactéries à Gram négatif* testées. Les températures élevées sont, elles, associées à des forts niveaux d’antibiorésistance mais chez les Entérobactéries uniquement (Escherichia coli et Klebsiella pneumoniae).

« Cette étude met en évidence la diversité des déterminants conduisant à l’antibiorésistance de différentes bactéries pathogènes au niveau mondial, et la nécessité d’adapter les approches de contrôle de la résistance au contexte local (pays, contexte de transmission) et à la combinaison bactérie-antibiotique en question», conclut Philippe Glaser, responsable de l'unité Écologie et évolution de la résistance aux antibiotiques à l'Institut Pasteur et co-principal auteur de l’étude.

«Notre modèle statistique pourra être appliqué à d’autres bases de données, comme celle de l’OMS notamment. Une meilleure connaissance des déterminants de résistance, différents entre les pays, et probablement entre des régions d’un même pays, est essentielle et permettra d’adapter les actions de santé publique», conclut Lulla Opatowski, Professeur à l’université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines et chercheuse au sein de l’unité d’Epidémiologie et modélisation de la résistance aux antimicrobiens, co-principale auteure de l’étude.

*Les bactéries à Gram négatif sont des bactéries à deux membranes qui posent plus de problème de résistance aux antibiotiques, du fait de la perméabilité réduite de la membrane externe.

NB : L'image est du CDC.

Mise à jour du 25 juillet 2023

On lira l'artcile paru dans Le Figaro du 25 juillet 2023«Les causes des résistances aux antibiotiques dans le monde mieux connues», par Vincent Bordenave.
La consommation globale d’antibiotiques n’est pas la cause première de résistance chez la majorité des bactéries testées. 

Deux probiotiques améliorent le lupus érythémateux disséminé, peut-être en régulant les réponses immunitaires et en remodelant le microbiote intestinal

Akkermansia muciniphila et Lactobacillus plantarum améliorent le lupus érythémateux disséminé, peut-être en régulant les réponses immunitaires et en remodelant le microbiote intestinal. En savoir plus dans une étude parue dans mSphere, «Akkermansia muciniphila and Lactobacillus plantarum ameliorate systemic lupus erythematosus by possibly regulating immune response and remodeling gut microbiota».

Résumé

Le lupus érythémateux disséminé (LES), caractérisé par une inflammation persistante, est une maladie auto-immune complexe qui affecte tous les organes et qui rend difficile le traitement clinique. La dysbiose du microbiote intestinal favorise les maladies auto-immunes qui endommagent les organes extra-intestinaux. La modulation du microbiome intestinal est proposée comme une approche prometteuse pour les parties fines du système immunitaire, soulageant l'inflammation systématique dans de multiples maladies. Cette étude a démontré que l'administration de Akkermansia muciniphila et de Lactobacillus plantarum contribuait à un environnement anti-inflammatoire en diminuant l'interleukine (IL)-6 et l'IL-17 et en augmentant les niveaux d'IL-10 dans la circulation. Le traitement par  A. muciniphila et L. plantarum a restauré l'intégrité de la barrière intestinale d’une façon différente. De plus, les deux souches ont réduit le dépôt d'IgG dans le rein et amélioré la fonction rénale de manière significative. D'autres études ont révélé des rôles de remodelage distincts de l'administration de A. muciniphila et de L. plantarum sur le microbiome intestinal. Ce travail a démontré les mécanismes essentiels de la façon dont A. muciniphila et L. plantarum remodèlent le microbiote intestinal et régulent les réponses immunitaires dans un modèle chez la souris atteinte de LES.

Importance

Plusieurs recherches ont démontré que certaines souches probiotiques contribuent à réguler l'inflammation excessive et à restaurer les tolérances dans le modèle animal du LES. D'autres essais sur des animaux combinés à des études cliniques sont nécessaires de toute urgence pour élucider davantage les mécanismes de l'effet de bactéries probiotiques spécifiques dans la prévention des symptômes du LES et le développement de nouvelles cibles thérapeutiques. Dans cette étude, nous avons exploré le rôle de A. muciniphila et L. plantarum dans l'amélioration de l'activité de la maladie du LES. Le traitement par A. muciniphila et L. plantarum a soulagé l'inflammation systémique et amélioré la fonction rénale dans le modèle murin de LES. Nous avons démontré que A. muciniphila et L. plantarum contribuaient à un environnement anti-inflammatoire en régulant les niveaux de cytokines dans la circulation, en restaurant l'intégrité de la barrière intestinale et en remodelant le microbiome intestinal, mais dans une mesure différente.

jeudi 13 juillet 2023

Des bactéries intestinales liées aux dépôts graisseux dans les coronaires

«Des bactéries intestinales liées aux dépôts graisseux dans les coronaires», source communiqué de l’Université d’Uppsala du 12 juillet 2023.

Dans une importante étude suédoise, des chercheurs ont découvert un lien entre les taux de certaines bactéries vivant dans l'intestin et la plaque d'athérosclérose coronarienne. Cette plaque d'athérosclérose, qui est formée par l'accumulation de dépôts de graisse et de cholestérol, constitue une cause majeure de crises cardiaques. L'étude a été menée par des chercheurs d'Uppsala et de l'Université de Lund.

La nouvelle étude, publiée dans la revue scientifique Circulation, était basée sur des analyses de bactéries intestinales et d'imagerie cardiaque chez 8 973 participants âgés de 50 à 64 ans d'Uppsala et de Malmö sans maladie cardiaque connue auparavant. Ils ont tous participé à l'étude suédoise CArdioPulmonary bioImage Study (SCAPIS). Les résultats ont été publiés dans la revue scientifique Circulation.

Nous avons découvert que des bactéries buccales, en particulier les espèces du genre Streptococcus, sont associées à une augmentation de la présence de plaques d'athérosclérose dans les petites artères du cœur lorsqu'elles sont présentes dans la flore intestinale. Les espèces du genre Streptococcus sont des causes fréquentes de pneumonie et d'infections de la gorge, de la peau et des valves cardiaques. Nous devons maintenant comprendre si ces bactéries contribuent au développement de l'athérosclérose», a dit Tove Fall, professeure d'épidémiologie moléculaire au Département des sciences médicales et au SciLifeLab de l'Université d'Uppsala, qui a coordonné l'étude avec des chercheurs de l'Université de Lund.

Séquençage du contenu ADN

Les progrès technologiques ont permis une caractérisation approfondie à grande échelle des communautés bactériennes dans des prélèvements biologiques en séquençant le contenu en ADN et en le comparant à des séquences bactériennes connues. De plus, les améliorations des techniques d'imagerie ont permis la détection et la mesure des changements précoces dans les petits vaisseaux du cœur. L'étude SCAPIS représente l'une des plus grandes collections au monde de ces deux types de données. Dans cette étude, les scientifiques ont étudié les liens entre le microbiote intestinal et l'accumulation de dépôts graisseux dans les artères du cœur.

«Le grand nombre de prélèvements avec des données de haute qualité provenant de l'imagerie cardiaque et de la flore intestinale nous a permis d'identifier de nouvelles associations. Parmi nos découvertes les plus importantes, Streptococcus anginosus et S. oralis subsp. oralis étaient les deux plus fortes», explique Sergi Sayols-Baixeras, auteur principal de l'Université d'Uppsala.

Prélèvements de matières fécales et de salive

L'équipe de recherche a également découvert que certaines des espèces liées à l'accumulation de dépôts graisseux dans les artères coronaires étaient liées aux niveaux de la même espèce dans la bouche. Cela a été mesuré à l'aide d'échantillons de matières fécales et de salive prélevés lors de l'étude Malmö Offspring et de l'étude dentaire Malmö Offspring. De plus, ces bactéries étaient associées à des marqueurs d'inflammation dans le sang, même après avoir pris en compte les différences de régime alimentaire et de médicaments entre les participants porteurs de la bactérie et ceux qui ne l'étaient pas.

samedi 8 juillet 2023

Des chercheurs créent un test pour détecter le SARS-CoV-2 dans n'importe quelle espèce animale

«Des chercheurs créent un test pour détecter le SARS-CoV-2 dans n'importe quelle espèce animale», source article de Mary Van Beusekom paru le 6 juillet 2023 dans CIDRAP News.

Une équipe dirigée par des chercheurs de l'Université de l'Illinois a mis au point un test qui, selon eux, peut détecter le SRAS-CoV-2 chez n'importe quelle espèce d'animal sauvage ou domestique.

Leur étude, publiée dans mSphere, détaille le développement et la validation de leur test immunoenzymatique (bELISA) basé sur des anticorps monoclonaux (mAb), qui, selon les auteurs de l'étude, est un outil utile pour identifier de nouveaux réservoirs animaux potentiels afin de prévenir de futurs épidémies de coronavirus.

Le test cible la protéine N du virus

La plupart des tests d'anticorps sont conçus pour les humains et reposent sur des réactifs chimiques spéciaux spécifiques à l'espèce, dont la plupart ne sont pas disponibles dans le commerce, ce qui entrave la recherche pan-espèce. Mais celui-ci détecte les anticorps dirigés contre la protéine N du virus, ce qui est constant d'une espèce à l'autre, ce qui en fait une meilleure cible que les protéines virales liées à la membrane habituellement utilisées dans ces tests.

«La protéine N est plus abondante et plus conservée que les protéines utilisées dans la plupart des tests», a dit l'auteure principale Ying Fang, dans un communiqué de presse de l'Université de l'Illinois à Urbana-Champaign.

En plus des humains, le SRAS-CoV-2 est connu pour infecter les chats, les chiens, les cerfs, les visons, les lions, les léopards des neiges et les tigres. «Ces découvertes suscitent de grandes inquiétudes quant au potentiel de transmission d'homme à animal et d'animal à homme, ainsi qu'à l'apparition de mutations virales en tant que propagation du virus entre les espèces», ont écrit les auteurs.

Outil de surveillance utile

Les chercheurs ont créé le test en enduisant une plaque ELISA de la protéine N du virus de type sauvage et en ajoutant un échantillon de sérum regroupé de 24 chats infectés expérimentalement par les variants Alpha, Delta ou Omicron du SRAS-CoV-2. S'il est infecté par le SRAS-CoV-2, le sérum de l'animal contiendra des anticorps anti-protéine N, qui se lieront à la plaque.

L'équipe lave ensuite la plaque et ajoute un mAb secondaire marqué à la biotine (vitamine B) qui cible la protéine N. Si l'animal est infecté, ses anticorps empêcheront les anticorps secondaires de se lier à la protéine N. S'ils ne sont pas infectés, les mAb se fixent à la plaque enduite et génèrent un signal de couleur lorsque certains produits chimiques sont ajoutés à la plaque.

Les chercheurs ont validé l'outil à l'aide d'échantillons de sérum d'animaux dont le statut infectieux était connu, obtenant une sensibilité diagnostique de 97,8% et une spécificité diagnostique de 98,9%.

La sensibilité est la probabilité qu'un test identifie correctement tous les cas positifs ; plus la sensibilité est élevée, plus la probabilité de résultats faussement négatifs est faible. La spécificité, d'autre part, est la capacité d'identifier ceux qui n'ont pas de condition ; plus la spécificité est élevée, plus le risque de résultats faussement positifs est faible. L'aire sous la courbe du test, qui représente la précision, était de 0,998, démontrant une grande précision.

Les auteurs de l'étude ont déclaré que le test présente une répétabilité élevée, déterminée par un faible coefficient de variation, ou rapport de l'écart type à la moyenne, entre les séries (7,2%), au sein des séries (4,9%) et dans la plaque (3,2%). Le test a pu détecter les anticorps du SRAS-CoV-2 chez les chats infectés expérimentalement dès 7 jours après l'infection et chez deux des trois chiens présentant des symptômes de type COVID traités dans une clinique vétérinaire.

«Le panel de mAbs générés dans cette étude fournit des réactifs précieux pour le diagnostic des maladies et les études de pathogenèse virale», ont écrit les chercheurs. «Le bELISA basé sur les mAbs pourrait être un outil utile pour la surveillance sur le terrain afin de déterminer la prévalence de la COVID-19 dans les populations animales et d'identifier de nouveaux réservoirs animaux potentiels.»

Un capteur qui détecte les aliments quand ils sont altérés

Sceptique quant à la date limite de consommation de vos courses ?

Le développement d'un minuscule capteur pH par une étudiante de SMU pourrait être un prédicteur de fraîcheur de nouvelle génération pour les aliments conditionnés, source communiqué de la Southern Methodist University du 16 mars 2023.

Khengdauliu Chawang, étudiante diplômée de SMU, a développé un capteur pH miniature qui peut dire quand l’aliment s'est altéré en temps réel. La création de l'appareil était une chose personnelle pour elle.

Oubliez cette date de péremption de votre saumon ou votre yaourt. Une étudiante diplômée de la SMU (Southern Methodist University) a mis au point un capteur miniature du pH qui peut dire quand les aliments se sont avariés en temps réel.

Le capteur flexible du pH ne mesure que 2 mm de long et 10 mm de large, ce qui permet d'intégrer le capteur dans les méthodes actuelles d'emballage alimentaire, telles que les emballages en plastique. Les industries utilisent généralement des capteurs beaucoup plus volumineux - environ 2,5 cm de long sur 33 cm de large - pour mesurer le pH, ils ne conviennent donc pas pour être inclus dans chaque emballage d’aliment pour surveiller sa fraîcheur en temps réel.

«Les capteurs de pH que nous avons développés fonctionnent comme un petit dispositif d'identification par radiofréquence sans fil - similaire à ce que vous trouvez à l'intérieur de votre étiquette de bagage après qu'elle a été vérifiée dans les aéroports. Chaque fois qu'un emballage alimentaire avec notre appareil passe un point de contrôle, tel que des centres logistiques d'expédition, des ports, des portes ou des entrées de supermarchés, il peut être scanné et les données peuvent être renvoyées à un serveur qui suit leurs pH», a dit Khengdauliu Chawang, étudiante en doctorat à la Lyle School of Engineering du SMU et créateur principal de l'appareil. «Une telle configuration permettrait une surveillance continue du pH et détecterait avec précision les limites de fraîcheur tout au long du trajet, des fermes aux maisons des consommateurs.»

Le concours Big Ideas de l'Institute of Electrical and Electronics Engineer (IEEE) lors de la conférence 2022 IEEE Sensors a décerné à Chawang le prix de la meilleure entreprise appartenant à des femmes pour son invention, qu'elle a construite avec le soutien de J.-C. Chiao, professeur au département de génie électrique et informatique de la Lyle School.

Comment ça fonctionne ?

Le niveau de fraîcheur des aliments est directement corrélé aux niveaux de pH, a expliqué Chawang. Par exemple, les aliments dont le pH est supérieur à la plage normale indiquent des aliments altérés, car les champignons et les bactéries se développent dans des environnements à pH élevé. Ainsi, des changements soudains de pH dans le stockage des aliments pendant la production et l'expédition peuvent indiquer une éventuelle altération des aliments.

Le niveau de pH est mesuré par la concentration d'ions hydrogène présents dans une substance ou une solution.

Étant donné que les ions hydrogène sont des molécules chargées électriquement, les électrodes du capteur de pH de Chawang peuvent détecter la charge électrique générée par la concentration d'ions hydrogène dans les aliments, convertissant le niveau en valeurs de pH à l'aide de ce que l'on appelle l'équation de Nernst.

Le capteur de pH a été testé avec succès sur des aliments comme le poisson, les fruits, le lait et le miel, a dit Chawang. D'autres tests sont en cours.

Le capteur est fabriqué avec une très petite quantité de matériaux biocompatibles et utilise des technologies d'impression sur des films flexibles.

«L'ensemble du processus est similaire à l'impression de journaux. Le traitement ne nécessite pas d'équipement coûteux, ni d'environnement de salle blanche pour semi-conducteurs », a dit le professeur Chiao. «Ainsi, les coûts sont faibles et rendent le capteur jetable.»

Chiao et l'étudiante diplômée Chawang étudient si le dispositif à électrodes qu'ils ont développé pour surveiller les aliments pourrait également être utilisé pour assurer une fermentation fiable du fromage et du vin. En outre, la même technologie pourrait avoir des applications potentielles dans la détection des signes avant-coureurs de septicémie ou d'infection des plaies lorsqu'elles sont utilisées sur la peau, a dit Chawang.

Chiao, qui a rejoint la faculté SMU en 2018, est largement reconnu pour ses recherches sur l'utilisation des ondes électromagnétiques dans des applications médicales, notamment les systèmes de gestion de la douleur en boucle fermée et la gestion de la motilité gastrique.

Une vidéo accompagne le communiqué.

lundi 3 juillet 2023

Une nouvelle puce avec un capteur fait progresser le diagnostic rapide et rentable des maladies

Un schéma résumé montrant la configuration de base de la chambre de réaction LAMP et du capteur comprenant un film nanopore contenant des produits LAMP immobilisés (Texas A&M AgriLife Illustration).

«Une nouvelle puce avec un capteur fait progresser le diagnostic rapide et rentable des maladies», source AgriLife Today.

Une puce avec un capteur intégré détecte l'agent pathogène de la maladie du mildiou, ainsi que de nombreuses autres.

Des scientifiques et collaborateurs de Texas A&M AgriLife Research de l'Iowa State University ont mis au point une puce avec un capteur capable de détecter de nombreux agents pathogènes avec une sensibilité 10 fois supérieure aux méthodes actuellement disponibles.

La puce élimine également le besoin de réactifs colorants chimiques généralement utilisés dans le processus de diagnostic. La nouvelle technologie est prometteuse pour des capacités rapides de diagnostic et peu coûteuses au point de service des plantes, des aliments, des animaux et des humains, y compris la détection des pathogènes d'origine alimentaire, de la grippe aviaire et de la COVID-19.

Les résultats du nouveau capteur sont disponibles en 30 minutes environ.

Dans leur étude, publiée dans ASC Sensors, les scientifiques ont utilisé le nouveau capteur pour détecter Phytophthora infestans. L'agent pathogène qui provoque le mildiou dévastateur à l'échelle mondiale, une menace particulière pour les cultures de pommes de terre et de tomates.

L’étude a été codirigée par Jinping Zhao, chercheur en postdoc à AgriLife Research à Dallas, et Subin Mao, candidat en génie électrique et informatique à l'Iowa State University. Les auteurs correspondants étaient les collaborateurs Junqi Song, professeur et responsable de la recherche sur l'immunité des plantes chez AgriLife Research à Dallas, et Long Que, professeur de génie électrique à l'Iowa State University. Des subventions de démarrage de chaque université ont financé la recherche.

«Cette recherche fait progresser les technologies qui sont apparues comme l'une de nos plus grandes opportunités pour améliorer l'agriculture, la sécurité des aliments et la santé humaine », a dit Song. «Notre publication représente une étape vers la réalisation de ces puissants outils contre les maladies.»

S'appuyer sur les technologies existantes

Le nouveau capteur améliore une technique connue sous le nom d'amplification isotherme médiée par les boucles, ou LAMP (loop-mediated isothermal amplification), qui est largement utilisée pour détecter les pathogènes en amplifiant leur ADN.

La détection des produits LAMP amplifiés à partir de matrices, telles que l'ADN de pathogènes, nécessite souvent que les produits soient «marqués» à l'aide de colorants fluorescents, un processus coûteux avec une faible sensibilité. Le nouveau capteur diagnostique les pathogènes sans ces réactifs et avec une sensibilité élevée. Il élimine également un long processus de purification de l'ADN qui crée des défis pour l'utilisation au point d’utilisation.

La nouvelle puce consiste en un capteur nanopore à couche mince à l'intérieur d'une chambre de réaction spéciale. Les amorces sont spécialement conçues pour être immobilisées sur le nanofilm, provoquant la liaison des produits LAMP amplifiés au capteur, qui produit des signaux qui peuvent être mesurés directement et facilement avec un spectromètre portable.

Et après

La puce LAMP offre une nouvelle plate-forme portable pour détecter les pathogènes à l'aide de capteurs sans marquage avec une ultrasensibilité. L'équipe de recherche va désormais travailler pour améliorer encore la sensibilité à un niveau sous-attomolaire (1 attomaire : 10-18 moles par litre) ou même inférieur.

L'équipe vise à compenser les défis actuels de détection et de distinction des espèces et des souches de pathogènes présentant des similitudes de séquence élevée. Ils travailleront également à améliorer la spécificité des détections et à établir une détection quantitative en intégrant l'intelligence artificielle et les technologies d'édition de gènes CRISPR.

Leur objectif est de parvenir à un produit viable pour une large adoption dans les applications de santé végétale, animale et humaine au point d’utilisation.

Des chercheurs produisent le premier vaccin à ARNm contre les bactéries

Des chercheurs ont trouvé un moyen d'utiliser des vaccins à ARNm pour cibler les agents pathogènes bactériens, en développant spécifiquement un vaccin à ARNm efficace à 100% pour protéger les souris contre l'infection par la bactérie mortelle qui cause la peste. Source tweet de l’ASM.

Les vaccins à ARN messager n'ont été déployés que dans le cadre de maladies virales, à savoir la COVID-19. Cependant, des chercheurs ont trouvé un moyen d'utiliser la technologie pour cibler les pathogènes bactériens, en développant spécifiquement un vaccin à ARNm efficace à 100% pour protéger les souris contre l'infection par la bactérie mortelle qui cause la peste.

Référence de l’étude

- Kon E., et al. A single-dose F1-based mRNA-LNP vaccine provides protectiong against lethal plague bacterium. Science Advances. March 8, 2023.

Autres références

- Aizenman, N. Frozen cells reveal a clue for a vaccine to block the deadly TB bug. NPR. March 6, 2023.
- Ghert-Zand R. Des Israéliens produisent le premier vaccin à ARNm au monde contre les bactéries. The Times of Israel. 14 mars 2023.

dimanche 2 juillet 2023

Un probiotique oral pourrait traiter la sécheresse oculaire

«Un probiotique oral pourrait traiter la sécheresse oculaire», source ASM News du 18 juin 2023.

Dans une étude menée par un groupe de recherche du Baylor College of Medicine, l'administration orale d'une souche bactérienne probiotique disponible dans le commerce s'est avérée efficace pour améliorer la sécheresse oculaire chez un modèle animal. Les résultats ont été présentés à ASM Microbe 2023, la réunion annuelle de l'American Society for Microbiology.

La sécheresse oculaire, une affection courante dans laquelle les larmes produites par l'œil ne peuvent pas maintenir l'œil correctement lubrifié, touche environ 1 personne sur 20 aux États-Unis. Il peut provoquer des picotements et des brûlures aux yeux, une inflammation, une vision floue et une sensibilité à la lumière. Les cas extrêmes peuvent entraîner des dommages à la surface de l'œil s'ils ne sont pas traités. Les traitements les plus courants impliquent l'application de gouttes ophtalmiques, de gels ou de pommades. Ce nouveau traitement non conventionnel implique des bactéries du tractus intestinal.

L'auteure, Laura Schaefer du Baylor College of Medicine à Houston, au Texas, a dit : «Les bactéries ‘amicales’ qui vivent dans le tractus gastro-intestinal humain ont été liées à la santé et à la protection contre les maladies dans de nombreuses parties du corps, y compris l'intestin, le cerveau et les poumons. Il n'est donc pas surprenant que le microbiome intestinal ait également des effets sur nos yeux.»

Des travaux antérieurs de ce groupe de recherche ont montré que des souris ayant reçu des bactéries intestinales de patients humains atteints du syndrome de Sjögren souffrant de sécheresse oculaire sévère développaient une maladie oculaire pire dans des conditions sèches que des souris ayant reçu des bactéries intestinales de patients humains en bonne santé. Cela suggère que les bactéries intestinales de personnes en bonne santé aident à protéger la surface de l'œil dans des conditions sèches. Une voie de traitement possible pour la sécheresse oculaire impliquerait des bactéries probiotiques qui ont des effets protecteurs similaires. Le groupe a étudié cela en utilisant une souche bactérienne probiotique administrée par voie orale, Limosilactobacillus reuteri DSM17938, dans un modèle de souris à œil sec. DSM17938 est une souche bactérienne probiotique d'origine humaine disponible dans le commerce qui a déjà démontré des effets protecteurs sur l'intestin et le système immunitaire chez l'homme et la souris, mais elle n'a pas été testée dans le contexte de la santé oculaire.

Les souris ont d'abord été traitées avec des antibiotiques, qui tuent de nombreuses bactéries «amies» vivant dans l'intestin. Ils ont ensuite été exposés à des conditions très sèches et ont reçu des doses quotidiennes de bactéries probiotiques ou d'une solution saline comme témoin. Après 5 jours, les yeux ont été examinés pour la maladie. Les souris qui ont été nourries avec les bactéries probiotiques avaient des surfaces cornéennes plus saines et plus intactes. De plus, ces souris avaient plus de cellules caliciformes dans leur tissu oculaire, qui sont des cellules spécialisées qui produisent de la mucine, un composant essentiel des larmes. Prises ensemble, ces données suggèrent que le bon probiotique oral pourrait aider à traiter et à gérer les symptômes de la sécheresse oculaire.

Les auteurs de cette étude sont Laura Schaefer, Robert Britton, Steven Pflugfelder et Cintia de Paiva. La recherche a été effectuée dans le laboratoire du Dr Cintia de Paiva du département d'ophtalmologie du Baylor College of Medicine et financée par des fonds du National Institutes of Health et de la Research to Prevent Blindness Foundation.

Un probiotique pourrait aider à réduire l'absorption du mercure dans l'intestin

«Un probiotique pourrait aider à réduire l'absorption du mercure dans l'intestin», source ASM News du 18 juin 2023.

Une nouvelle étude menée par une équipe de la Pennsylvania State University suggère que les microbes de l'intestin humain pourraient être exploités pour bloquer l'absorption des métaux toxiques comme le mercure et aider le corps à absorber les éléments nutritifs utiles, comme le fer. Le groupe a présenté ses résultats au cours de ASM Microbe 2023, la réunion annuelle de l'American Society for Microbiology (ASM).

Le méthylmercure, une neurotoxine, est particulièrement inquiétant, selon Daniela Betancurt-Anzola, étudiante diplômée à Penn State qui a dirigé la nouvelle étude. Il a une variété d'effets toxiques et nuit au développement neurologique pendant la grossesse et l'enfance, en particulier dans les communautés fortement tributaires d'une alimentation à base de poisson. La plupart des expositions au méthylmercure se font par le biais de poissons ou de crustacés, mais elles peuvent également se manifester ailleurs. «Il s'accumule dans les êtres vivants, dans les plantes et les poissons», a-t-elle dit. «Nous mangeons ces choses, et elles s'accumulent en nous.»

Betancurt-Anzola et ses collègues ont d'abord analysé des milliers de génomes de bactéries intestinales, en se concentrant sur les déterminants génétiques associés à la capacité d'interagir avec les métaux. De nombreux gènes sont connus pour être liés à la résistance aux métaux, a-t-elle dit, mais le groupe s'est concentré sur ceux qui permettent aux bactéries de convertir le mercure dangereux en des formes moins toxiques et d'absorber le métal lourd.

Pour comprendre comment ces gènes fonctionnent et impactent l'hôte, l'équipe a utilisé le séquençage métagénomique pour étudier comment les microbes humains et de souris réagissaient à l'exposition au mercure. Enfin, les chercheurs ont utilisé ces connaissances pour développer un probiotique spécialement conçu pour détoxifier un type de mercure dangereux souvent présent dans l'alimentation humaine. Ils ont inséré des gènes de la bactérie Bacillus megaterium, connue pour être très résistante au méthylmercure, dans des souches de Lacticaseibacillus, un genre de bactéries lactiques.

«C'est un probiotique parfait pour cela parce que nous avons déjà montré qu'il fonctionne chez l'homme, et maintenant nous le concevons pour le rendre encore meilleur», a dit Betancurt-Anzola. «Il est à l'intérieur de l'intestin, il attrape le méthylmercure, puis il s’en va.»

Pour l'instant, le groupe se concentre sur la compréhension de la façon dont les microbes intestinaux interagissent avec le mercure, mais ils prévoient également d'étudier d'autres métaux. Leur objectif ultime est de développer des interventions qui pourraient aider à réduire les niveaux de métaux dangereux, comme le mercure, et à stimuler l'absorption de ceux dont le corps humain a besoin. «Nous sommes intéressés à étudier comment l'ensemble de la communauté microbienne réagit aux différents métaux», a dit Betancurt-Anzola.