Selon une étude, la prévalence de Salmonella dans les aliments analysés en vente au Royaume-Uni était faible mais la plus élevée était pour le poulet surgelé importé.
Des chercheurs du Quadram Institute et de l'Université d'East Anglia en Angleterre ont isolé Salmonella de 42 échantillons d'aliments.
Les isolats de Salmonella collectés à partir d'aliments à l'aide du séquençage du génome entier (WGS) ont été comparés à des isolats humains au Royaume-Uni.
Des aliments crus ont été collectés au détail à Norfolk, dont 311 échantillons de poulet, de légumes verts à feuilles et du porc, 279 échantillons de crevettes et 157 de saumons entre mai 2018 et novembre 2019.
Résultats positifs pour le poulet
Une étude précédente menée par certains des mêmes scientifiques a révélé que le poulet et le saumon importés étaient plus susceptibles d'être contaminés que les produits nationaux. Dans les derniers travaux, 17% des 88 échantillons de poulet importés contenaient Salmonella liées à des isolats d'origine humaine, mais chez le poulet domestique, le nombre n'était que de 2,3% sur 214 échantillons. Cependant, la plupart des échantillons de poulet importé étaient congelés tandis que les poulets canadiens étaient principalement réfrigérés, de sorte que les différences peuvent être dues à des pratiques de cuisson dangereuses associées au poulet surgelé. Les échantillons de poulet contenant Salmonella Enteritidis provenaient de plusieurs pays, dont la Pologne.
Salmonella a été isolé à partir de 30 échantillons de poulet, huit de crevettes et quatre échantillons de porc et comprenait 14 sérotypes, dont Salmonella Infantis et Salmonella Enteritidis qui étaient les plus courants. Salmonella Enteritidis n'a été isolé que sur du poulet importé.
Salmonella Newport deux fois et Salmonella Enteritidis (neuf fois) ont été isolées uniquement à partir d'échantillons de poulet importé. Salmonella Kedougou et Salmonella Mbandaka ont été retrouvés une fois et Salmonella Ohio deux fois à partir d'échantillons nationaux. Salmonella Infantis a été isolée 14 fois à partir de poulet domestique et importé.
Relier les prélèvements alimentaires et humains
Tous les échantillons positifs à Salmonella Weltevreden dans l'étude étaient quatre échantillons de crevettes tigrées noires du Vietnam, un échantillon d'Indonésie et un d'origine inconnue. D'autres échantillons étaient positifs pour Salmonella Bovismorbificans, Brunei, Derby, Newport, Reading et Schwarzengrund.
Des isolats humains étroitement apparentés ont été collectés jusqu'à trois ans avant ou un an après ceux des échantillons d'aliments. Selon les chercheurs, des données épidémiologiques supplémentaires sont nécessaires pour évaluer la source des cas humains.
Seules Salmonella Typhimurium monophasique Salmonella Enteritidis et Salmonella Infantis retrouvés dans les aliments étaient similaires aux isolats de personnes malades.
Un quart des aliments contaminés hébergeaient diverses souches de Salmonella qui n'auraient pas été détectées si un seul isolat avait été échantillonné.
«Le séquençage du génome entier a identifié des aliments associés à Salmonella cliniquement importants et des aliments contenant Salmonella génétiquement diversifiés, ce qui peut entraver les enquêtes sur les épidémies et l'attribution des sources», a dit le Dr Samuel Bloomfield du Quadram Institute et auteur principal de l'étude.
Les chercheurs ont examiné chaque séquence à la recherche de gènes conférant une résistance aux antibiotiques. Ils ont découvert que 5,1% des échantillons de poulet et 0,64% des échantillons de porc avaient des gènes qui les rendraient résistants à plusieurs antibiotiques. Ces informations pourraient être utiles pour orienter le traitement.
«Les sources alimentaires, les pratiques agricoles et de production et le comportement des consommateurs changent constamment, modifiant les types d'aliments associés aux maladies d'origine alimentaire. La prévention de futures épidémies de salmonellose repose sur une surveillance continue de Salmonella sur les aliments au détail avec la haute résolution du WGS pour relier les aliments et les isolats humains.»
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