Un réseau de l’UE met en lumière les principaux problèmes microbiens

«Un réseau de l’UE met en lumière les principaux problèmes microbiens», source article paru dans Food Safety Newsr du 26 novembre 2023.

E. coli producteurs de shigatoxines (STEC), Taenia solium et les produits à base de plantes figuraient parmi les sujets abordés lors de la dernière réunion d'un réseau européen axé sur l'évaluation des risques.

Le Réseau scientifique sur l'évaluation des risques microbiologiques (MRA Network) comprend 25 États membres ainsi que la Suisse et la Norvège en tant qu'observateurs. Il est coordonné par l'Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA).

Divers sujets ont été présentés lors d'une réunion en octobre 2023, notamment la pathogénicité des STEC, les risques dus aux pannes de courant, le chauffage et le stockage réfrigéré des œufs, le lait des fermes laitières atteint de botulisme, les œufs de Echinococcus sur des baies, Salmonella dans la chaîne porcine, les voies de transmission de Campylobacter, Listeria monocytogenes dans les aliments prêts à consommer, Enterobacteriaceae pathogènes dans des gâteaux et une mise à jour sur une épidémie à Taenia solium.

E. coli et botulisme

L'Agence de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (Anses) revient sur son avis de 2017 sur le pouvoir pathogène des STEC. Sur la base de l'analyse des données de surveillance de 2017 à 2021, l'agence a proposé une nouvelle classification des souches de STEC selon leur potentiel de virulence. Cette classification prend en compte l'association de souches à des formes sévères d'infection comme le syndrome hémolytique et urémique (SHU), qui attaque les reins, et entraîne des diarrhées sanglantes.

Les souches STEC dotées des gènes stx2a et/ou stx2d et des gènes d'adhésion, eae ou aggR, sont les plus susceptibles de provoquer le SHU. Les souches eae ou aggR négatives avec des variants stx2a et/ou stx2d ont également un potentiel élevé de provoquer le SHU, en particulier chez les adultes. Les souches portant d'autres sous-types du gène stx sont moins fréquemment associées au SHU et se retrouvent principalement chez les patients souffrant de diarrhée sanglante et de diarrhée.

En 2023, Salmonella Enteritidis a été retrouvé chez des poules pondeuses pour la première fois depuis des décennies en Suède. Des millions d'œufs ont été rappelés et au moins 79 personnes étaient malades. Une étude a évalué si les œufs à la coque provenant de lots rappelés pouvaient toujours être consommés sans danger. Si le jaune est crémeux mais ferme, une température d'au moins 65°C suffira à tuer Salmonella Enteritidis.

L'Institut fédéral allemand pour l'évaluation des risques (BfR) a évalué le risque de contracter le botulisme lors de la consommation de produits laitiers si l'on transforme du lait de vaches saines provenant d'une ferme présentant des cas de botulisme dans le troupeau laitier.

L'agence a constaté que le risque de contracter le botulisme en consommant du lait et des produits laitiers était très faible. Il a conseillé aux consommateurs de ne pas conserver le lait cru sans réfrigération et de faire bouillir le lait cru de la ferme avant de le boire.

Trois cas de cysticercose neurologique causée par Taenia solium ont été détectés chez des enfants à Lier, Belgique. Les enfants concernés ont été diagnostiqués en 2023, ils n’avaient pas d’antécédents de voyage et le seul lien est qu’ils fréquentent la même école, bien qu’ils soient dans des classes différentes car ils ont des âges différents. En octobre, un quatrième enfant infecté par le ténia du porc a été découvert. Ils ne présentaient aucun symptôme de maladie mais ont été examinés par mesure de précaution.

L'infection s'est probablement produite il y a plus d'un an. L'enquête se concentre sur les personnes en contact avec les enfants à l'école, notamment celles qui manipulent leurs aliments, mais pas sur les aliments eux-mêmes.

Pathogènes dans les produits à base de végétaux

La prévalence et le potentiel de croissance de Listeria monocytogenes ont été évalués dans une étude portant sur trois catégories d'aliments prêts à consommer préemballés à base de végétaux sur le marché belge – garnitures végétaliens et végétariens de sandwichs en tranches, légumes verts à feuilles fraîchement découpés et bols à salade multi-ingrédients.

Les experts ont également discuté des risques associés aux substituts de produits laitiers et de viande à base de plantes. Quatre foyers ont été couverts en raison des alternatives au fromage, trois étant causés par Salmonella et un par Listeria. Les représentants irlandais ont demandé un échange d'études sur le sujet suite à un rappel dans le pays lié à une épidémie de listériose provoquée par un fromage végétalien.

Une étude européenne a identifié l'ADN des parasites Echinococcus multilocularis et Echinococcus granulosus sensu lato sur des laitues et des baies de plusieurs pays de l'UE, y compris des échantillons de baies des Pays-Bas. Bien que les résultats représentent une étape importante vers la compréhension de la contribution des sources alimentaires aux infections humaines, la viabilité des œufs n'a pas pu être évaluée.

La viande de gibier sauvage devrait devenir plus sûre, selon le BfR

«La viande de gibier sauvage devrait devenir plus sûre», source communiqué du BfR 17/2023 du 4 octobre 2023.

Un réseau européen vise à réduire davantage les risques sanitaires.

La viande de gibier, notamment celle du cerf élaphe, du sanglier ou du faisan, fait partie des aliments ayant la plus faible empreinte écologique. Ces animaux grandissent dans la nature, se nourrissant de ce que la nature leur offre, ce qui signifie également qu'ils peuvent être exposés à divers contaminants environnementaux. De plus, les animaux sauvages peuvent être porteurs d’agents pathogènes zoonotiques. Le réseau européen ‘Safety in the Game Meat Chain’ (Sécurité sanitaire dans la chaîne de la viande de gibier) qui sera créé au cours des quatre prochaines années sous la direction de l'Institut fédéral allemand pour l'évaluation des risques (BfR), et promeut l'échange de connaissances sur les risques sanitaires associés au gibier. viande obtenue par la chasse pour les consommateurs. «Notre objectif est de rendre ces aliments d'origine animale aussi sûrs que possible, tant en Europe que dans le monde», déclare le président du BfR, le professeur Andreas Hensel. «Nous visons à minimiser autant que possible les risques chimiques et microbiens.» Le réseau en pleine expansion comprend actuellement 29 pays, englobant non seulement des États membres de l’UE, mais également des pays tiers, notamment ceux des Balkans occidentaux, la Turquie, le Royaume-Uni, les États-Unis, la Nouvelle-Zélande et l’Australie.

Sur une période de quatre ans, les cinq groupes de travail du réseau se concentreront sur la chasse et la transformation, les réseaux de commercialisation de la viande de gibier et la chaîne d'approvisionnement, ainsi que sur divers risques biologiques et chimiques. Pour ce faire, les activités de recherche au niveau national seront compilées et évaluées. Les groupes de parties prenantes du monde universitaire, de l'industrie, des institutions gouvernementales et des consommateurs finaux recevront des mises à jour continues sur les nouvelles découvertes.

L'un des objectifs centraux du réseau est la collaboration directe avec les groupes de parties prenantes pour traduire les connaissances en actions tout au long de la chaîne de production, «de la forêt à l'assiette». L'accent n'est pas seulement mis sur les substances indésirables provenant de l'environnement (contaminants environnementaux), mais également sur la prévention ou la réduction de l'apport de métaux lourds, notamment le plomb, provenant des munitions de chasse. Les risques biologiques vont des parasites tels que les larves de Trichinella, qui peuvent être transmises à l'homme par la consommation de viande de gibier, jusqu'aux agents zoonotiques bactériens, notamment Salmonella et Escherichia coli vérotoxinogènes (VTEC), en passant par des virus comme le virus de l'hépatite E (VHE) chez les sangliers.

Les risques d'origine chimique et microbiologique pouvant survenir lors de la transformation et du commerce de la viande de gibier, contaminant potentiellement le produit final, seront également évalués. L’objectif est de diffuser les connaissances scientifiques acquises grâce au réseau dans diverses régions et d’aligner les normes de sécurité des aliments à long terme au-delà des frontières.

Le réseau vise également à recueillir des informations sur les différentes pratiques de chasse et de formation ainsi que sur les réglementations et normes juridiques nationales en matière d'inspection de la viande et d'hygiène pour la viande de gibier dans chaque pays. Les règles de sécurité sanitaire pour le commerce transfrontalier de produits sauvages doivent être renforcées et harmonisées. En outre, le réseau met l'accent sur l'éducation des consommateurs sur les risques associés à la manipulation sûre de la viande de gibier. En fin de compte, cela peut renforcer la confiance du consommateur dans les produits à base de viande de gibier.

‘La sécurité sanitaire dans la chaîne de la viande de gibier’ est fondée par la Coopération européenne en science et technologie (COST).

Liens utiles : Safe Game Meat COST Action (CA22166)

Maladies infectieuses émergentes : DURABLE, un projet européen mené par l'Institut Pasteur

«Maladies émergentes : DURABLE, un projet européen mené par l'Institut Pasteur», souce communiqué de l’Institut Pasteur du 5 juin 2023.

Le projet européen DURABLE, mené par l'Institut Pasteur, a été lancé en février 2023. DURABLE signifie Delivering a Unified Research Alliance of Biomedical and public health Laboratories against Epidemics. Il s'agit d'un réseau dont l'objectif principal est de mettre en place un guichet unique pour la préparation des laboratoires aux maladies émergentes. Ce projet à grande échelle, d'une durée de quatre ans, contribuera à la mise en place de systèmes de santé plus solides, plus résistants et plus accessibles.

Avec l'augmentation des épidémies de maladies infectieuses, un réseau solide d'instituts de recherche fondamentale et translationnelle de classe mondiale est nécessaire pour répondre aux menaces sanitaires. Le consortium DURABLE de laboratoires européens de recherche et de santé publique a été financé dans le cadre du programme européen EU4Health à hauteur de 25 millions d'euros dont 20 millions par l'Union Européenne sur quatre ans (2023-2027). En plus de développer un guichet unique, ce projet établira un réseau durable de laboratoires et d'instituts de recherche capable d’améliorer la préparation aux maladies émergentes mais aussi d’alerter, de fournir des données scientifiques en temps réel et des analyses intégrées aux autorités européennes, telles que HERA et ECDC.

Coordonné par le Dr Jean-Claude Manuguerra, responsable de l'unité Environnement et risques infectieux au sein du Département Santé Globale de l'Institut Pasteur (Paris, France), avec le Professeur Marion Koopmans (Erasmus Medical Center, Pays-Bas) et Roberto Bruzzone (HKU-Pasteur Reasearch Pole), DURABLE va également :

- Développer et utiliser des méthodes ciblées et non ciblées pour l'identification des menaces connues et nouvelles ;

- Coordonner, intégrer, analyser et partager les résultats pour une utilisation rapide et directe dans la prise de décision en matière de santé publique ;

- Élaborer des études ciblées pour guider la collecte de données supplémentaires en réponse aux alertes.

Partenaires et entités affiliées de DURABLE

1. Institut Pasteur (IP) France
   
2. Pasteur Network (PN)
3. Katholieke Universiteit Leuven (KU LEUVEN) Belgique
   
4. Statens Serum Institut (SSI) Danemark
   
5. Friedrich Loeffler Institut - Bundesforschungsinstitut fuer Tiergesundheit (FLI) Allemagne
   
6. Charite - Universitaetsmedizin Berlin (CHARITE) Allemagne
   
7. Erasmus Medisch Centrum Rotterdam (EMC) Pays-Bas
   
8. Partikas Drosibas, Dzivnieku Veselibas un Vides Zinatniskais Institutsbior (BIOR) Lettonie
   
9. Universite d’Aix Marseille (AMU) France
   
10. Rijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu (RIVM) Pays-Bas
    
11. Universita Degli Studi di Padova (UNIPD) Italie
    
12. Uniwersytet Jagiellonski (JU) Pologne
    
13. Agencia Estatal Consejo Superior de Investigaciones Cientificas (CSIC) Espagne
    
14. Helsingin Yliopisto (UH) Finlande
    
15. Aristotelio Panepistimio Thessalonikis (AUTH) Grèce
    
16. Instituto Nacional de Saúde Dr. Ricardo Jorge (INSA) Portugal
    
17. Univerzita Karlova (CU) République Tchèque
    
18. Istituto Superiore di Sanità (ISS) Italie
    
19. Tartu Ulikool (UTARTU) Estonie
    
20. Hrvatski Zavod za Javno Zdravstvo (CIPH) Croatie

27 personnes interpellées entre l'Espagne et la France dans une macro-opération contre le trafic illégal de civelles

«Un réseau de trafic de civelles démantelé en Europe, 27 arrestations», source AFP du 11/05/2023.

Un réseau international de trafic de civelles, alevins de l'anguille vendus à prix d'or en Asie sur le marché noir, a été démantelé en France, Espagne, Belgique et Pologne avec l'arrestation mercredi de 27 trafiquants, ont annoncé jeudi les enquêteurs.

Le coup de filet européen a permis l’interpellation de quatre commanditaires en France, où un vivier clandestin a été découvert avec des civelles de contrebande et du matériel pour stocker et ré-oxygéner ces animaux en voie d’extinction. Selon les enquêteurs, le trafic était «l’oeuvre d’une bande organisée (utilisant) la frontière franco-espagnole pour tenter de dissimuler ses activités délictuelles avec l’Asie».

Au total, près de quatre tonnes de civelles ont été exportées frauduleusement entre 2021 et 2023, pour un bénéfice estimé à 1,18 million d’euros, selon l’équipe européenne chargée des investigations.

Quelque 115 agents ont été mobilisés en France au sein de la gendarmerie (Oclaesp et sections de recherche de Bordeaux et Pau), de la police, du Service des enquêtes judiciaires des finances (SEJF), de l’Office français de la biodiversité et de la Brigade nationale des enquêtes vétérinaires et phytosanitaires.

Les investigations, lancées en 2021, ont permis de constater l’implication de mareyeurs, responsables commerciaux et pêcheurs, qui prélevaient cette espèce réglementée hors quotas, et de mettre au jour des filières illégales d’exportation par les aéroports européens, notamment via des intermédiaires asiatiques installés en région parisienne.

En Espagne, la Guardia Civil a interpellé une vingtaine de personnes et des investigations ont également été menées dans des installations en Belgique et auprès d’une entreprise de repeuplement en Pologne soupçonnée d’être une «société écran» en vue d’exportations en contrebande vers l’Asie.

Quelque 200 000 euros en liquide ont été saisis, ainsi que 900 000 euros de biens divers, dont des civelles de contrebande et des véhicules.

La valeur annuelle du trafic illégal de civelles, menacées d’extinction et interdites d’exportation hors de l’Union européenne depuis 2010, est estimée à trois milliards d’euros. Elles se négocient entre 700 et 900 euros le kilo en France, où la pêche est très réglementée, et jusqu’à 5 000 euros en Asie.

La contrebande de l’anguille européenne dite «Anguilla anguilla» est une des causes de la baisse de 75% de sa population en trente ans.

Incidents stables en sécurité des aliments au second trimestre 2022, selon INFOSAN

«Résumé trimestriel INFOSAN, 2022 #2Avril - Juin 2022», source INFOSAN du 20 juillet 2022.

Incidents liés à la sécurité des aliments

Le secrétariat d'INFOSAN a été impliqué dans 46 incidents de sécurité des aliments concernant 106 États membres (EM) et territoires de l'OMS au cours de ce deuxième trimestre de l'année. Il y a eu 22 incidents impliquant un danger biologique [Listeria monocytogenes (8), Salmonella spp. (7), Norovirus (3), Hépatite A (1), moisissures (1), et deux incidents en cours d'identification du danger biologique] ; 17 impliquant un allergène et/ou un ingrédient non déclaré [lait (6), crustacés (2), arachides (2), amandes (1), œuf (1), gluten (1), noisettes (1), moutarde (1), sésame ( 1) et soja (1)] ; cinq impliquant un danger chimique [aflatoxines (1), chlorpyriphos (1), histamine (1), alcaloïdes (1), analogue du thio-sildénafil (1)] et deux impliquant un danger physique [métal (1), plastique (1)] .

Les catégories d'aliments les plus fréquemment impliquées dans les 46 incidents survenus au cours du deuxième trimestre de 2022 étaient des collations, des desserts et d’autres aliments (11), le poisson et autres produits de la mer (7), des aliments composés (5), des herbes, des épices et des condiments (5), fruits à coques et oléagineux (4), fruits et produits à base de fruits (3), légumes et produits à base de légumes (3), viande et produits de viande (2), céréales et produits de céréales (1), œuf (1), additifs alimentaires (1) , lait et produits laitiers (1), boissons non alcoolisées (1) et un inconnu.

Au cours du deuxième trimestre, le nombre d'incidents s'est maintenu à un niveau élevé, atteignant 46, soit un de moins qu'au dernier trimestre (47). En raison de l'engagement actif des membres et partenaires d'INFOSAN, 52% par les membres d'INFOSAN (points de contact d'urgence et points focaux), 33% de ces incidents ont été signalés au secrétariat par le biais du système d'alerte rapide pour les denrées alimentaires et les aliments pour animaux (RASFF) de la Commission européenne. et 15% par divers canaux de l'OMS.

Portée géographique

Les 46 incidents ont impliqué 106 États et territoires membres de l'OMS de toutes les Régions de l'OMS. Les États membres touchés se répartissaient comme suit : 49 États membres sur 53 de la Région européenne, 18 sur 47 en Afrique, 13 sur 27 dans le Pacifique occidental, 11 sur 35 dans les Amériques, 11 sur 21 dans Méditerranée orientale, et enfin 3 sur 11 en Asie du Sud-Est.

Épidémie dans plusieurs pays à Salmonella Typhimurium monophasique liée à des produits à base de chocolat

Au 18 mai 2022, 369 cas du cluster à Salmonella Typhimurium étaient liés à l'épidémie dans 14 États membres de l'OMS de la Région européenne de l'OMS et deux États membres de la Région OMS des Amériques. L'évaluation des risques et les conseils de l'OMS pour cette épidémie sont disponibles dans un article d'actualité dédié aux épidémies sur le site Internet de l'OMS. De plus amples informations sur les enquêtes épidémiologiques et microbiologiques peuvent être trouvées dans une première mise à jour de l'évaluation conjointe rapide par l’ECDC-EFSA de l'épidémie, publiée en mai 2022.

Tout au long de ce trimestre, le secrétariat d'INFOSAN a continué de suivre cette épidémie dans plusieurs pays à Salmonella Typhimurium monophasique liée à la consommation de produits chocolatés distribués à l'échelle internationale. Le secrétariat d'INFOSAN a maintenu des contacts étroits avec les États membres concernés afin de faciliter les échanges de communication et de fournir des informations pertinentes pour étayer les enquêtes.

Les États membres de l'OMS impliqués dans cette urgence en matière de sécurité des aliments ont fourni au secrétariat d'INFOSAN diverses mises à jour concernant leurs enquêtes et mis en œuvre des mesures de gestion des risques après avoir été informés de l'alerte mondiale INFOSAN publiée en mars 2022. Ces mises à jour comprenaient, par exemple, des inspections locales à l'entreprise de chocolat impliqués, des détails sur les rappels des produits inclus dans l'alerte, et sur la surveillance pour identifier les cas liés à la consommation des produits impliqués. Certains États membres ont également notifié la redistribution des produits concernés et ont partagé avec le secrétariat d'INFOSAN les informations nécessaires pour notifier d'autres États membres destinataires.

Le secrétariat d'INFOSAN continue de compiler les mises à jour et les résultats des différents États membres dans le résumé des incidents sur le site Internet de la communauté INFOSAN, qui a été régulièrement mis à jour au fur et à mesure que les informations sont devenues disponibles. Des espaces dédiés ont également été créés au sein du site Web de la communauté INFOSAN où les membres du réseau ont pu partager directement les résultats de leurs enquêtes et d'autres mises à jour. Des expériences et des solutions nationales dans la gestion de cet incident à prendre en compte lors de la gestion de futures urgences internationales en matière de sécurité sanitaire des aliments ont également été partagées au sein de ces espaces.

Les États membres ont reconnu l'importance de disposer de réseaux tels qu'INFOSAN pour faciliter l'échange d'informations entre les États membres lors d'urgences en matière de sécurité sanitaire des aliments. Une telle communication a permis la mise en œuvre rapide de mesures de gestion des risques lors de cette épidémie. Le secrétariat d'INFOSAN continue de suivre cet incident et tiendra les États membres informés si de nouvelles informations deviennent disponibles.

Épidémie à Salmonella aux États-Unis d'Amérique liée au beurre de cacahuète, distribuée à l'échelle internationale.

Par le biais du point de contact d'urgence (ECP) d'INFOSAN aux États-Unis d'Amérique (USA), le secrétariat d'INFOSAN a été informé d'une épidémie à Salmonella (n = 16) liée à des produits à base de beurre d'arachide et d'un rappel volontaire ultérieur émis par le compagnie.

Avec la collaboration de l'ECP aux États-Unis, les membres du réseau ont été informés que les produits impliqués liés à l'épidémie étaient distribués à l'échelle internationale à un certain nombre d'États membres et de sites de l'OMS. Le secrétariat d'INFOSAN a contacté directement les ECPs des États membres destinataires pour s'assurer qu'ils étaient au courant de la distribution internationale des produits impliqués et demander des informations supplémentaires sur la réponse à cet incident, y compris l'identification de tout cas possible lié à la consommation des produits impliqués.

Les États membres destinataires ont notifié au secrétariat INFOSAN les mesures de gestion des risques mises en œuvre suite à la notification émise. Aucun cas de maladie lié à la consommation de produits en cause n'a été signalé dans d'autres États membres de l'OMS.

Suit dans ce compte-rendu d’INFOSAN, différentes actions de coopération internationale ...

Aux lecteurs du blog

La revue PROCESS Alimentaire censure pour une triste question d’argent les 10 052 articles initialement publiés gracieusement par mes soins de 2009 à 2017 sur le blog de la revue, alors que la revue a bénéficié de la manne de la publicité faite lors de la diffusion de ces articles. La revue PROCESS Alimentaire a fermé le blog et refuse tout assouplissement. Derrière cette revue, il faut que vous le sachiez, il y a une direction aux éditions du Boisbaudry, pleine de mépris, et un rédacteur en chef complice !

Un réseau allemand mis en place pour la surveillance des bactéries

«Un réseau allemand mis en place pour la surveillance des bactéries», source Food Safety News.

Trois organisations allemandes ont créé un consortium pour surveiller les agents pathogènes bactériens et détecter plus rapidement les épidémies.

L'Université de Münster, le Centre de recherche Borstel et l'Institut Robert Koch ont formé le réseau miGenomeSurv (pour Microbial Genomic Surveillance ou Surveillance du génome microbien des agents infectieux).

Ce réseau s'appuie sur des laboratoires nationaux de référence, où les agents infectieux pertinents pour la population sont caractérisés microbiologiquement et par l’analyse génomique. Les méthodes de séquençage du génome fournissent des empreintes génétiques et d'autres caractéristiques de la bactérie permettant la surveillance et la détection de cas groupés.

L'objectif initial comprend E. coli entérohémorragique (EHEC) et Listeria monocytogenes et a soumis des prélèvements datés du début de 2019, atteignant près de 3 000 d'ici le deuxième trimestre de 2021.

Une empreinte digitale détaillée d'un agent pathogène est nécessaire pour identifier ou exclure toute similitude entre les souches. Cela aide les investigateurs à reconnaître si les agents pathogènes impliqués sont similaires et s'ils ont déjà été observés ailleurs ou plus tôt.

«Afin d'améliorer le contrôle des infections, la surveillance moléculaire des agents infectieux est essentielle», a déclaré le professeur Lothar H. Wieler, président de l'Institut Robert Koch.

Signature unique des agents pathogènes

En 2011, le système de santé publique allemand a été confronté à une épidémie à E. coli O104:H4 d'origine alimentaire, qui a provoqué l'une des plus importantes épidémies d'infections à EHEC, entraînant 2 987 maladies, 855 cas d'insuffisance rénale grave et 53 décès. Les graines germées de fenugrec d'Égypte ont été identifiées comme le véhicule le plus probable de l'infection.

L'identification de la source de l'infection est essentielle pour un contrôle efficace de l'épidémie. Si la source n'est pas retrouvée rapidement, de telles épidémies peuvent se poursuivre pendant de longues périodes et à différents endroits, ce qui rend l'identification de l'agent causal très difficile.

Une base de données à accès restreint déclenche automatiquement des avertissements précoces d'épidémie en envoyant des courriels aux soumettants de données en cas de correspondances génomiques étroites entre les échantillons.

Dans le consortium, un langage commun, appelé nomenclature, est défini pour les nombreuses lignées d'agents pathogènes détectés.

Ceci est basé sur la séquence du génome et d'un core génome (cg) - typage par séquençage multilocus (MultiLocus Sequence Typing ou MLST) calculé à partir des données du génome. En conséquence, le matériel génétique de l'agent pathogène est traduit en un code numérique standardisé.

Cela permet l'échange de données entre les laboratoires participants, avec d'autres partenaires et institutions nationaux et internationaux tels que le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC) et les services de santé publique responsables de mesures telles que la gestion des épidémies.

«Des outils bioinformatiques faciles à utiliser aident à donner à chaque agent pathogène une signature unique», a déclaré le professeur Dag Harmsen, de l'Université de Münster.

Des groupes similaires existants incluent le réseau GenomeTrakr de la FDA, le consortium Global Microbial Identifier et PulseNet International.

Bactéries et virus : un réseau de relations dans nos intestins

«Bactéries et virus : un réseau de relations dans nos intestins», source communiqué du CNRS du 10 mars 2021.

L’équilibre du microbiote intestinal humain est crucial pour la santé. Il se compose de centaines d’espèces bactériennes et de phages (des virus qui n’infectent que les bactéries). Une équipe de recherche, comprenant des scientifiques du CNRS et de l’Institut Pasteur, a caractérisé avec une précision sans précédent les réseaux d’interaction phages-bactéries du microbiote de dix individus sains. Les scientifiques ont détecté plusieurs centaines de génomes de bactéries et de phages et identifié les milliers d’interactions les liant grâce à la quantification des contacts entre les molécules d’ADN des virus et de leurs hôtes. Cette méthode a l’avantage de fournir des données exhaustives à partir de très peu d’échantillons biologiques. Les résultats ont ensuite été analysés avec des algorithmes semblables à ceux appliqués à l’étude des communautés d’individus sur les réseaux sociaux. La mise en lumière de ce panorama de relations entre bactéries et phages pourrait s’appliquer à des thérapies impliquant le microbiote intestinal, telles que la transplantation fécale et la phagothérapie. L’approche utilisée dans l'étude, récemment parue dans eLife, pourrait également déboucher sur des analyses plus précises des écosystèmes terrestres et marins.

Réseau d’interactions entre les phages (en bleu) et les bactéries (en vert) présent dans un microbiote humain. Les traits représentent l’assignation d’un phage à son hôte bactérien. © Martial Marbouty / Romain Koszul.

Contamination de l'eau potable dans une petite commune de la Marne

Depuis le 7 février,les habitants d’Hermonville sont privés d’eau potable à cause d’une pollution provenant de la station d’épuration.

L'information d'Europe 1 du 17 février 2021 privilégie l'émotionnel aux faits,

A Hermonville, commune de 1 500 habitants située dans la Marne, 284 cas de malades ont été comptés. En cause : la présence dans le réseau d'eau d'au moins deux bactéries, Escherichia coli et entérocoques. La consommation d'eau est donc interdite depuis le 7 février.

Des packs d'eau pour remplacer l'eau du robinet

«Il faut venir chercher l’eau tous les jours. C’est la galère», raconte à Europe 1 un habitant venu récupérer de l’eau en bouteille. «C’est le petit rituel», complète-t-il. Dans la cour de la mairie, des centaines de packs d’eau s’entassent. Ces bouteilles sont vitales pour remplacer cette eau du robinet devenue dangereuse pour les habitants. «Tous les habitants de la rue de Reims ont été malades. Au bout de ma rue, ils ont aussi été malades. Je connais une famille de cinq personnes, ils ont vomi trippes et boyaux le samedi et dimanche», énumère encore un habitant.

«C’est une hécatombe», commente également Sophie. Dès le 8 février, son fils Malo est tombé malade. «Malo est rentré du collège lundi, avec des vomissements, des diarrhées. C’était le chaos total. On commence à comprendre que le problème vient de l’eau. Malo est hospitalisé le mardi et dans la nuit de mardi à mercredi, c’est mon tour. Bilan : quatre malades sur quatre et trois hospitalisations», développe la mère de famille.

Une erreur de manipulation

Pour trouver une explication, il faut aller à la sortie du village. Au bout d’un chemin, on peut voir un silo, à côté de grands bacs qui recueillent les eaux usées : c’est la station d’épuration d’Hermonville, gérée par l'opérateur Suez, d’où vient l’origine du problème. «Suite à une erreur de manipulation, il y a de l’eau industrielle de la station qui s’est retrouvée dans le réseau d’eau potable» explique Katia Beaujard, la maire de la commune. «On est à 284 malades donc cette situation m’inquiète. Je m’interroge sur les conséquences de cette pollution à long terme», poursuit-elle.

La maire d’Hermonville a déposé plainte au nom de la commune. Une enquête a été ouverte en parallèle contre X pour blessures involontaires. Contacté, Suez a dit ne pas vouloir commenter une enquête en cours.

Selon cette information de la mairie du 12 février 2021,

La poullution est localisée et circonscrite. Le réseau d'eau de notre commune est isolé, sur-chloré et purgé. Les bornes à incendie peuvent être ouvertes à cet effet. Pour lever la prescription de ne plus consommer l'eau du robinet, nous devons attendre de nouvelles analyses de l'ARS.

Pour le journal L'Union du 11 février 2021,

«Reconstruite en 2017, la station n’était pas équipée d’un disconnecteur permettant d’isoler les deux circuits, comme elle aurait dû l’être. Le risque était faible mais connu et identifié, avec un plan d’action en cours avec le Grand Reims pour corriger.» Un problème de plomberie, donc, qui au regard du contexte, ne saurait perdurer : jeudi lors de notre échange, Suez affirmait que l’installation du disconnecteur devait avoir lieu l’après-midi même, évitant ainsi tout nouveau risque de retour des eaux usées.

L'implication d'INFOSAN dans les incidents de sécurité des aliments a doublé

« L'implication d'INFOSAN dans les incidents de sécurité des aliments a doublé », source article de Joe Whitworth paru le 16 octobre 2020 dans Food safety News.

Le réseau mondial de sécurité sanitaire des aliments a été impliqué dans près du double du nombre d'incidents par rapport à ces dernières années.

INFOSAN a été actif lors de 162 événements sur la sécurité des aliments dans toutes les régions en 2018 et 2019, dont 84 en 2019 et 78 en 2018. Il a été impliqué dans 84 incidents internationaux en 2016 et 2017.

Le réseau international des autorités de sécurité des aliments (INFOSAN), lancé en 2004, est géré par l'Organisation mondiale de la santé (OMS) et l'Organisation des Nations Unies pour l'alimentation et l'agriculture (FAO).

Les dangers biologiques étaient responsables du plus grand nombre d'événements INFOSAN, dont le plus courant était lié à Salmonella spp. Il y a eu 110 alertes impliquant un danger biologique, 29 impliquant un danger physique, 11 dues à un danger chimique, 11 impliquant un allergène non déclaré et une concernant un danger non spécifié.

Salmonella, un problème majeur

Salmonella a été responsable de 41 événements en 2018-2019. Suivi de 22 à cause de Listeria monocytogenes, de 13 à cause de E. coli, de 6 à cause du norovirus, de 5 à cause de Clostridium spp., le virus de l'hépatite A et des dangers biologiques non spécifiés en comptaient quatre chacun et trois pour Vibrio spp., Deux à cause de Bacillus sp., Cronobacter sakazakii, Cyclospora cayetanensis et un pour Anisakis, des mycotoxines, Pseudomonas spp. et Staphylococcus aureus.

Pour les dangers chimiques, les problèmes impliquant des quantités excessives de métaux lourds se sont produits le plus fréquemment, d'autres dangers responsables d'événements liés à la sécurité des aliments étaient l'iode, la toxine ciguatera, l'histamine, le cyanure d'hydrogène, le méthanol, le bore et un danger non spécifié.

Vingt-trois incidents concernaient du lait et des produits laitiers, 19 étaient dus au poisson et à d'autres produits de la mer, 15 à des collations, des desserts et d'autres aliments, et 14 à de la viande et des produits carnés.

Le secrétariat INFOSAN facilite la communication et partage les informations sur la sécurité des aliments entre les membres du réseau. Cela permet aux pays de retirer les aliments contaminés des marchés internationaux et nationaux et de réduire le risque d'épidémies de maladies d'origine alimentaire.

Durée et région des incidents

La durée moyenne pendant laquelle le secrétariat INFOSAN a été impliqué dans un événement a été de 10 jours, avec un minimum d'un jour et un maximum de 134 jours, contre une moyenne de 28 jours en 2016-2017.

La plus longue implication a été l'épidémie de listériose liée à des légumes surgelés distribués internationalement et produits en Hongrie par Greenyard. Elle a touché 54 personnes dans six pays avec 10 décès de 2015 à 2018.

La plupart des 162 événements impliquaient des pays de la Région européenne, suivis du Pacifique occidental et des Amériques avec entre 80 et 92 incidents. La région de la Méditerranée orientale, de l'Afrique et de l'Asie du Sud-Est ont participé à 21 à 34 événements.

La plupart des rapports en 2018/2019 ont été envoyés au secrétariat par un point de contact d'urgence INFOSAN ou un point focal, suivi par le contact RASFF de la Commission européenne.

« Alors que la proportion de notifications d'événements provenant directement des points de contact d'urgence INFOSAN ou des points focaux a augmenté en 2018-2019 par rapport aux années précédentes, il y a de la place à l'amélioration », selon le rapport.

« Les retards dans la notification des événements liés à la sécurité des aliments signifient que des aliments non sûrs peuvent rester sur le marché, disponibles pour les consommateurs à l'achat, et peuvent entraîner des maladies d'origine alimentaire évitables dans plusieurs pays. »

Renforcement des capacités

Pour renforcer les capacités régionales, INFOSAN a soutenu des ateliers en Tunisie et au Ghana axés sur l'établissement de liens entre les agences nationales impliquées dans la sécurité sanitaire des aliments pour mieux répondre aux situations d'urgence.

Le rapport a identifié les limites de la capacité de surveillance de base pour détecter les maladies d'origine alimentaire et les événements liés à la sécurité des aliments dans de nombreux pays.

« Cela souligne la nécessité continue pour INFOSAN de s'associer aux programmes de renforcement des capacités de la FAO et de l'OMS pour soutenir le développement global de systèmes de sécurité des aliments. Lorsque les systèmes nationaux de sécurité des aliments seront renforcés, les membres d'INFOSAN deviendront mieux équipés et capables d'identifier, de communiquer et de répondre aux urgences en matière de sécurité sanitaire des aliments. »

Pendant ce temps, des chercheurs ont décrit les opinions des membres d'INFOSAN pour mieux comprendre le rôle du réseau dans l'amélioration de la sécurité alimentaire.

Un questionnaire en ligne a été adapté de l'anglais au français et à l'espagnol avant d'être envoyé aux membres d'INFOSAN. Des réponses ont été reçues de 239 membres dans 137 pays entre août et octobre 2019. L'étude a été publiée dans le Journal of Food Protection (Exploring the International Food Safety Authorities Network as a Community of Practice: Results from a Global Survey ofNetwork Members).

Plus des deux tiers des répondants étaient d'accord ou tout à fait d'accord avec le fait que grâce à INFOSAN, des maladies ont été évitées et des vies ont été sauvées. Soixante-deux pour cent ont convenu qu'il avait amélioré la sécurité de l'approvisionnement alimentaire mondial et 59 pour cent étaient d'accord ou tout à fait d'accord pour dire qu'INFOSAN a réduit la charge des maladies d'origine alimentaire dans le monde.

La fraude alimentaire va augmenter de façon ‘inévitable’ en raison du COVID-19

« La fraude alimentaire va augmenter de façon ‘inévitable’ en raison du COVID-19 », source article de Joe Whitworth paru le 22 mai 2020 dans Food Safety News.

Des experts en authenticité des aliments ont déclaré qu'une augmentation de la fraude alimentaire était inévitable en raison de l'épidémie de coronavirus.

Le Food Authenticity Network Advisory Board s'est réuni plus tôt ce mois-ci et, compte tenu de la perturbation des chaînes d'approvisionnement mondiales causée par le COVID-19 et de la diminution du niveau de surveillance, ils ont déclaré qu'ils pensaient qu'une augmentation de la fraude alimentaire était probable.

Selon Europol, plusieurs colis contenant des compléments alimentaires contrefaits ont été saisis lors d'une récente investigation dans l'UE. Les colis provenaient du Brésil, de Chine et de Hong Kong, d'Allemagne, de la Suède et du Royaume-Uni. Ils ont été faussement déclarés comme confiserie ou comme complément alimentaire spécifique ou générique.

Le Food Authenticity Network a établi une base de données sur la fraude alimentaire sur son site Internet rassemblant des informations mondiales pour aider à lutter contre les menaces pesant sur la chaîne d'approvisionnement en raison de la pandémie mondiale.

Rassembler les ressources

Selvarani Elahi, directrice du Food Authenticity Network, a déclaré qu'en partageant les meilleures pratiques et en travaillant ensemble, l'impact de la fraude alimentaire peut être minimisé.

« Le site Internet sur l'authenticité des aliments est comme un panneau d’indication vers d'autres ressources, mais il a été diffusé dans de nombreux endroits différents du réseau. Vous trouverez donc sur cette page des liens directs. La page d'information est là et elle sera mise à jour si nous ajoutons autre chose et les gens peuvent nous contacter s'ils ont une ressource qu'ils veulent listée. Elle restera là en tant que ressource, elle s'appelle COVID-19 parce que c'est le problème en ce moment, mais ces choses sont également applicables chaque fois que vous perturbez considérablement la chaîne d'approvisionnement alimentaire », a-t-elle déclaré à Food Safety News.

« Le gouvernement du Royaume-Uni a mis cela en place, mais maintenant nous travaillons avec l'industrie alimentaire et d'autres gouvernements afin qu'ils puissent ajouter des pages spécifiques à chaque pays sur le site Internet sans créer leur propre système. De nombreuses preuves montrent que la sécurité des aliments et la fraude sont liées. Habituellement, beaucoup de problèmes de fraude alimentaire deviennent des problèmes de sécurité sanitaire des aliments, car s'ils sont prêts à commettre une fraude, ils ne se soucient pas vraiment de la sécurité des aliments ou des ingrédients qu'ils contiennent. »

Le Food Authenticity Network a été créé en juillet 2015 par le gouvernement du Royaume-Uni après une recommandation dans le «Elliott Review». Il compte aujourd'hui plus de 1 500 membres de 69 pays.

Le réseau est un site Internet en accès libre contenant des informations sur les tests d'authenticité des aliments, la réduction de la fraude alimentaire et l'intégrité de la chaîne d'approvisionnement. Il est dirigé par LGC et a été créé avec le financement du ministère de l'environnement, de l'alimentation et des affaires rurales, de la Food Standards Agency et de la Food Standards Scotland. Il est actuellement soutenu par un financement de partenariat public-privé du Department for Business, Energy and Industrial Strategy, McCormick and Co., LGC Standards et de l’Institute of Food Science & Technology.

Elahi a dit que la lutte contre la fraude lorsqu'elle se produisait est une chose, mais la plupart des gens veulent la prévenir en premier lieu, c'est pourquoi les conseils de réduction de la fraude alimentaire sont une priorité.

« La ressource est destinée aux entreprises et aux personnes qui regardent leur chaîne d'approvisionnement alimentaire, donc aux courtiers, agents et quiconque s'occupe des transactions alimentaires et a une chaîne d'approvisionnement à protéger », a dit Elahi. « Il existe des systèmes de traçabilité de la chaîne d'approvisionnement, mais aussi des bases de données qui sont des enregistrements historiques sur la fraude alimentaire par produit. Les services réglementaires doivent également être conscients des outils que l'industrie utilise. »

Comment mesurer les niveaux de fraude alimentaire ?

Une récente analyse de la Commission européenne a montré une augmentation de 20% des cas de fraude alimentaire en Europe en 2019. On ne sait pas si cela signifie que les personnes recherchent davantage ou s'il y a plus de fraude, mais il doit y avoir un tel rapport pour que la fraude soit mesurée, a dit Elahi.

« Le sentiment que le le board a eu était multiple. Il existe actuellement une surveillance limitée avec toutes les normes commerciales des autorités locales et les agents de santé environnementale travaillant à domicile ou en congé. Ils ne peuvent pas physiquement entrer et prélever des échantillons, il y a donc peu de mesures d'application », a-t-elle dit.

« Il est difficile de chiffrer mais si vous regardez la combinaison de facteurs, il y a un excédent de biens dans certains domaines et des pénuries et des perturbations dans d'autres et les gens achètent de différentes sources pour combler cet écart. L'opportunité est définitivement là car la demande est là. »

Sterling Crew, président du conseil consultatif du réseau, a dit que la sécurité des aliments mondiale de la chaîne d'approvisionnement avait été perturbée par l'impact de la pandémie de COVID-19, ouvrant de nouvelles opportunités pour les fraudeurs alimentaires sans scrupules.

« La prévention de cette fraude alimentaire pendant la pandémie est primordiale pour garantir la confiance de nos consommateurs et maintenir des pratiques commerciales sûres, équitables et durables », a-t-il dit.

Le rapport EU Food Fraud Network and Administrative Assistance and Cooperation System pour 2019 a montré 292 demandes, contre 234 en 2018. L'Allemagne en a créé le plus avec 76, suivie de la France avec 38 et de la Belgique avec 26. La Commission était responsable de 70 demandes.

Les graisses et les huiles sont devenues la première catégorie en fonction du nombre de demandes faisant de l'huile d'olive le produit le plus notifié. La catégorie des produits à base de poisson a été suivie par les produits à base de viande autres que la volaille. La principale non-conformité était le mauvais étiquetage, qui représentait 47,3% des 431 non-conformités signalées dans le système.

Retour à la normale après la pandémie?

Il est difficile de savoir si les chaînes d'approvisionnement locales plus courtes et populaires pendant la pandémie continueront, a déclaré Elahi.

« Après la viande de cheval en 2013, tout le monde jurait qu'ils allaient acheter Britannique, local et aller aux marchés de producteurs, mais cela a duré environ un mois. Dès que le temps s'est amélioré et que les barbecues ont recommencé, tout le monde est retourné vers les supermarchés et avec les mêmes habitudes d'achat », a-t-elle dit.

« Même si j'aimerais croire que tout le monde va changer fondamentalement à cause du COVID-19, je ne le vois pas. Cela a sans aucun doute fait réfléchir les gens et nous pouvons acheter de manière légèrement plus responsable, mais je pense que la commodité et le style de vie moderne seront toujours un facteur. Nous ne produisons pas non plus suffisamment de nourriture pour approvisionner le pays, nous devons donc importer et avoir besoin de chaînes d'approvisionnement mondiales. Nous voulons manger des avocats tous les jours de l'année, il y a donc une demande des consommateurs et je ne pense pas que cela disparaisse. »

Selon les directives de l'Organisation mondiale de la santé et de l'Organisation des Nations Unies pour l'alimentation et l'agriculture, pressées d'identifier de nouveaux fournisseurs en raison d'une pénurie ou d'une indisponibilité, les entreprises peuvent accorder moins d'attention à l'intégrité de la chaîne d'approvisionnement, ce qui ouvre des possibilités de fraude alimentaire.

Alors que les autorités réduisent temporairement les contrôles, les inspections et l'échantillonnage des aliments, les fraudeurs peuvent en profiter. Il est également probable qu'il y aura moins d'audits et de contrôles des systèmes de certification et d'accréditation dans le secteur privé. Les entreprises du secteur alimentaire devraient également envisager d'introduire des systèmes d'évaluation de la vulnérabilité basés sur les risques pour atténuer la fraude alimentaire.

Un nombre croissant de consommateurs se tournent vers le commerce électronique et les achats en ligne de produits alimentaires. Beaucoup de gens achètent désormais des aliments en ligne sur des sites qui ont vu le jour depuis le début de la pandémie. Selon le guide, le risque de fraude alimentaire dans le secteur du commerce électronique peut être élevé. Le document conseillait aux autorités de renforcer les contrôles alimentaires et la surveillance des ventes sur Internet afin de protéger les consommateurs contre les pratiques de commerce électronique trompeuses.