jeudi 18 mai 2023

De la responsabilité des politiques dans les déboires du nucléaire depuis 20 ans

C’est surtout parce cela ne fait pas partie des domaines de prédilection du blog que je vous propose ce document, mais aussi, et surtout, afin que vous y pensiez, tout comme moi, chaque que vous vous direz, tiens ma note d’élctricité ou de chauffage est excessive !

Sur l’énergie nucléaire, les lecteurs attentifs du blog auront déjà lu Grand déballage explosif dans lequel on découvre où est passée notre énergie ? et Si vous n'aviez pas encore tout vu ou entendu sur le sabotage de notre énergie nucléaire.

A écouter sans modération ...

Un rapport met en évidence les progrès et les lacunes du G7 dans les efforts pour stimuler le développement d'antibiotiques

«Un rapport met en évidence les progrès et les lacunes du G7 dans les efforts pour stimuler le développement d'antibiotiques», source article de Chris Dall paru 16 mai 2023 dans CIDRAP News.

Un rapport conjoint de l'Organisation mondiale de la santé et du Global AMR R&D Hub exhorte les pays du G7 à faire pression pour des mécanismes de financement innovants et d'autres incitations afin d'assurer un approvisionnement «robuste et durable» de nouveaux antibiotiques.

Le rapport est une mise à jour sur les progrès réalisés par les ministres des Finances et de la Santé du G7 sur les engagements pris en 2021 et 2022 pour accélérer la mise en œuvre de stratégies de résistance aux antimicrobiens (RAM), prendre des mesures supplémentaires pour faire face au marché cassé des nouveaux antibiotiques, renforcer la recherche sur la RAM et développement (R&D), et commercialiser de nouveaux antibiotiques et d'autres produits traitant de la résistance aux antimicrobiens. Il conclut que même si les pays du G7 se sont engagés dans une série d'activités pour créer les conditions économiques qui encourageraient le développement de nouveaux antibiotiques, il faut en faire davantage.

Parmi les réalisations mises en évidence figurent le modèle d'abonnement du Royaume-Uni pour de nouveaux antibiotiques et l'annonce récente du Japon d'un programme de garantie de revenus pour les nouveaux antibiotiques, qui devrait commencer cette année.

Le rapport note également que les États-Unis, le Canada, le Japon et l'Union européenne sont tous en train d'évaluer et de mettre en œuvre des incitations à la demande et d'autres modèles économiques innovants qui encourageraient le développement d'antibiotiques de grande valeur. Il ajoute que les pays du G7 continuent d'investir dans des partenariats qui soutiennent le développement d'antibiotiques à un stade précoce, tels que CARB-X (Combating Antibiotic-Resistant Bacteria Biopharmaceutical Accelerator) et GARDP (Global Antibiotic Research & Development Partnership).

Cependant, pour tirer parti de ces progrès, le rapport indique que les pays du G7 doivent s'efforcer d'atteindre des engagements et des objectifs «tangibles et spécifiques» pour encourager le développement et l'accès équitable à de nouveaux antibiotiques au cours des deux prochaines années, fournir un financement durable et prévisible pour la R&D sur les antibiotiques, s'appuyer sur des programmes pilotes réussis d'incitation à l'attraction et explorer la possibilité de formuler des mécanismes de collaboration internationale sur les incitations à l'attraction, et soutenir les initiatives visant à améliorer l'accès mondial et équitable aux antibiotiques nouveaux et existants.

«Le G7 peut s'appuyer sur les réalisations passées et en cours pour collaborer et s'unir dans l'action contre les effets dévastateurs de la RAM et assurer un approvisionnement solide et durable en antibactériens et autres technologies de la santé traitant de la RAM», conclut le rapport.

Confirmation de la sécurité sanitaire des œufs sans allergène avec l’édition génomique

«Confirmation de la sécurité sanitaire des œufs sans allergène avec l’édition génomique», source Université d'Hiroshima, via EurkAlert!

Des chercheurs ont mis au point un œuf de poule qui pourrait être sans danger pour les personnes allergiques au blanc d'œuf. Les allergies aux œufs de poule sont l'une des allergies les plus courantes chez les enfants. Bien que la plupart des enfants surmontent cette allergie à l'âge de 16 ans, certains auront encore une allergie aux œufs à l'âge adulte. Les allergies au blanc d'œuf peuvent provoquer divers symptômes, notamment des vomissements, des crampes d'estomac, des problèmes respiratoires, de l'urticaire et un gonflement. Certaines personnes allergiques au blanc d'œuf ne peuvent pas recevoir certains vaccins comme celui contre la grippe.

En utilisant la technologie d'édition génomique, des chercheurs ont produit un œuf sans la protéine qui cause les allergies au blanc d'œuf. Cette protéine, appelée ovomucoïde (OVM), représente environ 11% de toutes les protéines du blanc d'œuf.

L’étude détaillant le profil de sécurité des aliments de cet œuf modifié, appelé OVM-knockout (ou sans OVM), a été détaillée dans un article publié dans Food and Chemical Toxicology en avril 2023.

«Pour utiliser des œufs de poule OVM-knockout comme aliment, il est important d'évaluer sa sécurité sanitaire en tant qu'aliment. Dans cette étude, nous avons examiné la présence ou l'absence d'expression de protéines mutantes, d'insertion de séquences vectorielles et d'effets hors cible chez des poulets sans OVM par des TALENs (Transcription Activator-Like Effector Nucleases ou nucléases effectrices de type activateur de transcription)», a dit Ryo Ezaki, professeur à la Graduate School of Integrated Sciences for Life de l'Université d'Hiroshima, Japon. Les TALENs sont des enzymes de restriction artificielles obtenues par assemblage d’un domaine de liaison à l’ADN appelé TALE.

Afin de développer les œufs OVM-knokout, les chercheurs devaient détecter et éliminer la protéine d’ovomucoïde dans les blancs d'œufs. Les TALENs ont été conçus pour cibler un morceau d'ARN appelé exon 1, qui code pour des protéines spécifiques. Les œufs produits à partir de cette technique ont ensuite été testés pour s'assurer qu'il n'y avait pas de protéine d’ovomucoïde, de protéine d’ovomucoïde mutante ou d'autres effets hors cible. Les œufs avaient la mutation de décalage de cadre souhaitée, qui est une mutation créée en insérant ou en supprimant des bases nucléotidiques dans un gène, et aucun d'entre eux n'exprimait de protéines ovomucoïdes matures. Des anticorps anti-ovomucoïde et anti-ovomucoïde mutant ont été utilisés pour détecter toute trace de la protéine, mais il n'y avait aucune preuve d'ovomucoïde dans les œufs. Cela signifie que les ovomucoïdes mutants ne pourraient pas créer de nouveaux allergènes. Il s'agit d'une étape importante dans la détermination du profil d'innocuité des œufs.

D'autres outils d'édition de gènes, tels que CRISPR, ont tendance à avoir des effets de mutagenèse hors cible. Cela signifie que de nouvelles mutations sont provoquées par le processus d'édition génomique. Cependant, le séquençage du génome entier des blancs d'œufs modifiés a montré que des mutations, qui étaient peut-être des effets hors cible, n'étaient pas localisées dans les régions codant pour les protéines.

«Les œufs pondus par des poules homozygotes OVM-knokout ne présentaient aucune anomalie évidente. L'albumen ne contenait ni l'OVM mature, ni le variant OVM tronqué», a dit Ezaki. «Les effets hors cible potentiels induits par TALEN chez les poulets OVM-knockout ont été localisés dans les régions intergéniques et introniques. Les vecteurs plasmidiques utilisés pour l'édition génomique n'étaient que transitoirement présents et ne s'intégraient pas dans le génome des poulets édités. Ces résultats indiquent l'importance des évaluations de sécurité sanitaire et révèlent que les œufs pondus par cette poule OVM-knokout résolvent le problème d'allergie dans les aliments et les vaccins.

À l'avenir, les chercheurs continueront de vérifier le profil d'innocuité des œufs OVM-knockout. Parce que certaines personnes sont très allergiques à cette protéine spécifique, même de petites quantités d'ovomucoïde peuvent provoquer une réaction. Les chercheurs devront effectuer des études immunologiques et cliniques supplémentaires pour déterminer la sécurité sanitaire des œufs OVM-knokout. À l'heure actuelle, les chercheurs ont déterminé que les œufs OVM-knokout sont moins allergènes que les œufs standard et peuvent être utilisés en toute sécurité dans les aliments transformés par la chaleur que les patients allergiques aux œufs peuvent manger. «La prochaine phase de la recherche consistera à évaluer les propriétés physiques et l'aptitude au traitement des œufs OVM-knokout et à confirmer leur efficacité par le biais d'essais cliniques», a dit Ezaki. «Nous continuerons à mener d'autres recherches sur l'application pratique des œufs à allergie réduite.»

NB : Photo d’Ezaki et al. 2023, Food and Chemical Toxicology. 

Mise à jour du 21 mai 2023
On lira l'article paru sur le blog d'Ansré Heitz, «Première université à introduire un produit de bétail génétiquement édité dans l'alimentation humaine ». Une saucisse de l'Université de l'État de Washington est entrée dans l'histoire.

Les mycobactériophages pourraient utiles pour développer de nouvelles molécules antimicrobiennes

Nouveauté dans Microbiology Spectrum
Une approche de dépistage basée sur le séquençage de nouvelle génération (SGN) pour identifier les protéines codées par les mycobactériophages qui sont toxiques pour les mycobactéries. Les résultats de l’étude, Identification de protéines toxiques codées par le mycobactériophage TM4 à l'aide d'une méthode basée sur le séquençage de nouvelle génération, pourraient être utiles pour développer de nouvelles molécules antimicrobiennes.

Résumé
Les mycobactériophages sont des virus qui infectent spécifiquement les mycobactéries et qui, du fait de leur diversité, représentent un pool génétique important. La caractérisation de la fonction de ces gènes devrait fournir des informations utiles sur les interactions hôte-phage. Nous décrivons ici une approche de dépistage à haut débit basée sur le SGN pour l'identification des protéines codées par les mycobactériophages qui sont toxiques pour les mycobactéries. Une bibliothèque dérivée des plasmides représentant le génome du mycobactériophage TM4 a été construite et transformée en Mycobacterium smegmatis . Les tests de SGN et de croissance ont montré que l'expression de TM4 était toxique pour M. smegmatis. Bien que les gènes associés à la toxicité bactérienne aient été exprimés lors de l'infection par le phage, ils n'étaient pas nécessaires à la réplication lytique du mycobactériophage TM4. En conclusion, nous décrivons ici une approche basée sur le NGS qui a nécessité beaucoup moins de temps et de ressources que les méthodes traditionnelles et a permis l'identification de nouveaux produits géniques de mycobactériophages qui sont toxiques pour les mycobactéries.

Importance
La large propagation de Mycobacterium tuberculosis résistant aux antibiotiques a entraîné un besoin urgent de développement de nouveaux médicaments.

Les mycobactériophages sont des tueurs naturels de M. tuberculosis, et leurs produits géniques toxiques pourraient fournir des candidats anti-Mycobacterium vis-à-vis de la tuberculose.

Cependant, l'énorme diversité génétique des mycobactériophages pose des défis pour l'identification de ces gènes. Ici, nous avons utilisé une méthode de dépistage simple et pratique, basée sur le SGN, pour identifier les gènes de mycobactériophages codant pour les produits toxiques pour les mycobactéries. Grâce à cette approche, nous avons ciblé et validé plusieurs produits toxiques codés par le mycobactériophage TM4. De plus, nous avons également découvert que les gènes codant pour ces produits toxiques ne sont pas essentiels à la réplication lytique de TM4. Notre travail décrit une méthode prometteuse pour l'identification de gènes de phage qui codent pour des protéines toxiques pour les mycobactéries et qui pourrait faciliter l'identification de nouvelles molécules antimicrobiennes.

Les microbes et le béton ...

Il n'y a pas beaucoup de microbes dans le béton, mais il y en a. Des chercheurs ont utilisé le séquençage de l'ADN pour identifier les bactéries, notamment Staphylococcus, Streptococcus et autres, dans un pont en béton corrodé en Pennsylvanie., dans une étude intitulée Identification of Bacterial Taxa Present in a Concrete Pennsylvania Bridge.

Le béton contient une faible biomasse microbienne, mais certaines bactéries peuvent se développer dans cet environnement hautement alcalin. Nous avons utilisé l'extraction d'ADN à base de silice et l'analyse de la séquence d'ARNr 16S pour identifier des bactéries dans un échantillon de pont en béton corrodé de Bethlehem, en Pennsylvanie.
StaphylococcusStreptococcusCorynebacteriumLeifsoniaVicinamibacterales et Actinophytocola étaient les genres les plus abondants.

Les genres les plus abondants dans l'échantillon intérieur étaient Staphylococcus, Streptococcus et Corynebacterium, dont il a été démontré précédemment qu'ils étaient les principaux constituants de la communauté bactérienne dans la poudre de ciment. Les genres les plus abondants dans l'échantillon de surface étaient Leifsonia, Vicinamibacterales et Actinophytocola, qui n'étaient pas auparavant associées à des communautés bactériennes dans le béton.

Six cas d’infection à STEC liés à du lait cru fermenté en France (5) et en Belgique (1)

Le blog vous en avait parlé le 8 mai 2023 ici, mais voici du nouveau avec «Six cas d’infection à E. coli liés à du lait cru fermenté», source article de Joe Whitworth paru le 18 mai 2023 dans Food Safety News.

Cinq personnes ont été malades en France, deux gravement, et une en Belgique après avoir bu une marque de lait cru fermenté.

En France, quatre enfants et un adulte ont été infectés par des E. coli producteurs de shigatoxines (STEC) O26:H11. Ils sont tombés malades entre fin mars et début avril de cette année.

Santé publique France enquête sur deux cas de syndrome hémolytique et urémique (SHU) dans les régions Hauts-de-France et Île-de-France. Cette dernière s'inscrivait dans le cadre d'une éclosion familiale. L'aliment suspect était du lait cru fermenté. Le SHU est une complication grave associée aux infections à E. coli qui provoque une insuffisance rénale.

«Le séquençage des souches isolées au sein de ces foyers a confirmé le même profil génomique. Les enquêtes alimentaires ont permis d'identifier, pour le cas des Hauts-de-France, le lieu d'achat et de prélever du lait en vente au moment des contrôles. C'était du lait cru fermenté fabriqué en Belgique», ont déclaré des responsables de l'agence à Food Safety News.

Des prélèvements de ce lait réalisés dans les Hauts-de-France ont été analysés par le Laboratoire National de Référence (LNR). Le LNR réalise un séquençage pour voir s'il existe un lien basé sur les résultats et la comparaison avec des souches humaines, avec l'aide du Centre National de Référence (CNR).

Le 11 mai 2023, du lait cru fermenté de la marque Ferme Dumortier a été rappelé en France. La ferme est basée à Rekkem, Belgique. L'annonce porte sur tous les lots commercialisés à partir de la mi-mars, (lait, lait cru, lait battu, lait cru fermenté). La boisson est présentée dans une bouteille de 2 litres avec un bouchon rouge ou vert. Il a été distribué dans certains magasins L'Oasis à Lille.

Vue de la Belgique
L'Agence fédérale pour la sécurité de la chaîne alimentaire (AFSCA) a dit à Food Safety News qu'il y a un adulte malade en Belgique.

«Il y a correspondance entre la souche du malade identifiée en Belgique et celle analysée par la France. Le lien entre le produit consommé et la maladie peut donc être établi», a dit une porte-parole de l'agence.

En Belgique, une enquête de traçabilité menée par l'agence est en cours. La production de l'entreprise a été temporairement arrêtée pour permettre aux responsables de faire ce travail. STEC n'a pas été détecté dans 10 échantillons et écouvillons prélevés par l'AFSCA et analysés par Sciensano, l'institut national de santé publique de Belgique.

Dans une recommandation générale, les autorités sanitaires françaises ont indiqué que, par mesure de précaution, le lait cru et les fromages au lait cru ne doivent pas être consommés par les jeunes enfants, en particulier ceux de moins de 5 ans. Cette recommandation doit également être suivie par les femmes enceintes, les personnes immunodéprimées et les personnes âgées.

NB : Image du lait de la Ferme Dumortier rappelé.

Commentaire
Une notification au RASFF de l’UE par la France, le 5 mai 2023 et un rappel le 11 mai 2023, il y a quelque chose qui ne va pas (?). Vivement, la nouvelle police unique sanitaire ...

De l'analyse de la séquence du gène coa de Staphylococcus aureus et de sa maîtrise dans les troupeaux de vaches laitières

L'analyse de la séquence du gène responsable de la coagulase, coa, de Staphylococcus aureus peut prévenir les erreurs d'identification des souches à coagulase négative et contribuer à leur contrôle dans les troupeaux de vaches laitières. Cela se passe dans Frontiers in Microbiology, «Staphylococcus aureus coa gene sequence analysis can prevent misidentification of coagulase-negative strains and contribute to their control in dairy cow herds». L’article est disponible en intégralité.

Résumé
La différenciation exacte et précise des staphylocoques isolés du lait est importante pour la gestion de la santé du pis. En particulier, l'identification rapide et spécifique de Staphylococcus aureus joue un rôle essentiel dans les programmes de prévention et de traitement de la mammite bovine. La gélatinisation du plasma dans les dosages de coagulase est couramment utilisée pour discriminer la présence de S. aureus des autres espèces en détectant la présence de staphylocoagulase libre extracellulaire. Cependant, des souches rares de S. aureus déficientes en coagulase peuvent être responsables de cas de mammite clinique et subclinique. En investiguant sur les isolats de S. aureus d'un seul troupeau sur une période de 10 ans, nous avons identifié la persistance d'une souche de S. aureus phénotypiquement coagulase négative et identifié la cause possible d'une suppression d'une seule paire de bases dans la séquence du gène coa. Nos résultats confirment la nécessité d'intégrer des tests biochimiques primaires avec des approches d'analyse moléculaire et séquentielle pour identifier et discriminer correctement les S. aureus atypiques dans les troupeaux de bovins, car le test de coagulase seul peut ne pas détecter les souches persistantes responsables de la mammite.

Quand le ministre de l'économie fait de la pub pour la fausse viande ! Qu'en pense le ministre de l'agriculture ?

Mise à jour du 20 mai 2023
«Elevage : Bruno Le Maire déclare la guerre à la viande», source La France Agricole du 19 mai 2023. La visite du ministre de l’Économie sur le nouveau site de la société HappyVore ainsi que ses déclarations sur le réseau social Twitter ont entraîné une vague de mécontentement.
Et voici la réaction de la Confédération Française de la Boucherie, Boucherie-Charcuterie, Traiteurs.
Mise à jour du 21 mai 2023
Triste nouvelle, le numéro un français du porc , Cooperl s’attaque au marché des protéines végétales
Il se lance dans les protéines végétales. Sa gamme baptisée la Tablée Végétale a été présentée au Salon International de la Restauration et de l’Hôtellerie et s’adresse dans un premier temps au circuit de la restauration hors domicile.

Autre réaction aux propos de M. Le Maire, 
Mise à jour du 7 novembre 2023
On lira l'article publié sur le blog d'André HeitzBeyond Meat s'effondre sans répit – la vérité sur le veggie boom. 

mercredi 17 mai 2023

Nouveau règlement européen (UE) 2023/915 sur les contaminants

Cette information est pour ceux qui sont fan de la réglementation européenne …

Il s’agit du nouveau règlement européen (UE) 2023/915 du 25 avril 2023 concernant les teneurs maximales pour certains contaminants dans les denrées alimentaires et abrogeant le règlement (CE) n°1881/2006.

Le 5 mai 2023, le règlement (UE) 2023/915 de la Commission du 25 avril 2023 concernant les teneurs maximales pour certains contaminants dans les denrées alimentaires a été publié et sera d’application à partir du 25 mai 2023. Ce règlement abroge le règlement (CE) 1881/2006.

Ce dernier a été modifié fréquemment depuis 2006. La Commission européenne a décidé ensemble avec les États membres de l’abroger et de remplacer par un nouveau règlement afin d’améliorer l’harmonisation des différents contaminants et augmenter la lisibilité du règlement.

Ce règlement 203/915 fait beaucoup référence au règlement (CE) n°178/2002 du Parlement européen et du Conseil du 28 janvier 2002 établissant les principes généraux et les prescriptions générales de la législation alimentaire, instituant l'Autorité européenne de sécurité des aliments et fixant des procédures relatives à la sécurité des denrées alimentaires.

Quelques changements majeurs incluent :

- L’ajout de définitions, comme entre autres sur l’exploitant du secteur alimentaire, la mise sur le marché ou le consommateur final (article 1).

«exploitant du secteur alimentaire» est un exploitant du secteur alimentaire au sens de l’article 3, point 3), du règlement (CE) n°178/2002, c’est-à-dire un  «exploitant du secteur alimentaire», la ou les personnes physiques ou morales chargées de garantir le respect des prescriptions de la législation alimentaire dans l'entreprise du secteur alimentaire qu'elles contrôlent.

«mise sur le marché» est la mise sur le marché au sens de l’article 3, point 8), du règlement (CE) n°178/2002, c’est-àdire la détention de denrées alimentaires ou d'aliments pour animaux en vue de leur vente, y compris l'offre en vue de la vente ou toute autre forme de cession, à titre gratuit ou onéreux, ainsi que la vente, la distribution et les autres formes de cession proprement dites.

«consommateur final»: un consommateur final au sens de l’article 3, point 18), du règlement (CE) n°178/2002, c’est-à-dire  le dernier consommateur d'une denrée alimentaire qui n'utilise pas celle-ci dans le cadre d'une opération ou d'une activité d'une entreprise du secteur alimentaire.

- L’interdiction de décontamination de denrées alimentaires (article 4) : Les denrées alimentaires contenant des contaminants figurant à l’annexe I (Teneurs maximales pour certains contaminants dans les denrées alimentaires) ne peuvent être délibérément décontaminées au moyen de traitements chimiques.

- Des mesures transitoires pour des denrées alimentaires légalement mises sur le marché avant une date visée (article 10). Il s’agit de denrées alimentaires légalement mises sur le marché avant les dates visées aux points a) à k) peuvent rester sur le marché jusqu’à leur date de durabilité minimale ou leur date limite de consommation.

A noter que les limites maximales en place via le règlement prédecesseur, règlement (CE) 1881/2006 vont être maintenues.

Le Val d'Oise, département pilote en matière de sécurité des aliments : Deux nouvelles fermetures adminstratives de restaurants !

Le Val d’Oise est bel et bien un département pilote en matière de police sanitaire unique dont on sait désormais qu’elle devrait être opérationnelle dès 2024

Le Val d’Oise se distingue par la fréquence et la publicité de ses interventions en matière de sécurité sanitaire des aliments, de quoi en faire un département pilote !

Et aujourd’hui, au programme du 17 mai 2023, nous avons des fermetures administratives pour deux restaurants :
«Au bonheur», situé 61 rue de Paris à Franconville et «Da Giovanni», situé 11 rue des Thermes  Enghien-les-Bains.

- locaux et équipements sales
- denrées conservées dans des conditions inadéquates
- personnel non suffisamment formé aux bonnes pratiques d’hygiène
- bonnes pratiques d’hygiène non respectées
- locaux non équipés de dispositifs permettant le nettoyage hygiénique des mains
- la traçabilité des denrées non assurée

Du fait de ces manquements, et en raison du risque de contamination ou de développement de micro-organismes et d’intoxication alimentaire, les établissement ont fait l’objet d’une fermeture. Les mesures de fermeture seront levées dès que les établissements seront aux normes en vigueur.  

N'hésitez pas à cliquer sur les images pour avoir la légende ...