samedi 18 janvier 2020

Des chercheurs découvrent une étape d'adhésion précoce dans le transit intestinal de Shigella


« Des chercheurs découvrent une étape d'adhésion précoce dans le transit intestinal de Shigella », source Massachusetts General Hospital via euralert!

La découverte d'une expression génétique altérée aux premiers stades de l'infection remet en question la compréhension actuelle de la shigellose.

Le pathogène bactérien Shigella, souvent propagé par les aliments ou l'eau contaminée, est une des principales causes de mortalité chez les enfants et les personnes âgées dans les pays en voie de développement.

Bien que des scientifiques étudient Shigella depuis des décennies, aucun vaccin efficace n'a été développé et le pathogène a acquis une résistance à de nombreux antibiotiques. La découverte récente d'une étape d'adhésion précoce dans le cycle d'infection par des chercheurs du Massachusetts General Hospital (MGH) pourrait fournir une nouvelle cible thérapeutique ou même une nouvelle méthode de développement de vaccins.

En se déplaçant dans le système digestif, Shigella traverse l'intestin grêle et infecte ensuite le gros intestin, provoquant des crampes, de la diarrhée et une déshydratation dans la maladie appelée shigellose.

« Nous voulions déterminer comment Shigella établit son premier contact avec les cellules épithéliales aux premiers stades du développement de la maladie », explique le Dr Christina Faherty, auteur principal de l'étude publiée dans mSphere.

« En raison de certaines annotations de séquences de gènes et de la façon dont Shigella est apparue après la croissance dans des milieux de laboratoire standard, on pensait que les souches de Shigella ne produisaient pas de fimbriae ou d'autres facteurs d'adhérence. » Les fimbriae sont de fibres courtes ressemblant à des cheveux que les cellules bactériennes utilisent pour adhérer aux cellules épithéliales individuelles pour déclencher l'infection.

Les travaux de Faherty et de l'équipe de recherche ont mis au jour des preuves de fimbriae qui facilitent l'adhésion aux cellules épithéliales, une étape importante dans le début d'une infection à shigellose.

« Nous avons imité les conditions auxquelles Shigella serait confrontée lors de son voyage à travers l'intestin grêle en ajoutant des sels biliaires et du glucose aux milieux de laboratoire », explique Faherty. « Avec cette méthode, nous avons découvert ce qui avait été caché à la vue de tous - les profils d'expression génique qui ont permis à Shigella de lancer cette première étape de l'infection en se fixant au tissu épithélial de l'hôte. »

Des chercheurs du Mucosal Immunology and Biology Research Center du MGH ont effectué une microscopie complète et des analyses génétiques de Shigella pour déterminer ses étapes ultérieures après avoir quitté l'estomac. Leurs résultats démontrent qu’« au moins trois gènes structurels facilitent l'adhésion de S. flexneri (souche) 2457T pour le contact avec les cellules épithéliales et la formation de biofilm. » En d'autres termes, leurs résultats contredisent l'hypothèse actuelle selon laquelle les composants critiques des clusters de gènes sont incapables de produire des fimbriae ou d'autres facteurs d'adhérence.

Dans des recherches antérieures, Faherty et ses collègues ont déterminé que l'exposition aux sels biliaires entraînait la formation de biofilms, un revêtement protecteur des communautés bactériennes. Faherty émet l'hypothèse que cet enrobage permet au pathogène de survivre aux conditions difficiles de l'intestin grêle pour réussir à pénétrer dans le côlon. Étant donné que la formation de biofilm nécessite des facteurs d'adhérence et que les cellules bactériennes dispersées à partir du biofilm adhèrent mieux aux cellules épithéliales, la prochaine étape du groupe a été d'étudier l'expression du facteur d'adhérence dans ces conditions. Cette étape suivante a en effet été controversée compte tenu des hypothèses selon lesquelles Shigella ne produit pas de structures d'adhérence; pourtant, les analyses approfondies ont fourni des preuves solides du contraire.

La co-auteur Rachael Chanin note que l'étude la plus récente du groupe confirme leurs analyses antérieures que les conditions « de type in vivo » ont facilité la formation de biofilm et l'adhésion aux cellules épithéliales par l'attachement des fimbriae.

« L'un des principaux défis dans l'étude de Shigella est le manque de modèles animaux qui récapitulent fidèlement les maladies humaines », explique Chanin. « Bien qu'il y ait eu des études élégantes et approfondies de ce qui se passe lorsque le pathogène pénètre dans les cellules épithéliales du côlon, nous n'avons pas compris ce qui se passe pendant le transit à travers le système digestif ou comment la bactérie s'approche ou interagit avec les cellules hôtes avant l'entrée. Notre travail commence à répondre à ces questions et souligne l'importance des méthodes de culture de type in vivo. Il montre également que ces méthodes peuvent influencer nos résultats expérimentaux, que ce soit intentionnellement ou non. »

Après les résultats prometteurs de leur modèle de laboratoire de sels biliaires et de glucose, les chercheurs ont ajouté un autre composant à leur analyse d'adhérence, un organoïde intestinal humain. Le « mini-intestin », créé à partir de cellules souches isolées du tissu intestinal, représente un modèle de l'épithélium intestinal humain. En travaillant avec un mini-intestin du côlon ascendant, les chercheurs ont découvert les structures d'adhérence de Shigella en contact initial avec les cellules épithéliales. « Nous pensons que ces facteurs d'adhérence utilisés dans le modèle organoïde intestinal reproduisent le contact établi avec les cellules épithéliales du côlon aux stades initiaux de la shigellose », explique Faherty.

Coquillages et norovirus en France, une dimension internationale. Une suite au Danemark et en Suède


Il y a bien une suite à Coquillages et norovirus en France, une dimension internationale, voici « Le Danemark et la Suède touchés par norovirus dans les huîtres », source article de Joe Whitworth paru le 18 janvier 2020 dans Food Safety News.

Le Danemark et la Suède sont les derniers pays à avoir signalé des foyers épidémiques de cas à norovirus liés aux coquillages de France.

Au moins 180 personnes au Danemark sont malades depuis le début de l'année et 70 ont été touchées en Suède, bien que certaines d'entre elles seraient tombées malades après avoir mangé des huîtres suédoises.

En France, 1 033 personnes ont été malades et 21 ont dû être hospitalisées. L'Italie et les Pays-Bas ont également signalé des foyers épidémiques de cas liés à des huîtres vivantes de France.

Des produits ont été rappelés en raison d'un risque de contamination par norovirus en Belgique, Luxembourg, Suisse, Hong Kong et Singapour. Un total de 23 zones conchylicoles dans sept régions ont été fermées avec plus de 400 entreprises concernées, selon le ministère français de l'Agriculture et de l'Alimentation.
Les investigations se poursuivent aux Pays-Bas
Tjitte Mastenbroek, attachée de presse à l'Autorité néerlandaise de sécurité des produits alimentaires et de consommation (NVWA), a déclaré que les cas de maladies dans le pays n'étaient pas définitivement liées aux huîtres.

« Il y a des personnes malades aux Pays-Bas, qui sont peut-être tombées malades à cause de norovirus dans les huîtres, mais cela n'a pas encore été déterminé par l'analyse. Il n'est donc pas encore établi qu'il existe une source commune à ces patients », a-t-il déclaré à Food Safety News.

« Cependant, nous sommes conscients du nombre récemment croissant de rapports dans un contexte européen et de la couverture médiatique. Nous suivons de près l'évolution de la situation et dès que des produits dangereux seront identifiés, nous surveillerons leur retrait du marché. »

Le conseil standard du Centre néerlandais de nutrition (Voedingscentrum) pour les consommateurs est le suivant: « Les coquillages et les crustacés crus tels que les moules crues ou les huîtres crues peuvent être infectés par norovirus. Vous ne pouvez pas voir ou sentir cela, mais vous pouvez ressentir des nausées, des vomissements et de la diarrhée. Pour éviter ce risque, il vaut mieux ne pas consommer des coquillages et crustacés crus. »

Situation au Danemark et en Suède
L'administration vétérinaire et alimentaire danoise (Fødevarestyrelsen) a commencé à voir des rapports de maladie dans les premiers jours de 2020.

Plusieurs foyers épidémiques de cas ont été signalées et au moins 180 personnes ont été malades de vomissements et de diarrhée après avoir mangé des huîtres de France fin décembre et le soir du Nouvel An, selon Statens Serum Institut.

Les produits concernés sont vendus dans les poissonneries, les supermarchés et les restaurants. L'agence a informé les importateurs qu'ils doivent éviter les huîtres provenant de zones fermées par les autorités françaises. Il est prévu que les huîtres actuellement sur le marché proviennent de zones ouvertes où aucun norovirus ou autre contamination microbiologique n'a été retrouvé.

L'Agence suédoise des aliments (Livsmedelsverket) a indiqué qu'en décembre et janvier, un nombre inhabituellement élevé de personnes étaient tombées malades après avoir mangé des huîtres. Des foyers épidémiques de cas sont survenus dans plusieurs municipalités, 70 personnes ayant contacté les services médicaux et demandé de l'aide.

Les symptômes étaient pour la plupart conformes à ceux du norovirus et, dans certains cas, ils ont été confirmés par une analyse microbiologique. Norovirus a également été détecté dans des huîtres en Suède et dans d'autres pays.

Les autorités suédoises ont recherché l'origine des huîtres qui ont causé la maladie dans le pays. Dans certains cas, ce sont les huîtres suédoises qui sont soupçonnées d'avoir causé la maladie.

Les symptômes du norovirus apparaissent un à deux jours après l'infection et durent généralement deux ou trois jours. Le norovirus se transmet en contaminant des aliments ou de l'eau ou d'une personne à l'autre par contact avec la peau, des objets ou par inhalation de particules en suspension dans l'air. Le virus peut vivre pendant de longues périodes sur des surfaces telles que des comptoirs et des boutons de porte.

Mise à jour du 20 janvier 2020. Selon Fødevarestyrelsen (mais aussi selon une traduction approximative Google), Près de 200 Danois en ont assez des huîtres françaises.
Depuis le début de l'année, les autorités alimentaires françaises ont trouvé norovirus dans des huîtres à plusieurs endroits le long du littoral français. Des milliers de Français et au moins 180 consommateurs au Danemark sont tombés malades.

vendredi 17 janvier 2020

Survie de Salmonella dans le sol et transfert sur les produits via des éclaboussures


Une récente étude parue dans le Journal of Food Protection, traite d’un sujet méconnu, « Survie de Salmonella dans le sol et transfert sur les produits via des éclaboussures » (Salmonella Survival in Soil and Transfer onto Produce via Splash Events).

Résumé
Aux États-Unis, près de la moitié des cas de maladie d'origine alimentaire peuvent être attribuées à la consommation de produits frais. L'étape de production avant la récolte offre une occasion cruciale de prévenir la contamination des produits sur le terrain de contaminer les opérations après récolte et d'exposer les consommateurs aux pathogènes d'origine alimentaire.
Une voie de contamination des produits qui n'est pas souvent explorée est le transfert de pathogènes dans le sol aux portions comestibles des cultures via les éclaboussures.

Nous rapportons ici les résultats de plusieurs expériences sur le terrain et en microcosme examinant le potentiel de contamination par Salmonella de cultures de fruits et de légumes par des éclaboussures, et l'effet de la teneur en eau du sol sur la survie de Salmonella dans le sol et la concentration dans les éclaboussures.

Dans des expériences sur le terrain et en microcosme, nous avons détecté Salmonella jusqu'à 8 à 10 jours après l'inoculation dans le sol et sur les produits. Salmonella et des solides en suspension ont été détectés dans les projections d'eau à des hauteurs pouvant atteindre 80 cm de la surface du sol. Les conditions d'humidité du sol avant l'événement d'éclaboussure ont influencé la détection de Salmonella sur les cultures après les événements d'éclaboussuresles concentrations de Salmonella sur les produits après la pluie étaient significativement plus élevées dans les parcelles humides que dans les parcelles sèches (différence moyenne géométrique = 0,43 UFC/g ; P = 0,03).

De même, les concentrations de Salmonella dans les éclaboussures des parcelles humides avaient tendance à être plus élevées que les concentrations des parcelles sèches (différence géométrique moyenne = 0,67 UFC/100 ml; P = 0,04).

Ces résultats indiquent que le transfert par éclaboussures de Salmonella du sol sur les cultures peut se produire et que la teneur en humidité du sol antérieure peut médier l'efficacité du transfert microbien. Le transfert par éclaboussures de Salmonella peut donc présenter un danger pour la sécurité sanitaire du produit.

Le potentiel de risque d'éclaboussures devrait être étudié plus avant dans les régions agricoles où Salmonella et d'autres pathogènes sont présents dans le sol. Ces résultats aideront à éclairer l'évaluation des risques pour la sécurité sanitaires des produits et l'élaboration de pratiques de management pour la réduction de la contamination des produits.

Faits saillants
  • Salmonella a été détectée pendant 8 à 10 jours après l'inoculation dans le sol et sur les produits.
  • Salmonella dans le sol peuvent être détecté dans les éclaboussures d'eau lors des événements de pluie/irrigation.
  • Salmonella a été détecté dans des éclaboussures d'eau jusqu'à 80 cm de hauteur.
  • Les conditions d'humidité du sol peuvent affecter le potentiel de transfert de Salmonella.
Mots-clés
Irrigation, sécurité sanitaire du produit , précipitations, Salmonella, éclaboussures

Etats-Unis : Les éclosions à E. coli liées à de la laitue romaine sont peut-être terminées, mais sans connaître l’origine, ni la cause profonde du problème de contamination


« Les éclosions à E. coli liées à de la laitue romaine sont peut-être terminées, mais sans connaître l’origine, ni la cause profonde du problème de contamination », source article de Dan Flynn paru le 17 janvier 2020 dans Food Safety News.

C’est un jour rare où deux épidémies à E. coli O157:H7 dans plusieurs États et un seul Etat sont déclarées terminées.
C'est probablement même un événement qui a lieu pour la première fois, juste un autre dans l'odyssée qui se déroule depuis fin 2017, quand la laitue romaine a commencé à répandre le dangereux contaminant qui provient de l’intestin des bovins.

La Food and Drug Administration, le Centers for Disease Control and Prevention, l'Agence de la santé publique du Canada et la santé publique du comté de Seattle-King ont déclaré que les épidémies étaient terminées et que la laitue romaine était à nouveau sûre à consommer. Y compris la laitue romaine de la zone de culture de Salinas, en Californie.

Mais alors que les épidémies ou l’épidémie sont pour le moment terminées, le problème de la laitue romaine n'est pas résolu. Aucune source définitive, ni aucune cause profonde n'a été retrouvée. Les producteurs de légumes à feuilles font un examen approfondi de leurs protocoles de sécurité des aliments. La Californie a renforcé son leadership.

L'industrie était fourni un flux rapide de communiqués peu de temps après que les agences gouvernementales aient fait leurs annonces cette semaine. Steve Church of Church Brothers est un producteur de laitue romaine de premier plan qui siège au conseil d'administration de la California Leafy Greens Marketing Agreement. (LGMA).

« Ces épidémies », dit-il, « sont dévastatrices pour notre industrie ainsi que pour les consommateurs, et elles doivent cesser. »

Le LGMA, en Californie et Arizona, sont des groupes bénévoles de l'industrie qui se concentrent sur une variété de sujets, y compris les programmes de sécurité des aliments qui imposent des normes plus strictes aux producteurs par le biais de programmes d'audit de l'État. Les programmes LGMA ont commencé en 2007, un an après la contamination des épinards par E. coli.

« Nous devons prendre le contrôle de notre destin », a déclaré le président du LGMA de Californie, Dan Sutton. « Le LGMA existe pour établir des normes de sécurité des aliments pour la culture de légumes verts à feuilles. Nous avons besoin d'un effort ciblé à l'échelle de l'industrie pour comprendre ce qui se passe dans l'environnement où nous avons des cultures. »

Sutton, lui-même producteur de légumes à feuilles vertes, affirme que les règles de LGMA sont « déterminées à apporter de réels changements » pour améliorer la sécurité de leur produit. Les deux organisations ont modifié leurs normes de l'ère 2007 depuis le début des épidémies de laitue romaine.

La FDA a indiqué qu'elle n'avait pas encore déterminé la source des épidémies. L'agence s'est concentrée sur une seule exploitation agricole ces dernières semaines, mais elle n'a encore cité personne ou aucune entité. Dans sa découverte précédente de E. coli dans l'eau d'irrigation, la FDA a également fait une découverte dans le sol. Ce n'est pas la souche de l'épidémie, ni même celle qui est virulente.

Une grande partie du problème est que cela est compliqué. L’analyse des causes profondes de l’industrie comprend trois types d’eau, le ruissellement environnemental, l’eau d’irrigation ou l’eau agricole et l’eau utilisée pour la récolte, et environ une douzaine d’autres facteurs non liés à l’eau, du contact des travailleurs agricoles à la contamination croisée sur les plates-formes de récolte.

« La communauté des légumes à feuilles est extrêmement motivée pour aller au fond des choses, et nous voulons être plus impliqués », a déclaré Jan Berk de San Miguel Produce, qui est également vice-président de LGMA.

Berk suggère que les investigateurs de la FDA gagneraient à inclure les producteurs dans l'enquête du gouvernement. « Ils ne savent pas ce qui se passe dans nos domaines comme nous le faisons », dit Berk. « Nous sommes ceux qui doivent résoudre ce problème. »

En attendant d'être invités à aider la FDA, les producteurs du LGMA et une association industrielle influente ne sont pas en reste. « Le LGMA procède actuellement à une refonte systématique des pratiques de sécurité sanitaire des aliments incluses dans notre programme », a déclaré Scott Horsfall, PDG du LGMA de Californie.

Horsfall dit que son groupe travaille avec Western Growers sur « un examen ouvert et transparent des pratiques de séécurité des aliments requises dans le cadre de la LGMA ». L'étude inclura une expertise externe avec de nouvelles connaissances et des recherches.

Le California Department of Food and Agriculture (CDFA) a invité les producteurs à une réunion le 4 février à Salinas. La session est pour les producteurs de discuter des opportunités de recherche dans « une vaste étude qui surveillera les conditions environnementales en Californie qui peuvent contribuer aux épidémies. »

« Notre objectif est de travailler en collaboration avec les producteurs de légumes à feuilles vertes et avec la FDA pour résoudre les problèmes qui continuent d'avoir un impact sur la laitue romaine », a déclaré la secrétaire du CDFA, Karen Ross. « Le LGMA et l'ensemble de l'industrie des légumes à feuilles vertes ont été extrêmement coopératifs dans ces efforts. Nous voulons tous voir la fin de ces épidémies afin que les consommateurs puissent avoir confiance en la consommation des légumes à feuilles vertes. Nous le devons à nos consommateurs et à nos producteurs. »

Les modifications que le LGMA apporte aux normes et aux procédures sont des exigences pour des milliers d'exploitations, qui produisent ensemble plus de 90 pour cent des légumes à feuilles vertes cultivés aux États-Unis. Les auditeurs du gouvernement américain vérifient que les producteurs respectent les nouvelles exigences grâce à des audits obligatoires.

Le nombre total de cas confirmés dans les éclosions déclarées après le 15 janvier est de 221 à la fois aux États-Unis et au Canada. Environ la moitié d'entre eux ont dû être hospitalisés, mais dans cette vague de maladie à E. coli, personne n'est décédé. Les épidémies dans plusieurs Etats à E. coli O157:H7 liées à de la laitue romaine depuis fin 2017 étaient les suivantes :

2017
2018
2019
Ensemble, ces éclosions sont responsables de six décès et ont rendu malades au moins 474 personnes aux États-Unis, dont 219, soit près de 50%, ont dû être hospitalisées. À un moment, les épidémies de laitue romaine ont touché les consommateurs de 35 États.

Les épidémies qui ne traversent pas les frontières d'un État ne sont pas incluses dans le décompte ci-dessus. Également apparemment non répertoriée est l'épidémie à E. coli liée à la laitue romaine que la FDA et le CDC ont gardée secrète du public du 17 septembre au 1er novembre. Elle a rendu malade 23 personnes dans 12 États. Parmi ces patients pour lesquels des informations complètes étaient disponibles, 11 étaient tellement malades qu'ils ont dû être hospitalisés. Les maladies ont commencé à des dates allant du 12 juillet au 8 septembre.

Listeria est en tête des dangers gérés par INFOSAN au 4e trimestre 2019


Ce n’est pas à proprement parlé une surprise, car nous savons que Listeria, en France, est la première cause de rappel de produit alimentaire ; par ailleurs, dans l’UE, Listeria est en très bonne place parmi les foyers épidémique d’origine alimentaire au sein de l’UE et, selon, lEFSA, « la listériose représente la proportion la plus élevée de cas d’hospitalisation (97%) et le plus grand nombre de décès (229), ce qui en fait l'une des maladies d'origine alimentaire les plus graves. »

Et donc, « Listeria est en tête des dangers gérés par INFOSAN au 4e trimestre 2019 », source article de Joe Whitworth paru le 17 janvier 2020 dans Food sfaety News.

Salmonella n’a plus la première place remplacé par Listeria monocytogenes en tant que principal danger traité par un réseau international de sécurité alimentaire.

Au cours du quatrième trimestre 2019, le Réseau international des autorités de sécurité sanitaire des aliments (INFOSAN) a été impliqué dans quatre incidents impliquant Listeria sur 15 concernant 44 pays, selon un récent rapport.

Salmonella était à égalité au deuxième rang avec E. coli tandis que d'autres éclosions d'octobre à décembre 2019 mettaient en vedette norovirus et Clostridium botulinum. Un problème concernait également des morceaux de verre et aussi de morceaux de plastique. INFOSAN a participé à 83 événements au cours de l'année écoulée, ce qui est le même chiffre qu'en 2018. Les 83 incidents de sécurité des aliments sont un de moins que ce que le réseau a dû faire face en 2016 et 2017 combinés.

Salmonella était le principal danger depuis qu'INFOSAN a commencé à produire des résumés trimestriels de janvier à mars 2018, alors que Listeria était le principal problème.

Les catégories d'aliments les plus couramment impliquées au 4 trimestre 2019 étaient la viande et les produits carnés, le poisson et autres produits de la mer, les herbes, les épices et les condiments, le lait et les produits laitiers, les boissons alcoolisées, des aliments composites, les fruits et les produits de fruits, les noix et les oléagineux, et les légumes et les produits végétaux.

Zoom sur E. coli O157 et la laitue romaine
Le réseau est géré par l'Organisation des Nations Unies pour l'alimentation et l'agriculture (FAO) et l'Organisation mondiale de la santé (OMS).

Au 4 trimestre 2019, une éclosion d'infection à E. coli O157:H7 aux États-Unis liée à de la laitue romaine cultivée à Salinas, en Californie, a été signalée à INFOSAN. Les autorités fédérales ont récemment déclaré que l'épidémie est terminée avec 167 personnes infectées provenant de 27 États des Etats-Unis.

Après la suspension à Hong Kong de l'importation et de la vente de laitue romaine des États-Unis, INFOSAN a travaillé avec ses points de contact d'urgence (ECP pour Emergency Contact Points) pour voir s'il y avait des cas de maladie dans le pays liés à la laitue romaine.

S'exprimant en novembre, un porte-parole du Center for Food Safety (CFS) à Hong Kong, a déclaré que l'agence avait demandé à l'importateur, Wing Kee Produce Ltd., de suspendre les ventes et de rappeler le produit concerné.

« Les investigations de suivi du CFS ont révélé que l'importateur avait également vendu plusieurs autres types de produits concernés fabriqués dans la zone concernée. En outre, le CFS a constaté qu'un autre importateur, City Super Limited, avait également importé plusieurs types de produits concernés. »

Des collègues aux États-Unis ont partagé des informations sur la séquence du génome entier pour aider à l'identification des cas internationaux. Il a été confirmé par la suite qu'aucune infection à E. coli O157: H7 n'a été documentée à Hong Kong et aucun autre signalement de maladie en dehors des États-Unis n'a été transmis à INFOSAN.

En novembre 2019, des médias de Taïwan ont annoncé que la Food and Drug Administration exigerait un certificat de sécurité sanitaire pour toutes les importations de laitue romaine des États-Unis pendant un mois en raison de l'épidémie liée à la laitue romaine de Californie.

Le ministère de la santé de Trinité-et-Tobago, le Département du commerce et de la consommation de la Barbade et l'Institut national de recherche et de vulgarisation agricoles de la Guyane ont tous conseillé aux consommateurs de ne pas utiliser de laitue romaine de Salinas, en Californie.

En Jamaïque, une interdiction a été imposée sur les importations de laitue romaine en novembre 2018, qui était toujours en vigueur à la fin de novembre 2019, selon la Direction de la quarantaine des plantes et de l'inspection des produits du ministère de l'Industrie, du Commerce, de l'Agriculture et de la Pêche.

Deuxième réunion du réseau
En décembre, l'OMS, la FAO et l'Autorité d'Agriculture et de Sécurité Alimentaire d'Abu Dhabi ont organisé la deuxième réunion INFOSAN à Abu Dhabi, Emirats Arabes Unis.

La réunion a réuni 250 représentants de plus de 130 pays pour discuter des progrès et des défis rencontrés par le réseau au cours des 15 dernières années.

Alan Reilly, membre du groupe consultatif INFOSAN et professeur à l'University College de Dublin, Irlande, a déclaré que le réseau avait réussi à mettre un terme à certaines éclosions de maladies d'origine alimentaire dans le monde.

« Des régions et des pays peuvent travailler ensemble, partager des informations et protéger la santé des consommateurs en utilisant la plate-forme d'INFOSAN. »

Le premier jour, les participants ont entendu comment INFOSAN est devenu mondial avec un effectif de 190 pays et 600 membres.

La deuxième journée a couvert d'autres réseaux régionaux tels que le système d'alerte rapide de la Commission européenne pour les denrées alimentaires et les aliments pour animaux (RASFF), le Conseil de coopération du Golfe RASFF, le RASFF arabe, l'Association pour les nations de l'Asie du Sud-Est (ASEAN) RASFF et Réseau d'échange de risques émergents (EREN) de l'Autorité européenne de sécurité des aliments.

« L'intelligence artificielle, l'apprentissage automatique et l'utilisation des mégadonnées auront un impact profond sur la production alimentaire, le contrôle des aliments et les investigations sur les épidémies à l'avenir et les responsables de la sécurité des aliments doivent se préparer », a déclaré Peter Ben Embarek, du secrétariat INFOSAN, OMS.

Cristina Baptista Rodrigues, INFOSAN ECP au Portugal, a déclaré que le groupe était important de connecter les membres ayant des intérêts communs de différents pays.

« INFOSAN est devenu une partie vraiment importante de notre travail car nous voulons développer une connexion entre les agences de sécurité des aliments dans les pays lusophones. »

Caroline Merten, membre du groupe consultatif INFOSAN et responsable scientifique à l'Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA), a déclaré que des suggestions ont été faites pour le développement futur du réseau.

« Il existe un potentiel énorme pour INFOSAN de se développer davantage à l'avenir… comme la formation et le renforcement de la collaboration et de la communication sur les activités non urgentes, telles que les activités de surveillance et les activités d'évaluation des risques au niveau national. »

jeudi 16 janvier 2020

La plus importante des trois éclosions liées à de la laitue romaine a rendu malades 167 personnes dans 27 États des Etats-Unis


« La plus importante des trois éclosions liées à de la laitue romaine a rendu malades 167 personnes dans 27 États », source Food Safety News.
Personnes infectée par la souche épidémique de E. coli O157:H7, par Etat de résidence, au 13 janvier 2020 (n=167)
Lorsqu'ils ont déclaré le 15 janvier 2020 l'épidémie terminée, des responsables fédéraux du CDC ont mis en évidence certains points dans leur investigation sur une épidémie à E. coli. Il s'agissait de l'une des trois éclosions concomitantes liées à de la laitue romaine fin 2019.

Un total de 167 personnes infectées par la souche épidémique de E. coli O157:H7 a été confirmé dans 27 États. Les cas de maladie ont commencé à des dates allant du 20 septembre au 21 décembre 2019. Les personnes malades étaient âgées de moins de 1 à 89 ans, avec un âge médian de 27 ans.

Soixante-quatre pour cent des personnes malades étaient des femmes. Sur 165 personnes malades pour lesquelles des informations étaient disponibles, plus de la moitié étaient si malades qu'elles ont dû être hospitalisées. Quinze personnes ont développé un syndrome hémolytique et urémique (SHU), un type d'insuffisance rénale. Aucun décès n'a été signalé.

L'Agence de la santé publique du Canada a également signalé plusieurs cas de maladie qui étaient étroitement liées génétiquement aux maladies aux États-Unis.

Au 6 décembre 2019, deux cas de maladie liées à l'épidémie aux États-Unis avaient été identifiées au Canada. Ces personnes sont tombées malades de la mi-octobre à début novembre 2019. Une personne a été hospitalisée. Aucune des deux n'est décédée. Des preuves épidémiologiques, de laboratoire et de traçabilité ont indiqué que la laitue romaine de la région de culture de la vallée de Salinas en Californie était la source probable de cette éclosion.

Selon la FDA, cette épidémie, une épidémie de l'État de Washington liée aux légumes à feuilles vertes et une autre épidémie dan plusieurs États partageaient un dénominateur commun, un fournisseur de laitue romaine de Salinas, Californie.

Bien que ce producteur ait été déterminé comme étant un fournisseur commun pour les trois épidémies sur la base des informations disponibles sur la chaîne d'approvisionnement, la laitue romaine de ce producteur n'explique pas toutes les cas de maladie observés dans les trois épidémies, selon la FDA et le CDC. Aucune des deux agences n'a nommé le producteur.

Le Maryland Department of Health a identifié la souche épidémique de E. coli O157:H7 dans un emballage non ouvert de salade César Bistro au poulet de chez Ready Pac Foods (actuellement la propirété du groupe Bonduelle) prélevé chez un malade au Maryland. Le Wisconsin Department of Health Services a identifié la souche épidémique de E. coli O157:H7 dans un sachet non ouvert de laitue romaine de chez Fresh Express prélevé chez un malade au Wisconsin. La région de culture de la vallée de Salinas en Californie était la principale source de laitue romaine dans les deux produits.

Une épidémie à Campylobacter liée au poulet se poursuit au Danemark


« Une épidémie à Campylobacter liée au poulet se poursuit au Danemark », source article de Joe Whitworth paru le 16 janvier 2020 dans Food safety News.

Près de 90 personnes font partie d'une épidémie au Danemark à Campylobacter après avoir consommé de la viande de poulet d’un abattoir.

Le Statens Serum Institut (SSI), l'Administration vétérinaire et alimentaire danoise (Fødevarestyrelsen) et le DTU Food - National Food Institute ont investigué sur l'épidémie à Campylobacter jejuni.

Dans le cadre d'un projet de l'année dernière impliquant le Département de microbiologie clinique (KMA) à Aalborg, l'Administration vétérinaire et alimentaire danoise et SSI, des isolats de Campylobacter provenant de patients diagnostiqués à Aalborg à partir de mars 2019 ont été collectés, envoyés au SSI et le génome complet a été séquencé.

Chute des infections vers la fin de l'année
Les isolats de Campylobacter ne sont pas systématiquement soumis et séquencés, de sorte que l'épidémie a probablement été détectée en raison du projet, selon les responsables. La séquence type 122 de Campylobacter jejuni a été identifiée chez des patients par séquençage du génome complet.

Ce type a également été retrouvé dans de la viande de poulet d'un abattoir appartenant à HKScan à Vinderup, une ville du nord-ouest du Jutland. Les produits de ce site sont vendus dans toutes les grandes chaînes de magasins danoises. Il a été précédemment révélé que l'Administration vétérinaire et alimentaire danoise avait envoyé des agents pour aider l'entreprise à rechercher et à éliminer la source d'infection.

Entre février 2019 et le 9 janvier 2020, 88 patients avec le même type de Campylobacter ont été identifiés. Parmi les malades, 35 femmes et 53 hommes âgés de 2 à 91 ans. L'épidémie semble diminuer avec moins de cas d'infection vers la fin de 2019.

Steen Ethelberg, de SSI, a déclaré que le projet s'est déroulé en 2019 mais se poursuivra sous une forme modérée en 2020. Les isolats humains du laboratoire clinique d'Aalborg seront séquencés en temps réel cette année.

« Nous continuerons à le suivre, mais il est principalement entre les mains de la Danish Veterinary and Food Administration. Il a travaillé avec l'industrie pour contenir et arrêter l'épidémie. Il n'est pas tout à fait clair si elle est finie, mais le nombre de nouveaux cas a diminué », a-t-il déclaré à Food Safety News.

Meilleure compréhension de l'épidémie
Ethelberg a déclaré que le séquençage des isolats de Campylobacter nous avait beaucoup appris, mais que les partenaires du projet n'avaient pas encore eu la chance de se rencontrer, de discuter et de digérer toutes les données. Une publication scientifique est prévue sur les résultats.

« Nous avons eu une reconfirmation du fait que de nombreux cas groupés et d’épidémies jusqu'ici inconnus ont été découverts par le séquençage et que les produits de poulet sur le marché peuvent être associés à une partie de ceux-ci. Nous avons également découvert une énorme épidémie. Nous n'aurions probablement pas compris cela aussi bien que nous le faisons sans le séquençage. »

Campylobacter est la principale cause d'infections intestinales bactériennes au Danemark. En 2019, 5 300 cas ont été enregistrés, en hausse par rapport aux 4 500 infections enregistrées en 2018.

« Campylobacter est une grande préoccupation. Les chiffres ont tendance à augmenter ou à diminuer avec quelques centaines de cas d'année en année, ce qui est probablement une variation naturelle. En 2019, nous pensons qu'une partie de l'explication de l'augmentation est la grande épidémie », a déclaré Ethelberg.

« Les cas que nous avons dénombré sont basés sur le nombre d'isolats séquencés, donc en réalité il pourrait y avoir plusieurs fois plus de cas si nous supposons que l'épidémie a affecté l'ensemble du pays. Et encore une fois, nous n'aurions pas compris cela sans le séquençage. »